New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3629073 = | 29 (0.590) | 4 (0.080) | 4/246 | NT | 12.0% | coding (863/1125 nt) | PP_3199 | monooxygenase |
? | NC_002947 | 3629119 = | 31 (0.650) | coding (909/1125 nt) | PP_3199 | monooxygenase |
CCTCCGCCAGCGGCTTGCCGGCTTCGGCGGGCTGATCGGCGAATTGCGCGAGCAGATCGTCGACAACGCCGGGGTCGTTTACAAGCCGCTTGAAGCGGTGTTTGTCGACGAACCCTGGTACTGCGGTCGAGTGCTGCTGATCGGGGATGCC‑‑‑‑GCCCATGCCACCACGCCACACCTGGGGCAGGGGGCAGGCATGGCCATTGAGGACGCCGTGGTGCTCGCCGAGGAGCTCACCGCGGGTGGCAGCCTCGACGCGCAATTGCAGCGTTTCATGGGCCGGCGTTTCGAGCGCTG > NC_002947/3628927‑3629217 | ccTCCGCCAGCGGCTTGCCGGCTTCGGCGGGCTGATCGGCGAATTGCGCGAGCAGATCGTCGACAACGCCGGGGTCGTTTACAAGCCGCTTGAAGCGGTGTTTGTCGACGAACCCTGGTACTGCGGTCGAGTGCTGCTGATCGGGGATg > 3:194598/1‑149 (MQ=255) gatttccttcacacctgccagcagggacatttcgctgatgaacttgcagcgctcgaaacgccggcccatgaaacgctgcaattgcgcgtcgaggctgccacccgcggtgagctcctcggcgagcaccacggcgtcctcaatggccATgc > 4:184078‑M1/146‑149 (MQ=255) cTCCGCCAGCGGCTTGCCGGCTTCGGCGGGCTGATCGGCGAATTGCGCGAGCAGATCGTCGACAACGCCGGGGTCGTTTACAAGCCGCTTGAAGCGGTGTTTGTCGACGAACCCTGGTACTGCGGTCGAGTGCTGCTGATCGGGGATgc > 1:166110/1‑149 (MQ=255) cGCCAGCGGCTTGCCGGCTTCGGCGGGCTGATCGGCGAATTGCGCGAGCAGATCGTCGACAACGCCGGGGTCGTTTACAAGCCGCTTGAAGCGGTGTTTGTCGACGAACCCTGGTACTGCGGTCGAGTGCTGCTGATCGGGGATgcc‑‑‑‑gc > 2:198544/1‑149 (MQ=255) cGCCAGCGGCTTGCCGGCTTCGGCGGGCTGATCGGCGAATTGCGCGAGCAGATCGTCGACAACGCCGGGGTCGTTTACAAGCCGCTTGAAGCGGTGTTTGTCGACGAACCCTGGTACTGCGGTCGAGTGCTGCTGATCGGGGATgcc < 2:285371/147‑1 (MQ=255) cGGCTTGCCGGCTTCGGCGGGCTGATCGGCGAATTGCGCGAGCAGATCGTCGACAACGCCGGGGTCGTTTACAAGCCGCTTGAAGCGGTGTTTGTCGACGAACCCTGGTACTGCGGTCGAGTGCTGCTGATCGGGGATGCC‑‑‑‑GCCCATGc < 1:198544/149‑1 (MQ=255) cacctgccagcagggacatttcgctgatgaacttgcagcgctcgaaacgccggcccatgaaacgctgcaattgcgcgtcgaggctgccacccgcggtgagctcctcggcgagcaccacggcgtcctcaatggccATgc > 6:26728‑M1/135‑138 (MQ=255) cacctgccagcagggacatttcgctgatgaacttgcagcgctcgaaacgccggcccatgaaacgctgcaattgcgcgtcgaggctgccacccgcggtgagctcctcggcgagcaccacggcgtcctcaatggccATgc < 5:26728‑M1/4‑1 (MQ=255) gCTTCGGCGGGCTGATCGGCGAATTGCGCGAGCAGATCGTCGACAACGCCGGGGTCGTTTACAAGCCGCTTGAAGCGGTGTTTGTCGACGAACCCTGGTACTGCGGTTGAGTGCTGCTGATCGGGGATGCC‑‑‑‑GCCCATGCCACCACGCca > 3:256651/1‑149 (MQ=255) cggGCTGATCGGCGAATTGCGCGAGCAGATCGTCGACAACGCCGGGGTCGTTTACAAGCCGCTTGAAGCGGTGTTTGTCGACGAACCCTGGTACTGCGGTTGAGTGCTGCTGATCGGGGATGCC‑‑‑‑GCCCATGCCACCACGCCACACCTgg < 4:256651/149‑1 (MQ=255) ggCTGATCGGCGAATTGCGCGAGCAGATCGTCGACAACGCCGGGGTCGTTTACAAGCCGCTTGAAGCGGTGTTTGTCGACGAACCCTGGTACTGCGGTCGAGTGCTGCTGATCGGGGATGCC‑‑‑‑GCCCATGCCACCACGCCACACCTgggg < 6:110128/149‑1 (MQ=255) gCTGATCGGCGAATTGCGCGAGCAGATCGTCGACAACGCCGGGGTCGTTTACAAGCCGCTTGAAGCGGTGTTTGTCGACGAACCCTGGTACTGCGGTCGAGTGCTGCTGATCGGGGATGCC‑‑‑‑GCCCATGCCACCACGCCACACCTgggg > 5:35774/1‑148 (MQ=255) cTGATCGGCGAATTGCGCGAGCAGATCGTCGACAACGCCGGGGTCGTTTACAAGCCGCTTGAAGCGGTGTTTGTCGACGAACCCTGGTACTGCGGTCGAGTGCTGCTGATCGGGGATGCC‑‑‑‑GCCCATGCCACCACGCCACACCTgggg > 4:284078/1‑147 (MQ=255) gCGAATTGCGCGAGCAGATCGTCGACAACGCCGGGGTCGTTTACAAGCCGCTTGAAGCGGTGTTTGTCGACGAACCCTGGTACTGCGGTCGAGTGCTGCTGATCGGGGATGCC‑‑‑‑GCCCATGCCACCCCGCCACACCTggggcaggggg > 4:38679/1‑147 (MQ=255) aacttgcagcgctcgaaacgccggcccatgaaacgctgcaattgcgcgtcgaggctgccacccgcggtgagctcctcggcgagcaccacggcgtcctcaatggccATGCCTGCCGCCCATGCCACCACGCCACACCTggggcagggggc > 6:295077‑M1/106‑149 (MQ=255) gcagcgctcgaaacgccggcccatgaaacgctgcaattgcgcgtcgaggctgccacccgcggtgagctcctcggcgagcaccacggcgtcctcaatggccATGCC‑‑‑‑GCCCATGCCACCACGCCACACCTGGGGCAGGGGGCAGGCATg > 2:101125‑M1/101‑147 (MQ=255) cgcgAGCAGATCGTCGACAACGCCGGGGTCGTTTACAAGCCGCTTGAAGCGGTGTTTGTCGACGAACCCTGGTACTGCGGTCGAGTGCTGCTGATCGGGGATGCC‑‑‑‑GCCCATGCCACCACGCCACACCTggg > 6:309160/1‑131 (MQ=255) cgcgAGCAGATCGTCGACAACGCCGGGGTCGTTTACAAGCCGCTTGAAGCGGTGTTTGTCGACGAACCCTGGTACTGCGGTCGAGTGCTGCTGATCGGGGATGCC‑‑‑‑GCCCATGCCACCACGCCACACCTggg < 5:309160/131‑1 (MQ=255) cgcgAGCAGATCGTCGACAACGCCGGGGTCGTTTACAAGCCGCTTGAAGCGGTGTTTGTCGACGAACCCTGGTACTGCGGTCGAGTGCTGCTGATCGGGGATGCC‑‑‑‑GCCCATGCCACCACGCCACACCTGGGGCAGGGGGCAGGCATgg < 6:35774/148‑1 (MQ=255) cgcgAGCAGATCGTCGACAACGCCGGGGTCGTTTACAAGCCGCTTGAAGCGGTGTTTGTCGACGAACCCTGGTACTGCGGTCGAGTGCTGCTGATCGGGGATGCC‑‑‑‑GCCCATGCCACCACGCCACACCTGGGGCAGGGGGCAGGCATgg < 3:284078/148‑1 (MQ=255) aGCAGATCGTCGACAACGCCGGGGGCGTTTACAAGCCGCTTGAAGCGGTGTTTGTCGACGAACCCTGGTACTGCGGTCGAGTGCTGCTGATCGGGGATGCC‑‑‑‑GCCCATGCCACCACGCCACACCTGGGGCAGGGGGCAGGCATGGCCAtt < 4:194598/149‑1 (MQ=255) tcgtcgACAACGCCGGGGTCGTTTACAAGCCGCTTGAAGCGGTGTTTGTCGACGAACCCTGGTACTGCGGTCGAGTGCTGCTGATCGGGGATGCC‑‑‑‑GCCCATGCCACCACGCCACACCTGGGGCAGGGGGCAGGCATGGCCATTGAGGAc > 2:227671/1‑149 (MQ=255) acgccggcccatgaaacgctgcaattgcgcgtcgaggctgccacccgcggtgagctcctcggcgagcaccacggcgtcctcaatggccATGCC‑‑‑‑GCCCATGCCACCACGCCACACCTGGGGCAGGGggcaggca > 8:256495‑M1/89‑133 (MQ=255) acgccggcccatgaaacgctgcaattgcgcgtcgaggctgccacccgcggtgagctcctcggcgagcaccacggcgtcctcaatggccATGCC‑‑‑‑GCCCATGCCACCACGCCACACCTGGGGCAGGGggcaggca < 7:256495‑M1/45‑1 (MQ=255) tCGTTTACAAGCCGCTTGAAGCGGTGTTTGTCGACGAACCCTGGTACTGCGGTCGAGTGCTGCTGATCGGGGATGCC‑‑‑‑GCCCATGCCACCACGCCACACCTGGGGCAGGGGGCAGGCATGGCCATTGAGGACGCCGTGGTGCTCGCCgag < 2:166110/149‑1 (MQ=255) tACAAGCCGCTTGAAGCGGTGTTTGTCGACGAACCCTGGTACTGCGGTCGAGTGCTGCTGATCGGGGATGCC‑‑‑‑GCCCATGCCACCACGCCACACCTGGGGCAGGGGGCAGGCATGGCCATTGAGGACGCCGTGGTGCTCGCCGAGGAGc < 3:78607/148‑1 (MQ=255) aaGCCGCTTGAAGCGGTGTTTGTCGACGAACCCTGGTACTGCGGTCGAGTGCTGCTGATCGGGGATGCC‑‑‑‑GCCCATGCCACCACGCCACACCTGGGGCAGGGGGCAGGCATGGCCATTGAGGACGCCGTGGTGCTCGCCGAGGAGCTCAc > 5:79064/1‑149 (MQ=255) gCCGCTTGAAGCGGTGTTTGTCGACGAACCCTGGTACTGCGGTCGAGTGCTGCTGATCGGGGATGCC‑‑‑‑GCCCATGCCACCACGCCACACCTgg > 4:230360/1‑92 (MQ=255) gCCGCTTGAAGCGGTGTTTGTCGACGAACCCTGGTACTGCGGTCGAGTGCTGCTGATCGGGGATGCC‑‑‑‑GCCCATGCCACCACGCCACACCTgg < 3:230360/92‑1 (MQ=255) gCCGCTTGAAGCGGTGTTTGTCGACGAACCCTGGTACTGCGGTCGAGTGCTGCTGATCGGGGATGCC‑‑‑‑GCCCATGCCACCACGCCACACCTGGGGCAGGGGGCAGGCATGGCCATTGAGGACGCCGTGGTGCTCGCCGAGGAGCTCACcg > 7:189394/1‑149 (MQ=255) ccGCTTGAAGCGGTGTTTGTCGACGAACCCTGGTACTGCGGTCGAGTGCTGCTGATCGGGGATGCC‑‑‑‑GCCCATGCCACCACGCCACACCTGGGGCAGGGGGCAGGCATGGCCATTGAGGACGCCGTGGTGCTCGCCGAGGAGCTCACcgc > 8:106299/1‑149 (MQ=255) gTCGACGAACCCTGGTACTGCGGTCGAGTGCTGCTGATCGGGGATGCC‑‑‑‑GCCCATGCCACCACGCCACACCTGGGGCAGGGGGCAGGCATGGCCATTGAGGACGCCGTGGTGCTCGCCGAGGAGCTCACCGCGGGTGGCAGCCTCGAcgc > 2:20090/1‑149 (MQ=255) tGGTACTGCGGTCGAGTGCTGCTGATCGGGGATGCC‑‑‑‑GCCCATGCCACCACGCCACACCTGGGGCAGGGGGCAGGCATGGCCATTGAGGACGCCgtg > 4:50936/1‑96 (MQ=255) tGGTACTGCGGTCGAGTGCTGCTGATCGGGGATGCC‑‑‑‑GCCCATGCCACCACGCCACACCTGGGGCAGGGGGCAGGCATGGCCATTGAGGACGCCgtg < 3:50936/96‑1 (MQ=255) ctgctgATCGGGGATGCC‑‑‑‑GCCCATGCCACCACGCCACACCTGGGGCAGGGGGCAGGCATGGCCATTGAGGACGCCGTGGTGCTCGCCGAGGAGCTCACCGCGGGTGGCAGCCTCGACGCGCAATTGCAGCGTTTCATGGGCCGGCGtt < 1:227671/148‑1 (MQ=255) gctgATCGGGGATGCC‑‑‑‑GCCCATGCCACCACGCCACACCTGGGGCAGGGGGCAGGCATGGCCATTGAGGACGCCGTGGTGCTCGCCGAGGAGCTCACCGCGGGTGGCAGCCTCGACGCGCAATTGc < 3:137198/125‑1 (MQ=255) gctgATCGGGGATGCC‑‑‑‑GCCCATGCCACCACGCCACACCTGGGGCAGGGGGCAGGCATGGCCATTGAGGACGCCGTGGTGCTCGCCGAGGAGCTCACCGCGGGTGGCAGCCTCGACGCGCAATTGc > 4:137198/1‑125 (MQ=255) ctgATCGGGGATGCC‑‑‑‑GCCCATGCCACCACGCCACACCTGGGGCAGGGGGCAGGCATGGCCATTGAGGACGCCGTGGTGCTCGCCGAGGAGCTCACCGCGGGTGGCAGCCTCGACGCGCAATTGCAGCGTTTCATGGGCCGGCGTTTCGa < 7:106299/149‑1 (MQ=255) tCGGGGATGCC‑‑‑‑GCCCATGCCACCACGCCACACCTGGGGCAGGGGGCAGGCATGGCCATTGAGGACGCCGTGGTGCTCGCCGAGGAGCTCACCGCGGGTGGCAGCCTCGACGCGCAATTGCAGCGTTTCATGGGCCGGCGTTTCGAgcgc > 8:45556/1‑149 (MQ=255) ggggTTGCC‑‑‑‑GCCCATGCCACCACGCCACACCTGGGGCAGGGGGCAGGCATGGCCATTGAGGACGCCGTGGTGCTCGCCGAGGAGCTCACCGCGGGTGGCAGCCTCGACGCGCAATTGCAGCGTTTCATGGGCCGGCGTTTCGAGCGCTg > 3:187470/1‑149 (MQ=255) gggATGCC‑‑‑‑GCCCATGCCACCACGCCACACCTGGGGCAGGGGGCAGGCATGGCCATTGAGGACGCCGTGGTGCTCGCCGAGGAGCTCACCGCGGGTGGCAGCCTCGACGCGCAATTg < 6:89160/116‑1 (MQ=255) gggATGCC‑‑‑‑GCCCATGCCACCACGCCACACCTGGGGCAGGGGGCAGGCATGGCCATTGAGGACGCCGTGGTGCTCGCCGAGGAGCTCACCGCGGGTGGCAGCCTCGACGCGCAATTg > 5:89160/1‑116 (MQ=255) | CCTCCGCCAGCGGCTTGCCGGCTTCGGCGGGCTGATCGGCGAATTGCGCGAGCAGATCGTCGACAACGCCGGGGTCGTTTACAAGCCGCTTGAAGCGGTGTTTGTCGACGAACCCTGGTACTGCGGTCGAGTGCTGCTGATCGGGGATGCC‑‑‑‑GCCCATGCCACCACGCCACACCTGGGGCAGGGGGCAGGCATGGCCATTGAGGACGCCGTGGTGCTCGCCGAGGAGCTCACCGCGGGTGGCAGCCTCGACGCGCAATTGCAGCGTTTCATGGGCCGGCGTTTCGAGCGCTG > NC_002947/3628927‑3629217 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |