New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5174206 = | 54 (1.090) | 3 (0.060) | 3/244 | NT | 5.9% | coding (774/1689 nt) | fadD‑II | long‑chain‑fatty acid‑‑CoA ligase |
? | NC_002947 | 5174263 = | 45 (0.960) | coding (717/1689 nt) | fadD‑II | long‑chain‑fatty acid‑‑CoA ligase |
ATTATGGTTGCCGGTGACCATCATGCACATGCAGTTCGCGGTGAAGGCATAGATGTGGTACAGCGGCAGCGGCGCAATCATCACTTCCTGGCCGTCCTTCAGCAGCTTCTGCCCATCGGGGCCGTGCTGCGAGAAGCAGGCCAGCACTTGCAGCATGTTGGCCACCAGGTTGCCATGGGTGAGCATGGCGCCCTTGGCCAGGCCGGTGGTGCCGCCGGTGTACTGCAGCACCGCGATGTCATCGAGGTTCAGCGACACCGGTTTGGGCGACAGCCCGCGGCCCTCGCGCA > NC_002947/5174119‑5174408 | aTTATGGTTGCCGGTGACCATCATGCACATGCAGTTCGCGGTGAAGGCATAGATGTGGTACAGCGGCAGCGGCGCAATCATCACTTGCTGGCCGTCCTTCAGCAGCTTCTGCCCATCGGGGCCGTGCTGCGAGAAGCAGGCCAGCACtt > 1:310695/1‑149 (MQ=255) ctgcagtacaccggcggcaccaccggcctggccaagggcgccatgctcacccatggcaacctggtggccaacatgctgcaagtgCTGGCCGTCCTTCAGCAGCTTCTGCCCATCGGGGCCGTGCTGCGAGAAGCAGGCCAGCACTTgca > 1:179557‑M1/85‑149 (MQ=255) aTGGTTGCCGGTGACCATCATGCACATGCAGTTCGCGGTGAAGGCATAGATGTGGTACAGCGGCAGCGGCGCAATCATCACTTCCTGGCCGTCCTTCAGCAGCTTCTGCCCATCGGGGCCGTGCTGCGAGAAGCAGGCCAGCACTTgc < 2:305865/148‑1 (MQ=255) cGGTGACCATCATGCACCTGCAGTTCGCGGTGAAGGCATAGATGTGGTACAGCGGCAGCGGCGCAATCATCACTTCCTGGCCGTCCTTCAGCAGCTTCTGCCCATCGGGGCCGTGCTGCGAGAAGCAGGCCAGCACTTGCAGCATGTTg < 4:189407/149‑1 (MQ=255) catcatGCACATGCAGTTCGCGGTGAAGGCATAGATGTGGTACAGCGGCAGCGGCGCAATCATCACTTCCTGGCCGTCCTTCAGCAGCTTCTGCCCATCGGGGCCGTCCTGCGAGAAGCAGGCCAGCACTTGCAGCATGTTGGccac > 5:272323/1‑147 (MQ=255) tgcacatgcaGTTCGCGGTGAAGGCATAGATGTGGTACAGCGGCAGCGGCGCAATCATCACTTCCTGGCCGTCCTTCAGCAGCTTCTGCCCATCGGGGCCGTGCTGCGAGAAGCAGGCCAGCACTTGCAGCATGTTGGCCACCAGGTTg < 4:189159/149‑1 (MQ=255) tgcaGTTCGCGGTGAAGGCATAGATGTGGTACAGCGGCAGCGGCGCAATCATCACTTCCTGGCCGTCCTTCAGCAGCTTCTGCCCATCGGGGCCGTGCTGCGAGAAGCAGGCCAGCACTTGCAGCATGTTGGCCACCAGGTTGCCATgg < 2:162216/149‑1 (MQ=255) gcaGTTCGCGGTGAAGGCATAGATGTGGTACAGCGGCAGCGGCGCAATCATCACTTCCTGGCCGTCCTTCAGCAGCTTCTGCCCATCGGGGCCGTGCTGCGAGAAGCAGGCCAGCACTTGCAGCATGTTGGCCACCAGGTTGCCATggg > 1:85837/1‑149 (MQ=255) gTTCGCGGTGAAGGCATAGATGTGGTACAGCGGCAGCGGCGCAATCATCACTTCCTGGCCGTCCTTCAGCAGCTTCTGCCCATCGGGGCCGTGCTGCGAGAAGCAGGCCAGCACTTGCAGCATGTTGGCCACCAGGTTGCCATGGGt > 7:23525/1‑147 (MQ=255) gTTCGCGGTGAAGGCATAGATGTGGTACAGCGGCAGCGGCGCAATCATCACTTCCTGGCCGTCCTTCAGCAGCTTCTGCCCATCGGGGCCGTGCTGCGAGAAGCAGGCCAGCACTTGCAGCATGTTGGCCACCAGGTTGCCATGGGTGa > 7:239373/1‑149 (MQ=255) cgGTGAAGGCATAGATGTGGTACAGCGGCAGCGGCGCAATCATCACTTCCTGGCCGTCCTTCAGCAGCTTCTGCCCATCGGGGCCGTGCTGCGAGAAGCAGGCCAGCACTTGCAGCATGTTGGCCACCAGGTTGCCATGGGTGAGCATg < 1:130693/149‑1 (MQ=255) aaGGCATAGATGTGGTACAGCGGCAGCGGCGCAATCATCACTTCCTGGCCGTCCTTCAGCAGCTTCTGCCCATCGGGGCCGTGCTGCGAGAAGCAGGCCAGCACTTGCAGCATGTTGGCCACCAGGTTGCCATGGGTGAGCATGGCGcc < 1:125395/149‑1 (MQ=255) aaGGCATACATGTGGTACAGCGGCAGCGGCGCAATCATCACTTACTGCCCGTCCTTCAGCAGCTACTGCCCATCGGGGCAGTCCTGCGAGAAGCAGGCCAGCACTTGCAGCATGTTCGCCACCAGGTTGCCATGGGTGACCATGGCGcc > 6:102439/1‑149 (MQ=255) aTAGATGTGGTACAGCGGCAGCGGCGCAATCATCACTTCCTGGCCGTCCTTCAGCAGCTTCTGCCCATCGGGGCCGTGCTGCGAGAAGCAGGCCAGCACTTGCAGCATGTTGGc < 4:99294/114‑1 (MQ=255) aTAGATGTGGTACAGCGGCAGCGGCGCAATCATCACTTCCTGGCCGTCCTTCAGCAGCTTCTGCCCATCGGGGCCGTGCTGCGAGAAGCAGGCCAGCACTTGCAGCATGTTGGc > 3:99294/1‑114 (MQ=255) aTAGATGTGGTACAGCGGCAGCGGCGCAATCATCACTTCCTGGCCGTCCTTCAGCAGCTTCTGCCCATCGGGGCCGTGCTGCGAGAAGCAGGCCAGCACTTGCAGCATGTTGGCCACCAGGTTGCCATGGGTGAGCATGGCGCCCTTgg > 2:107818/1‑149 (MQ=255) aTAGATGTGGTACAGCGGCAGCGGCGCAATCATCACTTCCTGGCCGTCCTTCAGCAGCTTCTGCCCATCGGGGCCGTGCTGCGAGAAGCAGGCCAGCACTTGCAGCATGTTGGCCACCAGGTTGCCATGGGTGAGCATGGCGCCCTTgg > 6:240163/1‑149 (MQ=255) aTGTGGTACAGCGGCAGCGGCGCAATCATCACTTCCTGGCCGTCCTTCAGCAGCTTCTGCCCATCGGGGCCGTGCTGCGAGAAGCAGGCCAGCACTTGCAGCATGTTGGCCACCAGGTTGCCATGGGTGAGCATGGCGCCCTTGGCCAg > 7:26548/1‑149 (MQ=255) tgtgGTACAGCGGCAGCGGCGCAATCATCACTTCCTGGCCGTCCTTCAGCAGCTTCTGCCCATCGGGGCCGTGCTGCGAGAAGCAGGCCAGCACTTGCAGCATGTTGGCCACCAgg < 8:81073/116‑1 (MQ=255) tgtgGTACAGCGGCAGCGGCGCAATCATCACTTCCTGGCCGTCCTTCAGCAGCTTCTGCCCATCGGGGCCGTGCTGCGAGAAGCAGGCCAGCACTTGCAGCATGTTGGCCACCAgg > 7:81073/1‑116 (MQ=255) ggTACAGCGGCAGCGGCGCAATCATCACTTCCTGGCCGTCCTTCAGCAGCTTCTGCCCATCGGGGCCGTGCTGCGAGAAGCAGGCCAGCACTTGCAGCATGTTGGCCACCAGGTTGCCATGGGTGAGCATGGCGCCCTTGGCCAGGCCg > 7:62776/1‑149 (MQ=255) gTACAGCGGCAGCGGCGCAATCATCACTTCCTGGCCGTCCTTCAGCAGCTTCTGCCCATCGGGGCCGGGCTGCGAGAAGCAGGCCAGCACTTGCAGCATGTTGGCCACCAGGTTGCCATGGGTGAGCATGGCGCCCTTGGCCAGGCCgg < 5:240163/149‑1 (MQ=255) tACAGCGGCAGCGGCGCAATCATCACTTCCTGGCCGTCCTTCAGCAGCTTCTGCCCATCGGGGCCGTGCTGCGAGAAGCAGGCCAGCACTTGCAGCATGTTGGCCACCAGGTTGCCATGGGTGAGCATGGCGCCCTTGGCCAGGCCggt < 8:239373/149‑1 (MQ=255) tACAGCGGCAGCGGCGCAATCATCACTTCCTGGCCGTCCTTCAGCAGCTTCTGCCCATCGGGGCCGTGCTGCGAGAAGCAGGCCAGCACTTGCAGCATGTTGGCCACCAGGTTGCCATGGGTGAGCATGGCGCCCTTGGCCAGGCCggt < 7:85785/149‑1 (MQ=255) tACAGCGGCAGCGGCGCAATCATCACTTCCTGGCCGTCCTTCAGCAGCTTCTGCCCATCGGGGCCGTGCTGCGAGAAGCAGGCCAGCACTTGCAGCATGTTGGCCACCAGGTTGCCATGGGTGAGCATGGCGCCCTTGGCCAGGCCggt < 8:23525/149‑1 (MQ=255) tACAGCGGCAGCGGCGCAATCATCACTTCCTGGCCGTCCTTCAGCAGCTTCTGCCCATCGGGGCCGTGCTGCGAGAAGCAGGCCAGCACTTGCAGCATGTTGGCCACCAGGTTGCCATGGGTGAGCATGGCGCCCTTGGCCAGGCCggt < 8:26548/149‑1 (MQ=255) aCAGCGGCAGCGGCGCAATCATCACTTCCTGGCCGTCCTTCAGCAGCTTCTGCCCATCGGGGCCGTGCTGCGAGAAGCAGGCCAGCACTTGCAGCATGTTGGCCACCAGGTTGCCATGGGTGAGCATGGCGCCCTTGGCCAGGCCggtg > 3:171178/1‑149 (MQ=255) gcggcagcggcGCAATCATCACTTCCTGGCCGTCCTTCAGCAGCTTCTGCCCATCGGGGCCGTGCTGCGAGAAGCAGGCCAGCACTTGCAGCATGTTGGCCACCAGGTTGCCATGGGTGAGCATGGCGCCCTTGGCCAGGCCGgtggtg > 3:24581/1‑149 (MQ=255) gcggcgCAATCATCACTTCCTGGCCGTCCTTCAGCAGCTTCTGCCCATCGGGGCCGTGCTGCGAGAAGCAGGCCAGCACTTGCAGCATGTTGGCCACCAGGTTGCCATGGGTGAGCATGGCGCCCTTGGCCAGGCCGGTGGTGccgccg < 2:85837/149‑1 (MQ=255) ggcgCAATCATCACTTCCTGGCCGTCCTTCAGCAGCTTCTGCCCATCGGGGCCGTGCTGCGAGAAGCAGGCCAGCACTTGCAGCTTGTTGGCCACCAGGTTGCCATGGGTGAGCATGGCGCCCTTGGCCAGGCCGGTGGTGCCGCCGgt < 4:24581/149‑1 (MQ=255) tcatcaCTTCCTGGCCGTCCTTCAGCAGCTTCTGCCCATCGGGGCCGTGCTGCGAGAAGCAGGCCAGCACTTGCAGCATGTTGGCCACCAGGTTGCCATGGGTGAGCATGGCGCCCTTGGCCAGGCCGGTGGTGCCGCCGgt > 3:230607/1‑142 (MQ=255) tcatcaCTTCCTGGCCGTCCTTCAGCAGCTTCTGCCCATCGGGGCCGTGCTGCGAGAAGCAGGCCAGCACTTGCAGCATGTTGGCCACCAGGTTGCCATGGGTGAGCATGGCGCCCTTGGCCAGGCCGGTGGTGCCGCCGGTGTACTg > 7:133821/1‑148 (MQ=255) tcagcaCGTCCAGGCCGTCCTTCAGCCGCTTCTGCCCATCGGGGCCGTGCTGCGAGAAGCAGGCCAGCACTTGCAGCATGTTGGCCACCAGGTTGCCATGGGTGAGCATGGCGCCCTTGGCCAGGCCGGTGGTGCCGCCGgt < 4:230607/142‑1 (MQ=255) tgcaagtgctggcctgcttctcgcagcacggccccgatgggcagaagctgctgaaggacggccagCACTTGCAGCATGTTGGCCACCAGGTTGCCATGGGTGAGCATGGCGCCCTTGGCCAGGCCGGTGGTGCCGCCGGTGTACTgcag > 1:179557‑M2/66‑149 (MQ=255) aCTTCCTGGCCGTCCTTCAGCAGCTTCTGCCCATCGGGGCCGTGCTGCGAGAAGCAGGCCAGCACTTGCAGCATGTTGGCCACCAGGTTGCCATGGGTGAGCATGGCGCCCTTGGCCAGGCCGGTGGTGCCGCCGgt < 7:112415/137‑1 (MQ=255) aCTTCCTGGCCGTCCTTCAGCAGCTTCTGCCCATCGGGGCCGTGCTGCGAGAAGCAGGCCAGCACTTGCAGCATGTTGGCCACCAGGTTGCCATGGGTGAGCATGGCGCCCTTGGCCAGGCCGGTGGTGCCGCCGgt > 8:112415/1‑137 (MQ=255) gcctgcttctcgcagcacggccccgatgggcagaagctgctgaaggacggccagCACTTGCAGCATGTTGGCCACCAGGTTGCCATGGGTGAGCATGGCGCCCTTGGCCAGGCCGGTGGTGCCGCCGGTGTACTgca > 8:236310‑M2/55‑137 (MQ=255) gcctgcttctcgcagcacggccccgatgggcagaagctgctgaaggacggccagCACTTGCAGCATGTTGGCCACCAGGTTGCCATGGGTGAGCATGGCGCCCTTGGCCAGGCCGGTGGTGCCGCCGGTGTACTgca < 7:236310‑M2/83‑1 (MQ=255) GCCGTCCTTCAGCAGCTTCTGCCCATCGGGGCCGTGCTGCGAGAAGCAGGCCAGCACTTGCAGCATGTTGGCCACCAGGTTGCCATGGGTGAGCATGGCGCCCTTGGCCAGGCCGGTGGTGCCGCCGGTGTACTGCAGCACCGCGATGt < 5:206551‑M1/149‑1 (MQ=255) GCCGTCCTTCAGCAGCTTCTGCCCATCGGGGCCGTGCTGCGAGAAGCAGGCCAGCACTTGCAGCATGTTGGCCACCAGGTTGCCATGGGTGAGCATGGCGCCCTTGGCCAGGCCGGTGGTGCCGCCGGTGTACTGCAGCACCGCGATGt < 8:51618‑M1/149‑1 (MQ=255) gTCCTTCAGCAGCTTCTGCCCATCGGGGCCGTGCTGCGAGAAGCAGGCCAGCACTTGCAGCATGTTGGCCACCAGGTTGCCATGGGTGAGCATGGCGCCCTTGGCCAGGCCGGTGGTGCCGCCGGTGTACTGCAGCACCGCGATGTCAt < 1:107818/149‑1 (MQ=255) tCAGCAGCTTCTGCCCATCGGGGCCGTGCTGCGAGAAGCAGGCCAGCACTTGCAGCATGTTGGCCACCAGGTTGCCATGGGTGAGCATGGCGCCCTTGGCCAGGCCGGTGGTGCCGCCGGTGTACTGCAGCACCGCGATGTCATCGAgg > 7:151411/1‑149 (MQ=255) cagcagCTTCTGCCCATCGGGGCCGTGCTGCGAGAAGCAGGCCAGCACTTGCAGCATGTTGGCCACCAGGTTGCCATGGGTGAGCATGGCGCCCTTGGCCAGGCCGGTGGTGCCGCCGGTGTACTGCAGCACCGCGATGTCATCGAg < 8:62776/147‑1 (MQ=255) agcagcTTCTGCCCATCGGGGCCGTGCTGCGAGAAGCAGGCCAGCACTTGCAGCATGTTGGCCACCAGGTTGCCATGGGTGAGCATGGCGCCCTTGGCCAGGCCGGTGGTGCCGCCGGTGTACTGCAGCACCGCGATGTCATCGAGGtt > 2:274839/1‑149 (MQ=255) cTTCTGCCCATCGGGGCCGTGCTGCGAGAAGCAGGCCAGCACTTGCAGCATGTTGGCCACCAGGTTGCCATGGGTGAGCATGGCGCCCTTGGCCAGGCCGGTGGTGCCGCCGGTGTACTGCAGCACCGCGATGTCATCGAGGTTCAGc < 6:152968/148‑1 (MQ=255) cTTCTGCCCATCGGGGCCGTGCTGCGAGAAGCAGGCCAGCACTTGCAGCATGTTGGCCACCAGGTTGCCATGGGTGAGCATGGCGCCCTTGGCCAGGCCGGTGGTGCCGCCGGTGTACTGCAGCACCGCGATGTCATCGAGGTTCAGc > 5:152968/1‑148 (MQ=255) ttCTGCCCATCGGGGCCGTGCTGCGAGAAGCAGGCCAGCACTTGCAGCATGTTGGCCACCAGGTTGCCATGGGTGAGCATGGCGCCCTTGGCCAGGCCGGTGGTGCCGCCGGTGTACTGCAGCACCGCGATGTCATCGAGGTTCAGCGa > 1:80554/1‑149 (MQ=255) cccATCGGGGCCGTGCTGCGAGAAGCAGGCCAGCACTTGCAGCATGTTGGCCACCAGGTTGCCATGGGTGAGCATGGCGCCCTTGGCCAGGCCGGTGGTGCCGCCGGTGTACTGCAGCACCGCGATGTCATCGAGGTTCAGCGacac < 2:80554/147‑1 (MQ=255) tCGGGGCCGTGCTGCGAGAAGCAGGCCAGCACTTGCAGCATGTTGGCCACCAGGTTGCCATGGGTGAGCATGGCGCCCTTGGCCAGGCCGGTGGTGCCGCCGGTGTACTGCAGCACCGCGATGTCATCGAGGTTCAGCGACACCGGttt < 8:151411/149‑1 (MQ=255) tCGGGGCCGTGCTGCGAGAAGCAGGCCAGCACTTGCAGCATGTTGGCCACCAGGTTGCCATGGGTGAGCATGGCGCCCTTGGCCAGGCCGGTGGTGCCGCCGGTGTACTGCAGCACCGCGATGTCATCGAGGTTCAGCGACACCAGttt < 6:206551/149‑1 (MQ=255) tgctgcGAGAAGCAGGCCAGCACTTGCAGCATGTTGGCCACCAGGTTGCCATGGGTGAGCATGGCGCCCTTGGCCAGGCCGGTGGTGCCGCCGGTGTACTGCAGCACCGCGATGTCATCGAGGTTCAGCGACACCGGTTTGGGCGACAg < 4:171178/149‑1 (MQ=255) gctgcGAGAAGCAGGCCAGCACTTGCAGCATGTTGGCCACCAGGTTGCCATGGGTGAGCATGGCGCCCTTGGCCAGGCCGGTGGTGCCGCCGGTGTACTGCAGCACCGCGATGTCATCGAGGTTCAGCGACACCGGTTTGGGCGACAGc < 8:133821/149‑1 (MQ=255) gCAGGCCAGCACTTGCAGCATGTTGGTCACCAGGTTGCCATGGGTGAGCATGGCGCCCTTGGCCAGGCCGGTGGTGCCGCCGGTGTACTGCAGCACCGCGATGTCATCGAGGTTCAGCGACACCGGTTTGGGCGACAGCCCGCGGCCCt > 4:245973/1‑149 (MQ=255) gccagCACTTGCAGCATGTTGGCCACCAGGTTGCCATGGGTGAGCATGGCGCCCTTGGCCAGGCCGGTGGTGCCGCCGGTGTACTGCAGCACCGCGATGTCATCGAGGTTCAGCGACACCGGTTTGGGCGACAGCCCGCGGCCCTcgcg > 4:139916‑M2/6‑149 (MQ=255) ctgCACTTGCTGATTGTGGGCCACCTGGTGGCCTTGGGTGAGCAGGGGGCCCTTGGCCTGGCGGGTGGTGCCGCGGGTTTATTGCTGCACCGCTTTGTATTCGAGGTTCAGCTACACGGGTTTGGGCTACAGCCCGCGGCCCTCGCgca < 6:272323/147‑1 (MQ=255) | ATTATGGTTGCCGGTGACCATCATGCACATGCAGTTCGCGGTGAAGGCATAGATGTGGTACAGCGGCAGCGGCGCAATCATCACTTCCTGGCCGTCCTTCAGCAGCTTCTGCCCATCGGGGCCGTGCTGCGAGAAGCAGGCCAGCACTTGCAGCATGTTGGCCACCAGGTTGCCATGGGTGAGCATGGCGCCCTTGGCCAGGCCGGTGGTGCCGCCGGTGTACTGCAGCACCGCGATGTCATCGAGGTTCAGCGACACCGGTTTGGGCGACAGCCCGCGGCCCTCGCGCA > NC_002947/5174119‑5174408 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |