New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3608915 = | 42 (0.850) | 4 (0.080) | 4/248 | NT | 8.4% | coding (202/2265 nt) | PP_3182 | GGDEF domain‑containing protein |
? | NC_002947 | 3608979 = | 47 (0.980) | coding (138/2265 nt) | PP_3182 | GGDEF domain‑containing protein |
CTGGCCGCTAGCAGCCGGCCTTGTCGGTCGTACAGGCTCAAGCGCTTGAACACAGGGTCTGCTGCCAGGCTGAGGTTGCCTTGGCGCCGCGCTTTCATGTCGTCCTGGGTCACACGACCCACCGCCTGGGCGCGGTCGACAAGCTGTCGGAGGTTTTCGCCCACGATGCTGGCCAGGTTCAGGTGCTCGATGGCCTTGGCCGACAGTGCATTCTGTCGGGCGGCGGCTTTCTGGGTGACGTGCAGCCCCCAGAGAAAGGCCAGGGTCGCTGCACAGAGCATCAGGATAAGCA > NC_002947/3608836‑3609127 | ctggcCGCTAGCAGCCGGCCTTGTCGGTCGTACAGGCTCAAGCGCTTGAACACAGGGTCTGCTGCCAGGCTGAGGTTGCCTTGGCGCCGCGCTTTCATGTCGTCCTGGGTCACACGACCCACCGCCTGGGCGCGGTCGACAAGCTGTc > 3:1534/1‑148 (MQ=255) ctggcCGCTAGCAGCCGGCCTTGTCGGTCGTACAGGCTCAAGCGCTTGAACACAGGGTCTGCTGCCAGGCTGAGGTTGCCTTGGCGCCGCGCTTTCATGTCGTCCTGGGTCACACGACCCACCGCCTGGGCGCGGTCGACAAGCTGTc < 4:1534/148‑1 (MQ=255) ctggcCGCTAGCAGCCGGCCTTGTCGGTCGTACAGGCTCAAGCGCTTGAACACAGGGTCTGCTGCCAGGCTGAGGTTGCCTTGGCGCCGCGCTTTCATGTCGTCCTGGGTCACACGACCCACCGCCTGGGCGCGGTCGACAAGCTGTCg > 8:169300/1‑149 (MQ=255) ctggcCGCTAGCAGCCGGCCTTGTCGGTCGTACAGGCTCAAGCGCTTGAACACAGGGTCTGCTGCCAGGCTGAGGTTGCCTTGGCGCCGCGCTTTCATGTCGTCCTGGGTCACACGACCCACCGCCTGGGCGCGGTCGACAAGCTGTCg > 4:139905/1‑149 (MQ=255) gcCGCTAGCAGCCGGCCTTGTCGGTCGTACAGGCTCAAGCGCTTGAACACAGGGTCTGCTGCCAGGCTGAGGTTGCCTTGGCGCCGCGCTTTCATGTCGTCCTGGGTCACACGACCCACCGCCTGGGCGCGGTCGACAAGCTGTCGGa < 3:308908/148‑1 (MQ=255) acagaatgcactgtcggccaaggccatcgagcacctgaacctggccagcatcgtgggcgaaaacctccgacagCTTGGCGCCGCGCTTTCATGTCGTCCTGGGTCACACGACCCACCGCCTGGGCGCGGTCGACAAGCTGt < 8:284934‑M1/68‑1 (MQ=255) acagaatgcactgtcggccaaggccatcgagcacctgaacctggccagcatcgtgggcgaaaacctccgacagCTTGGCGCCGCGCTTTCATGTCGTCCTGGGTCACACGACCCACCGCCTGGGCGCGGTCGACAAGCTGt > 7:284934‑M1/74‑141 (MQ=255) cTAGCAGCCGGCCTTGTCGGTCGTACAGGCTCAAGCGCTTGAACACAGGGTCTGCTGCCAGGCTGAGGTTGCCTTGGCGCCGCGCTTTCATGTCGTCCTGGGTCACACGACCCACCGCCTGGGCGCGGTCGACAAGCTGTCGGAGGttt > 2:113106/1‑149 (MQ=255) cTAGCAGCCGGCCTTGTCGGTCGTACAGGCTCAAGCGCTTGAACACAGGGTCTGCTGCCAGGCTGAGGTTGCCTTGGCGCCGCGCTTTCATGTCGTCCTGGGTCACACGACCCACCGCCTGGGCGCGGTCGACAAGCTGTCGGAGGttt > 2:278471/1‑149 (MQ=255) gtcggtcgTACAGGCTCAAGCGCTTGAACACAGGGTCTGCTGCCAGGCTGAGGTTGCCTTGGCGCCGCGCTTTCATGTCGTCCTGGGTCACACGACCCACCGCCTGGGCGCGGTCGACAAGCTGTCGGAGGTTTTCGCCCACGATGCTg > 6:172989/1‑149 (MQ=255) aGGCTCAAGCGCTTGAACACAGGGTCTGCTGCCAGGCTGAGGTTGCCTTGGCGCCGCGCTTTCATGTCGTCCTGGGTCACACGACCCACCGCCTGGGCGCGGTCGACAAGCTGTCGGAGGTTTTCGCCCACGATGCTGGCCAGGTTCAg < 7:113551/149‑1 (MQ=255) gCTCAAGCGCTTGAACACAGGGTCTGCTGCCAGGCTGAGGTTGCCTTGGCGCCGCGCTTTCATGTCGTCCTGGGTCACACGACCCACCGCCTGGGCGCGGTCGACAAGCTGTCGGAGGTTTTCGCCCACGATGCTGGCCAGGTTCAg < 2:144377/147‑1 (MQ=255) gCTCAAGCGCTTGAACACAGGGTCTGCTGCCAGGCTGAGGTTGCCTTGGCGCCGCGCTTTCATGTCGTCCTGGGTCACACGACCCACCGCCTGGGCGCGGTCGACAAGCTGTCGGAGGTTTTCGCCCACGATGCTGGCCAGGTTCAg > 1:144377/1‑147 (MQ=255) tCAAGCGCTTGAACACAGGGTCTGCTGCCAGGCTGAGGTTGCCTTGGCGCCGCGCTTTCATGTCGTCCTGGGTCACACGACCCACCGCCTGGGCGCGGTCGACAAGCTGTCGGAGGTTTTCGCCCACGATGCTGGCCAGGTTCAGGTGc > 2:208763/1‑149 (MQ=255) aaGCGCTTGAACACAGGGTCTGCTGCCAGGCTGAGGTTGCCTTGGCGCCGCGCTTTCATGTCGTCCTGGGTCACACGACCCACCGCCTGGGCGCGGTCGACAAGCTGTCGGAGGTTTTCGCCCACGATGCTGGCCAGGTTCAGGTGCt < 7:169300/148‑1 (MQ=255) aGCGCTTGAACACAGGGTCTGCTGCCAGGCTGAGGTTGCCTTGGCGCCGCGCTTTCATGTCGTCCTGGGTCACACGACCCACCGCCTGGGCGCGGTCGACAAGCTGTCGGAGGTTTTCGCCCACGATGCTGGCCAGGTTCAGGTGCTCg < 5:166557/149‑1 (MQ=255) ttGAACACAGGGTCTGCTGCCAGGCTGAGGTTGCCTTGGCGCCGCGCTTTCATGTCGTCCTGGGTCACACGACCCACCGCCTGGGCGCGGTCGACAAGCTGTCGGAGGTTTTCGCCCACGATGCTGGCCAGGTTCAGGTGCTCGATGGc > 4:50447/1‑149 (MQ=255) caGGGTCTGCTGCCAGGCTGAGGTTGCCTTGGCGCCGCGCTTTCATGTCGTCCTGGGTCACACGACCCACCGCCTGGGCGCGGTCGACAAGCTGTCGGAGGTTTTCGCCCACGATGCTGGCCAGGTTCAGGTGCTCGATGGCCTTGGcc < 1:17723/149‑1 (MQ=255) gggTCTGCTGCCAGGCTGAGGTTGCCTTGGCGCCGCGCTTTCATGTCGTCCTGGGTCACACGACCCACCGCCTGGGCGCGGTCGACAAGCTGTCGGAGGTTTTCGCCCACGATGCTGGCCAGGTTCAGGTGCTCGATGGCCTTGGCCGa > 6:236389/1‑149 (MQ=255) gTCTGCTGCCAGGCTGAGGTTGCCTTGGCGCCGCGCTTTCATGTCGTCCTGGGTCACACGACCCACCGCCTGGGCGCGGTCGACAAGCTGTCGGAGGTTTTCGCCCACGATGCTGGCCAGGTTCAGGTGCTCGATGGCCTTGGCCGACa < 7:22696/149‑1 (MQ=255) tCTGCTGCCAGGCTGAGGTTGCCTTGGCGCCGCGCTTTCATGTCGTCCTGGGTCACACGACCCACCGCCTTGGCGCGGTCGACAAGCTGTCGGAGGTTTTCGCCCACGATGCTGGCCAGGTTCAGGTGCTCGATGGCCTTGGCCGACAg < 7:6757/149‑1 (MQ=255) ctgcCAGGCTGAGGTTGCCTTGGCGCCGCGCTTTCATGTCGTCCTGGGTCACACGACCCACCGCCTGGGCGCGGTCGACAAGCTGTCGGAGGTTTTCGCCCACGATGCTGGCCAGGTTCAGGTGCTCGATGGCCTTGGCCGACAGt < 3:139905/146‑1 (MQ=255) ctgcCAGGCTGAGGTTGCCTTGGCGCCGCGCTTTCATGTCGTCCTGGGTCACACGACCCACCGCCTGGGCGCGGTCGACAAGCTGTCGGAGGTTTTCGCCCACGATGCTGGCCAGGTTCAGGTGCTCGATGGCCTTGGCCGACAGTg < 5:172989/147‑1 (MQ=255) gcCAGGCTGAGGTTGCCTTGGCGCCGCGCTTTCATGTCGTCCTGGGTCACACGACCCACCGCCTGGGCGCGGTCGACAAGCTGTCGGAGGTTTTCGCCCACGATGCTGGCCAGGTTCAGGTGCTCGATg < 3:389/129‑1 (MQ=255) gcCAGGCTGAGGTTGCCTTGGCGCCGCGCTTTCATGTCGTCCTGGGTCACACGACCCACCGCCTGGGCGCGGTCGACAAGCTGTCGGAGGTTTTCGCCCACGATGCTGGCCAGGTTCAGGTGCTCGATg > 4:389/1‑129 (MQ=255) ccAGGCTGAGGTTGCCTTGGCGCCGCGCTTTCATGTCGTCCTGGGTCACACGACCCACCGCCTGGGCGCGGTCGACAAGCTGTCGGAGGTTTTCGCCCACGATGCTGGCCAGGTTCAGGTGCTCGATGGCCTTGGCCGACAGTGCAtt < 2:175547/148‑1 (MQ=255) gggtGAGGTTGCCTTGGCGCCGCGCTTTCATGTCGTGCTGGGTCACACGACCCACCGCCTGGGCGCGGTCGACAAGCTGTCGGAGGTTTTCGCCCACGATGCTGGCCAGGTTCAGGTGGTCGATGGCCTTGGCCGACAGTGCATTCTGt < 6:7521/146‑1 (MQ=255) gCTGAGGTTGCCTTGGCGCCGCGCTTTCATGTCGTCCTGGGTCACACGACCCACCGCCTGGGCGCGGTCGACAAGCTGTCGGAGGTTTTCGCCCACGATGCTGGCCAGGTTCAGGTGCTCGATGGCCTTGGCCGACAGTGCATTCTGTc > 1:205009/1‑149 (MQ=255) cTGAGGTTGCCTTGGCGCCGCGCTTTCATGTCGTCCTGGGTCACACGACCCACCGCCTGGGCGCGGTCGACAAGCTGTCGGAGGTTTTCGCCCACGATGCTGGCCAGGTTCAGGTGCTCGATGGCCTTGGCCGACAGTGCATTCTGTCg > 7:69470/1‑149 (MQ=255) gAGGTTGCCTTGGCGCCGCGCTTTCATGTCGTCCTGGGTCACACGACCCACCGCCTGGGCGCGGTCGACAAGCTGTCGGAGGTTTTCGCCCACGATGCTGGCCAGGTTCAGGTGCTCGATGGCCTTGGCCGACAGTGCATTCTGTCggg > 2:262126/1‑149 (MQ=255) ggTTGCCTTGGCGCCGCGCTTTCATGTCGTCCTGGGTCACACGACCCACCGCCTGGGCGCGGTCGACAAGCTGTCGGAGGTTTTCGCCCACGATGCTGGCCAGGTTCAGGTGCTCGATGGCCTTGGCCGACAGTGCATTCTGTCGggcg > 6:41374/1‑149 (MQ=255) acagcttgtcgaccgcgcccaggcggtgggtcgtgtgacccaggacgacatgaaagcgcggcgccaagCTGTCGGAGGTTTTCGCCCACGATGCTGGCCAGGTTCAGGTGCTCGATGGCCTTGGCCGACAGTGCATTCTGt > 7:284934‑M2/69‑141 (MQ=255) acagcttgtcgaccgcgcccaggcggtgggtcgtgtgacccaggacgacatgaaagcgcggcgccaagCTGTCGGAGGTTTTCGCCCACGATGCTGGCCAGGTTCAGGTGCTCGATGGCCTTGGCCGACAGTGCATTCTGt < 8:284934‑M2/73‑1 (MQ=255) cttgtcgaccgcgcccaggcggtgggtcgtgtgacccaggacgacatgaaagcgcggcgccaagCTGTCGGAGGTTTTCGCCCACGATGCTTGCCAGGTTCAGGTGCTCGATGGCCTTGGCCGACa < 4:86946‑M2/62‑1 (MQ=255) cttgtcgaccgcgcccaggcggtgggtcgtgtgacccaggacgacatgaaagcgcggcgccaagCTGTCGGAGGTTTTCGCCCACGATGCTGGCCAGGTTCAGGTGCTCGATGGCCTTGGCCGACa > 3:86946‑M2/65‑126 (MQ=255) TGGCGCCGCGCTTTCATGTCGTCCTGGGTCACACGACCCACCGCCTGGGCGCGGTCGACAAGCTGTCGGAGGGTTTCGCCCACGATGCTGGCCAGGTTCAGGTGCTCGATGGCCTTGGCCGACAGTGCATTCTGTCGGGCGGCGGCttt < 8:57530‑M1/149‑1 (MQ=255) GGCGCCGCGCTTTCATGTCGTCCTGGGTCACACGACCCACCGCCTGGGCGCGGTCGACAAGCTGTCGGAGGTTTTCGCCCACGATGCTGGCCAGGTTCAGGTGCTCGATGGCCTTGGCCGACAGTGCATTCTGTCGGGCGGCGGCttt > 5:236389‑M1/1‑148 (MQ=255) gccgcGCTTTCATGTCGTCCTGGGTCACACGACCCACCGCCTGGGCGCGGTCGACAAGCTGTCGGAGGTTTTCGCCCACGATGCTGGCCAGGTTCAGGTGCTCGATGGCCTTGGCCGACAGTGCATTCTGTCGGGCGGCGGCTTTCTgg > 1:308307/1‑149 (MQ=255) gccgcGCTTTCATGTCGTCCTGGGTCACACGACCCACCGCCTGGGCGCGGTCGACAAGCTGTCGGAGGTTTTCGCCCACGATGCTGGCCAGGTTCAGGGGCTCGATGGCCTTGGCCGACAGTGCATTCTGTCGGGCGGCGGCTTTCTgg < 7:57530/149‑1 (MQ=255) tttCATGTCGTCCTGGGTCACACGACCCACCGCCTGGGCGCGGTCGACAAGCTGTCGGAGGTTTTCGCCCACGATGCTGGCCAGGTTCAGGTGCTCGATGGCCTTGGCCGACAGTGCATTCTGTCGGGCGGCGGCTTTCTGGGTGACGt > 7:115178/1‑149 (MQ=255) gtcgtcCTGGGTCACACGACCCACCGCCTGGGCGCGGTCGACAAGCTGTCGGAGGTTTTCGCCCACGATGCTGGCCAGGTTCAGGTGCTCGATGGCCTTGGCCGACAGTGCATTCTGTCGGGCGGCGGCTTTCTggg < 8:220983/137‑1 (MQ=255) gtcgtcCTGGGTCACACGACCCACCGCCTGGGCGCGGTCGACAAGCTGTCGGAGGTTTTCGCCCACGATGCTGGCCAGGTTCAGGTGCTCGATGGCCTTGGCCGACAGTGCATTCTGTCGGGCGGCGGCTTTCTggg > 7:220983/1‑137 (MQ=255) tcCTGGGTCACACGACCCACCGCCTGGGCGCGGTCGACAAGCTGTCGGAGGTTTTCGCCCACGATGCTGGCCAGGTTCAGGTGCTCGATGGCCTTGGCCGACAGTGCATTCTGTCGGGCGGCGGCTTTCTGGGTGACGTGCAGCCCCCa < 8:125857/149‑1 (MQ=255) cTGGGTCACACGACCCACCGCCTGGGCGGGGTCGACAAGCTGTCGGAGGTTTTCGCCCACGATGCTGGCCAGGTTCAGGTGCTCGATGGCCTTGGCCGACAGTGCATTCTGTCGGGCGGCGGCTTTCTGTGTGACGTGCAGCCCCCaga < 3:50447/149‑1 (MQ=255) ggTCACACGACCCACCGCCTGGGCGCGGTCGACAAGCTGTCGGAGGTTTTCGCCCACGATGCTGGCCAGGTTCAGGTGCTCGATGGCCTTGGCTGACAGTGCATTCTGTCGGGCGGCGGCTTTCTGGGTGACGTGCAGCCCCCAgaga > 2:274633/1‑148 (MQ=255) gTCACACGACCCACCGCCTGGGCGCGGTCGACAAGCTGTCGGAGGTTTTCGCCCACGATGCTGGCCAGGTTCAGGTGCTCGATGGCCTTGGCCGACAGTGCATTCTGTCGGGCGGCGGCTTTCTGGGTGACGTGCAGCCCCCACAGaaa < 1:262126/149‑1 (MQ=255) tCACACGACCCACCGCCTGGGCGCGGTCGACAAGCTGTCGGAGGTTTTCGCCCACGATGCTGGCCAGGTTCAGGTGCTCGATGGCCTTGGCCGACAGTGCATTCTGTCGGGCGGCGGCTTTCTGGGTGACGTGCAGCCCCCAGAGAAAg > 6:3913/1‑149 (MQ=255) tCACACGACCCACCGCCTGGGCGCGGTCGACAAGCTGTCGGAGGTTTTCGCCCACGATGCTGGCCAGGTTCAGGTGCTCGATGGCCTTGGCCGACAGTGCATTCTGTCGGGCGGCGGCTTTCTGGGTGACGTGCAGCCCCCAGAGAAAg < 8:115178/149‑1 (MQ=255) tCACACGACCCACCGCCTGGGCGCGGTCGACAAGCTGTCGGAGGTTTTCGCCCACGATGCTGGCCAGGTTCAGGTGCTCGATGGCCTTGGCCGACAGTGCATTCTGTCGGGCGGCGGCTTTCTGGGTGACGTGCAGCCCCCAGAGAAAg > 1:85531/1‑149 (MQ=255) acGACCCACCGCCTGGGCGCGGTCGACAAGCTGTCGGAGGTTTTCGCCCACGATGCTGGCCAGGTTCAGGTGCTCGATGGCCTTGGCCGACAGTGCATTCTGTCGggcggcgg < 4:159183/113‑1 (MQ=255) acGACCCACCGCCTGGGCGCGGTCGACAAGCTGTCGGAGGTTTTCGCCCACGATGCTGGCCAGGTTCAGGTGCTCGATGGCCTTGGCCGACAGTGCATTCTGTCGGGCGGCGGCTTTCTGGGTGACGTGCAGCCCCCAGAGAAAGGCCa < 2:205009/149‑1 (MQ=255) gACCCACCGCCTGGGCGCGGTCGACAAGCTGTCGGAGGTTTTCGCCCACGATGCTGGCCAGGTTCAGGTGCTCGATGGCCTTGGCCGACAGTGCATTCTGTCGGGCGGCGGCTTTCTGGGTGACGTGCAGCCCCCAGAGAAAGGCCAgg > 2:269915/1‑149 (MQ=255) aCCGCCTGGGCGCGGTCGACAAGCTGTCGGAGGTTTTCGCCCACGATGCTGGCCAGGTTCAGGTGCTCGTTGGCCTTGGCCGACAGTGCATTCTGTc < 4:31766/97‑1 (MQ=255) aCCGCCTGGGCGCGGTCGACAAGCTGTCGGAGGTTTTCGCCCACGATGCTGGCCAGGTTCAGGTGCTCGATGGCCTTGGCCGACAGTGCATTCTGTc > 3:31766/1‑97 (MQ=255) ccTGGGCGCGGTCGACAAGCTGTCGGAGGTTTTCGCCCACGATGCTGGCCAGGTTCAGGTGCTCGATGGCCTTGGCCGACAGTGCATTCTGTCGGGCGGCGGCTTTCTGGGTGACGTGCAGCCCCCag > 5:289596/1‑128 (MQ=255) ccTGGGCGCGGTCGACAAGCTGTCGGAGGTTTTCGCCCACGATGCTGGCCAGGTTCAGGTGCTCGATGGCCTTGGCCGACAGTGCATTCTGTCGGGCGGCGGCTTTCTGGGTGACGTGCAGCCCCCag < 6:289596/128‑1 (MQ=255) ggCGCGGTCGACAAGCTGTCGGAGGTTTTCGCCCACGATGCTGGCCAGGTTCAGGTGCTCGATGGCCTTGGCCGACAGTGCATTCTGTCGGGCGGCGGCTTTCTGGGTGACGTGCAGCCCCCAGAGAAAGGCCAGGGTCGCTGCACaga < 5:3913/149‑1 (MQ=255) gTCGACAAGCTGTCGGAGGTTTTCGCCCACGATGCTGGCCAGGTTCAGGTGCTCGATGGCCTTGGCCGACAGTGCATTCTGTCGGGCGGCGGCTTTCTGGGTGACGTGCAGCCCCCAGAGAAAGGCCAGGGTCGCTGCACAGAGCAt > 7:103189/1‑147 (MQ=255) tCGACAAGCTGTCGGAGGTTTTCGCCCACGATGCTGGCCAGGTTCAGGTGCTCGATGGCCTTGGCCGACAGTGCATTCTGTCGGGCGGCGGCTTTCTGGGTGACGTGCAGCCCCCAGAGAAAGGCCAGGGTCGCTGCACAGAGCATCAg < 8:103189/149‑1 (MQ=255) cGACAAGCTGTCGGAGGTTTTCGCCCACGATGCTGGCCAGGTTCAGGTGCTCGATGGCCTTGGCCGACAGTGCATTCTGTCGGGCGGCGGCTTTCTGGGTGACGTGCAGCCCCCAGAGAAAGGCCAGGGTCGCTGCACAGAGCATCAg > 5:282/1‑148 (MQ=255) gACAAGCTGTCGGAGGTTTTCGCCCACGATGCTGGCCAGGTTCAGGTGCTCGATGGCCTTGGCCGACAGTGCATTCTGTCGGGCGGCGGCTTTCTgg < 3:192860/97‑1 (MQ=255) gACAAGCTGTCGGAGGTTTTCGCCCACGATGCTGGCCAGGTTCAGGTGCTCGATGGCCTTGGCCGACAGTGCATTCTGTCGGGCGGCGGCTTTCTgg > 4:192860/1‑97 (MQ=255) aCAAGCTGTCGGAGGTTTTCGCCCACGATGCTGGCCAGGTTCAGGTGCTCGATGGCCTTGGCCGACAGTGCATTCTGTCGGGCGGCGGCTTTCTGGGTGACGTGCAGCCCCCAGAGAAAGGCCAGGGTCGCTGCACAGAGCATCAGGa > 2:309175/1‑148 (MQ=255) caagCTGTCGGAGGTTTTCGCCCACGATGCTGGCCAGGTTCAGGTGCTCGATGGCCTTGGCCGACAGTGCATTCTGTCGGGCGGCGGCTTTCTGGGTGACGTGCAGCCCCCAGAGAAAGGCCAGGGTCGCTGCACAGAGCATCAGGAt > 1:307902‑M2/5‑148 (MQ=255) aagCTGTCGGAGGTTTTCGCCCACGATGCTGGCCAGGTTCAGGTGCTCGATGGCCTTGGCCGACAGTGCATTCTGTCGGGCGGCGGCTTTCTGGGTGACGTGCAGCCCCCAGAGAAAGGCCAGGGTCGCTGCACAGAGCATCAGGATaa < 1:269915‑M2/146‑1 (MQ=255) gCTGTCGGAGGTTTTCGCCCACGATGCTGGCCAGGTTCAGGTGCTCGATGGCCTTGGCCGACAGTGCATTCTGTCGGGCGGCGGCTTTCTGGGTGACGTGCAGCCCCCAGAGAAAGGCCAGGGTCGCTGCACAGAGCATCAGGATAAg > 5:43413‑M2/2‑148 (MQ=255) cTGTCGGAGGTTTTCGCCCACGATGCTGGCCAGGTTCAGGTGCTCGATGGCCTTGGCCGACAGTGCATTCTGTCGGGCGGCGGCTTTCTGGGTGACGTGCAGCCCCCAGAGAAAGGCCAGGGTCGCTGCACAGAGCATCAGGATAAGCa < 1:208763/149‑1 (MQ=255) | CTGGCCGCTAGCAGCCGGCCTTGTCGGTCGTACAGGCTCAAGCGCTTGAACACAGGGTCTGCTGCCAGGCTGAGGTTGCCTTGGCGCCGCGCTTTCATGTCGTCCTGGGTCACACGACCCACCGCCTGGGCGCGGTCGACAAGCTGTCGGAGGTTTTCGCCCACGATGCTGGCCAGGTTCAGGTGCTCGATGGCCTTGGCCGACAGTGCATTCTGTCGGGCGGCGGCTTTCTGGGTGACGTGCAGCCCCCAGAGAAAGGCCAGGGTCGCTGCACAGAGCATCAGGATAAGCA > NC_002947/3608836‑3609127 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |