New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 136826 | 65 (1.290) | 5 (0.100) | 4/248 | NT | 7.0% | coding (711/789 nt) | amiD | 1,6‑anhydro‑N‑acetylmuramyl‑L‑alanine amidase |
? | NC_002947 | = 136859 | 70 (1.450) | coding (744/789 nt) | amiD | 1,6‑anhydro‑N‑acetylmuramyl‑L‑alanine amidase |
ACCCGCCAAGCGTTGGCTGGTACCAGCAGGAGCTGGCACGGTTTGGCTATCAGATCGAGCAGACCGGCGTGCTGGATGTCGCCACACGTCATGTGGTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAGTCACGGCGGGCGGGGTCCTTGTTGCAAAGCCTTGCGCTGCGAAGAGGCGAGTTGGGTCGACGCAGTTGTATCGACTTAACGGTCGCATCGCAGCCA > NC_002947/136711‑137001 | aCCCGCCAAGCGTTGGCTGGTACCAGCAGGAGCTGGCACGGTTTGGCTATCAGATCGAGCAGACCGGCGTGCTGGATGTCGCCACACGTCATGTGGTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGAt > 3:16502/1‑149 (MQ=255) aCCCGCCAAGCGTTGGCTGGTACCAGCAGGAGCTGGCACGGTTTGGCTATCAGATCGAGCAGACCGGCGTGCTGGATGTCGCCACACGTCATGTGGTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGAt < 6:229151/149‑1 (MQ=255) cccGCCAAGCGTTGGCTGGTACCAGCAGGAGCTGGCACGGTTTGGCTATCAGATCGAGCAGACCGGCGTGCTGGATGTCGCCACACGTCATGTGGTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATg < 7:33263‑M2/149‑2 (MQ=255) ccGCCAAGCGTTGGCTGGTACCAGCAGGCGCTGTCACGGTTTTGCTATCAGATCGAGCAGACGTGCGTGCTGGATGTCGCCACACGTCATGTGGTCGCCGCCTTCCTGATGCGCTTCCGCCCGCAGCTCTTCTACGTTATGCCGGAttc < 2:289795/149‑3 (MQ=255) ccAGCAGGAGCTGGCACGGTTTGGCTATCAGATCGAGCAGACCGGCGTGCTGGATGTCGCCACACGTCATGTGGTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGAtgctgc < 3:38870/149‑1 (MQ=255) ccAGCAGGAGCTGGCACGGTTTGGCTATCAGATCGAGCAGACCGGCGTGCTGGATGTCGCCACACGTCATGTGGTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGAtgctg < 7:233617/148‑1 (MQ=255) agGAGCTGGCACGGTTTGGCTATCAGATCGAGCAGACCGGCGTGCTGGATGTCGCCACACGTCATGTGGTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGt > 1:299571/1‑148 (MQ=255) ggAGCTGGCACGGTTTGGCTATCAGATCGAGCAGACCGGCGTGCTGGATGTCGCCACACGTCATGTGGTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTAc < 4:16502/149‑1 (MQ=255) gAGCTTGCACGGTTTGGCTATCAGATCGAGCAGACCGTCGTGCTGGATGTCGCCACACGTCATGTGGTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATTCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACt < 5:246151/149‑1 (MQ=255) gCACGGTTTGGCTATCAGATCGAGCAGACCGGCGTGCTGGATGTCGCCACACGTCATGTGGTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCg > 6:50812/1‑149 (MQ=255) aCGGTTTGGCTATCAGATCGAGCAGACCGGCGTGCTGGATGTCGCCACACGTCATGTGGTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCa > 5:86938/1‑149 (MQ=255) aCGGTTTGGCTATCAGATCGAGCAGACCGGCGTGCTGGATGTCGCCACACGTCATGTGGTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCa > 3:84780/1‑149 (MQ=255) aCGGTTTGGCTATCAGATCGAGCAGACCGGCGTGCTGGATGTCGCCACACGTCATGTGGTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCa > 5:113711/1‑149 (MQ=255) gCTATCAGATCGAGCAGACCGGCGTGCTGGATGTCGCCACACGTCATGTGGTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCATGCGTTGa < 2:299571/149‑1 (MQ=255) cAGATCGAGCAGACCGGCGTGCTGGATGTCGCCACACGTCATGTGGTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAGTCAc > 5:60046/1‑149 (MQ=255) gATCGAGCAGACCGGCGTGCTGGATGTCGCCACACGTCATGTGGTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAGTCAcgg > 8:252066/1‑149 (MQ=255) aGCAGACCGGCGTGCTGGATGTCGCCACACGTCATGTGGTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAGTCACggcgggc > 1:169421/1‑149 (MQ=255) gCAGACCGGCGTGCTGGATGTCGCCACACGTCATGTGGTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCg > 2:162841/1‑106 (MQ=255) gCAGACCGGCGTGCTGGATGTCGCCACACGTCATGTGGTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCg < 1:162841/106‑1 (MQ=255) aGACCGGCGTGCTGGATGTCGCCACACGTCATGTGGTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAGTCACGGcgggcggg < 6:86938/149‑1 (MQ=255) aCCGGCGTGCTGGATGTCGCCACACGTCATGTGGTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATgcgc > 2:190161‑M2/1‑87 (MQ=255) aCCGGCGTGCTGGATGTCGCCACACGTCATGTGGTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATgcgc < 1:190161‑M2/91‑5 (MQ=255) gCGTGCTGGATGTCGCCACACGTCATGTGGTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAGTCACGGCGGGCGGGGTCCtt > 4:125004/1‑149 (MQ=255) gTGCTGGATGTCGCCACACTTCATGTGCTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAGTCACGGCGGGCGGGGTCCttgt < 6:220661/149‑1 (MQ=255) tGCTGGATGTCGCCACACGTCATGTGGTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAGTCACGGCGGGCGGGGTCCttgtt < 7:252066/149‑1 (MQ=255) tGCTGGATGTCGCCACACGTCATGTGGTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAGTCACGGCGGGCGGGGTCCttgtt < 2:169421/149‑1 (MQ=255) gCTGGATGTCGCCACACGTCATGTGGTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAGTCACGGCGGGCGGGGTCCttgttg > 5:174426/1‑149 (MQ=255) cTGGATGTCGCCACACGTCATGTGGTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACt > 5:322920/1‑107 (MQ=255) cTGGATGTCGCCACACGTCATGTGGTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACt < 6:322920/107‑1 (MQ=255) cTGGATGTCGCCACACGTCATGTGGTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAAcc < 6:248060/112‑1 (MQ=255) cTGGATGTCGCCACACGTCATGTGGTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAAcc > 5:248060/1‑112 (MQ=255) cTGGATGTCGCCACACGTCATGTGGTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAGTCACGGCGGGCGGGGTCCTTGTTGc < 3:38035/149‑1 (MQ=255) ggATGTCGCCACACGTCATGTGGTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAGTCACGGCGGGCGGGGTCCTTGTTGCa > 8:269014/1‑148 (MQ=255) tGTCGCCACACGTCATGTGGTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAGTCACGGcgggcggg < 4:47390/133‑1 (MQ=255) tGTCGCCACACGTCATGTGGTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAGTCACGGcgggcggg > 3:47390/1‑133 (MQ=255) tCGCCACACGTCATGTGGTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAGTCACGGCGGGCGGGGTCCTTGTTGCAAAGCC < 3:145394‑M1/148‑1 (MQ=255) gCCACACGTCATGTGGTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAGTCACGGCGGGCGGGGTCCTTGTTGCAAAGCCTTG < 7:86974‑M1/149‑1 (MQ=255) gCCACACGTCATGTGGTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAGTCACGGCGGGCGGGGTCCTTGTTGCAAAGCCTTG < 4:84780‑M1/149‑1 (MQ=255) gCCACACGTCATGTGGTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAGTCACGGCGGGCGGGGTCCTTGTTGCAAAGCCTTG > 5:188724‑M1/1‑149 (MQ=255) gCCACACGTCATGTGGTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAGTCACGGCGGGCGGGGTCCTTGTTGCAAAGCCTTG > 3:261327‑M1/1‑149 (MQ=255) acacGTCATGTGGTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGAATGCGTTGAGTCACGGCGGGCGGGGTCCTTGTTGCAAAGCCTTgcgc > 8:178927/1‑149 (MQ=255) cGTCATGTGGTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAGTCACGGCGGGCGGGGTCCTTGTTGCAAAGCCTT > 1:149587‑M1/1‑142 (MQ=255) cGTCATGTGGTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAGTCACGGCGGGCGGGGTCCTTGTTGCAAAGCCTT < 2:149587‑M1/142‑1 (MQ=255) tCATGTGGTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTACAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAGTCACGGCGGGCGGGGTCCTTGTTGCAAAGCCTTGCGCTGCg > 4:197568/1‑148 (MQ=255) tgtgGTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAg > 6:197938/1‑104 (MQ=255) tgtgGTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAg < 5:197938/104‑1 (MQ=255) tgGTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGAGGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAGTCACGGCGGGCGGGGTCCTTGTTGCAAAGCCTTGCGCTGCGAagag < 5:50812/148‑1 (MQ=255) tgGTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAGTCAcg > 4:266790/1‑107 (MQ=255) tgGTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAGTCAcg < 3:266790/107‑1 (MQ=255) tgGTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAGTCACGGCGGGCGGGGTCCTTGTTGCAAAGCCTTGCGCTGCGAagag < 6:113711/148‑1 (MQ=255) gTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAGTCACGGCGGGCGGGGTCCTTGTTGCAAAGCCTTgc > 4:309228/1‑135 (MQ=255) gTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAGTCACGGCGGGCGGGGTCCTTGTTGCAAAGCCTTgc < 3:309228/135‑1 (MQ=255) gTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAGTCACGGCGGGCGGGGTCCTTGTTGCAAAGCCTTGCGCTGCGAAGAGGc < 8:241618/148‑1 (MQ=255) tCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAGTCACGGCGGGCGGGGTCCTTGTTGCAAAGCCTTGCGCTGCGAAGAGGc > 4:78749/1‑147 (MQ=255) tCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAGTCACGGCGGGCGGGGTCCTTGTTGCAAAGCCTTGCGCTGCGAAGAGGc > 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cTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAGTCACGGCGGGCGGGGTCCTTGTTGCAAAGCCTTGCGCTGCGAAGAGGCGAGTTGGGt > 8:180270/1‑149 (MQ=255) tCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATgcgcatctggaaggcggcgaccacatgacgtgtggcgacatccagcacgccggtctgctcgatctgatagccaaaccgtgccagctcctgctggtaccagccaac < 6:205707‑M2/149‑106 (MQ=255) tCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAGTCACGGCGGGCGGGGTCCTTGTTGCAAAGCCTTGCGCt < 1:159368/128‑1 (MQ=255) tCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAGTCACGGCGGGCGGGGTCCTTGTTGCAAAGCCTTGCGCt > 2:159368/1‑128 (MQ=255) cAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAGTCACGGCGGGCGGGGTCCTTGTTGCAAAGCCTTGCGCTGCGAAGAGGCGAGTTGGGTCGAc < 6:188724/149‑1 (MQ=255) gATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAGTCACGGCGGGCGGGGTCCTTGTTGCAAAGCCTTGCGCTGCGAAGAGGCGAGTTGGGTCGa > 1:264317/1‑146 (MQ=255) gATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAGTCACGGCGGGCGGGGTCCTTGTTGCAAAGCCTTGCGCTGCGAAGAGGCGAGTTGGGTCGa < 2:264317/146‑1 (MQ=255) aTGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATgcgcatctggaaggcggcgaccacatgacgtgtggcgacatccagcacgccggtctgctcgatctgatagccaaaccgtgccagctcctgctggtaccagccaacgcttg < 3:165451‑M2/149‑111 (MQ=255) tGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATgcgcatctggaaggcggcgaccacatgacgtgtggcgacatccagcacgccggtctgctcgatctgatagccaaaccgtgccagctcctgctggtaccagccaacgcttgg < 8:17543‑M2/149‑112 (MQ=255) tGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATgcgcatctggaaggcggcgaccacatgacgtgtggcgacatccagcacgccggtctgctcgatctgatagccaaaccgtgccagctcctgctggtaccagccaacgcttgg < 2:315941‑M2/149‑112 (MQ=255) tGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAGTCACGGCGGGCGGGGTCCTTGTTGCAAAGCCTTGCGCTGCGAAGAGGCGAGTTGGGTCGACGCAg < 3:78749/149‑1 (MQ=255) cgcTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAGTCACGGCGGGCGGGGTCCTTGTTGCAAAGCCTTGCGCTGCGAAGAGGCGAGTTGGGTCGACGCAGt < 3:125004/148‑1 (MQ=255) tcTTACGACCGAAGCGCTTCGACGGAATGCCCGATGCGAAGACAGCAGCGATGCTGCAGCAACTTAACCCAATGCATACAGTCACGGCCGGCGGGGTCCTTGTTGCAAAGCCTTGCGCTGCGAAGAGGCGAGTTGGGTCGACGCAGTTg > 4:252287/2‑149 (MQ=255) gcTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATgcgcatctggaaggcggcgaccacatgacgtgtggcgacatccagcacgccggtctgctcgatctgatagccaaaccgtgccagctcctgctggtaccagccaacgcttggcgg > 1:315941‑M2/1‑35 (MQ=255) cgcccgcAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAGTCACGGCGGGCGGGGTCCTTGTTGCAAAGCCTTGCGCTGCGAAGAGGCGAGTTGGGTCGACGCAGTTGTATc < 7:269014/148‑1 (MQ=255) gcccgcAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAGTCACGGCGGGCGGGGTCCTTGTTGCAAAGCCTTGCGCTGCGAAGAGGCGAGTTGGGTCGACGCAGTTGTATCGa > 5:116515/1‑149 (MQ=255) gcAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAGTCACGGCGGGCGGGGTCCttgtt > 3:87554/1‑94 (MQ=255) gcAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAGTCACGGCGGGCGGGGTCCttgtt < 4:87554/94‑1 (MQ=255) cgcTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAGTCACGGCGGGCGGGGTCCTTGTTGCAAAGCCTTGCGCTGCGAAGAGGCGAGTTGGGTCGACGCAGTTGTATCg < 1:315137/140‑1 (MQ=255) cgcTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAGTCACGGCGGGCGGGGTCCTTGTTGCAAAGCCTTGCGCTGCGAAGAGGCGAGTTGGGTCGACGCAGTTGTATCg > 2:315137/1‑140 (MQ=255) cTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAGTCACGGCGGGCGGGGTCCTTGTTGCAAAGCCTTGtggctgcgatgcgaccgttaagtcgatacaactgcgtcgacccaactcgc > 2:74605‑M1/1‑99 (MQ=255) cTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAGTCACGGCGGGCGGGGTCCTTGTTGCAAAGCCTTGCGCTGCGAAGAGGCGAGTTGGGTCGACGCAGTTGTATCGACTTAACGGtc < 7:180270/149‑1 (MQ=255) ttCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAGTCACGGCGGGCGGGGTCCTTGTTGCAAAGCCTTGCGCTGCGaa > 6:312287/1‑107 (MQ=255) cGACGGTATGCCGTATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAGTCACGGCGGGGGGGGTCGTTGTTGCAAAGCCTTGCGCTGCGAag < 1:43965/106‑1 (MQ=255) cGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAGTCACGGCGGGCGGGGTCCTTGTTGCAAAGCCTTGCGCTGCGAAGAGGCGAGTTGGGTCGACGCAGTTGTATCGACTTAACGGtcgcatcg < 4:261327/149‑1 (MQ=255) cGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAGTCACGGCGGGCGGGGTCCTTGTTGCAAAGCCTTGCGCTGCGAAGAGGCGAGTTGGGTCGACGCAGTTGTATCGACTTAACGGtcgcatcg > 8:66236/1‑149 (MQ=255) ggTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAGTCACGGCGGGCGGGGTCCTTGTTGCAAAGCCTTGCGCTGCGAAGAGGCGAGTTGGGTCGACGCAGTTGTATCGACTTAACGGtcgcatcgc < 6:116515/149‑1 (MQ=255) tGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAGTCACGGCGGGCGGGGTCCTTGTTGCAAAGCCTTGCGCTGCGAAGAGGCGAGTTGGGTCGACGCAGTTGTATCGACTTAACGGTCGCATCGCAGc < 8:85721/148‑1 (MQ=255) ccGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTACAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAGTCACGGCGGGCGGGGTCCTTGTTGCAAAGCCTTGCGCTGCGAAGAGGCGAGTTGGGTCGACGCAGTTGTATCGACTTAACGGTCGCATCGCAGCca < 3:197568/148‑1 (MQ=255) | ACCCGCCAAGCGTTGGCTGGTACCAGCAGGAGCTGGCACGGTTTGGCTATCAGATCGAGCAGACCGGCGTGCTGGATGTCGCCACACGTCATGTGGTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAGTCACGGCGGGCGGGGTCCTTGTTGCAAAGCCTTGCGCTGCGAAGAGGCGAGTTGGGTCGACGCAGTTGTATCGACTTAACGGTCGCATCGCAGCCA > NC_002947/136711‑137001 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |