| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 4038846 | 61 (1.240) | 4 (0.090) | 4/242 | NT | 6.3% | coding (645/849 nt) | PP_3559 | glycine betaine ABC transporter permease |
| ? | NC_002947 | = 4038866 | 62 (1.330) | coding (665/849 nt) | PP_3559 | glycine betaine ABC transporter permease | |||||
TACGCCCTGCCGCCGCTGGTGCGGTTGACCGAACTGGGCCTGAGCCAGATCGACCCCTCGTTGCTGCAGGCCGCACACGGCCTTGGCGCAAGCCGCTGGCAGCGGTTGCGGCGCATCGCCCTGCCCCTGGCGCTACCAAGCATCATGGCCGGGCTCAACCAGTCGGTCATGATGGCCTTGTCGATGGTGGTCGTGGCGTCGATGATCGGCGCCCGTGGATTGGGTGAAGATGTGCTGGCGGGAATCCAGACCTTGAATGTTGGCCAAGGGATGGAGGCCGGGCTGGCAATTGTCG > NC_002947/4038700‑4038994 | tACGCCCTGCCGCCGCTGGTGCGGTTGACCGAACTGGGCCTGAGCCAGATCGACCCCTCGTTGCTGCAGGCCGCACACGGCCTTGGCGCAAGCCGCTGGCAGCGGTTGCGGCGCATCGCCCTGCCCCTGGCGCTACCAAGCATCATGGc > 2:158702/1‑149 (MQ=255) gCCCTGCCGCCGCTGGTGCGGTTGACCGAACTGGGCCTGAGCCAGATCGACCCCTCGTTGCTGCAGGCCGCACACGGCCTTGGCGCAAGCCGCTGGCAGCGGTTGCGGCGCATCGCCCTGCCCCTGGCGCTACCAAGCATCATGGCCgg > 8:252733/1‑149 (MQ=255) cTGCCGCCGCTGGTGCGGTTGACCGAACTGGGCCTGAGCCAGATCGACCCCTCGTTGCTGCAGGCCGCACACGGCCTTGGCGCAAGCCGCTGGCAGCGGTTGCGGCGCATCGCCCTGCCCCTGGCGCTACCAAGCATCATGGCCGGGCt > 1:67854/1‑149 (MQ=255) ccgccgCTGGTGCGGTTGACCGAACTGGGCCTGAGCCAGATCGACCCCTCGTTGCTGCAGGCCGCACACGGCCTTGGCGCAAGCCGCTGGCAGCGGTTGCGGCGCATCGCCCTGCCCCTGGCGCTACCAAGCATCATGGCCGGGCTCaa > 7:66810/1‑149 (MQ=255) ccgccgCTGGTGCGGTTGACCGAACTGGGCCTGAGCCAGATCGACCCCTCGTTGCTGCAGGCCGCACACGGCCTTGGCGCAAGCCGCTGGCAGCGGTTGCGGCGCATCGCCCTGCCCCTGGCGCTACCAAGCATCATGGCCGGGCTCaa < 7:209835/149‑1 (MQ=255) cgccgcTGGTGCGGTTGACCGAACTGGGCCTGAGCCAGATCGACGCCTCGTTGCTGCAGGCCGCACACGGCCTTGGCGCAAGCCGCTGGCAGCGGTTGCGGCGCATCGCCCTGCCCCTGGCGCTACCAAGCATCATGGCCGGGCTCAAc < 8:169753/149‑1 (MQ=255) gccgcTGGTGCGGTTGACCGAACTGGGCCTGAGCCAGATCGACCCCTCGTTGCTGCAGGCCGCACACGGCCTTGGCGCAAGCCGCTGGCAGCGGTTGCGGCGCATCGCCCTGCCCCTGGCGCTACCAAGCATCATGGCCGGGCTCAAc > 8:235255/1‑148 (MQ=255) gcTGGTGCGGTTGACCGAACTGGGCCTGAGCCAGATCGACCCCTCGTTGCTGCAGGCCGCACACGGCCTTGGCGCAAGCCGCTGGCAGCGGTTGCGGCGCATCGCCCTGCCCCTGGCGCTACCAAGCATCATGGCCGGGCTCAACCAGt > 1:120742/1‑149 (MQ=255) gTGCGGTTGACCGAACTGGGCCTGAGCCAGATCGACCCCTCGTTGCTGCAGGCCGCACACGGCCTTGGCGCAAGCCGCTGGCAGCGGTTGCGGCGCATCGCCCTGCCCCTGGCGCTACCAAGCATCATGGCCGGGCTCAACCAGTCGGt < 2:67854/149‑1 (MQ=255) gTGCGGTTGACCGAACTGGGCCTGAGCCAGATCGACCCCTCGTTGCTGCAGGCCGCACACGGCCTTGGCGCAAGCCGCTGGCAGCGGTTGCGGCGCATCGCCCTGCCCCTGGCGCTACCAAGCATCATGGCCGGGCTCAACCAGTCGGt > 4:141992/1‑149 (MQ=255) tGCGGTTGACCGAACTGGGCCTGAGCCAGATCGACCCCTCGTTGCTGCAGGCCGCACACGGCCTTGGCGCAAGCCGCTGGCAGCGGTTGCGGCGCATCGCCCTGCCCCTGGCGCTACCAAGCATCATGGCCGGGCTCAACCAGTCGGt > 6:21433/1‑148 (MQ=255) gTTGACCGAACTGGGCCTGAGCCAGATCGACCCCTCGTTGCTGCAGGCCGCACACGGCCTTGGCGCAAGCCGCTGGCAGCGGTTGCGGCGCATCGCCCTGCCCCTGGCGCTACCAAGCATCATGGCCGGGCTCAACCAGTCGGTcatga < 4:72776‑M2/149‑6 (MQ=255) aCCGAACTGGGCCTGAGCCAGATCGACCCCTCGTTGCTGCAGGCCGCACACGGCCTTGGCGCAAGCCGCTGGCAGCGGTTGCGGCGCATCGCCCTGCCCCTGGCGCTACCAAGCATCATGGCCGGGc < 5:133947/127‑1 (MQ=255) aCCGAACTGGGCCTGAGCCAGATCGACCCCTCGTTGCTGCAGGCCGCACACGGCCTTGGCGCAAGCCGCTGGCAGCGGTTGCGGCGCATCGCCCTGCCCCTGGCGCTACCAAGCATCATGGCCGGGc > 6:133947/1‑127 (MQ=255) ccGAACTGGGCCTGAGCCAGATCGACCCCTCGTTGCTGCAGGCCGCACACGGCCTTGGCGCAAGCCGCTGGCAGCGGTTGCGGCGCATCGCCCTGCCCCTGGCGCTACCAAGCATCATGGCCGGGCTCAACCAGTCGGTCATGATGGcc < 3:141992/149‑1 (MQ=255) cGAACTGGGCCTGAGCCAGATCGACCCCTCGTTGCTGCAGGCCGCACACGGCCTTGGCGCAAGCCGCTGGCAGCGGTTGCGGCGCATCGCCCTGCCCCTGGCGCTACCAAGCATCATGGCCgg > 2:209117/1‑123 (MQ=255) cGAACTGGGCCTGAGCCAGATCGACCCCTCGTTGCTGCAGGCCGCACACGGCCTTGGCGCAAGCCGCTGGCAGCGGTTGCGGCGCATCGCCCTGCCCCTGGCGCTACCAAGCATCATGGCCgg < 1:209117/123‑1 (MQ=255) cTGGGCCTGAGCCAGATCGACCCCTCGTTGCTGCAGGCCGCACACGGCCTTGGCGCAAGCCGCTGGCAGCGGTTGCGGCGCATCGCCCTGCCCCTGGCGCTACCAAGCATCATGGCCGGGCTCAACCAGTCGGTCATGATGGCCTTGTc > 3:3884/1‑149 (MQ=255) gCCTGAGCCAGATCGACCCCTCGTTGCTGCAGGCCGCACACGGCCTTGGCGCAAGCCGCTGGCAGCGGTTGCGGCGCATCGCCCTGCCCCTGGCGCTACCAAGCATCATGGCCGGGCTCAACCAGTCGGTCATGATGGCCTTGTCGAtg < 1:32384/149‑1 (MQ=255) aGCCAGATCGACCCCTCGTTGCTGCAGGCCGCACACGGCCTTGGCGCAAGCCGCTGGCAGCGGTTGCGGCGCATCGCCCTGCCCCTGGCGCTACCAAGCATCATGGCCGGGCTCAACCAGTCGGTCATGATGGCCTTGTCGAtggtgg < 7:235255/148‑1 (MQ=255) aGCCAGATCGACCCCTCGTTGCTGCAGGCCGCACACGGCCTTGGCGCAAGCCGCTGGCAGCGGTTGCGGCGCATCGCCCTGCCCCTGGCGCTACCAAGCATCATGGCCGGGCTCAACCAGTCGGTCATGATGGCCTTGTCGAtggtg < 4:199287/147‑1 (MQ=255) ccAGATCGACCCCTCGTTGCTGCAGGCCGCACACGGCCTTGGCGCAAGCCGCTGGCAGCGGTTGCGGCGCATCGCCCTGCCCCTGGCGCTACCAAGCATCATGacc < 1:254267‑M1/106‑4 (MQ=255) ccAGATCGACCCCTCGTTGCTGCAGGCCGCACACGGCCTTGGCGCAAGCCGCTGGCAGCGGTTGCGGCGCATCGCCCTGCCCCTGGCGCTACCAAGCATCATGacc > 2:254267‑M1/1‑103 (MQ=255) ccAGATCGACCCCTCGTTGCTGCAGGCCGCACACGGCCTTGGCGCAAGCCGCTGGCAGCGGTTGCGGCGCATCGCCCTGCCCCTGGCGCTACCAAGCATCATGGCCGGGCTCAACCAGTCGGTCATGATGGCCTTGTCGATGGTGGTCg > 6:160551/1‑149 (MQ=255) cAGATCGACCCCTCGTTGCTGCAGGCCGCACACGGCCTTGGCGCAAGCCGCTGGCAGCGGTTGCGGCGCATCGCCCTGCCCCTGGCGCTACCAAGCATCATGaccgactggttgagcccggccatgatgcttggta < 7:130397‑M1/136‑35 (MQ=255) cAGATCGACCCCTCGTTGCTGCAGGCCGCACACGGCCTTGGCGCAAGCCGCTGGCAGCGGTTGCGGCGCATCGCCCTGCCCCTGGCGCTACCAAGCATCATGaccgactggttgagcccggccatgatgcttggta > 8:130397‑M1/1‑102 (MQ=255) aGATCGACCCCTCGTTGCTGCAGGCCGCACACGGCCTTGGCGCAAGCCGCTGGCAGCGGTTGCGGCGCATCGCCCTGCCCCTGGCGCTACCAAGCATCATGGCCGGGCTCAACCAGTCGGTca > 1:49937‑M2/1‑121 (MQ=255) aGATCGACCCCTCGTTGCTGCAGGCCGCACACGGCCTTGGCGCAAGCCGCTGGCAGCGGTTGCGGCGCATCGCCCTGCCCCTGGCGCTACCAAGCATCATGGCCGGGCTCAACCAGTCGGTca < 2:49937‑M2/123‑3 (MQ=255) gATCGACCCCTCGTTGCTGCAGGCCGCACACGGCCTTGGCGCAAGCCGCTGGCAGCGGTTGCGGCGCATCGCCCTGCCCCTGGCGCTACCAAGCATCATGGCCGGGCTCAACCAGTCGGTCATGATGGCCTTGTCGATGGTGGTCGTgg > 5:114266/1‑149 (MQ=255) gATCGACCCCTCGTTGCTGCAGGCCGCACACGGCCTTGGCGCAAGCCGCTGGCAGCGGTTGCGGCGCATCGCCCTGCCCCTGGCGCTACCAAGCATCATGGCCGGGCTCAACCAGTCGGTCATGATGGCCTTGTCGATGGTGGTCGTgg > 1:52163/1‑149 (MQ=255) cccTCGTTGCTGCAGGCCGCACACGGCCTTGGCGCAAGCCGCTGGCAGCGGTTGCGGCGCATCGCCCTGCCCCTGGCGCTACCAAGCATCATGGCCGGGCTCAACCAGTCGGTCATGATGGCCTTGTCGAtg < 5:316279/132‑1 (MQ=255) cccTCGTTGCTGCAGGCCGCACACGGCCTTGGCGCAAGCCGCTGGCAGCGGTTGCGGCGCATCGCCCTGCCCCTGGCGCTACCAAGCATCATGGCCGGGCTCAACCAGTCGGTCATGATGGCCTTGTCGAtg > 6:316279/1‑132 (MQ=255) cccTCGTTGCTGCAGGCCGCACACGGCCTTGGCGCAAGCCGCTGGCAGCGGTTGCGGCGCATCGCCCTGCCCCTGGCGCTACCAAGCATCATGGCCGGGCTCAACCAGTCGGTCATGATGGCCTTGTCGATGGTGGTCGTGGCGTCgat < 2:52163/149‑1 (MQ=255) cccTCGTTGCTGCAGGCCGCACACGGCCTTGGCGCAAGCCGCTGGCAGCGGTTGCGGCGCATCGCCCTGCCCCTGGCGCTACCAAGCATCATGGCCGGGCTCAACCAGTCGGTCATGATGGCCTTGTCGATGGTGGTCGTGGCGTCgat > 6:205337/1‑149 (MQ=255) cAGGCCGCACACGGCCTTGGCGCAAGCCGCTGGCAGCGGTTGCGGCGCATCGCCCTGCCCCTGGCGCTACCAAGCATCATGGCCGGGCTCAACCAGTCGGTCATGATGGCCTTGTCGATGGTGGTCGTGGCGCCGATCATCGACGcca < 5:21433/148‑2 (MQ=255) ggCCGCACACGGCCTTGGCGCAAGCCGCTGGCAGCGGTTGCGGCGCATCGCCCTGCCCCTGGCGCTACCAAGCATCATGGCCGGGCTCAACCAGTCGGTCATGATGGCCTTGTCGATGGTGGTCGTGGCGTCGATGATCGGCGCCCGTg > 1:107496/1‑149 (MQ=255) cGCACACGGCCTTGGCGCAAGCCGCTGGCAGCGGTTGCGGCGCATCGCCCTGCCCCTGGCGCTACCAAGCATCATGGCCGGGCTCAACCAGTCGGTCATGATGGCCTTGTCGAtgg < 8:103767/116‑1 (MQ=255) cGCACACGGCCTTGGCGCAAGCCGCTGGCAGCGGTTGCGGCGCATCGCCCTGCCCCTGGCGCTACCAAGCATCATGGCCGGGCTCAACCAGTCGGTCATGATGGCCTTGTCGAtgg > 7:103767/1‑116 (MQ=255) acacGGCCTTGGCGCAAGCCGCTGGCAGCGGTTGCGGCGCATCGCCCTGCCCCTGGCGCTACCAAGCATCATGGCCGGGCTCAACCAGTCGGTCATGATGGCCTTGTCGATGGTGGTCGTGGCGTCGATGATCGGCGCCCGTGGATTgg < 6:114266/149‑1 (MQ=255) acacGGCCTTGGCGCAAGCCGCTGGCAGCGGTTGCGGCGCATCGCCCTGCCCCTGGCGCTACCAAGCATCATGGCCGGGCTCAACCAGTCGGTCATGATGGCCTTGTCGATGGTGGTCGTGGCGTCGATGATCGGCGCCCGTGGATTgg < 3:72776/149‑1 (MQ=255) acGGCCTTGGCGCAAGCCGCTGGCAGCGGTTGCGGCGCATCGCCCTGCCCCTGGCGCTACCAAGCATCATGGCCGGGCTCAACCAGTCGGTCATGATGGCCTTGTCGAtg < 6:248063/110‑1 (MQ=255) acGGCCTTGGCGCAAGCCGCTGGCAGCGGTTGCGGCGCATCGCCCTGCCCCTGGCGCTACCAAGCATCATGGCCGGGCTCAACCAGTCGGTCATGATGGCCTTGTCGAtg > 5:248063/1‑110 (MQ=255) acGGCCTTGGCGCAAGCCGCTGGCAGCGGTTGCGGCGCATCGCCCTGCCCCTGGCGCTACCAAGCATCATGGCCGGGCTCAACCAGTCGGTCATGATGGCCTTGTCGATGGTGGTCGTGGCGTCGATGATCGGCGCCCGTGGATTGGGt > 4:16054/1‑149 (MQ=255) ccgtGGCGCAAGCCGCTGGCAGCGGTTGCGGCGCATCGCCCTGCCCCTGGCGCTACCAAGCATCATGGCCGGGCTCAACCAGTCGGTCATGATGGCCTTGTCGATGGTGGTCGTGGCGTCGATGATCGGCGCCCGTGGATTGGGTGAAg < 8:50213/146‑1 (MQ=255) ccTTGGCGCAAGCCGCTGGCAGCGGTTGCGGCGCATCGCCCTGCCCCTGGCGCTACCAAGCATCATGGCCGGGCTCAACCAGTCGGTCATGATGGCCTTGTCGATGGTGGTCGTGGCGTCGATGATCGGCGCCCGTGGATTGGGTg > 8:66832/1‑146 (MQ=255) ccTTGGCGCAAGCCGCTGGCAGCGGTTGCGGCGCATCGCCCTGCCCCTGGCGCTACCAAGCATCATGGCCGGGCTCAACCAGTCGGTCATGATGGCCTTGTCGATGGTGGTCGTGGCGTCGATGATCGGCGCCCGTGGATTGGGTGAAg < 5:160551/149‑1 (MQ=255) cTTGGCGCAAGCCGCTGGCAGCGGTTGCGGCGCATCGCCCTGCCCCTGGCGCTACCAAGCATCATGaccgactggttgagcccggccatg > 6:296674‑M1/1‑66 (MQ=255) cTTGGCGCAAGCCGCTGGCAGCGGTTGCGGCGCATCGCCCTGCCCCTGGCGCTACCAAGCATCATGaccgactggttgagcccggccatg < 5:296674‑M1/90‑25 (MQ=255) cgcAAGCCGCTGGCAGCGGTTGCGGCGCATCGCCCTGCCCCTGGCGCTACCAAGCATCATGGCCGGGCTCAACCAGTCGGTCATGATGGCCTTGTCGATGGTGGTCGTGGCGTCGATGATCGGCGCCCGTGGATTGGGTGAAGATGTGc > 6:50103/1‑149 (MQ=255) aaGCCGCTGGCAGCGGTTGCGGCGCATCGCCCTGCCCCTGGCGCTACCAAGCATCATGGCCGGGCTCAACCAGTCGGTCATGATGGCCTTGTCGATGGTGGTCGTGGCGTCGATGATCGGCGCCCGTGGATTGGGTGAAGATGTGCTgg > 7:247681/1‑149 (MQ=255) aaGCCGCTGGCAGCGGTTGCGGCGCATCGCCCTGCCCCTGGCGCTACCAAGCATCATGGCCGGGCTCAACCAGTCGGTCATGATGGCCTTGTCGATGGTGGTCGTGGCGTCGATGATCGGCGCCCGTGGATTGGGTGAAGATGTGCTgg < 3:146734/149‑1 (MQ=255) ccGCTGGCAGCGGTTGCGGCGCATCGCCCTGCCCCTGGCGCTACCAAGCATCATGGCCGGGCTCAACCAGTCGGTCATGATGGCCTTGTCGATGGTGGTCGTGGCGTCGATGATCGGCGCCCGTGGATTGGGTGAAGATGTGCTGGCgg > 1:271234/1‑149 (MQ=255) ccGCTGGCAGCGGTTGCGGCGCATCGCCCTGCCCCTGGCGCTACCAAGCATCATGGCCGGGCTCAACCAGTCGGTCATGATGGCCTTGTCGATGGTGGTCGTGGCGTCGATGATCGGCGCCCGTGGATTGGGTGAAGATGTGCTGGCgg < 4:3884/149‑1 (MQ=255) cGCTGGCAGCGGTTGCGGCGCATCGCCCAGCCCCTGGCGCTACCAAGCATCATGGCCGGGCTCAACCAGTCGGTCATGATGGCCTTGTCGATGGTGGTCGTGGCGTCGATGATCGGCGCCCGTGGATTGGGTGAAGATGTGCTGGCgg > 1:176348/1‑148 (MQ=255) gCTGGCAGCGGTTGCGGCGCATCGCCCTGCCCCTGGCGCTACCAAGCATCATGGCCGGGCTCAACCAGTCGGTCATGATGGCCTTGTCGATGGTGGTCGTGGCGTCGATGATCGGCGCCCGTGGATTGGGTGAAGATGTGCTGGCggg > 2:152216/1‑148 (MQ=255) cAGCGGTTGCGGCGCATCGCCCTGCCCCTGGCGCTACCAAGCATCATGGCCGGGCTCAACCAGTCGGTCATGATGGCCTTGTCGATGGTGGTCGTGGCGTCGATGATCGGCGCCCGTGGATTGGGTGAAGATGTGCTGGCGGGAATCCa < 5:50103/149‑1 (MQ=255) cAGCGGTTGCGGCGCATCGCCCTGCCCCTGGCGCTACCAAGCATCATGGCCGGGCTCAACCAGTCGGTCATGATGGCCTTGTCGATGGTGGTCGTGGCGTCGATGATCGGCGCCCGTGGATTGGGTGAAGATGTGCTGGCGGGAATCCa < 2:107496/149‑1 (MQ=255) cGGTTGCGGCGCATCGCCCTGCCCCTGGCGCTACCAAGCATCATGGCCGGGCTCAACCAGTCGGTCATGATGGCCTTGTCGATGGTGGTCGTGGCGTCGATGATCGGCGCCCGTGGATTGGGTGAAGATGTGCTGGCGGGAATCCAGAc < 7:252733/149‑1 (MQ=255) ttGCGGCGCATCGCCCTGCCCCTGGCGCTACCAAGCATCATGGCCGGGCTCAACCAGTCGGTCATGATGGCCTTGTCGATGGTGGTCGTGGCGTCGATGATCGGCGCCCGTGGATTGGGTGAAGATGTGCTGGCGGGAATc > 8:287645/1‑141 (MQ=255) ttGCGGCGCATCGCCCTGCCCCTGGCGCTACCAAGCATCATGGCCGGGCTCAACCAGTCGGTCATGATGGCCTTGTCGATGGTGGTCGTGGCGTCGATGATCGGCGCCCGTGGATTGGGTGAAGATGTGCTGGCGGGAATc < 7:287645/141‑1 (MQ=255) cggcgCATCGCCCTGCCCCTGGCGCTACCAAGCATCATGGCCGGGCTCAACCAGTCGGTCATGATGGCCTTGTCGATGGTGGTCGTGGCGTCGATGATCGGCGCCCGTGGATTGGGTGAAGATGTGCTGGCGGGAATCCAGACCTTGaa > 1:198674/1‑149 (MQ=255) gcgcATCGCCCTGCCCCTGGCGCTACCAAGTATCATGGCCGGGCTCAACCAGTCGGTCATGATGGCCTTGTCGATGGTGGTCGTGGCGTCGATGATCGGCGCCCGTGGATTGGGTGAAGATGTGCTGGCGGGAATCCAGACCTTGAATg > 7:88856/1‑149 (MQ=255) gcgcATCGCCCTGCCCCTGGCGCTACCAAGCATCATGGCCGGGCTCAACCAGTCGGTCATGATGGCCTTGTCGATGGTGGTCGTGGCGTCGATGATCGGCGCCCGTGGATTGGGTGAAGATGTGCTGGCGGGAATCCAGACCTTGAATg < 7:66832/149‑1 (MQ=255) cATCGCCCTGCCCCTGGCGCTACCAAGCATCATGGCCGGGCTCAACCAGTCGGTCATGATGGCCTTGTCGATGGTGGTCGTGGCGTCGATGATCGGCGCCCGTGGATTGGGTGAAGATGTGCTGGCGGGAATCCAg < 3:9923/136‑1 (MQ=255) cATCGCCCTGCCCCTGGCGCTACCAAGCATCATGGCCGGGCTCAACCAGTCGGTCATGATGGCCTTGTCGATGGTGGTCGTGGCGTCGATGATCGGCGCCCGTGGATTGGGTGAAGATGTGCTGGCGGGAATCCAg > 4:9923/1‑136 (MQ=255) cATCGCCCTGCCCCTGGCGCTACCAAGCATCATGGCCGGGCTCAACCAGTCGGTCATGATGGCCTTGTCGATGGTGGTCGTGGCGTCGATGATCGGCGCCCGTGGATTGGGTGAAGATGTGCTGGCGGGAATCCAGACCTTGAATGTTg > 2:99453/1‑149 (MQ=255) aTCGCCCTGCCCCTGGCGCTACCAAGCATCATGGCCGGGCTCAACCAGTCGGTCATGATGGCCTTGTCGATGGTGGTCGTGGCGTCGATGATCGGCGCCCGTGGATTGGGTGAAGATGTGCTGGCGGGAATCCAGACCTTGAATGTTgg < 8:66810/149‑1 (MQ=255) ccTGCCCCTGGCGCTACCAAGCATCATGGCCGGGCTCAACCAGTCGGTCATGATGGCCTTGTCGATGGTGGTCGTGGCGTCGATGATCGGCGCCCGTGGATTGGGTGAAGATGTGCTGGCGGGAATCCAGACCTTGAATGTTGGCCAAg < 2:120742/149‑1 (MQ=255) cTGCCCCTGGCGCTACCAAGCATCATGGCCGGGCTCAACCAGTCGGTCATGATGGCCTTGTCGATGGTGGTCGTGGCGTCGATGATCGGCGCCCGTGGATTGGGTGAAGATGTGCTGGCGGGAATCCAGACCTTGAATGTTGGCCAAgg > 8:85164/1‑149 (MQ=255) ccccTGGCGCTACCAAGCATCATGGCCGGGCTCAACCAGTCGGTCATGATGGCCTTGTCGATGGTGGTCGTGGCGTCGATGATCGGCGCCCGTGGATTGGGTGAAGATGTGCTGGCGGGAATCCAGACCTTGAATGTTGGCCAAGGGAt < 5:205337/149‑1 (MQ=255) ccTGGCGCTACCAAGCATCATGGCCGGGCTCAACCAGTCGGTCATGATGGCCTTGTCGATGGTGGTCGTGGCGTCGATGATCGGCGCCCGTGGATTGGGTGAAGATGTGCTGGCGGGAATCCAGACCTTGAATGTTGGCCAAGGGATgg < 1:152216/149‑1 (MQ=255) tACCAAGCATCATGGCCGGGCTCAACCAGTCGGTcatgatgcttggtagcgccaggggcagggcgatgcgccgcaaccgctgccagcggcttgcgccaaggccgtgtgcggcctgcagcaacgaggggtcgatctg < 7:130397‑M2/136‑103 (MQ=255) tACCAAGCATCATGGCCGGGCTCAACCAGTCGGTcatgatgcttggtagcgccaggggcagggcgatgcgccgcaaccgctgccagcggcttgcgccaaggccgtgtgcggcctgcagcaacgaggggtcgatctg > 8:130397‑M2/1‑34 (MQ=255) aaGCATCATGGCCGGGCTCAACCAGTCGGTCATGATGGCCTTGTCGATGGTGGTCGTGGCGTCGATGATCGGCGCCCGTGGATTGGGTGAAGATGTGCTGGCGGGAATCCAGACCTTGAATGTTGTCCAAGGGATGGAGGCCGGGCTgg < 2:198674/149‑1 (MQ=255) aaGCATCATGGCCGGGCTCAACCAGTCGGTCATGATGGCCTTGTCGATGGTGGTCGTGGCGTCGATGATCGGCGCCCGTGGATTGGGTGAAGATGTGCTGGCGGGAATCCAGACCTTGAATGTTGGCCAAGGGATGGAGGCCGGGCTgg < 2:157292/149‑1 (MQ=255) aGCATCATGGCCGGGCTCAACCAGTCGGTCATGATGGAATTTTCGATGGTGGTCGTGGCGTCGATGATCTGCTCCCGTGGATTGGGTGAAGATGTGATGCCGGTAATAAATAAATTTAATGTTGGCCAAGGGATGGAGGCCgggaggg > 2:194549/1‑144 (MQ=255) tcatGaccgactggttgagcccggccatgatgcttggtagcgccaggggcagggcgatgcgccgcaaccgctgccagcggcttgcgccaaggccgtgtgcggcctgcagcaacgaggggtcgatctggctcaggcccagttcggtcaac < 4:72776‑M1/149‑145 (MQ=255) tcatGGCCGGGCTCAACCAGTCGGTCATGATGGCCTTGTCGATGGTGGTCGTGGCGTCGATGATCGGCGCCCGTGGATTGGGTGAAGATGTGCTGGCGGGAATCCAGACCTTGAATGTTGGCCAAGGGATGGAGGCCGGGCTGGCAAtt < 1:158702/149‑1 (MQ=255) catGGCCGGGCTCAACCAGTCGGTcatgatgcttggtagcgccaggggcagggcgatgcgccgcaaccgctgccagcggcttgcgccaag > 6:296674‑M2/1‑24 (MQ=255) catGGCCGGGCTCAACCAGTCGGTcatgatgcttggtagcgccaggggcagggcgatgcgccgcaaccgctgccagcggcttgcgccaag < 5:296674‑M2/90‑67 (MQ=255) tGaccgactggttgagcccggccatgatgcttggtagcgccaggggcagggcgatgcgccgcaaccgctgccagcggcttgcgccaaggccgtgtgcggcctgcagcaacgaggggtcgatct > 1:49937‑M1/1‑2 (MQ=255) tGaccgactggttgagcccggccatgatgcttggtagcgccaggggcagggcgatgcgccgcaaccgctgccagcggcttgcgccaaggccgtgtgcggcctgcagcaacgaggggtcgatct < 2:49937‑M1/123‑122 (MQ=255) ggCCGGGCTCAACCAGTCGGTCATGATGGCCTTGTCGATGGTGGTCGTGGCGTCGATGATCGGCGCCCGTGGATTGGGTGAAGATGTGCTGGCGGGAATCCAGACCTTGAATGTTGGCCAAGGGATGGAGGCCGGGCTGGCAATTGTCg > 2:272087/1‑149 (MQ=255) | TACGCCCTGCCGCCGCTGGTGCGGTTGACCGAACTGGGCCTGAGCCAGATCGACCCCTCGTTGCTGCAGGCCGCACACGGCCTTGGCGCAAGCCGCTGGCAGCGGTTGCGGCGCATCGCCCTGCCCCTGGCGCTACCAAGCATCATGGCCGGGCTCAACCAGTCGGTCATGATGGCCTTGTCGATGGTGGTCGTGGCGTCGATGATCGGCGCCCGTGGATTGGGTGAAGATGTGCTGGCGGGAATCCAGACCTTGAATGTTGGCCAAGGGATGGAGGCCGGGCTGGCAATTGTCG > NC_002947/4038700‑4038994 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |