New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4819242 = | 49 (0.990) | 3 (0.060) | 3/244 | NT | 6.2% | coding (11948/12954 nt) | pvdL | non‑ribosomal peptide synthetase |
? | NC_002947 | 4819316 = | 44 (0.940) | coding (11874/12954 nt) | pvdL | non‑ribosomal peptide synthetase |
TTGTTATCGGTTGGCGTGCCGATTGGCAGGTAGCTGCCTTGGGTCGAGGCGGCATCGACGCGGAAGAACGCCACGTCATCCGAGCACTCCGCCGGGCCATAGGCATTGACCAGGCCGATCTGCGGGTAGCGCTGCAGCCACTGCGCCGCCAGCTCCGGTGGCATGACCTCGCCGGTCGGCAGCATCCAGCGCAGGCCGTCGAGGGCCTGGTGGTCGCTGGCCAGCATGCCCTGGATCAGGGACGGCACGCTCTCCAGCACGGTGATGCCGGTGGCCTGCACGTGCGCCAG > NC_002947/4819095‑4819384 | ttgttATCGGTTGGCGTGCCGATTGGCAGGTAGCTGCCTTGGGTCGAGGCGGCATCGACGCGGAAGAACGCCACGTCATCCGAGCACTCCGCCGGGCCATAGGCATTGACCAGGCCGATCTGCGGGTAGCGCTGCAGCCACTGcgccgc < 2:225237/149‑1 (MQ=255) ttATCGGTTGGCGTGCCGATTGGCAGGTAGCTGCCTTGGGTCGAGGCGGCATCGACGCGGAAGAACGCCACGTCATCCGAGCACTCCGCCGGGCCATAGGCATTGACCAGGCCGATCTGCGGGTAGCGCTGCAGCCACTGCGCCGCCAg < 8:246953/149‑1 (MQ=255) ttATCGGTTGGCGTGCCGATTGGCAGGTAGCTGCCTTGGGTCGAGGCGGCATCGACGCGGAAGAACGCCACGTCATCCGAGCACTCCGCCGGGCCATAGGCATTGACCAGGCCGATCTGCGGGTAGCGCTGCAGCCACTGCGCCGCCAg > 6:187672/1‑149 (MQ=255) ggTTGGCGTGCCGATTGGCAGGTAGCTGCCTTGGGTCGAGGCGGCATCTACGCGGAAGAACGCCACGTCATCCGAGCACTCCGCCGGGCCATAGGCATTGACCAGGCCGATCTGCGGGTAGCGCTGCAGCCACTGCGCCGCCAGCTCCg > 8:15402/1‑149 (MQ=255) gTGCCGATTGGCAGGTAGCTGCCTTGGGTCGAGGCGGCATCGACGCGGAAGAACGCCACGTCATCCGAGCACTCCGCCGGGCCATAGGCATTGACCAGGCCGATCTGCGGGTAGCGCTGCAGCCACTGCGCCGCCAGCTCCGGTGGCAt < 2:87855/149‑1 (MQ=255) gCCGATTGGCAGGTAGCTGCCTTGGGTCGAGGCGGCATCGACGCGGAAGAACGCCACGTCATCCGAGCACTCCGCCGGGCCATAGGCATTGACCAGGCCGATCTGCGGGTAGCGCTGCAGCCACTGCGCCGCCAGCTCCGGTGGCATGa > 1:304849/1‑149 (MQ=255) cGATTGGCAGGTAGCTGCCTTGGGTCGAGGCGGCATCGACGCGGAAGAACGCCACGTCATCCGAGCACTCCGCCGGTCCATAGGCATTGACCAGGCCGATCTGCGGGTAGCGCTGCAGCCACTGCGCCGCCAGCTCCGGTGGCATGAcc > 2:204284/1‑149 (MQ=255) gCAGGTAGCTGCCTTGGGTCGAGGCGGCATCGACGCGGAAGAACGCCACGTCATCCGAGCACTCCGCCGGGCCATAGGCATTGACCAGGCCGATCTGCGGGTAGCGCTGCAGCCACTGCGCCGCCAGCTCCGGTGGCATGACCTCGcc < 2:34729/148‑1 (MQ=255) aGGTAGCTGCCTTGGGTCGAGGCGGCATCTACGCGGAAGAACGCCACGTCATCCGAGCACTCCGCCGGGCCATAGGCATTGACCAGGCCGATCTGCGGGTAGCGCTGCAGCCACTGCGCCGCCAGCTCCGGTGGCATGACCTCGCCGGt < 7:15402/149‑1 (MQ=255) aGGTAGCTGCCTTGGGTCGAGGCGGCATCGACGCGGAAGAACGCCACGTCATACGAGCAATCCGCCGGGCCATAGGCATTGACAAGGCCGATCTGCGTGTAGCGCTGAAGCAACTGCGACGCCAGATACAGTGGCATGACATCGCCTGt > 8:250197/1‑149 (MQ=255) gCTGCCTTGGGTCGAGGCGGCATCGACGCGGAAGAACGCCACGTCATCCGAGCACTCCGCCGGGCCATAGGCATTGACCAGGCCGATCTGCGGGTAGCGCTGCAGCCACTGCGCCGCCAGCTCCGGTGGCATGACCTCGCCGGTCGgca < 2:201569/149‑1 (MQ=255) gCCTTGGGTCGAGGCGGCATCGACGCGGAAGAACGCCCCGTCATCCGAGCACTCCGCCGGGCCATAGGCATTGACCAGGCCGATCTGCGGGTAGCGCTGCAGCCACTGCGCCGCCAGCTCCGGTGGCATGACCTCGCCGGTCGgcagca > 6:233355/1‑149 (MQ=255) ttGGGTCGAGGCGGCATCGACGCGGAAGAACGCCACGTCATCCGAGCACTCCGCCGGGCCATAGGCATTGACCAGGCCGATCTGCGGGTAGCGCTGCAGCCACTGCGCCGCCAGCTCCGGTGGCATGACCTCGCCGGTCGGCAGCATcc > 8:129453/1‑149 (MQ=255) gggTCGAGGCGGCATCGACGGGGAAGAACGCCACGTCATCCGAGCACTCCGCCGGGCCATAGGCATTGACCAGGCCGATCTGCGGGTAGCGCTGCAGCCACTGCGCCGCCAGCTCCGGTGGCATGACCTCGCCGGTCGGCAGCATCCAg > 1:61103/1‑149 (MQ=255) gggTCGAGGCGGCATCGACGCGGAAGAACGCCACGTCATCCGAGCACTCCGCCGGGCCATAGGCATTGACCAGGCCGATCTGCGGGTAGCGCTGCAGCCACTGCGCCGCCAGCTCCGGTGGCATGACCTCGCCGGTCGGCAGCATCCAg > 1:65684/1‑149 (MQ=255) gTCGAGGCGGCATCGACGCGGAAGAACGCCACGTCATCCGAGCACTCCGCCGGGCCATAGGCATTGACCAGGCCGATCTGCGGGTAGCGCTGCAGCCACTGCGCCGCCAGCTCCGGTGGCATGACCTCGCCGGTCGGCAGCATCCAgcg > 7:65942/1‑149 (MQ=255) gAGGCGGCATCGACGCGGAAGAACGCCACGTCATCCGAGCACTCCGCCGGGCCATAGGCATTGACCAGGCCGATCTGCGGGTAGCGCTGCAGCCACTGCGCCGCCAGCTCCGGTGGCATGACCTCGCCGGTCGGCAGCATCCAGCGCa < 2:304849/148‑1 (MQ=255) aTCGACGCGGAAGAACGCCACGTCATCCGAGCACTCCGCCGGGCCATAGGCATTGACCAGGCCGATCTGCGGGTAGCGCTGCAGCCACTGCGCCGCCAGCTCCGGTGGCATGACCTCGCCGGTCGGCAGCATCCAGCGCAGGCCGTc > 5:27969/1‑147 (MQ=255) aTCGACGCGGAAGAACGCCACGTCATCCGAGCACTCCACCGGGCCATAGGCATTGACCAGGCCGATCTGCGGGTAGCGCTGCAGCCACTGCGCCGCCAGCTCAGGTGGCATGACCTCGCCGGTCGGCAGCAACCAGCGCAGGCCGTc > 1:56668/1‑147 (MQ=255) gcgGAAGAACGCCACGTCATCCGAGCACTCCGCCGGGCCATAGGCATTGACCAGGCCGATCTGCGGGTAGCGCTGCAGCCACTGCGCCGCCAGCTCCGGTGGCATGACCTCGCCGGTCGGCAGCATCCAGCGCAGGCCGTCGAGGGCCt > 4:30577/1‑149 (MQ=255) cgGAAGAACGCCACGTCATCCGAGCACTCCGCCGGGCCATAGGCATTGACCAGGCCGATCTGCGGGTAGCGCTGCAGCCACTGCGCCGCCAGCTCCGGTGGCATGACCTCGCCGGTCGGCAGCATCCAGCGCAGGCCGTCGAGGGCCtg < 3:30577/149‑1 (MQ=255) ggAAGAACGCCACGTCATCCGAGCACTCCGCCGGGCCATAGGCATTGACCAGGCCGATCTGCGGGTAGCGCTGCAGCCACTGCGCCGCCAGCTCCGGTGGCATGACCTCGCCGGTCGGCAGCATCCAGCGCAGGCCGTCGAGGGCCtgg < 7:129453/149‑1 (MQ=255) ggAAGAACGCCACGTCATCCGAGCACTCCGCCGGGCCATAGGCATTGACCAGGCCGATCTGCGGGTAGCGCTGCAGCCACTGCGCCGCCAGCTCCGGTGGCATGACCTCGCCGGTCGGCAGCATCCAGCGCAGGCCGTCGAGGGCCtgg < 5:187672/149‑1 (MQ=255) gcagggcctgctggcgcacgtgcaggccaccggcatcaccgtgctggagagcgtgccgtccctgatcctgggcatgctgGCCAGCTCCGGTGGCATGACCTCGCCGGTCGGCAGCATCCAGCGCAGGCCGTCGAGGGCCTGGTGGTCGc < 2:91551‑M1/70‑1 (MQ=255) ggcctgctggcgcacgtgcaggccaccggcatcaccgtgctggagagcgtgccgtccctgatcctgggcatgctgGCCAGCTCCGGTGGCATGACCTCGCCGGTCGGCAGCATCCAGCGCAGGCCGTCGAGGGCCTGGTGGTCGCTGGc > 1:91551‑M1/76‑149 (MQ=255) cctgctggcgcacgtgcaggccaccggcatcaccgtgctggagagcgtgacttccctgatccagggcatgctgGCCAGCTCCGGTGGCATGACCTCGCCGGTCGGCAGCATCCAGCGCAGGCCGTCGAGGGCCTGGTGGTCGCTGGCCa > 1:291110‑M1/74‑149 (MQ=255) gCACTCCGCCGGGCCATAGGCATTGACCAGGCCGATCTGCGGGTAGCGCTGCAGCCACTGCGCCGCCAGCTCCGGTGGCATGACCTCGCCGGTCGGCAGCATCCAGCGCAGGCCGTCGAGGGCCTGGTGGTCGCTGGCCAGCATGCCCt < 2:248971/149‑1 (MQ=255) cTCCGCCGGGCCATAGGCATTGACCAGGCCGATCTGCGGGTAGCGCTGCAGCCACTGCGCCGCCAGCTCCGGTGGCATGACCTCGCCGGTCGGCAGCATCCAGCGCAGGCCGTCGAGGGCCTGGTGGTCGCTGGCCAGCATGCCCTGGa < 6:27969/149‑1 (MQ=255) tCCGCCGGGCCATAGGCATTGACCAGGCCGATCTGCGGGTAGCGCTGCAGCCACTGCGCCGCCAGCTCCGGTGGCATGACCTCGCCGGTCGGCAGCATCCAGCGCAGGCCGTCGAGGGCCTGGTGGTCGCTg < 3:280238/132‑1 (MQ=255) tCCGCCGGGCCATAGGCATTGACCAGGCCGATCTGCGGGTAGCGCTGCAGCCACTGCGCCGCCAGCTCCGGTGGCATGACCTCGCCGGTCGGCAGCATCCAGCGCAGGCCGTCGAGGGCCTGGTGGTCGCTg > 4:280238/1‑132 (MQ=255) tCCGCCGGGCCATAGGCATTGACCAGGCCGATCTGCGGGTAGCGCTGCAGCCACTGCGCCGCCAGCTCCGGTGGCATGACCTCGCCGGTCGGCAGCATCCAGCGCAGGCCGTCGAGGGCCTGGTGGTCGCTGGCCAGCATGCCCTGGAt > 5:327146/1‑149 (MQ=255) tCCGCCGGGCCATAGGCATTGACCAGGCCGATCTGCGGGTAGCGCTGCAGCCACTGCGCCGCCAGCTCCGGTGGCATGACCTCGCCGGTCGGCAGCATCCAGCGCAGGCCGTCGAGGGCCTGGTGGTCGCTGGCCAGCATGCCCTGGAt > 6:266467/1‑149 (MQ=255) cgccgGTCCATAGGCATTGACCAGGCCGATCTGCGGGTAGCGCTGCAGCCACTGCGCCGCCAGCTCCGGTGGCATGACCTCGCCGGTCGGCAGCATCCAGCGCAGGCCGTCGAGGGCCTGGTGGTCGCTGGCCAGCATGCCCTGGATCa < 6:327146/149‑1 (MQ=255) gggCCATAGGCATTGACCAGGCCGATCTGCGGGTAGCGCTGCAGCCACTGCGCCGCCAGCTCCGGTGGCATGACCTCGCCGGTCGGCAGCATCCAGCGCAGGCCGTCGAGGGCCTGGTGGTCGCTGGCCAGCATGCCCTGGATCAGGGa < 2:65684/149‑1 (MQ=255) gggCCATAGGCATTGACCAGGCCGATCTGCGGGTAGCGCTGCAGCCACTGCGCCGCCAGCTCCGGTGGCATGACCTCGCCGGTCGGCAGCATCCAGCGCAGGCCGTCGAGGGCCTGGTGGTCGCTGGCCAGCATGCCCTGGATCAGGGa < 2:61103/149‑1 (MQ=255) ccATAGGCATTGACCAGGCCGATCTGCGGGTAGCGCTGCAGCCACTGCGCCGCCAGCTCCGGTGGCATGACCTCGCCGGTCGGCAGCATCCAGCGCAGGCCGTCGAGGGCCTGGTGGTCGCTGGCCAGCATGCCCTGGATCAGGGACgg > 5:55160/1‑149 (MQ=255) gCATTGACCAGGCCGATCTGCGGGTAGCGATGCAGCCACTGCGCCGCCAGCTCCGGTGGCATGACCTCGCCGGTCGGCAGCATCCAGCGCAGGCCGTCGAGGGCCTGGTGGTCGCTGGCCAGCATGCCCTGGATCAGGGACGGCACGct > 1:181989/1‑149 (MQ=255) aTTGACCAGGCCGATCTGCGGGTAGCGCTGCAGCCACTGCGCCGCCAGCTCCGGTGGCATGACCTCGCCGGTCGGTAGCATCCAGCGCAGGCCGTCGAGGGCCTGGTGGTCGCTGGCCAGCATGCCCTGGATc > 1:73182/1‑133 (MQ=255) aTTGACCAGGCCGATCTGCGGGTAGCGCTGCAGCCACTGCGCCGCCAGCTCCGGTGGCATGACCTCGCCGGTCGGTAGCATCCAGCGCAGGCCGTCGAGGGCCTGGTGGTCGCTGGCCAGCATGCCCTGGATc < 2:73182/133‑1 (MQ=255) aTTGACCAGGCCGATCTGCGGGTAGCGCTGCAGCCACTGCGCCGCCAGCTCCGGTGGCATGACCTCGCCGGTCGGCAGCATCCAGCGCAGGCCGTCGAGGGCCTGGTGGTCGCTg < 5:237906/115‑1 (MQ=255) aTTGACCAGGCCGATCTGCGGGTAGCGCTGCAGCCACTGCGCCGCCAGCTCCGGTGGCATGACCTCGCCGGTCGGCAGCATCCAGCGCAGGCCGTCGAGGGCCTGGTGGTCGCTg > 6:237906/1‑115 (MQ=255) aGGCCGATCTGCGGGTAGCGCTGCAGCCACTGCGCCGCCAGCTCCGGTGGCATGACCTCGCCGGTCGGCAGCATCCAGCGCAGGCCGTCGAGGGCCTGGTGGTCGCTg > 6:318904/1‑108 (MQ=255) aGGCCGATCTGCGGGTAGCGCTGCAGCCACTGCGCCGCCAGCTCCGGGGGCATGACCTCGCCGGTCGGCAGCATCCAGCGCAGGCCGTCGAGGGCCTGGTGGTCGCTg < 5:318904/108‑1 (MQ=255) gCCGATCTGCGGGTAGCGCTGCAGCCACTGCGCCGCCAGCTCCGGTGGCATGACCTCGCCGGTCGGCAGCATCCAGCGCAGGCCGTCGAGGGCCTGGTGGTCGCTGGCCAGCATGCCCTGGATCAGGGACGGCACGCTCTCCAGCACgg > 4:202131/1‑149 (MQ=255) cgcTGCAGCCACTGCGCCGCCAGCTCCTGTGGCATGACCTCGCCGGTCGTCAGCATCCAGCGCAGGCCGTCGAGTGCCTGGTGGTCGCTTGCCAGCATGCCCTGGATCAGTGACGGCACGCTCTCCAGCACGGTGATGCCGGTGGCCt < 7:250197/148‑1 (MQ=255) cgcTGCAGCCACTGCGCCGCCAGCTCCGGTGGCATGACCTCGCCGGTCGGCAGCATCCAGCGCAGGCCGTCGAGGGCCTGGTGGTCGCTGGCCAGCATGCCCTGGATCAGGGACGGCACGCTCTCCa > 4:158024/1‑127 (MQ=255) cgcTGCAGCCACTGCGCCGCCAGCTCCGGTGGCATGACCTCGCCGGTCGGCAGCATCCAGCGCAGGCCGTCGAGGGCCTGGTGGTCGCTGGCCAGCATGCCCTGGATCAGGGACGGCACGCTCTCCa < 3:158024/127‑1 (MQ=255) gcTGCAGCCTCTGCGCCGCCAGGTCCGGTGGGATGTCCTCGCCGGTGGGCAGCATCCAGCGCAGGCCGTCGAGGGCCTGGTGGTCGCTGGCCAGCATGCCCTGGATCAGGGACGGCACGCTCTCCAGCACGGTGATGCCGGTGGCCTGc < 4:304579/149‑1 (MQ=255) gcTGCAGCCACTGCGCCGCCAGCTCCGGTGGCATGACCTCGCCGGTCGGCAGCATCCAGCGCAGGCCGTCGAGGGCCTGGTGGTCGCTGGCCAGCATGCCCTGGATCAGGGACGGCACGCTCTCCAGCACGGTGATGCCGGTGGCCTg > 1:175095/1‑148 (MQ=255) gcTGCAGCCACTGCGCCGCCAGCTCCGGTGGCATGACCTCGCCGGTCGGCAGCATCCAGCGCAGGCCGTCGAGGGCCTGGTGGTCGCTGGCCAGCATGCCCTGGATCAGGGACGGCACGCTCTCCAGCACGGTGATGCCGGTGGCCTGc < 5:94281/149‑1 (MQ=255) cAGCCACTGCGCCGCCAGCTCCGGTGGCATGACCTCGCCGGTCGGCAGCATCCAGCGCAGGCCGTCGAGGGCCTGGTGGTCGCTGGCCAGCATGCCCTGGATCAGGGACGGCACGCTCTCCAGCACGGTGATGCCGGTGGCCTGCAc < 6:55160/147‑1 (MQ=255) ccACTGCGCCGCCAGCTCCGGTGGCATGACCTCGCCGGTCGGCAGCATCCAGCGCAGGCCGTCGAGGGCCTGGTGGTCGCTGGCCAGCATGCCCTGGATCAGGGACGGCACGCTCTCCAGCACg < 2:182608/124‑1 (MQ=255) ccACTGCGCCGCCAGCTCCGGTGGCATGACCTCGCCGGTCGGCAGCATCCAGCGCAGGCCGTCGAGGGCCTGGTGGTCGCTGGCCAGCATGCCCTGGATCAGGGACGGCACGCTCTCCAGCACg > 1:182608/1‑124 (MQ=255) aCTGCGCCGCCAGCTCCGGTGGCATGACCTCGCCGGTCGGCAGCATCCAGCGCAGGCCGTCGAGGGCCTGGTGGTCGCTGGCCAGCATGCCCTGGATCAGGGACGGCACGCTCTCCAGCACGGTGATGCCGGTGGCCTGGACGTgcgc > 4:220555/1‑148 (MQ=255) tGCGCCGCCAGCTCCGGTGGCATGACCTCGCCGGTCGGCAGCATCCAGCGCAGGCCGTCGAGGGCCTGGTGGTCGCTGGCCAGCATGCCCTGGATCAGGGACGGCACGCTCTCCAGCACGGTGATGCCGGTGGCCTGCACGTGCGCcag > 2:298061/1‑149 (MQ=255) | TTGTTATCGGTTGGCGTGCCGATTGGCAGGTAGCTGCCTTGGGTCGAGGCGGCATCGACGCGGAAGAACGCCACGTCATCCGAGCACTCCGCCGGGCCATAGGCATTGACCAGGCCGATCTGCGGGTAGCGCTGCAGCCACTGCGCCGCCAGCTCCGGTGGCATGACCTCGCCGGTCGGCAGCATCCAGCGCAGGCCGTCGAGGGCCTGGTGGTCGCTGGCCAGCATGCCCTGGATCAGGGACGGCACGCTCTCCAGCACGGTGATGCCGGTGGCCTGCACGTGCGCCAG > NC_002947/4819095‑4819384 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |