| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 2354551 | 55 (1.110) | 6 (0.130) | 4/240 | NT | 11.0% | intergenic (‑20/+38) | PP_2068/PP_2069 | multidrug MFS transporter membrane fusion protein/multidrug MFS transporter outer membrane protein |
| ? | NC_002947 | = 4856112 | 46 (0.990) | intergenic (+84/+112) | PP_4270/PP_5670 | hypothetical protein/hypothetical protein | |||||
CAATCTCGAATTGGGCCTGCTGGCTGTCGGTTGTGGGAGCCACTGTCTTGCTCAATTTCTAAAAGCTGGCGCGTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGTCTTGCCTCTCGCTACCACCGCCCGCCCAGCGCGCGGAACAGGTTTACCTGCGCTTGCGCCAGGCGCCCTCGGGCTTCTGTGTGGTTGGCCCGCAGGCTGATCATTTCGCGCTCGCTGTCGA > NC_002947/2354410‑2354698 | cAATCTCGAATTGGGCCTGCTGGCTGTCGGTTGTGGGAGCCACTGTCTTGCTCAATTTCTAAAAGCTGGCGCGTGTGTGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCTGTGTATTCTTCTCGGGTACAGTg > 6:221872/1‑149 (MQ=255) aaTCTCGAATTGGGCCTGCTGGCTGTCGGTTGTGGGAGCCACTGTCTTGCTCAATTTCTAAAAGCTGGCGCGTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTgg > 7:116977/1‑149 (MQ=255) ctcGAATTGGGCCTGCTGGCTGTCGGTTGTGGGAGCCACTGTCTTGCTCAATTTCTAAAAGCTGGCGCGTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCg > 8:239282/1‑149 (MQ=255) tcGAATTGGGCCTGCTGGCTGTCGGTTGTGGGAGCCACTGTCTTGCTCAATTTCTAAAAGCTGGCGCGTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCgg > 2:109122/1‑149 (MQ=255) cGAATTGGGCCTGCTGGCTGTCGGTTGTGGGAGCCACTGTCTTGCTCAATTTCTAAAAGCTGGCGCGTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGt > 5:169755/1‑149 (MQ=255) gAATTGGGCCTGCTGGCTGTCGGTTGTGGGAGCCACTGTCTTGCTCAATTTCTAAAAGCTGGCGCGTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCg < 5:182437/146‑1 (MQ=255) aaTTGGGCCTGCTGGCTGTCGGTTGTGGGAGCCACTGTCTTGCTCAATTTCTAAAAGCTGGCGCGTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTgg > 3:242691/1‑142 (MQ=255) aaTTGGGCCTGCTGGCTGTCGGTTGTGGGAGCCACTGTCTTGCTCAATTTCTAAAAGCTGGCGCGTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTgg < 4:242691/142‑1 (MQ=255) ccTGCTGGCTGTCGGTTGTGGGAGCCACTGTCTTGCTCAATTTCTAAAAGCTGGCGCGTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTg > 4:184830/1‑141 (MQ=255) ccTGCTGGCTGTCGGTTGTGGGAGCCACTGTCTTGCTCAATTTCTAAAAGCTGGCGCGTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTg < 3:184830/141‑1 (MQ=255) ctggctgTCGGTTGTGGGAGCCACTGTCTTGCTCAATTTCTAAAAGCTGGCGCGTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGt > 4:178989/1‑149 (MQ=255) gctgTCGGTTGTGGGAGCCACTGTCTTGCTCAATTTCTAAAAGCTGGCGCGTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCgctgc < 4:196592/142‑1 (MQ=255) gctgTCGGTTGTGGGAGCCACTGTCTTGCTCAATTTCTAAAAGCTGGCGCGTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCgctgc > 3:196592/1‑142 (MQ=255) gctgTCGGTTGTGGGAGCCACTGTCTTGCTCAATTTCTAAAAGCTGGCGCGTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGTCtt < 8:116977/149‑1 (MQ=255) tgTCGGTTGTGGGAGCCACTGTCTTGCTCAATTTCTAAAAGCTGGCGCGTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGTCTTGc < 5:221872/149‑1 (MQ=255) tCGGTTGTGGGAGCCACTGTCTTGCTCAATTTCTAAAAGCTGGCGCGTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGTCTTGc < 7:268368/147‑1 (MQ=255) tgGGAGCCACTGTCTTGCTCAATTTCTAAAAGCTGGCGCGTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGTCTTGCCTCTCGCTa < 7:239282/149‑1 (MQ=255) aGCCACTGTCTTGCTCAATTTCTAAAAGCTGGCGCGTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGTCTTGCCTCTCGCTaccac > 8:215494/1‑149 (MQ=255) tGTCTTGCTCAATTTCTAAAAGCTGGCGCGTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGTCTTGCCTCTCGCTACCAccgcccg > 7:112282/1‑149 (MQ=255) tCTTGCTCAATTTCTAAAAGCTGGCGCGTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGTCTTGCCTCTCGCTACCACcgcccgcc > 3:304240/1‑149 (MQ=255) tCTTGCTCAATTTCTAAAAGCTGGCGCGTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGTCTTGCCTCTCGCTACCACcgcccgcc < 5:305073/149‑1 (MQ=255) ttGCTCAATTTCTAAAAGCTGGCGCGTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGTCTTGCCTCTCGCTACCACcgcccgcc > 2:5173/1‑147 (MQ=255) gCTCAATTTCTAAAAGCTGGCGCGTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGTCTTGCCTCTCGCTACCACCGCCCGCCCa > 6:131003/1‑147 (MQ=255) gCTCAATTTCTAAAAGCTGGCGCGTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGTCTTGCCTCTCGCTACCACCGCCCGCCCa < 5:131003/147‑1 (MQ=255) gCTCAATTTCTAAAAGCTGGCGCGTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGTCTTGCCTCTCGCTACCACCGCCCGCCCAgc > 5:173853/1‑149 (MQ=255) tCAATTTCTAAAAGCTGGCGCGTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGTCTTGCCTCTCGCTACCACCGCCCGCCCAgcgc > 2:304087/1‑149 (MQ=255) aaTTTCTAAAAGCTGGCGCGTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGTCTTGCCTCTCGCTACCACCGCCCGCCCAgcgcgc > 3:24191/1‑149 (MQ=255) tAAATGCTGGCGCGTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGTCTTGCCTCTCGCTACCACCGCCCGCCCAGCGCGCGGAACa < 8:190442/149‑1 (MQ=255) tAAAAGCTGGCGCGTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGTCTTGCCTCTCGCTACCACCGCCCGCCCAGCGCGCGGaa > 6:69409/1‑147 (MQ=255) aaaaGCTGGCGCGTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGTCTTGCCTCTCGCTACCACCGCCCGCCCAGCGCGCGGAACAg > 5:237897/1‑149 (MQ=255) aaaGCTGGCGCGTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGTCTTGCCTCTCGCTACCACCGCCCGCCCAGCGCGCGGAACAgg < 1:204253/149‑1 (MQ=255) aaaGCTGGCGCGTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGTCTTGCCTCTCGCTACCACCGCCCGCCCAGCGCGCGGAACAg < 5:69409/148‑1 (MQ=255) tgGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGTCTTGCCTCTCGCTACCACCGCCCGCCCAGCGCGCGGAACAGGTTTACCTGCGCtt < 2:235641/148‑1 (MQ=255) gggAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGTCTTGCCTCTCGCTACCACCGCCCGCCCAGCGCGCGGAACAGGTTTACCTGCGCTTgc < 7:215494/149‑1 (MQ=255) aGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGTCTTGCCTCTCGCTACCACCGCCCGCCCAGCGCGCGGAACAGGTTTACCTGCGCTTGCGcc < 6:173853/149‑1 (MQ=255) ggCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGCTATATTCTTCGCGGGcatgcccgctcccacagggatcgcgccagcttttagaaattgagcaagacagttgcgcaagcggtcgcgaaatgagcagggccgttagtt > 3:90131‑M1/1‑59 (MQ=255) ttGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCACGGTGTTGGCTTCGCGGGcaagcccgctcccccagggatcgcgccagcttttagaaattgagcaa < 7:213372‑M1/103‑48 (MQ=255) ttGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCACGGTGTTGGCTTCGCGGGcaagcccgctcccccagggatcgcgccagcttttagaaattgagcaa > 8:213372‑M1/1‑56 (MQ=255) ttGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCACGGTGTTGGCTTCGCGGGcaagcccgctcccccagggatcgcgccagcttttagaaattgagcaa < 2:242216‑M1/103‑48 (MQ=255) ttGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCACGGTGTTGGCTTCGCAGGcaagcccgctcccccagggatcgcgccagcttttagaaattgagcaa > 1:242216‑M1/1‑56 (MQ=255) ccGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGctgctg < 2:128667/76‑1 (MQ=255) ccGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGTCTTGCCTCTCGCTACCACCGCCCGCCCAGCGCGCGGAACAGGt < 6:90174/121‑1 (MQ=255) ccGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGTCTTGCCTCTCGCTACCACCGCCCGCCCAGCGCGCGGAACAGGt > 5:90174/1‑121 (MQ=255) ccGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGCTATATTCTTCGCGGGcatgcccgctcccacagggatcgcgccagcttttagaaattgagcaagacagttgcgcaagcggtcgcgaaatgagcagggccgttagttgcgctgg < 4:90131‑M1/149‑98 (MQ=255) cgcgAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGGCTTGCCTCTCGCTACCACCGCCCGCCCAGCGCGCGGAACAGGTTTACCTGCGCTTGCGCCAGGCGCCCTCgg < 3:178989/149‑1 (MQ=255) cGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGTCTTGCCTCTCGCTACCACCGCCCGCCCAGCGCGCGGAACAGGTTTACCTGCGCTTGCGCCAGGCGCCCTCGGGCTTCtgt > 2:81868/1‑149 (MQ=255) gggCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGTCTTGCCTCTCGCTACCACCGCCCGCCCAGCGCGCGGAACAGGTTTACCTGCGCTTGCGCCAGGCGCCCTCGGGCTTCtgtg < 4:24191/149‑1 (MQ=255) gCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGTCTTGCCTCTCGCTACCACCGCCCGCCCAGCGCGCGGAACAGGTTTACCTGCGCTTGCGCCAGGCGCCCTCGGGCTTCtgtgtg > 5:149894/1‑149 (MQ=255) aTCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGTCTTGCCTCTCGCTACCACCGCCCGCCCAGCGCGCGGAACAGGTTTACCTGCGCTTGCGCCAGGCGCCCTCGGGCTTCTGTGTGGTTGGCCCGCAGGc > 6:304608/1‑149 (MQ=255) aTCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGTCTTGCCTCTCGCTACCACCGCCCGCCCAGCGCGCGGAACAGGTTTACCTGCGCTTGCGCCAGGCGCCCTCGGGCTTCTGTGTGGTTGGCCCGCAGGc < 3:149572/149‑1 (MQ=255) aTCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGTCTTGCCTCTCGCTACCACCGCCCGCCCAGCGCGCGGAACAGGTTTACCTGCGCTTGCGCCAGGCGCCCTCGGGCTTCTGTGTGGTTGGCCCGCAGGc < 6:237897/149‑1 (MQ=255) aTCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGTCTTGCCTCTCGCTACCACCGCCCGCCCAGCGCGCGGAACAGGTTTACCTGCGCTTGCGCCAGGCGCCCTCGGGCTTCTGTGTGGTTGGCCCGCAGGc < 6:149894/149‑1 (MQ=255) tgcACCGCGGTGTATTCTTCTCGGGTACAGTGGGCGGTTCTCGCTGCTGTTCTTGCCTCTCGCTACCACCGCCCGCCCATCGCGCGGAACATGTTTACCTGCGCTTgcgc < 4:224063/108‑1 (MQ=255) tCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGTCTTGCCTCTCGCTACCACCGCCCGCCCAGCGCGCGGAACAGGTTTACCTGCGCTTgcgc > 3:224063/1‑110 (MQ=255) tCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGTCTTGCCTCTCGCTACCACCGCCCGCCCAGCGCGCGGAACAGGTTTACCTGCGCTTGCGCCAGGCGCCCTCGGGCTTCTGTGTGGTTGGCCCGCAGGCt < 6:169755/149‑1 (MQ=255) cgcgGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGTCTTGCCTCTCGCTACCACCGCCCGCCCAGCGCGCGGAACAGGTTTACCTGCGCTTGCGCCAGGCGCCCTCGGGCTTCTGTGTGGTTGGCCCGCAGGCTGATCa > 7:119976/1‑149 (MQ=255) gtgtATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGTCTTGCCTCTCGCTACCACCGCCCGCCCAGCGCGCGGAACAGGTTTACCTGCGCTTGCGCCAGGCGCCCTCGGGCTTCTGTGTGGTTGGCCCGCAGGCTGATCATTTc < 8:112282/149‑1 (MQ=255) gtgtATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGTCTTGCCTCTCGCTACCACCGCCCGCCCAGCGCGCGGAACAGGTTTACCTGCGCTTGCGCCAGGCGCCCTCGGGCTTCTGTGTGGTTGGCCCGCAGGCTGATCATTTc < 5:304608/149‑1 (MQ=255) gtgtATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGTCTTGCCTCTCGCTACCACCGCCCGCCCAGCGCGCGGAACAGGTTTACCTGCGCTTGCGCCAGGCGCCCTCGGGCTTCTGTGTGGTTGGCCCGCAGGCTGATCATTTc < 1:81868/149‑1 (MQ=255) tcttcGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGTCTTGCCTCTCGCTACCACCGCCCGCCCAGCGCGCGGAACAGGTTTACCTGCGCTTGCGCCAGGCGCCCTCggg < 1:151169/109‑1 (MQ=255) tcttcGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGTCTTGCCTCTCGCTACCACCGCCCGCCCAGCGCGCGGAACAGGTTTACCTGCGCTTGCGCCAGGCGCCCTCggg > 2:151169/1‑109 (MQ=255) ggTACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGTCTTGCCTCTCGCTACCACCGCCCGCCCAGCGCGCGGAACAGGTTTACCTGCGCTTGCGCCAGGCGCCCTCGGGCTTCTGTGTGGTTGGCCCGCAGGCTGATCATTTCGCGCTCGCTGTCGa < 1:304087/149‑1 (MQ=255) | CAATCTCGAATTGGGCCTGCTGGCTGTCGGTTGTGGGAGCCACTGTCTTGCTCAATTTCTAAAAGCTGGCGCGTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGTCTTGCCTCTCGCTACCACCGCCCGCCCAGCGCGCGGAACAGGTTTACCTGCGCTTGCGCCAGGCGCCCTCGGGCTTCTGTGTGGTTGGCCCGCAGGCTGATCATTTCGCGCTCGCTGTCGA > NC_002947/2354410‑2354698 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |