New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 2692260 | 40 (0.810) | 4 (0.090) | 4/244 | NT | 8.2% | coding (421/534 nt) | PP_2359 | putative Type 1 pili subunit CsuA/B protein |
? | NC_002947 | = 2692328 | 51 (1.080) | coding (489/534 nt) | PP_2359 | putative Type 1 pili subunit CsuA/B protein |
AACTTTGTACCGTACGACCTCTATACCGACGCGGGGCGTACGGCGCTGCTGGCGGTCGACGACACCATCACCCTGCCGACCAGTACCGGCGCCGCTCAGACGGTCAACCTTTATGGCAAGGCCGTCGGCAAGCCGGGCCTGCCCGCAGGGGTGTACA‑GCGACACGATCTCGGTCGAGCTGTCGTTCTGACCCATGCGCGGCTGGCTGGCAGGAGGCCTGACTGGCGTCAGCGTGTTGTTGGCCGCTCCTTTGGGGGCAGTGACTACCAGTACCTTCACGGTGACGGCGCA > NC_002947/2692185‑2692474 | aaCTTTGTACCGTACGACCTCTATACCGACGCGGGGCGTACGGCGCTGCTGGCGGTCGACGACACCATCACCCTGCCGACCAGTACCGGCGCCGCTCAGACGGTCAACCTTTATGGCAAGGCCGTCGGCAAGCCGGGCCTGCCCgcagg < 1:137647‑M2/149‑6 (MQ=255) aaCTTTGTACCGTACGACCTCTATACCGACGCGGGGCGTACGGCGCTGCTGGCGGTCGACGACACCATCACCCTGCCGACCAGTACCGGCGCCGCTCAGACGGTCAACCTTTATGGCAAGGCCGTCGGCAAGCCGGGCCTGCCCgcagg < 7:63030‑M2/149‑6 (MQ=255) tttGTACCGTACGACCTCTATACCGACGCGGGGCGTACGGCGCTGCTGGCGGTCGACGACACCATCACCCTGCCGACCAGTACCGGCGCCGCTCAGACGGTCAACCTTTATGGCAAGGCCGTCGGCAAGCCGGGCCTGCCCGCAGGGgt > 5:44305/1‑149 (MQ=255) ccGTACGACCTCTATACCGACGCGGGTCGTACGGCGCTGCTGGCGGTCGACGACACCATCACCCTGCCGACCAGTACCGGCGCCGCTCAGACGGTCAACCTTTATGGCAAGGCCGTCGGCAAGCCGGGCCTGCCCGCAGGGGTGTACA‑g > 2:137435/1‑149 (MQ=255) cGTACGACCTCTATACCGACGCGGGGCGTACGGCGCTGCTGGCGGTCGACGACACCATCACCCTGCCGACCAGTACCGGCGCCGCTCAGACGGTCAACCTTTATGGCAAGGCCGTCGGCAAGCCGGGCCTGCCCGCAGGGGTGTACA‑Gc > 1:52848/1‑149 (MQ=255) gACCTCTATACCGACGCGGGGCGTACGGCGCTGCTGGCGGTCGACGACACCATCACCCTGCCGACCAGTACCGGCGCCGCTCAGACGGTCAACCTTTATGGCAAGGCCGTCGGCAAGCCGGGCCTGCCCGCAGGGGTGTACA‑GCGacac < 8:67642/149‑1 (MQ=255) tataCCGACGCGGGGCGTACGGCGCTGCTGGCGGTCGACGACACCATCACCCTGCCGACCAGTACCGGCGCCGCTCAGACGGTCAACCTTTATGGCAAGGCCGTCGGCAAGCCGGGCCTGCCCGCAGGGGTGTACA‑GCGACACGAtc < 8:63030/147‑1 (MQ=255) taCCGACGCGGGTCGTACGGCGCTGCTGGCGGTCGACGACACCATCACCCTGCCGACCAGTACCGGCGCCGCTCAGACGGTCAACCTTTATGGCAAGGCCGTCGGCAAGCCGGGCCTGCCCGCAGGGGTGTACA‑GCGACACGATCTCgg < 1:137435/149‑1 (MQ=255) taCCGACGCGGGGCGTACGGCGCTGCTGGCGGTCGACGACACCATCACCCTGCCGACCAGTACCGGCGCCGCTCAGACGGTCAACCTTTATGGCAAGGCCGTCGGCAAGCCGGGCCTGCCCGCAGGGGTGTACA‑GCGACACGATCTCgg < 3:158077/149‑1 (MQ=255) cGACGCGGGGCGTACGGCGCTGCTGGCGGTCGACGACACCATCACCCTGCCGACCAGTACCGGCGCCGCTCAGCCGGTCACCCTTTATGGCAAGGCCGTCGGGAAGCCGGGCCTGCCCGCAGGGGTGTACA‑GCGCCGCGAGCTCGGTCg > 2:300540/1‑149 (MQ=255) cGACGCGGGGCGTACGGCGCTGCTGGCGGTCGACGACACCATCACCCTGCCGACCAGTACCGGCGCCGCTCAGACGGTCAACCTTTATGGCAAGGCCGTCGGCAAGCCGGGCCTGCCCGCAGGGGTGTACA‑GCGACACGATCTCGGTc > 2:18712/1‑148 (MQ=255) aCGCGGGGCGTACGGCGCTGCTGGCGGTCGACGACACCATCACCCTGCCGACCAGTACCGGCGCCGCTCAGACGGTCAACCTTTATGGCAAGGCCGTCGGCAAGCCGGGCCTGCCCGCAGGGGTGTACA‑GCGACACGATCTCGGTCGAg < 2:168006/149‑1 (MQ=255) aCGCGGGGCGTACGGCGCTGCTGGCGGTCGACGACACCATCACCCTGCCGACCAGTACCGGCGCCGCTCAGACGGTCAACCTTTATGGCAAGGCCGTCGGCAAGCCGGGCCTGCCCGCAGGGGTGTACA‑GCGACACGATCTCGGTCGAg < 2:238162/149‑1 (MQ=255) cGTACGGCGCTGCTGGCGGTCGACGACACCATCACCCTGCCGACCAGTACCGGCGCCGCTCAGACGGTCAACCTTTATGGCAAGGCCGTCGGCAAGCCGGGCCTGCCCGCAGGGGTGTACA‑GCGACACGATCTCGGTCGAGCTGTCGtt < 2:52848/149‑1 (MQ=255) ggTCGACGACACCATCACCCTGCCGACCAGTACCGGCGCCGCTCAGACGGTCAACCTTTATGGCAAGGCCGTCGGCAAGCCGGGCCTGCCCGCAGGGGTGTACA‑GCGACACGATCTCGGTCGAGCTGTCGTTCTGACCCATGCGCggct < 6:44305/149‑1 (MQ=255) gTCGACGACACCATCACCCTGCCGACCAGTACCGGCGCCGCTCAGACGGTCAACCTTTATGGCAAGGCCGTCGGCAAGCCGGGCCTGCCCGCAGGGGTGTACA‑GCGACACg > 1:67146/1‑111 (MQ=255) gTCGACGACACCATCACCCTGCCGACCAGTACCGGCGCCGCTCAGACGGTCAACCTTTATGGCAAGGCCGTCGGCAAGCCGGGCCTGCCCGCAGGGGTGTACA‑GCGACACg < 2:67146/111‑1 (MQ=255) tCGACGACACCATCACCCTGCCGACCAGTACCGGCGCCGCTCAGACGGTCAACCTTTATGGCAAGGCCGTCGGCAAGCCGGGCCTGCCCGCAGGGGTGTACA‑GCGACACGATCTCGGTCGAGCTGTCGTTCTGACCCATGCGCggctgg > 6:55141/1‑149 (MQ=255) cgccacCATCACCCTGCCGACCAGTACCGGCGCCGCTCAGACGGTCAACCTTTATGGCAAGGCCGTCGGCAAGCCGGGCCTGCCCGCAGGGGTGTACA‑GCGACACGATCTCGGTCGAGCTGTCGTTCTGACCCATGCGCGGctggctgg > 6:125311/4‑149 (MQ=255) acCATCACCCTGCCGACCAGTACCGGCGCCGCTCAGACGGTCAACCTTTATGGCAAGGCCGTCGGCAAGCCGGGCCTGCCCGCAGGGGTGTACA‑GCGACACGATCTCGGTCGAGCTGTCGTTCTGACCCATGCGCGGCTGGCTGGCag > 1:130099/1‑148 (MQ=255) cATCACCCTGCCGACCAGTACCGGCGCCGCTCAGACGGTCAACCTTTATGGCAAGGCCGTCGGCAAGCCGGGCCTGCCCgcagggtgatggtgtcgtcgaccgccagcagcgccgtacgccccgcgtcggtatagaggtcgtacggta < 7:88609‑M2/148‑70 (MQ=255) tCACCCTGCCGACCAGTACCGGCGCCGCTCAGACGGTCAACCTTTATGGCAAGGCCGTCGGCAAGCCGGGCCTGCCCGCAGGGGTGTACA‑GCGACACGATCTCGGTCGAGCTGTCGTTCTGACCCATGCGCGGCTGGCTGGCAGGAGGc < 2:137647/149‑1 (MQ=255) cACCCTGCCGACCAGTACCGGCGCCGCTCAGACGGTCAACCTTTATGGCAAGGCCGTCGGCAAGCCGGGCCTGCCCGCAGGGGTGTACA‑GCGACACGATCTCGGTCGAGCTGTCGTTCTGACCCATGCGCGGCTGGCTGGCAGGAGGcc > 5:38628/1‑149 (MQ=255) cccTGCCGACCAGTACCGGCGCCGCTCAGACGGTCAACCTTTATGGCAAGGCCGTCGGCAAGCCGGGCCTGCCCGCAGGGgtgt > 5:50645/1‑84 (MQ=255) cccTGCCGACCAGTACCGGCGCCGCTCAGACGGTCAACCTTTATGGCAAGGCCGTCGGCAAGCCGGGCCTGCCCGCAGGGgtgt < 6:50645/84‑1 (MQ=255) ccTGCCGACCAGTACCGGCGCCGCTCAGACGGTCAACCTTTATGGCAAGGCCGTCGGCAAGCCGGGCCTGCCCGCAGGGGTGTACA‑GCGACACGATCTCGGTCGAGCTGTCGTTCTGACCCATGCGCGGCTGGCTGGCAGGAGGCCTGa > 4:2165/1‑149 (MQ=255) tGCCGACCAGTACCGGCGCCGCTCAGACGGTCAACCTTTATGGCAAGGCCGTCGGCAAGCCGGGCCTGCCCGCAGGGGTGTACA‑GCGACACGATCTCGGTCGAGCTGTCGTTCTGACCCATGCGCGGCTGGCTGGCAGGAGGCCTGACt > 5:233996/1‑149 (MQ=255) gACCAGTACCGGCGCCGCTCAGACGGTCAACCTTTATGGCAAGGCCGTCGGCAAGCCGGGCCTGCCCGCAGGGGTGTACA‑GCGACACGATCTCGGTCGAGCTGTCGTTCTGACCCATGCGCGGCTGGCTGGCAGGAGGCCTGACTGGCg < 3:2165/149‑1 (MQ=255) ccAGTACCGGCGCCGCTCAGACGGTCAACCTTTATGGCAAGGCCGTCGGCAAGCCGGGCCTGCCCGCAGGGgtgt > 5:213867/1‑75 (MQ=255) ccAGTACCGGCGCCGCTCAGACGGTCAACCTTTATGGCAAGGCCGTCGGCAAGCCGGGCCTGCCCGCAGGGgtgt < 6:213867/75‑1 (MQ=255) aGTACCGGCGCCGCTCAGACGGTCAACCTTTATGGCAAGGCCGTCGGCAAGCCGGGCCTGCCCGCAGGGGTGTACA‑GCGACACGATCTCGGTCGAGCTGTCGTTCTGACCCATGCGCGGCTGGCTGGCAGGAGGccagccag > 4:60247/1‑136 (MQ=255) aGTACCGGCGCCGCTCAGACGGTCAACCTTTATGGCAAGGCCGTCGGCAAGCCGGGCCTGCCCGCAGGGGTGTACA‑GCGACACGATCTCGGTCGAGCTGTCGTTCTGACCCATGCGCGGCTGGCTGGCAGGAGGccagccag < 3:60247/142‑7 (MQ=255) gTACCGGCGCCGCTCAGACGGTCAACCTTTATGGCAAGGCCGTCGGCAAGCCGGGCCTGCCCGCAGGGGTGTACA‑GCGACACGATCTCGGTCGAGCTGTCGTTCTGACCCATGCGCGGCTGGCTGGCAGGAGGCCTGACTGGCGTCAGc < 6:233996/149‑1 (MQ=255) cGGCGCCGCTCAGACGGTCAACCTTTATGGCAAGGCCGTCGGCAAGCCGGGCCTGCCCgcaggg < 1:45153‑M2/64‑7 (MQ=255) cGGCGCCGCTCAGACGGTCAACCTTTATGGCAAGGCCGTCGGCAAGCCGGGCCTGCCCgcaggg > 2:45153‑M2/1‑58 (MQ=255) cGGCGCCGCTCAGACGGTCAACCTTTATGGCAAGGCCGTCGGCAAGCCGGGCCTGCCCGCAGGGGTGTACA‑GCGACACGATCTCGGTCGAGCTGTCGTTCTGACCCATGCGCGGCTGGCTGGCAGGAGGCCTGACTGGCGTCAGCgtgt < 5:125311/149‑1 (MQ=255) cGGCGCCGCTCAGACGGTCAACCTTTATGGCAAGGCCGTCGGCAAGCCGGGCCTGCCCGCAGGGGTGTACA‑GCGACACGATCTCGGTCGAGCTGTCGTTCTGACCCATGCGCGGCTGGCTGGCAGGAGGCCTGACTGGCGTCAGCgtgt > 6:166714/1‑149 (MQ=255) gcgcCGCTCAGACGGTCAACCTTTATGGCAAGGCCGTCGGCAAGCCGGGCCTGCCCgcagggtgatggtgtcgtcgaccgccagcagcgccgtacgccccgcgtcggtatagaggtcgtacggtacaaagttgccagaaccatcggc < 4:55619‑M2/147‑92 (MQ=255) ccgcTCAGACGGTCAACCTTTATGGCAAGGCCGTCGGCAAGCCGGGCCTGCCCGCAGGGGTGTACA‑GCGACACGATCTCGGTCGAGCTGTCGTTCTGACCCATGCGCGGCTGGCTGGCAGGAGGCCTGACTGGCGTCAGCGTGttgttg < 2:130099/149‑1 (MQ=255) gcTCAGACGGTCAACCTTTATGGCAAGGCCGTCGGCAAGCCGGGCCTGCCCGCAGGGGTGTACA‑GCGACACGATCTCGGTCGAGCTGTCGtt < 2:317059/92‑1 (MQ=255) aGACGGTCAACCTTTATGGCAAGGCCGTCGGCAAGCCGGGCCTGCCCGCAGGGGTGTACA‑GCGACACGATCTCGGTCGAGCTGTCGTTCTGACCCATGCGCGGCTGGCTGGCAGGAGGCCTGACTGGCGTCAGc < 6:216178/134‑1 (MQ=255) aGACGGTCAACCTTTATGGCAAGGCCGTCGGCAAGCCGGGCCTGCCCGCAGGGGTGTACA‑GCGACACGATCTCGGTCGAGCTGTCGTTCTGACCCATGCGCGGCTGGCTGGCAGGAGGCCTGACTGGCGTCAGc > 5:216178/1‑134 (MQ=255) cGGTCAACCTTTATGGCAAGGCCGTCGGCAAGCCGGGCCTGCCCGCAGGGGTGTACA‑GCGACACGATCTCGGTCGAGCTGTCGTTCTGACCCATGCGCGGCTGGCTGGCAGGAGGCCTGACTGGCGTCAGCGTGTTGTTGGCCGCTCCt > 8:26080/1‑149 (MQ=255) gTCAACCTTTATGGCAAGGCCGTCGGCAAGCCGGGCCTGCCCGCAGGGGTGTACA‑GCGACACGATCTCGGTCGAGCTGTCGTTCTGACCCATGCGCGGCTGGCTGGCAGGAGGCCTGACTGGCGTCAGCGTGTTGTTGGCCg > 4:65876/1‑142 (MQ=255) gTCAACCTTTATGGCAAGGCCGTCGGCAAGCCGGGCCTGCCCGCAGGGGTGTACA‑GCGACACGATCTCGGTCGAGCTGTCGTTCTGACCCATGCGCGGCTGGCTGGCAGGAGGCCTGACTGGCGTCAGCGTGTTGTTGGCCg < 3:65876/142‑1 (MQ=255) aaCCTTTATGGCAAGGCCGTCGGCAAGCCGGGCCTGCCCGCAGGGGTGTACA‑GCGACACGATCTCGGTCGAGCTGTCGTTCTGACCCATGCGCGGCTGGCTGGCAGGAGGCCTGACTGGCGTCAGCGTGTTGTTGGCCGCTCCTTTggg > 8:135490/1‑149 (MQ=255) aaCCTTTATGGCAAGGCCGTCGGCAAGCCGGGCCTGCCCGCAGGGGTGTACA‑GCGACACGATCTCGGTCGAGCTGTCGTTCTGACCCATGCGCGGCTGGCTGGCAGGAGGCCTGACTGGCGTCAGCGTGTTGTTGGCCGCTCCTTTgg < 1:18712/148‑1 (MQ=255) aaCCTTTATGGCAAGGCCGTCGGCAAGCCGGGCCTGCCCGCAGGGGTGTACA‑GCGACACGATCTCGGTCGAGCTGTCGTTCTGACCCATGCGCGGCTGGCTGGCAGGAGGCCTGACTGGCGTCAGCGTGTTGTTGGCCGCTCCTTTgg < 6:38628/148‑1 (MQ=255) aCCTTTATGGCAAGGCCGTCGGCAAGCCGGGCCTGCCCGCAGGGGTGTACA‑GCGACACGATCTCGGTCGAGCTGTCGTTCTGACCCATGCGCGGCTGGCTGGCAGGAGGCCTGACTGGCGTCAGCGTGTTGTTGGCCGCTCCTTTgggg > 7:279703/1‑149 (MQ=255) ccTTTATGGCAAGGCCGTCGGCAAGCCGGGCCTGCCCGCAGGGGTGTACA‑GCGACACGATCTCGGTCGCGCTGTCGTTCTGACCCATGCGCGGCTGGCTGGCAGGAGGCCTGACTGGCGTCAGCGTGGTGTTGGCCGCTCCTTTggggg > 4:106981/1‑149 (MQ=255) cTTTATGGCAAGGCCGTCGGCAAGCCGGGCCTGCCCGCAGGGGTGTACA‑GCGACACGATCTCGGTCGAGCTGTCGTTCTGACCCATGCGCGGCTGGCTGGCAGGAGGCCTGACTGGCGTCAGCGTGTTGTTGGCCGCTCCTTTggggg > 8:26727/1‑148 (MQ=255) cTTTATGGCAAGGCCGTCGGCAAGCCGGGCCTGCCCGCAGGGGTGTACA‑GCGACACGATCTCGGTCGAGCTGTCGTTCTGACCCATGCGCGGCTGGCTGGCAGGAGGCCTGACTGGCGTCAGCGTGTTGTTGGCCGCTCCTTTgggg < 8:3947/147‑1 (MQ=255) cTTTATGGCAAGGCCGTCGGCAAGCCGGGCCTGCCCGCAGGGGTGTACA‑GCGACACGATCTCGGTCGAGCTGTCGTTCTGACCCATGCGCGGCTGGCTGGCAGGAGGCCTGACTGGCGTCAGCGTGTTGTTGGCCGCTCCTTTgggg > 7:3947/1‑147 (MQ=255) cTTTATGGCAAGGCCGTCGGCAAGCCGGGCCTGCCCGCAGGGGTGTACA‑GCGACACGATCTCGGTCGAGCTGTCGTTCTGACCCATGCGCGGCTGGCTGGCAGGAGGCCTGACTGGCGTCAGCGTGTTGTTGGCCGCTCCTTTGGGGGc < 7:26080/149‑1 (MQ=255) ttATGGCAAGGCCGTCGGCAAGCCGAGCCTGCCCGCAGGGGTGTACA‑GCGACACGATCTCGGTCGAGCTGTCGTTCTGACCCATGCGCGGCTGGCTGGCAGGAGGCCTGACTGGCGTCAGCGTGTTGTTGGCCGCTCCTTTGGGGGCAg > 7:243865/1‑149 (MQ=255) tGGCAAGGCCGTCGGCAAGCCGGGCCTGCCCgcagggtgatggtgtcgtcgaccgccagcagcgccgtacgccccgcgtcggtatagaggtcgtacggtacaaagttgccagaaccatcggcgagcgcacgggtgccaccgctcgactg > 3:55619‑M2/1‑31 (MQ=255) gCAAGGCCGTCGGCAAGCCGGGCCTGCCCGCAGGGGTGTACA‑GCGACACGATCTCGGTCGAGCTGTCGTTCTGACCCATGCGCGGCTGGCTGGCAGGAGGCCTGACTGGCGTCAGCGTGTTGTTGGCCGCTCCTTTGGGGGCAGTGAc > 8:137170/1‑148 (MQ=255) aaGGCCGTCGGCAAGCCGGGCCTGCCCGCAGGGGTGTACA‑GCGACACGATCTCGGTCGAGCTGTCGTTCTGACCCATGCGCGGCTGGCTGGCAGGAGGCCTGACTGGCGTCAGCGTGTTGTTGGCCGCTCCTTTGGGGGCAGTGACTAc < 7:137170/149‑1 (MQ=255) ccGTCGGCAAGCCGGGCCTGCCCgcagggtgatggtgtcgtcgaccgccagcagcgccgtacgccccgcgtcggtatagaggtcgtacggtacaaagttgccagaaccatcggcgagcgcacgggtgccaccgctcgactggccatcat > 8:88609‑M2/1‑23 (MQ=255) cGTCGGCAAGCCGGGCCTGCCCGCAGGGGTGTACA‑GCGACACGATCTCGGTCGAGCTGTCGTTCTGACCCATGCGCGGCTGGCTGGCAGGAGGCCTGACTGGCGTCAGCGTGTTGTTGGCCGCTCCTTTGGGGGCAGTGACTACCAGTa > 6:181795/1‑149 (MQ=255) tCGGCAAGCCGGGCCTGCCCGCAGGGGTGTACA‑GCGACACGATCTCGGTCGAGCTGTCGTTCTGACCCATGCGCGGCTGGCTGGCAGGAGGCCTGACTGGCGTCAGCGTGTTGTTGGCCGCTCCTTTGGGGGCAGTGACTACCAGTAcc < 3:160099/149‑1 (MQ=255) ccGGGCCTGCCCGCAGGGGTGTACAGGCGACACGATCTCGGTCGAGCTGTCGTTCTGACCCATGCGCGGCTGGCTGGCAGGAGGCCTGACTGGCGTCAGCGTGTTGTTGGCCGCTCCTTTGGGGGCAGTGACTACCAGTACCTTCACg > 1:3661/1‑148 (MQ=255) ccGGGCCTGCCCGCAGGGGTGTACA‑GCGACACGATCTCGGTCGAGCTGTCGTTCTGACCCATGCGCGGCTGGCTGGCAGGAGGCCTGACTGGCGTCAGCGTGTTGTTGGCCGCTCCTTTGGGGGCAGTGACTACCAGTACCTTCACg < 2:3661/147‑1 (MQ=255) ccGGGCCTGCCCGCAGGGGTGTACA‑GCGACACGATCTCGGTCGAGCTGTCGTTCTGACCCATGCGCGGCTGGCTGGCAGGAGGCCTGACTGGCGTCAGCGTGTTGTTGGCCGCTCCTTTGGGGGCAGTGACTACCAGTACCTTCACGGt > 7:126411/1‑149 (MQ=255) tGCCCGCAGGGGTGTACA‑GCGACACGATCTCGGTCGAGCTGTCGTTCTGACCCATGCGCGGCTGGCTGGCAGGAGGCCTGACTGGCGTCAGCGTGTTGTTGGCCGCTCCTTTGGGGGCAGTGACTACCAGTACCTTCACGGTGACGgcg > 5:169353/1‑149 (MQ=255) gCCCGCAGGGGTGTACA‑GCGACACGATCTCGGTCGAGCTGTCGTTCTGACCCATGCGCGGCTGGCTGGCAGGAGGCCTGACTGGCGTCAGCGTGTTGTTGGCCGCTCCTTTGGGGGCAGTGACTACCAGTACCTTCACGGTGACGgcg > 7:212767/1‑148 (MQ=255) cccGCAGGGGTGTACA‑GCGACACGATCTCGGTCGAGCTGTCGTTCTGACCCATGCGCGGCTGGCTGGCAGGAGGCCTGACTGGCGTCAGCGTGTTGTTGGCCGCTCCTTTGGGGGCAGTGACTACCAGTACCTTCACGGTGACGgcgc < 8:126411/148‑1 (MQ=255) cccGCAGGGGTGTACA‑GCGACACGATCTCGGTCGAGCTGTCGTTCTGACCCATGCGCGGCTGGCTGGCAGGAGGCCTGACTGGCGTCAGCGTGTTGTTGGCCGCTCCTTTGGGGGCAGTGACTACCAGTACCTTCACGGTGACGGCGCa < 7:135490/149‑1 (MQ=255) | AACTTTGTACCGTACGACCTCTATACCGACGCGGGGCGTACGGCGCTGCTGGCGGTCGACGACACCATCACCCTGCCGACCAGTACCGGCGCCGCTCAGACGGTCAACCTTTATGGCAAGGCCGTCGGCAAGCCGGGCCTGCCCGCAGGGGTGTACA‑GCGACACGATCTCGGTCGAGCTGTCGTTCTGACCCATGCGCGGCTGGCTGGCAGGAGGCCTGACTGGCGTCAGCGTGTTGTTGGCCGCTCCTTTGGGGGCAGTGACTACCAGTACCTTCACGGTGACGGCGCA > NC_002947/2692185‑2692474 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |