New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3082878 = | 37 (0.750) | 4 (0.090) | 3/240 | NT | 10.7% | coding (1190/1551 nt) | PP_2692 | BCCT family transporter |
? | NC_002947 | 3082933 = | 32 (0.690) | coding (1135/1551 nt) | PP_2692 | BCCT family transporter |
AACTTAGGAACAGGAACAGCGCGCTGACAAGGCCACCTAGTGGCAGGTTCTGCGTCACTCCCAGCAGCAGGTCTTCAGGCTTGGCGCCATGGGCGGTGACGCTGCCTGGCGTTTGCAGCTCCAGGCCGATCCCGGTACCGCCCACCACAGTGAACCAGAACATGGTCACCAGCGGTGCGATGATCGACAGCGTCATGATGATCTCGCGGATGGTGCGGCCCCGCGAGATCCGCGCGACATACAGGGCCACCATGGGCGCATAGCCGATGAACCAGCCCCAATAGAACA > NC_002947/3082789‑3083076 | gcggatctcgcggggccgcaccatccgcgagatcatcatgacgctgtcgatcatcgcaccgctggtgaccatgttctggttcactgtggTGGGCTGTGACGCTGCCTGGCGTTTGCAGCTCCAGGCCGATCCCTGTACCGCCCACcaca > 6:305802‑M1/90‑149 (MQ=255) aaCTTAGGAACAGGAACAGCGCGCTGACAAGGCCACCTAGTGGCAGGTTCTGCGTCACTCCCAGCAGCAGGTCTTCAGGCTTGGCGCCATGGGCGGTGACGCTGCCTGGCGTTTGCAGCTCCAGGCCGATCCCGGTACCGCCCACcaca < 4:241194/149‑1 (MQ=255) aacaggaacagCGCGCTGACAAGGCCACCTAGTGGCAGGTTCTGCGTCACTCCCAGCAGCAGGTCTTCAGGCTTGGCACCATGGGCGGTGACGCTGCCTGGCGTTTGCAGCTCCAGGCCGATCCCGGTACCGCCCACCACAGTGAAc > 5:9691/1‑147 (MQ=255) gaacagCGCGCTGACAAGGCCACCTAGTGGCAGGTTCTGCGTCACTCCCAGCAGCAGGTCTTCAGGCTTGGCGCCATGGGCGGTGACGCTGCCTGGCGTTTGCAGCTCCAGGCCGATCCCGGTACCGCCCACCACAGTGAACCAGAACa > 1:121456/1‑149 (MQ=255) acagCGCGCTGACAAGGCCACCTAGTGGCAGGTTCTGCGTCACTCCCAGCAGCAGGTCTTCAGGCTTGGCGCCATGGGCGGTGACGCTGCCTGGCGTTTGCAGCTCCAGGCCGATCCCGGTACCGCCCACCACAGTGAACCAGAACATg > 4:276071/1‑149 (MQ=255) cagCGCGCTGACAAGGCCACCTAGTGGCAGGTTCTGCGTCACTCCCAGCAGCAGGTCTTCAGGCTTGGCGCCATGGGCGGTGACGCTGCCTGGCGTTTGCAGCTCCAGGCCGATCCCGGTACCGCccac < 1:236228/129‑1 (MQ=255) cagCGCGCTGACAAGGCCACCTAGTGGCAGGTTCTGCGTCACTCCCAGCAGCAGGTCTTCAGGCTTGGCGCCATGGGCGGTGACGCTGCCTGGCGTTTGCAGCTCCAGGCCGATCCCGGTACCGCccac > 2:236228/1‑129 (MQ=255) gCAGGTTCTGCGTCACTCCCAGCAGCAGGTCTTCAGGCTTGGCGCCATGGGCGGTGACGCTGCCTGGCGTTTGCAGCTCCAGGCCGATCCCGGTACCGCCCACCACAGTGAACCAGAACATGGTCACCAGCGGTGCGATGATCGACAGc < 2:121456/149‑1 (MQ=255) tGCGTCACTCCCAGCAGCAGGTCTTCAGGCTTGGCGCCATGGGCGGTGACGCTGCCTGGCGTTTGCAGCTCCAGGCCGATCCCGGTACCGCCCACCACAGTGAACCAGAACATGGTCACCAGCGGTGCGATGATc < 1:93706/135‑1 (MQ=255) tGCGTCACTCCCAGCAGCAGGTCTTCAGGCTTGGCGCCATGGGCGGTGACGCTGCCTGGCGTTTGCAGCTCCAGGCCGATCCCGGTACCGCCCACCACAGTGAACCAGAACATGGTCACCAGCGGTGCGATGATc > 2:93706/1‑135 (MQ=255) tCCCAGCAGCAGGTCTTCAGGCTTGGCGCCATGGGCGGTGACGCTGCCTGGCGTTTGCAGCTCCAGGCCGATCCCGGTACCGCCCACCACAGTGAACCAGAACATGGTCACCAGCGGTGCGATGATCGACAGCGTCATGATGATCTcgc > 3:18505/1‑149 (MQ=255) tCCCAGCAGCAGGTCTTCAGGCTTGGCGCCATGGGCGGTGACGCTGCCTGGCGTTTGCAGCTCCAGGCCGATCCCGGTACCGCCCACCACAGTGAACCAGAACATGGTCACCAGCGGTGCGATGATCGACAGCGTCATGATGATCTcgc > 6:118400/1‑149 (MQ=255) ccAGCAGCAGGTCTTCAGGCTTGGCGCCATGGGCGGTGACGCTGCCTGGCGTTTGCAGCTCCAGGCCGATCCCGGTACCGCCCACCACAGTGAACCAGAACATGGTCACCAGCGGTGCGATGATCGACAGCGTCATGATGATCTcgcg > 5:124018/1‑148 (MQ=255) gcagGTCTTCAGGCTTGGCGCCATGGGCGGTGACGCTGCCTGGCGTTTGCAGCTCCAGGCCGATCCCGGTACCGCCCACCACAGTGAACCAGAACATGGTCACCAGCGGTGCGATGATCGACAGCGTCATGATGATCTCGCGGATGGTg < 3:276071/149‑1 (MQ=255) cagGTCTTCAGGCTTGGCGCCATGGGCGGTGACGCTGCCTGGCGTTTGCAGCTCCAGGCCGATCCCGGTACCGCCCACCACAGTGAACCAGAACATGGTCACCAGCGGTGCgatgat < 4:742/117‑1 (MQ=255) cagGTCTTCAGGCTTGGCGCCATGGGCGGTGACGCTGCCTGGCGTTTGCAGCTCCAGGCCGATCCCGGTACCGCCCACCACAGTGAACCAGAACATGGTCACCAGCGGTGCgatgat > 3:742/1‑117 (MQ=255) gTCTTCAGGCTTGGCGCCATGGGCGGTGACGCTGCCTGGCGTTTGCAGCTCCAGGCCGATCCCGGTACCGCCCACCACAGTGAACCAGAACATGGTCACCAGCGGTGCGATGATCGACAGCGTCATGATGATCTCGCGGATg > 3:16775/1‑142 (MQ=255) gTCTTCAGGCTTGGCGCCATGGGCGGTGACGCTGCCTGGCGTTTGCAGCTCCAGGCCGATCCCGGTACCGCCCACCACAGTGAACCAGAACATGGTCACCAGCGGTGCGATGATCGACAGCGTCATGATGATCTCGCGGATg < 4:16775/142‑1 (MQ=255) ttCAGGCTTGGCGCCATGGGCGGTGACGCTGCCTGGCGTTTGCAGCTCCAGGCCGATCCCGGTACCGCCCACCACAGTGAACCAGAACATGGTCACCAGCGGTGCGATGATCGCCAGCGTCATGATGATCTCGCGGATGGTGCGGcccc > 2:301615/1‑149 (MQ=255) cAGGCTTGGCGCCATGGGCGGTGACGCTGCCTGGCGTTTGCAGCTCCAGGCCGATCCCGGTACCGCCCACCACAGTGAACCAGAACATGGTCACCAGCGGTGCGATGATCGACAGCGTCATGATGATCTCGCGGATGGTGCGGCCCcgc > 6:170596/1‑149 (MQ=255) cAGGCTTGGCGCCATGGGCGGTGACGCTGCCTGGCGTTTGCAGCTCCAGGCCGATCCCGGTACCGCCCACCACAGTGAACCAGAACATGGTCACCAGCGGTGCGATGATCGACAGCGTCATGATGATCTCGCGGATGGTGCGGCCCcgc > 1:197477/1‑149 (MQ=255) gCTTGGCGCCATGGGCGGTGACGCTGCCTGGCGTTTGCAGCTCCAGGCCGATCCCGGTACCGCCCACCACAGTGAACCAGAACATGGTCACCAGCGGTGCGATGATCGACAGCGTCATGATGATCTCGCGGATGGTGCGGCCCcgc > 5:85994/1‑146 (MQ=255) ttGGCGCCATGGGCGGTGACGCTGCCTGGCGTTTGCAGCTCCAGGCCGATCCCGGTACCGCCCACCACAGTGAACCAGAACATGGTCACCAGCGGTGCGATGATCGACAGCGTCat < 1:75544/116‑1 (MQ=255) ttGGCGCCATGGGCGGTGACGCTGCCTGGCGTTTGCAGCTCCAGGCCGATCCCGGTACCGCCCACCACAGTGAACCAGAACATGGTCACCAGCGGTGCGATGATCGACAGCGTCat > 2:75544/1‑116 (MQ=255) tgtggtgggcggtacagggatcggcctggagctgcaaacgccaggcagcgtcacagcccaCCACAGTGAACCAGAACATGGTCACCAGCGGTGCGATGATCGACAGCGTCATGATGATCTCGCGGATGGTGCGGCCCCGCGAGATCcgc > 6:305802‑M2/61‑149 (MQ=255) cATGGGCGGTGACGCTGCCTGGCGTTTGCAGCTCCAGGCCGATCCCGGTACCGCCCACCACAGTGAACCAGAACATGGTCACCAGCGGTGCGATGATCGACAGCGTCATGATGATCTCGCGGATGGTGCGGCCCCGCGAGATCcgcgc > 2:57380/1‑148 (MQ=255) tgggcggtaccgggatcggcctggagctgcaaacgccaggcagcgtcaccgcccaCCACAGTGAACCAGAACATGGTCACCAGCGGTGCGATGATCGACAGCGt > 3:199595‑M2/56‑104 (MQ=255) tgggcggtaccgggatcggcctggagctgcaaacgccaggcagcgtcaccgcccaCCACAGTGAACCAGAACATGGTCACCAGCGGTGCGATGATCGACAGCGt < 4:199595‑M2/49‑1 (MQ=255) tgggcggtaccgggatcggcctggagctgcaaacgccaggcagcgtcaccgcccaCCACAGTGAACCAGAACATGGTCACCAGCGGTGCGATGATCGACAGCGTCATGATGATCTCGCGGATGGTGCGGCCCCGCGAGATCCGCGCGa > 3:215138‑M2/56‑148 (MQ=255) CGGTGACGCTGCCTGGCGTTTGCAGCTCCAGGCCGATCCCGGTACCGCCCACCACAGTGAACCAGAACATGGTCACCAGCGGTGCGATGATCGACAGCGTCATGATGATCTCGCGGATGGTGCGGCCCCGCGAGATCCGCGCGACATa < 5:53442‑M1/148‑1 (MQ=255) tGGCGTTTGCAGCTCCAGGCCGATCCCGGTACCGCCCACCACAGTGAACCAGAACATGGTCACCAGCGGTGCGATGATCGACAGCGTCATGATGATCTCGCGGATGGTGCGGCCCCGCGAGATCCGCGCGACATACAGGGCCACCATgg > 2:5756/1‑149 (MQ=255) tGGCGTTTGCAGCTCCAGGCCGATCCCGGTACCGCCCACCACAGTGAACCAGAACATGGTCACCAGCGGTGCGATGATCGACAGCGTCATGATGATCTCGCGGATGGTGCGGCCCCGCGAGATCCGCGCGACATACAGGGCCACCATgg > 1:306809/1‑149 (MQ=255) cAGCTCCAGGCCGATCCCGGTACCGCCCACCACAGTGAACCAGAACATGGTCACCAGCGGTGCGATGATCGACAGCGTCATGATGATCTCGCGGATGGTGCGGCCCCGCGAGATCCGCGCGACATACAGGGCCACCATGGGCGCATAg < 1:57380/148‑1 (MQ=255) cTCCAGGCCGATCCCGGTACCGCCCACCACAGTGAACCAGAACATGGTCACCAGCGGTGCGATGATCGACAGCGTCATGATGATCTCGCGGATGGTGCGGCCCCGCGAGATCCGCGCGACATACAGGGCCACCATGGGCGCATAGCCGa < 6:53442/149‑1 (MQ=255) tCCAGGCCGATCCCGGTACCGCCCACCACAGTGAACCAGAACATGGTCACCAGCGGTGCGATGATCGACAGCGTCATGATGATCTCGCGGATGGTGCGGCCCCGCGAGATCCGCGCGACATACAGGGCCACCATGGGCGCATAGCCGa > 5:59478/1‑148 (MQ=255) tCCAGGCCGATCCCGGTACCGCCCACCACAGTGAACCAGAACATGGTCACCAGCGGTGCGATGATCGACAGCGTCATGATGATCTCGCGGATGGTGCGGCCCCGCGAGATCCGCGCGACATACAGGGCCACCATGGGCGCATAGCCGAt > 4:40043/1‑149 (MQ=255) cAGGCCGATCCCGGTACCGCCCACCACAGTTAACCAGAACATGGTCACCAGCGGTGCGATGATCGACAGCGTCATGATGATCTCGCGGATGGTGCGGCCCCGCGAGATCCGCGCGACATACAGGGCCACCATGGGCGCATAGCCGa < 6:59478/146‑1 (MQ=255) cAGGCCGATCCCGGTACCGCCCACCACAGTGAACCAGAACATGGTCACCAGCGGTGCGATGATCGACAGCGTCATGATGATCTCGCGGATGGTGCGGCCCCGCGAGATCCGCGCGACATACAGGGCCACCATGGGCGCATAGCCGAt < 6:124018/147‑1 (MQ=255) cAGGCCGATCCCGGTACCGCCCACCACAGTGAACCAGAACATGGTCACCAGCGGTGCGATGATCGACAGCGTCATGATGATCTCGCGGATGGTGCGGCCCCGCGAGATCCGCGCGACATACAGGGCCACCATGGGCGCATAGCCGATGa < 2:306809/149‑1 (MQ=255) ggCCGATCCCGGTACCGCCCACCACAGTGAACCAGAACATGGTCACCAGCGGTGCGATGATCGACAGCGTCATGATGATCTCGCGGATGGTGCGGCCCCGCGAGATCCGCGCGACATACAGGGCCACCATGGGCGCATAGCCGATGAAc < 2:197477/149‑1 (MQ=255) gATCCCGGTACCGCCCACCACAGTGAACCAGAACATGGTCACCAGCGGTGCGATGATCGACAGCGTCATGATGATCTCGCGGATGGTGCGGCCCCGCGAGATCCGCGCGACATACAGGGCCACCATGGGCGCATAGCCGATGAACCAGc < 5:170596/149‑1 (MQ=255) ccgcccaCCACAGTGAACCAGAACATGGTCACCAGCGGTGCGATGATCGACAGCGTCATGATGATCTCGCGGATGGTGCGGCCCCGCGAGATCCGCGCGACATACAGGGCCACCATGGGCGCATAGCCGATGAACCAGCCCCAATAGaa < 4:215138‑M2/142‑1 (MQ=255) cgcccaCCACAGTGAACCAGAACATGGTCACCAGCGGTGCGATGATCGACAGCGTCATGATGATCTCGCGGATGGTGCGGCCCCGCGAGATCCGCGCGACATACAGGGCCACCATGGTCGCATAGCCGATGAACCAGCCCCAATAGAac < 5:305802‑M2/143‑1 (MQ=255) gcccaCCACAGTGAACCAGAACATGGTCACCAGCGGTGCGATGATCGACAGCGTCATGATGATCTCGCGGATGGTGCGGCCCCGCGAGATCCGCGCGACATACAGGGCCACCATGGGCGCATAGCCGATGAACCAGCCCCAATAGAaca > 6:290059‑M2/6‑149 (MQ=255) gcccaCCACAGTGAACCAGAACATGGTCACCAGCGGTGCGATGATCGACAGCGTCATGATGATCTCGCGGATGGTGCGGCCCCGCGAGATCCGCGCGACATACAGGGCCACCATGGGCGCATAGCCGATGAACCAGCCCCAATAGAaca < 4:18505‑M2/144‑1 (MQ=255) | AACTTAGGAACAGGAACAGCGCGCTGACAAGGCCACCTAGTGGCAGGTTCTGCGTCACTCCCAGCAGCAGGTCTTCAGGCTTGGCGCCATGGGCGGTGACGCTGCCTGGCGTTTGCAGCTCCAGGCCGATCCCGGTACCGCCCACCACAGTGAACCAGAACATGGTCACCAGCGGTGCGATGATCGACAGCGTCATGATGATCTCGCGGATGGTGCGGCCCCGCGAGATCCGCGCGACATACAGGGCCACCATGGGCGCATAGCCGATGAACCAGCCCCAATAGAACA > NC_002947/3082789‑3083076 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |