New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3082878 = | 37 (0.750) | 4 (0.090) | 3/240 | NT | 10.7% | coding (1190/1551 nt) | PP_2692 | BCCT family transporter |
? | NC_002947 | 3082933 = | 32 (0.690) | coding (1135/1551 nt) | PP_2692 | BCCT family transporter |
GACATCGCCAGCGCCACGGTGAAGGCCATGGCGTCGCCATTGGTGGCCACTGAGATGAAACTTAGGAACAGGAACAGCGCGCTGACAAGGCCACCTAGTGGCAGGTTCTGCGTCACTCCCAGCAGCAGGTCTTCAGGCTTGGCGCCATGGGCGGTGACGCTGCCTGGCGTTTGCAGCTCCAGGCCGATCCCGGTACCGCCCACCACAGTGAACCAGAACATGGTCACCAGCGGTGCGATGATCGACAGCGTCATGATGATCTCGCGGATGGTGCGGCCCCGCGAGATCCGCGC > NC_002947/3082731‑3083023 | gACATCGCCAGCGCCACGGTGAAGGCCATGGCGTCGCCATTGGTGGCCACTGAGATGAAACTTAGGAACAGGAACAGCGCGCTGACAAGGCCACCTAGTGGCAGGTTCTGCGTCACTCCCAGCAGCAGGTCTTCAGGCTTGGCGCCAt < 7:268878/148‑1 (MQ=255) tgttctattggggctggttcatcggctatgcgcccatggtggccctgtatgtcgcgcggatctcgcggggccgcaccatccgcgagatcatcatgacgctgtcgatcatcgcaccgctggtgaccatgttctggttcactgtggTGGGc > 6:290059‑M1/145‑149 (MQ=255) tgttctattggggctggttcatcggctatgcgcccatggtggccctgtatgtcgcgcggatctcgcggggccgcaccatccgcgagatcatcatgacgctgtcgatcatcgcaccgctggtgaccatgttctggttcactgtggTGGGc < 4:18505‑M1/5‑1 (MQ=255) gttctattggggctggttcatcggctatgcgaccatggtggccctgtatgtcgcgcggatctcgcggggccgcaccatccgcgagatcatcatgacgctgtcgatcatcgcaccgctggtgaccatgttctggttcactgtggTGGGCg < 5:305802‑M1/6‑1 (MQ=255) ttctattggggctggttcatcggctatgcgcccatggtggccctgtatgtcgcgcggatctcgcggggccgcaccatccgcgagatcatcatgacgctgtcgatcatcgcaccgctggtgaccatgttctggttcactgtggTGGGCgg < 4:215138‑M1/7‑1 (MQ=255) aGCGCCACGGTGAAGGCCATGGCGTCGCCATTGGTGGCCACTGAGATGAAACTTAGGAACAGGAACAGCGCGCTGACAAGGCCACCTAGTGGCAGGTTCTGCGTCACTCCCAGCAGCAGGTCTTCAGGCTTGGCGCCATGGGCGGTGAc < 5:40191/149‑1 (MQ=255) gCCATGGCGTCGCCATTGGTGGCCACTGAGATGAAACTTAGGAACAGGAACAGCGCGCTGACAAGGCCACCTAGTGGCAGGTTCTGCGTCACTCCCAGCAGCAGGTCTTCAGGCTTGGCGCCATGGGCGGTGACGCTGCCTGGCGTTTg > 2:291411/1‑149 (MQ=255) gTCGCCATTGGTGGCCACTGAGATGAAACTTAGGAACAGGAACAGCGCGCTGACAAGGCCACCTAGTGGCAGGTTCTGCGTCACTCCCAGCAGCAGGTCTTCAGGCTTGGCGCCATGGGCGGTGACGCTGCCTGGCGttt > 8:132107/1‑140 (MQ=255) gTCGCCATTGGTGGCCACTGAGATGAAACTTAGGAACAGGAACAGCGCGCTGACAAGGCCACCTAGTGGCAGGTTCTGCGTCACTCCCAGCAGCAGGTCTTCAGGCTTGGCGCCATGGGCGGTGACGCTGCCTGGCGttt < 7:132107/140‑1 (MQ=255) gCCATTGGTGGCCACTGAGATGAAACTTAGGAACAGGAACAGCGCGCTGACAAGGCCACCTAGTGGCAGGTTCTGCGTCACTCCCAGCAGCAGGTCTTCAGGCTTGGCGCCATGGGCGGTGACGCTGCCTGGCGTTTGCAGCTCCAGGc < 1:247590/149‑1 (MQ=255) cATTGGTGGCCACTGAGATGAAACTTAGGAACAGGAACAGCGCGCTGACAAGGCCACCTAGTGGCAGGTTCTGCGTCACTCCCAGCAGCAGGTCTTCAGGCTTGGCGCCATGGGCGGTGACGCTGCCTGGCGTTTGCAGCTCCAGGCCg < 2:95557/149‑1 (MQ=255) gCCACTGAGATGAAACTTAGGAACAGGAACAGCGCGCTGACAAGGCCACCTAGTGGCAGGTTCTGCGTCACTCCCAGCAGCAGGTCTTCAGGCTTGGCGCCATGGGCGGTGACg > 2:287843/1‑114 (MQ=255) gCCACTGAGATGAAACTTAGGAACAGGAACAGCGCGCTGACAAGGCCACCTAGTGGCAGGTTCTGCGTCACTCCCAGCAGCAGGTCTTCAGGCTTGGCGCCATGGGCGGTGACg < 1:287843/114‑1 (MQ=255) tcgcgcggatctcgcggggccgcaccatccgcgagatcatcatgacgctgtcgatcatcgcaccgctggtgaccatgttctggttcactgtggTGGGCGGTGACGCTGCCTGGCGTTTGCAGCTCCAGGCCGATCCCGGTACCGCcca > 3:215138‑M1/94‑148 (MQ=255) gAAACTTAGGAACAGGAACAGCGCGCTGACAAGGCCACCTAGTGGCAGGTTCTGCGTCACTCCCAGCAGCAGGTCTTCAGGCTTGGCGCCATGGGCGGTGACGCTGCCTGGCGTTTGCAGCTcc < 6:154917/124‑1 (MQ=255) gAAACTTAGGAACAGGAACAGCGCGCTGACAAGGCCACCTAGTGGCAGGTTCTGCGTCACTCCCAGCAGCAGGTCTTCAGGCTTGGCGCCATGGGCGGTGACGCTGCCTGGCGTTTGCAGCTcc > 5:154917/1‑124 (MQ=255) gcggatctcgcggggccgcaccatccgcgagatcatcatgacgctgtcgatcatcgcaccgctggtgaccatgttctggttcactgtggTGGGCTGTGACGCTGCCTGGCGTTTGCAGCTCCAGGCCGATCCCTGTACCGCCCACcaca > 6:305802‑M1/90‑149 (MQ=255) aaCTTAGGAACAGGAACAGCGCGCTGACAAGGCCACCTAGTGGCAGGTTCTGCGTCACTCCCAGCAGCAGGTCTTCAGGCTTGGCGCCATGGGCGGTGACGCTGCCTGGCGTTTGCAGCTCCAGGCCGATCCCGGTACCGCCCACcaca < 4:241194/149‑1 (MQ=255) ttAGGAACAGGAACAGCGCGCTGACAAGGCCACCTAGTGGCAGGTTCTGCGTCACTCCCAGCAGCAGGTCTTCAGGCTTGGCGCCATGGGCGGTGACGCTGCCTGGCGTTTg < 6:116338/112‑1 (MQ=255) ttAGGAACAGGAACAGCGCGCTGACAAGGCCACCTAGTGGCAGGTTCTGCGTCACTCCCAGCAGCAGGTCTTCAGGCTTGGCGCCATGGGCGGTGACGCTGCCTGGCGTTTg > 5:116338/1‑112 (MQ=255) aacaggaacagCGCGCTGACAAGGCCACCTAGTGGCAGGTTCTGCGTCACTCCCAGCAGCAGGTCTTCAGGCTTGGCACCATGGGCGGTGACGCTGCCTGGCGTTTGCAGCTCCAGGCCGATCCCGGTACCGCCCACCACAGTGAAc > 5:9691/1‑147 (MQ=255) gaacagCGCGCTGACAAGGCCACCTAGTGGCAGGTTCTGCGTCACTCCCAGCAGCAGGTCTTCAGGCTTGGCGCCATGGGCGGTGACGCTGCCTGGCGTTTGCAGCTCCAGGCCGATCCCGGTACCGCCCACCACAGTGAACCAGAACa > 1:121456/1‑149 (MQ=255) acagCGCGCTGACAAGGCCACCTAGTGGCAGGTTCTGCGTCACTCCCAGCAGCAGGTCTTCAGGCTTGGCGCCATGGGCGGTGACGCTGCCTGGCGTTTGCAGCTCCAGGCCGATCCCGGTACCGCCCACCACAGTGAACCAGAACATg > 4:276071/1‑149 (MQ=255) cagCGCGCTGACAAGGCCACCTAGTGGCAGGTTCTGCGTCACTCCCAGCAGCAGGTCTTCAGGCTTGGCGCCATGGGCGGTGACGCTGCCTGGCGTTTGCAGCTCCAGGCCGATCCCGGTACCGCccac > 2:236228/1‑129 (MQ=255) cagCGCGCTGACAAGGCCACCTAGTGGCAGGTTCTGCGTCACTCCCAGCAGCAGGTCTTCAGGCTTGGCGCCATGGGCGGTGACGCTGCCTGGCGTTTGCAGCTCCAGGCCGATCCCGGTACCGCccac < 1:236228/129‑1 (MQ=255) acgctgtcgatcatcgcaccgctggtgaccatgttctggttcactgtggTGGGCGGTGACGCTGCCTGGCGTTTGCAGCTCCAGGCCGATCCCGGTACCGCcca < 4:199595‑M1/55‑1 (MQ=255) acgctgtcgatcatcgcaccgctggtgaccatgttctggttcactgtggTGGGCGGTGACGCTGCCTGGCGTTTGCAGCTCCAGGCCGATCCCGGTACCGCcca > 3:199595‑M1/50‑104 (MQ=255) gCAGGTTCTGCGTCACTCCCAGCAGCAGGTCTTCAGGCTTGGCGCCATGGGCGGTGACGCTGCCTGGCGTTTGCAGCTCCAGGCCGATCCCGGTACCGCCCACCACAGTGAACCAGAACATGGTCACCAGCGGTGCGATGATCGACAGc < 2:121456/149‑1 (MQ=255) gTTCTGCGTCACTCCCAGCAGCAGGTCTTCAGGCTTGGCGCCATGGGCGGTGACGCTGCCTGGCGTTTGCAGCTCCAGGCCGATCCCGGTACCGc < 6:157134/95‑1 (MQ=255) gTTCTGCGTCACTCCCAGCAGCAGGTCTTCAGGCTTGGCGCCATGGGCGGTGACGCTGCCTGGCGTTTGCAGCTCCAGGCCGATCCCGGTACCGc > 5:157134/1‑95 (MQ=255) tGCGTCACTCCCAGCAGCAGGTCTTCAGGCTTGGCGCCATGGGCGGTGACGCTGCCTGGCGTTTGCAGCTCCAGGCCGATCCCGGTACCGCCCACCACAGTGAACCAGAACATGGTCACCAGCGGTGCGATGATc > 2:93706/1‑135 (MQ=255) tGCGTCACTCCCAGCAGCAGGTCTTCAGGCTTGGCGCCATGGGCGGTGACGCTGCCTGGCGTTTGCAGCTCCAGGCCGATCCCGGTACCGCCCACCACAGTGAACCAGAACATGGTCACCAGCGGTGCGATGATc < 1:93706/135‑1 (MQ=255) tCCCAGCAGCAGGTCTTCAGGCTTGGCGCCATGGGCGGTGACGCTGCCTGGCGTTTGCAGCTCCAGGCCGATCCCGGTACCGCCCACCACAGTGAACCAGAACATGGTCACCAGCGGTGCGATGATCGACAGCGTCATGATGATCTcgc > 6:118400/1‑149 (MQ=255) tCCCAGCAGCAGGTCTTCAGGCTTGGCGCCATGGGCGGTGACGCTGCCTGGCGTTTGCAGCTCCAGGCCGATCCCGGTACCGCCCACCACAGTGAACCAGAACATGGTCACCAGCGGTGCGATGATCGACAGCGTCATGATGATCTcgc > 3:18505/1‑149 (MQ=255) ccAGCAGCAGGTCTTCAGGCTTGGCGCCATGGGCGGTGACGCTGCCTGGCGTTTGCAGCTCCAGGCCGATCCCGGTACCGCCCACCACAGTGAACCAGAACATGGTCACCAGCGGTGCGATGATCGACAGCGTCATGATGATCTcgcg > 5:124018/1‑148 (MQ=255) gcagGTCTTCAGGCTTGGCGCCATGGGCGGTGACGCTGCCTGGCGTTTGCAGCTCCAGGCCGATCCCGGTACCGCCCACCACAGTGAACCAGAACATGGTCACCAGCGGTGCGATGATCGACAGCGTCATGATGATCTCGCGGATGGTg < 3:276071/149‑1 (MQ=255) cagGTCTTCAGGCTTGGCGCCATGGGCGGTGACGCTGCCTGGCGTTTGCAGCTCCAGGCCGATCCCGGTACCGCCCACCACAGTGAACCAGAACATGGTCACCAGCGGTGCgatgat < 4:742/117‑1 (MQ=255) cagGTCTTCAGGCTTGGCGCCATGGGCGGTGACGCTGCCTGGCGTTTGCAGCTCCAGGCCGATCCCGGTACCGCCCACCACAGTGAACCAGAACATGGTCACCAGCGGTGCgatgat > 3:742/1‑117 (MQ=255) gTCTTCAGGCTTGGCGCCATGGGCGGTGACGCTGCCTGGCGTTTGCAGCTCCAGGCCGATCCCGGTACCGCCCACCACAGTGAACCAGAACATGGTCACCAGCGGTGCGATGATCGACAGCGTCATGATGATCTCGCGGATg > 3:16775/1‑142 (MQ=255) gTCTTCAGGCTTGGCGCCATGGGCGGTGACGCTGCCTGGCGTTTGCAGCTCCAGGCCGATCCCGGTACCGCCCACCACAGTGAACCAGAACATGGTCACCAGCGGTGCGATGATCGACAGCGTCATGATGATCTCGCGGATg < 4:16775/142‑1 (MQ=255) ttCAGGCTTGGCGCCATGGGCGGTGACGCTGCCTGGCGTTTGCAGCTCCAGGCCGATCCCGGTACCGCCCACCACAGTGAACCAGAACATGGTCACCAGCGGTGCGATGATCGCCAGCGTCATGATGATCTCGCGGATGGTGCGGcccc > 2:301615/1‑149 (MQ=255) cAGGCTTGGCGCCATGGGCGGTGACGCTGCCTGGCGTTTGCAGCTCCAGGCCGATCCCGGTACCGCCCACCACAGTGAACCAGAACATGGTCACCAGCGGTGCGATGATCGACAGCGTCATGATGATCTCGCGGATGGTGCGGCCCcgc > 6:170596/1‑149 (MQ=255) cAGGCTTGGCGCCATGGGCGGTGACGCTGCCTGGCGTTTGCAGCTCCAGGCCGATCCCGGTACCGCCCACCACAGTGAACCAGAACATGGTCACCAGCGGTGCGATGATCGACAGCGTCATGATGATCTCGCGGATGGTGCGGCCCcgc > 1:197477/1‑149 (MQ=255) gCTTGGCGCCATGGGCGGTGACGCTGCCTGGCGTTTGCAGCTCCAGGCCGATCCCGGTACCGCCCACCACAGTGAACCAGAACATGGTCACCAGCGGTGCGATGATCGACAGCGTCATGATGATCTCGCGGATGGTGCGGCCCcgc > 5:85994/1‑146 (MQ=255) ttGGCGCCATGGGCGGTGACGCTGCCTGGCGTTTGCAGCTCCAGGCCGATCCCGGTACCGCCCACCACAGTGAACCAGAACATGGTCACCAGCGGTGCGATGATCGACAGCGTCat < 1:75544/116‑1 (MQ=255) ttGGCGCCATGGGCGGTGACGCTGCCTGGCGTTTGCAGCTCCAGGCCGATCCCGGTACCGCCCACCACAGTGAACCAGAACATGGTCACCAGCGGTGCGATGATCGACAGCGTCat > 2:75544/1‑116 (MQ=255) cATGGGCGGTGACGCTGCCTGGCGTTTGCAGCTCCAGGCCGATCCCGGTACCGCCCACCACAGTGAACCAGAACATGGTCACCAGCGGTGCGATGATCGACAGCGTCATGATGATCTCGCGGATGGTGCGGCCCCGCGAGATCcgcgc > 2:57380/1‑148 (MQ=255) | GACATCGCCAGCGCCACGGTGAAGGCCATGGCGTCGCCATTGGTGGCCACTGAGATGAAACTTAGGAACAGGAACAGCGCGCTGACAAGGCCACCTAGTGGCAGGTTCTGCGTCACTCCCAGCAGCAGGTCTTCAGGCTTGGCGCCATGGGCGGTGACGCTGCCTGGCGTTTGCAGCTCCAGGCCGATCCCGGTACCGCCCACCACAGTGAACCAGAACATGGTCACCAGCGGTGCGATGATCGACAGCGTCATGATGATCTCGCGGATGGTGCGGCCCCGCGAGATCCGCGC > NC_002947/3082731‑3083023 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |