New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4819242 = | 49 (0.990) | 3 (0.060) | 3/244 | NT | 6.2% | coding (11948/12954 nt) | pvdL | non‑ribosomal peptide synthetase |
? | NC_002947 | 4819316 = | 44 (0.940) | coding (11874/12954 nt) | pvdL | non‑ribosomal peptide synthetase |
GTCATCCGAGCACTCCGCCGGGCCATAGGCATTGACCAGGCCGATCTGCGGGTAGCGCTGCAGCCACTGCGCCGCCAGCTCCGGTGGCATGACCTCGCCGGTCGGCAGCATCCAGCGCAGGCCGTCGAGGGCCTGGTGGTCGCTGGCCAGCATGCCCTGGATCAGGGACGGCACGCTCTCCAGCACGGTGATGCCGGTGGCCTGCACGTGCGCCAGCAGGCCCTGCGGGTCATGGGCGATGACATTAGGCACGATCTCTACCTTGGCGCCGAACAGCGGCGCAGC > NC_002947/4819169‑4819453 | cctgctggcgcacgtgcaggccaccggcatcaccgtgctggagagcgtgacttccctgatccagggcatgctgGCCAGCTCCGGTGGCATGACCTCGCCGGTCGGCAGCATCCAGCGCAGGCCGTCGAGGGCCTGGTGGTCGCTGGCCa > 1:291110‑M1/74‑149 (MQ=255) gCACTCCGCCGGGCCATAGGCATTGACCAGGCCGATCTGCGGGTAGCGCTGCAGCCACTGCGCCGCCAGCTCCGGTGGCATGACCTCGCCGGTCGGCAGCATCCAGCGCAGGCCGTCGAGGGCCTGGTGGTCGCTGGCCAGCATGCCCt < 2:248971/149‑1 (MQ=255) cTCCGCCGGGCCATAGGCATTGACCAGGCCGATCTGCGGGTAGCGCTGCAGCCACTGCGCCGCCAGCTCCGGTGGCATGACCTCGCCGGTCGGCAGCATCCAGCGCAGGCCGTCGAGGGCCTGGTGGTCGCTGGCCAGCATGCCCTGGa < 6:27969/149‑1 (MQ=255) tCCGCCGGGCCATAGGCATTGACCAGGCCGATCTGCGGGTAGCGCTGCAGCCACTGCGCCGCCAGCTCCGGTGGCATGACCTCGCCGGTCGGCAGCATCCAGCGCAGGCCGTCGAGGGCCTGGTGGTCGCTGGCCAGCATGCCCTGGAt > 6:266467/1‑149 (MQ=255) tCCGCCGGGCCATAGGCATTGACCAGGCCGATCTGCGGGTAGCGCTGCAGCCACTGCGCCGCCAGCTCCGGTGGCATGACCTCGCCGGTCGGCAGCATCCAGCGCAGGCCGTCGAGGGCCTGGTGGTCGCTGGCCAGCATGCCCTGGAt > 5:327146/1‑149 (MQ=255) cgccgGTCCATAGGCATTGACCAGGCCGATCTGCGGGTAGCGCTGCAGCCACTGCGCCGCCAGCTCCGGTGGCATGACCTCGCCGGTCGGCAGCATCCAGCGCAGGCCGTCGAGGGCCTGGTGGTCGCTGGCCAGCATGCCCTGGATCa < 6:327146/149‑1 (MQ=255) gggCCATAGGCATTGACCAGGCCGATCTGCGGGTAGCGCTGCAGCCACTGCGCCGCCAGCTCCGGTGGCATGACCTCGCCGGTCGGCAGCATCCAGCGCAGGCCGTCGAGGGCCTGGTGGTCGCTGGCCAGCATGCCCTGGATCAGGGa < 2:65684/149‑1 (MQ=255) gggCCATAGGCATTGACCAGGCCGATCTGCGGGTAGCGCTGCAGCCACTGCGCCGCCAGCTCCGGTGGCATGACCTCGCCGGTCGGCAGCATCCAGCGCAGGCCGTCGAGGGCCTGGTGGTCGCTGGCCAGCATGCCCTGGATCAGGGa < 2:61103/149‑1 (MQ=255) ccATAGGCATTGACCAGGCCGATCTGCGGGTAGCGCTGCAGCCACTGCGCCGCCAGCTCCGGTGGCATGACCTCGCCGGTCGGCAGCATCCAGCGCAGGCCGTCGAGGGCCTGGTGGTCGCTGGCCAGCATGCCCTGGATCAGGGACgg > 5:55160/1‑149 (MQ=255) gCATTGACCAGGCCGATCTGCGGGTAGCGATGCAGCCACTGCGCCGCCAGCTCCGGTGGCATGACCTCGCCGGTCGGCAGCATCCAGCGCAGGCCGTCGAGGGCCTGGTGGTCGCTGGCCAGCATGCCCTGGATCAGGGACGGCACGct > 1:181989/1‑149 (MQ=255) aTTGACCAGGCCGATCTGCGGGTAGCGCTGCAGCCACTGCGCCGCCAGCTCCGGTGGCATGACCTCGCCGGTCGGTAGCATCCAGCGCAGGCCGTCGAGGGCCTGGTGGTCGCTGGCCAGCATGCCCTGGATc > 1:73182/1‑133 (MQ=255) aTTGACCAGGCCGATCTGCGGGTAGCGCTGCAGCCACTGCGCCGCCAGCTCCGGTGGCATGACCTCGCCGGTCGGTAGCATCCAGCGCAGGCCGTCGAGGGCCTGGTGGTCGCTGGCCAGCATGCCCTGGATc < 2:73182/133‑1 (MQ=255) gCCGATCTGCGGGTAGCGCTGCAGCCACTGCGCCGCCAGCTCCGGTGGCATGACCTCGCCGGTCGGCAGCATCCAGCGCAGGCCGTCGAGGGCCTGGTGGTCGCTGGCCAGCATGCCCTGGATCAGGGACGGCACGCTCTCCAGCACgg > 4:202131/1‑149 (MQ=255) cgcTGCAGCCACTGCGCCGCCAGCTCCTGTGGCATGACCTCGCCGGTCGTCAGCATCCAGCGCAGGCCGTCGAGTGCCTGGTGGTCGCTTGCCAGCATGCCCTGGATCAGTGACGGCACGCTCTCCAGCACGGTGATGCCGGTGGCCt < 7:250197/148‑1 (MQ=255) cgcTGCAGCCACTGCGCCGCCAGCTCCGGTGGCATGACCTCGCCGGTCGGCAGCATCCAGCGCAGGCCGTCGAGGGCCTGGTGGTCGCTGGCCAGCATGCCCTGGATCAGGGACGGCACGCTCTCCa < 3:158024/127‑1 (MQ=255) cgcTGCAGCCACTGCGCCGCCAGCTCCGGTGGCATGACCTCGCCGGTCGGCAGCATCCAGCGCAGGCCGTCGAGGGCCTGGTGGTCGCTGGCCAGCATGCCCTGGATCAGGGACGGCACGCTCTCCa > 4:158024/1‑127 (MQ=255) gcTGCAGCCTCTGCGCCGCCAGGTCCGGTGGGATGTCCTCGCCGGTGGGCAGCATCCAGCGCAGGCCGTCGAGGGCCTGGTGGTCGCTGGCCAGCATGCCCTGGATCAGGGACGGCACGCTCTCCAGCACGGTGATGCCGGTGGCCTGc < 4:304579/149‑1 (MQ=255) gcTGCAGCCACTGCGCCGCCAGCTCCGGTGGCATGACCTCGCCGGTCGGCAGCATCCAGCGCAGGCCGTCGAGGGCCTGGTGGTCGCTGGCCAGCATGCCCTGGATCAGGGACGGCACGCTCTCCAGCACGGTGATGCCGGTGGCCTg > 1:175095/1‑148 (MQ=255) gcTGCAGCCACTGCGCCGCCAGCTCCGGTGGCATGACCTCGCCGGTCGGCAGCATCCAGCGCAGGCCGTCGAGGGCCTGGTGGTCGCTGGCCAGCATGCCCTGGATCAGGGACGGCACGCTCTCCAGCACGGTGATGCCGGTGGCCTGc < 5:94281/149‑1 (MQ=255) cAGCCACTGCGCCGCCAGCTCCGGTGGCATGACCTCGCCGGTCGGCAGCATCCAGCGCAGGCCGTCGAGGGCCTGGTGGTCGCTGGCCAGCATGCCCTGGATCAGGGACGGCACGCTCTCCAGCACGGTGATGCCGGTGGCCTGCAc < 6:55160/147‑1 (MQ=255) ccACTGCGCCGCCAGCTCCGGTGGCATGACCTCGCCGGTCGGCAGCATCCAGCGCAGGCCGTCGAGGGCCTGGTGGTCGCTGGCCAGCATGCCCTGGATCAGGGACGGCACGCTCTCCAGCACg < 2:182608/124‑1 (MQ=255) ccACTGCGCCGCCAGCTCCGGTGGCATGACCTCGCCGGTCGGCAGCATCCAGCGCAGGCCGTCGAGGGCCTGGTGGTCGCTGGCCAGCATGCCCTGGATCAGGGACGGCACGCTCTCCAGCACg > 1:182608/1‑124 (MQ=255) aCTGCGCCGCCAGCTCCGGTGGCATGACCTCGCCGGTCGGCAGCATCCAGCGCAGGCCGTCGAGGGCCTGGTGGTCGCTGGCCAGCATGCCCTGGATCAGGGACGGCACGCTCTCCAGCACGGTGATGCCGGTGGCCTGGACGTgcgc > 4:220555/1‑148 (MQ=255) tGCGCCGCCAGCTCCGGTGGCATGACCTCGCCGGTCGGCAGCATCCAGCGCAGGCCGTCGAGGGCCTGGTGGTCGCTGGCCAGCATGCCCTGGATCAGGGACGGCACGCTCTCCAGCACGGTGATGCCGGTGGCCTGCACGTGCGCcag > 2:298061/1‑149 (MQ=255) tggccagcgaccaccaggccctcgacggcctgcgctggatgctgccgaccggcgaggtcatgccaccggagctggcCAGCATGCCCTGGATCAGGGAAGTCACGCTCTCCAGCACGGTGATGCCGGTGGCCTGCACGTGCGCCAGCAgg > 1:291110‑M2/77‑149 (MQ=255) gccagcgaccaccaggccctcgacggcctgcgctggatgctgccgaccggcgaggtcatgccaccggagctggcCAGCATGCCCAGGATCAGGGACGGCACGCTCTCCAGCACGGTGATGCCGGTGGCCTGCACGTGCGCCAGCAGGcc > 1:91551‑M2/75‑149 (MQ=255) CAGCTCCGGTGGCATGACCTCGCCGGTCGGCAGCATCCAGCGCAGGCCGTCGAGGGCCTGGTGGTCGCTGGCCAGCATGCCCTGGATCAGGGACGGCACGCTCTCCAGCACGGTGATGCCGGTGGCCTGCACGTGCGCCAGCAGGCCCt < 5:259772‑M1/149‑1 (MQ=255) AGCTCCGGTGGCATGACCTCGCCGGTCGGCAGCATCCAGCGCAGGCCGTCGAGGGCCTGGTGGTCGCTGGCCAGCATGCCCTGGATCAGGGACGGCACGCTCTCCAGCACGGTGATGCCGGTGGCCTGCACGTGCGCCAGCAGGCCCTg < 4:250806‑M1/149‑1 (MQ=255) gcgaccaccaggccctcgacggcctgcgctggatgctgccgaccggcgaggtcatgccaccggagctggcCAGCATGCCCAGGATCAGGGACGGCACGCTCTCCAGCACGGTGATGCCGGTGGCCTGCACGTGCGCCAGCAGGCCCTGc < 2:91551‑M2/79‑1 (MQ=255) cGGTGGCATGACCTCGCCGGTCGGCAGCATCCAGCGCAGGCCGTCGAGGGCCTGGTGGTCGCTGGCCAGCATGCCCTGGATCAGGGACGGCACGCTCTCCAGCACGGTGATGCCGGTGGCCTGCACGTGCGCCAGCAGGCCCTGCgg < 1:204284/147‑1 (MQ=255) tGGCATGACCTCGCCGGTCGGCAGCATCCAGCGCAGGCCGTCGAGGGCCTGGTGGTCGCTGGCCAGCATGCCCTGGATCAGGGACGGCACGCTCTCCAGCACGGTGATGCCGGTGGCCTGCACGTGCGCCAGCAGGCCCTGCGGGTCAt < 6:259772/149‑1 (MQ=255) gCATGACCTCGCCGGTCGGCAGCATCCAGCGCAGGCCGTCGAGGGCCAGGTGGTCGCTGGCCAGCATGCCCTGGATCAGGGACGGCACGCTCTCCAGCACGGTGATGCCGGTGGCCTGCACGTGCGCCAGCAGGCCCTGCGGGTCATgg < 8:65942/149‑1 (MQ=255) tCGCCGGTCGGCAGCATCCAGCGCAGGCCGTCGAGGGCCTGGTGGTCGCTGGCCAGCATGCCCTGGATCAGGGACGGCACGCTCTCCAGCACGGTGATGCCGGTGGCCTGCACGTGCGCCAGCAGGCCCTGCGGGTCATGGGCGATGa > 3:75583/1‑148 (MQ=255) ccGGTCGGCAGCATCCAGCGCAGGCCGTCGAGGGCCTGGTGGTCGCTGGCCAGCATGCCCTGGATCAGGGACGGCACGCTCTCCAGCACGGTGATGCCGGAGGCCTGCACGTGCGCCAGCAGGCCCTGCGGGTCATGGGCGATGCCag > 6:118722/1‑147 (MQ=255) cGGTCGGCAGCATCCCGCGCAGGCCGTCGAGGGCCTGGTGGTCGCTGGCCAGCATGCCCTGGATCAGGGACGGCACGCTCTCCAGCACGGTGATGCCGGTGGCCTGCACGTGCGCCAGCAGGCCCTGCGGGTCATGGGCGATGACAt > 8:213455/1‑147 (MQ=255) ggctgcagcaTCCAGCGCAGGCCGTCGAGGGCCTGGGGGTCGCTGGCCAGCATGCCCTGGATCAGGGACGGCACGCTCTCCAGCACGGTGATGCCGGTGGCCTGCACGTGCGCCAGCAGGCCCTGCGGGTCATGGGCGATGACATTAgg < 5:118722/145‑1 (MQ=255) gTCGGCAGCATCCAGCGCAGGCCGTCGAGGGCCTGGTGGTCGCTGGCCAGCATGCCCTGGATCAGGGACGGCACGCTCTCCAGCACGGTGATGCCGGTGGCCTGCACGTGCGCCAGCAGGCCCTGCGGGTCATGGGCGATGACATTAgg < 2:181989/149‑1 (MQ=255) gcagcaTCCAGCGCAGGCCGTCGAGGGCCTGGTGGTCGCTGGCCAGCATGCCCTGGATCAGGGACGGCACGCTCTCCAGCACGGTGATGCCGGTGGCCTGCACGTGCGCCAGCAGGCCCTGCGGGTCATGGGCGATGACATTAGGCAc > 7:262091/1‑148 (MQ=255) agcaTCCAGCGCAGGCCGTCGAGGGCCTGGTGGTCGCTGGCCAGCATGCCCTGGATCAGGGACGGCACGCTCTCCAGCACGGTGATGCCGGTGGCCTGCACGTGCGCCAGCAGGCCCTGCGGGTCATGGGCGATGACATTAGGCACGAt < 8:262091/149‑1 (MQ=255) cAGCGCAGGCCGTCGAGGGCCTGGTGGTCGCTGGCCAGCATGCCCTGGATCAGGGACGGCACGCTCTCCAGCACGGTGATGCCGGTGGCCTGCACGTGCGCCAGCAGGCCCTGCGGGTCATGGGCGATGACATTAGGCa > 5:278660/1‑139 (MQ=255) cAGCGCAGGCCGTCGAGGGCCTGGTGGTCGCTGGCCAGCATGCCCTGGATCAGGGACGGCACGCTCTCCAGCACGGTGATGCCGGTGGCCTGCACGTGCGCCAGCAGGCCCTGCGGGTCATGGGCGATGACATTAGGCa < 6:278660/139‑1 (MQ=255) gcgcAGGCCGTCGAGGGCCTGGTGGTCGCTGGCCAGCATGCCCTGGATCAGGGACGGCACGCTCTCCAGCACGGTGATGCCGGTGGCCTGCACGTGCGCCAGCAGGCCCTGCGGGTCATGGGCGATGACATTAGGCACGATCTCTACCt > 1:159616/1‑149 (MQ=255) cAGGCCGTCGAGGGCCTGGTGGTCGCTGGCCAGCATGCCCTGGATCAGGGACGGCACGCTCTCCAGCACGGTGATGCCGGTGGCCTGCACGTGCGCCAGCAGGCCCTGCGGGTCATGGGCGATGACATTAGGCACGATCTCTACCTTgg > 5:126704/1‑149 (MQ=255) aGGCCGTCGAGGGCCTGGTGGTCGCTGGCCAGCATGCCCTGGATCAGGGACGGCACGCTCTCCAGCACGGTGATGCCGGTGGCCTGCACGTGCGCCAGCAGGCCCTGCGGGTCATGGGCGATGACATTAGGCACGATCTCTACCTTGgc < 6:126704/149‑1 (MQ=255) gCCGTCGAGGGCCTGGTGGTCGCTGGCCAGCATGCCCTGGATCAGGGACGGCACGCTCTCCAGCACGGTGATGCCGGTGGCCTGCACGTGCGCCAGCAGGCCCTGCGGGTCATGGGCGATGACATTAGGCACGATCTCTACCTTGgcgc < 1:298061/149‑1 (MQ=255) ccGTCGAGGGCCTGGTGGTCGCTGGCCAGCATGCCCTGGATCAGGGACGGCACGCTCTCCAGCACGGTGATGCCGGTGGCCTGCACGTGCGCCAGCAGGCCCTGCGGGTCATGGGCGATGACATTAGGCACGATCTCTACCTTGGCGcc < 5:266467/149‑1 (MQ=255) gggCCTGGTGGTCGCTGGCCAGCATGCCCTGGATCAGGGACGGCACGCTCTCCAGCACGGTGATGCCGGTGGCCTGCACGTGCGCCAGCAGGCCCTGCGGGTCATGGGCGATGACATTAGGCACGATCTCTACCTTGGCGCCGAACAgc < 5:233355/149‑1 (MQ=255) cTGGTGGTCGCTGGCCAGCATGCCCTGGATCAGGGACGGCACGCTCTCCAGCACGGTGATGCCGGTGGCCTGCACGTGCGCCAGCAGGCCCTGCGGGTCATGGGCGATGACATTAGGCACGATCTCTACCTTGGCGCCGAACAgcggcg > 1:43025/1‑149 (MQ=255) gtggtCGCTGGCCAGCATGCCCTGGATCAGGGACGGCACGCTCTCCAGCACGGTGATGCCGGTGGCCTGCACGTGCGCCAGCAGGCCCTGCGGGTCATGGGCGATGACATTAGGCACGATCTCTACCTTGGCGCCGAACAGCGGCGCAg > 5:201476/1‑149 (MQ=255) gtggtCGCTGGCCAGCATGCCCTGGAGCAGGGACGGCACGCTCTCCAGCACGGTGATGCCGGTGGCCTGCACGTGCGCCAGCAGGCCCTGCGGGTCATGGGCGATGACATTAGGCACGATCTCTACCTTGGCGCCTAACAGCGGCGCa < 3:220555/148‑1 (MQ=255) tggtCGCTGGCCAGCATGCCCTGGATCAGGGACGGCACGCTCTCCAGCACGGTGATGCCGGTGGCCTGCACGTGCGCCAGCAGGCCCTGCGGGTCATGGGCGATGACATTAGGCACGATCTCTACCTTGGCGCCGAACAGCGGCGCAGc < 3:202131/149‑1 (MQ=255) tggtCGCTGGCCAGCATGCCCTGGATCAGGGACGGCACGCTCTCCAGCACGGTGATGCCGGTGGCCTGCACGTGCGCCAGCAGGCCCTGCGGGTCATGGGCGATGACATTAGGCACGATCTCTACCTTGGCGCCGAACAGCGGCGCAGc < 3:250806/149‑1 (MQ=255) | GTCATCCGAGCACTCCGCCGGGCCATAGGCATTGACCAGGCCGATCTGCGGGTAGCGCTGCAGCCACTGCGCCGCCAGCTCCGGTGGCATGACCTCGCCGGTCGGCAGCATCCAGCGCAGGCCGTCGAGGGCCTGGTGGTCGCTGGCCAGCATGCCCTGGATCAGGGACGGCACGCTCTCCAGCACGGTGATGCCGGTGGCCTGCACGTGCGCCAGCAGGCCCTGCGGGTCATGGGCGATGACATTAGGCACGATCTCTACCTTGGCGCCGAACAGCGGCGCAGC > NC_002947/4819169‑4819453 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |