| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 448271 = | 71 (1.410) | 4 (0.090) | 4/240 | NT | 5.9% | coding (850/1284 nt) | PP_0369 | diguanylate cyclase |
| ? | NC_002947 | 448347 = | 61 (1.300) | coding (926/1284 nt) | PP_0369 | diguanylate cyclase | |||||
ACGAGGCTTATCAGATGGCCTTCCGTGACGAGCTGACTGGCCTGCCGGGGCGCCGTGCGCTGAACGAGCGCATGCAGCGCCTGGGGCGTAACTATGTGATCGCCATGACCGATGTCGACCACTTCAAGAAATTCAATGACACCCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGTGCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTACCGTTATGGCGGGGAGGAGTTCGCCCTGGTGTTCGCCGGCAAGACCGCCGCGGAATGCGTGCCGCATGT > NC_002947/448128‑448419 | gtcctgcgggcggttgtgctgatcgcgcaggtgcatcacgtaattggcgatcacttcacgcacggcttccacatgcggcacgcattccgcggcggtcttgccggcgaacaccagggcgaactcctccccgccataacggtaggCACgg > 2:108497‑M1/144‑148 (MQ=255) tcctgcgggcggttgtgctgatcgcgcaggtgcatcacgtaattggcgatcacttcacgcacggcttccacatgcggcacgcattacgcggcggtcttgccggcgaaccccagtgcgaactcctccccgccataacggtaggCACGGcc < 6:24680‑M1/7‑1 (MQ=255) gAGGCTTATCAGATGGCCTTCCGTGACGAGCTGACTGGCCTGCCGGGGCGCCGTGCGCTGAACGAGCGCATGCAGCGCCTGGGGCGTAACTATGTGATCGCCATGACCGATGTCGACCACTTCAAGAAATTCAATGACACCCACGGCCa > 5:26710/1‑149 (MQ=255) ctgcgggcggttgtgctgatcgcgcaggtgcatcacgtaattggcgatcacttcacgcacggcttccacatgcggcacgcattccgcggcggtcttgccggcgaacaccagggcgaactcctccccgccataacggtaggCACGGCCa > 4:299896‑M1/141‑148 (MQ=255) aGGCTTATCAGATGGCCTTCCGTGACGAGCTGACTGGCCTGCCGGGGCGCCGTGCGCTGAACGAGCGCATGCAGCGCCTGGGGCGTAACTATGTGATCGCCATGACCGATGTCGACCACTTCAAGAAATTCAATGACACCCACGGCCAc > 1:24857/1‑149 (MQ=255) tCAGATGGCCTTCCGTGACGAGCTGACTGGCCTGCCGGGGCGCCGTGCGCTGAACGAGCGCATGCAGCGCCTGGGGCGTAACTATGTGATCGCCATGACCGATGTCGACCACTTCAAGAAATTCAATGACACCCACGGCCACGATGTCg < 6:318980/149‑1 (MQ=255) tCAGATGGCCTTCCGTGACGAGCTGACTGGCCTGCCGGGGCGCCGTGCGCTGAACGAGCGCATGCAGCGCCTGGGGCGTAACTATGTGATCGCCATGACCGATGTCGACCACTTCAAGAAATTCAATGACACCCACGGCCACGATGTCg > 7:135208/1‑149 (MQ=255) ttgtgctgatcgcgcaggtgcatcacgtaattggcgatcacttcacgcacggcttccacatgcggcacgcattccgcggcggtcttgccggcgaacaccagggcgaactcctccccgccataacggtaggCACGGCCACGATGTCGGt < 4:287618‑M1/18‑1 (MQ=255) gATGGCCTTCCGTGACGAGCTGACTGGCCTGCCGGGGCGCCGTGCTCTGAACGAGCGCATGCAGCGCCTGGGGCGTAACTATGTGATCGCCATGACCGATGTCGACCACTTCAAGAAATTCAATGACACCCACGGCCACGATGTCGGTg < 5:159135/149‑1 (MQ=255) cTTCCGTGACGAGCTGACTGGCCTGCCGGGGCGCCGTGCGCTGAACGAGCGCATGCAGCGCCTGGGGCGTAACTATGTGATCGCCATGACCGATGTCGACCACTTCAAGAAATTCAATGACACCCACGGCCACGATGTCGGTGACCAgg < 5:103089/149‑1 (MQ=255) tGACGAGCTGACTGGCCTGCCGGGGCGCCGTGCGCTGAACGAGCGCATGCAGCGCCTGGGGCGTAACTATGTGATCGCCATGACCGATGTCGACCACTTCAAGAAATTCAATGACACCCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGtgctgc > 1:119612/1‑149 (MQ=255) aGCTGACTGGCCTGCCGGGGCGCCGTGCGCTGAACGAGCGCATGCAGCGCCTGGGGCGTAACTATGTGATCGCCATGACCGATGTCGACCACTTCAAGAAATTCAATGACACCCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGTGCTGCGGTTg < 8:135208/149‑1 (MQ=255) gCTGACTGGCCTGCCGGGGCGCCGTGCGCTGAACGAGCGCATGCAGCGCCTGGGGCGTAACTATGTGATCGCCATGACCGATGTCGACCACTTCAAGAAATTCTATGACACCCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGTGCTGCGGTTgg < 5:139741/149‑1 (MQ=255) gCTGACTGGCCTGCCGGGGCGCCGTGCGCTGAACGAGCGCATGCAGCGCCTGGGGCGTAACTATGTGATCGCCATGACCGATGTCGACCACTTCAAGAAATTCAATGACACCCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGTGCTGCg < 1:25153/144‑1 (MQ=255) gCTGACTGGCCTGCCGGGGCGCCGTGCGCTGAACGAGCGCATGCAGCGCCTGGGGCGTAACTATGTGATCGCCATGACCGATGTCGACCACTTCAAGAAATTCAATGACACCCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGTGCTGCg > 2:25153/1‑144 (MQ=255) gCTGACTGGCCTGCCGGGGCGCCGTGCGCTGAACGAGCGCATGCAGCGCCTGGGGCGTAACTATGTGATCGCCATGACCGATGTCGACCACTTCAAGAAATTCAATGACACCCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGTGCTGCGGTTgg > 7:96518/1‑149 (MQ=255) cTGCCGGGGCGCCGTGCGCTGAACGAGCGCATGCAGCGCCTGGGGCGTAACTATGTGATCGCCATGACCGATGTCGACCACTTCAAGAAATTCAATGACACCCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGTGCTGCGGTTGGTCGCCAGCCg > 6:252534/1‑149 (MQ=255) cTGCCGGGGCGCCGTGCGCTGAACGAGCGCATGCAGCGCCTGGGGCGTAACTATGTGATCGCCATGACCGATGTCGACCACTTCAAGAAATTCAATGACACCCACAGCCACGATGTCGGTGACCAGGTGCTGCGGTTGGTCGCCAGCCg > 5:50013/1‑149 (MQ=255) ccGGGGCGCCGTGCGCTGAACGAGCGCATGCAGCGCCTGGGGCGTAACTATGTGATCGCCATGACCGATGTCGACCACTTCAAGAAATTCAATGACACCCACGGCCACGATGTCGGTGACCCGGTGCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCtt < 2:220868/149‑1 (MQ=255) 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gcCGTGCGCTGAACGAGCGCATGCAGCGCCTGGGGCGTAACTATGTGATCGCCATGACCGATGTCGACCACTTCAAGAAATTCAATGACACCCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGTGCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAg < 8:13209/149‑1 (MQ=255) gcTGAACGAGCGCATGCAGCGCCTGGGGCGTAACTATGTGATCGCCATGACCGATGTCGACCACTTCAAGAAATTCAATGACACCCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGTGCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACcg > 1:298217/1‑149 (MQ=255) gcTGAACGAGCGCATGCAGCGCCTGGGGCGTAACTATGTGATCGCCATGACCGATGTCGACCACTTCAAGAAATTCAATGACACCCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGTGCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACcg > 8:8639/1‑149 (MQ=255) cTGAACGAGCGCATGCAGCGCCTGGGGCGTAACTATGTGATCGCCATGACCGATGTCGACCACTTCAAGAAATTCAATGACACCCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGTGCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACcgg > 2:218983/1‑149 (MQ=255) cTGAACGAGCGCATGCAGCGCCTGGGGCGTAACTATGTGATCGCCATGACCGATGTCGACCACTTCAAGAAATTCAATGACACCCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGTGCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACcgg < 2:121727/149‑1 (MQ=255) gAGCGCATGCAGCGCCTGGGGCGTAACTATGTGATCGCCATGACCGATGTCGACCACTTCAAGAAATTCAATGACACCCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGTGCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTgg > 2:282816/1‑149 (MQ=255) gcgcATGCAGCGCCTGGGGCGTAACTATGTGATCGCCATGACCGATGTCGACCACTTCAAGAAATTCAATGACACCCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGTGCTGCGGTTGGTCGCCAGcc < 3:298585/122‑1 (MQ=255) gcgcATGCAGCGCCTGGGGCGTAACTATGTGATCGCCATGACCGATGTCGACCACTTCAAGAAATTCAATGACACCCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGTGCTGCGGTTGGTCGCCAGcc > 4:298585/1‑122 (MQ=255) gcgcATGCAGCGCCTGGGGCGTAACTATGTGATCGCCATGACCGATGTCGACCACTTCAAGAAATTCAATGACACCCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGTGCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGcc > 6:326929/1‑149 (MQ=255) gcgcATGCAGCGCCTGGGGCGTAACTATGTGATCGCCATGACCGATGTCGACCACTTCAAGAAATTCAATGACACCCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGTGCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGcc > 6:39871/1‑149 (MQ=255) cgcATGCAGCGCCTGGGGCGTAACTATGTGATCGCCATGACCGATGTCGACCACTTCAAGAAATTCAATGACACCCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGTGCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCg < 1:282816/149‑1 (MQ=255) cacatgcggcacgcattccgcggcggtcttgccggcgaacaccagggcgaactcctccccgccataacggtaggCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGTGCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGt > 1:226095‑M1/75‑149 (MQ=255) catgcggcacgcattccgcggcggtcttgccggcgaacaccagggcgaactcctccccgccataacggtaggCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGTGCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGc > 3:287618‑M1/73‑149 (MQ=255) aTGCAGCGCCTGGGGCGTAACTATGTGATCGCCATGACCGATGTCGACCACTTCAAGAAATTCAATGACACCCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGTGCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGc < 8:71719/149‑1 (MQ=255) atgcggcacgcattccgcggcggtcttgccggcgaacaccagggcgaactcctccccgccataacggtaggCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGTGCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGcc > 7:244777‑M1/72‑149 (MQ=255) gCAGCGCCTGGGGCGTAACTATGTGATCGCCATGACCGATGTCGACCACTTCAAGAAATTCAATGACACCCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGTGCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGcc > 3:271571/1‑148 (MQ=255) cAGCGCCTGGGGCGTAACTATGTGATCGCCATGACCGATGTCGACCACTTCAAGAAATTCAATGACACCCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGTGCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTa > 8:191392/1‑149 (MQ=255) cAGCGCCTGGGGCGTAACTATGTGATCGCCATGACCGATGTCGACCACTTCAAGAAATTCAATGACACCCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGTGCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTa < 5:39871/149‑1 (MQ=255) cAGCGCCTGGGGCGTAACTAGGGGATCGCCATGACCGATGTCGACCACTTCAAGAAATTCAATGACACCCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGTGCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTa < 7:116347/149‑1 (MQ=255) aGCGCCTGGGGCGTAACTATGTGATCGCCATGACCGATGTCGACCACTTCAAGAAATTCAATGACACCCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGTGCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTAc > 1:59854/1‑149 (MQ=255) cTGGGGCGTAACTATGTGATCGCCATGACCGATGTCGACCACTTCAAGAAATTCAATGACACCCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGTGCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTACCGTTa < 8:96518/149‑1 (MQ=255) 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aTGTCGACCACTTCAAGAAATTCAATGACACCCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGTGCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTACCGTTATGGCGGGGAGGAGTTCGcc > 8:138805/1‑137 (MQ=255) gACCACTTCAAGAAATTCAATGACACCCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGTGCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTACCGTTATGGCggg > 3:126535/1‑120 (MQ=255) gACCACTTCAAGAAATTCAATGACACCCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGTGCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTACCGTTATGGCggg < 4:126535/120‑1 (MQ=255) gACCACTTCAAGAAATTCAATGACACCCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGTGCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTACCGTTATGGCGGGGAGGAGTTc > 6:10279/1‑129 (MQ=255) gACCACTTCAAGAAATTCAATGACACCCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGTGCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTACCGTTATGGCGGGGAGGAGTTc < 5:10279/129‑1 (MQ=255) gACCACTTCAAGAAATTCAATGACACCCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGTGCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTACCGTTATGGCGGGGAGGAGTTCGCCCTGGTGTTCGCCgg > 4:90890/1‑146 (MQ=255) 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acCCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGTGCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTACCGTTATGGCGGGGAGGAGTTCGCCCTGGTGTTCGCCGGCAAGACCGCCGCGGAATGCGTGCCGCa > 3:262014/1‑149 (MQ=255) cccACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGTGCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTACCGTTATGGCGGGGAGGAGTTCGCCCTGGTGTTCGCCGGCAAGACCGCCGCGGAATGCGTGCCGCAt < 3:224998/149‑1 (MQ=255) ccACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGTGCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTACCGTTATGGCGGGGAGGAGTTCGCCCTGGTGTTCGCCGGCAAGACCGCCGCGGAATGCGTGCCGCAtg < 2:267418/149‑1 (MQ=255) ccACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGTGCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTACCGTTATGGCGGGGAGGAGTTCGCCCTGGTGTTCGCCGGCAAGACCGCCGCGGAATGCGTGCCGCAtg > 1:267418/1‑149 (MQ=255) ccACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGTGCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTACCGTTATGGCGGGGAGGAGTTCGCCCTGGTGTTCGCCGGCAAGACCGCCGCGGAATGCGTGCCGCAtg > 1:214126/1‑149 (MQ=255) ccACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGTGCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTACCGTTATGGCGGGGAGGAGTTAGCCCTGGTGTTCGCCGGCAAGACCGCCGCGGAATGCGTGCCGCAtg > 7:45476/1‑149 (MQ=255) CACGGCAACGATGTCGGTGACCAGGGGCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAATGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTACCGTTATGGCGGGGAGGAGTTCGCCCTGGTGTTCGCCGGCAAGACCGCCGCGGAATGCGTGCCGCAtgt > 2:277905‑M1/1‑149 (MQ=255) | ACGAGGCTTATCAGATGGCCTTCCGTGACGAGCTGACTGGCCTGCCGGGGCGCCGTGCGCTGAACGAGCGCATGCAGCGCCTGGGGCGTAACTATGTGATCGCCATGACCGATGTCGACCACTTCAAGAAATTCAATGACACCCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGTGCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTACCGTTATGGCGGGGAGGAGTTCGCCCTGGTGTTCGCCGGCAAGACCGCCGCGGAATGCGTGCCGCATGT > NC_002947/448128‑448419 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |