New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 279658 | 42 (0.850) | 3 (0.060) | 3/246 | NT | 6.4% | coding (591/669 nt) | sctS | sulfur compound ABC transporter permease |
? | NC_002947 | = 279717 | 47 (0.990) | coding (532/669 nt) | sctS | sulfur compound ABC transporter permease |
TTCAATCATGCTCAATGCTCCTGGTCATGCTGGTTGACCCGCGCTTCCATGCGGTTCTGGAAGTGCGCAAGGATGCTGCACAGCACCCAGTAGATGACCGCGACCGCCACGTACATGGTGAACACTTCGAACGTGCGCGCGGTAATCAGCTGGGCTTGGCGGAACAGCTCGGGCACCTGGATGGTCGCCGCCAGGGCGGTGTCCTTTACCAGCGAGATGAAGCTGTTGCCCAGCGGTGGCAACGCGGTGCGCAAGGCCTGTGGCAGGATCGCCCGGCGCATGGCTTGCACGCGG > NC_002947/279569‑279862 | ttCAATCATGCTCAATGCTCCTGGTCATGCTGGTTGACCCGCGCTTCCATGCGGTTCTGGAAGTGCGCAAGGATGCTGCACAGCACCCAGTAGATGACCGCGACCGCCACGTACATGGTGAACACTTCGAACGTGCGCGCGGTAATCAg > 2:57281/1‑149 (MQ=255) aaTCATGCTCAATGCTCCTGGTCATGCTGGTTGACCCGCGCTTCCATGCGGTTCTGGAAGTGCGCAAGGATGCTGCACAGCACCCAGTAGATGACCGCGACCGCCACGTACATGGTGAACACTTCGAACGTGCGCGCGGTAATCAGctg < 5:100685‑M2/149‑4 (MQ=255) aaTCATGCTCAATGCTCCTGGTCATGCTGGTTGACCCGCGCTTCCATGCGGTTCTGGAAGTGCGCAAGGATGCTGCACAGCACCCAGTAGATGACCGCGACCGCCACGTACATGGTGAACACTTCGAACGTGCGCGCGGTAATCAGct > 2:301313‑M2/1‑146 (MQ=255) tCATGCTCAATGCTCCTGGTCATGCTGGTTGACCCGCGCTTCCATGCGGTTCTGGAAGTGCGCAAGGATGCTGCACAGCACCCAGTAGATGACCGCGACCGCCACGTACATGGTGAACACTTCGAACGTGCGCGCGGTAATCAGctggg > 5:56580‑M2/1‑144 (MQ=255) tGCTCAATGCTCCTGGTCATGCTGGTTGACCCGCGCTTCCATGCGGTTCTGGAAGTGCGCAAGGATGCTGCACAGCACCCAGTAGATGACCGCGACCGCCACGTACATGGTGAACACTTCGAACGTGCGCGCGGTAATCAGCTGGGCt < 4:124520/148‑1 (MQ=255) tGCTCAATGCTCCTGGTCATGCTGGTTGACCCGCGCTTCCATGCGGTTCTGGAAGTGCGCAAGGATGCTGCACAGCACCCAGTAGATGACCGCGACCGCCACGTACATGGTGAACACTTCGAACGTGCGCGCGGTAATCAGCTGGGCt > 3:124520/1‑148 (MQ=255) aaTGCTCCTGGTCATGCTGGTTGACCCGCGCTTCCATGCGGTTCTGGAAGTGCGCAAGGATGCTGCACAGCACCCAGTAGATGAACGCGACCGCCACGTACATGGTGAACACTTCGAACGTGCGCGCGGTAATCAGCTGGGCTTGGCg > 1:260851/1‑148 (MQ=255) tCCTGGTCATGCTGGTTGACCCGCGCTTCCATGCGGTTCTGGAAGTGCGCAAGGATGCTGCACAGCACCCAGTAGATGACCGCGACCGCCACGTACATGGTGAACACTTCGAACGTGCGCGCGGTAATCAGCTGGGCTTGGCGGAACAg > 6:181371/1‑149 (MQ=255) cTGGTCATGCTGGTTGACCCGCGCTTCCATGCGGTTCTGGAAGTGCGCAAGGATGCTGCACAGCACCCAGTAGATGACCGCGACCGCCACGTACATGGTGAACACTTCGAACGTGCGCGCGGTAATCAGCTGGGCTTGGCGGAACAGCt > 5:67549/1‑149 (MQ=255) gTTGACCCGCGCTTCCATGCGGTTCTGGAAGTGCGCAAGGATGCTGCACAGCACCCAGTAGATGACCGCGACCGCCACGTACATGGTGAACACTTCGAACGTGCGCGCGGTAATCAGCTGGGCTTGGCGGAACAGCTCGGGCACCTGGa > 1:247623/1‑149 (MQ=255) cccGCGCTTCCATGCGGTTCTGGAAGTGCGCAAGGATGCTGCACAGCACCCAGTAGATGACCGCGACCGCCACGTACATGGTGAACACTTCGAACGTGCGCGCGGTAATCAGCTGGGCTTGGCGGAACAGCTCGGGCACCTGGATGGTc < 7:108540/149‑1 (MQ=255) ccGCGCTTCCATGCGGTTCTGGAAGTGCGCAAGGATGCTGCACAGCACCCAGTAGATGACCGCGACCGCCACGTACATGGTGAACACTTCGAACGTGCGCGCGGTAATCAGCTGGGCTTGGCGGAACAGCTCGGGCACCTGGATGGTcg > 6:231675/1‑149 (MQ=255) gcTTCCATGCGGTTCTGGAAGTGCGCAAGGATGCTGCACAGCACCCAGTAGATGACCGCGACCGCCACGTACATGGTGAACACTTCGAACGTGCGCGCGGTAATCAGCTGGGCTTGGCGGAACAGCTCGGGCACCTGGATGGTcgccgc > 2:32494/1‑149 (MQ=255) ttCTGGAAGTGCGCAAGGATGCTGCACAGCACCCAGTAGATGACCGCGACCGCCACGTACATGGTGAACACTTCGAACGTGCGCGCGGTAATCAGCTGGGCTTGGCGGAACAGCTCGGGCACCTGGATGGTCGCCGCCAGGGCGGTGTc < 2:247623/149‑1 (MQ=255) tGGAAGTGCGCAAGGATGCTGCACAGCACCCAGTAGATGACCGCGACCGCCACGTACATGGTGAACACTTCGAACGTGCGCGCGGTAATCAGCTGGGCTTGGCGGAACAGCTCGTGCACCTGGATGGTCGCCGCCAGGGCGGTGTCCtt > 3:210682/1‑149 (MQ=255) tGGAAGTGCGCAAGGATGCTGCACAGCACCCAGTAGATGACCGCGACCGCCACGTACATGGTGAACACTTCGAACGTGCGCGCGGTAATCAGCTGGGCTTGGCGGAACAGCTCGGGCACCTGGATGGTCGCCGCCAGGGCGGTGTCCtt > 6:121461/1‑149 (MQ=255) tGGAAGTGCGCAAGGATGCTGCACAGCACCCAGTAGATGACCGCGACCGCCACGTACATGGTGAACACTTCGAACGTGCGCGCGGTAATCAGCTGGGCTTGGCGGAACAGCTCGGGCACCTGGATGGTCGCCGCCAGGGCGGTGTCCtt > 6:126307/1‑149 (MQ=255) gAAGTGCGCAAGGATGCTGCACAGCACCCAGTAGATGACCGCGACCGCCACGTACATGGTGAACACTTCGAACGTGCGCGCGGTAATCAGCTGGGCTTGGCGGAACAGCTCGGGCACCTGGATGGTCGCCGCCAGGGCGGTGTCCtt < 1:312055/147‑1 (MQ=255) gcAAGGATGCTGCACAGCACCCAGTAGATGACCGCGACCGCCACGTACATGGTGAACACTTCGAACGTGCGCGCGGTAATCAGCTGGGCTTGGCGGAACAGCTCGGGCACCTGGATGGTCGCCGCCAGGGCGGTGTCCTTTACCAGCga < 2:260851/149‑1 (MQ=255) aaGGATGCTGCACAGCACCCAGTAGATGACCGCGACCGCCACGTACATGGTGAACACTTCGAACGTGCGCGCGGTAATCAGCTGGGCTTGGCGGAACAGCTCGGGCACCTGGATGGTCGCCGCCAGGGCGGTGTCCTTTACCAGc > 8:183707/1‑145 (MQ=255) gATGCTGCACAGCACCCAGTAGATGACCGCGACCGCCACGTACATGGTGAACACTTCGAACGTGCGCGCGGTAATCAGCTGGGCTTGGCGGAACAGCTCGGGCACCTGGATGGTCGCCGCCAGGGCGGTGTCCTTTACCAGCGAGATGa < 2:61592/149‑1 (MQ=255) ctgcACAGCACCCAGTAGATGACCGCGACCGCCACGTACATGGTGAACACTTCGAACGTGCGCGCGGTAATCAGCTGGGCTTGGCGGAACAGCTCGGGCACCTGGATGGTCGCCGCCAGGGCGGTGTCCTTTACCAGCGAGATGAAGCt > 5:72353/1‑149 (MQ=255) tgcACAGCACCCAGTAGATGACCGCGACCGCCACGTACATGGTGAACACTTCGAACGTGCGCGCGGTAATCAGCTGGGCTTGGCGGAACAGCTCGGGCACCTGGATGGTCGCCGCCAGGGCGGTGTCCTTTACCAGCGAGATGAAGCTg > 3:188758/1‑149 (MQ=255) cacaGCACCCAGTAGATGACCGCGACCGCCACGTACATGGTGAACACTTCGAACGTGCGCGCGGTAATCAGCTGGGCTTGGCGGAACAGCTCGGGCACCTGGATGGTCGCCGCCAGGGCGGTGTCCTTTACCAGCGAGATGAAGCTGtt < 1:57281/149‑1 (MQ=255) caGCACCCAGTAGATGACCGCGACCGCCACGTACATGGTGAACACTTCGAACGTGCGCGCGGTAATCAGCTGGGCTTGGCGGAACAGCTCGGGCACCTGGATGGTCGCCGCCAGGGCGGTGTCCTTTACCAGCGAGATGAAGCTGTTGc < 5:181371/149‑1 (MQ=255) aCCCAGTAGATGACCGCGACCGCCACGTACATGGTGAACACTTCGAACGTGCGCGCGGTAATCAGCTGGGCTTGGCGGAACAGCTCGGGCACCTGGATGGTCGCCGCCAGGGCGGTGTCCTTTACCAGCGAGATGAAGCTGTTGCCCAg > 6:53464/1‑149 (MQ=255) ccAGTAGATGACCGCGACCGCCACGTACATGGTGAACACTTCGAACGTGCGCGCGGTAATCAGctgggtgctgtgcagcatccttgcgcacttccagaaccgcatggaagcgcgggtcaaccagcatgaccaggagcattgagcatgat < 2:307256‑M2/149‑87 (MQ=255) ccAGTAGATGACAGCGACCGCCACGTACATGGTGAACACTTCGAACGTGCGCGCGGTAATCAGCTGGGCTTGGCGGAACAGCTCGGGCACCTGGATGGTCGCCGCCAGGGCGGTGTCCTTTACCAGCGAGATGAAGCTGTTGCCCAGCg > 7:24278/1‑149 (MQ=255) aGTAGATGACCGCGACCGCCACGTACATGGTGAACACTTCGAACGTGCGCGCGGTAATCAGCTGGGCTTGGCGGAACAGCTCGGGCACCTGGATGGTCGCCGCCAGGGCGGTGTCCTTTACCAGCGAGATGAAGATGTTGCCCAGAGGt > 8:43770/1‑149 (MQ=255) tAGATGACCGCGACCGCCACGTACATGGTGAACACTTCGAACGTGCGCGCGGTAATCAGctgggtgctgtgcagcatccttgcgcacttccagaaccgcatggaagcgcgggtcaaccagcatgaccaggagcattgagcatgattgaa > 7:99728‑M2/1‑59 (MQ=255) tAGATGACCGCGACCGCCACGTACATGGTGAACACTTCGAACGTGCGCGCGGTAATCAGCTGGGCTTGGCGGAACAGCTCGGGCACCTGGATGGTCGCCGCCAGGGCGGTGTCCTTTACCAGCGAGATGAAGCTGTTGCCCAGCGGTgg < 6:67549/149‑1 (MQ=255) gATGACCGCGACCGCCACGTACATGGTGAACACTTCGAACGTGCGCGCGGTAATCAGCTGGGCTTGGCGGAACAGCTCGGGCACCTGGATGGTCGCCGCCAGGGCGGTGTCCTTTACCAGCGAGATGAAGCTGTTGCCCAGCGGTGGc < 5:180925/148‑1 (MQ=255) gATGACCGCGACCGCCACGTACATGGTGAACACTTCGAACGTGCGCGCGGTAATCAGCTGGGCTTGGCGGAACAGCTCGGGCACCTGGATGGTCGCCGCCAGGGCGGTGTCCTTTACCAGCGAGATGAAGCTGTTGCCCAGCGGTGGCa > 8:237374/1‑149 (MQ=255) gATGACCGCGACCGCCACGTACATGGTGAACACTTCGAACGTGCGCGCGGTAATCAGCTGGGCTTGGCGGAACAGCTCGGGCACCTGGATGGTCGCCGCCAGGGCGGTGTCCTTTACCAGCGAGATGAAGCTGTTGCCCAGCGGTGGCa < 4:188758/149‑1 (MQ=255) tGACCGCGACCGCCACGTACATGGTGAACACTTCGAACGTGCGCGCGGTAATCAGCTGGGCTTGGCGGAACAGCTCGGGCACCTGGATGGTCGCCGCCAGGGCGGTGTCCTTTACCAGCGAGATGAAGCTGTTGCCCAGCGGTGGCAAc < 6:100685/149‑1 (MQ=255) tGACCGCGACCGCCACGTACATGGTGAACACTTCGAACGTGCGCGCGGTAATCAGCTGGGCTTGGCGGAACAGCTCGGGCACCTGGATGGTCGCCGCCAGGGCGGTGTCCTTTACCAGCGAGATGAAGCTGTTGCCCAGCGGTGGCAAc < 7:87426/149‑1 (MQ=255) gaccgcCACGTACATGGTGAACACTTCGAACGTGCGCGCGGTAATCAGCTGGGCTTGGCGGAACAGCTCGGGCACCTGGATGGTCGCCGCCAGGGCGGTGTCCTTTACCAGCGAGATGAAGCTGTTGCCCAGCGGTGGCAACGCGGTgc < 5:126307/149‑1 (MQ=255) gaccgcCACGTACATGGTGAACACTTCGAACGTGCGCGCGGTAATCAGCTGGGCTTGGCGGAACAGCTCGGGCACCTGGATGGTCGCCGCCAGGGCGGTGTCCTTTACCAGCGAGATGAAGCTGTTGCCCAGCGGTGGCAACGCGGTgc > 8:84724/1‑149 (MQ=255) gaccgcCACGTACATGGTGAACACTTCGAACGTGCGCGCGGTAATCAGCTGGGCTTGGCGGAACAGCTCGGGCACCTGGATGGTCGCCGCCAGGGCGGTGTCCTTTACCAGCGAGATGAAGCTGTTGCCCAGCGGTGGCAACGCGGTgc < 8:24278/149‑1 (MQ=255) gaccgcCACGTACATGGTGAACACTTCGAACGTGCGCGCGGTAATCAGCTGGGCTTGGCGGAACAGCTCGGGCACCTGGATGGTCGCCGCCAGGGCGGTGTCCTTTACCAGCGAGATGAAGCTGTTGCCCAGCGGTGGCAACGCGGTgc < 5:121461/149‑1 (MQ=255) cACGTACATGGTGAACACTTCGAACGTGCGCGCGGTAATCAGCTGGGCTTGGCGGAACAGCTCGGGCACCTGGATGGTCGCCGCCAGGGCGGTGTCCTTTACCAGCGAGATGAAGCTGTTGCCCAGCGGTGGCAACGCGGTGCGCAAgg > 5:9928/1‑149 (MQ=255) aCATGGTGAACACTTCGAACGTGCGCGCGGTAATCAGCTGGGCTTGGCGGAACAGCTCGGGCACCTGGATGGTCGCCGCCAGGGCGGTGTCCTTTACCAGCGAGATGAAGCTGTTGCCCAGCGGTGGCAACGCGGTGCGCAAGGCCtgt > 3:67119/1‑149 (MQ=255) cATGGTGAACACTTCGAACGTGCGCGCGGTAATCAGCTGGGCTTGGCGGAACAGCTCGTGCACCTGGATGGTCGCCGCCAGGGCGGTGTCCTTTACCAGCGAGATGAAGCTGTTGCCCAGCGGTGGCAACGCGGTGCGCAAGGCCtgt < 4:210682/148‑1 (MQ=255) cATGGTGAACACTTCGAACGTGCGCGCGGTAATCAGCTGGGCTTGGCGGAACAGCTCGGGCACCTGGATGGTCGCCGCCAGGGCGGTGTCCTTTACCAGCGAGATGAAGCTGTTGCCCAGCGGTGGCAACGCGGTGCGCAAGGCCtgt < 7:237374/148‑1 (MQ=255) tGGTGAACACTTCGAACGTGCGCGCGGTAATCAGCTGGGCTTGGCGGAACAGCTCGGGCACCTGGATGGTCGCCGCCAGGGCGGTGTCCTTTACCAGCGAGATGAAGCTGTTGCCCAGCGGTGGCAACGCGGTGCGCAAGGCCTGTGGc < 7:183707/149‑1 (MQ=255) gTGAACACTTCGAACGTGCGCGCGGTAATCAGCTGGGCTTGGCGGAACAGCTCGGGCACCTGGATGGTCGCCGCCAGGGCGGTGTCCTTTACCAGCGAGATGAAGCTGTTGCCCAGCGGTGGCAACGCGGTGCGCAAGGCCTGTGGCAg < 4:67119/149‑1 (MQ=255) tGAACACTTCGAACGTGCGCGCGGTAATCAGctgggtgctgtgcagcatccttgcgcacttccagaaccgcatggaagcgcgggtcaaccagcatgaccaggagcattgagcatgattgaagtcaaaggcctgaccaagcggttcaagg > 1:307256‑M2/1‑31 (MQ=255) aaCACTTCGAACGTGCGCGCGGTAATCAGCTGGGCTTGGCGGAACAGCTCGGGCACCTGGATGGTCGCCGCCAGGGCGGTGTCCTTTACCAGCGAGATGAAGCTGTTGCCCAGCGGTGGCAACGCGGTGCGCAAGGCCTGTGGCAGGa < 6:72353/148‑1 (MQ=255) cTTCGAACGTGTGCGCGGTAATCAGCTGGGCTTGGCGGAACAGCTCGGGCACCTGGATGGTCGCCGCCAGGGCGGTGTCCTTTACCAGCGAGATGAAGCTGTTGCCCAGCGGTGGCAACGCGGt < 4:299763/124‑1 (MQ=255) cTTCGAACGTGTGCGCGGTAATCAGCTGGGCTTGGCGGAACAGCTCGGGCACCTGGATGGTCGCCGCCAGGGCGGTGTCCTTTACCAGCGAGATGAAGCTGTTGCCCAGCGGTGGCAACGCGGt > 3:299763/1‑124 (MQ=255) ttCGAACGTGCGCGCGGTAATCAGCTGGGCTTGGCGGAACAGCTCGGGCACCTGGATGGTCGCCGCCAGGGCGGTGTCCTTTACCAGCGAGATGAAGCTGTTGCCCAGCGGTGGCAACGCGGTGCGCAAGGCCTGTGGCAGGATCGccc > 4:67803/1‑149 (MQ=255) ttCGAACGTGCGCGCGGTAATCAGCTGGGCTTGGCGGAACAGCTCGGGCACCTGGATGGTCGCCGCCAGGGCGGTGTCCTTTACCAGCGAGATGAAGCTGTTGCCCAGCGGTGGCAACGCGGTGCGCAAGGCCTGTGGCAGGATCGccc > 2:133501/1‑149 (MQ=255) cGTGCGCGCGGTAATCAGCTGGGCTTGGCGGAACAGCTCGGGCACCTGGATGGTCGCCGCCAGGGCGGTGTCCTTTACCAGCGAGATGAAGCTGTTGCCCAGCGGTGGCAACGCGGTGCGCAAGGCCTGTGGCAGGATCGCCCGGCGCa < 7:84724/149‑1 (MQ=255) cgcgcgGTAATCAGCTGGGCTTGGCGGAACAGCTCGGGCACCTGGATGGGCGCCGCCAGGGCGGTGTCCTTTACCAGCGAGATGAAGCTGTTGCCCAGCGGTGGCAACGCGGTGCGCAAGGCCTGTGGCAGGATCGCCCGGCGCATGGc < 3:64773/149‑1 (MQ=255) ggTAATCAGCTGGGCTTGGCGGAACAGCTCGGGCACCTGGATGGTCGCCGCCAGGGc < 7:294495/57‑1 (MQ=255) ggTAATCAGCTGGGCTTGGCGGAACAGCTCGGGCACCTGGATGGTCGCCGCCAGGGc > 8:294495/1‑57 (MQ=255) tCAGCTGGGCTTGGCGGAACAGCTCGGGCACCTGGATGGTCGCCGCCAGGGCGGTGTCCTTTACCAGCGAGATGAAGCTGTTGCCCAGCGGTGGCAACGCGGTGCGCAAGGCCTGTGGCAGGATCGCCCGGCGCATGGCTTGCACGCgg < 5:53464/149‑1 (MQ=255) | TTCAATCATGCTCAATGCTCCTGGTCATGCTGGTTGACCCGCGCTTCCATGCGGTTCTGGAAGTGCGCAAGGATGCTGCACAGCACCCAGTAGATGACCGCGACCGCCACGTACATGGTGAACACTTCGAACGTGCGCGCGGTAATCAGCTGGGCTTGGCGGAACAGCTCGGGCACCTGGATGGTCGCCGCCAGGGCGGTGTCCTTTACCAGCGAGATGAAGCTGTTGCCCAGCGGTGGCAACGCGGTGCGCAAGGCCTGTGGCAGGATCGCCCGGCGCATGGCTTGCACGCGG > NC_002947/279569‑279862 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |