| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 2362107 | 61 (1.240) | 4 (0.090) | 4/242 | NT | 6.1% | coding (1770/2724 nt) | PP_2076 | hypothetical protein |
| ? | NC_002947 | = 2362130 | 65 (1.390) | coding (1747/2724 nt) | PP_2076 | hypothetical protein | |||||
CTGCGCTGCGTTGTGGGTTGATGGGCTGCCCGCTACGTGCAGCTTCACTCAGGCGAATATCGACAGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTT‑GGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATACAGGGTGTTGATGCGCCCAAAGGCATTGGCAGCGACATGGGCTTGCCTGGCAAGC > NC_002947/2361971‑2362254 | ctgcgctgcgTTGTGGGTTGATGGGCTGCCCGCTACGTGCAGCTTCACTCAGGCGAATATCGACAGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTT‑GGGGGTCGCGGTgcg > 3:108108/1‑148 (MQ=37) tgcgTTGTGGGTTGATGGGCTGCCCGCTACGTGCAGCTTCACTCAGGCGAATATCGACAGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTT‑GGGGGTCGCGGTGCGCAGCACt > 1:89249/1‑149 (MQ=37) gcgTTGTGGGTTGATGGGCTGCCCGCTACGTGCAGCTTCACTCAGGCGAATATCGACAGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTT‑GGGGGTCGCGGTGCGCAGCACtt > 1:1069/1‑149 (MQ=37) tgGGTTGATGGGCTGCCCGCTACGTGCAGCTTCACTCAGGCGAATATCGACAGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTT‑GGGGGTcgcg > 6:255345/1‑130 (MQ=38) tgGGTTGATGGGCTGCCCGCTACGTGCAGCTTCACTCAGGCGAATATCGACAGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTT‑GGGGGTcgcg < 5:255345/130‑1 (MQ=38) gggTTGATCGGCTGCCCGCTACGTGCAGCTTCACTCAGGCGAATATCGACAGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTT‑GGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGccc < 5:36149‑M2/149‑4 (MQ=255) gATGGGCTGCCCGCTACGTGCAGCTTCACTCAGGCGAATATCGACAGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTT‑GGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGccccaac > 2:1069‑M2/1‑141 (MQ=255) aTGGGCTGCCCGCTACGTGCAGCTTCACTCAGGCGAATATCGACAGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTT‑GGGGcggcaagtgctgcgcaccgcgacccccaaca < 8:93780‑M1/148‑32 (MQ=255) tGGGCTGCCCGCTACGTGCAGCTTCACTCAGGCGAATATCGACAGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTT‑GGGGGTCGCGGTGCGCAGCAc > 5:171828/1‑133 (MQ=37) tGGGCTGCCCGCTACGTGCAGCTTCACTCAGGCGAATATCGACAGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTT‑GGGGGTCGCGGTGCGCAGCAc < 6:171828/133‑1 (MQ=37) tGGGCTGCCCGCTACGTGCAGCTTCACTCAGGCGAATATCGACAGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGCCCATGCTGTT‑GGGGcggcaagtgctgcgcaccgcgacccccaacagc < 1:70459‑M1/149‑34 (MQ=255) gggCTGCCCGCTACGTGCAGCTTCACTCAGGCGAATATCGACAGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTT‑GGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGa > 1:297598/1‑149 (MQ=39) gCTGCCCGCTACGTGCAGCTTCACTCAGGCGAATATCGACAGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTT‑GGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACg < 4:108108/149‑1 (MQ=39) gCCCGCTACGTGCAGCTTCACTCAGGCGAATATCGACAGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTT‑GGGGGTCGCGGTgcgc > 3:51316/1‑122 (MQ=38) gCCCGCTACGTGCAGCTTCACTCAGGCGAATATCGACAGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTT‑GGGGGTCGCGGTgcgc < 4:51316/122‑1 (MQ=38) ccGCTACGTGCAGCTTCACTCAGGCGAATATCGACAGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTT‑GGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCa < 4:153178/149‑1 (MQ=39) cGCTACGTGCAGCTTCACTCAGGCGAATATCGACAGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTT‑GGGGGTCGCGGTgcg > 4:102917/1‑118 (MQ=39) cGCTACGTGCAGCTTCACTCAGGCGAATATCGACAGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTT‑GGGGGTCGCGGTgcg < 3:102917/118‑1 (MQ=39) gCTACGTGCAGCTTCACTCAGGCGAATATCGACAGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTT‑GGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAgg < 2:89249/149‑1 (MQ=39) aGCTTCACTCAGGCGAATATCGACAGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTT‑GGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAggt < 3:249809/149‑2 (MQ=39) cTTCACTCAGGCGAATATCGACAGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTT‑GGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGcc > 4:229150/1‑148 (MQ=39) cACTCAGGCGAATATCGACAGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTT‑GGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGAt < 3:229150/148‑1 (MQ=39) aCTCAGGCGAATATCGACAGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTT‑GGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGc > 1:305082/1‑149 (MQ=39) tCAGGCGAATATCGACAGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTT‑GGGGGACGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTg > 5:325691/1‑149 (MQ=255) gCGAATATCGACAGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTT‑GGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATg < 7:151420/142‑1 (MQ=39) gCGAATATCGACAGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTT‑GGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATg > 8:151420/1‑142 (MQ=39) gCGAATATCGACAGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTT‑GGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCg > 5:201532/1‑149 (MQ=39) atatCGACAGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTT‑GGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGtgct > 8:194084/1‑149 (MQ=39) atatCGACAGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTT‑GGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGtgct < 2:297598/149‑1 (MQ=39) tatCGACAGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTT‑GGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGtgctg > 4:255071/1‑149 (MQ=39) tatCGACAGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTT‑GGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGtgctg > 1:188187/1‑149 (MQ=39) aCAGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTT‑GGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCtg > 6:44650/1‑149 (MQ=39) aGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTT‑GGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCt > 1:117063/1‑132 (MQ=255) aGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTT‑GGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCt < 2:117063/132‑1 (MQ=255) aGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTT‑GGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCtgtg < 6:36149/149‑1 (MQ=39) cGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTT‑GGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCtt < 5:168108/149‑1 (MQ=40) gTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTT‑GGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTg < 3:255071/149‑1 (MQ=255) aCCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTA‑GGGCGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGtt > 8:49099/1‑148 (MQ=255) cGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTT‑GGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATACAgg < 2:305082/149‑1 (MQ=255) aaCAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTT‑GGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATACTGGgt > 5:217330/1‑149 (MQ=255) ggTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTT‑GGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATACAGGGTGTTGa > 2:275401/1‑149 (MQ=255) tCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTT‑GGGGcggcaagtgctgcgcaccgcgacccccaa < 7:77646‑M1/73‑30 (MQ=255) tCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTT‑GGGGcggcaagtgctgcgcaccgcgacccccaa > 8:77646‑M1/1‑44 (MQ=255) aGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTT‑GGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATACAGGGTGTTg < 3:182764/144‑1 (MQ=255) aGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTT‑GGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATACAGGGTGTTg > 4:182764/1‑144 (MQ=255) gCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTT‑GGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATACAGGGTGTTGATGCGccc > 5:266542/1‑148 (MQ=255) cccTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTT‑GGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATACAGGGTGTTGATGCGCCCAAAGGc < 7:194084/149‑1 (MQ=255) ccTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTT‑GGGGGTCGCGGTGCGCTGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATACAGGGTGTTGATGCGCCCAAAGGCa > 8:234859/1‑149 (MQ=255) ccTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTT‑GGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGa < 7:227563/87‑1 (MQ=255) ccTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTT‑GGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGa > 8:227563/1‑87 (MQ=255) tGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTT‑GGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCtg < 4:128304/104‑1 (MQ=40) tGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTT‑GGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCtg > 3:128304/1‑104 (MQ=40) gTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTTGGGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATACAGGGTGTTGATGCGCCCAAAGGCATTg > 1:4441/1‑149 (MQ=255) gTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTT‑GGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATACAGGGTGTTGATGCGCCCAAAGGCATTgg > 2:81110/1‑149 (MQ=255) cAGTGCGCGGTCCATGCTGTT‑GGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGGCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATACAGGGTGTTGATGCGCCCAAAGGCATTGGCAg < 3:308819/149‑1 (MQ=255) cAGTGCGCGGTCCATGCTGTT‑GGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATACAGGGTGTTGATGCGCCCAAAGGCATTGGCAg < 1:81110/149‑1 (MQ=255) tGCGCGGTCCATGCTGTT‑GGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGc > 3:63117/1‑66 (MQ=255) tGCGCGGTCCATGCTGTT‑GGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGc < 4:63117/66‑1 (MQ=255) gcgGTCCATGCTGTT‑GGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATACAGGGTGTTGATGCGCCCAAAGGCATTGGCAGCGACAt > 1:300992/1‑149 (MQ=255) cATGCTGTT‑GGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATACAGGGTGTTGATGCGCCCAAAGGCATTGGCAGCGACATGGGCtt > 6:209514/1‑149 (MQ=255) aTGCTGTT‑GGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATACAGGGTGTTGATGCGCCCaaa < 5:254109/125‑1 (MQ=40) aTGCTGTT‑GGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATACAGGGTGTTGATGCGCCCaaa > 6:254109/1‑125 (MQ=40) gCTGTT‑GGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGccccaacagcatgggccgcgcactgcaccagggtttgcggctgaccttgttcgcttcggtgcatgaaacggctgtcgatattcgcctgagtgaagctgcacgtagcgggcagccca < 1:70459‑M2/149‑117 (MQ=255) tGTT‑GGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGccccaacagcatggaccgcgcactgcaccagggtttgcggctgaccttgttcgcttcggtgcatgaaacggctgtcgatattcgcctgagtgaagctgcacgtagcgggcagcccat < 8:93780‑M2/148‑118 (MQ=255) tGTT‑GGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCAt > 4:218462/1‑99 (MQ=255) tGTT‑GGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCAt < 3:218462/99‑1 (MQ=255) gTT‑GGGGcggcaagtgctgcgcaccgcgacccccaacagcatggaccgcgcactgcaccagggtttgcggctgaccttgttcgcttcggtgcatgaaacggctgtcgatattcgcctgagtgaagctgcacgtagcgggcagcccatc > 2:1069‑M1/1‑7 (MQ=255) gTT‑GGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATACAGGGTGTTGATGCGCCCAAAGGCATTGGCAGCGACATGGGCTTGCCTgg > 2:223532/1‑149 (MQ=255) tt‑GGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGccccaacagcatggaccgcgcactgcaccagggtttgcggctga < 7:77646‑M2/73‑45 (MQ=255) tt‑GGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGccccaacagcatggaccgcgcactgcaccagggtttgcggctga > 8:77646‑M2/1‑29 (MQ=255) tt‑GGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATACAGGGTGTTGATGCGCCCAAAGGCATTGGCAGCGACATGGGCTTGCCTg < 5:44650/147‑1 (MQ=255) tt‑GGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATACAGGGTGTTGATGCGCCCAAAGGCATTGGCAGCGACATGGGCTTGCCTGGc < 2:300992/149‑1 (MQ=255) ggggggCGCGGTGCGCAGCACTTGCCCCCCCAACGCGACGTACCCGCCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCAAACAGGGTGTTTATGCGCCCaac < 2:91440/117‑2 (MQ=14) gggggTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATACAGGGTGTTGATgcg < 6:138584/111‑1 (MQ=255) gggggTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATACAGGGTGTTGATgcg > 5:138584/1‑111 (MQ=255) gggggTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATACAGGGTGTTGATGCGCCCaaa > 1:91440/1‑117 (MQ=255) gggcggcaagtgctgcgcaccgcgacccccaacagcatggaccgcgcactgcaccagggtttgcggctgaccttgttcgcttcggtgcatgaaacggctgtcgatattcgcctgagtgaagctgcacgtagcgggcagccgatcaaccc < 5:36149‑M1/149‑147 (MQ=255) gggTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATACAGGGTGTTGATGCGCCCAAAGGCATTGGCAGCGACATGGGCTTGCCTGGCAAgc < 6:201532/149‑1 (MQ=255) gggACGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATACAGGGTGTTGATGCGCCCAAAGGCATTGGCAGCGACATGGGCTTGCCTGGCAAgc < 6:325691/149‑1 (MQ=255) | CTGCGCTGCGTTGTGGGTTGATGGGCTGCCCGCTACGTGCAGCTTCACTCAGGCGAATATCGACAGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTT‑GGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATACAGGGTGTTGATGCGCCCAAAGGCATTGGCAGCGACATGGGCTTGCCTGGCAAGC > NC_002947/2361971‑2362254 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |