| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 250473 | 60 (1.190) | 4 (0.080) | 4/246 | NT | 7.1% | coding (730/1347 nt) | nfeD | membrane bound peptidase NefD |
| ? | NC_002947 | = 250522 | 48 (1.000) | coding (681/1347 nt) | nfeD | membrane bound peptidase NefD | |||||
AACAGCTGCAGCGCATACAGCGCCAGCAGCAGGCAGATACCACCGACCACACCGCCCACCGCAGAACCTGGGTTCATGAATTCGAACAACAGGCCGTAAACGCCGATCATGATCAGGATCA‑GCGCTACGCTGGGGTTGGTGATGACCGCCAGAAACCGTGTGCGCCAGTCCGGCAGATGCTCGACCACGCTGGCGCCTGCGGTCTGCAACTGCCGTGGTTGGCCGGCCACCTGAAGCGTTTTGCCGTCGAGCTTGCGCAGCAGGTCAGGCAGGTCATCGGCCACCTGATCGAT > NC_002947/250325‑250617 | aaCAGCTGCAGCGCATACAGCGCCAGCAGCAGGCAGATACCACCGACCACACCGCCCACCGCAGAACCTGGGTTCATGAATTCGAACAACAGGCCGTAAACGCCGATCATGATCAGGATCA‑GCGCTACGCTGGGGTTGGTGATGACCGC < 6:251580‑M1/149‑1 (MQ=255) tGCAGCGCATACAGCGCCAGCAGCAGGCAGATACCACCGACCACACCGCCCACCGCAGAACCTGGGTTCATGAATTCGAACAACAGGCCGTAAACGCCGATCATGATCAGGATCA‑GCGCTACGCTGGGGTTGGTGATGACCGCCAGaac > 6:210002/1‑148 (MQ=255) cAGCGCATACAGCGCCAGCAGCAGGCAGATACCACCGACCACACCGCCCACCGCAGAACCTGGGTTCATGAATTCGAACAACAGGCCGTAAACGCCGATCATGATCAGGATCA‑GCGCTACGCTGGGGTTGGTGATGACCGCCAGAAAcc > 7:227600/1‑149 (MQ=255) aGCGCCAGCAGCAGGCAGATACCACCGACCACACCGCCCACCGCAGAACCTGGGTTCATGAATTCGAACAACAGGCCGTAAACGCCGATCATGATCAGGATCA‑GCGCTACGCTGGGGTTGGTGATGACCGCCAGAAACCGTGTgcgc > 5:146199/1‑147 (MQ=255) aGCGCCAGCAGCAGGCAGATACCACCGACCACACCGCCCACCGCAGAACCTGGGTTCATGAATTCGAACAACAGGCCGTAAACGCCGATCATGATCAGGATCA‑GCGCTACGCTGGGGTTGGTGATGACCGCCAGAAACCGTGTgcgc > 2:14947/1‑147 (MQ=255) gcgcCAGCAGCAGGCAGATACCACCGACCACACCGCCCACCGCAGAACCTGGGTTCATGAATTCGAACAACAGGCCGTAAACGCCGATCATGATCAGGATCA‑GCGCTACGCTGGGGTTGGTGATGACCGCCAGAAACCGTGTGCGCCAg > 3:253926/1‑149 (MQ=255) ccAGCAGCAGGCAGATACCACCGACCACACCGCCCACCGCAGAACCTGGGTTCATGAATTCGAACAACAGGCCGTAAACGCCGATCATGATCAGGATCA‑GCGCTACGCTGGGGTTGGTGATGACCGCCAGAAACCGTGTGCGCCAGTcc < 8:227600/149‑1 (MQ=255) gcagcagGCAGATACCACCGACCACACCGCCCACCGCAGAACCTGGGTTCATGAATTCGAACAACAGGCCGTAAACGCCGATCATGATCAGGATCA‑GCGCTACGCTGGGGTTGGTGATGACCGCCAGAAACCGTGTGCGCCAGTCCGGc < 6:4983/149‑1 (MQ=255) gcaggcagATACCACCGACCACACCGCCCACCGCAGAACCTGGGTTCATGAATTCGAACAACAGGCCGT‑AACGCCGATCATGATCAGGATCA‑GCGCTACGCTGGGGTTGGTGATGACCGCCAGAAACCGTGTGCGCCAGTCCGGCAGAt > 7:288528/1‑149 (MQ=255) caggcagATACCACCGACCACACCGCCCACCGCAGAACCTGGGTTCATGAATTCGAACAACAGGCCGTAAACGCCGATCATGATCAGGATCA‑GCGCTACGCTGGGGTTGGTGATGACCGCCAGAAACCGTGTGCGCCAGTCCGGCAGAt < 4:192338/149‑1 (MQ=255) caggcagATACCACCGACCACACCGCCCACCGCAGAACCTGGGTTCATGAATTCGAACAACAGGCCGTAAACGCCGATCATGATCAGGATCA‑GCGCTACGCTGGGGTTGGTGATGACCGCCAGAAACCGTGTGCGCCAGTCCGGCAGAt < 3:21197/149‑1 (MQ=255) gcagATACCACCGACCACACCGCCCACCGCAGAACCTGGGTTCATGAATTCGAACAACAGGCCGTAAACGCCGATCATGATCAGGATCA‑GCGCTACGCTGGGGTTGGTGATGACCGCaggcgccagcgtggtcgagcatctgccggact > 8:45439‑M1/1‑117 (MQ=255) gcagATACCACCGACCACACCGCCCACCGCAGAACCTGGGTTCATGAATTCGAACAACAGGCCGTAAACGCCGATCATGATCAGGATCA‑GCGCTACGCTGGGGTTGGTGATGACCGCCAGAAACCGTGTGCGCCAGTCCGGCAGATGCt > 8:205119/1‑149 (MQ=255) cagATACCACCGACCACACCGCCCACCGCAGAACCTGGGTTCATGAATTCGAACAACAGGCCGTAAACGCCGATCATGATCAGGATCA‑GCGCTACGCTGGGGTTGGTGATGACCGCCAGAAACCGTGTGCGCCAGTCCGGCAGATGCTc < 4:189326/149‑1 (MQ=255) agATACCACCGACCACACCGCCCACCGCAGAACCTGGGTTCATGAATTCGAACAACAGGCCGTAAACGCCGATCATGATCAGGATCA‑GCGCTACGCTGGGGTTGGTGATGACCGCCAGAAACCGTGTGCGCCAGTCCGGCAGATGCTc > 4:194920/1‑148 (MQ=255) agATACCACCGACCACACCGCCCACCGCAGAACCTGGGTTCATGAATTCGAACAACAGGCCGTAAACGCCGATCATGATCAGGATCA‑GCGCTACGCTGGGGTTGGTGATGACCGCCAGAAACCGTGTGCGCCAGTCCGGCAGATGCTCg < 1:239990/149‑1 (MQ=255) accGACCACACCGCCCACCGCAGAACCTGGGTTCATGAATTCGAACAACAGGCCGTAAACGCCGATCATGATCAGGATCA‑GCGCTACGCTGGGGTTGGTGATGACCGCCAGAAACCGTGTGCGCCAGTCCGGCAGATGCTCGACCACGc > 4:208130/1‑149 (MQ=255) aCCACACCGCCCACCGCAGAACCTGGGTTCATGAATTCGAACAACAGGCCGTAAACGCCGATCATGATCAGGATCA‑GCGCTACGCTGGGGTTGGTGATGACCGCaggcgccagcgtggtcgagcatctgccggactggcgcacacggtt > 2:22748‑M1/1‑104 (MQ=255) aCCACACCGCCCACCGCAGAACCTGGGTTCATGAATTCGAACAACAGGCCGTAAACGCCGATCATGATCAGGATCA‑GCGCTACGCTGGGGTTGGTGATGACCGCCAGAAACCGTGTGCGCCAGTCCGGc < 5:249786/129‑1 (MQ=255) aCCACACCGCCCACCGCAGAACCTGGGTTCATGAATTCGAACAACAGGCCGTAAACGCCGATCATGATCAGGATCA‑GCGCTACGCTGGGGTTGGTGATGACCGCCAGAAACCGTGTGCGCCAGTCCGGc > 6:249786/1‑129 (MQ=255) ccACACCGCCCACCGCAGAACCTGGGTTCATGAATTCGAACAACAGGCCGTAAACGCCGATCATGATCAGGATCA‑GCGCTACGCTGGGGTTGGTGATGACCGCCAGAAACCGTGTGCGCCAGTCCGGCAGATGCTCGACCACGCTGgcg > 7:216041/1‑149 (MQ=255) ccACACCGCCCACCGCAGAACCTGGGTTCATGAATTCGAACAACAGGCCGTAAACGCCGATCATGATCAGGATCA‑GCGCTACGCTGGGGTTGGTGATGACCGCCAGAAACCGTGTGCGCCAGTCCGGCAGATGCTCGACCACGCTGgcg < 1:14947/149‑1 (MQ=255) cacaCCGCCCACCGCAGAACCTGGGTTCATGAATTCGAACAACAGGCCGTAAACGCCGATCATGATCAGGATCA‑GCGCTACGCTGGGGTTGGTGATGACCGCCAGAAACCGTGTGCGCCAGTCCGGCAGATGCTCGACCACGCTGgcgc > 4:51740/1‑149 (MQ=255) cACCGCAGAACCTGGGTTCATGAATTCGAACAACAGGCCGTAAACGCCGATCATGATCAGGATCA‑GCGCTACGCTGGGGTTGGTGATGACCGCCAGAAACCGTGTGCGCCAGTCCGGCAGATGCTCGACCACGCTGGCGCCTGCGGTCt < 7:145804/149‑1 (MQ=255) cACCGCAGAACCTGGGTTCATGAATTCGAACAACAGGCCGTAAACGCCGATCATGATCAGGATCA‑GCGCTACGCTGGGGTTGGTGATGACCGCCAGAAACCGTGTGCGCCAGTCCGGCAGATGCTCGACCACGCTGGCGCCTGCGGTCt < 5:209770/149‑1 (MQ=255) ccGCAGAACCTGGGTTCATGAATTCGAACAACAGGCCGTAAACGCCGATCATGATCAGGATCA‑GCGCTACGCTGGGGTTGGTGATGACCGCaggcgccagcgtggtcgagcatctgccggactggcgcacacggtttctggcggtcatc < 7:45439‑M1/149‑59 (MQ=255) cGCAGAACCTGGGTTCATGAATTCGAACAACAGGCCGTAAACGCCGATCATGATCAGGATCA‑GCGCTACGCTGGGGTTGGTGATGACCGCaggcgccagcgtggtcgagcatctgccggactggcgcacacggtttctggcggtcatca < 1:22748‑M1/149‑60 (MQ=255) gCAGAACCTGGGTTCATGAATTCGAACAACAGGCCGTAAACGCCGATCATGATCAGGATCA‑GCGCTACGCTGGGGTTGGTGATGACCGCCAGAAACCGTGTGCGCCAGTCCGGCAGATGCTCGACCACGCTGGCGCCTGCGGTCTGCaa > 7:298922/1‑149 (MQ=255) gCAGAACCTGGGTTCATGAATTCGAACAACAGGCCGTAAACGCCGATCATGATCAGGATCA‑GCGCTACGCTGGGGTTGGTGATGACCGCCAGAAACCGTGTGCGCCAGTCCGGCAGATGCTCGACCACGCTGGCGCCTGCGGTCTGCaa < 2:114033/149‑1 (MQ=255) cAGAACCTGGGTTCATGAATTCGAACAACAGGCCGTAAACGCCGATCATGATCAGGATCA‑GCGCTACGCTGGGGTTGGTGATGACCGCCAGAAACCGTGTGCGCCAGTCCGGCAGATGCTCGACCACGCTGGCGCCTGCGGTCTGCAAc > 7:23421/1‑149 (MQ=255) aaCCTGGGTTCATGAATTCGAACAACAGGCCGTAAACGCCGATCATGATCAGGATCA‑GCGCTACGCTGGGGTTGGTGATGACCGCCAGAAACCgt < 6:86043/95‑1 (MQ=255) aaCCTGGGTTCATGAATTCGAACAACAGGCCGTAAACGCCGATCATGATCAGGATCA‑GCGCTACGCTGGGGTTGGTGATGACCGCCAGAAACCgt > 5:86043/1‑95 (MQ=255) aCCTGGGTTCATGAATTCGAACAACAGGCCGTAAACGCCGATCATGATCAGGATCA‑GCGCTACGCTGGGGTTGGTGATGACCGCCAGAAACCGTGTGCGCCAGTCCGGCAGATGCTCGACCACGCTGGCGCCTGCGGTCTGCAACTGcc < 7:181033/149‑1 (MQ=255) aCCTGGGTTCATGAATTCGAACAACAGGCCGT‑AACGCCGATCATGATCAGGATCA‑GCGCTACGCTGGGGTTGGTGATGACCGCCAGAAACCGTGTGCGCCAGTCCGGCAGATGCTCGACCACGCTGGCGCCTGCGGTCTGCAACTGCCg < 8:288528/149‑1 (MQ=255) cTGGGTTCATGAATTCGAACAACAGGCCGTAAACGCCGATCATGATCAGGATCA‑GCGCTACGCTGGGGTTGGTGATGACCGCCAGAAACCGTGTGCGCCAGTCCGGCAGATGCTCGACCACGCTGGCGCCTGCGGTCTGCAACTGCCGt < 2:299867/149‑1 (MQ=255) ggTTCATGAATTCGAACAACAGGCCGTAAACGCCGATCATGATCAGGATCA‑GCGCTACGCTGGGGTTGGTGATGACCGCCAGAAACCGTGTGCGCCAGTCCGGCAGATGCTCGACCACGCTGGCGCCTGCGGTCTGCAACTGCCGTgg < 3:51740/148‑1 (MQ=255) gTTCATGAATTCGAACAACAGGCCGTAAACGCCGATCATGATCAGGATCA‑GCGCTACGCTGGGGTTGGTGATGACCGCCAGAAACCGTGTGCGCCAGTCCGGCAGATGCTCGACCACGCTGGCGCCTGCGGTCTGCAACTGCCGTGGtt < 6:242294/149‑1 (MQ=255) aaTTCGAACAACAGGCCGTAAACGCCGATCATGATCAGGATCA‑GCGCTACGCTGGGGTTGGTGATGACCGCCAGAAACCGTGTGCGCCAGTCCGGCAGATGCTCGACCACGCTGGCGCCTGCGGTCTGCAACTGCCGTGGTTggccggc > 3:310703/1‑149 (MQ=255) gAACAACAGGCCGTAAACGCCGATCATGATCAGGATCA‑GCGCTACGCTGGGGTTGGTGATGACCGCCAGAAACCGTGTGCGCCAGTCCGGCAGATGCTCGACCACGCTGGCGCCTGCGGTCTGCAACTGCCGTGGTTGGCCGGCCACCt > 1:133215/1‑149 (MQ=255) gAACAACAGGCCGTAAACGCCGATCATGATCAGGATCA‑GCGCTACGCTGGGGTTGGTGATGACCGCCAGAAACCGTGTGCGCCAGTCCGGCAGATGCTCGACCACGCTGGCGCCTGCGGTCTGCAACTGCCGTGGTTGGCCGGCCACCt < 2:133215/149‑1 (MQ=255) aacaGGCCGTAAACGCCGATCATGATCAGGATCA‑GCGCTACGCTGGGGTTGGTGATGACCGCCAGAAACCGTGTGCGCCAGTCCGGCAGATGCTCGACCACGCTGGCGCCTGCGGTCTGCAACTGCCGTGGTTggcc < 5:33988/137‑1 (MQ=255) aacaGGCCGTAAACGCCGATCATGATCAGGATCA‑GCGCTACGCTGGGGTTGGTGATGACCGCCAGAAACCGTGTGCGCCAGTCCGGCAGATGCTCGACCACGCTGGCGCCTGCGGTCTGCAACTGCCGTGGTTggcc > 6:33988/1‑137 (MQ=255) tccGTAATCGCCGTTCATGTTCTGGATCA‑GCGCTACGCTGGGGTTGGTGATGACCGCCAGAAACCTTGTGCGCCAGTCCGGCAGATGCTCGACCACGCTGGCGCCTGCGGTCTGCAACTGCCGTGGTTGGCCGGCCACCTGAAGCGtt < 8:256831/147‑1 (MQ=255) gCCGTAAACGCCGATCATGATCAGGATCA‑GCGCTACGCTGGGGTTGGTGATGACCGCCAGAAACCGTGTGCGCCAGTCCGGCAGATGCTCGACCACGCTGGCGCCTGCGGTCTGCAACTGCCGTGGTTGGCCGGCCACCTGAAGCGttt > 5:237075/1‑149 (MQ=255) gCCGTAAACGCCGATCATGATCAGGATCA‑GCGCTACGCTGGGGTTGGTGATGACCGCCAGAAACCGTGTGCGCCAGTCCGGCAGATGCTCGACCACGCTGGCGCCTGCGGTCTGCAACTGCCGTGGTTGGCCGGCCACCTGAAGCGttt > 8:12023/1‑149 (MQ=255) ccGTAAACGCCGATCATGATCAGGATCATGCGCTACGCTGGGGTTGGTGATGACCGCCAGAAACCGTGTGCGCCAGTCCGGCAGATGCTCGACCACGCTGGCGCCTGCGGTCTGCAACTGCCGTGGTTGGCCGGCCACCTGAAGCGttt > 1:182278/1‑149 (MQ=255) gTAAACGCCGATCATGATCAGGATCA‑GCGCTACGCTGGGGTTGGTGATGACCGCCAGAAACCGTGTGCGCCAGTCCGGCAGATGCTCGACCACGCTGGCGCCTGCGGTCTGCAACTGCCGTGGTTGGCCGGCCACCTGAAGCGTTTTGc < 8:23421/149‑1 (MQ=255) tAAACGCCGATCATGATCAGGATCA‑GCGCTACGCTGGGGTTGGTGATGACCGCCAGAAACCGTGTGCGCCAGTCCGGCAGATGCTCGACCACGCTGGCGCCTGCGGTCTGCAACTGCCGTGGTTGGCCGGCCACCTGAAGCGTTTTGcc < 1:137481/149‑1 (MQ=255) aaCGCCGATCATGATCAGGATCA‑GCGCTACGCTGGGGTTGGTGATGACCGCCAGAAACCGTGTGCGCCAGTCCGGCAGATGCTCGACCACGCTGGCGCCTGCGGTCTGCAACTGCCGTGGTTGGCCGGCCACCTGAAGCGTTTTGCCGt > 8:105462/1‑149 (MQ=255) ccGATCATGATCAGGATCA‑GCGCTACGCTGGGGTTGGTGATGACCGCCAGAAACCGTGTGCGCCAGTCCGGCAGATGCTCGACCACGCTGGCGCCTGCGGTCTGCAACTGCCGTGGTTGGCCGGCCACCTGAAGCGTTTTGCCGTCGAg < 7:205119/149‑1 (MQ=255) aTCATGATCAGGATCA‑GCGCTACGCTGGGGTTGGTGATGACCGCCAGAAACCGTGTGCGCCAGTCCGGCAGATGCTCGACCACGCTGGCGCCTGCGGTCTGCAACTGCCGTGGTTGGCCGGCCACCTGAAGCGTTTTGCCGTCGAGCtt < 8:298922/149‑1 (MQ=255) cATGATCAGGATGA‑GGGGTACGCTGGGGTTGGTGATGACCGCCAGAATCCGTGTGCGCCAGTCCGGCAGATGCTCGAGCACGCTGGCGCCTGCGGTCTGCAACTGCCGTGGTTTGCCGTCCACCTGAAGCGTTTTGCCGTCGAGCTTg < 6:237075/148‑1 (MQ=255) gatcaggatca‑gCGCTACGCTGGGGTTGGTGATGACCGCCAGAAACCGTGTGCGCCAGTCCGGCAGATGCTCGACCAGGCTGGCGCCTGCGGTCTGCAACTGCCGTGGTTGGCCGGCCACCTGGAGCGTTTTGCCGTCGAGCTTgcg > 1:102391/1‑147 (MQ=255) atcaggatca‑gCGCTACGCTGGGGTTGGTGATGACCGCCAGAAACCGTGTGCGCCAGTCCGGCAGATGCTCGACCACGCTGGCGCCTGCGGTCTGCAACTGCCGTGGTTGGCCGGCCACCTGAAGCGTTTTGCCGTCGAGCTTGCgcag > 6:50425/1‑149 (MQ=255) tcaggatca‑gCGCTACGCTGGGGTTGGTGATGACCGCCAGAAACCGTGTGCGCCAGTCCGGCAGATGCTCGACCACGCTGGCGCCTGCGGTCTGCAACTGCCGTGGTTGGCCGGCCACCTGGAGCGTTTTGCCGTCGAGCTTGCgcagc < 2:102391/149‑1 (MQ=255) gatca‑gCGCTACGCTGGGGTTGGTGATGACCGCCAGAAACCGTGTGCGCCAGTCCGGCAGATGCTCGACCACGCTGGCGCCTGCGGTCTGCAACTGCCGTGGTTGGCCGGCCACCTGAAGCGTTTTGCCGTCGAGCTTGCGCAGCAGGt > 3:30604/1‑149 (MQ=255) a‑gCCCTACGCTGGGGTTGGTGATGACCGCCAGAAACCGTGTGCGCCAGTCCGGCAGATGCTCGACCACGCTGGCGCCTGCGGTCTGCAACTGCCGTGGTTGGCCGGCCACCTGAAGCGTTTTGCCGTCGAGCTTGCGCAGCAGGTcag < 4:311415/148‑1 (MQ=255) gcgcTACGCTGGGGTTGGTGATGACCGCCAGAAACCGTGTGCGCCAGTCCGGCAGATGCTCGACCACGCTGGCGCCTGCGGTCTGCAACTGCCGTGGTTGGCCGGCCACCTGAAGCGTTTTGCCGTCGAGCTTGCGCAGCAGGTcaggc < 5:50425/149‑1 (MQ=255) gcgcTACGCTGGGGTTGGTGATGACCGCCAGAAACCGTGTGCGCCAGTCCGGCAGATGCTCGACCACGCTGGCGCCTGCGGTCTGCAACTGCCGTGGTTGGCCGGCCACCTGAAGCGTTTTGCCGTCGAGCTTGCGCAGCAGGTcaggc < 5:210002/149‑1 (MQ=255) cgcTACGCTGGGGTTGGTGATGACCGCCAGAAACCGTGTGCGCCAGTCCGGCAGATGCTCGACCACGCTGGCGCCTGCGGTCTGCAACTGCCGTGGTTGGCCGGCCACCTGAAGCGTTTTGCCGTCGAGCTTGCGCAGCAGGTcaggca < 7:105462/149‑1 (MQ=255) cgcTACGCTGGGGTTGGTGATGACCGCCAGAAACCGTGTGCGCCAGTCCGGCAGATGCTCGACCACGCTGGCGCCTGCGGTCTGCAACTCCCGTGGTTGGCCGGCCACCTCAAGCGTTTTGCCGTCGAGCTTGCGCAGCAGGTcagg > 7:266085/1‑147 (MQ=255) gcTACGCTGGGGTTGGTGATGACCGCCAGAAACCGTGTGCGCCAGTCCGGCAGATGCTCGACCACGCTGGCGCCTGCGGTCTGCAACTGCCGTGGTTGGCCGGCCACCTGAAGCGTTTTGCCGTCGAGCTTGCGCAGCAGGTcaggcag < 7:12023/149‑1 (MQ=255) gcTACGCTGGGGTTGGTGATGACCGCCAGAAACCGTGTGCGCCAGTCCGGCAGATGCTCGACCACGCTGGCGCCTGCGGTCTGCAACTGCCGTGGTTGGCCGGCCACCTGAAGCGTTTTGCCGTCGAGCTTGCGCAGCAGGTcaggcag < 8:216041/149‑1 (MQ=255) gCTGGGGTTGGTGATGACCGCCAGAAACCGTGTGCGCCAGTCCGGCAGATGCTCGACCACGCTGGCGCCTGCGGTCTGCAACTGCCGTGGTTGGCCGGCCACCTGAAGCGTTTTGCCGTCGAGCTTGCGCAGCAGGTCAGGCAGGTCAt < 2:208634/149‑1 (MQ=255) gggTTGGTGATGACCGCCAGAAACCGTGTGCGCCAGTCCGGCAGATGCTCGACCACGCTGGCGCCTGCGGTCTGCAACTGCCGTGGTTGGCCGGCCACCTGAAGCGTTTTGCCGTCGAGCTTGCGCAGCAGGTCAGGCAGGTCATCGGc > 6:24798/1‑149 (MQ=255) ggTTGGTGATGACCGCCAGAAACCGTGTGCGCCAGTCCGGCAGATGCTCGACCACGCTGGCGCCTGCGGTCTGCAACTGCCGTGGTTGGCCGGCCACCTGAAGCGTTTTGCCGTCGAGCTTGCGCAGCAGGTCAGGCAGGTCATCGGcc < 4:310703/149‑1 (MQ=255) tgatgaCCGCCAGAAACCGTGTGCGCCAGTCCGGCAGATGCTCGACCACGCTGGCGCCTgcggtcatcaccaaccccagcgtagcgctgatcctgatcatgatcggcgtttacggcctgttgttcgaattcatgaacccaggttctgcg < 1:22748‑M2/149‑91 (MQ=255) gatgaCCGCCAGAAACCGTGTGCGCCAGTCCGGCAGATGCTCGACCACGCTGGCGCCTgcggtcatcaccaaccccagcgtagcgctgatcctgatcatgatcggcgtttacggcctgttgttcgaattcatgaacccaggttctgcgg < 7:45439‑M2/149‑92 (MQ=255) aCCGCCAGAAACCGTGTGCGCCAGTCCGGCAGATGCTCGACCACGCTGGCGCCTGCGGTCTGCAACTGCCGTGGTTGGCCGGCCACCTGAAGCGTTTTGCCGTCGAGCTTGCGCAGCAGGTCAGGCAGGTCATCGGCCACCTgatcgat < 2:182278/149‑1 (MQ=255) aCCGCCAGAAACCGTGTGCGCCAGTCCGGCAGATGCTCGACCACGCTGGCGCCTGCGGTCTGCAACTGCCGTGGTTGGCCGGCCACCTGAAGCGTTTTGCCGTCGAGCTTGCGCAGCAGGTCAGGCAGGTCATCGGCCACCTgatcga < 4:30604/148‑1 (MQ=255) ccGCCAGAAACCGTGTGCGCCAGTCCGGCAGATGCTCGACCACGCTGGCGCCTGCGGTCTGCAACTGCCGTGGTTGGCCGGCCACCTGAAGCGTTTTGCCGTCGAGc < 1:294311/107‑1 (MQ=255) ccGCCAGAAACCGTGTGCGCCAGTCCGGCAGATGCTCGACCACGCTGGCGCCTGCGGTCTGCAACTGCCGTGGTTGGCCGGCCACCTGAAGCGTTTTGCCGTCGAGc > 2:294311/1‑107 (MQ=255) | AACAGCTGCAGCGCATACAGCGCCAGCAGCAGGCAGATACCACCGACCACACCGCCCACCGCAGAACCTGGGTTCATGAATTCGAACAACAGGCCGTAAACGCCGATCATGATCAGGATCA‑GCGCTACGCTGGGGTTGGTGATGACCGCCAGAAACCGTGTGCGCCAGTCCGGCAGATGCTCGACCACGCTGGCGCCTGCGGTCTGCAACTGCCGTGGTTGGCCGGCCACCTGAAGCGTTTTGCCGTCGAGCTTGCGCAGCAGGTCAGGCAGGTCATCGGCCACCTGATCGAT > NC_002947/250325‑250617 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |