| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 448271 = | 71 (1.410) | 4 (0.090) | 4/240 | NT | 5.9% | coding (850/1284 nt) | PP_0369 | diguanylate cyclase |
| ? | NC_002947 | 448347 = | 61 (1.300) | coding (926/1284 nt) | PP_0369 | diguanylate cyclase | |||||
ATGCAGCGCCTGGGGCGTAACTATGTGATCGCCATGACCGATGTCGACCACTTCAAGAAATTCAATGACACCCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGTGCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTACCGTTATGGCGGGGAGGAGTTCGCCCTGGTGTTCGCCGGCAAGACCGCCGCGGAATGCGTGCCGCATGTGGAAGCCGTGCGTGAAGTGATCGCCAATTACGTGATGCACCTGCGCGATCAGCACAACCGCCCGCAGGAC > NC_002947/448199‑448489 | catgcggcacgcattccgcggcggtcttgccggcgaacaccagggcgaactcctccccgccataacggtaggCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGTGCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGc > 3:287618‑M1/73‑149 (MQ=255)aTGCAGCGCCTGGGGCGTAACTATGTGATCGCCATGACCGATGTCGACCACTTCAAGAAATTCAATGACACCCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGTGCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGc < 8:71719/149‑1 (MQ=255) atgcggcacgcattccgcggcggtcttgccggcgaacaccagggcgaactcctccccgccataacggtaggCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGTGCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGcc > 7:244777‑M1/72‑149 (MQ=255) gCAGCGCCTGGGGCGTAACTATGTGATCGCCATGACCGATGTCGACCACTTCAAGAAATTCAATGACACCCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGTGCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGcc > 3:271571/1‑148 (MQ=255) cAGCGCCTGGGGCGTAACTATGTGATCGCCATGACCGATGTCGACCACTTCAAGAAATTCAATGACACCCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGTGCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTa > 8:191392/1‑149 (MQ=255) cAGCGCCTGGGGCGTAACTATGTGATCGCCATGACCGATGTCGACCACTTCAAGAAATTCAATGACACCCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGTGCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTa < 5:39871/149‑1 (MQ=255) cAGCGCCTGGGGCGTAACTAGGGGATCGCCATGACCGATGTCGACCACTTCAAGAAATTCAATGACACCCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGTGCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTa < 7:116347/149‑1 (MQ=255) aGCGCCTGGGGCGTAACTATGTGATCGCCATGACCGATGTCGACCACTTCAAGAAATTCAATGACACCCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGTGCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTAc > 1:59854/1‑149 (MQ=255) cTGGGGCGTAACTATGTGATCGCCATGACCGATGTCGACCACTTCAAGAAATTCAATGACACCCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGTGCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTACCGTTa < 8:96518/149‑1 (MQ=255) gTAACTATGTGATCGCCATGACCGATGTCGACCACTTCAAGAAATTCAATGACACCCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGTGCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTACCGTTATGGCggg < 2:59854/149‑1 (MQ=255) tAACTATGTGATCGCCATGACCGATGTCGACCACTTCAAGAAATTCAATGACACCCACGGCCACGATAACGGTGACCAGGTGCTGGGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTACCGTTATGGCggg > 1:97103/1‑148 (MQ=255) aCTATGTGATCGCCATGACCGATGTCGACCACTTCAAGAAATTCAATGACACCCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGTGCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTACCGTTATGGCGGgga < 7:191392/148‑1 (MQ=255) gATCGCCATGACCGATGTCGACCACTTCAAGAAATTCAATGACACCCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGTGCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTACCGTTATGGCgggg > 2:166016/1‑140 (MQ=255) gATCGCCATGACCGATGTCGACCACTTCAAGAAATTCAATGACACCCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGTGCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTACCGTTATGGCgggg < 1:166016/140‑1 (MQ=255) aTCGCCATGACCGATGTCGACCACTTCAAGAAATTCAATGACACCCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGTGCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTACCGTTATGGCGGGGAGGAGt > 6:323325/1‑145 (MQ=255) aTCGCCATGACCGATGTCGACCACTTCAAGAAATTCAATGACACCCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGTGCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTACCGTTATGGCGGGGAGGAGt < 5:323325/145‑1 (MQ=255) aTCGCCATGACCGATGTCGACCACTTCAAGAAATTCAATGACACCCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGTGCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTACCGTTATGGCGGGGAGGAGTTCGc > 4:224998/1‑149 (MQ=255) ccATGACCGATGTCGACCACTTCAAGAAATTCAATGACACCCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGTGCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTACCGTTATGGCGGGGAGGAGTTCGCCCTg < 2:298217/149‑1 (MQ=255) aTGACCGATGTCGACCACTTCAAGAAATTCAATGACACCCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGTGCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTACCGTTATGGCGGGGAGGAGTTCGCCCTGgt < 2:24857/149‑1 (MQ=255) aTGACCGATGTCGACCACTTCAAGAAATTCAATGACACCCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGTGCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTACCGTTATGGCGGGGAGGAGTTCGCCCTGgt < 7:174701/149‑1 (MQ=255) aTGACCGATGTCGACCACTTCAAGAAATTCAATGACACCCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGTGCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTACCGTTATGGCGGGGAGGAGTTCGCCCTGgt < 2:104792/149‑1 (MQ=255) ccGATGTCGACCACTTCAAGAAATTCAATGACACCCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGTGCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTACCGTTATGGCGGGGAGGAGTTCGCCCTGGTGTTc < 2:110148/149‑1 (MQ=255) aTGTCGACCACTTCAAGAAATTCAATGACACCCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGTGCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTACCGTTATGGCGGGGAGGAGTTCGcc < 7:138805/137‑1 (MQ=255) aTGTCGACCACTTCAAGAAATTCAATGACACCCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGTGCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTACCGTTATGGCGGGGAGGAGTTCGcc > 8:138805/1‑137 (MQ=255) gACCACTTCAAGAAATTCAATGACACCCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGTGCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTACCGTTATGGCggg > 3:126535/1‑120 (MQ=255) gACCACTTCAAGAAATTCAATGACACCCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGTGCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTACCGTTATGGCggg < 4:126535/120‑1 (MQ=255) gACCACTTCAAGAAATTCAATGACACCCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGTGCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTACCGTTATGGCGGGGAGGAGTTc > 6:10279/1‑129 (MQ=255) gACCACTTCAAGAAATTCAATGACACCCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGTGCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTACCGTTATGGCGGGGAGGAGTTc < 5:10279/129‑1 (MQ=255) gACCACTTCAAGAAATTCAATGACACCCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGTGCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTACCGTTATGGCGGGGAGGAGTTCGCCCTGGTGTTCGCCgg > 4:90890/1‑146 (MQ=255) gACCACTTCAAGAAATTCAATGACACCCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGTGCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTACCGTTATGGCGGGGAGGAGTTCGCCCTGGTGTTCGCCgg < 3:90890/146‑1 (MQ=255) gACCACTTCAAGAAATTCAATGACACCCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGTGCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTACCGTTATGGCGGGGAGGAGTTCGCCCTGGTGTTCGCCGGc > 3:54800/1‑147 (MQ=255) aCCACTTCAAGAAATTCAATGACACCCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGTGCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTACCGTTATGGCGGGGAGGAGTTCGCCCTGGTGTTCGCCGGCAAg < 5:252534/149‑1 (MQ=255) aCTTCAAGAAATTCAATGACACCCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGTGCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTACCGTTATGGCGGGGAGGAGTTCGCCCTGGTGTTCGCCGGCAAGAcc > 4:16280/1‑149 (MQ=255) aGAAATTGAATGACACCCACGGCCACGATGTCGGTGACGAGGTGCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTAGCGTTATGGCGGGGAGGAGTTCGCCCTGGTGTGCGCCGGCAAGACCGCcgcg > 5:24680/1‑149 (MQ=255) gAAATTCAATGACACCCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGTGCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTACCGTTATGGCGGGGAGGAGTTCGCCCTGGTGTTCGCCGGCAAGACCGCCGCgg < 3:16280/149‑1 (MQ=255) ttCAATGACACCCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGTGCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTACCGTTATGGCGGGGAGGAGTTCGCCCTGGTGTTCGCCGGCAAGACCGCCGCGGAATg > 8:285345/1‑149 (MQ=255) aaTGACACCCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGTGCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTACCGTTATGGCGGGGAGGAGTTCGCCCTGGTGTTCGCCGGCAAGACCGCCGCGGAATGCGt < 1:218983/149‑1 (MQ=255) tGACACCCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGTGCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTACCGTTAt < 8:71287/94‑1 (MQ=255) tGACACCCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGTGCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTACCGTTAt > 7:71287/1‑94 (MQ=255) tGACACCCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGTGCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTACCGTTATGGCGGGGAGGAGTTCGCCCTGGTGTTCGCCGGCAAGACCGCCGCGGAATGCGTGc < 7:285345/149‑1 (MQ=255) acCCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGTGCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTACCGTTATGGCGGGGAGGAGTTCGCCCTGGTGTTCGCCGGCAAGACCGCCGCGGAATGCGTGCCGCa > 3:262014/1‑149 (MQ=255) ggcacggccaccgccggtgaccttggacaagcggctggcgaccaaccgcagcacctggtcaccgacatcgtggccgtgCCTACCGTTATGGCGGGGAGGAGTTCGCCCTGGTGTTCGCCGGCAAGACCGCCGCGGAATGCGTGCCGCAt > 7:244777‑M2/79‑149 (MQ=255) cccACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGTGCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTACCGTTATGGCGGGGAGGAGTTCGCCCTGGTGTTCGCCGGCAAGACCGCCGCGGAATGCGTGCCGCAt < 3:224998/149‑1 (MQ=255) gcacggccaccgccggtgaccttggacaagcggctggcgaccaaccgcagcacctggtcaccgacatcgtggccgtgCCTACCGTTATGGCGGGGAGGAGTTCGCCCTGGTGTTCGCCGGCAAGACCGCCGCGGAATGCGTGCCGCAtg > 3:287618‑M2/78‑149 (MQ=255) ccACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGTGCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTACCGTTATGGCGGGGAGGAGTTCGCCCTGGTGTTCGCCGGCAAGACCGCCGCGGAATGCGTGCCGCAtg > 1:214126/1‑149 (MQ=255) ccACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGTGCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTACCGTTATGGCGGGGAGGAGTTCGCCCTGGTGTTCGCCGGCAAGACCGCCGCGGAATGCGTGCCGCAtg < 2:267418/149‑1 (MQ=255) ccACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGTGCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTACCGTTATGGCGGGGAGGAGTTCGCCCTGGTGTTCGCCGGCAAGACCGCCGCGGAATGCGTGCCGCAtg > 1:267418/1‑149 (MQ=255) ccACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGTGCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTACCGTTATGGCGGGGAGGAGTTAGCCCTGGTGTTCGCCGGCAAGACCGCCGCGGAATGCGTGCCGCAtg > 7:45476/1‑149 (MQ=255) CACGGCAACGATGTCGGTGACCAGGGGCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAATGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTACCGTTATGGCGGGGAGGAGTTCGCCCTGGTGTTCGCCGGCAAGACCGCCGCGGAATGCGTGCCGCAtgt > 2:277905‑M1/1‑149 (MQ=255) acggccaccgccggtgaccttggacaagcggctggcgaccaaccgcagcacctggtcaccgacatcgtggccgtgCCTACCGTTATGGCGGGGAGGAGTTCGCCCTGGTGTTCGCCGGCAAGACCGCCGCGGAATGCGTGCCGCAtgtg > 1:226095‑M2/76‑149 (MQ=255) CACGATGTCGGTGACCAGGTGCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTACCGTTATGGCGGGGAGGAGTTCGCCCTGGTGTTCGCCGGCAAGACCGCCGCGGAATGCGTGCCGCAtg > 8:117569‑M1/1‑142 (MQ=255) CACGATGTCGGTGACCAGGTGCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTACCGTTATGGCGGGGAGGAGTTCGCCCTGGTGTTCGCCGGCAAGACCGCCGCGGAATGCGTGCCGCAtg < 7:117569‑M1/142‑1 (MQ=255) ACGATGTCGGTGACCAGGTGCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTACCGTTATGGCGGGGAGGAGTTCGCCCTGGTGTTCGCCGGCAAGACCGCCGCGGAATGCGTGCCGCATGTGGAAGcc < 3:244382‑M1/149‑1 (MQ=255) gATGTCGGTGACCAGGTGCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTACCGTTATGGCGGGGAGGAGTTCGCCCTGGTGTTCGCCGGCAAGACCGCCGCGGAATGCGTGCCGCATGTGGAAGCcgt < 4:244382/149‑1 (MQ=255) gACCAGGTGCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTACCGTTATGGCGGGGAGGAGTTCGCCCTGGTGTTCGCCGGCAAGACCGCCGCGGa < 2:222469/116‑1 (MQ=255) gACCAGGTGCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTACCGTTATGGCGGGGAGGAGTTCGCCCTGGTGTTCGCCGGCAAGACCGCCGCGGa > 1:222469/1‑116 (MQ=255) cAGGTGCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTACCGTTATGGCGGGGAGGAGTTCGCCCTGGTGTTCGCCGGCAAGACCGCCGCGGAATGCGTGCCGCATGTGGAAGCCGTGCGTGAAGTGAt < 3:9052/149‑1 (MQ=255) cAGGTGCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTACCGTTATGGCGGGGAGGAGTTCGCCCTGGTGTTCGCCGGCAAGACCGCCGCGGAATGCGTGCCGCATGTGGAAGCCGTGCGTGAAGTGAt > 5:16920/1‑149 (MQ=255) aGGTGCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTACCGTTATGGCGGGGAGGAGTTCGCCCTGGTGTTCGCCGGCAAGACCGCCGCGGAATGCGTGCCGCATGTGGAAGCCGTGCGTGAAGTGATc < 5:326929/149‑1 (MQ=255) ctgcGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTACCGTTATGGCGGGGAGGAGTTCGCCCTGGTGTTCGCCGGCAAGACCGCCGCGGAATGCGTGCCGCATGTGGAAGCCGTGCGTGAAGTGATCGCCaa > 7:160611/1‑149 (MQ=255) tgcGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTACCGTTATGGCGGGGAGGAGTTCGCCCTGGTGTTCGCCGGCAAGACCGCCGCGGAATGCGTGCCGCATGTGGAAGCCGTGCGTGAAg > 5:173264/1‑138 (MQ=255) tgcGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTACCGTTATGGCGGGGAGGAGTTCGCCCTGGTGTTCGCCGGCAAGACCGCCGCGGAATGCGTGCCGCATGTGGAAGCCGTGCGTGAAg < 6:173264/138‑1 (MQ=255) gCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTACCGTTATGGCGGGGAGGAGTTCGCCCTGGTGTTCGCCGGCAAGACCGCCGCGGAATGCGTGCCGCATGTGGAAGCCGTGCGTGAAGTGATCGCCAATTACGTGATGCa > 7:118839/1‑149 (MQ=255) ccAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTACCGTTATGGCGGGGAGGAGTTCGCCCTGGTGTTCGCCGGCAAGACCGCCGCGGAATGCGTGCCGCATGTGGAAGCCGTGCGTGAAGTGATCGCCAATTACGt > 6:83985/1‑142 (MQ=255) ccAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTACCGTTATGGCGGGGAGGAGTTCGCCCTGGTGTTCGCCGGCAAGACCGCCGCGGAATGCGTGCCGCATGTGGAAGCCGTGCGTGAAGTGATCGCCAATTACGt < 5:83985/142‑1 (MQ=255) ccAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTACCGTTATGGCGGGGAGGAGTTCGCCCTGGTGTTCGCCGGCAAGACCGCCGCGGAATGCGTGCCGCATGTGGAAGCCGTGCGTGAAGTGATCGCCAATTACGTGATGCAc > 5:40670/1‑149 (MQ=255) ttcGCTTGTCCAAGGTCACCGTCGGTGGCCGTGCCTACCGTTATGGCGGGGAGGAGTTCGCCCTGGTGTTCGCCGGCAAGACCGCCGCGGAATGCGTGCCGCATGTGGAAGCCGTGCGTGAAGTGATCGCCAATTACGTGATGc < 6:147167/142‑1 (MQ=255) gCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTACCGTTATGGCGGGGAGGAGTTCGCCCTGGTGTTCGCCGGCAAGACCGCCGCGGAATGCGTGCCGCATGTGGAAGCCGTGAGTGAAGTGATCGCCAATTACGTGATGCaagat > 5:147167/1‑145 (MQ=255) cGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTACCGTTATGGCGGGGAGGAGTTCGCCCTGGTGTTCGCCGGCAAGACCGCCGCGGAATGCGTGCCGCATGTGGAAGCCGTGCGTGAAGTGATCGCCAATTACGTGATGCACCTgc < 8:160611/148‑1 (MQ=255) tCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTACCGTTATGGCGGGGAGGAGTTCGCCCTGGTGTTCGCCGGCAAGACCGCcgcg < 3:298818/81‑1 (MQ=255) tCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTACCGTTATGGCGGGGAGGAGTTCGCCCTGGTGTTCGCCGGCAAGACCGCcgcg > 4:298818/1‑81 (MQ=255) ccAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTACCGTTATGGCGGGGAGGAGTTCGCCCTGGTGTTCGCCGGCAAGACCGCCGCGGAATGCGTGCCGCATGTGGAAGCCGTGCGTGAAGTGATCGCCAATTACGTGATGCACCTGCGCGATCAg < 4:262014/149‑1 (MQ=255) cAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTACCGTTATGGCGGGGAGGAGTTCGCCCTGGTGTTCGCCGGCAAGACCGCCGCGGAATGCGTGCCGCATGTGGAAGCCGTGCGTGAAGTGATCGCCAATTACGTGATGCACCTGCGCGATCAg < 6:40670/148‑1 (MQ=255) aaGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTACCGTTATGGCGGGGAGGAGTTCGCCCTGGTGTTCGCCGGCAAGACCGCCGCGGAATGCGTGCCGCATGTGGAAGCCGTGCGTGAAGTGATCGCCAATTACGTGATGCACCTGCGCGATCAGca < 4:54800/149‑1 (MQ=255) aaGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTACCGTTATGGCGGGGAGGAGTTCGCCCTGGTGTTCGCCGGCAAGACCGCCGCGGAATGCGTGCCGCATGTGGAAGCCGTGCGTGAAGTGATCGCCAATTACGTGATGCACCTGCGCGATCAGca > 4:243195/1‑149 (MQ=255) accgacatcgtggccgtgCCTACCGTTATGGCGGGGAGGAGTTCGCCCTGGTGTTCGCCGGCAAGACCGCCGCGGAATGCGTGCCGCATGTGGAAGCCGTGCGTGAAGTGATCGCCAATTACGTGATGCACCTGCGCGATCAGCACaa < 4:287618‑M2/130‑1 (MQ=255) aCCGGCGGTGGCCGTGCCTACCGTTATGGCGGGGAGGAGTTCGCCCTGGTGTTCGCCGGCAAGACCGCCGCGGAATGCGTGCCGCATGTGGAAGCCGTGCGTGAAGTGATCGCCAATTACGTGATGCACCTGCGCGATCAGCACAAcc < 7:8639/148‑1 (MQ=255) tggccgtgCCTACCGTTATGGCGGGGAGGAGTTCGCCCTGGTGTTCGCCGGCAAGACCGCCGCGGAATGCGTGCCGCATGTGGAAGCCGTGCGTGAAGTGATCGCCAATTACGTGATGCACCTGCGCGATCAGCACAACCGCCCGCAg > 4:299896‑M2/9‑148 (MQ=255) ggccgtgCCTACCGTTATGGCGGGGAGGAGTTCGCACTGGGGTTCGCCGGCAAGACCGCCGCGTAATGCGTGCCGCATGTGGAAGCCGTGCGTGAAGTGATCGCCAATTACGTGATGCACCTGCGCGATCAGCACAACCGCCCGCAGGa < 6:24680‑M2/142‑1 (MQ=255) ccgtgCCTACCGTTATGGCGGGGAGGAGTTCGCCCTGGTGTTCGCCGGCAAGACCGCCGCGGAATGCGTGCCGCATGTGGAAGCCGTGCGTGAAGTGATCGCCAATTACGTGATGCACCTGCGCGATCAGCACAACCGCCCGCAGGAc > 2:108497‑M2/6‑148 (MQ=255) | ATGCAGCGCCTGGGGCGTAACTATGTGATCGCCATGACCGATGTCGACCACTTCAAGAAATTCAATGACACCCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGTGCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTACCGTTATGGCGGGGAGGAGTTCGCCCTGGTGTTCGCCGGCAAGACCGCCGCGGAATGCGTGCCGCATGTGGAAGCCGTGCGTGAAGTGATCGCCAATTACGTGATGCACCTGCGCGATCAGCACAACCGCCCGCAGGAC > NC_002947/448199‑448489 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |