New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3198090 = | 35 (0.710) | 3 (0.060) | 3/248 | NT | 7.9% | coding (567/1527 nt) | ethA | FAD‑containing monooxygenase EthA |
? | NC_002947 | 3198123 = | 36 (0.750) | coding (534/1527 nt) | ethA | FAD‑containing monooxygenase EthA |
GGGCTGGTTGATGATGTAGGAGGGCGTGCGCTGCAGCATGGTGATGCTGGCGACCTTGTCGGCCATGGCCGGGATCAGGGTTACCGCAGTTGCGCCACTGCCAATGACCACGACGCGCTTGCCGGTGTAGTCGAGGTCTTCCGGCCAGTGTTGCGGATGGATGATCTGGCCCTTGAACTGTT‑CGCTGCCTTCGAACCGGGGGCTGAAGCCCTGATCATAGCGATAGTAACCGCCTGCACTGAACAGCCAGCGGCATTCGACCGTGCGGATCTGCGCCGTGCGG > NC_002947/3197985‑3198267 | gggCTGGTTGATGATGTAGGAGGGCGTGCGCTGCAGCATGGTGATGCTGGCGACCTTGTCGGCCATGGCCGGGATCAGGGTTACCGCAGTTGCGCCACTGCCAATGACCACGACGCGCTTGCCGGTGTAGTCGAGGTCTTCCGGCCAgt < 1:132373/149‑1 (MQ=255) cagtgcaggcggttactatcgctatgatcagggcttcagcccccggttcgaaggcagcgaacagttcaagggccagatcatccatccgcaacactggccggaaGACCACGACGCGCTTGCCGGTGTAGTCGAGGTCTTCCGGCCAgtg > 8:194661‑M1/104‑148 (MQ=255) gTTGATGATGTAGGAGGGCGTGCGCTGCAGCATGGTGATGCTGGCGACCTTGTCGGCCATGGCCGGGATCAGGGTTACCGCAGTTGCGCCACTGCCAATGACCACGACGCGCTTGCCGGTGTAGTCGAGGTCTTCCGGCCAGTGTTGCg > 1:6918/1‑149 (MQ=255) tgatgaTGTAGGAGGGCGTGCGCTGCAGCATGGTGATGCTGGCGACCTTGTCGGCCATGGCCGGGATCAGGGTTACCGCAGTTGCGCCACTGCCAATGACCACGACGCGCTTGCCGGTGTAGTCGAGGTCTTCCGGCCAGTGtt < 5:256761/144‑1 (MQ=255) tgatgaTGTAGGAGGGCGTGCGCTGCAGCATGGTGATGCTGGCGACCTTGTCGGCCATGGCCGGGATCAGGGTTACCGCAGTTGCGCCACTGCCAATGACCACGACGCGCTTGCCGGTGTAGTCGAGGTCTTCCGGCCAGTGtt > 6:256761/1‑144 (MQ=255) gatgatGTAGGAGGGCGTGCGCTGCAGCATGGTGATGCTGGCGACCTTGTCGGCCATGGCCGGGATCAGGGTTACCGCAGTTGCGCCACTGCCAATGACCACGACGCGCTTGCCGGTGTAGTCGAGGTCTTCCGGCCAGTGTTGCggat > 6:226735/1‑149 (MQ=255) atgatgTAGGAGGGCGTGCGCTGCAGCATGGTGATGCTGGCGACCTTGTCGGCCATGGCCGGGATCAGGGTTACCGCAGTTGCGCCACTGCCAATGACCACGACGCGCTTGCCGGTGTAGTCGAGGTCTTCCGGCCAGTGTTGCggatg > 3:198309/1‑149 (MQ=255) tgatgTAGGAGGGCGTGCGCTGCAGCATGGTGATGCTGGCGACCTTGTCGGCCATGGCCGGGATCAGGGTTACCGCAGTTGCGCCACTGCCAATGACCACGACGCGCTTGCCGGTGTAGTCGAGGTCTTCCGGCCAGTGTTGCggatg > 5:152391/1‑148 (MQ=255) atcgctatgatcagggcttcagcccccggttcgaaggcagcgaacagttcaagggccagatcatccatccgcaacactggccggaaGACCACGACGCGCTTGCCGGTGTAGTCGAGGTCTTCCg < 3:8054‑M1/38‑1 (MQ=255) atcgctatgatcagggcttcagcccccggttcgaaggcagcgaacagttcaagggccagatcatccatccgcaacactggccggaaGACCACGACGCGCTTGCCGGTGTAGTCGAGGTCTTCCg > 4:8054‑M1/87‑124 (MQ=255) aggGCGTGCGCTGCAGCATGGTGATGCTGGCGACCTTGTCGGCCATGGCCGGGATCAGGGTTACCGCAGTTGCGCCACTGCCAATGACCACGACGCGCTTGCCGGTGTAGTCGAGGTCTTCCGGCCAGTGTTGCGGATGGATGATCTgg < 2:6918/149‑1 (MQ=255) gggCGTGCGCTGCAGCATGGTGATGCTGGCGACCTTGTCGGCCATGGCCGGGATCAGGGTTACCGCAGTTGCGCCACTGCCAATGACCACGACGCGCTTGCCGGTGTAGTCGAGGTCTTCCGGCCAGTGTTGCGGATGGATGATCTgg < 4:198309/148‑1 (MQ=255) ggTGATGCTGGCGACCTTGTCGGCCATGGCCGGGATCAGGGTTACCGCAGTTGCGCCACTGCCAATGACCACGACGCGCTTGCAGGTGTAGTCGAGGTCTTCCGGCCAGTGTTGCGGATGGATGATCTGGCCCTTGAACTGTT‑CGCTGc > 7:203048/1‑149 (MQ=255) caccaTGCTGGCGACCTTGTCGGCCATGGCCGGGATCAGGGTTACCGCAGTTGCGCCACTGCCAATGACCACGACGCGCTTGCCGGTGTAGTCGAGGTCTTCCGGCCAGTGTTGCGGATGGATGATCTGGCCCTTGAACTGTT‑CGCTGc > 3:264360/5‑149 (MQ=255) gTGATGCTGGCGACCTTGTCGGCCATGGCCGGGATCAGGGTTACCGCAGTTGCGCCACTGCCAATGACCACGACGCGCTTGCCGGTGTAGTCGAGGTCTTCCGGCCAGTGTTGCGGATGGATGATCTGGCCCTTGAACTGTT‑CGCTGcc > 5:234521/1‑149 (MQ=255) gTGATGCTGGCGACCTTGTCGGCCATGGCCGGGATCAGGGTTACCGCAGTTGCGCCACTGCCAATGACCACGACGCGCTTGCCGGTGTAGTCGAGGTCTTCCGGCCAGTGTTGCGGATGGATGATCTGGCCCTTGAACTGTT‑CGCTGcc > 5:230152/1‑149 (MQ=255) aTGCTGGCGACCTTGTCGGCCATGGCCGGGATCAGGGTTACCGCAGTTGCGCCACTGCCAATGACCACGACGCGCTTGCCGGTGTAGTCGAGGTCTTCCGGCCAGTGTTGCGGATGGATGATCTGGCCCTTGAACTGTT‑CGCTGCCTTc < 6:152391/149‑1 (MQ=255) gCCATGGCCTGGATCAGGGTTAGCGCAGTTTCGTCACTTGATATGACCACGACGAGATTTCCGGTGTAGTCGAGGTCTTCCGGCCAGTGTTGAGGATGGTTGATATGGCCCTTGAACTGAT‑CTCTGCCTTCGAACCGGGGGCTGAAGcc < 3:55357/149‑1 (MQ=255) gCCATGGCCGGGATCAGGGTTACCGCAGTTGCGCCACTGCCAATGACCACGACGCGCTTGCCGGTGTAGTCGAGGTCTTCCGGCCAGTGTTGCGGATGGATGATCTGGCCCTTGAACTGTT‑CGCTGCCTTCGAACCGGGGGCTGAAGcc < 3:59551/149‑1 (MQ=255) ggATCAGGGTTACCGCAGTTGCGCCACTGCCAATGACCACGACGCGCTTGCCGGTGTAGTCGAGGTCTTCCGGCCAGTGTTGCGGATGGATGATCTGGCCCTTGAACTGTT‑CGCTGCCTTCGAACCGGGGGCTGAAGCCCTGATCATAg < 6:230152/149‑1 (MQ=255) ggATCAGGGTTACCGCAGTTGCGCCACTGCCAATGACCACGACGCGCTTGCCGGTGTAGTCGAGGTCTTCCGGCCAGTGTTGCGGATGGATGATCTGGCCCTTGAACTGTT‑CGCTGCCTTCGAACCGGGGGCTGAAGCCCTGATCATAg < 6:234521/149‑1 (MQ=255) tcccgggtACCGCAGTTGCGCCACTGCAAATGACCACTACGCGCTTGCCGGTGTAGTCGATGTCTTCCGGCCAGTGTTGCGGATGGATGATCTGGCCCTTGAACTGTT‑CGCTGCCTTCGAACCGGGGGCTGAAGCCCTGATCATAGCGa < 8:203048/142‑1 (MQ=255) tCAGGGTTACCGCAGTTGCGCCACTGCCAATGACCACGACGCGCTTGCCGGTGTAGTCGAGGTCTTCCGGCCAGTGTTGCGGATGGATGATCTGGCCCTTGAACTGTT‑CGCTGCCTTCGAACCGGGGGCTGAAGCCCTGATCTTAGCGa > 5:276912/1‑149 (MQ=255) tCAGGGTTACCGCAGTTGCGCCACTGCCAATGACCACGACGCGCTTGCCGGTGTAGTCGAGGTCTTCCGGCCAGTGTTGCGGATGGATGATCTGGCCCTTGAACTGTT‑CGCTGCCTTCGAACCGGGGGCTGAAGCCCTGATCATAGCGa > 1:142870/1‑149 (MQ=255) aGGGTTACCGCAGTTGCGCAACTGGCAATGACCACGTCGCGCTTTCGGGTGTAGTCGAGGTCTTCCGGCCAGTGTTGCGGATGGATGATCTGGACCTTGAACTGTT‑CGGTGCCTTCGAACGGGGGGCTGAAGCCCTTATCATAGCGATa < 4:264360/149‑1 (MQ=255) gggTTACCGCAGTTGCGCCACTGCCAATGACCACGACGCGCTTGCCGGTGTAGTCGAGGTCTTCCGGCCAGTGTTGCGGATGGATGATCTGGCCCTTGAACTGTT‑CGCTGCCTTCGAACCGGGGGCTGAAGCCCTGATCATAGCGATAg > 1:262915/1‑149 (MQ=255) aCCGCAGTTGCGCCACTGCCAATGACCACGACGCGCTTGCCGGTGTAGTCGAGGTCTTCCGGCCAGTGTTGCGGATGGATGATCTGGCCCTTGAACTGTT‑CGCTGCCTTCGAACCGGGGGCTGAAGCCCTGATCATAGCGATAGTAAc < 5:226735/148‑1 (MQ=255) ccGCAGTTGCGCCACTGCCAATGACCACGACGCGCTTGCCGGTGTAGTCGAGGTCTTCCGGCCAGTGTTGCGGATGGATGATCTGGCCCTTGAACTGTTCCGCTGCCTTCGAACCGGGGGCTGAAGCCCTGATCATAGCGATAGTAAcc < 1:233642/149‑1 (MQ=255) cactggccggaagacctcgactacaccggcaagcgcgtcgtggtcTTCCGGCCAGTGTTGCGGATGGATGATCTGGCCCTTGAACTGTT‑CGCTGCCTTCGAACCGGGGGCTGAAGCCCTGATCATAGCGATAGTAACCGCCTGCACTg > 8:194661‑M2/46‑148 (MQ=255) aCTGCCAATGACCACGACGCGCTTGCCGGTGTAGTCGAGGTCTTCCGGCCAGTGTTGCGGATGGATGATCTGGCCCTTGAACTGTT‑CGCTGCCTTCGAACCGGGGGCTGAAGCCCTGATCATAGCGATAGTAACCGCCTGCACTGAAca < 2:142870/149‑1 (MQ=255) cggaagacctcgactacaccggcaagcgcgtcgtggtcTTCCGGCCAGTGTTGCGGATGGATGATCTGGCCCTTGAACTGTT‑CGCTGCCTTCGAACCGGGGGCTGAAGCCCTGATCATAGCGAt > 4:8054‑M2/39‑124 (MQ=255) cggaagacctcgactacaccggcaagcgcgtcgtggtcTTCCGGCCAGTGTTGCGGATGGATGATCTGGCCCTTGAACTGTT‑CGCTGCCTTCGAACCGGGGGCTGAAGCCCTGATCATAGCGAt < 3:8054‑M2/86‑1 (MQ=255) ccAATGACCACGACGCGCTTGCCGGTGTAGTCGAGGTCTTCCGGCCAGTGTTGCGGATGGATGATCTGGCCCTTGAACTGTT‑CGCTGCCTTCGAACCGGGGGCTGAAGCCCTGATCATAGCGATAGTAACCGCCTGCACTGAAcagc > 1:178410/1‑147 (MQ=255) cAATGACCACGACGCGCTTGCCGGTGTAGTCGAGGTCTTCCGGCCAGTGTTGCGGATGGATGATCTGGCCCTTGAACTGTT‑CGCTGCCTTCGAACCGGGGGCTGAAGCCCTGATCATAGCGATAGTAACCGCCTGCACTGAAcagccag > 5:121697/1‑149 (MQ=255) cAATGACCACGACGCGCTTGCCGGTGTAGTCGAGGTCATCCGGCCAGTGTTGCGGATGGATGATCTGGCCCTTGAACTGTT‑CGCTGCCTTCGAACCggggg < 2:70630/101‑1 (MQ=255) cAATGACCACGACGCGCTTGCCGGTGTAGTCGAGGTCATCCGGCCAGTGTTGCGGATGGATGATCTGGCCCTTGAACTGTT‑CGCTGCCTTCGAACCggggg > 1:70630/1‑101 (MQ=255) acgacgtcgCGCTTGCCGGTGTAGTCGAGGTCTTCCGGCCAGTGTTGCGGATGGATGATCTGGCCCTTGAACTGTT‑CGCTGCCTTCGAACCGGGGGCTGAAGc < 6:195861/100‑1 (MQ=255) ACCACGACGCGCTTGCCGGTGTAGTCGAGGTCTTCCGGCCAGTGTTGCGGATGGATGATCTGGCCCTTGAACTGTT‑CGCTGCCTTCGAACCGGGGGCTGAAGCCCTGATCATAGCGATAGTAACCGCCTGCACTGAACAGCCAGCGGCa < 7:693‑M1/149‑1 (MQ=255) ACCACGACGCGCTTGCCGGTGTAGTCGACGTCTTCCGGCCAGTGTTGAGGATCGATCATCTGGCCCTTGAACTGTT‑CGCTGCCTTCGAACCGGGGGCTGAAGc < 5:195861‑M1/103‑1 (MQ=255) gcgcTTGCCGGTGTAGTCGTGGTGTTCCGGCGAGTGTTGCGGATGCATGATCTGGCCCTTGAACTGTT‑CGCTGGCTGCGAACCGGGGGCGGCCGCCGTGCTGATAGCGGTAGTCAGCGCCTGCACTGACCAGCCGGCGGCATTCgcgcg > 8:167024/1‑145 (MQ=255) cTTGCCGGTGTAGTCGAGGTCTTCCGGCCAGTGTTGCGGATGGATGATCTGGCCCTTGAACTGTT‑CGCTGCCTTCGAACCGGGGGCTGAAGCCCTGATCATAGCGATAGTAACCGCCTGCACTGAACAGCCAGCGGCATTCGACCGTGc > 5:242569/1‑149 (MQ=255) gCCGGTGTAGTCGAGGTCTTCCGGCCAGTGTTGCGGATGGATGATCTGGCCCTTGAACTGTT‑CGCTGCCTTCGAACCGGGGGCTGAAGCCCTGATCATAGCGATAGTAACCGCCTGCACTGAACAGCCAGCGGCATTCGACCGTGCGGa > 5:102175/1‑149 (MQ=255) cGGTGTAGTCGAGGTCTTCCGGCCAGTGTTGCGGATGGATGATCTGGCCCTTGAACTGTT‑CGCTGCCTTCGAACCGGGGGCTGAAGCCCTGATCATAGCGATAGTAACCGCCTGCACTGAAca < 5:86114/123‑1 (MQ=255) cGGTGTAGTAGAGGTCTTCCGGCCAGTGTTGCGGATGGATGATCTGGCCCTTGAACTGTT‑CGCTGCCTTCGAACCGGGGGCTGAAGCCCTGATCATAGCGATAGTAACCGCCTGCACTGAAca > 6:86114/1‑123 (MQ=255) tCGAGGTCTTCCGGCCAGTGTTGCGGATGGATGATCTGGCCCTTGAACTGTT‑CGCTGCCTTCGAACCGGGGGCTGAAGCCCTGATCATAGCGATAGTAACCGCCTGCACTg < 7:162408/111‑1 (MQ=255) tCGAGGTCTTCCGGCCAGTGTTGCGGATGGATGATCTGGCCCTTGAACTGTT‑CGCTGCCTTCGAACCGGGGGCTGAAGCCCTGATCATAGCGATAGTAACCGCCTGCACTg > 8:162408/1‑111 (MQ=255) tCGAGGTCTTCCGGCCAGTGTTGCGGATGGATGATCTGGCCCTTGAACTGTT‑CGCTGCCTTCGAACCGGGGGCTGAAGCCCTGATCATAGCGATAGTAACCGCCTGCACTGAACAGCCAGCGGCATTCGACCGTGCGGATCTGCGCCGt > 1:275639/1‑149 (MQ=255) ggtcTTCCGGCCAGTGTTGCGGATGGATGATCTGGCCCTTGAACTGTT‑CGCTGCCTTCGAACCGGGGGCTGAAGCCCTGATCATAGCGCTAGTAACCGCCTGCACTGAACAGCCAGCGGCATTCGACCGTGCGGATCTGCGCCGTGCgg < 7:167024‑M2/145‑1 (MQ=255) | GGGCTGGTTGATGATGTAGGAGGGCGTGCGCTGCAGCATGGTGATGCTGGCGACCTTGTCGGCCATGGCCGGGATCAGGGTTACCGCAGTTGCGCCACTGCCAATGACCACGACGCGCTTGCCGGTGTAGTCGAGGTCTTCCGGCCAGTGTTGCGGATGGATGATCTGGCCCTTGAACTGTT‑CGCTGCCTTCGAACCGGGGGCTGAAGCCCTGATCATAGCGATAGTAACCGCCTGCACTGAACAGCCAGCGGCATTCGACCGTGCGGATCTGCGCCGTGCGG > NC_002947/3197985‑3198267 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |