New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1452064 = | 29 (0.590) | 3 (0.060) | 3/240 | NT | 10.3% | coding (226/1542 nt) | PP_1271 | putative Multidrug efflux MFS transporter |
? | NC_002947 | 1452131 = | 25 (0.540) | coding (293/1542 nt) | PP_1271 | putative Multidrug efflux MFS transporter |
GTAACCAAGATTTCCCTGGCCGATATCCGCGGCGCCATGGGCATCGGTGCCGACGAAGGTGCCTGGTTGCTGGCGGTATACAGCGCCGCTTCGGTCTCGGCCATGGCCTTTGCGCCGTGGCTGGCCACGACCTTCTCGCTGCGGCGCTTCACCATGAGCGCAGTGGGTCTGTTCGCCGTGCTTGGCCTGCTGCAGCCGTTCGCCCCCAACCTGCACAGCCTGATGTTGCTGCGCGTACTGCAGGGCTTTGCCGCTGGCGCCTTGCCGCCGATGCTGATGAGCGTGGCCCT > NC_002947/1451983‑1452272 | gTAACCAAGATTTCCCTGGCCGATATCCGCGGCGCCATGGGCATCGGTGCCGACGAAGGTGCCTGGTTGCTGGCGGTATACAGCGCCGCTTCGGTCTCGGCCATGGCCTTTGCGCCGTGGCTGGCCACGACCTTCTCGCTGCGGCGCtt > 3:128386/1‑149 (MQ=255) aacatcaggctatgcaggttgggggcgaacggctgcagcaggccaagcacggcgaacagacccactgcgctcatggtgaAGCGCCGCTTCGGTCTCGGCCATGGCCTTTGCGCCGTGGCTGGCCACGACCTTCTCGCTGCGGCGCTTCa > 1:11753‑M1/80‑149 (MQ=255) cAAGATTTCCCTGGCCGATATCCGCGGCGCCATGGGCATCGGTGCCGACGAAGGTGCCTGGTTGCTGGCGGTATACAGCGCCGCTTCGGTCTCGGCCATGGCCTTTGCGCCGTGGCTGGCCACGACCTTCTCGCTGCGGCGCTTCACCa > 7:199801/1‑149 (MQ=255) gATTTCCCTGGCCGATATCCGCGGCGCCATGGGCATCGGTGCCGACGAAGGTGCCTGGTTGCTGGCGGTATACAGCGCCGCTTCGGTCTCGGCCATGGCCTTTGCGCCGTGGCTGGCCACGACCTTCTCGCTGCGGCGCTTCACCATGa < 5:172981/149‑1 (MQ=255) tCCCTGGCCGATATCCGCGGCGCCAGGGGCAGCGGTGCCGACGCAGGTGCCTGGTGGCGGGCGGTATCCAGCGCCGCTTCGGTCTCGGCCATGGCCTGTGCGCCGTGGCTGGCCACGACCTTCTCGCTGCGGCGCTTCACCATgcgc < 5:37064/147‑1 (MQ=255) gCCGATATCCGCGGCGCCATGGGCATCGGTGCCGACGAAGGTGCCTGGTTGCTGGCGGTATACAGCGCCGCTTCGGTCTCGGCCATGGCCTTTGCGCCGTGGCTGGCCACGACCTTCTCGCTGCGGCGCTTCACCATGAGCGCAGTg < 8:182684/147‑1 (MQ=255) tCGGTGCCGACGAAGGTGCCTGGTTGCTGGCGGTATACAGCGCCGCTTCGGTCTCGGCCATGGCCTTTGCGCCGTGGCTGGCCACGACCTTCTCGCTGCGGCGCTTCACCATGAGCGCAGTGGGTCTGTTCGCCGTGCTTGGCctgctg < 8:199801/149‑1 (MQ=255) tCGGTGCCGACGAAGGTGCCTGGTTGCTGGCGGTATACAGCGCCGCTTCGGTCTCGGCCATGGCCTTTGCGCCGTGGCTGGCCACGACCTTCTCGCTGCGGCGCTTCACCATGAGCGCAGTGGGTCTGTTCGCCGTGCTTGGCctgctg > 5:132627/1‑149 (MQ=255) cgacgaAGGTGCCTGGTTGCTGGCGGTATACAGCGCCGCTTCGGTCTCGGCCATGGCCTTTGCGCCGTGGCTGGCCACGACCTTCTCGCTGCGGCGCTTCACCATGAGCGCAGTGGGTCTGTTCGCCGTGCTTGGCCTGCTGCAGCCGt < 1:138740/149‑1 (MQ=255) cgacgaAGGTGCCTGGTTGCTGGCGGTATACAGCGCCGCTTCGGTCTCGGCCATGGCCTTTGCGCCGTGGCTGGCCACGACCTTCTCGCTGCGGCGCTTCACCATGAGCGCAGTGGGTCTGTTCGCCGTGCTTGGCCTGCTGCAGCCGt > 2:138740/1‑149 (MQ=255) gacgaAGGTGCCTGGTTGCTGGCGGTATACAGCGCCGCTTCGGTCTCGGCCATGGCCTTTGCGCCGTGGCTGGCCACGACCTTCTCGCTGCGGCGCTTCACCATGAGCGCAGTgg < 3:183582/115‑1 (MQ=255) gacgaAGGTGCCTGGTTGCTGGCGGTATACAGCGCCGCTTCGGTCTCGGCCATGGCCTTTGCGCCGTGGCTGGCCACGACCTTCTCGCTGCGGCGCTTCACCATGAGCGCAGTgg > 4:183582/1‑115 (MQ=255) acgaAGGTGCCTGGTTGCTGGCGGTATACAGCGCCGCTTCGGTCTCGGCCATGGCCTTTGCGCCGTGGCTGGCCACGACCTTCTCGCTGCGGCGCTTCACCATGAGCGCAGTGGGTCTGTTCGCCGTGCTTGGCCTGCTGCAGCCGTTc < 4:128386/149‑1 (MQ=255) gCTGGCGGTATACAGCGCCGCTTCGGTCTCGGCCATGGCCTTTGCGCCGTGGCTGGCCACGACCTTCTCGCTGCGGCGCTTCACCATGAGCGCAGTGGGTCTGTTCGCCGTGCTTGGCCTGCTGCAGCCGTTCGCCCCCAACCTGcac < 4:209237/148‑1 (MQ=255) tgaagcgccgcagcgagaaggtcgtggccagccacggcgcaaaggccatggccgagaccgaagcggcgctTCACCATGAGCGCAGTGGGTCTGTTCGCCGTGCTTGGCCTGCTGCAGCCGTTCGCCCCCAACCTGCATAGCCTGATGtt > 1:11753‑M2/71‑149 (MQ=255) taCAGCGCCGCTTCGGTCTCGGCCATGGCCTTTGCGCCGTGGCTGGCCACGACCTTCTCGCTGCGGCGCTTCACCATGAGCGCAGTGGGTCTGTTCGCCGTGCTTGGCCTGCTGCAGCCGTTCGCCCCCAACCTGCACAGCCTGATGtt > 8:71124/1‑149 (MQ=255) gcgccgcagcgagaaggtcgtggccagccacggcgcaaaggccatggccgagaccgaagcggcgctTCACCATGAGCGCAGTGGGTCTGTTCGCCGTGCTTGGCCTGCTGCAGCCGTTCGCCCCCAACCTGCACAGCCTGATGTtgctg > 5:264712‑M2/67‑149 (MQ=255) ctcGGCCATGGCCTTTGCGCCGTGGCTGGCCACGACCTTCTCGCTACGGCGCTTCACCATGAGCGCAGTGGGTCTGTTCGCCGTGCTTGGc < 4:241867/91‑1 (MQ=255) ctcGGCCATGGCCTTTGCGCCGTGGCTGGCCACGACCTTCTCGCTACGGCGCTTCACCATGAGCGCAGTGGGTCTGTTCGCCGTGCTTGGc > 3:241867/1‑91 (MQ=255) tGGCCTTTGCGCCGTGGCTGGCCACGACCTTCTCGCTGCGGCGCTTCACCATGAGCGCAGTGGGTCTGTTCGCCGTGCTTGGCCTGCTGCAGCCGTTCGCCCCCAACCTGCACAGCCTGATGTTGCTGCGCGTACTGCAGGGCTTTGcc < 7:71124/149‑1 (MQ=255) cTTTGCGCCGTGGCTGGCCACGACCTTCTCGCTGCGGCGCTTCACCATGAGCGCAGTGGGTCTGTTCGCCGTGCTTGGCCTGCTGCAGCCGTTCGCCCCCAACCTGCACAGCCTGATGTTGCTGCGCGTACTGCAGGGCTTTGCCGCTg > 3:83362/1‑149 (MQ=255) ccacggcgcaaaggccatggccgagaccgaagcggcgctTCACCATGAGCGCAGTGGGTCTGTTCGCCGTGCTTGGCCTGCTGCAGCCGTTCGCCCCCAACCTGCATAGCCTGATGTTGCTGCGCGTACTGCAGGGCTTTGCCGCTGgc < 2:11753‑M2/110‑1 (MQ=255) ggtcGTGGCCAGCCACGCCCTTCTCGCTGCGGCGCTTCACCATGAGCGCAGTGGGTCTGTTCGCCGTGCTTGGCCTGCTGCAGCCGTTCGCCCCCAACCTGCACCGCCTGATGTTGCTGCGCGTACTGCAGGGCTTTGCCGCTGGCGcc > 5:248755/4‑149 (MQ=255) gcCGTGGCTGGCCACGACCTTCTCGCTGCGGCGCTTCACCATGAGCGCAGTGGGTCTGTTCGCCGTGCTTGGCCTGCTGCAGCCGTTCGCCCCCAACCTGCACAGCCTGATGTTGCTGCGCGTACTGCAGGGCTTTGCCGCTGGCGCCt > 8:41838/1‑149 (MQ=255) gctggcCACGACCTTCTCGCTGCGGCGCTTCACCATGAGCGCAGTGGGTCTGTTCGCCGTGCTTGGCCTGCTGCAGCCGTTCGCCCCCAACCTGCACAGCCTGATGTTGCTGCGCGTACTGCAGGGCTTTGCCGCTGGCGCCTTgccgc > 2:195898/1‑149 (MQ=255) tggcCACGACCTTCTCGCTGCGGCGCTTCACCATGAGCGCAGTGGGTCTGTTCGCCGTGCTTGGCCTGCTGCAGCCGTTCGCCCCCAACCTGCACAGCCTGATGTTGCTGCGCGTACTGCAGGGCTTTGCCGCTGGCGCCTTgccgcc > 1:24338/1‑148 (MQ=255) ggcCACGACCTTCTCGCTGCGGCGCTTCACCATGAGCGCAGTGGGTCTGTTCGCCGTGCTTGGCCTGCTGCAGCCGTTCGCCCCCAACCTGCACAGCCTGATGTTGCTGCGCGTACTGCAGGGCTTTGCCGCTGGCGCCTTGCCGCCGa < 7:41838/149‑1 (MQ=255) cACGACCTTCTCGCTGCGGCGCTTCACCATGAGCGCAGTGGGTCTGTTCGCCGTGCTTGGCCTGCTGCAGCCGTTCGCCCCCAACCTGCACAGCCTGATGTTGCTGCGCGTACTGCAGGGCTTTGCCGCTGGCGCCTTGCCGCCGATGc > 7:284620/1‑149 (MQ=255) aCGACCTTCTCGCTGCGGCGCTTCACCATGAGCGCAGTGGGTCTGTTCGCCGTGCTTGGCCTGCTGCAGCCGTTCGCCCCCAACCTGCACAGCCTGATGTTGCTGCGCGTACTGCAGGGCTTTGCCGCTGGCGCCTTGCCGCCGATGCt > 7:20158/1‑149 (MQ=255) ccTTCTCGCTGCGGCGCTTCACCATGAGCGCAGTGGGTCTGTTCGCCGTGCTTGGCCTGCTGCAGCCGTTCGCCCCCAACCTGCACAGCCTGATGTTGCTGCGCGTACTGCAGGGCTTTGCCGCAGGCGCCTTGCCGCCGATGCtgat > 3:238311/1‑148 (MQ=255) cTGCGGCGCTTCACCATGAGCGCAGTGGGTCTGTTCGCCGTGCTTGGCCTGCTGCAGCCGTTCGCCCCCAACCTGCACAGCCTGATGTTGCTGCGCGTACTGCAGGGCTTTGCCGCTGGCGCCTTGCCGCCGATGCTGATGAGCGTGGc < 8:20158/149‑1 (MQ=255) cggcgctTCACCATGAGCGCAGTGGGTCTGTTCGCCGTGCTTGGCCTGCTGCAGCCGTTCGCCCCCAACCTGCACAGCCTGATGTTGCTGCGCGTACTGCAGGGCTTTGCCGCTGGCGCCTTGCCGCCGATGCTGATGAGCGTGGCCCt < 8:284620‑M2/142‑1 (MQ=255) | GTAACCAAGATTTCCCTGGCCGATATCCGCGGCGCCATGGGCATCGGTGCCGACGAAGGTGCCTGGTTGCTGGCGGTATACAGCGCCGCTTCGGTCTCGGCCATGGCCTTTGCGCCGTGGCTGGCCACGACCTTCTCGCTGCGGCGCTTCACCATGAGCGCAGTGGGTCTGTTCGCCGTGCTTGGCCTGCTGCAGCCGTTCGCCCCCAACCTGCACAGCCTGATGTTGCTGCGCGTACTGCAGGGCTTTGCCGCTGGCGCCTTGCCGCCGATGCTGATGAGCGTGGCCCT > NC_002947/1451983‑1452272 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |