New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4956751 = | 64 (1.300) | 4 (0.080) | 4/248 | NT | 6.0% | coding (4/1374 nt) coding (767/792 nt) |
fliI fliH |
flagellum‑specific ATP synthase flagellar assembly protein FliH |
? | NC_002947 | 4956805 = | 63 (1.320) | coding (713/792 nt) | fliH | flagellar assembly protein FliH |
GATGGGCTGGGCCGGCAGCTCGATGGCCTCAGCGTAAGTGCCCAGACGCTTGCCGAAGCTGGTGCGTTCAAGGCGCATCTGGGCTGTCCACGGCACGCTCGGCCGGCGCGTCCAGGTCTATCGACATGTCTGGCGCCGCCGGGTGCAGGGAATGATCGTGCAACTGGTCGAACAGCTGCGTCACCGCTTTTTCGATACGCGTTTCCATGGTGGCATCGATACGGCTGTGGGCCGTCTCGATGCGGCAACCACCCGGTAGCAGCGTGCTGTCTTCCAGCAGCCGCCAGTTCTCCT > NC_002947/4956659‑4956952 | gaTGGGCTGGGCCGGCAGCTCGATGGCCTCAGCGTAAGTGCCCAGACGCTTGCCGAAGCTGGTGCGTTCAAGGCGCATCTGGGCTGTCCACGGCACGCTCGGCCGGCGCGTCCAGGTCTATCGACATGTCTGGCGCCGCCGGGTGCAgg > 4:252288/1‑149 (MQ=255) agacggcccacagccgtatcgatgccaccatggaaacgcgtatcgaaaaagcggtgacgcagctgttcgaccagttgcacgatcattccctGCACGCTCGGCCGGCGCGTCCAGGTCTATCGACATGTCTGGCGCCGCCGGGTGCAgg < 4:233605‑M1/57‑1 (MQ=255) gacggcccacagccgtatcgatgccaccatggaaacgcgtatcgaaaaagcggtgacgcagctgttcgaccagttgcacgatcattccctGCACGCTCGGCCGGCGCGTCCAGGTCTATCGACATGTCTGGCGCCGCCGGGTGCAGGGa > 3:233605‑M1/91‑149 (MQ=255) acggcccacagccgtatcgatgccaccatggaaacgcgtatcgaaaaagcggtgacgcagctgttcgaccagttgcacgatcattccctGCACGCTCGGCCGGCGCGTCCAGGTCTATCGACATGTCTGGCGCCGCCGGGTGCAGGGaa > 1:227334‑M1/90‑149 (MQ=255) ggctgggcCGGCAGCTCGATGGCCTCAGCGTAAGTGCCCAGACGCTTGCCGAAGCTGGTGCGTTCAAGGCGCATCTGGGCTGTCCACGGCACGCTCGGCCGGCGCGTCCAGGTCTATCGACATGTCTGGCGCCGCCGGGTGCAGGGaa < 2:109590/148‑1 (MQ=255) ggctgggcCGGCAGCTCGATGGCCTCAGCGTAAGTGCCCAGACGCTTGCCGAAGCTGGTGCGTTCAAGGCGCATCTGGGCTGTCCACGGCACGCTCGGCCGGCGCGTCCAGGTCTATCGACATGTCTGGCGCCGCCGGGTGCAGGGaa < 1:54753/148‑1 (MQ=255) gctgggcCGGCAGCTCGATGGCCTCAGCGTAAGTGCCCAGACGCTTGCCGAAGCTGGTGCGTTCAAGGCGCATCTGGGCTGTCCACGGCACGCTCGGCCGGCGCGTCCAGGTCTATCGACATGTCTGGCGCCGCCGGGTGCAGGGAAt > 7:271832/1‑148 (MQ=255) gctgggcCGGCAGCTCGATGGCCTCAGCGTAAGTGCCCAGACGCTTGCCGAAGCTGGTGCGTTCAAGGCGCATCTGGGCTGTCCACGGCACGCTCGGCCGGCGCGTCCAGGTCTATCGACATGTCTGGCGCCGCCGGGTGCAGGGAATg < 3:53698/149‑1 (MQ=255) ggcCGGCAGCTCGATGGCCTCAGCGTAAGTGCCCAGACGCTTGCCGAAGCTGGTGCGTTCAAGGCGCATCTGGGCTGTCCACGGCACGCTCGGCCGGCGCGTCCAGGTCTATCGACATGTCTGGCGCCGCCGGGTGCAGGGAATGATCg < 7:168976/149‑1 (MQ=255) gcCGGCAGCTCGATGGCCTCAGCGTAAGTGCCCAGACGCTTGCCGAAGCTGGTGCGTTCAAGGCGCATCTGGGCTGTCCACGGCACGCTCGGCCGGCGCGTCCAGGTCTATCGACATGTCTGGCGCCGCCGGGTGCAGGGAATGATCGt < 3:202239/149‑1 (MQ=255) gcCGGCAGCTCGATGGCCTCAGCGTAAGTGCCCAGACGCTTGCCGAAGCTGGTGCGTTCAAGGCGCATCTGGGCTGTCCACGGCACGCTCGGCCGGCGCGTCCAGGTCTATCGACATGTCTGGCGCCGCCGGGTGCAGGGAATGATCGt < 1:171439/149‑1 (MQ=255) ccGGCAGCTCGATGGCCTCAGCGTAAGTGCCCAGACGCTTGCCGAAGCTGGTGCGTTCAAGGCGCATCTGGGCTGTCCACGGCACGCTCGGCCGGCGCGTCCAGGTCTATCGACATGTCTGGCGCCGCCGGGTGCAGGGAATGATCGTg > 4:298932/1‑149 (MQ=255) gCAGCTCGATGGCCTCAGCGTAAGTGCCCAGACGCTTGCCGAAGCTGGTGCGTTCAAGGCGCATCTGGGCTGTCCACGGCACGCTCGGCCGGCGCGTCCAGGTCTATCGACATGTCTGGCGCCGCCGGGTGCAGGGAAGGATCGTGc > 2:153819/1‑147 (MQ=255) cAGCTCGATGGCCTCAGCGTAAGTGCCCAGACGCTTGCCGAAGCTGGTGCGTTCAAGGCGCATCTGGGCTGTCCACGGCACGCTCGGCCGGCGCGTCCAGGTCTATCGACATGTCTGGCGCCGCCGGGTGCAGGGAATGATCGTGCAAc < 3:252288/149‑1 (MQ=255) cAGCTCGATGGCCTCAGCGTAAGTGCCCAGACGCTTGCCGAAGCTGGTGCGTTCAAGGCGCATCTGGGCTGTCCACGGCACGCTCGGCCGGCGCGTCCAGGTCTATCGACATGTCTGGCGCCGCCGGGTGCAGGGAATGATCGTGCAAc < 8:54875/149‑1 (MQ=255) cTCGATGGCCTCAGCGTAAGTGCCCAGACGCTTGCCGAAGCTGGTGCGTTCAAGGCGCATCTGGGCTGTCCACGGCACGCTCGGCCGGCGCGTCCAGGTCTATCGACATGTCTGGCGCCGCCGGGTGCAGGGAATGATCGTGCAACTgg > 2:181478/1‑149 (MQ=255) cTCAGCGTAAGTGCCCAGACGCTTGCCGAAGCTGGTGCGTTCAAGGCGCATCTGGGCTGTCCACGGCACGCTCGGCCGGCGCGTCCAGGTCTATCGACATGTCTGGCGCCGCCGGGTGCAGGGAATGATCGTGCAACTGGTCGaa < 8:167771/145‑1 (MQ=255) cTCAGCGTAAGTGCCCAGACGCTTGCCGAAGCTGGTGCGTTCAAGGCGCATCTGGGCTGTCCACGGCACGCTCGGCCGGCGCGTCCAGGTCTATCGACATGTCTGGCGCCGCCGGGTGCAGGGAATGATCGTGCAACTGGTCGaa > 7:167771/1‑145 (MQ=255) cTCAGCGTAAGTGCCCAGACGCTTGCCGAAGCTGGTGCGTTCAAGGCGCATCTGGGCTGTCCACGGCACGCTCGGCCGGCGCGTCCAGGTCTATCGACATGTCTGGCGCCGCCGGGTGCAGGGAATGATCGTGCAACTGGTCGAACAGc > 3:302292/1‑149 (MQ=255) cTCAGCGTAAGTGCCCAGACGCTTGCCGAAGCTGGTGCGTTCAAGGCGCATCTGGGCTGTCCACGGCACGCTCGGCCGGCGCGTCCAGGTCTATCGACATGTCTGGCGCCGCCGGGTGCAGGGAATGATCGTGCAACTGGTCGAACAGc > 4:178072/1‑149 (MQ=255) tCAGCGTAAGTGCCCAGACGCTTGCCGAAGCTGGTGCGTTCAAGGCGCATCTGGGCTGTCCACGGCACGCTCGGCCGGCGCGTCCAGGTCTATCGACATGTCTGGCGCCGCCGGGTGCAGGGAATGATCGTGCAACTGGTCGAACAGCt > 5:31524/1‑149 (MQ=255) aGCGTAAGTGCCCAGACGCTTGCCGAAGCTGGTGCGTTCAAGGCGCATCTGGGCTGTCCACGGCACGCTCGGCCGGCGCGTCCAGGTCTATCGACATGTCTGGCGCCGCCGGGTGCAGGGAATGATCGTGCAACTGGTCGAACAGCTGc > 4:278423/1‑149 (MQ=255) cGTAAGTGCCCAGACGCTTGCCGAAGCTGGTGCGTTCAAGGCGCATCTGGGCTGTCCACGGCACGCTCGGCCGGCGCGTCCAGGTCTATCGACATGTCTGGCGCCGCCGGGTGCAGGGAATGATCGTGCAACTGGTCGAACAGCTGCGt > 5:226629/1‑149 (MQ=255) gTGCCCAGACGCTTGCCGAAGCTGGTGCGTTCAAGGCGCATCTGGGCTGTCCACGGCACGCTCGGCCGGCGCGTCCAGGTCTATCGACATGTCTGGCGCCGCCGGGTGCAGGGAATGATCGTGCAACTGGTCGAACAGCTGCGTCACCg > 8:284627/1‑149 (MQ=255) ccAGACGCTTGCCGAAGCTGGTGCGTTCAAGGCGCATCTGGGCTGTCCACGGCACGCTCGGCCGGCGCGTCCAGGTCTATCGACATGTCTGGCGCCGCCGGGTGCAGGGAATGATCGTGCAACTGGTCGAACAGCTGCGTCACCGCttt > 5:138764/1‑149 (MQ=255) ccAGACGCTTGCCGAAGCTGGTGCGTTCAAGGCGCATCTGGGCTGTCCACGGCACGCTCGGCCGGCGCGTCCAGGTCTATCGACATGTCTGGCGCCGCCGGGTGCAGGGAATGATCGTGCAACTGGTCGAACAGCTGCGTCACCGCttt > 2:257352/1‑149 (MQ=255) ccAGACGCTTGCCGAAGCTGGTGCGTTCAAGGCGCATCTGGGCTGTCCACGGCACGCTCGGCCGGCGCGTCCAGGTCTATCGACATGTCTGGCGCCGCCGGGTGCAGGGAATGATCGTGCAACTGGTCGAACAGCTGCGTCACCGCttt > 7:189664/1‑149 (MQ=255) ccAGACGCTTGCCGAAGCTGGTGCGTTCAAGGCGCATCTGGGCTGTCCACGGCACGCTCGGCCGGCGCGTCCAGGTCTATCGACATGTCTGGCGCCGCCGGGTGCAGGGAATGATCGTGCAACTGGTCGAACAGCTGCGTCACCGCttt > 4:293693/1‑149 (MQ=255) cAGACGCTTGCCGAAGCTGGTGCGTTCAAGGCGCATCTGGGCTGTCCACGGCACGCTCGGCCGGCGCGTCGAGGTCTATCGACATGTCTGGCGCCGCCGGGTGCAGGGCATGATCGTGCAACTGGTCGAACAGCTGCGTCACGGCtgtt > 8:126627/1‑149 (MQ=255) gCTTGCCGAAGCTGGTGCGTTCAAGGCGCATCTGGGCTGTCCACGGCACGCTCGGCCGGCGCGTCCAGGTCTATCGACATGTCTGGCGCCGCCGGGTGCAGGGAATGATCGTGCAACTGGTCGAACAGCTGCGTCACCGCTTTTTCGa > 4:36172/1‑148 (MQ=255) gCTTGCCGAAGCTGGTGCGTTCAAGGCGCATCTGGGCTGTCCACGGCACGCTCGGCCGGCGCGTCCAGGTCTATCGACATGTCTGGCGCCGCCGGGTGCAGGGAATGATCGTGCAACTGGTCGAACAGCTGCGTCACCGCTTTTTCGAt < 4:302292/149‑1 (MQ=255) gCTTGCCGAAGCTGGTGCGTTCAAGGCGCATCTGGGCTGTCCACGGCACGCTCGGCCGGCGCGTCCAGGTCTATCGACATGTCTGGCGCCGCCGGGTGCAGGGAATGATCGTGCAACTGGTCGAACAGCTGCGTCACCGCTTTTTCGAt < 8:189664/149‑1 (MQ=255) ttGCCGAAGCTGGTGCGTTCAAGGCGCATCTGGGCTGTCCACGGCACGCTCGGCCGGCGCGTCCAGGTCTATCGACATGTCTGGCGCCGCCGGGTGCAGGGAATGATCGTGCAACTGGTCGAACAGCTGCGTCACCGCTTTTTCGATAc > 5:79567/1‑149 (MQ=255) gCCGAAGCTGGTGCGTTCAAGGCGCATCTGGGCTGTCCACGGCACGCTCGGCCGGCGCGTCCAGGTCTATCGACATGTCTGGCGCCGCCGGGTGCAGGGAATGATCGTGCAACTGGTCGAACAGCTGCGTCACCGCTTTTTCGATAc < 8:271832/147‑1 (MQ=255) ccGAAGCTGGTGCGTTCAAGGCGCATCTGGGCTGTCCACGGCACGCTCGGCCGGCGCGTCCAGGTCTATCGACATGTCTGGCGCCGCCGGGTGCAGGGa < 1:141279/99‑1 (MQ=255) ccGAAGCTGGTGCGTTCAAGGCGCATCTGGGCTGTCCACGGCACGCTCGGCCGGCGCGTCCAGGTCTATCGACATGTCTGGCGCCGCCGGGTGCAGGGa > 2:141279/1‑99 (MQ=255) cGAAGCTGGTGCGTTCAAGGCGCATCTGGGCTGTCCACGGCACGCTCGGCCGGCGCGTCCAGGTCTATCGACATGTCTGGCGCCGCCGGGTGCAGGGAATGATCGTGCAACTGGTCGAACAGCTGCGTCACCGCTTTTTCGATACGCGt > 8:94176/1‑149 (MQ=255) cGAAGCTGGTGCGTTCAAGGCGCATCTGGGCTGTCCACGGCACGCTCGGCCGGCGCGTCCAGGTCTATCGACATGTCTGGCGCCGCCGGGTGCAGGGAATGATCGTGCAACTGGTCGAACAGCTGCGTCACCGCTTTTTCGATACGCGt > 7:102430/1‑149 (MQ=255) gAAGCTGGTGCGTTCAAGGCGCATCTGGGCTGTCCACGGCACGCTCGGCCGGCGCGTCCAGGTCTATCGACATGTCTGGCGCCGCCGGGTGCAGGGAATGATCGTGCAACTGGTCGAACAGCTGCGTCACCGCTTTTTCGATACGCGtt < 6:226629/149‑1 (MQ=255) tGGTGCGTTCAAGGCGCATCTGGGCTGTCCACGGCACGCTCGGCCGGCGCGTCCAGGTCTATCGACATGTCTGGCGCCGCCGGGTGCAGGGAATGATCGTGCAACTGGTCGAAc > 4:153328/1‑114 (MQ=255) tGGTGCGTTCAAGGCGCATCTGGGCTGTCCACGGCACGCTCGGCCGGCGCGTCCAGGTCTATCGACATGTCTGGCGCCGCCGGGTGCAGGGAATGATCGTGCAACTGGTCGAAc < 3:153328/114‑1 (MQ=255) gTGCGTTCAAGGCGCATCTGGGCTGTCCACGGCACGCTCGGCCGGCGCGTCCAGGTCTATCGACATGTCTGGCGCCGCCGGGTGCAGGGAATGATCGTGCAACTGGTCGAACAGCTGCGTCACCGCTTTTTCGATACGCGTTTCCAtg < 6:31524/148‑1 (MQ=255) cGTTCAAGGCGCATCTGGGCTGTCCACGGCACGCTCGGCCGGCGCGTCCAGGTCTATCGACATGTCTGGCGCCGCCGGGTGCAGGGAATGATCGTGCAACTGGTCGAACAGCTGCGTCACCGCTTTTTCGATACGCGTTTCCAtggtg < 7:94176/148‑1 (MQ=255) cAAGGCGCATCTGGGCTGTCCACGGCACGCTCGGCCGGCGCGTCCAGGTCTATCGACATGTCTGGCGCCGCCGGGTGCAGGGAATGATCGTGCAACTGGTCGAACAGCTGCGTCACCGCTTTTTCGATACGCGTTTCCATGGTGGCAt < 3:278423/148‑1 (MQ=255) cAAGGCGCATCTGGGCTGTCCACGGCACGCTCGGCCGGCGCGTCCAGGTCTATCGACATGTCTGGCGCCGCCGGGTGCAGGGAATGATCGTGCAACTGGTCGAACAGCTGCGTCACCGCTTTTTCGATACGCGTTTCCATGGTGGCAt < 1:257352/148‑1 (MQ=255) gcgcATCTGGGCTGTCCACGGCACGCTCGGCCGGCGCGTCCAGGTCTATCGACATGTCTGGCGCCGCCGGGTGCAGGGAATGATCGTGCAACTGGTCGAACAGCTGCGTCACCGCTTTTTCGATACGCGTTTCCATGGTGGCATCGATa > 2:49673/1‑149 (MQ=255) gcATCTGGGCTGTCCACGGCACGCTCGGCCGGCGCGTCCAGGTCTATCGACATGTCTGGCGCCGCCGGGTGCAGGGAATGATCGTGCAATTGGTCGAACAGCTGCGTCACCGCTTTTTCGATACGCGTTTCCATGGTGGCATCGATACg > 6:110273/1‑149 (MQ=255) cATGTGGGCTGTCCACGGCACGCTCGGCCGGCGCGTCCAGGTCTATCGTCATGTCTGGCGCCGCCGGGTGCAGGGAATGATCGTGCAACTGGTCGAACAGCTGCGTCACCGCTTTTTCGATACGCGTTTCCATGGTGGCATCGATACgg < 5:326071/149‑1 (MQ=255) aTCTGGGCTGTCCACGGCACGCTCGGCCGGCGCGTCCAGGTCTATCGACATGTCTGGCGCCGCCGGGTGCAGGGAATGATCGTGCAACTGGTCGAACAGCTGCGTCACCGCTTTTTCGATACGCGTTTCCATGGTGGCATCGATACGGc > 4:34832/1‑149 (MQ=255) tGTCCACGGCACGCTCGGCCGGCGCGTCCAGGTCTATCGACATGTCTGGCGCCGCCGGGTGCAGGGAATGATCGTGCAACTGGTCGAACAGCTGCGTCACCGCTTTTTCGATACGCGTTTCCATGGTGGCATCGATACGGCTGTGGGcc > 5:142886/1‑149 (MQ=255) ttccctgcacccggcggcgccagacatgtcgatagacctggacgcgccggccgagcgtgcAGGGAATGATCGTGCAACTGGTCGAACAGCTGCGTCACCGCTTTTTCGATACGCGTTTCCATGGTGGCATCGATACGGCTGTGGGCCGt > 1:227334‑M2/61‑149 (MQ=255) tccctgcacccggcggcgccagacatgtcgatagacctggacgcgccggccgagcgtgcAGGGAATGATCGTGCAACTGGTCGAACAGCTGCGTCACCGCTTTTTCGATACGCGTTTCCATGGTGGCATCGATACGGCTGTGGGCCGtc > 3:233605‑M2/60‑149 (MQ=255) ccACGGCACGCTCGGCCGGCGCGACCAGGTCTAAAGACATGTCTGGCGCCGCCGGGGGCAGGGAATGATCGTGCAACTGGTCGAACACCTGCGTCACCGCTGTTTCGATACACGATTCCATGGTGGCATCGATACGGCGGTGGGCCGtc > 1:278265/1‑149 (MQ=255) cACGGCACGCTCGGCCGGCGCGTCCAGGTCTATCGACATGTCTGGCGCCGCCGGGTGCAGGGAATGATCGTGCAACTGGTCGAACAGCTGCGTCACCGCTTTTTCGATACGCGTTTCCATGGTGGCATCGATACGGCTGTGGGCCGtct > 1:152417/1‑149 (MQ=255) cACGGCACGCTCGGCCGGCGCGTCCAGGTCTATCGACATGTCTGGCGCCGCCGGGTGCAGGGAATGATCGTGCAACTGGTCGAACAGCTGCGTCACCGCTTTTTCGAAACGCGTTTCCATGGTGGCATCGATACGGCTGTGGGCCGtct > 6:320439/1‑149 (MQ=255) cctgcacccggcggcgccagacatgtcgatagacctggacgcgccggccgagcgtgcAGGGAATGATCGTGCAACTGGTCGAACAGCTGCGTCACCGCTTTTTCGATACGCGTTTCCATGGTGGCATCGATACGGCTGTGGGCCGtct < 4:233605‑M2/91‑1 (MQ=255) CACGCTCGGCCGGCGCGTCCAGGTCTATCGACATGTCTGGCGCCGCCGGGTGCAGGGAATGATCGTGCAACTGGTCGAACAGCTGCGTCACCGCTTTTTCGATACGCGTTTCCATGGTGGCATCGATACGGCTGTGGGCCGTCTCGATg > 7:36600‑M1/1‑149 (MQ=255) ACGCTCGGCCGGCGCGTCCAGGTCTATCGACATGTCTGGCGCCGCCGGGTGCAGGGAATGATCGTGCAACTGGTCGAACAGCTGCGTCACCGCTTTTTCGATACGCGTTTCCATGGTGGCATCGATACGGCTGTGGGCCGTCTCGATGc > 3:298932‑M1/1‑149 (MQ=255) ggcGCGTCCAGGTCTATCGACATGTCTGGCGCCGCCGGGGGCAGGGAATGATCGTGCAACTGGTCGAACAGCTGCGTCACCGCTTTTTCGATACGCGTTTCCATGGTGGCATCGATACGGCTGTGGGCCGTCTCGATGCGGCAaccacc < 7:126627/149‑1 (MQ=255) gcgcGTCCAGGTCTATCGACATGTCTGGCGCCGCCGGGTGCAGGGAATGATCGTGCAACTGGTCGAACAGCTGCGTCACCGCTTTTTCGATACGCGTTTCCATGGTGGCATCGATACGGCTGTGGGCCGTCTCGATGCGGCAACCAccc < 5:156673/149‑1 (MQ=255) cgcgTCCAGGTCTATCGACATGTCTGGCGCCGCCGGGTGCAGGGAATGATCGTGCAACTGGTCGAACAGCTGCGTCACCGCTTTTTCGATACGCGTTTCCATGGTGGCATCGATACGGCTGTGGGCCGTCTCGATGCGGCAACCACCCg > 3:140575/1‑149 (MQ=255) cgcgTCCAGGTCTATCGACATGTCTGGCGCCGCCGGGTGCAGGGAATGATCGTGCAACTGGTCGAACAGCTGCGTCACCGCTTTTTCGATACGCGTTTCCATGGTGGCATCGATACGGCTGTGGGCCGTCTCGATGCGGCAACCACCCg < 1:181478/149‑1 (MQ=255) gcgTCCAGGTCTATCGACATGTCTGGCGCCGCCGGGTGCAGGGAATGATCGTGCAACTGGTCGAACAGCTGCGTCACCGCTTTTTCGATACGCGTTTCCATGGTGGCATCGATACGGCTGTGGGCCGTCTCGATGCGGCAACCACCCgg < 6:138764/149‑1 (MQ=255) gTCCAGGTCTATCGACATGTCTGGCGCCGCCGGGTGCAGGGAATGATCGTGCAACTGGTCGAACAGCTGCGTCACCGCTTTTTCGATACGCGTTTCCATGGTGGCATCGATACGGCTGTGGGCCGTCTCGATGCGGCAACCACCCGGTa < 6:142886/149‑1 (MQ=255) tCCAGGTCTATCGACATGTCTGGCGCCGCCGGGTGCAGGGAATGATCGTGCAACTGGTCGAACAGCTGCGTCACCGCTTTTTCGATACGCGTTTCCATGGTGGCATCGATACGGCTGTGGGCCGTCTCGATGCGGCAACCACCCGGTag > 4:144459/1‑149 (MQ=255) ccAGGTCTATCGACATGTCTGGCGCCGCCGGGTGCAGGGAATGATCGTGCAACTGGTCGAACAGCTGCGTCACCGCTTTTTCGATACGCGTTTCCATGGTGGCATCGATACGGCTGTTGGCCGTCTCGCTGCGGCAACCACCCGGGagc > 2:15483/1‑149 (MQ=255) cAGGTCTATCGACATGTCTGGCGCCGCCGGGTGCAGGGAATGATCGTGCAACTGGTCGAACAGCTGCGTCACCGCTTTTTCGATACGCGTTTCCATGGTGGCATCGATACGGCTGTGGGCCGTCTCGATGCGGCAACCACCCGGTagca < 3:36172/149‑1 (MQ=255) ggTCTATCGACATGTCTGGCGCCGCCGGGTGCAGGGAATGATCGTGCAACTGGTCGAACAGCTGCGTCACCGCTTTTTCGATACGCGTTTCCATGGTGGCATCGATACGGCTGTGGGCCGTCTCGATGCGGCAACCACCCGGTagcagc > 1:124894/1‑149 (MQ=255) tCGACATGTCTGGCGCCGCCGTGTGCAGGGAATGATCGAGCAACTGGTCGAACAGCTGCGTCACCGCTTTTTCGATACGCGTTTCCATGGTGGCATCGATACGGCTGTGGGCCGTCTCGATGCGGCAACCACCCGGTAGCAGCGTGCTg < 6:267099/149‑1 (MQ=255) tCGACATGTCTGGCGCCGCCGGGTGCAGGGACTGATCGTGCAACTGGTCGAACAGCTGCGTCACCGCTTTTTCGATACGCGTTTCCATGGTGGCATCGATACGGCTGTGGGCCGTCTCGATGCGGCAACCACCCGGTAGCAGCGTg < 1:15483/146‑1 (MQ=255) cctggacgcgccggccgagcgtgcAGGGAATGATCGTGCAACTGGTCGAACAGCTGCGTCACCGCTTTTTCGATACGCGTTTCCATGGTGGCATCGATACGGCTGTGGGCCGTCTCGATGCGGCAACCACCCGGTAGCAGCGTGCTGTc < 2:227334‑M2/125‑1 (MQ=255) aCATGTCTGGCGCCGCCGGGTGCAGGGAATGATCGTGCAACTGGTCGAACAGCTGCGTCACCGCTTTTTCGATACGCGTTTCCATGGTGGCATCGATACGGCTGTGGGCCGTCTCGATGCGGCAACCACCCGGTAGCAGCGTGCTGTcg > 3:41800/1‑148 (MQ=255) aCATGTCTGGCGCCGCCGGGTGCAGGGAATGATCGTGCAACTGGTCGAACAGCTGCGTCACCGCTTTTTCGATACGCGTTTCCATGGTGGCATCGATACGGCTGTGGGCCGTCTCGATGCGGCAACCACCCGGTAGCAGCGTGCTGTCt > 8:60052/1‑149 (MQ=255) aTGTCTGGCGCCGCCGGGTGCAGGGAATGATCGTGCAACTGGTCGAACAGCTGCGTCACCGCTTTTTCGATACGCGTTTCCATGGTGGCATCGATACGGCTGTGGGCCGTCTCGATGCGGCAACCACCCGGTAGCAGCGTGCTGTCTTc < 3:34832/149‑1 (MQ=255) tCTGGCGCCGCCGGGTGCAGGGAATGATCGTGCAATTGGTCGAACAGCTGCGTCACCGCTTTTTCGATACGCGTTTCCATGGTGGCATCGATACGGCTGTGGGCCGTCTCGATGCGGCAACCACCCGGTAGCAGCGTGCTGTCTTCca < 5:110273/148‑1 (MQ=255) gccgGGTGCAGGGAATGATCGTGCAACTGGTCGAACAGCTGCGTCACCGCTTTTTCGATACGCGTTTCCATGGTGGCATCGATACGGCTGTGGGCCGTCTCGATGCGGCAACCACCCGGTAGCAGCGTGCTGTCTTCCAGCAGCCGCCa < 7:284627/149‑1 (MQ=255) gccgGGTGCAGGGAATGATCGTGCAACTGGTCGAACAGCTGCGTCACCGCTTTTTCGATACGCGTTTCCATGGTGGCATCGATACGGCTGTGGGCCGTCTCGATGCGGCAACCACCCGGTAGCAGCGTGCTGTCTTCCAGCAGCCGCCa < 6:79567/149‑1 (MQ=255) tgcAGGGAATGATCGTGCAACTGGTCGAACAGCTGCGTCACCGCTTTTTCGATACGCGTTTCCATGGTGGCATCGATACGGCTGTGGGCCGTCTCGATGCGGCAACCACCCGGTAGCAGCGTGCTGTCTTCCAGCAGCCGCCAGTtctc < 5:320439‑M2/146‑1 (MQ=255) cAGGGAATGATCGTGCAACTGGTCGAACAGCTGCGTCACCGCTTTTTCGATACGCGTTTCCATGGTGGCATCGATACGGCTGTGGGCCGTCTCGATGCGGCAACCACCCGGTAGCAGCGTGCTGTCTTCCAGCAGCCGCCAGTTctcct < 7:60052‑M2/148‑1 (MQ=255) | GATGGGCTGGGCCGGCAGCTCGATGGCCTCAGCGTAAGTGCCCAGACGCTTGCCGAAGCTGGTGCGTTCAAGGCGCATCTGGGCTGTCCACGGCACGCTCGGCCGGCGCGTCCAGGTCTATCGACATGTCTGGCGCCGCCGGGTGCAGGGAATGATCGTGCAACTGGTCGAACAGCTGCGTCACCGCTTTTTCGATACGCGTTTCCATGGTGGCATCGATACGGCTGTGGGCCGTCTCGATGCGGCAACCACCCGGTAGCAGCGTGCTGTCTTCCAGCAGCCGCCAGTTCTCCT > NC_002947/4956659‑4956952 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |