New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3693203 = | 34 (0.690) | 3 (0.070) | 3/236 | NT | 8.1% | coding (423/1044 nt) | PP_3259 | acyl‑CoA dehydrogenase‑related protein |
? | NC_002947 | 3693283 = | 37 (0.810) | coding (343/1044 nt) | PP_3259 | acyl‑CoA dehydrogenase‑related protein |
CCTGGGGTATCGTTGAACGCCACCTCGACACTGGCGGTAGTGGCCATGCCAACGGCCTGCCAGTGCTCAATGTTCAGGCCCTGGCTTGGCTGTGACAGCTCGATTGCCACCAATTGCGGCTGCTCGGCCTCATCCCAGGCAGTAATCAGCGCGCGATCGATCTGCAAGGCACCGGAACACCAGGCCTTGGTGCCGTTGAGACGCACCTGGTCGCCGTCGCGCGCTGTGATGTGGACCCGCGCATCGGGTGGCTCTGCCGCCCACACGCCCCAGATGCCGTCGTTGGCGTGGTG > NC_002947/3693057‑3693349 | ccTGGGGTATCGTTGAACGCCACCTCGACACTGGCGGTAGTGGCCATGCCAACGGCCTGCCAGTGCTCAATGTTCAGGCCCTGGCTTGGCTGTGACAGCTCGATTGCCACCAATTGCGGCTGCTCGGCCTCATCCCAGGCAGTAATCa < 2:300762/148‑1 (MQ=255) ggctgtgacctggcactggccaagctctatgagggccataccgatgccttggcgatcctggcggaatgcggcgcagcgcaccacgccaacgacggcatctggggcgtgtgggcggcagagccacccgatgcgcgggtccacatcaCAgc < 6:142078‑M1/4‑1 (MQ=255) ggctgtgacctggcactggccaagctctatgagggccataccgatgccttggcgatcctggcggaatgcggcgcagcgcaccacgccaacgacggcatctggggcgtgtgggcggcagagccacccgatgcgcgggtccacatcaCAgc < 6:209879‑M1/4‑1 (MQ=255) gctgtgacctggcactggccaagctctatgagggccataccgatgccttggcgatcctggcggaatgcggcgcagcgcaccacgccaacgacggcatctggggcgtgtgggcggcagagccacccgatgcgcgggtccacatcaCAgcg < 4:77783‑M1/5‑1 (MQ=255) tCGTTGAACGCCACCTCGACACTGGCGGTAGTGGCCATGCCAACGGCCTGCCAGTGCTCAATGTTCAGGCCCTGGCTTGGCTGTGACAGCTCGATTGCCACCAATTGCGGCTGCTCGGGCTCATCCCAGGCAGTAATGAGCGCGcgatc < 2:680/149‑1 (MQ=255) cGTTGAACGCCACCTCGACACTGGCGGTAGTGGCCATGCCAACGGCCTGCCAGTGCTCAATGTTCAGGCCCTGGCTTGGCTGTGACAGCTCGATTGCCACCAATTGCGGCTGCTCGGCCTCATCCCAGGCAGTAATCAGCGCGcgatc > 4:27451/1‑148 (MQ=255) ttGAACGCCACCTCGACACTGGCGGTAGTGGCCATGCCAACGGCCTGCCAGTGCTCAATGTTCAGGCCCTGGCTTGGCTGTGACAGCTCGATTGCCACCAATTGCGGCTGCTCGGCCTCATCCCAGGCAGTAATCAGCGCGcgatcgat > 4:289511/1‑149 (MQ=255) gCCACCTCGACACTGGCGGTAGTGGCCATGCCAACGGCCTGCCAGTGCTCAATGTTCAGGCCCTGGCTTGGCTGTGACAGCTCGATTGCCACCAATTGCGGCTGCTCGGCCTCATCCCAGGCAGTAATCAGCGCGCGATCGATCTGCaa < 4:210335/149‑1 (MQ=255) tCGACACTGGCGGTAGTGGCCATGCCAACGGCCTGCCAGTGCTCAATGTTCAGGCCCTGGCTTGGCTGTGACAGCTCGATTGCCACCAATTGCGGCTGCTCGGCCTCATCCCAGGCAGTAATCAGCGCGCGATCGATCTGCAAGGCAcc > 5:125243/1‑149 (MQ=255) acTGGCGGTAGTGGCCATGCCAACGGCCTGCCAGTGCTCAATGTTCAGGCCCTGGCTTGGCTGTGACAGCTCGATTGCCACCAATTGCGGCTGCTCGGCCTCATCCCAGGCAGTAATCAGCGCGCGATCGATCTGCAAGGCACCGGaa > 7:253833/1‑148 (MQ=255) cGGTAGTGGCCATGCCAACGGCCTGCCAGTGCTCAATGTTCAGGCCCTGGCTTGGCTGTGACAGCTCGATTGCCACCAATTGCGGCTGCTCGGCCTCATCCCAGGCAGTAATCAGCGCGCGATCGATCTGCAAGGCACCGGAACACCAg < 8:269955/149‑1 (MQ=255) ggTAGTGGCCATGCCAACGGCCTGCCAGTGCTCAATGTTCAGGCCCTGGCTTGGCTGTGACAGCTCGATTGCCACCAATTGCGGCTGCTCGGCCTCATCCCAGGCAGTAATCAGCGCGCGATCGATCTGCAAGGCACCGGAACACCAgg < 4:5654/149‑1 (MQ=255) tGGCCATGCCAACGGCCTGCCAGTGCTCAATGTTCAGGCCCTGGCTTGGCTGTGACAGCTCGATTGCCACCAATTGCGGCTGCTCGGCCTCATCCCAGGCAGTAATCAGCGCGCGATCGATCTGCAAGGCACCGGAACACCAGGCCTTg < 3:27451/149‑1 (MQ=255) gCCATGCCAACGGCCTGCCAGTGCTCAATGTTCAGGCCCTGGCTTGGCTGTGACAGCTCGATTGCCACCAATTGCGGCTGCTCGGCCTCATCCCAGGCAGTAATCAGCGCGCGATCGATCTGCAAGGCACCGGAACACCAGGCCTTgg < 8:253833/148‑1 (MQ=255) gCCATGCCAACGGCCTGCCAGTGCTCAATGTTCAGGCCCTGGCTTGGCTGTGACAGCTCGATTGCCACCAATTGCGGCTGCTCGGCCTCATCCCAGGCAGTAATCAGCGCGCGATCGATCTGCAAGGCACCGGAACACCAGGCCTTGGt < 5:122742/149‑1 (MQ=255) gCCATGCCAACGGCCTGCCAGTGCTCAATGTTCAGGCCCTGGCTTGGCTGTGACAGCTCGATTGCCACCAATTGCGGCTGCTCGGCCTCATCCCAGGCAGTAATCAGCGCGCGATCGATCTGCAAGGCACCGGAACACCAGGCCTTGGt > 6:50442/1‑149 (MQ=255) cATGCCAACGGCCTGCCAGTGCTCAATGTTCAGGCCCTGGCTTGGCTGTGACAGCTCGATTGCCACCAATTGCGGCTGCTCGGCCTCATCCCAGGCAGTAATCAGCGCGCGATCGATCTGCAAGGCACCGGCACACCAGGCCTTGGTGc > 7:106332/1‑149 (MQ=255) ccAACGGCCTGCCAGTGCTCAATGTTCAGGCCCTGGCTTGGCTGTGACAGCTCGATTGCCACCAATTGCGGCTGCTCGGCCTCATCCCAGGCAGTAATCAGCGCGCGATCGATCTGCAAGGCACCGGAACACCAGGCCTTGGTGCCGt < 8:153096/148‑1 (MQ=255) tggcgatcctggcggaatgcggcgcagcgcaccacgccaacgacggcatctggggcgtgtgggcggcagagccacccgatgcgcgggtccacatcaCAg > 2:56110‑M1/97‑99 (MQ=255) tggcgatcctggcggaatgcggcgcagcgcaccacgccaacgacggcatctggggcgtgtgggcggcagagccacccgatgcgcgggtccacatcaCAg < 1:56110‑M1/3‑1 (MQ=255) gcggaatgcggcgcagcgcaccacgccaacgacggcatctggggcgtgtgggcggcagagccacccgatgcgcgggtccacatcaCAGCGCGCGATCGATCTGCAAGGCACCGGAACACCAGGCCTTGGTGCCGTTGAGACGCACCTgg < 2:166859‑M1/64‑1 (MQ=255) tCAATGTTCAGGCCCTGGCTTGGCTGTGACAGCTCGATTGCCACCAATTGCGGCTGCTCGGCCTCATCCCAGGCAGTAATCAGCTCGCGATCGATCTGCAAGGCACCGGAACACCAGGCCTTGGTGCCGTTGAGACGCACCTGGTCGcc > 2:210560/1‑149 (MQ=255) tCAATGTTCAGGCCCTGGATTGGCTGTGACAGCTCGATTGCCACCAATTGCGGCTGCTCGGCCTCATCCCAGGCAGTAATCAGCGCGCGATCGATCTGCAAGGCACCGGAACACCAGGCCTTGGTGCCGTTGAGACGCACCTGGTCg > 4:103278/1‑147 (MQ=255) aaTGTTCAGGCCCTGGCTTGGCTGTGACAGCTCGATTGCCACCAATTGCGGCTGCTCGGCCTCATCCCAGGCAGTAATCAGCGCGCGATCGATCTGCaa > 5:18925/1‑99 (MQ=255) aaTGTTCAGGCCCTGGCTTGGCTGTGACAGCTCGATTGCCACCAATTGCGGCTGCTCGGCCTCATCCCAGGCAGTAATCAGCGCGCGATCGATCTGCaa < 6:18925/99‑1 (MQ=255) aaTGTTCAGGCCCTGGCTTGGCTGTGACAGCTCGATTGCCACCAATTGCGGCTGCTCGGCCTCATCCCAGGCAGTAATCAGCGCGCGATCGATCTGCAAGGCACCGGAACACCAGGCCTTGGTGCCGTTGAGACGCACCTGGTCGCCGt > 7:28586/1‑149 (MQ=255) tGTTCAGGCCCTGGCTTGGCTGTGACAGCTCGATTGCCACCAATTGCGGCTGCTCGGCCTCATCCCAGGCAGTAATCAGCGCGCGATCGATCTGCAAGGCACCGGAACACCAGGCCTTGGTGCCGTTGAGACGCACCTGGTCGCCGTcg > 6:56250/1‑149 (MQ=255) gcgcaccacgccaacgacggcatctggggcgtgtgggcggcagagccacccgatgcgcgggtccacatcaCAGCGCGCGATCGATCTGCAAGGCACCGGAACACCAGGCCTTGGTGCCGTTGAGACGCACCTGGTCGCCGTCGCGCGCt > 5:209879‑M1/71‑149 (MQ=255) cccTGGCTTGGCTGTGACAGCTCGATTGCCACCAATTGCGGCTGCTCGGCCTCATCCCAGGCAGTAATCAGCGCGCGATCGATCTGCAAGGCACCGGAACACCAGGCCTTGGTGCCGTTGAGACGCACCTGGTCGCCGTCGCGCGCtgt < 3:279947/149‑1 (MQ=255) ccacgccaacgacggcatctggggcgtgtgggcggcagagccacccgatgcgcgggtccacatcaCAGCGCGCGATCGATCTGCAAGGCACCGGAACACCAGGCCTTGGTGCCGTTGAGACGCACCTGGTCGCCGTCGCGCGCTGTGAt > 1:166859‑M1/66‑149 (MQ=255) gcttggctGTGACAGCTCGATTGCCACCAATTGCGGCTGCTCGGCCTCATCCCAGGCAGTAATCAGCGCGCGATCGATCTGCAAGGCACCGGAACACCAGGCCTTGGTGCCGTTGAGACGCACCTGGTCGCCGTCGCGCGCTGTGAt < 3:301908/147‑1 (MQ=255) gATTGCCACCAATTGCGGCTGCTCGGCCTCATCCCAGGCAGTAATCAGCGCGCGATCGATCTGCAAGGCACCGGAACACCAGGCCTTGGTGCCGTTGAGACGCACCTGGTCGCCGTCGCGCGCTGTGATGTGGACCCGCGCATCggg < 8:28586/147‑1 (MQ=255) gATTGCCACCAATTGCGGCTGCTCGGCCTCATCCCAGGCAGTAATCAGCGCGCGATCGATCTGCAAGGCACCGGAACACCAGGCCTTGGTGCCGTTGAGACGCACCTGGTCGCCGTCGCGCGCTGTGATGTGGACCCGCGCATCGGGTg < 1:210560/149‑1 (MQ=255) ccaccaATTGCGGCTGCTTGGCCTCATCCCAGGCAGTAATCAGCGCGCGATCGATCTGCAAGGCACCGGAACACCAGGCCTTGGTGCCGTTGAGACGCACCTGGTCGCCGTCGCGCGCTGTGATGTGGACCCGCGCATCGGGTGGctct > 5:145556/1‑149 (MQ=255) ccaccaATTGCGGCTGCTCGGCCTCATCCCAGGCAGTAATCAGCGCGCGATCGATCTGCAAGGCACCGGAACACCAGGCCTTGGTGCCGTTGAGACGCACCTGGTCGCCGTCGCGCGCTGTGATGTGGACCCGCGCATCGGGTGGctct > 4:171241/1‑149 (MQ=255) caccaATTGCGGCTGCTCGGCCTCATCCCAGGCAGTAATCAGCGCGCGATCGATCTGCAAGGCACCGGAACACCAGGCCTTGGTGCCGTTGAGACGCACCTGGTCGCCGTCGCGCGCTGTGATGTGGACCCGCGCATCGGGTGGCTCTg < 3:289511/149‑1 (MQ=255) accaATTGCGGCTGCTCGGCCTCATCCCAGGCAGTAATCAGCGCGCGATCGATCTGCAAGGCACCGGAACACCAGGCCTTGGTGCCGTTGAGACGCACCTGGTCGCCGTCGCGCGCTGTGATGTGGACCCGCGCATCGGGTGGCTCTgc > 3:262557/1‑149 (MQ=255) caATTGCGGCTGCTCGGCCTCATCCCAGGCAGTAATCAGCGCGCGATCGATCTGCAAGGCACCGGAACACCAGGCCTTGGTGCCGTTGAGACGCACCTGGTCGCCGTCGCGCGCTGTGATGTGGACCCGCGCATCGGGTGGCTCTgccg > 1:12149/1‑149 (MQ=255) cTCATCCCAGGCAGTAATCAGCGCGCGATCGATCTGCAAGGCACCGGAACACCAGGCCTTGGTGCCGTTGAGACGCACCTGGTCGCCGTCGCGCGCTGTGATGTGGACCCGCGCATCGGGTGGCTCTGCCGCCCACACGCCCCAGATGc > 5:90446/1‑149 (MQ=255) tgaTCCCAGGCAGTTATGAGCGCGCGATCGAGCTGCATGTCACGGGAACAGCAGGGGTTGGTGGCGTTGAGACGCTCCTGGTCGGCGTCGCGCGCTGTGATGTGAACCCGCGCATAGGGTGGCTCTGCCGCCCTCACGcc < 6:159991/138‑1 (MQ=255) tCATCCCAGGCAGTAATCAGCGCGCGATCGATCTGCAAGGAACCGGAACACCAGGCCTTGGTGCCGTTGAGACGCACCTGGTCGCCGTCGCGCGCTGTGATGTGAACACGCGCATCGGGTGGCTCTGCCGCCCCCCCGcccagatagg > 5:159991/1‑141 (MQ=255) aGTAATCAGCGCGCGATCGATCTGCAAGGCACCGGAACACCAGGCCTTGGTGCCGTTGAGACGCACCTGGTCGCCGTCGCGCGCTGTGATGTGGACCCGCGCATCGGGTGGCTCTGCCGCCCACACGcccc > 7:12966/1‑131 (MQ=255) aGTAATCAGCGCGCGATCGATCTGCAAGGCACCGGAACACCAGGCCTTGGTGCCGTTGAGACGCACCTGGTCGCCGTCGCGCGCTGTGATGTGGACCCGCGCATCGGGTGGCTCTGCCGCCCACACGcccc < 8:12966/131‑1 (MQ=255) aTCAGCGCGCGATCGATCTGCAAGGCACCGGAACACCAGGCCTTGGTGCCGTTGAGACGCACCTGGTCGCCGTCGCGCGCTGTGATGTGGACCCGCGCATCGGGTGGCTCTGCCGCCCACACGCCCCAGATGCCGTCGTTGGCgtggtg < 5:56250/149‑1 (MQ=255) aTCAGCGCGCGATCGATCTGCAAGGCACCGGAACACCAGGCCTTGGTGCCGTTGAGACGCACCTGGTCGCCGTCGCGCGCTGTGATGTGGACCCGCGCATCGGGTGGCTCTGCCGCCCACACGCCCCAGATGCCGTCGTTGGCgtggtg > 3:119248/1‑149 (MQ=255) | CCTGGGGTATCGTTGAACGCCACCTCGACACTGGCGGTAGTGGCCATGCCAACGGCCTGCCAGTGCTCAATGTTCAGGCCCTGGCTTGGCTGTGACAGCTCGATTGCCACCAATTGCGGCTGCTCGGCCTCATCCCAGGCAGTAATCAGCGCGCGATCGATCTGCAAGGCACCGGAACACCAGGCCTTGGTGCCGTTGAGACGCACCTGGTCGCCGTCGCGCGCTGTGATGTGGACCCGCGCATCGGGTGGCTCTGCCGCCCACACGCCCCAGATGCCGTCGTTGGCGTGGTG > NC_002947/3693057‑3693349 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |