New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4875844 = | 30 (0.610) | 3 (0.060) | 3/240 | NT | 7.9% | coding (1032/1350 nt) | PP_4284 | transporter |
? | NC_002947 | 4875913 = | 42 (0.910) | coding (1101/1350 nt) | PP_4284 | transporter |
CCGGTGACCAGCTATGTGGAGAGTGCTGCGGGGGTTGCCGCAGGTGGCCGAACTGGCCTGACGGCTGTGGTGGTAGGCCTGCTGTTCATCGCCGCGATGTTCTTCGCGCCGCTGGCCGGGATGATTCCGGCCTATGCGACAGCAGGTGCACTGATCTACGTTGCGATGCTGATGATGGGCAGCATGGCGCACATCCATTGGGATGAGGCCACCGACAGCATTCCGGCGATCGTCACAGTGATCATGATGCCGCTGACGTTCTCGGTCGCCGATGGTATTGCCCTGGGCTTCAT > NC_002947/4875767‑4876059 | ccgGTGACCAGCTATGTGGAGAGTGCTGCGGGGGTTGCCGCAGGTGGCCGAACTGGCCTGACGGCTGTGGTGGTAGGCCTGCTGTTCATCGCCGCGATGTTCTTCGCGCCGCTGGCCGGGATGATTCCGGCCTATGCGACAGCAGGt < 7:12421/147‑1 (MQ=255) ccgGTGACCAGCTATGTGGAGAGTGCTGCGGGGGTTGCCGCAGGTGGCCGAACTGGCCTGACGGCTGTGGTGGTAGGCCTGCTGTTCATCGCCGCGATGTTCTTCGCGCCGCTGGCCGGGATGATTCCGGCCTATGCGACAGCAGGt > 8:12421/1‑147 (MQ=255) aCCAGCTATGTGGAGAGTGCTGCGGGGGTTGCCGCAGGTGGCCGAACTGGCCTGACGGCTGTGGTGGTAGGCCTGCTGTTCATCGCCGCGATGTTCTTCGCGCCGCTGGCCGGGATGATTCCGGCCTATGCGACAGCAGGTGCACTGAt > 7:223720/1‑149 (MQ=255) cAGCTATGTGGAGAGTGCTGCGGGGGTTGCCGCAGGTGGCCGAACTGGCCTGACGGCTGTGGTGGTAGGCCTGCTGTTCATCGCCGCGATGTTCTTCGCGCCGCTGGCCGGGATGATTCCGGCCTATGCGACAGCAGGTGCACTGAt < 4:86069/147‑1 (MQ=255) cAGCTATGTGGAGAGTGCTGCGGGGGTTGCCGCAGGTGGCCGAACTGGCCTGACGGCTGTGGTGGTAGGCCTGCTGTTCATCGCCGCGATGTTCTTCGCGCCGCTGGCCGGGATGATTCCGGCCTATGCGACAGCAGGTGCACTGATca > 3:86069/1‑148 (MQ=255) tgGAGAGTGCTGCGGGGGTTGCCGCAGGTGGCCGAACTGGCCTGACGGCTGTGGTGGTAGGCCTGCTGTTCATCGCCGCGATGTTCTTCGCGCCGCTGGCCGGGATGATTCCGGCCTATGCGACAGCAGGTGCACTGATCTACGTTGc > 1:111134/1‑148 (MQ=255) ggAGAGTGCTGCGGGGGTTGCCGCAGGTGGCCGAACTGGCCTGACGGCTGTGGTGGTAGGCCTGCTGTTCATCGCCGCGATGTTCTTCGCGCCGCTGGCCGGGATGATTCCGGCCTATGCGACAGCAGGTGCACTGa > 7:36541/1‑137 (MQ=255) ggAGAGTGCTGCGGGGGTTGCCGCAGGTGGCCGAACTGGCCTGACGGCTGTGGTGGTAGGCCTGCTGTTCATCGCCGCGATGTTCTTCGCGCCGCTGGCCGGGATGATTCCGGCCTATGCGACAGCAGGTGCACTGa < 8:36541/137‑1 (MQ=255) caatggatgtgcgccatgctgcccatcatcagcatcgcaacgtagatcagtgcaCCTGCTGTTCATCGCCGCGATGTTCTTCGCGCCGCTGGCCGGGATGATTCCGGCCTATGCGACAGCAGGt > 7:19684‑M1/55‑124 (MQ=255) caatggatgtgcgccatgctgcccatcatcagcatcgcaacgtagatcagtgcaCCTGCTGTTCATCGCCGCGAAGTTCTTCGCGCCGCTGGCCGGGATGATTCCGGCCTATGCGACAGCAGGt < 8:19684‑M1/70‑1 (MQ=255) gggggTTGCCGCAGGTGGCCGAACTGGCCTGACGGCTGTGGTGGTAGGCCTGCTGTTCATCGCCGCGATGTTCTTCGCGCCGCTGGCCGGGATGATTCCGGCCTATGCGACAGCAGGTGCACTGATCTACGTTGCGATGCTGATGATgg < 3:70901/149‑1 (MQ=255) ccGCAGGTGGCCGAACTGGCCTGACGGCTGTGGTGGTAGGCCTGCTGTTCATCGCCGCGATGTTCTTCGCGCCGCTGGCCGGGATGATTCCGGCCTATGCGACAGCAGGTGCACTGATCTACGTTGCGATGCt > 2:3812/1‑133 (MQ=255) ccGCAGGTGGCCGAACTGGCCTGACGGCTGTGGTGGTAGGCCTGCTGTTCATCGCCGCGATGTTCTTCGCGCCGCTGGCCGGGATGATTCCGGCCTATGCGACAGCAGGTGCACTGATCTACGTTGCGATGCt < 1:3812/133‑1 (MQ=255) ccGCAGGTGGCCGAACTGGCCTGACGGCTGTGGTGGTAGGCCTGCTGTTCATCGCCGCGATGTTCTTCGCGCCGCTGGCCGGGATGATTCCGGCCTATGCGACAGCAGGTGCACTGATCTACGTTGCGATGCTGATGATGGGCAGCATg < 2:173868/149‑1 (MQ=255) aaCTGGCCTGACGGCTGTGGTGGTAGGCCTGCTGTTCATCGCCGCGATGTTCTTCGCGCCGCTGGCCGGGATGATTCCGGCCTATGCGACAGCAGGTGCACTGATCTACGTTGCGATGCTGATGATGGGCAGCATGGCGCACATCCAtt < 7:153576/149‑1 (MQ=255) gCCTGACGGCTGTGGTGGTAGGCCTGCTGTTCATCGCCGCGATGTTCTTCGCGCCGCTGGCCGGGATGATTCCGGCCTATGCGACAGCAGGTGCACTGATCTACGTTGCGATGCTGATGATgg > 6:258078/1‑123 (MQ=255) gCCTGACGGCTGTGGTGGTAGGCCTGCTGTTCATCGCCGCGATGTTCTTCGCGCCGCTGGCCGGGATGATTCCGGCCTATGCGACAGCAGGTGCACTGATCTACGTTGCGATGCTGATGATgg < 5:258078/123‑1 (MQ=255) gACGGCTGTGGTGGTAGACCTGCTGTTCATCGCCGCGATGTTCTTCGCGCCGCTGGCCGGGATGATTCCGGCCTATGCGACAGCAGGTGCACTGATCTACGTTGCGATGCTGATGATGGGCAGCATGGCGCACATCCATTGGGATGAgg > 3:246256/1‑149 (MQ=255) aCGGCTGTGGTGGTAGGCCTGCTGTTCATCGCCGCGATGTTCTTCGCGCCGCTGGCCGGGATGATTCCGGCCTATGCGACAGCAGGTGCACTGATCTACGTTGCGATGCTGATGATGGGCAGCATGGCGCACATCCATTGGGATGAg < 2:118011/147‑1 (MQ=255) gtAGGCCTGCTGTTCATCGCCGCGATGTTCTTCGCGCCGCTGGCCGGGATGATTCCGGCCTATGCGACAGCAGGTGCACTGATCTACGTTGCGATGCtga < 8:54642/100‑1 (MQ=255) gtAGGCCTGCTGTTCATCGCCGCGATGTTCTTCGCGCCGCTGGCCGGGATGATTCCGGCCTATGCGACAGCAGGTGCACTGATCTACGTTGCGATGCtga > 7:54642/1‑100 (MQ=255) acctgctgtcgcataggccggaatcatcccggccagcggcgcgaagaacttcgcggcgatgaacagcaggTGCACTGATCTACGTTGCGATGCTGATGATGGGCAGCATGGCGCACATCCATTg < 8:19684‑M2/54‑1 (MQ=255) acctgctgtcgcataggccggaatcatcccggccagcggcgcgaagaacatcgcggcgatgaacagcaggTGCACTGATCTACGTTGCGATGCTGATGATGGGCAGCATGGCGCACATCCATTg > 7:19684‑M2/71‑124 (MQ=255) ctgctgtcgcataggccggaatcatcccggccagcggcgcgaagaacatcgcggcgatgaacagcaggTGCACTGATCTACGTTGCGATGCTGATGATGGGCAGCATGGCGCACATCCATTGGGATGAGGCCACCGACAGCATTCCGGc > 4:69997‑M2/69‑149 (MQ=255) TTCATCGCCGCGATGTTCTTCGCGCCGCTGGCCGGGATGATTCCGGCCTATGCGACAGCAGGTGCACTGATCTACGTTGCGATGCTGATGATGGGCAGCATGGCGCACATCCATTGGGa < 8:243856‑M1/119‑1 (MQ=255) TTCATCGCCGCGATGTTCTTCGCGCCGCTGGCCGGGATGATTCCGGCCTATGCGACAGCAGGTGCACTGATCTACGTTGCGATGCTGATGATGGGCAGCATGGCGCACATCCATTGGGa > 7:243856‑M1/1‑119 (MQ=255) TTCATCGCCGCGATGTTCTTCGCGCCGCTGGCCGGGATGATTCCGGCCTATGCGACAGCAGGTGCACTGATCTACGTTGCGATGCTGATGATGGGCAGCATGGCGCACATCCATTGGGATGAGGCCACCGACAGCATTCCGGCGATCGt < 2:278506‑M1/149‑1 (MQ=255) tCGCCGCGATGTTCTTCGCGCCGCTGGCCGGGATGATTCCGGCCTATGCGACAGCAGGTGCACTGATCTACGTTGCGATGCTGATGATGGGCAGCATGGCGCACATCCATTGGGATGAGGCCACCGACAGCATTCCGGCGATCGTcaca < 1:278506/149‑1 (MQ=255) tCGCCGCGATGTTCTTCGCGCCGCTGGCCGGGATGATTCCGGCCTATGCGACAGCAGGTGCACTGATCTACGTTGCGATGCTGATGATGGGCAGCATGGCGCACATCCATTGGGATGAGGCCACCGACAGCATTCCGGCGATCGTca > 1:19224/1‑147 (MQ=255) ccgcGATGTTCTTCGCGCCGCTGGCCGGGATGATTCCGGCCTATGCGACAGCAGGTGCACTGATCTACGTTGCGATGCTGATGATGGGCAGCATGGCGCACATCCATTGGGATGAGGCCACCGACAGCATTCCGGCGATCGTCACAGTg < 4:246256/149‑1 (MQ=255) gTTCTTCGCGCCGCTGGCCGGGATGATTCCGGCCTATGCGACAGCAGGTGCACTGATCTACGTTGCGATGCTGATGATGGGCAGCATGGCGCACATCCATTGGGATGAGGCCACCGACAGCATTCCGGCGATCGTCACAGTGATCatga > 3:261481/1‑149 (MQ=255) gTTCTTCGCGCCGCTGGCCGGGATGATTCCGGCCTATGCGACAGCAGGTGCACTGATCTACGTTGCGATGCTGATGATGGGCAGCATGGCGCACATCCATTGGGATGAGGCCACCGACAGCATTCCGGCGATCGTCACAGTGATCatga > 2:180402/1‑149 (MQ=255) cttcGCGCCGCTGGCCGGGATGATTCCGGCCTATGCGACAGCAGGTGCACTGATCTACGTTg > 6:183223/1‑62 (MQ=255) cttcGCGCCGCTGGCCGGGATGATTCCGGCCTATGCGACAGCAGGTGCACTGATCTACGTTg < 5:183223/62‑1 (MQ=255) cttcGCGCCGCTGGCCGGGATGATTCCGGCCTATGCGACAGCAGGTGCACTGATCTACGTTGCGATGCTGATGATGGGCAGCATGGCGCACATCCATTGGGATGAGGCCACCGACAGCATTCCGGCGATCGTCACAGTGATCATGATGc > 5:32866/1‑149 (MQ=255) ttcGCGCCGCTGGCCGGGATGATTCCGGCCTATGCGACAGCAGGTGCACTGATCTACGTTGCGATGCTGATGATGGGCAGCATGGCGCACATCCATTGGGATGAGGCCACCGACAGCATTCCGGCGATCGTCACAGTGATCATGATGcc > 7:279397/1‑149 (MQ=255) ttcGCGCCGCTGGCCGGGATGATTCCGGCCTATGCGACAGCAGGTGCACTGATCTACGTTGCGATGCTGATGATGGGCAGCATGGCGCACATCCATTGGGATGAGGCCACCGACAGCATTCCGGCGATCGTCACAGTGATCATGATGcc > 6:280609/1‑149 (MQ=255) ttcGCGCCGCTGGCCGGGATGATTCCGGCCTATGCGACAGCAGGTGCACTGATCTACGTTGCGATGCTGATGATGGGCAGCATGGCGCACATCCATTGGGATGAGGCCACCGACAGCATTCCGGCGATCGTCACAGTGATCATGATGcc > 7:63321/1‑149 (MQ=255) gcgcCGCTGGCCGGGATGATTCCGGCCTATGCGACAGCAGGTGCACTGATCTACGTTGCGATGCTGATGATGGGCAGCATGGCGCACATCCATTGGGATGAGGCCACCGACAGCATTCCGGCGATCGTCACAGTGATCATGATGCCGc < 6:32866/148‑1 (MQ=255) gcgtgCCGGGATGATTCCGGCCTATGCTACAGCAGGTTCACTGATCTACGTTGCGATGCTGATGATGGGCAGCATGGCGCACATCCATTGGGATGAGGCCACCGACAGCATTCCGGCGATCGTCACAGTGATCATGATGCCGCTGACGt < 8:223720/145‑1 (MQ=255) ataggCCGGAATCATCCCGGCCTATGCGACAGCAGGTCCACTGATCTACGTTGCGATGCTGATGATGGGCAGCATGGCGCACATCCATTGGGATGAGGCCACCGACAGCATTCCGGCGATCGTCACAGTGATCATGATGCCGCTGACGt > 1:57340/4‑149 (MQ=255) gCCGGGATGAGTCCGGCCTATGCGACAGCAGGTGCACTGATCTACGTTGCGATGCTGATGATGGGCCGCATGGCGCACATCCAGTGCGATGAGGCGCCCGAGAGCATTCCGGCGATCGTCACAGTGATCATGATGCCGCTGACGGtctc > 8:257960/1‑149 (MQ=255) gggATGATTCCGGCCTATGCGACAGCAGGTGCACTGATCTACGTTGCGATGCTGATGATGGGCAGCATGGCGCACATCCATTGGGATGAGGCCACCGACAGCATTCCGGCGATCGTCACAGTGATCATGATGCCGCTGACGTTCTCgg > 5:173764/1‑148 (MQ=255) ggATGATTCCGGCCTATGCGACAGCAGGTGCACTGATCTACGTTGCGATGCTGATGATGGGCAGCATGGCGCACATCCATTGGGATGAGGCCACCGACAGCATTCCGGCGATCGTCACAGTGATCATGATGCCGCTGACGTTCTCGGTc < 8:279397/149‑1 (MQ=255) tgatTCCGGCCTATGCGACAGCAGGTGCACTGATCTACGTTGCGATGCTGATGATGGGCAGCATGGCGCACATCCATTGGGATGAGGCCACCGACAGCATTCCGGCGATCGTCACAGTGATCATGATGCCGCTGACGCTCTCGGTCGc > 4:151163/1‑148 (MQ=255) tgatTCCGGCCTATGCGACAGCAGGTGCACTGATCTACGTTGCGATGCTGATGATGGGCAGCATGGCGCACATCCATTGGGATGAGGCCACCGACAGCATTCCGGCGATCGTCACAGTGATCATGATGCCGCTGACGCTCTCGGTCGc < 3:151163/148‑1 (MQ=255) ttCCGGCCTATGCGACAGCAGGTGCACTGATCTACGTTGCGATGCTGATGATGGGCAGCATGGCGCACATCCATTGGGATGAGGCCACCGACAGCATTCCGGCGATCGTCACAGTGATCATGATGCCGCTGACGTTCTCgg > 4:83981/1‑141 (MQ=255) ttCCGGCCTATGCGACAGCAGGTGCACTGATCTACGTTGCGATGCTGATGATGGGCAGCATGGCGCACATCCATTGGGATGAGGCCACCGACAGCATTCCGGCGATCGTCACAGTGATCATGATGCCGCTGACGTTCTCgg < 3:83981/141‑1 (MQ=255) ccGGCCTATGCGACAGCAGGTGCACTGATCTACGTTGCGATGCTGATGATGGGCAGCATGGCGCACATCCATTGGGATGAGGCCACCGACAGCATTCCGGCGATCGTCACAGTGATCATGATGCCGCTGACGTTCTCGGTCGCCGATg < 1:180402/148‑1 (MQ=255) ccGGCCTAAGCGACAGCAGGTGCACTGATCTACGATGCCATGCTGATGATGGCCAGCAAGGCGCACATCCATTGGGATGAGGCCACCGACACCATTCCGGCCATCGTCACAGTGATCATGATGCCGCTGACGTTCTCCGTCGCCGATgg > 6:157278/1‑149 (MQ=255) ggCCTATGCGACAGCTGGTGCAGTGATCTACGTTGCGATGCTGATGATGGGCAGCATGGCGCTCATCCATTGGGATGAGGCGAGCGACAGCTTTCCGGGGATCGTGACAGTGATCTTGATGCGGCTGACGTTCTCGGTCGCGGATGGtt < 5:157278/149‑2 (MQ=255) ggCCTATGCGACAGCAGGTGCACTGATCTACGTTGCGATGCTGATGATGGGCAGCATGGCGCACATCCATTGGGATGAGGCCACCGACAGCATTCCGGCGATCGTCACAGTGATCATGATGCCGCTGACGTTCTCGGTCGCCGATGGTa < 5:280609/149‑1 (MQ=255) cGACAGCAGGTGCACTGATCTACGTTGCGATGCTGATGATGGGCAGCATGGCGCACATCCATTGGGATGAGGCCACCGACAGCATTCCGGCGATCGTCACAGTGTTCATGATGCCGCTGACGTTCTCGGTCGCCGATGGTATTGACCTg > 6:186640/1‑149 (MQ=255) cGACAGCAGGTGCACTGATCTACGTTGCGATGCTGATGATGGGCAGCATGGCGCACATCCATTGGGATGAGGCCACCGACAGCATTCCGGCGATCGTCACAGTGATCATGATGCCGCTGACGTTCTCGGTCGCCGATGGTATTGCCCTg < 2:57340/149‑1 (MQ=255) gTGCACTGATCTACGTTGCGATGCTGATGATGGGCAGCATGGCGCACATCCATTGGGATGAGGCCACCGACAGCATTCCGGCGATCGTCACAGTGATCATGATGCCGCTGACGTTCTCGGTCGCAGATGGTATTGCCCTGGGCTtcat > 8:282259‑M2/2‑148 (MQ=255) | CCGGTGACCAGCTATGTGGAGAGTGCTGCGGGGGTTGCCGCAGGTGGCCGAACTGGCCTGACGGCTGTGGTGGTAGGCCTGCTGTTCATCGCCGCGATGTTCTTCGCGCCGCTGGCCGGGATGATTCCGGCCTATGCGACAGCAGGTGCACTGATCTACGTTGCGATGCTGATGATGGGCAGCATGGCGCACATCCATTGGGATGAGGCCACCGACAGCATTCCGGCGATCGTCACAGTGATCATGATGCCGCTGACGTTCTCGGTCGCCGATGGTATTGCCCTGGGCTTCAT > NC_002947/4875767‑4876059 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |