New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1710452 = | 40 (0.810) | 3 (0.060) | 3/246 | NT | 6.9% | coding (1071/2628 nt) | ppc | phosphoenolpyruvate carboxylase |
? | NC_002947 | 1710524 = | 42 (0.890) | coding (1143/2628 nt) | ppc | phosphoenolpyruvate carboxylase |
AGCAACCAACCGGCCGGTGCCGACGTGCTGGTGGACAACCGCGAGCTGATCGCGCCGCTGGAGCTGTGCTACCAGTCACTGCACGAATGCGGTATGGGCGTGATCGCCGAGGGGCCGCTGCTCGACTGCTTGCGTCGTGCGGTGACCTTCGGCCTGTTCCTGGGCCGCCTGGACGTACGCCAGGACGCTGCCCGCCACCGTGATGCGCTGACCGAGATAACCGATTACCTGGGCCTGGGGCGTTACGCCGACTGGGATGAGGAGCAGCGCATCGCGTTCCTCCAGGCCGAGCTG > NC_002947/1710378‑1710671 | ttatctcggtcagcgcatcacggtggcgggcagcgtcctggcgtacgtccaggcggcccaggaacaggccgaagGTCACTGCACGAATGCGGTATGGGCGTGATCGCCGAGGGGCCGCTGCTCGACTGCTTGCGTCGTGCGGTGACCtt > 8:134867‑M1/75‑149 (MQ=255) accaaccGGCCGGTGCCGACGTGCTGGTGGACAACCGCGAGCTGATCGCGCCGCTGGAGCTGTGCTACCAGTCACTGCACGAATGCGGTATGGGCGTGATCGCCGAGGGGCCGCTGCTCGACTGCTTGCGTCGTGCGGTGACCTTCGGc < 6:2974/149‑1 (MQ=255) ccaaccGGCCGGTGCCGACGTGCTGGTGGACAACCGCGAGCTGATCGCGCCGCTGGAGCTGTGCTACCAGTCACTGCACGAATGCGGTATGGGCGTGATCGCCGAGGGGCCGCTGCTCGACTGCTTGCGTCGTGCGGTGACCTTCGGcc > 2:186614/1‑149 (MQ=255) ggtcagcgcatcacggtggcgggcagcgtcctggcgtacgtccaggcggcccaggaacaggccgaagGTCACTGCACGAATGCGGTATGGGCGTGATCGCCGAGGGGCCGCTGCTCGACTGCTTGCGTCGTGCGGTGACCTTCgg > 5:232788‑M1/68‑145 (MQ=255) cggTGCCGACGTGCTGGTGGACAACCGCGAGCTGATCGCGCCGCTGGAGCTGTGCTACCAGTCACTGCACGAATGCGGTATGGGCGTGATCGCCGAGGGGCCGCTGCTCGACTGCTTGCGTCGTGCGGTGACCTTCGGCCTGTTCCTgg < 6:101383/149‑1 (MQ=255) gtggACAACCGCGAGCTGATCGCGCCGCTGGAGCTGTGCTACCAGTCACTGCACGAATGCGGTATGGGCGTGATCGCCGAGGGGCCGCTGCTCGACTGCTTGCGTCGTGCGGTGACCTTCGGCCTGTTCCTGGGCCGCCTGGACGTAc < 1:186614/148‑1 (MQ=255) gACAACCGCGAGCTGATCGCGCCGCTGGAGCTGTGCTACCAGTCACTGCACGAATGCGGTATGGGCGTGATCGCCGAGGGGCCGCTGCTCGACTGCTTGCGTCGTGCGGTGACCTTCGGCCTGTTCCTGGGCCGCCTGGACGTACGc > 8:208486/1‑147 (MQ=255) gACAACCGCGAGCTGATCGCGCCGCTGGAGCTGTGCTACCAGTCACTGCACGAATGCGGTATGGGCGTGATCGCCGAGGGGCCGCTGCTCGACTGCTTGCGTCGTGCGGTGACCTTCGGCCTGTTCCTGGGCCGCCTGGACGTACGc > 7:297449/1‑147 (MQ=255) gACAACCGCGAGCTGATCGCGCCGCTGGAGCTGTGCTACCAGTCACTGCACGAATGCGGTATGGGCGTGATCGCCGAGGGGCCGCTGCTCGACTGCTTGCGTCGTGCGGTGACCTTCGGCCTGTTCCTGGGCCGCCTGGACGTACGCCa < 8:297449/149‑1 (MQ=255) ccGCGAGCTGATCGCGCCGCTGGAGCTGTGCTACCAGTCACTGCACGAATGCGGTATGGGCGTGATCGCCGAGGGGCCGCTGCTCGACTGCTTGCGTCGTGCGGTGACCTTCGGCCTGTTCCTGGGCCGCCTGGACGTACGCCAGGACg > 8:109391/1‑149 (MQ=255) ccGCGAGCTGATCGCGCCGCTGGAGCTGTGCTACCAGTCACTGCACGAATGCGGTATGGGCGTGATCGCCGAGGGGCCGCTGCTCGACTGCTTGCGTCGTGCGGTGACCTTCGGCCTGTTCCTGGGCCGCCTGGACGTACGCCAGGACg > 7:71835/1‑149 (MQ=255) gCTGATCGCGCCGCTGGAGCTGTGCTACCAGTCACTGCACGAATGCGGTATGGGCGTGATCGCCGAGGGGCCGCTGCTCGACTGCTTGCGTCGTGCGGTGACCTTCGGCCTGTTCCTGGGCCGCCTGGACGTACGCCAGGACGCTGccc > 4:191966/1‑149 (MQ=255) gATCGCGCCGCTGGAGCTGTGCTACCAGTCACTGCACGAATGCGGTATGGGCGTGATCGCCGAGGGGCCGCTGCTCGACTGCTTGCGTCGTGCGGTGACCTTCGGc < 3:151641/106‑1 (MQ=255) gATCGCGCCGCTGGAGCTGTGCTACCAGTCACTGCACGAATGCGGTATGGGCGTGATCGCCGAGGGGCCGCTGCTCGACTGCTTGCGTCGTGCGGTGACCTTCGGc > 4:151641/1‑106 (MQ=255) gATCGCGCCGCTGGAGCTGTGCTACCAGTCACTGCACGAATGCGGTATGGGCGTGATCGCCGAGGGGCCGCTGCTCGACTGCTTGCGTCGTGCGGTGACCTTCGGCCTGTTCCTGGGCCGCCTGGACGTACGCCAGGACGCTGCCCGc > 2:227256/1‑148 (MQ=255) aTCGCGCCGCGGGAGCTGTGCTACCAGTCACTGCACGAATGCGGCATGGGCGTGATCGCCGAGGGGCCGCTGCTCGACTGCTTGCGTCGTGCGGTGACCTTCGGCCTGTTCCTGGGCCGCCTGGACGTACGCCAGGACGCTGCCCGc < 4:67613/147‑1 (MQ=255) gcgcCGCTGGAGCTGTGCTACCAGTCACTGCACGAATGCGGTATGGGCGTGATCGCCGAGGGGCCGCTGCTCGACTGCTTGCGTCGTGCGGTGACCTTCGGCCTGTTCCTGGGCCGCCTGGACGTACGCCAGGACGCTGCCCGCCACCg > 1:156786/1‑149 (MQ=255) cgccgcTGGAGCTGTGCTACCAGTCACTGCACGAATGCGGTATGGGCGTGATCGCCGAGGGGCCGCTGCTCGACTGCTTGCGTCGTGCGGTGACCTTCGGCCTGTTCCTGGGCCGCCTGGACGTACGCCAGGACGCTGCCCGCCACCGt > 6:199634/1‑149 (MQ=255) gccgcTGGAGCTGTGCTACCAGTCACTGCACGAATGCGGTATGGGCGTGATCGCCGAGGGGCCGCTGCTCGACTGCTTGCGTCGTGCGGTGACCTTCGGCCTGTTCCTGGGCCGCCTGGACGTACGCCAGGACGCTGCCCGCCACCGt > 1:144274/1‑148 (MQ=255) ccgcTGGAGCTGTGCTACCAGTCACTGCACGAATGCGGTATGGGCGTGATCGCTGAGGGGCCGCTGCTCGACTGCTTGCGTCGTGCGGTGACCTTCGGCCTGTTCCTGGGCCGCCTGGACGTACGCCAGGACGCTGCCCGCCACCGTGa < 3:10851/149‑1 (MQ=255) cgcTGGAGCTGTGCTACCAGTCACTGCACGAATGCGGTATGGGCGTGATCGCCGAGGGGCCGCTGCTCGACTGCTTGCGTCGTGCGGTGACCTTCGGCCTGTTCCTGGGCCGCCTGGACGTACGCCAGGACGCTGCCCGCCACCGTGAt < 5:199634/149‑1 (MQ=255) tGGAGCTGTGCTACCAGTCACTGCACGAATGCGGTATGGGCGTGATCGCCGAGGGGCCGCTGCTCGACTGCTTGCGTCGTGCGGTGACCTTCGGCCTGTTCCTGGGCCGCCTGGACGTACGCCAGGACGCTGCCCGCCACCGTGATgcg > 3:173160/1‑149 (MQ=255) tgCTACCAGTCACTGCACGAATGCGGTATGGGCGTGATCGCCGAGGGGCCGCTGCTCGACTGCTTGCGTCGTGCGGTGACCTTCGGCCTGTTCCTGGGCCGCCTGGACGTACGCCAGGACGCTGCCCGCCACCGTGATGCGCTGACCg < 2:156786/148‑1 (MQ=255) ccgaaggtcaccgcacgacgcaagcagtcgagcagcggcccctcggcgatcacgcccataccgcattcgtgcagtgacCTTCGGCCTGTTCCTGGGCCGCCTGGACGTACGCCAGGACGCTGCCCGCCACCGTGATGCGCTGAcc > 5:232788‑M2/79‑145 (MQ=255) cTACCAGTCACTGCACGAATGCGGTATGGGCGTGATCGCCGAGGGGCCGCTGCTCGACTGCTTGCGTCGTGCGGTGACCTTCGGCCTGTTCCTGGGCCGCCTGGACGTACGCCAGGACGCTGCCCGCCACCGTGATGCGCTGACCgag < 1:227256/148‑1 (MQ=255) aCCAGTCACTGCACGAATGCGGTATGGGCGTGATCGCCGAGGGGCCGCTGCTCGACTGCTTGCGTCGTGCGGTGACCTTCGGCCTGTTCCTGGGCCGCCTGGACGTACGCCAGGACGCTGCCCGCCACCGTGATGCGCTGACCAAGATa > 5:181149/1‑149 (MQ=255) ccAGTCACTGCACGAATGCGGTATGGGCGTGATCGCCGAGGGGCCGCTGCTCGACTGCTTGCGTCGTGCGGTGACCTTCGGCCTGTTCCTGGGCCGCCTGGACGTACGCCAGGACGCTGCCCGCCACCGTGATGCGCTGACCGAGAt < 7:208486/147‑1 (MQ=255) aaggtcaccgcacgacgcaagcagtcgagcagcggcccctcggcgatcacgcccataccgcattcgtgcagtgacCTTCGGCCTGTTCCTGGGCCGCCTGGACGTACGCCAGGACGCTGCCCGCCACCGTGATGCGCTGACCGAGATaa > 8:134867‑M2/76‑149 (MQ=255) cAGTCACTGCACGAATGCGGTATGGGCGTGATCGCCGAGGGGCCGCTGCTCGACTGCTTGCGTCGTGCGGTGACCTTCGGCCTGTTCCTGGGCCGCCTGGa < 3:282721/101‑1 (MQ=255) cAGTCACTGCACGAATGCGGTATGGGCGTGATCGCCGAGGGGCCGCTGCTCGACTGCTTGCGTCGTGCGGTGACCTTCGGCCTGTTCCTGGGCCGCCTGGa > 4:282721/1‑101 (MQ=255) tGCACGAATGCGGTATGGGCGTGATCGCCGAGGGGCCGCTGCTCGACTGCTTGCGTCGTGCGGTGACCTTCGGCCTGTTCCTGGGCCGCCTGGACGTACGCCAGGACGCTGCCCGCCAc < 5:157762/119‑1 (MQ=255) tGCACGAATGCGGTATGGGCGTGATCGCCGAGGGGCCGCTGCTCGACTGCTTGCGTCGTGCGGTGACCTTCGGCCTGTTCCTGGGCCGCCTGGACGTACGCCAGGACGCTGCCCGCCAc > 6:157762/1‑119 (MQ=255) acgacgcaagcagtcgagcagcggcccctcggcgatcacgcccataccgcattcgtgcagtgacCTTCGGCCTGTTCCTGGGCCGCCTGGACGTACGCCAGGACGCTGCCCGCCACCGTGATGCGCTGACCGAGATAACCGATTAcctg < 7:134867‑M2/85‑1 (MQ=255) cGAATGCGGTATGGGCGTGATCGCCGAGGGGCCGCTGCTCGACTGCTTGCGTCGTGCGGTGACCTTCGGCCTGTTCCTGGGCCGCCTGGACGTACGCCAGGACGCTGCCCGCCACCGTGATGCGCTGACCGAGATAACCGATTAcctgg < 5:149334/149‑1 (MQ=255) gAATGCGGTATGGGCGTGATCGCCGAGGGGCCGCTGCTCGCCTGCTTGCGTCGTGCGGTGACCTTCGGCCTGTTCCTGGGCCGCCTGGACGTACGCCAGGACGCTGCCCGCCACCGTGATGCGCTGCCCGAGAGACCCGCTTAcctggg > 4:162525/1‑149 (MQ=255) cGGTATGGGCGTGATCGCCGAGGGGCCGCTGCTCGACTGCTTGCGTCGTGCGGTGACCTTCGGCCTGTTCCTGGGCCGCCTGGACGTACGCCAGGACGCTGCCCGCCACCGTGATGCGCTGACCGAGATAACCGATTAcctgggcctg < 8:71835/148‑1 (MQ=255) cGTGATCGCCGAGGGGCCGCTGCTCGACTGCTTGCGTCGTGCGGTGACCTTCGGCCTGTTCCTGGGCCGCCTGGACGTACGCCAGGACGCTGCCCGCCACCGTGATGCGCTGACCGAGATAACCGATTACCTGGGCCTGGGGCGTTACg < 2:144274/149‑1 (MQ=255) gTGATCGCCGAGGGGCCGCTGCTCGACTGCTTGCGTCGTGCGGTGACCTTCGGCCTGTTCCTGGGCCGCCTGGACGTACGCCAGGACGCTGCCCGCCACCGTGATGCGCTGACCGAGATAACCGATTACCTGGGCCTGGGGCGTTACGc < 4:173160/149‑1 (MQ=255) cGAGGGGCCGCTGCTCGACTGCTTGCGTCGTGCGGTGACCTTCGGCCTGTTCCTGGGCCGCCTGGACGTACGCCAGGACGCTGCCCGCCACCGTGATGCGCTGACCGAGATAACCGATTACCTGGGCCTGGGGCGTTACGCCGACTggg < 7:109391/149‑1 (MQ=255) gggCCGCTGCTCGACTGCTTGCGTCGTGCGGTGACCTTCGGCCTGTTCCTGGGCCGCCTGGACGTACGCCAGGACGCTGCCCGCCACCGTGATGCGCTGACCAAGATAACCGATTACCTGGGCCTGGGGCGTTACGCCGACTGGGATga < 6:181149/149‑1 (MQ=255) gctgctCGACTGCTTGCGTCGTGCGGTGACCTTCGGCCTGTTCCTGGGCCGCCTGGACGTACGCCAGGACGCTGCCCGCCACCGTGATGCGCTGACCGAGATAACCGATTACCTGGGCCTGGGGCGTTACGCCGACTGGGATgaggag > 2:200066/1‑148 (MQ=255) tgctCGACTGCTTGCGTCGTGCGGTGACCTTCGGCCTGTTCCTGGGCCGCCTGGACGTACGCCAGGACGCTGCCCGCCACCGTGATGCGCTGACCGAGATAACCGATTACCTGGGCCTGGGGCGTTACGCCGACTGGGATGAGGagcag > 7:125531/1‑149 (MQ=255) ttGCGTCGTGCGGTGACCTTCGGCCTGTTCCTGGGCCGCCTGGACGTACGCCAGGACGCTGCCCGCCACCGTGATgc > 6:260021/1‑77 (MQ=255) ttGCGTCGTGCGGTGACCTTCGGCCTGTTCCTGGGCCGCCTGGACGTACGCCAGGACGCTGCCCGCCACCGTGATgc < 5:260021/77‑1 (MQ=255) ttGCGTCGTGCGGTGACCTTCGGCCTGTTCCTGGGCCGCCTGGACGTACGCCAGGACGCTGCCCGCCACCGTGATGCGCTGACCGAGATAACCGATTACCTGGGCCTGGGGCGTTACGCCGACTGGGATGAGGAGCAGCGCATCGCGtt > 5:106929/1‑149 (MQ=255) tGCGTCGTGCGGTGACCTTCGGCCTGTTCCTGGGCCGCCTGGACGTACGCCAGGACGCTGCCCGCCACCGTGATGCGCTGACCGAGATAACCGATTACCTGGGCCTGGGGCGTTACGCCGACTGGGATGAGGAGCAGCGCATCGCGTtc > 3:291217/1‑149 (MQ=255) cgtcgtGCGGTGACCTTCGGCCTGTTCCTGGGCCGCCTGGACGTACGCCAGGACGCTGCCCGCCACCGTGATGCGCTGACCGAGATAACCGATTACCTGGGCCTGGGGCGTTACGCCGACTGGGATGAGGAGCAGCGCATCGCGTtcc < 3:191966/148‑1 (MQ=255) gtGCGGTGACCTTCGGCCTGTTCCTGGGCCGCCTGGACGTACGCCAGGACGCTGCCCGCCACCGTGATGCGCTGACCGAGATAACCGATTACCTGGGCCTGGGGCGTTACGCCGACTGGGATGAGGAGCAGCGCATCGCGTTCCTCCa < 1:200066/148‑1 (MQ=255) ggTGACCTTCGGCCTGTTCCTGGGCCGCCTGGACGTACGCCAGGACGCTGCCCGCCACCGTGATGCGCTGACCGAGATAACCGATTACCTGGGCCTGGGGCGTTACGCCGACTGGGATGAGGAGCAGCGCATCGCGTTCCTCCAGGcc > 6:192059/1‑148 (MQ=255) cTTCGGCCTGTTCCTGGGCCGCCTGGACGTACGCCAGGACGCTGCCCGCCACCGTGATGCGCTGACCGAGATAACCGATTACCTGGGCCTGGGGCGTTACGCCGACTGGGATGAGGAGCAGCGCATCGCGTTCCTCCAGGCCGAGCTg > 5:297452/1‑148 (MQ=255) | AGCAACCAACCGGCCGGTGCCGACGTGCTGGTGGACAACCGCGAGCTGATCGCGCCGCTGGAGCTGTGCTACCAGTCACTGCACGAATGCGGTATGGGCGTGATCGCCGAGGGGCCGCTGCTCGACTGCTTGCGTCGTGCGGTGACCTTCGGCCTGTTCCTGGGCCGCCTGGACGTACGCCAGGACGCTGCCCGCCACCGTGATGCGCTGACCGAGATAACCGATTACCTGGGCCTGGGGCGTTACGCCGACTGGGATGAGGAGCAGCGCATCGCGTTCCTCCAGGCCGAGCTG > NC_002947/1710378‑1710671 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |