New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 822159 | 35 (0.690) | 4 (0.080) | 4/248 | NT | 9.6% | coding (1530/2412 nt) | PP_0707 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | = 822215 | 42 (0.870) | coding (1586/2412 nt) | PP_0707 | hypothetical protein |
CCCTGCTGTCGCCCCGACAGCCCGGTGGCCTGGCACTGGCGTCGACCCTGGGCCTGGCGCCTCGCCATCAGGCGCAGGCCAGCACCATACTGGC‑CGGCATCGGCCGCACTGTCGTGCTGTTCCTGGCACTGCTGCTGGTGTTGATGCCGTCGGGTACCAGCCCTAGCGAATTGCTGTTGAGTCTGGGCGACTGGGATGGGACCGGCGGCAAGGTGCTCGGCAACCTGAACATCGTGCCGCAGGACATCCTGCTGGCCTTGGCGATCTTCCTCGGTGGCCTGTTCGCCATCCGTGT > NC_002947/822011‑822305 | cccTGCTGTCGCCCCGACAGCCCGGTGGCCTGGCACTGGCGTCGACCCTGGGCCTGGCGCCTCGCCATCAGGCGCAGGCCAGCACCATACTGGC‑CGGCATCGGCCGCACTGTCGTGCTGTTCCTGGCACTGCTGCTGGTGTTGATGCCG > 1:24220‑M1/1‑149 (MQ=255) gatttgCCCCGACAGCCGGGTGGCCTGGCACTGGCGGCGCCCCTGGGCCTGGGGCCTGGCCATCTGGGGCAGGCCTGCACAATACTGGCTCGGCATCGGCCGCACTGTCGTGCTGTTCCTGGCACTGCTGCTGGTGTTGATGCCGTCgg < 1:92902/144‑1 (MQ=255) ctgTCGCCCCGACAGCCCGGTGGCCTGGCACTGGCGTCGACCCTGGGCCTGGCGCCTCGCCATCAGGCGCAGGCCAGCACCATACTGGC‑CGGCATCGGCCGCACTGTCGTGCTGTTCCTGGCACTGCTGCTGGTGTTGATGCCGTCgg < 5:101572/148‑1 (MQ=255) tgTCGCCCCGACAGCCCGGTGGCCTGGCACTGGCGTCGACCCTGGGCCTGGTGCCTCGCCATCAGGCGCAGGCCCGCACCATACTGGC‑CGGCATCGGCCGCACTGTCGTGCTGTTCCTGGCACTGCTGCTGGTGTTGATGCCGTCggg > 8:81103/1‑148 (MQ=255) gTCGCCCCGACAGCCCGGTGGCCTGGCACTGGCGTCGACCCTGGGCCTGGCGCCTCGCCATCAGGCGCAGGCCAGCACCATACTGGC‑CGGCATCGGCCGCACTGTCGTGCTGTTCCTGGCACTGCTGCTGGTGTTGATGCCGTCGGGTa > 8:94633/1‑149 (MQ=255) tCGCCCCGACAGCCCGGTGGCCTGGCACTGGCGTCGACCCTGGGCCTGGCGCCTCGCCATCAGGCGCAGGCCAGCACCATACTGGC‑CGGCATCGGCCGCACTGTCGTGCTGTTCCTGGCACTGCTGCTGGTGTTGATGCCGTCGGGt < 1:94702/147‑1 (MQ=255) ccccGACAGCCCGGTGGCCTTGCACTGTCTTCGACCCTGCGCCTCGCGCCTCGCCATCAGGCGCAGGCCACCACAATACTAGC‑CGGCATAGGCCGCACTGTCGTGCTGTTCCTCCCACTGCTACTGGTGTTGAAGCCGACgg > 2:92902/1‑142 (MQ=255) cgcGACAGCCCGGTGGCCTGGCACTGGCGTCGACCCTGGGCCTGGCGCCTCGCCATCAGGCGCTGGCCAGCACCATACTGGC‑CGGCATCGGCCGCACTGTCGTGCTGTTCCTGGCACTGCTGCTGGTGTTGATGCCGTCGGGTACCAGc < 7:74651/147‑1 (MQ=255) cccGACAGCCCGGTGGCCTGGCACTGGCGTCGACCCTGGGCCTGGCGCCTCGCCATCAGGCGCAGGCCAGCA‑CATACTGGC‑CGGCATCGGCCGCACTGTCGTGCTGTTCCTGGCACTGCTGCTGGTGTTGATGCCGTCGGGTACCAGcc > 6:101084/1‑149 (MQ=255) ggCCTGGCACTGGCGTCGACCCTGGGCCTGGCGCCTCGCCATCAGGCGCAGGCCAGCACCATACTGGC‑CGGCATCGGCCGCACTGTCGTGCTGTTCCTGGCACTGCTGCTGGTGTTGATGCCGTCGGGTACCAGCCCTAGCGAATTGCt < 4:309897/149‑1 (MQ=255) ccTGGCACTGGCGTCGACCCTGGGCCTGGCGCCTCGCCATCAGGCGCAGGCCAGCACCATACTGGC‑CGGCATCGGCCGCACTGTCGTGCTGTTCCTGGCACTGCTGCTGGTGTTGATGCCGTCGGGTACCAGCCCTAGc < 8:91287/139‑1 (MQ=255) ccTGGCACTGGCGTCGACCCTGGGCCTGGCGCCTCGCCATCAGGCGCAGGCCAGCACCATACTGGC‑CGGCATCGGCCGCACTGTCGTGCTGTTCCTGGCACTGCTGCTGGTGTTGATGCCGTCGGGTACCAGCCCTAGc > 7:91287/1‑139 (MQ=255) cTGGCACTGGCGTCGACCCTGGGCCTGGCGCCTCGCCATCAGGCGCAGGCCAGCACCATACTGGC‑CGGCATCGGCCGCACTGTCGTGCTGTTCCTGGCACTGATGCTGGTGTTGATGCCGccggtcccatcccagtcgcccagactcaa > 8:96105‑M1/1‑120 (MQ=255) cACTGGCGTCGACCCTGGGCCTGGCGCCTCGCCATCAGGCGCAGGCCAGCACCATACTGGC‑CGGCATCGGCCGCACTGTCGTGCTGTTCCTGGCACTGCTGCTGGTGTTGATGCCGTCGGGTACCAGCCCTAGCGAATTGCTGTTGAGt < 7:94633/149‑1 (MQ=255) aCTGGCGTCGACCCTGGGCCTGGCGCCTCGCCATCAGGCGCAGGCCAGCACCATACTGGC‑CGGCATCGGCCGCACTGTCGTGCTGTTCCTGGCACTGCTGCTGGTGTTGATGCCGTCGGGTAc > 7:220267/1‑123 (MQ=255) aCTGGCGTCGACCCTGGGCCTGGCGCCTCGCCATCAGGCGCAGGCCAGCACCATACTGGC‑CGGCATCGGCCGCACTGTCGTGCTGTTCCTGGCACTGCTGCTGGTGTTGATGCCGTCGGGTAc < 8:220267/123‑1 (MQ=255) gCGTCGACCCTGGGCCTGGCGCCTCGCCATCAGGCGCAGGCCAGCACCATACTGGC‑CGGCATCGGCCGCACTGTCGTGCTGTTCCTGGCACTGCTGCTGGTGTTGATGCCGTCGGGTACCAGCCCTAGc < 6:143303/129‑1 (MQ=255) gCGTCGACCCTGGGCCTGGCGCCTCGCCATCAGGCGCAGGCCAGCACCATACTGGC‑CGGCATCGGCCGCACTGTCGTGCTGTTCCTGGCACTGCTGCTGGTGTTGATGCCGTCGGGTACCAGCCCTAGc > 5:143303/1‑129 (MQ=255) gCGTCGACCCTGGGCCTGGCGCCTCGCCATCAGGCGCAGGCCAGCA‑CATACTGGC‑CGGCATCGGCCGCACTGTCGTGCTGTTCCTGGCACTGCTGCTGGTGTTGATGCCGTCGGGTACCAGCCCTAGCGAATTGCTGTTGAGTCTGGGc < 5:101084/149‑1 (MQ=255) aCCCTGGGCCTGGCGCCTCGCCATCAGGCGCAGGCCAGCACCATACTGGC‑CGGCATCGGCCGCACTGTCGTGCTGTTCCTGGCACTGCTGCTGGTGTTGATGCCGTCGGGTACCAGCCCTAGCGAATTGCTGTTGAGTCTGGGCGACtg > 4:80945/1‑149 (MQ=255) ccTGGGCCTGGCGCCTCGCCATCAGGCGCAGGCCAGCACCATACTGGC‑CGGCATCGGCCGCACTGTCGTGCTGTTCCTGGCACTGCTGCTGGTGTTGATGCCGTCGGGTACCAGCCCTAGCGAATTGCTGTTGAGTCTGGGCGACtggg < 3:80945/149‑1 (MQ=255) tGGGCCTGGCGCCTCGCCATCAGGCGCAGGCCAGCACCATACTGGC‑CGGCATCGGCCGCACTGTCGTGCTGTTCCTGGCACTGCTGCTGGTGTTGATGCCGTCGGGTACCAGCCCTAGCGAATTGCTGTTGAGTCTGGGCGACtgggat > 2:245616/1‑149 (MQ=255) ccTGGCGCCTCGCCATCAGGCGCAGGCCAGCACCATACTGGC‑CGGCATCGGCCGCACTGTCGTGCTGTTCCTGGCACTGCTGCTGGTGTTGATGCCGt < 1:260350/98‑1 (MQ=255) ccTGGCGCCTCGCCATCAGGCGCAGGCCAGCACCATACTGGC‑CGGCATCGGCCGCACTGTCGTGCTGTTCCTGGCACTGCTGCTGGTGTTGATGCCGt > 2:260350/1‑98 (MQ=255) tGGCGCCTCGCCATCAGGCGCAGGCCAGCACCATACTGGC‑CGGCATCGGCCGCACTGTCGTGCTGTTCCTGGCACTGCTGCTGGTGTTGATGCCGTCGGGTACCAGCCCTAGCGAATTGCTGTTGAGTCTGGGCGACTGGGATGGGAcc > 7:58579/1‑149 (MQ=255) gcgcCTCGCCATCAGGCGCAGGCCAGCACCATACTGGC‑CGGCATCGGCCGCACTGTCGTGCTGTTCCTGGCACTGCTGCTGGTGTTGATGCCGccggtcccatcccagtcgcccagactcaacagcaattcgctagggctggtacccga < 7:96105‑M1/149‑57 (MQ=255) ccTCGCCATCAGGCGCAGGCCAGCACCATACTGGC‑CGGCATCGGCCGCACTGTCGTGCTGTTCCTGGCACTGCTGCTGGTGTTGATGCCGTCGGGTACCAGCCCTAGCGAATTGCTGTTGAGTCTGGGCGACTGGGATGGGACCGGcgg > 2:24220‑M2/1‑146 (MQ=255) ccATCAGGCGCAGGCCAGCACCATACTGGC‑CGGCATCGGCCGCACTGTCGTGCTGTTCCTGGCACTGCTGCTGGTGTTGATGCCGTCGGGTACCAGCCCTAGCGAATTGCTGTTGAGTCTGGGCGACTGGGATGGGACCGGCGGCAAgg < 1:245616/149‑1 (MQ=255) tCAGGCGCAGGCCAGCACCATACTGGC‑CGGCATCGGCCGCACTGTCGTGCTGTTCCTGGCACTGCTGCTGGTGTTGATGCCGccggtcccatcccagtcgcccagactcaacagcaattcgctagggctggtacccgacg < 3:69642‑M1/140‑59 (MQ=255) tCAGGCGCAGGCCAGCACCATACTGGC‑CGGCATCGGCCGCACTGTCGTGCTGTTCCTGGCACTGCTGCTGGTGTTGATGCCGccggtcccatcccagtcgcccagactcaacagcaattcgctagggctggtaaccgacg > 4:69642‑M1/1‑82 (MQ=255) gcAGGCCAGCACCATACTGGC‑CGGCATCGGCCGCACTGTCGTGCTGTTCCTGGCACTGCTGCTGGTGTTGATGCCGTCGGGTACCAGCCCTAGCGAATTGCTGTTGAGTCTGGGCGACt < 2:229093/119‑1 (MQ=255) gcAGGCCAGCACCATACTGGC‑CGGCATCGGCCGCACTGTCGTGCTGTTCCTGGCACTGCTGCTGGTGTTGATGCCGTCGGGTACCAGCCCTAGCGAATTGCTGTTGAGTCTGGGCGACTGGGATGGGACCGGCGGCAAGGTGCTCGGc > 3:56204/1‑148 (MQ=255) gcAGGCCAGCACCATACTGGC‑CGGCATCGGCCGCACTGTCGTGCGCTTCCTGGCACTGCTGCTGGTGTTGATGCCGTCGGGTACCAGCCCTAGCGAATTGCTGTTGAGTCTGGGCGACt > 1:229093/1‑119 (MQ=255) aGGCCAGCACCATACTGGC‑CGGCATCGGCCGCACTGTCGTGCTGTTCCTGGCACTGCTGCTGGTGTTGATGCCGTCGGGTACCAGCCCTAGCGAATTGCTGTTGAGTCTGGGCGACTGGGATGGGACCGGCGGCAAGGTGCTCGGCAAc > 3:266057/1‑149 (MQ=255) aGGCCAGCACCATACTGGC‑CGGCATCGGCCGCACTGTCGTGCTGTTCCTGGCACTGCTGCTGGTGTTGATGCCGTCGGGTACCAGCCCTAGCGAATTGCTGTTGAGTCTGGGCGACTGGGATGGGACCGGCGGCAAGGTGCTCGGCAAc < 4:56204/149‑1 (MQ=255) tACTGGC‑CGGCATCGGCCGCACTGTCGTGCTGTTCCTGGCACTGCTGCTGGTGTTGATGCCGTCGGGTACCAGCCCTAGCGAATTGCTGTTGAGTCTGGGCGACTGGGATGGGACCGGCGGCAAGGTGCTCGGCAACCTGAACATCGTg < 7:66663/149‑1 (MQ=255) cGGCATCGGCCGCACTGTCGTGCTGTTCCTGGCACTGCTGCTGGTGTTGATGCCGTCGGGTACCAGCCCTAGCGAATTGCTGTTGAGTCTGGGCGACTGGGATGGGACCGGCGGCAAGGTGCTCGGCAACCTGAACATCGTGCCGCAg > 5:59357/1‑148 (MQ=255) ccGCACTGTCGTGCTGTTCCTTGCACTGCTGCTGGTGTTGATGCCGTCGGGTACCAGCCCTAGCGAATTGCTGTTGAGTCTGGGCGACTGGGAAGGGACCGGCGGCAAGGTGCTCGGCAACCTGAACATCGTGCCGCAGGACATCctgc > 3:35348/1‑149 (MQ=255) gCACTGTCGTGCTGTTCCTGGCACTGCTGCTGGTGTTGATGCCGTCGGGTACCAGCCCTAGCGAATTGCTGTTGAGTCTGGGCGACTGGGATGGGACCGGCGGCAAGGTGCTCGGCAACCTGAACATCGTGCCGCAGGACATCctgctg < 4:266057/149‑1 (MQ=255) tCGTGCTGTTCCTGGCACTGCTGCTGGTGTTGATGCCGTCGGGTACCAGCCCTAGCGAATTGCTGTTGAGTCTGGGCGACTGGGATGGGACCGGCGGCAAGGTGCTCGGCAACCTGAACATCGTGCCGCAGGACATCCTGCTGGCCTTg > 8:175765/1‑149 (MQ=255) gCACTGCTGCTGGTGTTGATGCCGTCGGGTACCAGCCCTAGCGAATTGCTGTTGAGTCTGGGCGACTGGGATGGGACCGGCGGCAAGGTGCTCGGCAACCTGAACATCGTGCCGCAGGACATCCTGCTGGCCTTGGCGATCTTCCTCgg > 7:100710/1‑149 (MQ=255) cACTGCTGCTGGTGTTGATGCCGTCGGGTACCAGCCCTAGCGAATTGCTGTTGAGTCTGGGCGACTGGGATGGGACCGGCGGCAAGGTGCTCGGCAACCTGAACATCGTGCCGCAGGACATCCTGCTGGCCTTGGCGATCTTCCTCGGt < 8:83248/149‑1 (MQ=255) gctgctgGTGTTGATGCCGTCGGGTACCAGCCCTAGCGAATTGCTGTTGAGTCTGGGCGACTGGGATGGGACCGGCGGCAAGGTGCTCGGCAACCTGAACATCGTGCCGCAGGACATCCTGCTGGCCTTGGCGATCTTCCTCGGTGGcc > 1:795/1‑149 (MQ=255) tgctgGTGTTGATGCCGTCGGGTACCAGCCCTAGCGAATTGCTGTTGAGTCTGGGCGACTGGGATGGGACCGGCGGCAAGGTGCTCGGCAACCTGAACATCGTGCCGCAGGACATCCTGCTGGCCTTGGCGATCTTCCTCGGTGGCCTg > 3:24133/1‑149 (MQ=255) tgGTGTTGTTGCCGTCGGGTACCAGGGCTTGCGAATTGCTGTTGAGTCTGGGGGACTGGGATGGGACCGGCGGGAAGGTGCTCGGCAACCTGAACATCGTGCCGCAGGACATCCTGCTTGCCTTGGCGATCTTCCTCGGTGGCCTGTTc < 4:35348/149‑1 (MQ=255) tgGTGTTGTTGCCGTCGGGTACCAGCCCTAGCGAATTGCTGTTGAGTCTGGGCGACTGGGATGGGACCGGCGGCAAGGTGCTCGGCAACCTGAACATCGTGCCGCAGGACATCCTGCTGGCCTTGGCGATCTTCCTCGGTGGCCTGTTc < 8:100710/149‑1 (MQ=255) ttGATGCCGTCGGGTACCAGCCCTAGCGAATTGCTGTTGAGTCTGGGCGACTGGGATGGGACCGGCGGCAAGGTGCTCGGCAACCTGAACATCGTGCCGCAGGACATCCTGCTGGCCTTGGCGATCTTCCTCGGTGGCCTGTTCGCCAt < 8:58579/149‑1 (MQ=255) ccgccggtcccatcccagtcgcccagactcaacagcaattcgctagggctggtacccgacggcatcaacaccagcagcagtgccaggaacagcacgacagtgcggccgatgccggccagtatggtgctggcctgcgcctgatggcgagg > 2:24220‑M1/1‑3 (MQ=255) cGTCGGTTACCAGCCCTAGCGAATTGCTGTTGAGTCTGGGCGACTGGGATGGGACCGGcggcatcaacaccagcagcagtgccaggaacagcacgacagtgcggccgatgccggccagtatggtgctggcctgcgcctga > 4:69642‑M2/1‑58 (MQ=255) cGTCGGGTACCAGCCCTAGCGAATTGCTGTTGAGTCTGGGCGACTGGGATGGGACCGGcggcatcaacaccagcagcagtgccaggaacagcacgacagtgcggccgatgccggccagtatggtgctggcctgcgcctga < 3:69642‑M2/140‑83 (MQ=255) | CCCTGCTGTCGCCCCGACAGCCCGGTGGCCTGGCACTGGCGTCGACCCTGGGCCTGGCGCCTCGCCATCAGGCGCAGGCCAGCACCATACTGGC‑CGGCATCGGCCGCACTGTCGTGCTGTTCCTGGCACTGCTGCTGGTGTTGATGCCGTCGGGTACCAGCCCTAGCGAATTGCTGTTGAGTCTGGGCGACTGGGATGGGACCGGCGGCAAGGTGCTCGGCAACCTGAACATCGTGCCGCAGGACATCCTGCTGGCCTTGGCGATCTTCCTCGGTGGCCTGTTCGCCATCCGTGT > NC_002947/822011‑822305 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |