New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 468712 | 63 (1.250) | 4 (0.090) | 4/238 | NT | 6.6% | coding (2245/3744 nt) | PP_0386 | sensory box protein |
? | NC_002947 | = 468784 | 56 (1.210) | coding (2173/3744 nt) | PP_0386 | sensory box protein |
CTTATGGTCAGCCAGCTTGGGTAAAGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGTAAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGC‑GCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGGCCGAGGGCCTCGATCTCGCTGTAGCCGGTGATTTCGCTGAAGGCGCGGTTGACGGCACTGATGCGCTGGTCAATGTCGGTAATCAGCACCCCTTCGGCAGTGTTCTCGAACACCGTGGCGGCCAGCTGCAGTTTTTCTTGCA > NC_002947/468636‑468927 | cTTATGGTCAGCCAGCTTGGGTAAAGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGTAAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGC‑GCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTg > 5:302113/1‑149 (MQ=255) ttATGGTCAGCCAGCTTGGGTAAAGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGACCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGTAAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGC‑GCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGg < 7:160198‑M2/149‑2 (MQ=255) gTCAGCCAGCTTGGTGACAGTTCGCGGTTCTTGCGCTTGTTCTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGTAAGCTGGTGCCACATGGCCAGTTAGAAAGC‑GCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCTAGCAGGCGCGGGGTCTGgccgag > 8:247149‑M2/1‑143 (MQ=255) gTCAGCCAGCTTGGGTAAAGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGTAAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGC‑GCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGgccga > 8:160198‑M2/1‑143 (MQ=255) tCAGCCAGCTTGGGTAAAGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGTAAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGC‑TCTGTCGTGCTGGCCATAGGCGATCAGGCGCGGGGTCTGgccgagg > 7:47684‑M2/1‑142 (MQ=255) tCAGCCAGCTTGGGTAAAGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGTAAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGC‑GCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGgccgagg < 5:259324‑M2/149‑8 (MQ=255) agccagcTTGGGTAAAGTTCGCCGTCCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGTAAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGC‑GCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGgccgagggc < 2:162095‑M2/149‑10 (MQ=255) gccagcTTGGGTAAAGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGTAAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGC‑GCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGgccgagggcc > 6:259324‑M2/1‑139 (MQ=255) gccagcGTGGGTAAAGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGTAAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGC‑GCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCGGgccgagggcc > 4:40609‑M2/1‑139 (MQ=255) ccagcTTGGGTAAAGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGTAAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGCCGCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGgccgagggcc > 1:237509‑M2/1‑139 (MQ=255) cagcTTGGGTAAAGTTCGCCGTCCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGTAAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGC‑GCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGGCCGAGGGCCTc < 1:162095/149‑1 (MQ=255) cTTGGGTAAAGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGGCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGTAAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGC‑GCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGGCCGAGGGCCTCGa < 8:88322/148‑1 (MQ=255) ggTAAAGTTCGCCGTTCTTGCGGTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGTAAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGC‑GCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGGCCGAGGGCCTCGAtc > 7:203016/1‑146 (MQ=255) ggTAAAGTTCGCCGTTCTTGCGGTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGTAAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGC‑GCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGGCCGAGGGCCTCGAtc < 8:203016/146‑1 (MQ=255) gTAAAGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGTAAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAATC‑GCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGGCCGAGGGCCTCGATCTCGc > 7:119411/1‑149 (MQ=255) gTAAAGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGTAAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGC‑GCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGGCCGAGGGCCTCGATCTCGc < 2:28018/149‑1 (MQ=255) gTAAAGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGTAAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGC‑GCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGGCCGAGGGCCTCGATCTCGc > 6:154966/1‑149 (MQ=255) gTAAAGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGTAAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGC‑GCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGGCCGAGGGCCTCGATCTCGc > 4:241971/1‑149 (MQ=255) tAAAGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGTAAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGC‑GCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGGCCGAGGGCCTCGATCTCGCt > 8:155260/1‑149 (MQ=255) aGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGTAAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGC‑GCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGGCCGAGGGCCTCGATCTCGCTg > 4:266200/1‑147 (MQ=255) cGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGTAAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGC‑GCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGGCCGAGGGCCTCGATCTCGCTGTAGcc < 2:59613/148‑1 (MQ=255) gCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGTAAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGC‑GCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGGCCGAGGGCCTCGATCTCGCTGTAGCCgg < 2:12491/149‑1 (MQ=255) gCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGTAAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGC‑GCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGGCCGAGGGCCTCGATCTCGCTGTAGCCgg > 4:54036/1‑149 (MQ=255) tGCGCTTGTTTTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCATCGGCGGTAAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGC‑GCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGGCCGAGGGCCTCGATCTCGCTGTAGCCGGTGATTTc < 7:103442/148‑1 (MQ=255) gcTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGTAAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGC‑GCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGGCCGAGGGCCTCGATCTCGCTGTAGCCGGTGATTTCGCt > 8:68168/1‑148 (MQ=255) ttgtAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGTAAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGC‑GCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGGCCGAGGGCCTCGATCTCGCTGTAGCCGGTGATTTCGCTGAAgg < 3:54036/148‑1 (MQ=255) ttCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGTAAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGC‑GCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGGCCGAGGGCCTCGATCTCGCTGTAGCCGGTGATTTCGCTGAAGGCGCGGTTGa > 7:130879/1‑149 (MQ=255) ttCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGTAAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGC‑GCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGGCCGAGGGCCTCGATCTCGCTGTAGCCGGTGATTTCGCTGAAGGCGCGGTTGa > 5:116777/1‑149 (MQ=255) gCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGTAAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGC‑GCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGGCCGAGGGCCTCGATCTCGCTGTAGCCGGTGATTTCGCTGAAGGCGCGGTTGACgg > 4:107830/1‑149 (MQ=255) gCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGTAAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGC‑GCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGGCCGAGGGCCTCGATCTCGCTGTAGCCGGTGATTTCGCTGAAGGCGCGGTTGACg < 8:166448/148‑1 (MQ=255) gCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGTAAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGC‑GCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGGCCGAGGGCCTCGATCTCGCTGTAGCCGGTGATTTCGCTGAAGGCGCGGTTGACg < 7:68168/148‑1 (MQ=255) ccTGCCAGTGGCCCTCGGCGGTAAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGC‑GCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGGCCGAGGGCCTCGATCTCGCTGTAGCCGGTGATTTCGCTGAAGGCGCGGTTGACGGCa > 3:15884/1‑149 (MQ=255) ccTGCCAGTGGCCCTCGGCGGTAAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGC‑GCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGGCCGAGGGCCTCGATCTCGCTGTAGCCGGTGATTTCGCTGAAGGCGCGGTTGACGGCa < 5:154966/149‑1 (MQ=255) ccTGCCAGTGGCCCTCGGCGGTAAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGC‑GCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGGCCGAGGGCCTCGATCTCGCTGTAGCCGGTGATTTCGCTGAAGGCGCGGTTGACGGCa > 1:217539/1‑149 (MQ=255) tGGCCCTCGGCGGTAAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGT‑GCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGGCCGAGGGCCTCGATCTCGCTGTAGCCGGTGATTTCGCTGAAGGCGCGGTTGACGGCACTGATgcg < 2:273842/149‑1 (MQ=255) cccTCGGCGGTAAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGC‑GCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGgccgagggccactggcagggcgaaatctacaacaagcgcaagaacggcgaactttacccaagctggct < 7:160599‑M2/148‑69 (MQ=255) ccTCGGCGGTAAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGC‑GCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGgccgagggccactggcagggcgaaatctacaacaagcgcaagaacggcgaactttacccaagctggctga < 2:83795‑M2/149‑71 (MQ=255) ccTCGGCGGTAAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGC‑GCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGGCCGAGGGCCTCGATCTCGCTGTAGCCGGTGATTTCGCTGAAGGCGCGGTTGACGGCACTGATGCGCTgg < 8:130879/149‑1 (MQ=255) cTCGGCGGTAAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGC‑GCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGgccgagggccactggcagggcgaaatctacaacaagcgcaagaacggcgaactttacccaagctggctgac > 8:160599‑M2/1‑78 (MQ=255) tCGGCGGTAAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGC‑GCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGGCCGAGGGCCTCGATCTCGCTGTAGCCGGTGATTTCGCTGAAGGCGCGGTTg < 2:21643/129‑1 (MQ=255) tCGGCGGTAAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGC‑GCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGGCCGAGGGCCTCGATCTCGCTGTAGCCGGTGATTTCGCTGAAGGCGCGGTTg > 1:21643/1‑129 (MQ=255) cggcggTAAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGC‑GCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGGCCGAGGGCCTCGATCTCGCTGTAGCCGGTGATTTCGCTGAAGGCGCGGTTGACGGCACTGATGCGCTGGTc > 1:252722/1‑148 (MQ=255) ggTAAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGC‑GCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGGCCGAGGGCCTCGATCTCGCTGTAGCCGGTGATTTCGCTGAAGGCGCGGTTGACGGCACTGATGCGCTGGTCAATGt > 7:142596/1‑149 (MQ=255) aGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGC‑GCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGGCCGAGGGCCTCGATCTCGCTGTAGCCGGTGATTTCGCTGAAGGCGCGGTTGACGGCACTGATGCGCTGGTCAATGTCgg < 3:241971/148‑1 (MQ=255) aGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGC‑GCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGGCCGAGGGCCTCGATCTCGCTGTAGCCGGTGATTTCGCTGAAGGCGCGGTTGACGGCACTGATGCGCTGGTCAATGTCGGt < 6:116777/149‑1 (MQ=255) ccACATGGCCAGGTAGAAAGC‑GCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGGCCGAGGGCCTCGATCTCg > 5:86187/1‑79 (MQ=255) ccACATGGCCAGGTAGAAAGC‑GCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGGCCGAGGGCCTCGATCTCg < 6:86187/79‑1 (MQ=255) ccACATGGCCAGGTAGAAAGC‑GCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGGCCGAGGGCCTCGATCTCGCTGTAGCCGGTGATTTCGCTGAAGGCGCGGTTGACGGCACTGATGCGCTGGTCAATGTCGGTAATCAGCa < 2:149097/149‑1 (MQ=255) acaTGGCCAGGTAGAAAGC‑GCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGGCCGAGGGCCTCGATCTCGCTGTAGCCGGTGATTTCGCTGAAGGCGCGGTTGACGGCACTGATGCGCTg < 7:225629/127‑1 (MQ=255) acaTGGCCAGGTAGAAAGC‑GCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGGCCGAGGGCCTCGATCTCGCTGTAGCCGGTGATTTCGCTGAAGGCGCGGTTGACGGCACTGATGCGCTg > 8:225629/1‑127 (MQ=255) gCCAGGTAGAAAGC‑GCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGGCCGAGGGCCTCGATCTCGCTGTAGCCGGTGATTTCGCTGAAGGCGCGGTTGACGGCACTGATGCGCTGGTCAATGTCGGTAATCAGCACCCCTTc < 2:217539/149‑1 (MQ=255) ccAGGTAGAAAGC‑GCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGGCCGAGGGCCTCGATCTCGCTGTAGCCGGTGATTTCGCTGAAGGCGCGGTTGACGGCACTGATGCGCTGGTCAATGTCGGTAATCAGCACCCCTTCg > 8:218684/1‑149 (MQ=255) ggTAGAAAGC‑GCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGgccgagggccactggcagggcgaaatctacaacaagcgcaagaacggtgaactttacccaagctggctgaccataagcgccgtgcgcaacagcgaccgcg > 1:83795‑M2/1‑49 (MQ=255) ggTAGAAAGC‑GCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGGCCGAGGGCCTCGATCTCGCTGTAGCCGGTGATTTCGCTGAAGGCGCGGTTGACGGGACTGATGCGCTGGTCAATGTCGGTAATCAGCACCCCTTCGGCa < 1:224523/149‑1 (MQ=255) gTAGAAAGC‑GCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGAGGGGTCTGGCCGAGGGCCTCGATCTCGCTGTAGCCGGTGATTTCGCTGAAGGCGCGGTTGACGGAACTGATGCGCTGGTCAATGTCGGTAATCAGCACCCCTTCGGCAg > 6:178650/1‑149 (MQ=255) tAGAAAGC‑GCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGGCCGAGGGCCTCGATCTCGCTGTAGCCGGTGATTTCGCTGAAGGCGCGGTTGACGGCACTGATGCGCTGGTCAATGTCGGTAATCAGCACCCCTTCGGCAgt < 8:142596/149‑1 (MQ=255) gc‑gcTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGGCCGAGGGCCTCGATCTCGCTGTAGCCGGTGATTTCGCTGAAGGCGCGGTTGACGGCACTGATGCGCTGGTCAATGTCGGTAATCAGCACCCCTTCGGCAGTGTtctc < 2:252722/149‑1 (MQ=255) gc‑gcTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGGCCGAGGGCCTCGATCTCGCTGTAGCCGGTGATTTCGCTGAAGGCGCGGGTGACGGCACTGATGCGCTGGTCAATGTCGGTAATCAGCACCCCTTCGGCAGTGTtctc < 6:302113/149‑1 (MQ=255) cTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGGCCGAGGGCCTCGATCTCGCTGTAGCCGGTGATTTCGCTGAAGGCGCGGTTGACGGCACTGATGCGCTGGTCAATGTCGGTAATCAGCACCACTTCGGCAGTGTTCTCGAACACCGTg < 5:178650/148‑1 (MQ=255) tGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGGCCGAGGGCCTCGATCTCGCTGTAGCCGGTGATTTCGCTGAAGGCGCGGTTGACGGCACTGATGCGCTGGTCAATGTCGGTAATCAGCACCCCTTCGGCAGTGTTCTCGAACACCGTggc < 7:111664/149‑1 (MQ=255) gCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGGCCGAGGGCCTCGATCTCGCTGTAGCCGGTGATTTCGCTGAAGGCGCGGTTGACGGCACTGATGCGCTGGTCAATGTCGGt > 7:58411/1‑108 (MQ=255) gCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGGCCGAGGGCCTCGATCTCGCTGTAGCCGGTGATTTCGCTGAAGGCGCGGTTGACGGCACTGATGCGCTGGTCAATGTCGGt < 8:58411/108‑1 (MQ=255) gCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGGCCGAGGGCCTCGATCTCGCTGTAGCCGGTGATTTCGCTGAAGGCGCGGTTGACGGCACTGATGCGCTGGTCAATGTCGGTAATCAGCACCCCTTCGGCAGTGTTCTCGAACACCGTggcgg < 7:218684/149‑1 (MQ=255) gagGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGGCCGAGGGCCTCGATCTCGCTGTAGCCGGTGATTTCGCTGAAGGCGCGGTTGACGGCACTGATGCGCTGGTCAATGTCGGTAATCAGCACCCCTTCGGCAGTGTACTCGAACACCGTGGCGGCCAg < 7:155260/149‑1 (MQ=255) gCGAGCAGGCGCGGGGTCTGGCCGAGGGCCTCGATCTCGCTGTAGCCGGTGATTTCGCTGAAGGCGCGGTTGACGGCACTGATGCGCTGGTCAATGTCGGTAATCAGCACCCCTTCGGCAGTGTTCTCGAACACCGTGGCGGCCAGCTg > 2:35717/1‑149 (MQ=255) cGAGCAGGCGCGGGGTCTGGCCGAGGGCCTCGATCTCGCTGTAGCCGGTGATTTCGCTGAAGGCGCGGTTGACGGCACTGATGCGCTGGTCAAAGTCGGTAATCAGCACCCCATCGGCAGTGTTCTCGAACACCGTGGCGGCCAGCTGc < 1:183914/149‑1 (MQ=255) gAGCAGGCGCGGGGTCTGGCCGAGGGCCTCGATCTCGCTGTAGCCGGTGATTTCGCTGAAGGCGCGGTTGACGGCACTGATGCGCTGGTCAATGTCGGTAATCAGCACCCCTTCGGCAGTGTTCTCGAACACCGTGGCGGCCAGCTg > 3:27948/1‑147 (MQ=255) gcgcGGGGTCTGGCCGAGGGCCTCGATCTCGCTGTAGCCGGTGATTTCGCTGAAGGCGCGGTTGACGGCACTGATGCGCTGGTCAATGTCGGTAATCAGCACCCCTTCGGCAGTGTTCTCGAACACCGTGGCGGCCAGCTGCAGttttt < 3:266200/149‑1 (MQ=255) gcgcGGGGTCTGGCCGAGGGCCTCGATCTCGCTGTAGCCGGTGATTTCGCTGAAGGCGCGGTTGACGGCACTGATGCGCTGGTCAATGTCGGTAATCAGCACCCCTTCGGCAGTGTTCTCGAACACCGTGGCGGCCAGCTGCAGttttt < 6:59848/149‑1 (MQ=255) cgGGGTCTGGCCGAGGGCCTCGTTCTCGCTGTAGCCGGTGATTTCGCTGAAGGCGCGGTTGACGGCACTGATGCGCTGGTCAATGTCGGTAATCAGCACCCCTTCGGCAGTGTTCTCGAACACCGTGGCGGCCAGCTGCAGTTTTTCtt < 8:119411/149‑1 (MQ=255) cgGGGTCTGGCCGAGGGCCTCGATCTCGCTGTAGCCGGTGATTTCGCTGAAGGCGCGGTTGACGGCACTGATGCGCTGGTCAATGTCGGTAATCAGCACCCCTTCGGCAGTGTTCTCGAACACCGTGGCGGCCAGCTGCAGTTTTTCtt < 4:27948/149‑1 (MQ=255) ggtgTCTGGCCGAGGGCCTCGATCTCGCTGTAGCCGGTGATTTCGCTGAAGGCGCGGTTGACGGCACTGATGCGCTGGTCAATGTCGGTAATCAGCACCCCTTCGGCAGTGTTCTCGAACACCGTGGCGGCCAGCTGCAGTTTTTCTTg < 2:99938/146‑1 (MQ=255) ggTCTGGCCGAGGGCCTCGATCTCGCTGTAGCCGGTGATTTCGCTGAAGGCGCGGTTGACGGCACTGATGCGCTGGTCAATGTCGGTAATCAGCACCCCTTCGGCAGTGTTCTCGAACACCGTGGCGGCCAGCTGCAGTTTTTCTTGCa > 6:88207/1‑149 (MQ=255) gTCTGGCCGAGGGCCTCGATCTCGCTGTAGCCGGTGATTTCGCTGAAGGCGCGGTTGACGGCACTGATGCGCTGGTCAATGTCGGTAATCAGCACCCCTTCGGCAGTGTTCTCGAACACCGTGGCGGCCAGCTGCAGTTTTTCTTGc > 4:57352/1‑147 (MQ=255) gTCTGGCCGAGGGCCTCGATCTCGCTGTAGCCGGTGATTTCGCTGAAGGCGCGGTTGACGGCACTGATGCGCTGGTCAATGTCGGTAATCAGCACCCCTTCGGCAGTGTTCTCGAACACCGTGGCGGCCAGCTGCAGTTTTTCTTGc < 3:57352/147‑1 (MQ=255) | CTTATGGTCAGCCAGCTTGGGTAAAGTTCGCCGTTCTTGCGCTTGTTGTAGATTTCGCCCTGCCAGTGGCCCTCGGCGGTAAGCTGGTGCCACATGGCCAGGTAGAAAGC‑GCTGTCGTGCTGGCCAGAGGCGAGCAGGCGCGGGGTCTGGCCGAGGGCCTCGATCTCGCTGTAGCCGGTGATTTCGCTGAAGGCGCGGTTGACGGCACTGATGCGCTGGTCAATGTCGGTAATCAGCACCCCTTCGGCAGTGTTCTCGAACACCGTGGCGGCCAGCTGCAGTTTTTCTTGCA > NC_002947/468636‑468927 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |