New junction evidence | |||||||||||
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seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3428206 = | 48 (0.970) | 3 (0.060) | 3/248 | NT | 6.2% | coding (117/207 nt) | PP_3043 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | 3428250 = | 45 (0.940) | coding (161/207 nt) | PP_3043 | hypothetical protein |
CAGGCACACCTCGCGGCCGTCGAGCGTGCGATTGCGCGTGGCGAACGGGTTGTTCGATACAGCGACCGCACCGTGGAGTATCGGACGGTAGACGAACTGA‑‑TCAAGGCCCGCGACCTGATCCGCACCGAATTGTCCCAGTCCGCTGGCCCGCGTTCCCGCGTGGTTCGGCTTTACCATGGGGGTAAGGGGCTGTGAGCGGCCGCTACATCTCCACACGTTCGGGGCTTCTGGTGCCCGAGCGGATCAAGGCCAGCTATGAGGGGGCCGCCGAAGGTCGGCGTTCCTCTGGCTGGGA > NC_002947/3428102‑3428396 | cAGGCACACCTCGCGGCCGTCGAGCGTGCGATTGCGCGTGGCGAACGGGTTGTTCGATACAGCGACCGCACCGTGGAGTATCGGACGGTAGACGAACTGA‑‑TCAAGGCCCGCGACCTGATCCGCACCGAATTGTCCCAGTCCGCTGGccc < 6:24410/149‑1 (MQ=255) aGGCACACCTCGCGGCCGTCGAGCGTGCGATTGCGCGTGGCGAACGGGTTGTTCGATACAGCGACCGCACCGTGGAGTATCGGACGGTAGACGAACTGA‑‑TCAAGGCCCGCGACCTGATCCGCACCGAATTGTCCCAGTCCGCTGGCCcg > 1:127570/1‑149 (MQ=255) gccttgatccgctcgggcaccagaagccccgaacgtgtggagatgtagcggccgctcacagccccttacccccatggtaaagccgaaccacgcgggaacgcgGGCCCGCGACCTGATCCGCACCGAATTGTCCCAGTCCGCTGGccc > 2:35552‑M1/103‑147 (MQ=255) cgGCCGTCGAGCGTGCGATTGCGCGTGGCGAACGGGTTGTTCGATACAGCGACCGCACCGTGGAGTATCGGACGGTAGACGAACTGA‑‑TCAAGGCCCGCGACCTGATCCGCACCGAATTGTCCCAGTCCGCTGGCCCGCGTTCCCGCGTg < 6:34902/149‑1 (MQ=255) gctcgggcaccagaagccccgaacgtgtggagatgtagcggccgctcacagccccttacccccatggtaaagccgaaccacgcgggaacgcgGGCCCGCGACATGATCCGCACCGAATTGTCCCAGTCCGCGGCcccgag < 6:223301‑M1/48‑3 (MQ=255) gctcgggcaccagaagccccgaacgtgtggagaggtagcggccgctcacagccccttacccccatggttaagccgaaccacgctggaacgcgGGCCCGCGACCTGATCCGCACCGAATTGTCCCAGTCCGCTGGCCcgcg > 5:223301‑M1/93‑140 (MQ=255) tCGAGCGTGCGATTGCGCGTGGCGAACGGGTTGTTCGATACAGCGACCGCACCGTGGAGTATCGGACGGTAGACGAACTGATCTCTAGGCCCGCGACCTGATCCGCACCGAATTGTCCCAGTCCGCTGGCCCGCGTTCCCGCGTGGTTc < 1:253014/149‑1 (MQ=255) cGTGCGATTGCGCGTGGCGAACGGGTTGTTCGATACAGCGACCGCACCGTGGAGTATCGGACGGTAGACGAACTGA‑‑TCAAGGCCCGCGACCTGATCCGCACCGAATTGTCCCAGTCCGCTGGCCCGCGTTCCCGCGTGGTTCGGCTTTa < 7:34250/149‑1 (MQ=255) gCGATTGCGCGTGGCGAACGGGTTGTTCGATACAGCGACCGCACCGTGGAGTATCGGACGGTAGACGAACTGA‑‑TCAAGGCCCGCGACCTGATCCGCACCGAATTGTCCCAGTCCGCTGGCCCGCGTTCCCGCGTGGTTCGGCTTTACCa > 3:127910/1‑149 (MQ=255) gCGATTGCGCGTGGCGAACGGGTTGTTCGATACAGCGACCGCACCGTGGAGTATCGGACGGTAGACGAACTGA‑‑TCAAGGCCCGCGACCTGATCCGCACCGAATTGTCCCAGTCCGCTGGCCCGCGTTCCCGCGTGGTTCGGCTTTACCa > 5:215068/1‑149 (MQ=255) aTTGCGCGTGGCGAACGGGTTGTTCGATACAGCGACCGCACCGTGGAGTATCGGACGGTAGACGAACTGA‑‑TCAAGGCCCGCGACCTGATCCGCACCGAATTGTCCCAGTCCGCTGGCCCGCGTTCCCGCGTGGTTCGGCTTTACCATgg < 2:127570/149‑1 (MQ=255) ttGCGCGTGGCGAACGGGTTGTTCGATACAGCGACCGCACCGTGGAGTATCGGACGGTAGACGAACTGA‑‑TCAAGGCCCGCGACCTGATCCGCACCGAATTGTCCCAGTCCGCTGGCCCGCGTTCCCGCGTGGTTCGGCTTTACCATggg > 2:167400/1‑149 (MQ=255) ttGCGCGTGGCGAACGGGTTGTTCGATACAGCGACCGCACCGGGGAGTATCGGACGGTAGACGAACTGA‑‑TCAAGGCCCGCGACCTGATCCGCACCGAATTGTCCCAGTCCGCTGGCCCGCGTTCCCGCGTGGTTCGGCTTTACCATggg < 8:211331/149‑1 (MQ=255) gcgcGTGGCGAACGGGTTGTTCGATACAGCGACCGCACCGTGGAGTATCGGACGGTAGACGAACTGA‑‑TCAAGGCCCGCGACCTGATCCGCACCGAATTGTCCCAGTCCGCTGGCCCGCGTTCCCGCGTGGTTCGGCTTTACCATgggg < 3:2374/148‑1 (MQ=255) gcgcGTGGCGAACGGGTTGTTCGATACAGCGACCGCACCGTGGAGTATCGGACGGTAGACGAACTGA‑‑TCAAGGCCCGCGACCTGATCCGCACCGAATTGTCCCAGTCCGCTGGCCCGCGTTCCCGCGTGGTTCGGCTTTACCATgggg < 2:69236/148‑1 (MQ=255) gcgcGTGGCGAACGGGTTGTTCGATACAGCGACCGCACCGTGGAGTATCGGACGGTAGACGAACTGA‑‑TCAAGGCCCGCGACCTGATCCGCACCGAATTGTCCCAGTCCGCTGGCCCGCGTTCCCGCGTGGTTCGGCTTTACCATgggg < 2:197209/148‑1 (MQ=255) cgcgTGGCGAACGGGTTGTTCGATACAGCGACCGCACCGTGGAGTATCGGACGGTAGACGAACTGA‑‑TCAAGGCCCGCGACCTGATCCGCACCGAATTGTCCCAGTCCGCTGGCCCGCGTTCCCGCGTGGTTCGGCTTTACCATGGGGGt < 6:164088/149‑1 (MQ=255) gAACGGGTTGTTCGATACAGCGACCGCACCGTGGAGTATCGGACGGTAGACGAACTGA‑‑TCAAGGCCCGCGACCTGATCCGCACCGAATTGTCCCAGTCCGCTGGCCCGCGTTCCCGCGTGGTTCGGCTTTACCATGGGGGTAAGGGGCt < 6:274309/149‑1 (MQ=255) cGGGTTGTTCGATACAGCGACCGCACCGTGGAGTATCGGACGGTAGACGAACTGA‑‑TCAAGGCCCGCGACCTGATCCGCACCGAATTGTCCCAGTCCGCTGGCCCGCGTTCCCGCGTGGTTCGGCTTTACCATGGGGGTAAGGGGCtgtg < 4:127910/149‑1 (MQ=255) gttgttCGATACAGCGACCGCACCGTGGAGTATCGGACGGTAGACGAACTGA‑‑TCAAGGCCCGCGACCTGATCCGCACCGAATTGTCCCAGTCCGCTGGCCCGCGTTCCCGCGTGGTTCGGCTTTACCATggg > 1:133415/1‑132 (MQ=255) gttgttCGATACAGCGACCGCACCGTGGAGTATCGGACGGTAGACGAACTGA‑‑TCAAGGCCCGCGACCTGATCCGCACCGAATTGTCCCAGTCCGCTGGCCCGCGTTCCCGCGTGGTTCGGCTTTACCATggg < 2:133415/132‑1 (MQ=255) gttgttCGATACAGCGACCGCACCGTGGAGTATCGGACGGTAGACGAACTGA‑‑TCAAGGCCCGCGACCTGATCCGCACCGAATTGTCCCAGTCCGCTGGCCCGCGTTCCCGCGTGGTTCGGCTTTACCATGGGGGTAAGGGGCTGTGAGc > 5:285543/1‑149 (MQ=255) cGATACAGCGACCGCACCGTGGAGTATCGGACGGTAGACGAACTGA‑‑TCAAGGCCCGCGACCTGATCCGCACCGAATTGTCCCAGTCCGCTGGCCCGCGTTCCCGCGTGGTTCGGCTTTACCATGGGGGTAAGGGGCTGTGAGCGGCCg < 6:285543/148‑1 (MQ=255) cAGCGACCGCACCGTGGAGTATCGGACGGTAGACGAACTGA‑‑TCAAGGCCCGCGACCTGATCCGCACCGAATTGTCCCAGTCCGCTGGCCCGCGTTCCCGCGTGGTTCGGCTTTACCATGGGGGTAAGGGGCTGTGAGCGGCCGCTACAt < 1:167563/149‑1 (MQ=255) aGCGACCGCACCGTGGAGTATCGGACGGTAGACGAACTGA‑‑TCAAGGCCCGCGACCTGATCCGCACCGAATTGTCCCAGTCCGCTGGCCCGCGTTCCCGCGTGGTTCGGCTTTACCATGGGGGTAAGGGGCTGTGAGCGGCCGCTACAtc > 3:241651/1‑149 (MQ=255) aCCGCACCGTGGAGTATCGGACGGTAGACGAACTGA‑‑TCAAGGCCCGCGACCTGATCCGCACCGAATTGTCCCAGTCCGCTGGCCCGCGTTCCCGCGTGGTTCGGCTTTACCATGGGGGTAAGGGGCTGTGAGCGGCCGCTACATCTCca < 1:167400/149‑1 (MQ=255) cGTGGAGTATCGGACGGTAGACGAACTGA‑‑TCAAGGCCCGCGACCTGATCCGCACCGAATTGTCCCAGTCCGCTGGCCCGCGTTCCCGCGTGGTTCGGCTTTACCATGGGGGTAAGGGGCTGTGAGCGGCCGCTACATCTCCACACGTTc < 6:288117/149‑1 (MQ=255) cGTGGAGTATCGGACGGTAGACGAACTGA‑‑TCAAGGCCCGCGACCTGATCCGCACCGAATTGTCCCAGTCCGCTGGCCCGCGTTCCCGCGTGGTTCGGCTTTACCATGGGGGTAAGGGGCTGTGAGCGGCCGCTACATCTCCACACGTTc > 5:288117/1‑149 (MQ=255) gTGGAGTATCGGACGGTAGACGAACTGA‑‑TCAAGGCCCGCGACCTGATCCGCACCGAATTGTCCCAGTCCGCTGGCCCGCGTTCCCGCGTGGTTCGGCTTTACCATGGGGGTAAGGGGCTGTGAGCGGCCGCTACATCTCCACACGTTCg < 6:215068/149‑1 (MQ=255) cGGACGGTAGACGAACTGA‑‑TCAAGGCCCGCGACCTGATCCGCACCGAATTGTCCCAGTCCGCTTGCCCGCGTTCCCGCGTGGTTCGGCTTTACCATGGGGGTAAGGGGCTGTGAGCGGCCGCTACATCTCCACACGTTCg < 3:146201/140‑1 (MQ=255) cGGACGGTAGACGAACTGA‑‑TCAAGGCCCGCGACCTGATCCGCACCGAATTGTCCCAGTCCGCTAGCCCGCGTTCCCGCGTGGTTCGGCTTTACCATGGGGGTAAGGGGCTGTGAGCGGCCGCTACATCTCCACACGTTCg > 4:146201/1‑140 (MQ=255) ggACGGTAGACGAACTGA‑‑TCAAGGCCCGCGACCTGATCCGCACCGAATTGTCCCAGTCCGCTGGCCCGCGTTCCCGCGTGGTTCGGCTTTACCATGGGGGTAAGGGGCTGTGAGCGGCCGCTACATCTCCACACGTTCGGGGCTTCTgg > 4:265425/1‑149 (MQ=255) ggACGGTAGACGAACTGA‑‑TCAAGGCCCGCGACCTGATCCGCACCGAATTGTCCCAGTCCGCTGGCCCGCGTTCCCGCGTGGTTCGGCTTTACCATGGGGGTAAGGGGCTGTGAGCGGCCGCTACATCTCCACACGTTCGGGGCTTCTgg > 2:226355/1‑149 (MQ=255) gACGGTAGACGAACTGA‑‑TCAAGGCCCGCGACCTGATCCGCACCGAATTGTCCCAGTCCGCTGGCCCGCGTTCCCGCGTGGTTCGGCTTTACCATGGGGGTAAGGGGCTGTGAGCGGCCGCTACATCTCCACACGTTCgg > 7:56836/1‑139 (MQ=255) gACGGTAGACGAACGCC‑‑TCACGGCCCGCGACCTGATCCGCACCGAATTGTCCCAGTCCGCTGGCCCGCGTTCCCGCGTGGTTCGGCTTTACCATGGGGGTAAGGGGCTGTGAGCGGCCGCTACATCTCCACACGTTCgg < 8:56836/139‑1 (MQ=255) ggTAGACGAACTGA‑‑TCAAGGCCCGCGACCTGATCCGCACCGAATTGTCCCAGTCCGCTGGCCCGCGTTCCCGCGTGGTTCGGCTTTACCATGGGGGTAAGGGGCTGTGAGCGGCCGCTACATCTCCACACGTTCGGGGCTTCTGGTGcc > 5:27404/1‑149 (MQ=255) tAGACGAACTGA‑‑TCAAGGCCCGCGACCTGATCCGCACCGAATTGTCCCAGTCCGCTGGCCCGCGTTCCCGCGTGGTTCGGCTTTACCATGGGGGTAAGGGGCTGTGAGCGGCCGCTACATCTCCACACGTTCGGGGCTTCTGGTGccc > 4:37554/1‑148 (MQ=255) aCGAACTGA‑‑TCAAGGCCCGCGACCTGATCCGCACCGAATTGTCCTTGTCCGCTGGCCCGCGTTCCCGCGTGGTTCGGCTTTACCATGGGGGTAAGGGGCTGTGAGCGGCCGCTACATCTCCACACGTTCGGGGCTTCTGGTGCCCGAGc > 1:225520/1‑149 (MQ=255) cGAACTGA‑‑TCAAGGCCCGCGACCTGATCCGCACCGAATTGTCCCAGTCCGCTGGCCCGCGTTCCCGCGTGGTTCGGCTTTACCATGGGGGTAAGGGGCTGTGAGCGGCCGCTACATCTCCACACGTTCGGGGCTTCTGGTGCCCGAGc < 2:36912/148‑1 (MQ=255) gA‑‑TCAAGGCCCGCGACCTGATCCGCACCGAATTGTCCCAGTCCGCTGGCCCGCGTTCCCGCGTGGTTCGGCTTTACCATGGGGGTAAGGGGCTGTGAGCGGCCGCTACATCTCCACACCTTCGGGGCTTCTGGTGCCCGAGCGGATc > 1:317526/1‑147 (MQ=255) a‑‑TCAAGGCCCGCGACCTGATCCGCACCGAATTGTCCCAGTCCGCTGGCCCGCGTTCCCGCGTGGTTCGGCTTTACCATGGGGGTAAGGGGCTGTGAGCGGCCGCTACATCTCCACACGTTCGGGGCTTCTGGTGCCCGAGCGGATCAAg < 6:27404/149‑1 (MQ=255) a‑‑TCAAGGCCCGCGACCTGATCCGCACCGAATTGTCCCAGTCCGCTGGCCCGCGTTCCCGCGTGGTTCGGCTTTACCATGGGGGTAAGGGGCTGTGAGCGGCCGCTACATCTCCACACGTTCGGGGCTTCTGGTGCCCGAGCGGATCAAg < 2:225520/149‑1 (MQ=255) ctcggggccgcggactgggacaattcggtgcggatcatgtcgcgggccCGCGTTCCCGCGTGGTTCGGCTTTACCATGGGGGTAAGGGGCTGTGAGCGGCCGCTACATCTCCACACGTTCGGGGCTTCTGGTGCCCGAGc < 6:223301‑M2/92‑1 (MQ=255) cgcgggccagcggactgggacaattcggtgcggatcaggtcgcgggccCGCGTTCCAGCGTGGTTCGGCTTAACCATGGGGGTAAGGGGCTGTGAGCGGCCGCTACCTCTCCACACGTTCGGGGCTTCTGGTGCCCGAGc > 5:223301‑M2/49‑140 (MQ=255) cAAGGCCCGCGACCTGATCCGCACCGAATTGTCCCAGTCCGCTGGCCCGCGTTCCCGCGTGGTTCGGCTTTACCATGGGGGTAAGGGGCTGTGAGCGGCCGCTACATCTCCACACGTTCGGGGCTTCTGGTGCCCGAGCGGATCAAGGc > 2:158551/1‑149 (MQ=255) gggccagcggactgggacaattcggtgcggatcaggtcgcgggccCGCGTTCCCGCGTGGTTCGGCTTTACCATGGGGGTAAGGGGCTGTGAGCGGCCGCTACATCTCCACACGTTCGGGGCTTCTGGTGCCCGAGCGGATCAAGGc > 2:35552‑M2/46‑147 (MQ=255) aGGCCCGCGACCTGATCCGCACCGAATTGTCCCAGTCCGCTGGCCCGCGTTCCCGCGTGGTTCGGCTTTACCATGGGGGTAAGGGGCTGTGAGCGGCCGCTACATCTCCACACGTTCGGGGCTTCTGGTGCCCGAGCGGATCAAGGCCa < 4:173023/149‑1 (MQ=255) GGCCCGCGACCTGATCCGCACCGAATTGTCCCAGTCCGCTGGCCCGCGTTCCCGCGTGGTTCGGCTTTACCATGGGGGTAAGGGGCTGTGAGCGGCCGCTACATCTCCACACGTTCGGGGCTTCTGGTGCCCGAGCGGATCAAGGCCAg > 1:158551‑M1/1‑149 (MQ=255) GGCCCGCGACCTGATCCGCACCGAATTGTCCCAGTCCGCTGGCCCGCGTTCCCGCGTGGTTCGGCTTTACCATGGGGGTAAGGGGCTGTGAGCGGCCGCTACATCTCCACACGTTCGGGGCTTCTGGTGCCCGAGCGGATCAAGGCCAg > 2:317526‑M1/1‑149 (MQ=255) GCCCGCGACCTGATCCGCACCGAATTGTCCCAGTCCGCTGGCCCGCGTTCCCGCGTGGTTCGGCTTTACCATGGGGGTAAGGGGCTGTGAGCGGCCGCTACATCTCCACACGTTCGGGGCTTCTGGTGCCCGAGCGGATCAAGGCCAGc < 1:230964‑M1/149‑1 (MQ=255) cgcgACCTGATCCGCACCGAATTGTCCCAGTCCGCTGGCCCGCGTTCCCGCGTGGTTCGGCTTTACCATGGGGGTAAGGGGCTGTGAGCGGCCGCTACATCTCCACACGTTCGGGGCTTCTGGTGCCCGAGCGGATCAAGGCCAGCTAt > 8:201056/1‑149 (MQ=255) aCCTGATCCGCACCGAATTGTCCCAGGCCGCTGGCCCGCGTTCCCGCGTGGTTCGGCTTTACCATGGGGGTAAGGGGCTGTGAGCGGCCGCTACATCTCCACACGTTCGGGGCTTCTGGCGCCCGAGCGGATCAAGGCCAGCTATGAgg < 4:241651/149‑1 (MQ=255) tGATCCGCACCGAATTGTCCCAGTCCGCTGGCCCGCGTTCCCGCGTGGTTCGGCTTTACCATGGGGGTAAGGGGCTGTGAGCGGCCGCTACATCTCCACACGTTCGGGGCTTCTGGTGCCCGAGCGGATCAAGGCCAGCTATGAggggg > 5:46591/1‑149 (MQ=255) cAGTCCGCTGGCCCGCGTTCCCGCGTGGTTCGGCTTTACCATGGGGGTAAGGGGCTGTGAGCGGCCGCTACATCTCCACACGTTCGGGGCTTCTGGTGCCCGAGCGGATCAAGGCCAGCTATGAGGGGGCCGCCGAAGGTCGGCGTTcc > 6:30955/1‑149 (MQ=255) aGTCCGCTGGCCCGCGTTCCCGCGTGGTTCGGCTTTACCATGGGGGTAAGGGGCTGTGAGCGGCCGCTACATCTCCACACGTTCGGGGCTTCTGGTGCCCGAGCGGATCAAGGCCAGCTATGAGGGGGCCGCCGAAGGTCGGCGTTCct < 7:201056/149‑1 (MQ=255) aGTCCGCTGCCCCGCGTTCCCGCGTGGTTCGGCTTTACCATGGGGGTAAGGCGCTCTGAGCGGCCGCTACATCTCAACACGTTCGGGGCTTCTGGTGCCCGAGCGGATCAAGGCCAGCTATGACGGGGCCGCCGAAGGTCTGCGTTcc > 4:242300/1‑148 (MQ=255) ccCGCGTTCCCGCGTGGTTCGGCTTTACCATGGGGGTAAGGGGCTGTGAGCGGCCGCTACATCTCCACACGTTCGGGGCTTCTGGTGCCCGAGCGGATCAAGGCCAGCTATGAGGGGGCCGCCGaa > 7:504‑M2/3‑126 (MQ=255) ccCGCGTTCCCGCGTGGTTCGGCTTTACCATGGGGGTAAGGGGCTGTGAGCGGCCGCTACATCTCCACACGTTCGGGGCTTCTGGTGCCCGAGCGGATCAAGGCCAGCTATGAGGGGGCCGCCGAAGGTCGGCGTTCCTCTGGCTGGGa < 1:35552‑M2/147‑1 (MQ=255) cCGCGTTCCCGCGTGGTTCGGCTTTACCATGGGGGTAAGGGGCTGTGAGCGGCCGCTACATCTcc > 4:96491‑M2/2‑65 (MQ=255) cCGCGTTCCCGCGTGGTTCGGCTTTACCATGGGGGTAAGGGGCTGTGAGCGGCCGCTACATCTcc < 3:96491‑M2/64‑1 (MQ=255) | CAGGCACACCTCGCGGCCGTCGAGCGTGCGATTGCGCGTGGCGAACGGGTTGTTCGATACAGCGACCGCACCGTGGAGTATCGGACGGTAGACGAACTGA‑‑TCAAGGCCCGCGACCTGATCCGCACCGAATTGTCCCAGTCCGCTGGCCCGCGTTCCCGCGTGGTTCGGCTTTACCATGGGGGTAAGGGGCTGTGAGCGGCCGCTACATCTCCACACGTTCGGGGCTTCTGGTGCCCGAGCGGATCAAGGCCAGCTATGAGGGGGCCGCCGAAGGTCGGCGTTCCTCTGGCTGGGA > NC_002947/3428102‑3428396 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |