New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1675701 = | 48 (0.970) | 3 (0.060) | 3/242 | NT | 6.6% | coding (868/1305 nt) | hom | homoserine dehydrogenase |
? | NC_002947 | 1675742 = | 39 (0.840) | coding (909/1305 nt) | hom | homoserine dehydrogenase |
GGGTTACCGCATCAAGCACCTGGGCGTGGCGCGTCGCACCGCCGAAGGTATCGAGTTGCGCGTGCACCCGACGCTGATCCCGGCCGACCGTCTGATCGCCAACGTCAACGGCGTGATGAACGCTGTCATGGTCAACGGTGATGCTGCCGGCTCCACCCTGTACTACGGTGCTGGCGCGGGTATGGAGCCTACCGCTTCGTCAGTGGTCGGCGACCTGGTCGACGTGGTCCGTGCCATGACCTCCGACCCGGAGAACCGTGTGCCGCACCTGGCATTCCAGCCAGACTCGCTGTCGGC > NC_002947/1675553‑1675849 | gtaggcgctttcgcaggcttcgatcggcaggatcgggtgggccgacagcgagtctggctggaatgccaggtgcggcacacggttctccgggtcggaggtcatcgcacggaccacgtcgaccaggtcgccgaccactgacgaagcggtag > 1:228862‑M1/149‑149 (MQ=255) taggcgctttcgcaggcttcgatcggcaggatcgggtgggccgacagcgagtctggctggaatgccaggtgcggcacacggttctccgggtcggaggtcatggcacggaccacgtcgaccaggtcgccgaccactgacgaagcggtagg < 2:44380‑M1/2‑1 (MQ=255) gTTACCGCTTAACGCACCTGGGCGTGGCGCGTCGCACCGCAGATGGTATCGAGTTGCGCGTGCACCCGACGCTGATCCCGGCCGACCGTCTGATCGCCAACGTCAACGGCGTGATGAACGCTGTCATGGTCAACGGTGATGCTGCCGGc < 1:303896/149‑1 (MQ=255) ggcgctttcgcaggcttcgatcggcaggatcgggtgggccgacagcgagtctggctggaatgccaggtgcggcacacggttctccgggtcggaggtcatggcacggaccacgtcgaccaggtcgccgaccactgacgaagcggtaGGCt < 5:219183‑M1/4‑1 (MQ=255) gcgctttcgcaggcttcgatcggcaggatcgggtgggccgacagcgagtctggctggaatgccaggtgcggcacacggttctccgggtcggaggtcatggcacggaccacgtcgaccaggtcgccgaccactgacgaagcggtaGGCTc < 6:116803‑M1/5‑1 (MQ=255) cgctttcgcaggcttcgatcggcaggatcgggtgggccgacagcgagtctggctggaatgccaggtgcggcacacggttctccgggtcggaggtcatggcacggaccacgtcgaccaggtcgccgaccactgacgaagcggtaGGCTcc > 3:7598‑M1/144‑149 (MQ=255) cgctttcgcaggcttcgatcggcaggatcgggtgggccgacagcgagtctggctggaatgccaggtgcggcacacggttctccgggtcggaggtcatggcacggaccacgtcgaccaggtcgccgaccactgacgaagcggtaGGCTcc > 3:3205‑M1/144‑149 (MQ=255) aCCGCATCAAGCACCTGGGCGTGGCGCGTCGCACCGCCGAAGGTATCGAGTTGCGCGTGCACCCGACGCTGATCCCGGCCGACCGTCTGATCGCCAACGTCAACGGCGTGATGAACGCTGTCATGGTCAACGGTGATGCTGCCGGCTc > 1:173503/1‑148 (MQ=255) aCCGCATCAAGCACCTGGGCGTGGCGCGTCGCACCGCCGAAGGTATCGAGTTGCGCGTGCACCCGACGCTGATCCCGGCCGACCGTCTGATCGCCAACGTCAACGGCGTGATGAACGCTGTCATGGTCAACGGTGATGCTGCCGGCTc < 5:62921/148‑1 (MQ=255) ccGCATCAAGCACCTGGGCGTGGCGCGTCGCACCGCCGAAGGTATCGAGTTGCGCGTGCACCCGACGCTGATCCCGGCCGACCGTCTGATCGCCAACGTCAACGGCGTGATGAACGCTGTCATGGTCAACGGTGATGCTGCCGGCTcc < 4:127918/148‑1 (MQ=255) cGCATCAAGCACCTGGGCGTGGCGCGTCGCACCGCCGAAGGTATCGAGTTGCGCGTGCACCCGACGCTGATCCCGGCCGACCGTCTGATCGCCAACGTCAACGGCGTGATGAACGCTGTCATGGTCAACGGTGATGCTGCCGGCTCCAc > 1:244128/1‑149 (MQ=255) gCATCAAGCACCTGGGCGTGGCGCGTCGCACCGCCGAAGGTATCGAGTTGCGCGTGCACCCGACGCTGATCCCGGCCGACCGTCTGATCGCCAACGTCAACGGCGTGATGAACGCTGTCATGGTCAACGGTGATGCTGCCGGCTCCAcc < 2:173503/149‑1 (MQ=255) cAAGCACCTGGGCGTGGCGCGTCGCACCGCCGAAGGTATCGAGTTGCGCGTGCACCCGACGCTGATCCCGGCCGACCGTCTGATCGCCAACGTCAACGGCGTGATGAACGCTGTCATGGTCAACGGTGATGCTGCCGGCTCCACCCTg > 8:21955/1‑148 (MQ=255) cAAGCACCTGGGCGTGGCGCGTCGCACCGCCGAAGGTATCGAGTTGCGCGTGCACCCGACGCTGATCCCGGCCGACCGTCTGATCGCCAACGTCAACGGCGTGATGAACGCTGTCATGGTCAACGGTGATGCTGCCGGCTCCACCCTg > 4:196068/1‑148 (MQ=255) aGCACCTGGGCGTGGCGCGTCGCACCGCCGAAGGTATCGAGTTGCGCGTGCACCCGACGCTGATCCCGGCCGACCGTCTGATCGCCAACGTCAACGGCGTGATGAACGCTGTCATGGTCAACGGTGATGCTGCCGGCTCCACCCTGtac > 5:107294/1‑149 (MQ=255) ccTGGGCGTGGCGCGTCGCACCGCCGAAGGTATCGAGTTGCGCGTGCACCCGACGCTGATCCCGGCCGACCGTCTGATCGCCAACGTCAACGGCGTGATGAACGCTGTCATGGTCAACGGTGATGCTGCCGGCTCCACCCTGTACTACg < 7:21955/149‑1 (MQ=255) ccTGGGCGTGGCGCGTCGCACCGCCGAAGGTATCGAGTTGCGCGTGCACCCGACGCTGATCCCGGCCGACCGTCTGATCGCCAACGTCAACGGCGTGATGAACGCTGTCATGGTCAACGGTGATGCTGCCGGCTCCACCCTGTACTACg < 3:196068/149‑1 (MQ=255) ccTGGGCGTGGCGCGTCGCACCGCCGAAGGTATCGAGTTGCGCGTGCACCCGACGCTGATCCCGGCCGACCGTCTGATCGCCAACGTCAACGGCGTGATGAACGCTGTCATGGTCAACGGTGATGCTGCCGGCTCCACCCTGTACTACg < 2:244128/149‑1 (MQ=255) gcggcgCAGCGCCGAAGGTTTCGAGGTGCGGGGGCACCCGACGCTGATCCCGCCCGACCGTCTGATCGCCAACGTCAACGGCGTGATGAACGCTGTCATGGTCAACGGTGATGCTGCCGGCTCCACCCTGTACTACGGTGCGGGCGCgg < 8:136583/149‑1 (MQ=255) tCGCACCGCCGAAGGTATCGAGTTGCGCGTGCACCCGACGCTGATCCCGGCCGACCGTCTGATCGCCAACGTCAACGGCGTGATGAACGCTGTCATGGTCAACGGTGATGCTGCCGGCTCCACCCTGTACTACGGTGCTGGCGCGGGTa < 6:107294/149‑1 (MQ=255) tCGCACCGCCGAAGGTATCGAGTTGCGCGTGCACCCGACGCTGATCCCGGCCGACCGTCTGATCGCCAACGTCAACGGCGTGATGAACGCTGCCATGGTCAACGGTGATGCTGCCGGCTCCACCCTGTACTACGGTGCTGGCGCGGGTa > 3:8674/1‑149 (MQ=255) cACCGCCGAAGGTATCGAGTTGCGCGTGCACCCGACGCTGATCCCGGCCGACCGTCTGATCGCCAACGTCAACGGCGTGATGAACGCTGTCATGGTCAACGGTGATGCTGCCGGCTCCACCCTGTACTACGGTGCTGGCGCGGGTATg > 6:225266/1‑148 (MQ=255) ccgccgAAGGTATCGAGTTGCGCGTGCACCCGACGCTGATCCCGGCCGACCGTCTGATCGCCAACGTCAACGGCGTGATGAACGCTGTCATGGTCAACGGTGATGCTGCCGGCTCCACCCTGTACTACGGTGCTGGCGCGGGTATGGAg < 5:14999/149‑1 (MQ=255) ggccgacagcgagtctggctggaatgccaggtgcggcacacggttctccgggtcggaggtcatggcacggaccacgtcgaccaggtcgccgaccactgacgaagcggtaGGCTCCACCCTGTACTACGGTGCTGGCGCGGGTATGGAGc > 6:219183‑M1/110‑149 (MQ=255) aaGGTATCGAGTTGCGCGTGCACCCGACGCTGATCCCGGCCGACCGTCTGATCGCCAACGTCAACGGCGTGATGAACGCTGTCATGGTCAACGGTGATGCTGCCGGCTCCACCCTGTACTACGGTGCTGGCGCGGGt < 5:96201/137‑1 (MQ=255) aaGGTATCGAGTTGCGCGTGCACCCGACGCTGATCCCGGCCGACCGTCTGATCGCCAACGTCAACGGCGTGATGAACGCTGTCATGGTCAACGGTGATGCTGCCGGCTCCACCCTGTACTACGGTGCTGGCGCGGGt > 6:96201/1‑137 (MQ=255) gcgagtctggctggaatgccaggtgcggcacacggttctccgggtcggaggtcatggcacggaccacgtcgaccaggtcgccgaccactgacgaagcggtaGGCTCCACCCTGTACTACGGTGCTGGCGCGGGTATGGAGCCt < 8:278773‑M1/42‑1 (MQ=255) gcgagtctggctggaatgccaggtgcggcacacggttctccgggtcggaggtcatggcacggaccacgtcgaccaggtcgccgaccactgacgaagcggtaGGCTCCACCCTGTACTACGGTGCTGGCGCGGGTATGGAGCCt > 7:278773‑M1/102‑143 (MQ=255) tATCGAGTTGCGCGTGCACCCGACGCTGATCCCGGCCGACCGTCTGATCGCCAACGTCAACGGCGTGATGAACGCTGTCATGGTCAACGGTGATGCTGCCGGCTCCACCCTGTACTACgg > 5:146247/1‑120 (MQ=255) tATCGAGTTGCGCGTGCACCCGACGCTGATCCCGGCCGACCGTCTGATCGCCAACGTCAACGGCGTGATGAACGCTGTCATGGTCAACGGTGATGCTGCCGGCTCCACCCTGTACTACgg < 6:146247/120‑1 (MQ=255) tCGAGTTGCGCGTGCACCCGACGCTGATCCCGGCCGACCGTCTGATCGCCAACGTCAACGGCGTGATGAACGCTGTCATGGTCAACGGTGATGCTGCCGGCTCCACCCTGTACTACGGTGCTGGCGCGGGTATGGAGCCTACCGCTTCg > 1:282536/1‑149 (MQ=255) tCGAGTTGCGCGTGCACCCGACGCTGATCCCGGCCGACCGGCTGATCGCCAACGTCAACGGCGTGATGAACGCTGTCATGGTCAACGGTGATGCTGCCGGCTCCACCCTGTACTACGGTGCTGGCGCGGGTATGGAGCCTACCGCTTc < 8:57347/148‑1 (MQ=255) gTTGCGCGTGCACCCGACGCTGATCCCGGCCGACCGTCTGATCGCCAACGTCAACGGCGTGATGAACGCTGTCATGGTCAACGGTGATGCTGCCGGCTCCACCCTGTACTACGGTGCTGGCGCGGGTATGGAGCCTACCGCTTCGTCAg > 7:105008/1‑149 (MQ=255) gcgcGTGCACCCGACGCTGATCCCGGCCGACCGTCTGATCGCCAACGTCAACGGCGTGATGAACGCTGTCATGGTCAACGGTGATGCTGCCGGCTCCACCCTGTACTACGGTGCTGGCGCGGGTATGGAGCCTACCGCTTCGTCAGTg < 2:58818/148‑1 (MQ=255) cccGACGCTGATCCCGGCCGACCGTCTGATCGCCAACGTCAACGGCGTGATGAACGCTGTCATGGTCAACGGTGATGCTGCCGGCTCCACCCTGTACTACGGTGCTGGCGCGGGTATGGAGCCTACCGCTTCGTCAGTGGTCGGCGAcc < 5:225266/149‑1 (MQ=255) cccGACGCTGATCCCGGCCGACCGTCTGATCGCCAACGTCAACGGCGTGATGAACGCTGTCATGGTCAACGGTGATGCTGCCGGCTCCACCCTGTACTACGGTGCTGGCGCGGGTATGGAGCCTACCGCTTCGTCAGTGGTCGGCGAcc > 5:265678/1‑149 (MQ=255) cGACGCTGATCCCGGCCGACCGTCTGATCGCCAACGTCAACGGCGTGATGAACGCTGTCATGGTCAACGGTGATGCTGCCGGCTCCACCCTGTACTACGGTGCTGGCGCGGGTATGGAGCCTACCGCTTCGTCAGTGGTCGGCGACCTg > 6:146677/1‑149 (MQ=255) gCTGATCCCGGCCGACCGTCTGATCGCCAACGTCAACGGCGTGATGAACGCTGTCATGGTCAACGGTGATGCTGCCGGCTCCACCCTGTACTACGGTGCTGGCGCGGGTATGGAGCCTACCGCTTCGTCAGTGGTCGGCGACCGGGtat < 6:7073/149‑3 (MQ=255) aTCCCGGCCGACCGTCTGATCGCCAACGTCAACGGCGTGATGAACGCTGTCATGGTCAACGGTGATGCTGCCGGCTCCACCCTGTACTACGGTGCTGGCGCGGGTATGGAGCCTACCGCTTCGTCAGTGGTCGGCGACCTGGTCGAc < 6:265678/147‑1 (MQ=255) cccGGCCGACCCTCTGATCGCCACAGTCCACGGCGTGATGAACGCTGCCATCCTCAACGGTGATGCTGCCGGCTCCACCCTGTACTACGGTGCTGGCGCGGGTATGGAGCCTACCGCTTCGTCAGTGGTCGGCGACCTGGTCGACGTgg < 4:8674/149‑1 (MQ=255) ggCCGACCGTCTGATCGCCAACGTCAACGGCGTGATGAACGCTGTCATGGTCAACGGTGATGCTGCCGGCTCCACCCTGTACTACGGTGCTGGCGCGGGTATGGAGCCTACCGCTTCGTCAGTGGTCGGCGACCTGGTCGACGTGGTcc > 8:75521/1‑149 (MQ=255) cGTCTGATCGCCAACGTCAACGGCGTGATGAACGCTGTCATGGTCAACGGTGATGCTGCCGGCTCCACCCTGTACTACGGTGCTGGCGCGGGTATGGAGCCTACCGCTTc < 6:251931/110‑1 (MQ=255) cGTCTGATCGCCAACGTCAACGGCGTGATGAACGCTGTCATGGTCAACGGTGATGCTGCCGGCTCCACCCTGTACTACGGTGCTGGCGCGGGTATGGAGCCTACCGCTTc > 5:251931/1‑110 (MQ=255) cGTCTGATCGCCAACGTCAACGGCGTGATGAACGCTGTCATGGTCAACGGTGATGCTGCCGGCTCCACCCTGTACTACGGTGCTGGCGCGGGTATGGAGCCTACCGCTTCGTCAGTGGTCGGCGACCTGGTCGACGTGGTCCGTGCCAt < 3:178322/149‑1 (MQ=255) tCTGATTGCCAACGTCAACGGCGTGATGAACGCTGTCATGGTCAACGGTGATGCTGCCGGCTCCACCCTGTACTACGGTGCTGGCGCGGGTATGGAGCCTACCGCTTCGTCAGTGGTCGGCGACCTGGTCGACGTGGTCCGTGCCATGa > 4:128044/1‑149 (MQ=255) tCTGATCGCCAACGTCAACGGCGTGATGAACGCTGTCATGGTCAACGGTGATGCTGCCGGCTCCACCCTGTACTACGGTGCTGGCGCGGGTATGGAGCCTACCGCTTCGTCAGTGGTCGGCGACCTGGTCGACGTGGTCCGTGCCATGa > 7:263593/1‑149 (MQ=255) aTCGCCAACGTCAACGGCGTGATGAACGCTGTCATGGTCAACGGTGATGCTGCCGGCTCCACCCTGTACTACGGTGCTGGCGCGGGTATGGAGCCTACCGCTTCGTCAGTGGTCGGCGACCTGGTCGACGTGGTCCGAGCCATGACCTc > 1:263066/1‑149 (MQ=255) aaCGTCAACGGCGTGATGAACGCTGTCATGGTCAACGGTGATGCTGCCGGCTCCACCCTGTACTACGGTGCTGGCGCGGGTATGGAGCCTACCGCTTCGTCAGTGGTCGGCGACCTGGTCGACGTGGTCCGTGCCATGACCTCCGAccc < 5:146677/149‑1 (MQ=255) aCGTCAACGGCGTGATGAACGCTGTCATGGTCAACGGTGATGCTGCCGGCTCCACCCTGTACTACGGTGCTGGCGCGGGTATGGAGCCTACCGCTTCGTCAGTGGTCGGCGACCTGGTCGACGTGGTCCGTGCCATGACCTCCGACCCg > 5:157498/1‑149 (MQ=255) aCGTCAACGGCGTGATGAACGCTGTCATGGTCAACGGTGATGCTGCCGGCTCCACCCTGTACTACGGTGCTGGCGCGGGTATGGAGCCTACCGCTTCGTCAGTGGTCGGCGACCTGGTCGACGTGGTCCGAGCCATGACCTCCGACCCg < 2:263066/149‑1 (MQ=255) aaCGGCGTGATGAACGCTGTCATGGTCAACGGTGATGCTGCCGGCTCCACCCTGTACTACGGTGCTGGCGCGGGTATGGAGCCTACCGCTTCGTCAGTGGTCGGCGACCTGGTCGACGTGGTCCGTGCCATGACCTCCGACCCGGAGaa > 6:79664/1‑149 (MQ=255) cGGCGTGATGAACGCTGTCATGGTCAACGGTGATGCTGCCGGCTCCACCCTGTACTACGGTGCTGGCGCGGGTATGGAGCCTACCGCTTCGTCAGTGGTCGGCGACCTGGTCGACGTGGTCCGTGCCATGACCTCCGACCCGGAGAAcc < 8:263593/149‑1 (MQ=255) cGTGATGAACGCTGTCATGGTCAACGGTGATGCTGCCGGCTCCACCCTGTACTACGGTGCTGGCGCGGGTATGGAGCCTACCGCTTCGTCAGTGGTCGGCGACCTGGTCGACGTGGTCCGTGCCATGACCTCCGACCCGGAGAACCgtg < 3:11770/149‑1 (MQ=255) gatgaACGCTGTCATGGTCAACGGTGATGCTGCCGGCTCCACCCTGTACTACGGTGCTGGCGCGGGTATGGAGCCTACCGCTTCGTCAGTGGTCGGCGACCTGGTCGACGTGGTCCGTGCCATGACCTcc > 6:175670/1‑130 (MQ=255) gatgaACGCTGTCATGGTCAACGGTGATGCTGCCGGCTCCACCCTGTACTACGGTGCTGGCGCGGGTATGGAGCCTACCGCTTCGTCAGTGGTCGGCGACCTGGTCGACGTGGTCCGTGCCATGACCTcc < 5:175670/130‑1 (MQ=255) atgaACGCTGTCATGGTCAACGGTGATGCTGCCGGCTCCACCCTGTACTACGGTGCTGGCGCGGGTATGGAGCCTACCGCTTCGTCAGTGGTCGGCGACCTGGTCGACGTGGTCCGTGCCATGACCTCCGACCCGGAGAACCGTGTGc < 2:282536/148‑1 (MQ=255) aCGCTGGCATGGTCAACGGTGATGCTCCCGGCTCCACCCTGTACTACGGTGCTGGCGCGGGTATGGAGCCTACCGCTTCGTCAGTGGTCTGCGACCTGGTCGACGTGGTCCGTGCCATGACCTCCGACCCGGAGAACCGTGTGCCGCAc < 4:254958/149‑1 (MQ=255) tCATGGTCAACGGTGATGCTGCCGGCTCCACCCTGTACTACGGTGCTGGCGCGGGTATGGAGCCTACCGCTTCGTCAGTGGTCGGCGACCTGGTCGACGTGGTCCGTGCCATGACCTCCGACCCGGAGAACCGTGTGCCGCACCTGGCa > 5:116803/1‑149 (MQ=255) gTCAACGGTGATGCTGCCGGCTCCACCCTGTACTACGGTGCTGGCGCGGGTATGGAGCCTACCGCTTCGTCAGTGGTCGGCGACCTGGTCGACGTGGTCCGTGCCATGACCTCCGACCCGGAGAACCGTGTGCCGCACCTGGCATTcca < 3:128044/149‑1 (MQ=255) aaCGGTGATGCTGCCGGCTCCACCCTGTACTACGGTGCTGGCGCGGGTATGGAGCCTACCGCTTCGTCAGTGGTCGGCGACCTGGTCGACGTGGTCCGTGCCATGACCTCCGACCCGGAGAACCGTGTGCCGCACCTGGCATTccagc < 6:157498/148‑1 (MQ=255) tgcCGGCTCCACCCTGTACTACGGTGCTGGCGCGGGTATGGAGCCTACCGCTTCGTCAGTGGTCGGCGACCTGGTCGACGTGGTCCGTGCCATGACCTCCGACCCGGAGAACCGTGTGCCGCACCTGGCATTACAGCCAGACTCGCTGt > 6:56899/1‑149 (MQ=255) GGCTCCACCCTGTACTACGGTGCTGGCGCGGGTATGGAGCCTACCGATTCGTCAGTGGTCGGCGACCTGGTCGACGTGGTCCGTGCCATGACCTCCGACCCGGAGAACCGTGTGCCGCACCTGGCATTCCAGCCAGACTCGCTGTCGGc < 1:69498‑M1/149‑1 (MQ=255) | GGGTTACCGCATCAAGCACCTGGGCGTGGCGCGTCGCACCGCCGAAGGTATCGAGTTGCGCGTGCACCCGACGCTGATCCCGGCCGACCGTCTGATCGCCAACGTCAACGGCGTGATGAACGCTGTCATGGTCAACGGTGATGCTGCCGGCTCCACCCTGTACTACGGTGCTGGCGCGGGTATGGAGCCTACCGCTTCGTCAGTGGTCGGCGACCTGGTCGACGTGGTCCGTGCCATGACCTCCGACCCGGAGAACCGTGTGCCGCACCTGGCATTCCAGCCAGACTCGCTGTCGGC > NC_002947/1675553‑1675849 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |