New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 468712 | 63 (1.250) | 4 (0.090) | 4/238 | NT | 6.6% | coding (2245/3744 nt) | PP_0386 | sensory box protein |
? | NC_002947 | = 468784 | 56 (1.210) | coding (2173/3744 nt) | PP_0386 | sensory box protein |
CTTGATGCTGGAGATGTCTGCAAAAACCGCCACGAAGTGGGTGATCTCGCGGTCGCTGTTGCGCACGGCGCTTATGGTCAGCCAGCTTGGGTAAAGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGT‑‑AAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGC‑GCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGGCCGAGGGCCTCGATCTCGCTGTAGCCGGTGATTTCGCTGAAGGCGCGGTTGACGGCACTGATGCGCTGGTCA > NC_002947/468566‑468857 | cTTGATGCTGGAGATGTCTGCAAAAACCGCCACGAAGTGGGTGATCTCGCGGTCGCTGTTGCGCACGGCGCTTATGGTCAGCCAGCTTGGGTAAAGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTcggcg < 1:5219/148‑1 (MQ=255) ttGATGCTGGAGATGTCTGCAAAAACCGCCACGAAGTGGGTGATCTCGCGGTCGCTGTTGCGCACGGCGCTTATGGTCAGCCAGCTTGGGTAAAGTTCGCCGTTCTTTCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTcggcgg > 8:103442/1‑148 (MQ=255) ttGATGCTGGAGATGTCTGCAAAAACCGCCACGAAGTGGGTGATCTCGCGGTCGCTGTTGCGCACGGCGCTTATGGTCAGCCAGCTTGGGTAAAGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTcggcgg > 8:28974/1‑148 (MQ=255) aTGCTGGAGATGTCTGCAAAAACCGCCACGAAGTGGGTGATCTCGCGGTCGCTGTTGCGCACGGCGCTTATGGTCAGCCAGCTTGGGTAAAGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGT‑‑aa < 6:294371/148‑1 (MQ=255) tCTGCAAAAACCGCCACGAAGTGGGTCATCTCGCGCTCGCTGTTGCGCACGGCGCTAATGGTCACCCAGCTTGGGTAAAGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGAAGATTTCGCCCTGCCAGAGGCCCTCGGCGGT‑‑AAGCTGGAGCCACAt > 4:25912/1‑149 (MQ=255) cTGCAAAAACCGCCACGAAGTGGGTGATCTCGCGGTCGCTGTTGCGCACGGCGCTTATGGTCAGCCAGCTTGGGTAAAGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGT‑‑AAGCTGGTGCCACATg < 1:303288/149‑1 (MQ=255) tGCAAAAACCGCCACGAAGTGGGTGATCTCGCGGTCGCTGTTGCGCACGGCGCTTATGGTCAGCCAGCTTGGGTAAAGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGT‑‑AAGCTGGTGCCACATgg > 1:10125/1‑149 (MQ=255) tGCAAAAACCGCCACGAAGTGGGTGATCTCGCGGTCGCTGTTGCGCACGGCGCTTATGGTCAGCCAGCTTGGGTAAAGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGT‑‑AAGCTGGTGCCACATgg > 2:253687/1‑149 (MQ=255) cAAAAACCGCCACGAAGTGGGTGATCTCGCGGTCGGTGTTGCGCACGGCGCTTATGGTCAGCCAGCTTGGGTAAAGTTCGCTGTTGTTGCGCTTGTTGTAGTTTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGT‑‑AAGCTGGTGCCACATGGcc < 4:96658/149‑1 (MQ=255) aaaaCCGCCACGAAGTGGGTGATCTCGCGGTCGCTGTTGCGCACGGCGCTTATGGTCAGCCAGCTTGGGTAAAGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGT‑‑AAGCTGGTGCCACATGGCCAg < 4:298128/149‑1 (MQ=255) aaaCCGCCACGAAGTGGGTGATCTCGCGGTCGCTGTTGCGCACGGCGCTTATGGTCAGCCAGCTTGGGTAAAGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGT‑‑AAGCTGGTGCCACATGGCCAgg < 2:10125/149‑1 (MQ=255) aCCGCCACGAAGTGGGTGATCTCGCGGTCGCTGTTGCGCACGGCGCTTATGGTCAGCCAGCTTGGGTAAAGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGT‑‑AAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTa < 7:28974/149‑1 (MQ=255) gCCACGAAGTGGGTGATCTCGCGGTCGCTGTTGCACAAGGAGCTTATGGTCAGCCAGCTTGGGTAAAGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGT‑‑AAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTCGa > 8:111664/1‑148 (MQ=255) ccACGAAGTGGGTGATCTCGCGGTCGCTGTTGCGCACGGCGCTTATGGTCAGCCAGCTTGGGTAAAGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGT‑‑AAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGa > 1:59613/1‑147 (MQ=255) cACGAAGTGGGTGATCTCGCGGTCGCTGTTGCGCACGGCGCTTATGGTCAGCCAGCTTGGGTAAAGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGT‑‑AAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAg > 4:233221/1‑149 (MQ=255) caGTGGGTGATCTCGCGGTCGCCGTTGCGCACGGCGCTTATGGGCAGCCAGCTTGGGTAAAGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGT‑‑AAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAgc‑g < 3:16526/146‑1 (MQ=255) aaGTGGGTGATCTCGCGGTCGCTGTTGCGCACGGCGCTTATGGTCAGCCAGCTTGGGTAAAGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGT‑‑AGGGTGGTGCCCCATGGCCAGGTAGAAAgc‑g > 4:16526/1‑147 (MQ=255) ggTGATCTCGCGGTCGCTGTTGCGCACGGCGCTTATGGTCAGCCAGCTTGGGTAAAGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGT‑‑AAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGC‑GCTGTCGt > 2:237509/1‑149 (MQ=255) gTGATCTCGCGGTCGCTGTTGCGCACGGCGCTTATGGTCAGCCAGCTTGGGTAAAGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGT‑‑AAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGC‑GCTGTCGTg > 1:12491/1‑149 (MQ=255) aTCTCGCGGTCGCTGTTGCGCACGGCGCTTATGGTCAGCCAGCTTGGGTAAAGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGT‑‑AAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGC‑GCTGTCGTGCTg > 1:149097/1‑149 (MQ=255) tctcGCGGTCGCTGTTGCGCACGGCGCTTATGGTCAGCCAGCTTGGGTAAAGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGT‑‑AAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGC‑GCTGTCGTGCTgg > 2:224523/1‑149 (MQ=255) tctcGCGGTCGCTGTTGCACACGGCGCTTATGGTCAGCCAGCTTGGGTAAAGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGT‑‑AAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGC‑GCTGTCGTGCTgg > 8:47684/1‑149 (MQ=255) tcGCGGTCGCTGTTGCGCACGGCGCTTATGGTCAGCCAGCTTGGGTAAAGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGT‑‑AAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGC‑GCTGTCGTGCTGGc > 3:165044/1‑148 (MQ=255) cgcgGTCGCTGTTGCGCACGGCGCTTATGGTCAGCCAGCTTGGGTAAAGTTCACCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCcagaccccgcgcctgctcgcctctggccagcacgacagcgctttctacc > 1:83795‑M1/1‑100 (MQ=255) gcgGTCGCTGTTGCGCACGGCGCTTATGGTCAGCCAGCTTGGGTAAAGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGT‑‑AAGCTGGTGCCACATGGCCAGCACGACAGC‑GCTTTCTACCTGGCCa < 3:25912/148‑1 (MQ=255) ggTCGCTGTTGCGCACGGCGCTTATGGTCAGCCAGCTTGGGTAAAGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGT‑‑AAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGC‑GCTGTCGTGCTGGCCagag < 5:184353/149‑1 (MQ=255) gCTGTTGCGCACGGCGCTTATGGTCAGCCAGCTTGGGTAAAGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGT‑‑AAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGC‑GCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGa < 7:103819/149‑1 (MQ=255) ttGCGCACGGCGCTTATGGTCAGCCAGCTTGGGTAAAGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGT‑‑AAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGC‑GCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGc < 4:165044/147‑1 (MQ=255) gcACGGCGCTTATGGTCAGCCAGCTTGGGTAAAGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGT‑‑AAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGC‑GCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGgcgc > 7:166448/1‑149 (MQ=255) aCGGCGGTTAATGGCCGCCAGCCTGGGTAAAGGTCGCCGTTCCTGCGCTTGGTGTAGCTTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGTTCTAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGC‑GCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGgcgc < 1:253687/149‑1 (MQ=255) aCGGCGCTTATGGTCAGCCAGCTTGGGTAAAGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGT‑‑AAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGC‑GCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCgg < 3:233221/149‑1 (MQ=255) cgcTTATGGTCAGCCAGCTTGGGTAAAGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGT‑‑AAGCTGGTGCCACATGCCCAGGTAGAAAGC‑GCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTc > 2:183914/1‑149 (MQ=255) gcTTATGGTCAGCCAGCTTGGGTAAAGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGT‑‑AAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGT‑GCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCt > 1:273842/1‑149 (MQ=255) cTTATGGTCAGCCAGCTTGGGTAAAGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGT‑‑AAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGC‑GCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTg > 5:302113/1‑149 (MQ=255) ttATGGTCAGCCAGCTTGGGTAAAGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGACCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGT‑‑AAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGC‑GCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGg < 7:160198‑M2/149‑2 (MQ=255) gTCAGCCAGCTTGGTGACAGTTCGCGGTTCTTGCGCTTGTTCTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGT‑‑AAGCTGGTGCCACATGGCCAGTTAGAAAGC‑GCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCTAGCAGGCGCGGGGTCTGgccgag > 8:247149‑M2/1‑143 (MQ=255) gTCAGCCAGCTTGGGTAAAGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCcagaccccgcgcctgctcgcctctggccagcacgacagcgctttctacctggccatgtggcaccagcttaccgccgag > 8:160599‑M1/1‑71 (MQ=255) gTCAGCCAGCTTGGGTAAAGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGT‑‑AAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGC‑GCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGgccga > 8:160198‑M2/1‑143 (MQ=255) tCAGCCAGCTTGGGTAAAGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCcagaccccgcgcctgctcgcctctggccagcacgacagcgctttctacctggccatgtggcaccagcttaccgccgagg < 2:83795‑M1/149‑80 (MQ=255) tCAGCCAGCTTGGGTAAAGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGT‑‑AAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGC‑TCTGTCGTGCTGGCCATAGGCGATCAGGCGCGGGGTCTGgccgagg > 7:47684‑M2/1‑142 (MQ=255) tCAGCCAGCTTGGGTAAAGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGT‑‑AAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGC‑GCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGgccgagg < 5:259324‑M2/149‑8 (MQ=255) agccagcTTGGGTAAAGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCcagaccccgcgcctgctcgcctctggccagcacgacagcgctttctacctggccatgtggcaccagcttaccgccgaggg < 7:160599‑M1/148‑81 (MQ=255) agccagcTTGGGTAAAGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGT‑‑AAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGC‑GCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCgt < 6:181113/124‑2 (MQ=255) agccagcTTGGGTAAAGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGT‑‑AAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGC‑GCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGa > 5:181113/1‑124 (MQ=255) agccagcTTGGGTAAAGTTCGCCGTCCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGT‑‑AAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGC‑GCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGgccgagggc < 2:162095‑M2/149‑10 (MQ=255) gccagcTTGGGTAAAGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGT‑‑AAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGC‑GCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGgccgagggcc > 6:259324‑M2/1‑139 (MQ=255) gccagcGTGGGTAAAGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGT‑‑AAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGC‑GCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCGGgccgagggcc > 4:40609‑M2/1‑139 (MQ=255) ccagcTTGGGTAAAGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGT‑‑AAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGCCGCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGgccgagggcc > 1:237509‑M2/1‑139 (MQ=255) cagcTTGGGTAAAGTTCGCCGTCCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGT‑‑AAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGC‑GCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGGCCGAGGGCCTc < 1:162095/149‑1 (MQ=255) cTTGGGTAAAGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGGCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGT‑‑AAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGC‑GCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGGCCGAGGGCCTCGa < 8:88322/148‑1 (MQ=255) ggTAAAGTTCGCCGTTCTTGCGGTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGT‑‑AAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGC‑GCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGGCCGAGGGCCTCGAtc < 8:203016/146‑1 (MQ=255) ggTAAAGTTCGCCGTTCTTGCGGTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGT‑‑AAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGC‑GCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGGCCGAGGGCCTCGAtc > 7:203016/1‑146 (MQ=255) gTAAAGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGT‑‑AAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAATC‑GCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGGCCGAGGGCCTCGATCTCGc > 7:119411/1‑149 (MQ=255) gTAAAGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGT‑‑AAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGC‑GCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCggg < 7:38338/124‑1 (MQ=255) gTAAAGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGT‑‑AAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGC‑GCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCggg > 8:38338/1‑124 (MQ=255) gTAAAGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGT‑‑AAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGC‑GCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGGCCGAGGGCCTCGATCTCGc < 2:28018/149‑1 (MQ=255) gTAAAGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGT‑‑AAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGC‑GCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGGCCGAGGGCCTCGATCTCGc > 6:154966/1‑149 (MQ=255) gTAAAGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGT‑‑AAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGC‑GCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGGCCGAGGGCCTCGATCTCGc > 4:241971/1‑149 (MQ=255) tAAAGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGT‑‑AAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGC‑GCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGGCCGAGGGCCTCGATCTCGCt > 8:155260/1‑149 (MQ=255) aaaGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCCGCCAGTGGCCCTCGGCGGT‑‑AAg < 1:108679/61‑1 (MQ=255) aaaGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCCGCCAGTGGCCCTCGGCGGT‑‑AAg > 2:108679/1‑61 (MQ=255) aGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGT‑‑AAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGC‑GCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGGCCGAGGGCCTCGATCTCGCTg > 4:266200/1‑147 (MQ=255) cGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGT‑‑AAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGC‑GCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGGCCGAGGGCCTCGATCTCGCTGTAGcc < 2:59613/148‑1 (MQ=255) gCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGT‑‑AAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGC‑GCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGGCCGAGGGCCTCGATCTCGCTGTAGCCgg < 2:12491/149‑1 (MQ=255) gCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGT‑‑AAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGC‑GCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGGCCGAGGGCCTCGATCTCGCTGTAGCCgg > 4:54036/1‑149 (MQ=255) tGCGCTTGTTTTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCATCGGCGGT‑‑AAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGC‑GCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGGCCGAGGGCCTCGATCTCGCTGTAGCCGGTGATTTc < 7:103442/148‑1 (MQ=255) gcTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGT‑‑AAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGC‑GCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGGCCGAGGGCCTCGATCTCGCTGTAGCCGGTGATTTCGCt > 8:68168/1‑148 (MQ=255) ttgtAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGT‑‑AAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGC‑GCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGGCCGAGGGCCTCGATCTCGCTGTAGCCGGTGATTTCGCTGAAgg < 3:54036/148‑1 (MQ=255) gtAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGT‑‑AAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGC‑GCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGc > 6:158979/1‑88 (MQ=255) gtAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGT‑‑AAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGC‑GCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGc < 5:158979/88‑1 (MQ=255) ttCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGT‑‑AAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGC‑GCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGGCCGAGGGCCTCGATCTCGCTGTAGCCGGTGATTTCGCTGAAGGCGCGGTTGa > 7:130879/1‑149 (MQ=255) ttCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGT‑‑AAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGC‑GCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGGCCGAGGGCCTCGATCTCGCTGTAGCCGGTGATTTCGCTGAAGGCGCGGTTGa > 5:116777/1‑149 (MQ=255) gCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGT‑‑AAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGC‑GCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGGCCGAGGGCCTCGATCTCGCTGTAGCCGGTGATTTCGCTGAAGGCGCGGTTGACgg > 4:107830/1‑149 (MQ=255) gCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGT‑‑AAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGC‑GCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGGCCGAGGGCCTCGATCTCGCTGTAGCCGGTGATTTCGCTGAAGGCGCGGTTGACg < 7:68168/148‑1 (MQ=255) gCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGT‑‑AAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGC‑GCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGGCCGAGGGCCTCGATCTCGCTGTAGCCGGTGATTTCGCTGAAGGCGCGGTTGACg < 8:166448/148‑1 (MQ=255) ccTGCCAGTGGCCCTCGGCGGT‑‑AAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGC‑GCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGGCCGAGGGCCTCGATCTCGCTGTAGCCGGTGATTTCGCTGAAGGCGCGGTTGACGGCa > 3:15884/1‑149 (MQ=255) ccTGCCAGTGGCCCTCGGCGGT‑‑AAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGC‑GCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGGCCGAGGGCCTCGATCTCGCTGTAGCCGGTGATTTCGCTGAAGGCGCGGTTGACGGCa > 1:217539/1‑149 (MQ=255) ccTGCCAGTGGCCCTCGGCGGT‑‑AAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGC‑GCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGGCCGAGGGCCTCGATCTCGCTGTAGCCGGTGATTTCGCTGAAGGCGCGGTTGACGGCa < 5:154966/149‑1 (MQ=255) tGGCCCTCGGCGGT‑‑AAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGT‑GCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGGCCGAGGGCCTCGATCTCGCTGTAGCCGGTGATTTCGCTGAAGGCGCGGTTGACGGCACTGATgcg < 2:273842/149‑1 (MQ=255) ggCCCTCGGCccgaccccgcgcctgctcgcctctggccagcacgacagcgctttctacctggccatgtggcaccagcttaccgccgagggccactggcagggcgaaatctacaacaagcgcaagaacggcgaactttacccacgctggc > 4:40609‑M1/1‑10 (MQ=255) ggCCCTCGGCcagaccccgcgcctgctcgcctctggccagcacgacagcggctttctacctggccatgtggcaccagcttaccgccgagggccactggcagggcgaaatctacaacaagcgcaagaacggcgaactttacccaagctgg > 1:237509‑M1/1‑10 (MQ=255) ggCCCTCGGCcagaccccgcgcctgctcgcctctggccagcacgacagcgctttctacctggccatgtggcaccagcttaccgccgagggccactggcagggcgaaatctacaacaagcgcaagaacggcgaactttacccaagctggc > 6:259324‑M1/1‑10 (MQ=255) gCCCTCGGCcagaccccgcgcctgctcgcctctggccagcacgacagcgctttctacctggccatgtggcaccagcttaccgccgagggccactggcagggcgaaatctacaacaagcgcaaggacggcgaactttacccaagctggct < 2:162095‑M1/149‑141 (MQ=255) cccTCGGCGGT‑‑AAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGC‑GCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGgccgagggccactggcagggcgaaatctacaacaagcgcaagaacggcgaactttacccaagctggct < 7:160599‑M2/148‑69 (MQ=255) ccTCGGCcagaccccgcgcctgctcgcctctggccagcacgacagcgctttctacctggccatgtggcaccagcttaccgccgagggccactggcagggcgaaatctacaacaagcgcaagaacggcgaactttacccaagctggctga < 5:259324‑M1/149‑143 (MQ=255) ccTCGGCcagaccccgcgcctgatcgcctatggccagcacgacagagctttctacctggccatgtggcaccagcttaccgccgagggccactggcagggcgaaatctacaacaagcgcaagaacggcgaactttacccaagctggctga > 7:47684‑M1/1‑7 (MQ=255) ccTCGGCGGT‑‑AAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGC‑GCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGgccgagggccactggcagggcgaaatctacaacaagcgcaagaacggcgaactttacccaagctggctga < 2:83795‑M2/149‑71 (MQ=255) ccTCGGCGGT‑‑AAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGC‑GCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGGCCGAGGGCCTCGATCTCGCTGTAGCCGGTGATTTCGCTGAAGGCGCGGTTGACGGCACTGATGCGCTgg < 8:130879/149‑1 (MQ=255) cTCGGCcagaccccgcgcctgctagcctctggccagcacgacagcgctttctaactggccatgtggcaccagcttaccgccgagggccactggcagggcgaaatctagaacaagcgcaagaaccgcgaactgtcaccaagctggctgac > 8:247149‑M1/1‑6 (MQ=255) cTCGGCGGT‑‑AAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGC‑GCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGgccgagggccactggcagggcgaaatctacaacaagcgcaagaacggcgaactttacccaagctggctgac > 8:160599‑M2/1‑78 (MQ=255) tCGGCcagaccccgcgcctgctcgcctctggccagcacgacagcgctttctacctggccatgtggcaccagcttaccgccgagggccactggcagggcgaaatctacaacaagcgcaagaacggcgaactttacccaagctggctgac > 8:160198‑M1/1‑5 (MQ=255) tCGGCGGT‑‑AAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGC‑GCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGGCCGAGGGCCTCGATCTCGCTGTAGCCGGTGATTTCGCTGAAGGCGCGGTTg < 2:21643/129‑1 (MQ=255) tCGGCGGT‑‑AAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGC‑GCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGGCCGAGGGCCTCGATCTCGCTGTAGCCGGTGATTTCGCTGAAGGCGCGGTTg > 1:21643/1‑129 (MQ=255) cggcggT‑‑AAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGC‑GCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGGCCGAGGGCCTCGATCTCGCTGTAGCCGGTGATTTCGCTGAAGGCGCGGTTGACGGCACTGATGCGCTGGTc > 1:252722/1‑148 (MQ=255) ccagaccccgcgcctgctcgcctctggccagcacgacagcgctttctacctggccatgtggcaccagcttaccgccgagggccactggcaggtcgaaatctacaacaagcgcaagaacggcgaactttacccaagctggctgaccataa < 7:160198‑M1/149‑149 (MQ=255) | CTTGATGCTGGAGATGTCTGCAAAAACCGCCACGAAGTGGGTGATCTCGCGGTCGCTGTTGCGCACGGCGCTTATGGTCAGCCAGCTTGGGTAAAGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGT‑‑AAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGC‑GCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGGCCGAGGGCCTCGATCTCGCTGTAGCCGGTGATTTCGCTGAAGGCGCGGTTGACGGCACTGATGCGCTGGTCA > NC_002947/468566‑468857 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |