| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 136826 | 65 (1.290) | 5 (0.100) | 4/248 | NT | 7.0% | coding (711/789 nt) | amiD | 1,6‑anhydro‑N‑acetylmuramyl‑L‑alanine amidase |
| ? | NC_002947 | = 136859 | 70 (1.450) | coding (744/789 nt) | amiD | 1,6‑anhydro‑N‑acetylmuramyl‑L‑alanine amidase | |||||
GGCACGGCAGCAAGCCTACTTCAGCGTCAACCCGCCAAGCGTTGGCTGGTACCAGCAGGAGCTGGCACGGTTTGGCTATCAGATCGAGCAGACCGGCGTGCTGGATGTCGCCACACGTCATGTGGTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAGTCACGGCGGGCGGGGTCCTTGTTGCAAAGCCTTGCGCTGCGAAGAGGCGAGTTGGGTCGACGCAGTTGT > NC_002947/136682‑136974 | agggcGGCAGCAAGCCTACTTCAGCGTCAACCCGCCAAGCGTTGGCTGGTACCAGCAGGAGCTGGCACGGTTTGGCTATCAGATCGAGCAGACCGGCGTGCTGGATGTCGCCACACGTCATGTGGTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTcc < 4:256602/145‑1 (MQ=255) cACGGCAGCAAGCCTACTTCAGCGTCAACCCGCCAAGCGTTGGCTGGTACCAGCAGGAGCTGGCACGGTTTGGCTATCAGATCGAGCAGACCGGCGTGCTGGATGTCTCCACACGTCATGTGGTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTccgc < 2:200538/149‑1 (MQ=255) tACTTCAGCGTCAACCCGCCAAGCGTTGGCTGGTACCAGCAGGAGCTGGCACGGTTTGGCTATCAGATCGAGCAGACCGGCGTGCTGGATGTCGCCACACGTCATGTGGTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGa > 5:229151/1‑149 (MQ=255) ttCAGCGTCAACCCGCCAAGCGTTGGCTGGTACCAGCAGGAGCTGGCACGGTTTGGCTATCAGATCGAGCAGACCGGCGTGCTGGATGTCGCCACACGTCATGTGGTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACgg > 8:86974/1‑149 (MQ=255) ttCAGCGTCAACCCGCCAAGCGTTGGCTGGTACCAGCAGGAGCTGGCACGGTTTGGCTATCAGATCGAGCAGACCGGCGTGCTGGATGTCGCCACACGTCATGTGGTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACgg > 7:85721/1‑149 (MQ=255) cAGCGTCAACCCGCCAAGCGTTGGCTGGTACCAGCAGGAGCTGGCACGGTTTGGCTATCAGATCGAGCAGACCGGCGTGCTGGATGTCGCCACACGTCATGTGGTCGACGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTa > 4:38035/1‑149 (MQ=255) aGCGTCAACCCGCCAAGCGTTGGCTGGTACCAGCAGGAGCTGGCACGGTTTGGCTATCAGATCGAGCAGACCGGCGTGCTGGATGTCGCCACACGTCATGTGGTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTAt > 7:241618/1‑149 (MQ=255) aaCCCGCCAAGCGTTGGCTGGTACCAGCAGGAGCTGGCACGGTTTGGCTATCAGATCGAGCAGACCGGCGTGCTGGATGTCGCCACACGTCATGTGGTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCgg < 8:273864/148‑1 (MQ=255) aCCCGCCAAGCGTTGGCTGGTACCAGCAGGAGCTGGCACGGTTTGGCTATCAGATCGAGCAGACCGGCGTGCTGGATGTCGCCACACGTCATGTGGTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGAt > 3:16502/1‑149 (MQ=255) aCCCGCCAAGCGTTGGCTGGTACCAGCAGGAGCTGGCACGGTTTGGCTATCAGATCGAGCAGACCGGCGTGCTGGATGTCGCCACACGTCATGTGGTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGAt < 6:229151/149‑1 (MQ=255) cccGCCAAGCGTTGGCTGGTACCAGCAGGAGCTGGCACGGTTTGGCTATCAGATCGAGCAGACCGGCGTGCTGGATGTCGCCACACGTCATGTGGTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATg < 7:33263‑M2/149‑2 (MQ=255) ccGCCAAGCGTTGGCTGGTACCAGCAGGCGCTGTCACGGTTTTGCTATCAGATCGAGCAGACGTGCGTGCTGGATGTCGCCACACGTCATGTGGTCGCCGCCTTCCTGATGCGCTTCCGCCCGCAGCTCTTCTACGTTATGCCGGAttc < 2:289795/149‑3 (MQ=255) ccGCCAAGCGTTGGCTGGTACCAGCAGGAGCTGGCACGGTTTGGCTATCAGATCGAGCAGACCGGCGTGCTGGATGTCGCCACACGTCATGTGGTCGCCGCCTTCCAGATGCGCatccggcataccgtcgaagcgctgcgggcggaagc > 1:315941‑M1/1‑114 (MQ=255) ccAAGCGTTGGCTGGTACCAGCAGGAGCTGGCACGGTTTGGCTATCAGATCGAGCAGACCGGCGTGCTGGATGTCGCCACACGTCATGTGGTCGCCGCCTTCCAGATGCGCatccggcataccgtcgaagcgctgcgggcggaagcgca < 2:315941‑M1/149‑39 (MQ=255) ccAAGCGTTGGCTGGTACCAGCAGGAGCTGGCACGGTTTGGCTATCAGATCGAGCAGACCGGCGTGCTGGATGTCGCCACACGTCATGTGGTCGCCGCCTTCCAGATGCGCatccggcataccgtcgaagcgctgcgggcggaagcgca < 8:17543‑M1/149‑39 (MQ=255) cAAGCGTTGGCTGGTACCAGCAGGAGCTGGCACGGTTTGGCTATCAGATCGAGCAGACCGGCGTGCTGGATGTCGCCACACGTCATGTGGTCGCCGCCTTCCAGATGCGCatccggcataccgtcgaagcgctgcgggcggaagcgcat < 3:165451‑M1/149‑40 (MQ=255) gTTGGCTGGTACCAGCAGGAGCTGGCACGGTTTGGCTATCAGATCGAGCAGACCGGCGTGCTGGATGTCGCCACACGTCATGTGGTCGCCGCCTTCCAGATGCGCatccggcataccgtcgaagcgctgcgggcggaagcgcatctgga < 6:205707‑M1/149‑45 (MQ=255) tGGTACCAGCAGGAGCTGGCACGGTTTGGCTATCAGATCGAGCAGACCGGCGTGCTGGATGTCGCCACACGTCATGTGGTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGc > 3:280028/1‑127 (MQ=255) tGGTACCAGCAGGAGCTGGCACGGTTTGGCTATCAGATCGAGCAGACCGGCGTGCTGGATGTCGCCACACGTCATGTGGTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGc < 4:280028/127‑1 (MQ=255) ccAGCAGGAGCTGGCACGGTTTGGCTATCAGATCGAGCAGACCGGCGTGCTGGATGTCGCCACACGTCATGTGGTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGAtgctgc < 3:38870/149‑1 (MQ=255) ccAGCAGGAGCTGGCACGGTTTGGCTATCAGATCGAGCAGACCGGCGTGCTGGATGTCGCCACACGTCATGTGGTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGAtgctg < 7:233617/148‑1 (MQ=255) agGAGCTGGCACGGTTTGGCTATCAGATCGAGCAGACCGGCGTGCTGGATGTCGCCACACGTCATGTGGTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGt > 1:299571/1‑148 (MQ=255) ggAGCTGGCACGGTTTGGCTATCAGATCGAGCAGACCGGCGTGCTGGATGTCGCCACACGTCATGTGGTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTAc < 4:16502/149‑1 (MQ=255) gAGCTTGCACGGTTTGGCTATCAGATCGAGCAGACCGTCGTGCTGGATGTCGCCACACGTCATGTGGTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATTCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACt < 5:246151/149‑1 (MQ=255) gCACGGTTTGGCTATCAGATCGAGCAGACCGGCGTGCTGGATGTCGCCACACGTCATGTGGTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCg > 6:50812/1‑149 (MQ=255) aCGGTTTGGCTATCAGATCGAGCAGACCGGCGTGCTGGATGTCGCCACACGTCATGTGGTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCa > 3:84780/1‑149 (MQ=255) aCGGTTTGGCTATCAGATCGAGCAGACCGGCGTGCTGGATGTCGCCACACGTCATGTGGTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCa > 5:113711/1‑149 (MQ=255) aCGGTTTGGCTATCAGATCGAGCAGACCGGCGTGCTGGATGTCGCCACACGTCATGTGGTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCa > 5:86938/1‑149 (MQ=255) gCTATCAGATCGAGCAGACCGGCGTGCTGGATGTCGCCACACGTCATGTGGTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCATGCGTTGa < 2:299571/149‑1 (MQ=255) cAGATCGAGCAGACCGGCGTGCTGGATGTCGCCACACGTCATGTGGTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAGTCAc > 5:60046/1‑149 (MQ=255) gATCGAGCAGACCGGCGTGCTGGATGTCGCCACACGTCATGTGGTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAGTCAcgg > 8:252066/1‑149 (MQ=255) aGCAGACCGGCGTGCTGGATGTCGCCACACGTCATGTGGTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAGTCACggcgggc > 1:169421/1‑149 (MQ=255) gCAGACCGGCGTGCTGGATGTCGCCACACGTCATGTGGTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCg < 1:162841/106‑1 (MQ=255) gCAGACCGGCGTGCTGGATGTCGCCACACGTCATGTGGTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCg > 2:162841/1‑106 (MQ=255) aGACCGGCGTGCTGGATGTCGCCACACGTCATGTGGTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAGTCACGGcgggcggg < 6:86938/149‑1 (MQ=255) aCCGGCGTGCTGGATGTCGCCACACGTCATGTGGTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATgcgc < 1:190161‑M2/91‑5 (MQ=255) aCCGGCGTGCTGGATGTCGCCACACGTCATGTGGTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATgcgc > 2:190161‑M2/1‑87 (MQ=255) gCGTGCTGGATGTCGCCACACGTCATGTGGTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAGTCACGGCGGGCGGGGTCCtt > 4:125004/1‑149 (MQ=255) gTGCTGGATGTCGCCACACTTCATGTGCTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAGTCACGGCGGGCGGGGTCCttgt < 6:220661/149‑1 (MQ=255) tGCTGGATGTCGCCACACGTCATGTGGTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAGTCACGGCGGGCGGGGTCCttgtt < 2:169421/149‑1 (MQ=255) tGCTGGATGTCGCCACACGTCATGTGGTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAGTCACGGCGGGCGGGGTCCttgtt < 7:252066/149‑1 (MQ=255) gCTGGATGTCGCCACACGTCATGTGGTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAGTCACGGCGGGCGGGGTCCttgttg > 5:174426/1‑149 (MQ=255) cTGGATGTCGCCACACGTCATGTGGTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACt > 5:322920/1‑107 (MQ=255) cTGGATGTCGCCACACGTCATGTGGTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACt < 6:322920/107‑1 (MQ=255) cTGGATGTCGCCACACGTCATGTGGTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAAcc > 5:248060/1‑112 (MQ=255) cTGGATGTCGCCACACGTCATGTGGTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAAcc < 6:248060/112‑1 (MQ=255) cTGGATGTCGCCACACGTCATGTGGTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAGTCACGGCGGGCGGGGTCCTTGTTGc < 3:38035/149‑1 (MQ=255) ggATGTCGCCACACGTCATGTGGTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAGTCACGGCGGGCGGGGTCCTTGTTGCa > 8:269014/1‑148 (MQ=255) tGTCGCCACACGTCATGTGGTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAGTCACGGcgggcggg < 4:47390/133‑1 (MQ=255) tGTCGCCACACGTCATGTGGTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAGTCACGGcgggcggg > 3:47390/1‑133 (MQ=255) tCGCCACACGTCATGTGGTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAGTCACGGCGGGCGGGGTCCTTGTTGCAAAGCC < 3:145394‑M1/148‑1 (MQ=255) gCCACACGTCATGTGGTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAGTCACGGCGGGCGGGGTCCTTGTTGCAAAGCCTTG < 4:84780‑M1/149‑1 (MQ=255) gCCACACGTCATGTGGTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAGTCACGGCGGGCGGGGTCCTTGTTGCAAAGCCTTG > 5:188724‑M1/1‑149 (MQ=255) gCCACACGTCATGTGGTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAGTCACGGCGGGCGGGGTCCTTGTTGCAAAGCCTTG > 3:261327‑M1/1‑149 (MQ=255) gCCACACGTCATGTGGTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAGTCACGGCGGGCGGGGTCCTTGTTGCAAAGCCTTG < 7:86974‑M1/149‑1 (MQ=255) acacGTCATGTGGTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGAATGCGTTGAGTCACGGCGGGCGGGGTCCTTGTTGCAAAGCCTTgcgc > 8:178927/1‑149 (MQ=255) cGTCATGTGGTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAGTCACGGCGGGCGGGGTCCTTGTTGCAAAGCCTT > 1:149587‑M1/1‑142 (MQ=255) cGTCATGTGGTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAGTCACGGCGGGCGGGGTCCTTGTTGCAAAGCCTT < 2:149587‑M1/142‑1 (MQ=255) tCATGTGGTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTACAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAGTCACGGCGGGCGGGGTCCTTGTTGCAAAGCCTTGCGCTGCg > 4:197568/1‑148 (MQ=255) tgtgGTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAg < 5:197938/104‑1 (MQ=255) tgtgGTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAg > 6:197938/1‑104 (MQ=255) tgGTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGAGGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAGTCACGGCGGGCGGGGTCCTTGTTGCAAAGCCTTGCGCTGCGAagag < 5:50812/148‑1 (MQ=255) tgGTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAGTCAcg > 4:266790/1‑107 (MQ=255) tgGTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAGTCAcg < 3:266790/107‑1 (MQ=255) tgGTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAGTCACGGCGGGCGGGGTCCTTGTTGCAAAGCCTTGCGCTGCGAagag < 6:113711/148‑1 (MQ=255) gTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAGTCACGGCGGGCGGGGTCCTTGTTGCAAAGCCTTgc < 3:309228/135‑1 (MQ=255) gTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAGTCACGGCGGGCGGGGTCCTTGTTGCAAAGCCTTgc > 4:309228/1‑135 (MQ=255) gTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAGTCACGGCGGGCGGGGTCCTTGTTGCAAAGCCTTGCGCTGCGAAGAGGc < 8:241618/148‑1 (MQ=255) tCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAGTCACGGCGGGCGGGGTCCTTGTTGCAAAGCCTTGCGCTGCGAAGAGGc > 4:78749/1‑147 (MQ=255) tCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAGTCACGGCGGGCGGGGTCCTTGTTGCAAAGCCTTGCGCTGCGAAGAGGc > 7:135617/1‑147 (MQ=255) tCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAGTCACGGCGGGCGGGGTCCTTGTTGCAAAGCCTTGCGCTGCGAAGAGGc > 8:100857/1‑147 (MQ=255) ccgcaTTCCAGATTCGCTTCGGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCTGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAGTCACGGCGGGCGGGGTCCTTGTTGAAATGCCTTGCGCTGCGAAGAGGCGAGtt < 8:135617/149‑1 (MQ=255) gccTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAGTCACGGCGGGCGGGGTCCTTGTTGCAAAGCCTTGCGCTGCGAAGAGGCGAGTTgg < 6:60046/149‑1 (MQ=255) gccTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAGTCACGGCGGGCGGGGTCCTTGTTGCAAAGCCTTGCGCTGCGAAGAGGCGAGTTgg < 6:174426/149‑1 (MQ=255) ccTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAGTCACGGCGGGCGGGGTCCTTGTTGCAAAGCCTTGCGCTGCGAAGAGGCGAGTTggg < 7:100857/149‑1 (MQ=255) cTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAGTCACGGCGGGCGGGGTCCTTGTTGCAAAGCCTTGCGCTGCGAAGAGGCGAGTTGGGt > 8:180270/1‑149 (MQ=255) tCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATgcgcatctggaaggcggcgaccacatgacgtgtggcgacatccagcacgccggtctgctcgatctgatagccaaaccgtgccagctcctgctggtaccagccaac < 6:205707‑M2/149‑106 (MQ=255) tCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAGTCACGGCGGGCGGGGTCCTTGTTGCAAAGCCTTGCGCt < 1:159368/128‑1 (MQ=255) tCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAGTCACGGCGGGCGGGGTCCTTGTTGCAAAGCCTTGCGCt > 2:159368/1‑128 (MQ=255) cAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAGTCACGGCGGGCGGGGTCCTTGTTGCAAAGCCTTGCGCTGCGAAGAGGCGAGTTGGGTCGAc < 6:188724/149‑1 (MQ=255) gATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAGTCACGGCGGGCGGGGTCCTTGTTGCAAAGCCTTGCGCTGCGAAGAGGCGAGTTGGGTCGa < 2:264317/146‑1 (MQ=255) gATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAGTCACGGCGGGCGGGGTCCTTGTTGCAAAGCCTTGCGCTGCGAAGAGGCGAGTTGGGTCGa > 1:264317/1‑146 (MQ=255) aTGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATgcgcatctggaaggcggcgaccacatgacgtgtggcgacatccagcacgccggtctgctcgatctgatagccaaaccgtgccagctcctgctggtaccagccaacgcttg < 3:165451‑M2/149‑111 (MQ=255) tGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATgcgcatctggaaggcggcgaccacatgacgtgtggcgacatccagcacgccggtctgctcgatctgatagccaaaccgtgccagctcctgctggtaccagccaacgcttgg < 2:315941‑M2/149‑112 (MQ=255) tGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATgcgcatctggaaggcggcgaccacatgacgtgtggcgacatccagcacgccggtctgctcgatctgatagccaaaccgtgccagctcctgctggtaccagccaacgcttgg < 8:17543‑M2/149‑112 (MQ=255) tGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAGTCACGGCGGGCGGGGTCCTTGTTGCAAAGCCTTGCGCTGCGAAGAGGCGAGTTGGGTCGACGCAg < 3:78749/149‑1 (MQ=255) gcgcatccggcataccgtcgaagcgctgcgggcggaagcgcatctggaaggcggcgaccacatgacgtgtggcgacatccagcacgccggt > 2:190161‑M1/1‑4 (MQ=255) gcgcatccggcataccgtcgaagcgctgcgggcggaagcgcatctggaaggcggcgaccacatgacgtgtggcgacatccagcacgccggt < 1:190161‑M1/91‑88 (MQ=255) cgcTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAGTCACGGCGGGCGGGGTCCTTGTTGCAAAGCCTTGCGCTGCGAAGAGGCGAGTTGGGTCGACGCAGt < 3:125004/148‑1 (MQ=255) tcTTACGACCGAAGCGCTTCGACGGAATGCCCGATGCGAAGACAGCAGCGATGCTGCAGCAACTTAACCCAATGCATACAGTCACGGCCGGCGGGGTCCTTGTTGCAAAGCCTTGCGCTGCGAAGAGGCGAGTTGGGTCGACGCAGTTg > 4:252287/2‑149 (MQ=255) gcTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATgcgcatctggaaggcggcgaccacatgacgtgtggcgacatccagcacgccggtctgctcgatctgatagccaaaccgtgccagctcctgctggtaccagccaacgcttggcgg > 1:315941‑M2/1‑35 (MQ=255) catccggcataccgtcgaagcgctgcgggcggaagcgcatctggaaggcggcgaccacatgacgtgtggcgacatccagcacgccggtctgctcgatctgatagccaaaccgtgccagctcctgctggtaccagccaacgcttggcggg < 7:33263‑M1/149‑149 (MQ=255) | GGCACGGCAGCAAGCCTACTTCAGCGTCAACCCGCCAAGCGTTGGCTGGTACCAGCAGGAGCTGGCACGGTTTGGCTATCAGATCGAGCAGACCGGCGTGCTGGATGTCGCCACACGTCATGTGGTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAGTCACGGCGGGCGGGGTCCTTGTTGCAAAGCCTTGCGCTGCGAAGAGGCGAGTTGGGTCGACGCAGTTGT > NC_002947/136682‑136974 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |