New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3693203 = | 34 (0.690) | 3 (0.070) | 3/236 | NT | 8.1% | coding (423/1044 nt) | PP_3259 | acyl‑CoA dehydrogenase‑related protein |
? | NC_002947 | 3693283 = | 37 (0.810) | coding (343/1044 nt) | PP_3259 | acyl‑CoA dehydrogenase‑related protein |
CCCTGGCTTGGCTGTGACAGCTCGATTGCCACCAATTGCGGCTGCTCGGCCTCATCCCAGGCAGTAATCAGCGCGCGATCGATCTGCAAGGCACCGGAACACCAGGCCTTGGTGCCGTTGAGACGCACCTGGTCGCCGTCGCGCGCTGTGATGTGGACCCGCGCATCGGGTGGCTCTG‑CCGCCCACACGCCCCAGATGCCGTCGTTGGCGTGGTGCGCTGCGCCGCATTCCGCCAGGATCGCCAAGGCATCGGTATGGCCCTCATAGAGCTTGGCCAGTGCCAGGTCACAGCCGG > NC_002947/3693135‑3693429 | cccTGGCTTGGCTGTGACAGCTCGATTGCCACCAATTGCGGCTGCTCGGCCTCATCCCAGGCAGTAATCAGCGCGCGATCGATCTGCAAGGCACCGGAACACCAGGCCTTGGTGCCGTTGAGACGCACCTGGTCGCCGTCGCGCGCtgt < 3:279947/149‑1 (MQ=255) ccacgccaacgacggcatctggggcgtgtgggcggcagagccacccgatgcgcgggtccacatcaCAGCGCGCGATCGATCTGCAAGGCACCGGAACACCAGGCCTTGGTGCCGTTGAGACGCACCTGGTCGCCGTCGCGCGCTGTGAt > 1:166859‑M1/66‑149 (MQ=255) gcttggctGTGACAGCTCGATTGCCACCAATTGCGGCTGCTCGGCCTCATCCCAGGCAGTAATCAGCGCGCGATCGATCTGCAAGGCACCGGAACACCAGGCCTTGGTGCCGTTGAGACGCACCTGGTCGCCGTCGCGCGCTGTGAt < 3:301908/147‑1 (MQ=255) gATTGCCACCAATTGCGGCTGCTCGGCCTCATCCCAGGCAGTAATCAGCGCGCGATCGATCTGCAAGGCACCGGAACACCAGGCCTTGGTGCCGTTGAGACGCACCTGGTCGCCGTCGCGCGCTGTGATGTGGACCCGCGCATCggg < 8:28586/147‑1 (MQ=255) gATTGCCACCAATTGCGGCTGCTCGGCCTCATCCCAGGCAGTAATCAGCGCGCGATCGATCTGCAAGGCACCGGAACACCAGGCCTTGGTGCCGTTGAGACGCACCTGGTCGCCGTCGCGCGCTGTGATGTGGACCCGCGCATCGGGTg < 1:210560/149‑1 (MQ=255) ccaccaATTGCGGCTGCTTGGCCTCATCCCAGGCAGTAATCAGCGCGCGATCGATCTGCAAGGCACCGGAACACCAGGCCTTGGTGCCGTTGAGACGCACCTGGTCGCCGTCGCGCGCTGTGATGTGGACCCGCGCATCGGGTGGctct > 5:145556/1‑149 (MQ=255) ccaccaATTGCGGCTGCTCGGCCTCATCCCAGGCAGTAATCAGCGCGCGATCGATCTGCAAGGCACCGGAACACCAGGCCTTGGTGCCGTTGAGACGCACCTGGTCGCCGTCGCGCGCTGTGATGTGGACCCGCGCATCGGGTGGctct > 4:171241/1‑149 (MQ=255) caccaATTGCGGCTGCTCGGCCTCATCCCAGGCAGTAATCAGCGCGCGATCGATCTGCAAGGCACCGGAACACCAGGCCTTGGTGCCGTTGAGACGCACCTGGTCGCCGTCGCGCGCTGTGATGTGGACCCGCGCATCGGGTGGCTCTg < 3:289511/149‑1 (MQ=255) accaATTGCGGCTGCTCGGCCTCATCCCAGGCAGTAATCAGCGCGCGATCGATCTGCAAGGCACCGGAACACCAGGCCTTGGTGCCGTTGAGACGCACCTGGTCGCCGTCGCGCGCTGTGATGTGGACCCGCGCATCGGGTGGCTCTg‑c > 3:262557/1‑149 (MQ=255) caATTGCGGCTGCTCGGCCTCATCCCAGGCAGTAATCAGCGCGCGATCGATCTGCAAGGCACCGGAACACCAGGCCTTGGTGCCGTTGAGACGCACCTGGTCGCCGTCGCGCGCTGTGATGTGGACCCGCGCATCGGGTGGCTCTg‑ccg > 1:12149/1‑149 (MQ=255) cTCATCCCAGGCAGTAATCAGCGCGCGATCGATCTGCAAGGCACCGGAACACCAGGCCTTGGTGCCGTTGAGACGCACCTGGTCGCCGTCGCGCGCTGTGATGTGGACCCGCGCATCGGGTGGCTCTG‑CCGCCCACACGCCCCAGATGc > 5:90446/1‑149 (MQ=255) tgaTCCCAGGCAGTTATGAGCGCGCGATCGAGCTGCATGTCACGGGAACAGCAGGGGTTGGTGGCGTTGAGACGCTCCTGGTCGGCGTCGCGCGCTGTGATGTGAACCCGCGCATAGGGTGGCTCTG‑CCGCCCTCACGcc < 6:159991/138‑1 (MQ=255) tCATCCCAGGCAGTAATCAGCGCGCGATCGATCTGCAAGGAACCGGAACACCAGGCCTTGGTGCCGTTGAGACGCACCTGGTCGCCGTCGCGCGCTGTGATGTGAACACGCGCATCGGGTGGCTCTG‑CCGCCCCCCCGcccagatagg > 5:159991/1‑141 (MQ=255) aGTAATCAGCGCGCGATCGATCTGCAAGGCACCGGAACACCAGGCCTTGGTGCCGTTGAGACGCACCTGGTCGCCGTCGCGCGCTGTGATGTGGACCCGCGCATCGGGTGGCTCTG‑CCGCCCACACGcccc > 7:12966/1‑131 (MQ=255) aGTAATCAGCGCGCGATCGATCTGCAAGGCACCGGAACACCAGGCCTTGGTGCCGTTGAGACGCACCTGGTCGCCGTCGCGCGCTGTGATGTGGACCCGCGCATCGGGTGGCTCTG‑CCGCCCACACGcccc < 8:12966/131‑1 (MQ=255) atcacagcgcgcgacggcgaccaggtgcgtctcaacggcaccaaggcctggtgttccggtgccttgcagatcgatcgcgcgctgTGATGTGGACCCGCGCATCGGGTGGCTCTG‑CCGCCCACACGCCCCAGATGCCGTCGTTGGCgtgg > 1:166859‑M2/85‑149 (MQ=255) aTCAGCGCGCGATCGATCTGCAAGGCACCGGAACACCAGGCCTTGGTGCCGTTGAGACGCACCTGGTCGCCGTCGCGCGCTGTGATGTGGACCCGCGCATCGGGTGGCTCTG‑CCGCCCACACGCCCCAGATGCCGTCGTTGGCgtggtg < 5:56250/149‑1 (MQ=255) aTCAGCGCGCGATCGATCTGCAAGGCACCGGAACACCAGGCCTTGGTGCCGTTGAGACGCACCTGGTCGCCGTCGCGCGCTGTGATGTGGACCCGCGCATCGGGTGGCTCTG‑CCGCCCACACGCCCCAGATGCCGTCGTTGGCgtggtg > 3:119248/1‑149 (MQ=255) agcgcgcgacggcgaccaggtgcgtctcaacggcaccaaggcctggtgttccggtgccttgcagatcgatcgcgcgctgTGATGTGGACCCGCGCATCGGGTGGCTCTG‑CCGCCCACACGCCCCAGATGCCGTCGTTGGCGTGGtgcgc > 5:209879‑M2/80‑149 (MQ=255) ATCGATCTGCAAGGCACCGGAACACCAGGCCTTGGTGCCGTTGAGACGCACCTGGTCGCCGTCGCGCGCTGTGATGTGGACCCGCGCATCGGGTGGCTCTG‑CCGCCCACACGCCCCAGATGCCGTCGTTGGCGTGGTGCGCTGcgccgc > 5:50442‑M1/1‑149 (MQ=255) atcTGCAAGGCACCGGAACACCAGGCCTTGGTGCCGTTGAGACGCACCTGGTCGCCGTCGCGCGCTGTGATGTGGACCCGCGCATCGGGTGGCTCTG‑CCGCCCACACGCCCCAGATGCCGTCGTTGGCGTGGTGCGCTGCGCCGCATTc > 1:219276/1‑149 (MQ=255) ccaggtgcgtctcaacggcaccaaggcctggtgttccggtgccttgcagatcgatcgcgcgctgTGATGTGGACCCGCGCATCGGGTGGCTCTG‑CCGCCCACACGCCCCAGATGCCGTCGTTGGCGTGGTGCGCTGCGCCGCATTCCGc < 2:166859‑M2/85‑1 (MQ=255) gCAAGGCACCGGAACACCAGGCCTTGGTGCCGTTGAGACGCACCTGGTCGCCGTCGCGCGCTGTGATGTGGACCCGCGCATCGGGTGGCTCTG‑CCGCCCACACGCCCCAGATGCCTACGTTGGCGTGGTGCGATCCCCCGCAtgcgcc > 8:56963/1‑143 (MQ=255) gCAAGGCACCGGAACACCAGGCCTTGGTGCCGTTGAGACGCACCTGGTCGCCGTCGCGCGCTGTGATGTGGACCCGCGCATCGGGTGGCTCTG‑CCGCCCACACGCCCCAGATGCCGTCGTTGGCGTGGTGCGCTGCGCCGCATTCCGc > 1:254524/1‑148 (MQ=255) cAAGGCACCGGAACACCAGGCCTTGGTGCCGTTGAGACGCACCTGGTCGCCGTCGCGCGCTGTGATGTGGACCCGCGCATCGGGTGGCTCTG‑CCGCCCACACGCCCCAGATGCCGTCGTTGGCGTGGTGCGCTGCGCCGCATTcc < 2:219276/145‑1 (MQ=255) aCCGGAACACCAGGCCTTGGTGCCGTTGAGACGCACCTGGTCGCCGTCGCGCGCTGTGATGTGGACCCGCGCATCGGGTGGCTCTG‑CCGCCCACACGCCCCAGATGCCGTCGTTGGCgtggt < 8:288437/122‑1 (MQ=255) aCCGGAACACCAGGCCTTGGTGCCGTTGAGACGCACCTGGTCGCCGTCGCGCGCTGTGATGTGGACCCGCGCATCGGGTGGCTCTG‑CCGCCCACACGCCCCAGATGCCGTCGTTGGCgtggt > 7:288437/1‑122 (MQ=255) ccAGGCCTTGGTGCCGTTGAGACGCACCTGGTCGCCGTCGCGCGCTGTGATGTGGACCCGCGCATCGGGTGGCTCTG‑CCGCCCACACGCCCCAGATGCCGTCGTTGGCGTGGTGCGCTGCGCCGCATTCCGCCAGGATCGCCAAGGCAt > 3:77783/1‑149 (MQ=255) cAGGCCTTGGTGCCGTTGAGACGCACCTGGTCGCCGTCGCGCGCTGTGATGTGGACCCGCGCATCGGGTGGCTCTG‑CCGCCCACACGCCCCAg > 5:130300/1‑93 (MQ=255) cAGGCCTTGGTGCCGTTGAGACGCACCTGGTCGCCGTCGCGCGCTGTGATGTGGACCCGCGCATCGGGTGGCTCTG‑CCGCCCACACGCCCCAg < 6:130300/93‑1 (MQ=255) cAGGCCTTGGTGCCGTTGAGACGCACCTGGTCGCCGTCGCGCGCTGTGATGTGGACCCGCGCATCGGGTGGCTCTG‑CCGCCCACACGCCCCAGATGCCGTCGTTGGCGTGGTGCGCTGCGCCGCATTCCGCCAGGATCGCCaa > 2:6093/1‑143 (MQ=255) cAGGCCTTGGTGCCGTTGAGACGCACCTGGTCGCCGTCGCGCGCTGTGATGTGGACCCGCGCATCGGGTGGCTCTG‑CCGCCCACACGCCCCAGATGCCGTCGTTGGCGTGGTGCGCTGCGCCGCATTCCGCCAGGATCGCCaa < 1:6093/143‑1 (MQ=255) cAGGCCTTGGTGCCGTTGAGACGCACCTGGTCGCCGTCGCGCGCTGTGATGTGGACCCGCGCATCGGGTGGCTCTG‑CCGCCCACACGCCCCAGATGCCGTCGTTGGCGTGGTGCGCTGCGCCGCATTCCGCCAGGATCGCCAAGGCATc > 5:142078/1‑149 (MQ=255) cAGGCCTTGGTGCCGTTGAGACGCACCTGGTCGCCGTCGCGCGCTGTGATGTGGACCCGCGCATCGGGTGGCTCTG‑CCGCCCACACGCCCCAGATGCCGTCGTTGGCGTGGTGCGCTGCGCCGCATTCCGCCAGGATCGCCAAGGCATc > 5:213561/1‑149 (MQ=255) ttGGTGCCGTTGAGACGCACCTGGTCGCCGTCGCGCGCTGTGATGTGGACCCGCGCATCGGGTGGCTCTG‑CCGCCCACACGCCCCAGATGCCGTCGTTGGCGTGGTGCGCTGCGCCGCATTCCGCCAGGATCGCCAAGGCATCGGTATg > 5:266613/1‑149 (MQ=255) ggTGCCGTTGAGACGCACCTGGTCGCCGTCGCGCGCTGTGATGTGGACCCGCGCATCGGGTGGCTCTG‑CCGCCCACACGCCCCAGATGCCGTCGTTGGCGTGGTGCGCTGCGCCGCATTCCGCCAGGATCGCCAAGGCATCGGTATgg < 6:90446/148‑1 (MQ=255) ccGTTGAGACGCACCTGGTCGCCGTCGCGCGCTGTGATGTGGACCCGCGCATCGGGTGGCTCTG‑CCGCCCACACGCCCCAGATGCCGTCGTTGGCGTGGTGCGCTGCGCCGCATTCCGCCAGGATCGCCAAGGCATCGGTATGGCCCt > 2:199351/1‑148 (MQ=255) ccGTTGAGACGCACCTGGTCGCCGTCGCGCGCTGTGATGTGGACCCGCGCATCGGGTGGCTCTG‑CCGCCCACACGCCCCAGATGCCGTCGTTGGCGTGGTGCGCTGCGCCGCATTCCGCCAGGATCGCCAAGGCATCGGTATGGCCCTc < 3:171241/149‑1 (MQ=255) cGTTGAGACGCACCTGGTCGCCGTCGCGCGCTGTGATGTGGACCCGCGCATCGGGTGGCTCTG‑CCGCCCACACGCCCCAGATGCCGTCGTTGGCGTGGTGCGCTGCGCCGCATTCCGCCAGGATCGCCAAGGCATCGGTATGGCCCTCa < 1:199351/149‑1 (MQ=255) agaCGCACCTGGTCGCCGTCGCGCGCTGTGATGTGGACCCGCGCATCGGGTGGCTCTG‑CCGCCCACACGCCCCAGATGCCGTCGTTGGCGTGGTGCGCTGCGCCGCATTCCGCCAGGATCGCCAAGGCATCGGTATGGCCCTCATagag < 2:12149/149‑1 (MQ=255) gaCGCACCTGGTCGCCGTCGCGCGCTGTGATGTGGACCCGCGCATCGGGTGGCTCTG‑CCGCCCACACGCCCCAGATGCCGTCGTTGGCGTGGTGCGCTGCGCCGCATTCCGCCAGGATCGCCAAGGCATCGGTATGGCCCTCATAGAGc < 6:125243/149‑1 (MQ=255) cACCTGGTCGCCGTCGCGCGCTGTGATGTGGACCCGCGCATCGGGTGGCTCTG‑CCGCCCACACGCCCCAGATGCCGTCGTTGGCGTGGTGCGCTGCGCCGCATTCCGCCAGGATCGCCAAGGCATCGGTATGGCCCTCATAGAGCTTgg < 1:171465/149‑1 (MQ=255) aCCTGGTCGCCGTCGCGCGCTGTGATGTGGACCCGCGCATCGGGTGGCTCTG‑CCGCCCACACGCCCCAGATGCCGTCGTTGGCGTGGTGCGCTGCGCCGCATTCCGCCAGGATCGCCAAGGCATCGGTATGGCCCTCATAGAGCtt > 6:317473/1‑146 (MQ=255) aCCTGGTCGCCGTCGCGCGCTGTGATGTGGACCCGCGCATCGGGTGGCTCTG‑CCGCCCACACGCCCCAGATGCCGTCGTTGGCGTGGTGCGCTGCGCCGCATTCCGCCAGGATCGCCAAGGCATCGGTATGGCCCTCATAGAGCtt < 5:317473/146‑1 (MQ=255) gCCGTCGCGCGCTGTGATGTGGACCCGCGCATCGGGGGGCTCTG‑CCGCCCACACGCCCCAGATGCCGTCGTTGGCGTGGTGCGCTGCGCCGCATTCCGCCAGGATCGCCAAGGCATCGGTATGGCCCTCATAGAGCTTGGCCAGTGCCa < 8:106332/149‑1 (MQ=255) ccGTCGCGCGCTGTGATGTGGACCCGCGCATCGGGTGGCTCTG‑CCGCCCACACGCCCCAGATGCCGTCGTTGGCGTGGTGCGCTGCGCCGCATTCCGCCAGGATCGCCAAGGCATCGGTATGGCCCTCATAGAGCTTGGCCAGTGCCAg < 2:254524/149‑1 (MQ=255) ccGTCGCGCGCTGTCCTGTGGACCCGCGCACCGGGTGGCTCTG‑CCGCCCACACGCCCCAGATGCCGTCGTTGGCGTGGTGCGCTGCGCCGCATTCCGCCAGGATCGCCAAGGCATCGGTATGGCCCTCATAGAGCTTGGCCAGTGCCAg < 6:213561/149‑1 (MQ=255) cgctgTGATGTGGACCCGCGCATCGGGTGGCTCTG‑CCGCCCACACGCCCCAGATGCCGTCGTTGGCGTGGTGCGCTGCGCCGCATTCCGCCAGGATCGCCAAGGCATCGGTATGGCCCTCATAGAGCTTGGCCAGTGCCAGGTCACAGc < 4:77783‑M2/144‑1 (MQ=255) gctgTGATGTGGACCCGCGCATCGGGTGGCTCTG‑CCGCCCACACGCCCCAGATGCCGTCGTTGGCGTGGTGCGCTGCGCCGCATTCCGCCAGGATCGCCAAGGCATCGGTATGGCCCTCATAGAGCTTGGCCAGTGCCAGGTCACAGcc < 6:142078‑M2/145‑1 (MQ=255) gctgTGATGTGGACCCGCGCATCGGGTGGCTCTG‑CCGCCCACACGCCCCAGATGCCGTCGTTGGCGTGGTGCGCTGCGCCGCATTCCGCCAGGATCGCCAAGGCATCGGTATGGCCCTCATAGAGCTTGGCCAGTGCCAGGTCACAGcc < 6:209879‑M2/145‑1 (MQ=255) ctgTGATGTGGACCCGCGCATCGGGTGGCTCTG‑CCGCCCACACGCCCCAGATGCCGTCGTTGGCGTGGTGCGCTGCGCCGCATTCCGCCAGGATCGCCa < 1:56110‑M2/96‑1 (MQ=255) ctgTGATGTGGACCCGCGCATCGGGTGGCTCTG‑CCGCCCACACGCCCCAGATGCCGTCGTTGGCGTGGTGCGCTGCGCCGCATTCCGCCAGGATCGCCa > 2:56110‑M2/4‑99 (MQ=255) tgATGTGGTCCCGGCCATGGGGTGGCAGTGCCCGCCAACA‑GCCCCAGATGCCGTCGTTGGCGTGGTGCGCTGCGCCGCATTCCGCCAGGATCGCCAAGGCATCGGTATGGCCCTCATAGAGCTTGGCCAGTGCCAGGTCACAGCCgg < 7:56963/147‑1 (MQ=255) | CCCTGGCTTGGCTGTGACAGCTCGATTGCCACCAATTGCGGCTGCTCGGCCTCATCCCAGGCAGTAATCAGCGCGCGATCGATCTGCAAGGCACCGGAACACCAGGCCTTGGTGCCGTTGAGACGCACCTGGTCGCCGTCGCGCGCTGTGATGTGGACCCGCGCATCGGGTGGCTCTG‑CCGCCCACACGCCCCAGATGCCGTCGTTGGCGTGGTGCGCTGCGCCGCATTCCGCCAGGATCGCCAAGGCATCGGTATGGCCCTCATAGAGCTTGGCCAGTGCCAGGTCACAGCCGG > NC_002947/3693135‑3693429 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |