New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3629073 = | 29 (0.590) | 4 (0.080) | 4/246 | NT | 12.0% | coding (863/1125 nt) | PP_3199 | monooxygenase |
? | NC_002947 | 3629119 = | 31 (0.650) | coding (909/1125 nt) | PP_3199 | monooxygenase |
CGCGAGCAGATCGTCGACAACGCCGGGGTCGTTTACAAGCCGCTTGAAGCGGTGTTTGTCGACGAACCCTGGTACTGCGGTCGAGTGCTGCTGATCGGGGATGCCGCCCATGCCACCACGCCACACCTGGGGCAGGGGGCAGGCATGGCCATTGAGGACGCCGTGGTGCTCGCCGAGGAGCTCACCGCGGGTGGCAGCCTCGACGCGCAATTGCAGCGTTTCATGGGC‑‑CGGCGTTTCGAGCGCTGCAAGTTCATCAGCGAAATGTCCCTGCTGGCAGGTGTGAAGGAAATC > NC_002947/3628973‑3629263 | gcagcgctcgaaacgccggcccatgaaacgctgcaattgcgcgtcgaggctgccacccgcggtgagctcctcggcgagcaccacggcgtcctcaatggccATGCCGCCCATGCCACCACGCCACACCTGGGGCAGGGGGCAGGCATg > 2:101125‑M1/101‑147 (MQ=255) cgcgAGCAGATCGTCGACAACGCCGGGGTCGTTTACAAGCCGCTTGAAGCGGTGTTTGTCGACGAACCCTGGTACTGCGGTCGAGTGCTGCTGATCGGGGATGCCGCCCATGCCACCACGCCACACCTGGGGCAGGGGGCAGGCATgg < 6:35774/148‑1 (MQ=255) cgcgAGCAGATCGTCGACAACGCCGGGGTCGTTTACAAGCCGCTTGAAGCGGTGTTTGTCGACGAACCCTGGTACTGCGGTCGAGTGCTGCTGATCGGGGATGCCGCCCATGCCACCACGCCACACCTGGGGCAGGGGGCAGGCATgg < 3:284078/148‑1 (MQ=255) aGCAGATCGTCGACAACGCCGGGGGCGTTTACAAGCCGCTTGAAGCGGTGTTTGTCGACGAACCCTGGTACTGCGGTCGAGTGCTGCTGATCGGGGATGCCGCCCATGCCACCACGCCACACCTGGGGCAGGGGGCAGGCATGGCCAtt < 4:194598/149‑1 (MQ=255) tcgtcgACAACGCCGGGGTCGTTTACAAGCCGCTTGAAGCGGTGTTTGTCGACGAACCCTGGTACTGCGGTCGAGTGCTGCTGATCGGGGATGCCGCCCATGCCACCACGCCACACCTGGGGCAGGGGGCAGGCATGGCCATTGAGGAc > 2:227671/1‑149 (MQ=255) tCGTTTACAAGCCGCTTGAAGCGGTGTTTGTCGACGAACCCTGGTACTGCGGTCGAGTGCTGCTGATCGGGGATGCCGCCCATGCCACCACGCCACACCTGGGGCAGGGGGCAGGCATGGCCATTGAGGACGCCGTGGTGCTCGCCgag < 2:166110/149‑1 (MQ=255) tACAAGCCGCTTGAAGCGGTGTTTGTCGACGAACCCTGGTACTGCGGTCGAGTGCTGCTGATCGGGGATGCCGCCCATGCCACCACGCCACACCTGGGGCAGGGGGCAGGCATGGCCATTGAGGACGCCGTGGTGCTCGCCGAGGAGc < 3:78607/148‑1 (MQ=255) aaGCCGCTTGAAGCGGTGTTTGTCGACGAACCCTGGTACTGCGGTCGAGTGCTGCTGATCGGGGATGCCGCCCATGCCACCACGCCACACCTGGGGCAGGGGGCAGGCATGGCCATTGAGGACGCCGTGGTGCTCGCCGAGGAGCTCAc > 5:79064/1‑149 (MQ=255) gCCGCTTGAAGCGGTGTTTGTCGACGAACCCTGGTACTGCGGTCGAGTGCTGCTGATCGGGGATGCCGCCCATGCCACCACGCCACACCTGGGGCAGGGGGCAGGCATGGCCATTGAGGACGCCGTGGTGCTCGCCGAGGAGCTCACcg > 7:189394/1‑149 (MQ=255) ccGCTTGAAGCGGTGTTTGTCGACGAACCCTGGTACTGCGGTCGAGTGCTGCTGATCGGGGATGCCGCCCATGCCACCACGCCACACCTGGGGCAGGGGGCAGGCATGGCCATTGAGGACGCCGTGGTGCTCGCCGAGGAGCTCACcgc > 8:106299/1‑149 (MQ=255) gTCGACGAACCCTGGTACTGCGGTCGAGTGCTGCTGATCGGGGATGCCGCCCATGCCACCACGCCACACCTGGGGCAGGGGGCAGGCATGGCCATTGAGGACGCCGTGGTGCTCGCCGAGGAGCTCACCGCGGGTGGCAGCCTCGAcgc > 2:20090/1‑149 (MQ=255) tGGTACTGCGGTCGAGTGCTGCTGATCGGGGATGCCGCCCATGCCACCACGCCACACCTGGGGCAGGGGGCAGGCATGGCCATTGAGGACGCCgtg > 4:50936/1‑96 (MQ=255) tGGTACTGCGGTCGAGTGCTGCTGATCGGGGATGCCGCCCATGCCACCACGCCACACCTGGGGCAGGGGGCAGGCATGGCCATTGAGGACGCCgtg < 3:50936/96‑1 (MQ=255) ctgctgATCGGGGATGCCGCCCATGCCACCACGCCACACCTGGGGCAGGGGGCAGGCATGGCCATTGAGGACGCCGTGGTGCTCGCCGAGGAGCTCACCGCGGGTGGCAGCCTCGACGCGCAATTGCAGCGTTTCATGGGC‑‑CGGCGtt < 1:227671/148‑1 (MQ=255) gctgATCGGGGATGCCGCCCATGCCACCACGCCACACCTGGGGCAGGGGGCAGGCATGGCCATTGAGGACGCCGTGGTGCTCGCCGAGGAGCTCACCGCGGGTGGCAGCCTCGACGCGCAATTGc > 4:137198/1‑125 (MQ=255) gctgATCGGGGATGCCGCCCATGCCACCACGCCACACCTGGGGCAGGGGGCAGGCATGGCCATTGAGGACGCCGTGGTGCTCGCCGAGGAGCTCACCGCGGGTGGCAGCCTCGACGCGCAATTGc < 3:137198/125‑1 (MQ=255) ctgATCGGGGATGCCGCCCATGCCACCACGCCACACCTGGGGCAGGGGGCAGGCATGGCCATTGAGGACGCCGTGGTGCTCGCCGAGGAGCTCACCGCGGGTGGCAGCCTCGACGCGCAATTGCAGCGTTTCATGGGC‑‑CGGCGTTTCGa < 7:106299/149‑1 (MQ=255) tCGGGGATGCCGCCCATGCCACCACGCCACACCTGGGGCAGGGGGCAGGCATGGCCATTGAGGACGCCGTGGTGCTCGCCGAGGAGCTCACCGCGGGTGGCAGCCTCGACGCGCAATTGCAGCGTTTCATGGGC‑‑CGGCGTTTCGAgcgc > 8:45556/1‑149 (MQ=255) ggggTTGCCGCCCATGCCACCACGCCACACCTGGGGCAGGGGGCAGGCATGGCCATTGAGGACGCCGTGGTGCTCGCCGAGGAGCTCACCGCGGGTGGCAGCCTCGACGCGCAATTGCAGCGTTTCATGGGC‑‑CGGCGTTTCGAGCGCTg > 3:187470/1‑149 (MQ=255) gggATGCCGCCCATGCCACCACGCCACACCTGGGGCAGGGGGCAGGCATGGCCATTGAGGACGCCGTGGTGCTCGCCGAGGAGCTCACCGCGGGTGGCAGCCTCGACGCGCAATTg < 6:89160/116‑1 (MQ=255) gggATGCCGCCCATGCCACCACGCCACACCTGGGGCAGGGGGCAGGCATGGCCATTGAGGACGCCGTGGTGCTCGCCGAGGAGCTCACCGCGGGTGGCAGCCTCGACGCGCAATTg > 5:89160/1‑116 (MQ=255) catgcctgccccctgccccaggtgtggcgtggtggcatgggcggcatGGCCATTGAGGACGCCGTGGTGCTCGCCGAGGAGCTCACCGCGGGTGGCAGCCTCGACGCGCAATTGCAGCGTTTCATGGGC‑‑CGGCGTTTCGAGCGCTGc > 2:101125‑M2/48‑147 (MQ=255) tgcctgccccctgccccaggtgtggcgtggtggcatgggcggcatGGCCATTGAGGACGCCGTGGTGCTCGCCGAGGAGCTCACCGCGGGTGGCAGCCTCGACGCGCAATTGCAGCGTTTCATGGGC‑‑CGGCGt > 8:256495‑M2/46‑133 (MQ=255) tgcctgccccctgccccaggtgtggcgtggtggcatgggcggcatGGCCATTGAGGACGCCGTGGTGCTCGCCGAGGAGCTCACCGCGGGTGGCAGCCTCGACGCGCAATTGCAGCGTTTCATGGGC‑‑CGGCGt < 7:256495‑M2/88‑1 (MQ=255) gccccctgccccaggtgtggcgtggtggcatgggcggcaggcatGGCCATTGAGGACGCCGTGGTGCTCGCCGAGGAGCTCACCGCGGGTGGCAGCCTCGACGCGCAATTGCAGCGTTTCATGGGC‑‑CGGCGTTTCGAGCGCTGCAAGtt > 6:295077‑M2/45‑149 (MQ=255) gccCATGCCACCACGCCACACCTGGGGCAGGGGGCAGGCATGGCCATTGAGGACGCCGTGGTGCTCGCCGAGGAGCTCACCGCGGGTGGCAGCCTCGACGCGCAATTGCAGCGTTTCATGGGC‑‑CGGCGTTTCGAGCGCTGCAAGTtcat > 8:5359/1‑149 (MQ=255) cATGCCACCACGCCACACCTGGGGCAGGGGGCAGGCATGGCCATTGAGGACGCCGTGGTGCTCGCCGAGGAGCTCACCGCGGGTGGCAGCCTCGACGCGCAATTGCAGCGTTTCATGGGc‑‑c < 5:315334/121‑1 (MQ=255) cATGCCACCACGCCACACCTGGGGCAGGGGGCAGGCATGGCCATTGAGGACGCCGTGGTGCTCGCCGAGGAGCTCACCGCGGGTGGCAGCCTCGACGCGCAATTGCAGCGTTTCATGGGc‑‑c > 6:315334/1‑121 (MQ=255) aTGCCACCACGCCACACCTGGGGCAGGGGGCAGGCATGGCCATTGAGGACGCCGTGGTGCTCGCCGAGGAGCTCACCGCGGGTGGCAGCCTCGACGCGCAATTGCAGCGTTTCATGGGC‑‑CGGCGTTTCGAGCGCTGCAAGTTCATCAGc > 2:66415/1‑149 (MQ=255) caccacGCCACACCTGGGGCAGGGGGCAGGCATGGCCATTGAGGACGCCGTGGTGCTCGCCGAGGAGCTCACCGCGGGTGGCAGCCTCGACGCGCAATTGCAGCGTTTCATGGGc‑‑c < 8:199203/116‑1 (MQ=255) caccacGCCACACCTGGGGCAGGGGGCAGGCATGGCCATTGAGGACGCCGTGGTGCTCGCCGAGGAGCTCACCGCGGGTGGCAGCCTCGACGCGCAATTGCAGCGTTTCATGGGc‑‑c > 7:199203/1‑116 (MQ=255) caccacGCCACACCTGGGGCAGGGGGCAGGCATGGCCATTGAGGACGCCGTGGTGCTCGCCGAGGAGCTCACCGCGGGTGGCAGCCTCGACGCGCAATTGCAGCGTTTCATGGGC‑‑CGGCGTTTCGAGCGCt > 1:75595/1‑131 (MQ=255) caccacGCCACACCTGGGGCAGGGGGCAGGCATGGCCATTGAGGACGCCGTGGTGCTCGCCGAGGAGCTCACCGCGGGTGGCAGCCTCGACGCGCAATTGCAGCGTTTCATGGGC‑‑CGGCGTTTCGAGCGCt < 2:75595/131‑1 (MQ=255) gggcagggggcaggCATGGCCATTGAGGACGCCGTGGTGCTCGCCGAGGAGCTCACCGCGGGTGGCAGCCTCGACGCGCAATTGCAGCGTTTCATGGGC‑‑CGGCGTTTCGAGCGCTGCAAGTTCATCAGCGAAATGTCCCTGCTGGCAg < 6:97516/148‑1 (MQ=255) ggcagggggcaggCATGGCCATTGAGGACGCCGTGGTGCTCGCCGAGGAGCTCACCGCGGGTGGCAGCCTCGACGCGCAATTGCAGCGTTTCATGGGC‑‑CGGCGTTTCGAGCGCTGCAAGTTCATCAGCGAAATGTCCCTGCTGGCAGgt < 1:20090/149‑1 (MQ=255) ggcagggggcaggCATGGCCATTGAGGACGCCGTGGTGCTCGCCGAGGAGCTCACCGCGGGTGGCAGCCTCGACGCGCAATTGCAGCGTTTCATGGGC‑‑CGGCGTTTCGAGCGCTGCAAGTTCATCAGCGAAATGTCCCTGCTGGCAGgt < 1:66415/149‑1 (MQ=255) agggggcaggCATGGCCATTGAGGACGCCGTGGTGCTCGCCGAGGAGCTCACCGCGGGTGGCAGCCTCGACGCGCAAATGCAGCGGTTCATGGGCGGTGGCGTTTAGAGCGCTGGAAATTAATAAGCGAAATTTACCAGCTGGCAGgtg > 1:102209/1‑149 (MQ=255) ggggcaggCATGGCCATTGAGGACGCCGTGGTGCTCGCCGAGGAGCTCACCGCGGGTGGCAGCCTCGACGCGCAATTGCAGCGTTTCATGGGC‑‑CGGCGTTTCGAGCGCTGCAAGTTCATCAGCGAAATGTCCCTGCTGGCAGGTGTGaa < 4:187470/149‑1 (MQ=255) caggcaTGGCCATTGAGGACGCCGTGGTGCTCGCCGAGGAGCTCACCGCGGGTGGCAGCCTCGACGCGCAATTGCAGCGTTTCATGGGC‑‑CGGCGTTTCGAGCGCTGCAAGTTCATCAGCGAAATGTCCCTGCTGGCAGGTGTGAAGGa > 3:131582/1‑148 (MQ=255) aggcaTGGCCATTGAGGACGCCGTGGTGCTCGCCGAGGAGCTCACCGCGGGTGGCAGCCTCGACGCGCAATTGCAGCGTTTCATGGGC‑‑CGGCGTTTCGAGCGCTGCAAGTTCATCAGCGAAATGTCCCTGCTGGCAGGTGTGAAGGaaa < 4:131582/149‑1 (MQ=255) gcatGGCCATTGAGGACGCCGTGGTGCTCGCCGAGGAGCTCACCGCGGGTGGCAGCCTCGACGCGCAATTGCAGCGTTTCATGGGC‑‑CGGCGTTTCGAGCGCTGCAAGTTCATCAGCGAAATGTCCCTGCTGGCAGgtg > 6:26728‑M2/5‑138 (MQ=255) gcatGGCCATTGAGGACGCCGTGGTGCTCGCCGAGGAGCTCACCGCGGGTGGCAGCCTCGACGCGCAATTGCAGCGTTTCATGGGC‑‑CGGCGTTTCGAGCGCTGCAAGTTCATCAGCGAAATGTCCCTGCTGGCAGgtg < 5:26728‑M2/134‑1 (MQ=255) gcatGGCCATTGAGGACGCCGTGGTGCTCGCCGAGGAGCTCACCGCGGGTGGCAGCCTCGACGCGCAATTGCAGCGTTTCATGGGC‑‑CGGCGTTTCGAGCGCTGCAAGTTCATCAGCGAAATGTCCCTGCTGGCAGGTGTGAAGGAAATc > 4:184078‑M2/5‑149 (MQ=255) | CGCGAGCAGATCGTCGACAACGCCGGGGTCGTTTACAAGCCGCTTGAAGCGGTGTTTGTCGACGAACCCTGGTACTGCGGTCGAGTGCTGCTGATCGGGGATGCCGCCCATGCCACCACGCCACACCTGGGGCAGGGGGCAGGCATGGCCATTGAGGACGCCGTGGTGCTCGCCGAGGAGCTCACCGCGGGTGGCAGCCTCGACGCGCAATTGCAGCGTTTCATGGGC‑‑CGGCGTTTCGAGCGCTGCAAGTTCATCAGCGAAATGTCCCTGCTGGCAGGTGTGAAGGAAATC > NC_002947/3628973‑3629263 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |