New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4875844 = | 30 (0.610) | 3 (0.060) | 3/240 | NT | 7.9% | coding (1032/1350 nt) | PP_4284 | transporter |
? | NC_002947 | 4875913 = | 42 (0.910) | coding (1101/1350 nt) | PP_4284 | transporter |
CGAGAACCTGTCGAAGGCGTTGAAGGCTGACAGTGCCTCGAGTGTGTTCGGCGCGGTGGTCGGTGTACCGCCGGTGACCAGCTATGTGGAGAGTGCTGCGGGGGTTGCCGCAGGTGGCCGAACTGGCCTGACGGCTGTGGTGGTAGGCCTGCTGTTCATCGCCGCGATGTTCTTCGCGCCGCTGGCCGGGATGATTCCGGCCTATGCGACAGCAGGTGCACTGATCTACGTTGCGATGCTGATGATGGGCAGCATGGCGCACATCCATTGGGATGAGG > NC_002947/4875697‑4875974 | atgaagcccagggcaataccatctgcgaccgagaacgtcagcggcatcatgatcactgtgacgatcgccggaatgctgtcggtggcctcatcccaatggatgtgcgccatgctgcccatcatcagcatcgcaacgtagatcagtgcac > 8:282259‑M1/148‑148 (MQ=255) agaACCTGTCGAAGGCGTTGAAGGCTGACAGTGCCTCGAGTGTGTTCGGCGCGGTGGTCGGTGTACCGCCGGTGACCAGCTATGTGGAGAGTGCTGCGGGGGTTGCCGCAGGTGGCCGAACTGGCCTGACGGCTGTGGTGGTAGGCctg > 5:256321/1‑149 (MQ=255) aCCTGTCGAAGGCGTTGAAGGCTGACAGTGCCTCGAGTGTGTTCGGCGCGGTGGTCGGTGTACCGCCGGTGACCAGCTATGTGGAGAGTGCTGCGGGGGTTGCCGCAGGTGGCCGAACTGGCCTGACGGCTGTGGTGGTAGGCctgct < 6:108432/148‑1 (MQ=255) aaGGTGTTGAAGGCTGACAGTGCCTCGAGTGTGTTCGGCGCGGTGGTCGGTGTACCGCCGGTGACCAGCTATGTGGAGAGTGCTGCGGGGGTTGCCGCAGGTGGCCGAACTGGCCTGACGGCTGTGGTGGTAGGCCTGCTGt < 2:270762/142‑1 (MQ=255) aaGGAGTTGAAGGCTGACAGTGCCTCGAGTGTGTTCGGCGCGGTGGTCGGTGTACCGCCGGTGACCAGCTATGTGGAGAGTGCTGCGGGGGTTGCCGCAGGTGGCCGAACTGGCCTGACGGCTGTGGTGGTAGGCCTGCTGt > 1:270762/1‑142 (MQ=255) gCCTCGAGTGTGTTCGGCGCGGTGGTCGGTGTACCGCCGGTGACCAGCTATGTGGAGAGTGCTGCGGGGGTTGCCGCAGGTGGCCGAACTGGCCTGACGGCTGTGGTGGTAGGCCTGCTGTTCATCGCCGCGATGTTCTTCGCGCCGCt > 4:70901/1‑149 (MQ=255) tCGAGTGTGTTCGGCGCGGTGGTCGGTGTACCGCCGGTGACCAGCTATGTGGAGAGTGCTGCGGGGGTTGCCGCAGGTGGCCGAACTGGCCTGACGGCTGTGGTGGTAGGCCTGCTGTTCATCGCCGCGATGTTCTTCGCGCCGCTGGc > 6:210895/1‑149 (MQ=255) gcgcGGTGGTCGGTGTACCGCCGGTGACCAGCTATGTGGAGAGTGCTGCGGGGGTTGCCGCAGGTGGCCGAACTGGCCTGACGGCTGTGGTGGTAGGCCTGCTGTTCATCGCCGCGATGTTCTTCGCGCCGCTGGCCGGGATGATTCCg < 6:256321/149‑1 (MQ=255) gtCGGTGTACCGCCGGTGACCAGCTATGTGGAGAGTGCTGCGGGGGTTGCCGCAGGTGGCCGAACTGGCCTGACGGCTGTGGTGGTAGGCctgct < 6:219376/95‑1 (MQ=255) gtCGGTGTACCGCCGGTGACCAGCTATGTGGAGAGTGCTGCGGGGGTTGCCGCAGGTGGCCGAACTGGCCTGACGGCTGTGGTGGTAGGCctgct > 5:219376/1‑95 (MQ=255) tCGGTGTACCGCCGGTGACCAGCTATGTGGAGAGTGCTGCGGGGGTTGCCGCAGGTGGCCGAACTGGCCTGACGGCTGTGGTGGTAGGCCTGCTGTTCATCGCCGCGATGTTCTTCGCGCCGCTGGCCGGAATCATCCCGGccagcggc < 5:210895/149‑7 (MQ=255) tACCGCCGGTGACCAGCTATGTGGAGAGTGCTGCGGGGGTTGCCGCAGGTGGCCGAACTGGCCTGACGGCTGTGGTGGTAGGCCTGCTGTTCATCGCCGCGATGTTCTTCGCGCCGCTGGCCGGGATGATTCCGGCCTATGCGAcag > 2:52884/1‑147 (MQ=255) gccggaatgctgtcggtggcctcatcccaatggatgtgcgccatgctgcccatcatcagcatcgcaacgtagatcagtgcaCCTGCTGTTCATCGCCGCGATGTTCTTCGCGCCGCTGGCCGGGATGATTCCGGCCTATGCGAcagcag > 4:69997‑M1/82‑149 (MQ=255) ccgccgGTGACCAGCTATGTGGAGAGTGCTGCGGGGGTTGCCGCAGGTGGCCGAACTGGCCTGACGGCTGTGGTGGTAGGCCTGCTGTTCATCGCCGCGATGTTCTTCGCGCCGCTGGCCGGGATGATTCCGGCCTATGCGACAGCAgg > 1:118011/1‑149 (MQ=255) ccgGTGACCAGCTATGTGGAGAGTGCTGCGGGGGTTGCCGCAGGTGGCCGAACTGGCCTGACGGCTGTGGTGGTAGGCCTGCTGTTCATCGCCGCGATGTTCTTCGCGCCGCTGGCCGGGATGATTCCGGCCTATGCGACAGCAGGt > 8:12421/1‑147 (MQ=255) ccgGTGACCAGCTATGTGGAGAGTGCTGCGGGGGTTGCCGCAGGTGGCCGAACTGGCCTGACGGCTGTGGTGGTAGGCCTGCTGTTCATCGCCGCGATGTTCTTCGCGCCGCTGGCCGGGATGATTCCGGCCTATGCGACAGCAGGt < 7:12421/147‑1 (MQ=255) aCCAGCTATGTGGAGAGTGCTGCGGGGGTTGCCGCAGGTGGCCGAACTGGCCTGACGGCTGTGGTGGTAGGCCTGCTGTTCATCGCCGCGATGTTCTTCGCGCCGCTGGCCGGGATGATTCCGGCCTATGCGACAGCAGGTGCACTGAt > 7:223720/1‑149 (MQ=255) cAGCTATGTGGAGAGTGCTGCGGGGGTTGCCGCAGGTGGCCGAACTGGCCTGACGGCTGTGGTGGTAGGCCTGCTGTTCATCGCCGCGATGTTCTTCGCGCCGCTGGCCGGGATGATTCCGGCCTATGCGACAGCAGGTGCACTGAt < 4:86069/147‑1 (MQ=255) cAGCTATGTGGAGAGTGCTGCGGGGGTTGCCGCAGGTGGCCGAACTGGCCTGACGGCTGTGGTGGTAGGCCTGCTGTTCATCGCCGCGATGTTCTTCGCGCCGCTGGCCGGGATGATTCCGGCCTATGCGACAGCAGGTGCACTGATca > 3:86069/1‑148 (MQ=255) tgGAGAGTGCTGCGGGGGTTGCCGCAGGTGGCCGAACTGGCCTGACGGCTGTGGTGGTAGGCCTGCTGTTCATCGCCGCGATGTTCTTCGCGCCGCTGGCCGGGATGATTCCGGCCTATGCGACAGCAGGTGCACTGATCTACGTTGc > 1:111134/1‑148 (MQ=255) ggAGAGTGCTGCGGGGGTTGCCGCAGGTGGCCGAACTGGCCTGACGGCTGTGGTGGTAGGCCTGCTGTTCATCGCCGCGATGTTCTTCGCGCCGCTGGCCGGGATGATTCCGGCCTATGCGACAGCAGGTGCACTGa > 7:36541/1‑137 (MQ=255) ggAGAGTGCTGCGGGGGTTGCCGCAGGTGGCCGAACTGGCCTGACGGCTGTGGTGGTAGGCCTGCTGTTCATCGCCGCGATGTTCTTCGCGCCGCTGGCCGGGATGATTCCGGCCTATGCGACAGCAGGTGCACTGa < 8:36541/137‑1 (MQ=255) gagTGCTGCGGGGGTTGCCGCAGGTGGCCGAACTGGCCTGACGGCTGTGGTGGTAGGCCTGCTGTTCATCGCCGCGATGTTCTTCGCGCCGCTGGcc > 5:166804/1‑97 (MQ=255) gagTGCTGCGGGGGTTGCCGCAGGTGGCCGAACTGGCCTGACGGCTGTGGTGGTAGGCCTGCTGTTCATCGCCGCGATGTTCTTCGCGCCGCTGGcc < 6:166804/97‑1 (MQ=255) caatggatgtgcgccatgctgcccatcatcagcatcgcaacgtagatcagtgcaCCTGCTGTTCATCGCCGCGATGTTCTTCGCGCCGCTGGCCGGGATGATTCCGGCCTATGCGACAGCAGGt > 7:19684‑M1/55‑124 (MQ=255) caatggatgtgcgccatgctgcccatcatcagcatcgcaacgtagatcagtgcaCCTGCTGTTCATCGCCGCGAAGTTCTTCGCGCCGCTGGCCGGGATGATTCCGGCCTATGCGACAGCAGGt < 8:19684‑M1/70‑1 (MQ=255) gggggTTGCCGCAGGTGGCCGAACTGGCCTGACGGCTGTGGTGGTAGGCCTGCTGTTCATCGCCGCGATGTTCTTCGCGCCGCTGGCCGGGATGATTCCGGCCTATGCGACAGCAGGTGCACTGATCTACGTTGCGATGCTGATGATgg < 3:70901/149‑1 (MQ=255) ccGCAGGTGGCCGAACTGGCCTGACGGCTGTGGTGGTAGGCCTGCTGTTCATCGCCGCGATGTTCTTCGCGCCGCTGGCCGGGATGATTCCGGCCTATGCGACAGCAGGTGCACTGATCTACGTTGCGATGCt < 1:3812/133‑1 (MQ=255) ccGCAGGTGGCCGAACTGGCCTGACGGCTGTGGTGGTAGGCCTGCTGTTCATCGCCGCGATGTTCTTCGCGCCGCTGGCCGGGATGATTCCGGCCTATGCGACAGCAGGTGCACTGATCTACGTTGCGATGCt > 2:3812/1‑133 (MQ=255) ccGCAGGTGGCCGAACTGGCCTGACGGCTGTGGTGGTAGGCCTGCTGTTCATCGCCGCGATGTTCTTCGCGCCGCTGGCCGGGATGATTCCGGCCTATGCGACAGCAGGTGCACTGATCTACGTTGCGATGCTGATGATGGGCAGCATg < 2:173868/149‑1 (MQ=255) aaCTGGCCTGACGGCTGTGGTGGTAGGCCTGCTGTTCATCGCCGCGATGTTCTTCGCGCCGCTGGCCGGGATGATTCCGGCCTATGCGACAGCAGGTGCACTGATCTACGTTGCGATGCTGATGATGGGCAGCATGGCGCACATCCAtt < 7:153576/149‑1 (MQ=255) gCCTGACGGCTGTGGTGGTAGGCCTGCTGTTCATCGCCGCGATGTTCTTCGCGCCGCTGGCCGGGATGATTCCGGCCTATGCGACAGCAGGTGCACTGATCTACGTTGCGATGCTGATGATgg > 6:258078/1‑123 (MQ=255) gCCTGACGGCTGTGGTGGTAGGCCTGCTGTTCATCGCCGCGATGTTCTTCGCGCCGCTGGCCGGGATGATTCCGGCCTATGCGACAGCAGGTGCACTGATCTACGTTGCGATGCTGATGATgg < 5:258078/123‑1 (MQ=255) gACGGCTGTGGTGGTAGACCTGCTGTTCATCGCCGCGATGTTCTTCGCGCCGCTGGCCGGGATGATTCCGGCCTATGCGACAGCAGGTGCACTGATCTACGTTGCGATGCTGATGATGGGCAGCATGGCGCACATCCATTGGGATGAgg > 3:246256/1‑149 (MQ=255) aCGGCTGTGGTGGTAGGCCTGCTGTTCATCGCCGCGATGTTCTTCGCGCCGCTGGCCGGGATGATTCCGGCCTATGCGACAGCAGGTGCACTGATCTACGTTGCGATGCTGATGATGGGCAGCATGGCGCACATCCATTGGGATGAg < 2:118011/147‑1 (MQ=255) gtAGGCCTGCTGTTCATCGCCGCGATGTTCTTCGCGCCGCTGGCCGGGATGATTCCGGCCTATGCGACAGCAGGTGCACTGATCTACGTTGCGATGCtga > 7:54642/1‑100 (MQ=255) gtAGGCCTGCTGTTCATCGCCGCGATGTTCTTCGCGCCGCTGGCCGGGATGATTCCGGCCTATGCGACAGCAGGTGCACTGATCTACGTTGCGATGCtga < 8:54642/100‑1 (MQ=255) | CGAGAACCTGTCGAAGGCGTTGAAGGCTGACAGTGCCTCGAGTGTGTTCGGCGCGGTGGTCGGTGTACCGCCGGTGACCAGCTATGTGGAGAGTGCTGCGGGGGTTGCCGCAGGTGGCCGAACTGGCCTGACGGCTGTGGTGGTAGGCCTGCTGTTCATCGCCGCGATGTTCTTCGCGCCGCTGGCCGGGATGATTCCGGCCTATGCGACAGCAGGTGCACTGATCTACGTTGCGATGCTGATGATGGGCAGCATGGCGCACATCCATTGGGATGAGG > NC_002947/4875697‑4875974 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |