New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 2362107 | 61 (1.240) | 4 (0.090) | 4/242 | NT | 6.1% | coding (1770/2724 nt) | PP_2076 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | = 2362130 | 65 (1.390) | coding (1747/2724 nt) | PP_2076 | hypothetical protein |
GGGTTGATGGGCTGCCCGCTACGTGCAGCTTCACTCAGGCGAATATCGACAGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTT‑GGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATACAGGGTGTTGATGCGCCCAAAGGCATTGGCAGCGACATGGGCTTGCCTGGCAAGCGCTTCCGGCAGGGCGAAGGA > NC_002947/2361985‑2362274 | gggTTGATCGGCTGCCCGCTACGTGCAGCTTCACTCAGGCGAATATCGACAGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTT‑GGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGccc < 5:36149‑M2/149‑4 (MQ=255) gATGGGCTGCCCGCTACGTGCAGCTTCACTCAGGCGAATATCGACAGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTT‑GGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGccccaac > 2:1069‑M2/1‑141 (MQ=255) gggCTGCCCGCTACGTGCAGCTTCACTCAGGCGAATATCGACAGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTT‑GGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGa > 1:297598/1‑149 (MQ=39) gCTGCCCGCTACGTGCAGCTTCACTCAGGCGAATATCGACAGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTT‑GGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACg < 4:108108/149‑1 (MQ=39) ccGCTACGTGCAGCTTCACTCAGGCGAATATCGACAGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTT‑GGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCa < 4:153178/149‑1 (MQ=39) gCTACGTGCAGCTTCACTCAGGCGAATATCGACAGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTT‑GGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAgg < 2:89249/149‑1 (MQ=39) aGCTTCACTCAGGCGAATATCGACAGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTT‑GGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAggt < 3:249809/149‑2 (MQ=39) cTTCACTCAGGCGAATATCGACAGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTT‑GGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGcc > 4:229150/1‑148 (MQ=39) cACTCAGGCGAATATCGACAGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTT‑GGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGAt < 3:229150/148‑1 (MQ=39) aCTCAGGCGAATATCGACAGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTT‑GGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGc > 1:305082/1‑149 (MQ=39) tCAGGCGAATATCGACAGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTT‑GGGGGACGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTg > 5:325691/1‑149 (MQ=255) gCGAATATCGACAGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTT‑GGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATg > 8:151420/1‑142 (MQ=39) gCGAATATCGACAGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTT‑GGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATg < 7:151420/142‑1 (MQ=39) gCGAATATCGACAGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTT‑GGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCg > 5:201532/1‑149 (MQ=39) atatCGACAGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTT‑GGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGtgct > 8:194084/1‑149 (MQ=39) atatCGACAGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTT‑GGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGtgct < 2:297598/149‑1 (MQ=39) tatCGACAGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTT‑GGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGtgctg > 1:188187/1‑149 (MQ=39) tatCGACAGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTT‑GGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGtgctg > 4:255071/1‑149 (MQ=39) aCAGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTT‑GGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCtg > 6:44650/1‑149 (MQ=39) aGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTT‑GGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCt > 1:117063/1‑132 (MQ=255) aGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTT‑GGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCt < 2:117063/132‑1 (MQ=255) aGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTT‑GGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCtgtg < 6:36149/149‑1 (MQ=39) cGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTT‑GGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCtt < 5:168108/149‑1 (MQ=40) gTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTT‑GGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTg < 3:255071/149‑1 (MQ=255) aCCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTA‑GGGCGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGtt > 8:49099/1‑148 (MQ=255) cGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTT‑GGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATACAgg < 2:305082/149‑1 (MQ=255) aaCAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTT‑GGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATACTGGgt > 5:217330/1‑149 (MQ=255) ggTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTT‑GGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATACAGGGTGTTGa > 2:275401/1‑149 (MQ=255) aGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTT‑GGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATACAGGGTGTTg > 4:182764/1‑144 (MQ=255) aGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTT‑GGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATACAGGGTGTTg < 3:182764/144‑1 (MQ=255) gCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTT‑GGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATACAGGGTGTTGATGCGccc > 5:266542/1‑148 (MQ=255) cccTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTT‑GGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATACAGGGTGTTGATGCGCCCAAAGGc < 7:194084/149‑1 (MQ=255) ccTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTT‑GGGGGTCGCGGTGCGCTGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATACAGGGTGTTGATGCGCCCAAAGGCa > 8:234859/1‑149 (MQ=255) ccTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTT‑GGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGa > 8:227563/1‑87 (MQ=255) ccTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTT‑GGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGa < 7:227563/87‑1 (MQ=255) tGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTT‑GGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCtg < 4:128304/104‑1 (MQ=40) tGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTT‑GGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCtg > 3:128304/1‑104 (MQ=40) gTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTTGGGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATACAGGGTGTTGATGCGCCCAAAGGCATTg > 1:4441/1‑149 (MQ=255) gTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTT‑GGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATACAGGGTGTTGATGCGCCCAAAGGCATTgg > 2:81110/1‑149 (MQ=255) cAGTGCGCGGTCCATGCTGTT‑GGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGGCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATACAGGGTGTTGATGCGCCCAAAGGCATTGGCAg < 3:308819/149‑1 (MQ=255) cAGTGCGCGGTCCATGCTGTT‑GGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATACAGGGTGTTGATGCGCCCAAAGGCATTGGCAg < 1:81110/149‑1 (MQ=255) tGCGCGGTCCATGCTGTT‑GGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGc < 4:63117/66‑1 (MQ=255) tGCGCGGTCCATGCTGTT‑GGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGc > 3:63117/1‑66 (MQ=255) gcgGTCCATGCTGTT‑GGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATACAGGGTGTTGATGCGCCCAAAGGCATTGGCAGCGACAt > 1:300992/1‑149 (MQ=255) cATGCTGTT‑GGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATACAGGGTGTTGATGCGCCCAAAGGCATTGGCAGCGACATGGGCtt > 6:209514/1‑149 (MQ=255) aTGCTGTT‑GGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATACAGGGTGTTGATGCGCCCaaa > 6:254109/1‑125 (MQ=40) aTGCTGTT‑GGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATACAGGGTGTTGATGCGCCCaaa < 5:254109/125‑1 (MQ=40) gCTGTT‑GGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGccccaacagcatgggccgcgcactgcaccagggtttgcggctgaccttgttcgcttcggtgcatgaaacggctgtcgatattcgcctgagtgaagctgcacgtagcgggcagccca < 1:70459‑M2/149‑117 (MQ=255) tGTT‑GGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGccccaacagcatggaccgcgcactgcaccagggtttgcggctgaccttgttcgcttcggtgcatgaaacggctgtcgatattcgcctgagtgaagctgcacgtagcgggcagcccat < 8:93780‑M2/148‑118 (MQ=255) tGTT‑GGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCAt < 3:218462/99‑1 (MQ=255) tGTT‑GGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCAt > 4:218462/1‑99 (MQ=255) gTT‑GGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATACAGGGTGTTGATGCGCCCAAAGGCATTGGCAGCGACATGGGCTTGCCTgg > 2:223532/1‑149 (MQ=255) tt‑GGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGccccaacagcatggaccgcgcactgcaccagggtttgcggctga < 7:77646‑M2/73‑45 (MQ=255) tt‑GGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGccccaacagcatggaccgcgcactgcaccagggtttgcggctga > 8:77646‑M2/1‑29 (MQ=255) tt‑GGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATACAGGGTGTTGATGCGCCCAAAGGCATTGGCAGCGACATGGGCTTGCCTg < 5:44650/147‑1 (MQ=255) tt‑GGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATACAGGGTGTTGATGCGCCCAAAGGCATTGGCAGCGACATGGGCTTGCCTGGc < 2:300992/149‑1 (MQ=255) ggggggCGCGGTGCGCAGCACTTGCCCCCCCAACGCGACGTACCCGCCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCAAACAGGGTGTTTATGCGCCCaac < 2:91440/117‑2 (MQ=14) gggggTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATACAGGGTGTTGATgcg < 6:138584/111‑1 (MQ=255) gggggTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATACAGGGTGTTGATgcg > 5:138584/1‑111 (MQ=255) gggggTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATACAGGGTGTTGATGCGCCCaaa > 1:91440/1‑117 (MQ=255) gggTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATACAGGGTGTTGATGCGCCCAAAGGCATTGGCAGCGACATGGGCTTGCCTGGCAAgc < 6:201532/149‑1 (MQ=255) gggACGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATACAGGGTGTTGATGCGCCCAAAGGCATTGGCAGCGACATGGGCTTGCCTGGCAAgc < 6:325691/149‑1 (MQ=255) cgGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATACAGGGTGTTGATGCGCCCAAAGGCATTGGCAGCGACATGGGCTTGCCAGGCAAgcccatgt < 7:49099/149‑7 (MQ=255) cgGTGCGCAGCACGTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACCGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGGTCTTGCATCTGTTCATACAGGGTGTTGATGCGCCCAAAGGCAGTGGCAGCGACATGGGCTTGCCTGGCAAGCGCTTcc < 7:122444/149‑1 (MQ=14) ggTGCGCTGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATACAGGGTGTTGATGCGCCCAAAGGCATTGGCAGCGACATGGGCTTGCCAGGCAAgcccatgtc < 7:234859/149‑8 (MQ=255) gTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATACAGGGTGTTGATGCGCCCAAAGGCATTGGCAGCGACATGGGCTTGCCTGGCAAGCGCTTCCgg > 8:97501/1‑149 (MQ=39) cgcAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATACAGGGTGTTGATGCGCCCAAAGGCATTGGCAGCGACATGGGCTTGCCTGGCGATCGCTTCCGGCAg > 1:108141/1‑149 (MQ=255) gcagcaCTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATACAGGGTGTTGATGCGCCCAAAGGCATTGGCAGCGACATGGGCTTGCCTGGCAAGCGCTTCCGGCAgg < 5:224860/149‑1 (MQ=39) caCTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATACAGGGTGTTGATGCGCCCAAAGGCATTGGCAGCGACATGGGCTTGCCTGGCAAGCGCTTCCGGCAGGGCg > 1:58039/1‑148 (MQ=39) ttGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATACAGGGTGTTGATGCGCCCAAAGGCATTGGCAGCGACATGGGCTTGCCTGGCAAGCGCTTCCGGCAGGGCGAAg > 3:117158/1‑148 (MQ=39) ttGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATACAGGGTGTTGATGCGCCCAAAGGCATTGGCAGCGACATGGGCTTGCCAGGCAAgcccat > 2:296117/1‑130 (MQ=255) ttGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATACAGGGTGTTGATGCGCCCAAAGGCATTGGCAGCGACATGGGCTTGCCAGGCAAgcccat < 1:296117/134‑5 (MQ=255) gccgccCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATACAGGGTGTTGATGCGCCCAAAGGCATTGGCAGCGACATGGGCTTGCCTGGCAAGCGCTTCCGGCAGGGCGAAGGa < 2:188187/148‑1 (MQ=39) | GGGTTGATGGGCTGCCCGCTACGTGCAGCTTCACTCAGGCGAATATCGACAGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTT‑GGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATACAGGGTGTTGATGCGCCCAAAGGCATTGGCAGCGACATGGGCTTGCCTGGCAAGCGCTTCCGGCAGGGCGAAGGA > NC_002947/2361985‑2362274 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |