New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 822159 | 35 (0.690) | 4 (0.080) | 4/248 | NT | 9.6% | coding (1530/2412 nt) | PP_0707 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | = 822215 | 42 (0.870) | coding (1586/2412 nt) | PP_0707 | hypothetical protein |
CCTCGCCATCAGGCGCAGGCCAGCACCATACTGGCCGGCATCGGCCGCACTGTCGTGCTGTTCCTGGCACTGCTGCTGGTGTTGATGCCGTCGGGTACCAGCCCTAGCGAATTGCTGTTGAGTCTGGGCGACTGGGATGGGACCGGCGGCAAGGTGCTCGGCAACCTGAACATCGT‑GCCGCAGGACATCCTGCTGGCCTTGGCGATCTTCCTCGGTGGCCTGTTCGCCATCCGTGTGGTCAAGCGCTGGCTGAGCGACCGCCTGCTGCCGGAAACCGAGATGGACGCCGGCA > NC_002947/822070‑822361 | ccTCGCCATCAGGCGCAGGCCAGCACCATACTGGCCGGCATCGGCCGCACTGTCGTGCTGTTCCTGGCACTGCTGCTGGTGTTGATGCCGTCGGGTACCAGCCCTAGCGAATTGCTGTTGAGTCTGGGCGACTGGGATGGGACCGGcgg > 2:24220‑M2/1‑146 (MQ=255) ccATCAGGCGCAGGCCAGCACCATACTGGCCGGCATCGGCCGCACTGTCGTGCTGTTCCTGGCACTGCTGCTGGTGTTGATGCCGTCGGGTACCAGCCCTAGCGAATTGCTGTTGAGTCTGGGCGACTGGGATGGGACCGGCGGCAAgg < 1:245616/149‑1 (MQ=255) gcAGGCCAGCACCATACTGGCCGGCATCGGCCGCACTGTCGTGCTGTTCCTGGCACTGCTGCTGGTGTTGATGCCGTCGGGTACCAGCCCTAGCGAATTGCTGTTGAGTCTGGGCGACTGGGATGGGACCGGCGGCAAGGTGCTCGGc > 3:56204/1‑148 (MQ=255) aGGCCAGCACCATACTGGCCGGCATCGGCCGCACTGTCGTGCTGTTCCTGGCACTGCTGCTGGTGTTGATGCCGTCGGGTACCAGCCCTAGCGAATTGCTGTTGAGTCTGGGCGACTGGGATGGGACCGGCGGCAAGGTGCTCGGCAAc < 4:56204/149‑1 (MQ=255) aGGCCAGCACCATACTGGCCGGCATCGGCCGCACTGTCGTGCTGTTCCTGGCACTGCTGCTGGTGTTGATGCCGTCGGGTACCAGCCCTAGCGAATTGCTGTTGAGTCTGGGCGACTGGGATGGGACCGGCGGCAAGGTGCTCGGCAAc > 3:266057/1‑149 (MQ=255) tACTGGCCGGCATCGGCCGCACTGTCGTGCTGTTCCTGGCACTGCTGCTGGTGTTGATGCCGTCGGGTACCAGCCCTAGCGAATTGCTGTTGAGTCTGGGCGACTGGGATGGGACCGGCGGCAAGGTGCTCGGCAACCTGAACATCGT‑g < 7:66663/149‑1 (MQ=255) cGGCATCGGCCGCACTGTCGTGCTGTTCCTGGCACTGCTGCTGGTGTTGATGCCGTCGGGTACCAGCCCTAGCGAATTGCTGTTGAGTCTGGGCGACTGGGATGGGACCGGCGGCAAGGTGCTCGGCAACCTGAACATCGT‑GCCGCAg > 5:59357/1‑148 (MQ=255) ccGCACTGTCGTGCTGTTCCTTGCACTGCTGCTGGTGTTGATGCCGTCGGGTACCAGCCCTAGCGAATTGCTGTTGAGTCTGGGCGACTGGGAAGGGACCGGCGGCAAGGTGCTCGGCAACCTGAACATCGT‑GCCGCAGGACATCctgc > 3:35348/1‑149 (MQ=255) gCACTGTCGTGCTGTTCCTGGCACTGCTGCTGGTGTTGATGCCGTCGGGTACCAGCCCTAGCGAATTGCTGTTGAGTCTGGGCGACTGGGATGGGACCGGCGGCAAGGTGCTCGGCAACCTGAACATCGT‑GCCGCAGGACATCctgctg < 4:266057/149‑1 (MQ=255) tCGTGCTGTTCCTGGCACTGCTGCTGGTGTTGATGCCGTCGGGTACCAGCCCTAGCGAATTGCTGTTGAGTCTGGGCGACTGGGATGGGACCGGCGGCAAGGTGCTCGGCAACCTGAACATCGT‑GCCGCAGGACATCCTGCTGGCCTTg > 8:175765/1‑149 (MQ=255) gCACTGCTGCTGGTGTTGATGCCGTCGGGTACCAGCCCTAGCGAATTGCTGTTGAGTCTGGGCGACTGGGATGGGACCGGCGGCAAGGTGCTCGGCAACCTGAACATCGT‑GCCGCAGGACATCCTGCTGGCCTTGGCGATCTTCCTCgg > 7:100710/1‑149 (MQ=255) cACTGCTGCTGGTGTTGATGCCGTCGGGTACCAGCCCTAGCGAATTGCTGTTGAGTCTGGGCGACTGGGATGGGACCGGCGGCAAGGTGCTCGGCAACCTGAACATCGT‑GCCGCAGGACATCCTGCTGGCCTTGGCGATCTTCCTCGGt < 8:83248/149‑1 (MQ=255) gctgctgGTGTTGATGCCGTCGGGTACCAGCCCTAGCGAATTGCTGTTGAGTCTGGGCGACTGGGATGGGACCGGCGGCAAGGTGCTCGGCAACCTGAACATCGT‑GCCGCAGGACATCCTGCTGGCCTTGGCGATCTTCCTCGGTGGcc > 1:795/1‑149 (MQ=255) tgctgGTGTTGATGCCGTCGGGTACCAGCCCTAGCGAATTGCTGTTGAGTCTGGGCGACTGGGATGGGACCGGCGGCAAGGTGCTCGGCAACCTGAACATCGT‑GCCGCAGGACATCCTGCTGGCCTTGGCGATCTTCCTCGGTGGCCTg > 3:24133/1‑149 (MQ=255) tgGTGTTGTTGCCGTCGGGTACCAGGGCTTGCGAATTGCTGTTGAGTCTGGGGGACTGGGATGGGACCGGCGGGAAGGTGCTCGGCAACCTGAACATCGT‑GCCGCAGGACATCCTGCTTGCCTTGGCGATCTTCCTCGGTGGCCTGTTc < 4:35348/149‑1 (MQ=255) tgGTGTTGTTGCCGTCGGGTACCAGCCCTAGCGAATTGCTGTTGAGTCTGGGCGACTGGGATGGGACCGGCGGCAAGGTGCTCGGCAACCTGAACATCGT‑GCCGCAGGACATCCTGCTGGCCTTGGCGATCTTCCTCGGTGGCCTGTTc < 8:100710/149‑1 (MQ=255) ttGATGCCGTCGGGTACCAGCCCTAGCGAATTGCTGTTGAGTCTGGGCGACTGGGATGGGACCGGCGGCAAGGTGCTCGGCAACCTGAACATCGT‑GCCGCAGGACATCCTGCTGGCCTTGGCGATCTTCCTCGGTGGCCTGTTCGCCAt < 8:58579/149‑1 (MQ=255) cGTCGGTTACCAGCCCTAGCGAATTGCTGTTGAGTCTGGGCGACTGGGATGGGACCGGcggcatcaacaccagcagcagtgccaggaacagcacgacagtgcggccgatgccggccagtatggtgctggcctgcgcctga > 4:69642‑M2/1‑58 (MQ=255) cGTCGGGTACCAGCCCTAGCGAATTGCTGTTGAGTCTGGGCGACTGGGATGGGACCGGcggcatcaacaccagcagcagtgccaggaacagcacgacagtgcggccgatgccggccagtatggtgctggcctgcgcctga < 3:69642‑M2/140‑83 (MQ=255) tCGGGTACCAGCCCTAGCGAATTGCTGTTGAGTCTGGGCGACTGGGATGGGACCGGcggcatcaacaccagcagcagtgccaggaacagcacgacagtgcggccgatgccggccagtatggtgctggcctgcgcctgatggcgaggcgc < 7:96105‑M2/149‑94 (MQ=255) tCGGGTACCAGCCCTAGCGAATTGCTGTTGAGTCTGGGCGACTGGGATGGGACCGGCGGCAAGGTGCTCGGCAACCTGAACATCGT‑GCCGCAGGACATCCTGCTGGCCTTGGCGATCTTCCTCGGTGGCCTGTTCGCCATCCGTGTGGt > 6:113421/1‑149 (MQ=255) tCGGGTACCAGCCCTAGCGAATTGCTGTTGAGGCGGGGCGACTGGGATGGGACCGGCGGCAAGGTGCTCGGCAACCTGAACATCGT‑GCCGCAGGACATCCTGCTGGCCTTGGCGATCTTCCTCGGTGGCCTGTTCGCCATCCGTGTGGt < 7:81103/149‑1 (MQ=255) ggTACCAGCCCTAGCGAATTGCTGTTGAGTCTGGGCGACTGGGATGGGACCGGCGGCAAGGTGCTCGGCAACCTGAACATCGT‑GCCGCAGGACATCCTGCTGGCCTTGGCGATCTTCCTCGGTGGCCTGTTCGCCATCCGTGTGGTCaa < 7:175765/149‑1 (MQ=255) ccAGCCCTAGCGAATTGCTGTTGAGTCTGGGCGACTGGGATGGGACCGGCGGCAAGGTGCTCGGCAACCTGAACATCGT‑GCCGCAGGACATCCTGCTGGCCTTGGCGATCTTCCTCGGTGGCCTGTTCGCCATCCGTGTGGTCAAgcg < 5:113421/148‑1 (MQ=255) cAGCCCTAGCGAATTGCTGTTGAGTCTGGGCGACTGGGATGGGACCGGCGGCAAGGTGCTCGGCAACCTGAACATCGT‑GCCGCAGGACATCCTGCTGGCCTTGGCGATCTTCCTCGGTGGCCTGTTCGCCATCCgtgt > 8:178718/1‑138 (MQ=255) cAGCCCTAGCGAATTGCTGTTGAGTCTGGGCGACTGGGATGGGACCGGCGGCAAGGTGCTCGGCAACCTGAACATCGT‑GCCGCAGGACATCCTGCTGGCCTTGGCGATCTTCCTCGGTGGCCTGTTCGCCATCCgtgt < 7:178718/138‑1 (MQ=255) tAGCGAATTGCTGTTGAGTCTGGGCGACTGGGATGGGACCGGCGGCAAGGTGCTCGGCAACCTGAACATCGT‑GCCGCAGGACATCCTGCTGGCCTTGGCGATCTTCCTCGGTGGCCTGTTCGCCATCCGTGTGGTCAAGCgctggct > 6:246231/1‑147 (MQ=255) gCGAATTGCTGTTGAGTCTGGGCGACTGGGATGGGACCGGCGGCAAGGTGCTCGGCAACCTGAACATCGT‑GCCGCAGGACATCCTGCTGGCCTTGGCGATCTTCCTCGGTGGCCTGTTCGCCATCCGTGTGGTCAAGCGCTGGCTGAg < 2:795/148‑1 (MQ=255) aaTTGCTGTTGAGTCTGGGCGACTGGGATGGGACCGGCGGCAAGGTGCTCGGCAACCTGAACATCGT‑GCCGCAGGACATCCTGCTGGCCTTGGCGATCTTCCTCGGTGGCCTGTTCGCCATCCGTGTGGTCAAGCGCTGGCTGAGCGAc > 5:7207/1‑149 (MQ=255) aTTGCTGTTGAGTCTGGGCGACTGGGATGGGACCGGCGGCAAGGTGCTCGGCAACCTGAACATCGT‑GCCGCAGGACATCCTGCTGGCCTTGGCGATCTTCCTCGGTGGCCTGTTCGCCATCCGTGTGGTCAAGCGCTGGCTGAGCGAcc < 6:59357/149‑1 (MQ=255) aTTGCTGGTGAGTCTGGGCGACTTGGATGGGACCGGCGGCAAGGTGCTCGGCAACCTGAACATCGT‑GCCGCAGGACATCCTGCTGGCCTTGGCGATCTTCCTCGGTGGCCTGTTCGCCATCCGTGTTGGCAAGCACTGGCTGAGCGAcc < 4:262550/149‑1 (MQ=255) cTGTTGAGTCTGGGCGACTGGGTTGGGACCGGCGGCAAGGTGCTCGGCAACCTGAACATCGT‑GCCGCAGGAAATCCTGCTGGCCTTGGCGATCTTCCTCGGTGGCCTGTTCGCCATCCGTGTGGTCAAGCGGTGGCTGAGCGACCGCct > 7:202671/1‑149 (MQ=255) tGTTGAGTCTGGGCGACTGGGATGGGACCGGCGGCAAGGTGCTCGGCAACCTGAACATCGT‑GCCGCAGGACATCCTGCTGGCCTTGGCGATCTTCCTCGGTGGCCTGTTCGCCATCCGTGTGGTCAAGCGCTGGCTGAGCGACCGCctg > 8:103966/1‑149 (MQ=255) tGTTGAGTCTGGGCGACTGGGATGGGACCGGCGGCAAGGTGCTCGGCAACCTGAACATCGT‑GCCGCAGGACATCCTGCTGGCCTTGGCGATCTTCCTCGGTGGCCTGTTCGCCATCCGTGTGGTCAAGCGCTGGCTGAGCGACCGCctg > 7:219217/1‑149 (MQ=255) ttGAGTCTGGGCGACTGGGATGGGACCGGcggcatcaacaccagcatcagtgccaggaacagcacgacagtgcggccgatgccggccagtatggtgctggcctgcgcctgatggcgaggcgccaggcccagggtcgacgccagtgccag > 8:96105‑M2/1‑29 (MQ=255) ttGAGTCTGGGCGACTGGGATGGGACCGGCGGCAAGGTGCTCGGCAACCTGAACATCGT‑GCCGCAGGACATCCTGCTGGCCTTGGCGATCTTCCTCGGTGGCCTGTTCGCCATCCGTGTGGTCAAGCgct > 6:211943/1‑130 (MQ=255) ttGAGTCTGGGCGACTGGGATGGGACCGGCGGCAAGGTGCTCGGCAACCTGAACATCGT‑GCCGCAGGACATCCTGCTGGCCTTGGCGATCTTCCTCGGTGGCCTGTTCGCCATCCGTGTGGTCAAGCgct < 5:211943/130‑1 (MQ=255) aGTCTGGGCGACTGGGATGGGACCGGCGGCAAGGTGCTCGGCAACCTGAACATCGT‑GCCGCAGGACATCCTGCTGGCCTTGGCGATCTTCCTCGGTGGCCTGTTCGCCATCCGTGTGGTCAAGCGCTGGCTGAGCGACCGCCtgctgc < 8:219217/148‑1 (MQ=255) tCTGGGCGACTGGGATGGGACCGGCGGCAAGGTGCTCGGCAACCTGAACATCGT‑GCCGCAGGACATCCTGCTGGCCTTGGCGATCTTCCTCGGTGGCCTGTTCGCCATCCGTGTGGTCAAGCGCTGGCTGAGCGACCGCCTGCTGCCg > 5:48008/1‑148 (MQ=255) tGGGCGACTGGGATGGGGCCGGCGGCAAGGTGCTCGGCAACCTGAACATCGT‑GCCGCAGGACATCCTGCTGGCCTTGGCGATCTTCCTCg < 8:190123/90‑1 (MQ=255) tGGGCGACTGGGATGGGACCGGCGGCAAGGTGCTCGGCAACCTGAACATCGT‑GCCGCAGGACATCCTGCTGGCCTTGGCGATCTTc > 6:22875/1‑86 (MQ=255) tGGGCGACTGGGATGGGACCGGCGGCAAGGTGCTCGGCAACCTGAACATCGT‑GCCGCAGGACATCCTGCTGGCCTTGGCGATCTTc < 5:22875/86‑1 (MQ=255) tGGGCGACTGGGATGGGACCGGCGGCAAGGTGCTCGGCAACCTGAACATCGT‑GCCGCAGGACATCCTGCTGGCCTTGGCGATCTTCCTCGGTGGCCTGTTc < 7:205032/101‑1 (MQ=255) tGGGCGACTGGGATGGGACCGGCGGCAAGGTGCTCGGCAACCTGAACATCGT‑GCCGCAGGACATCCTGCTGGCCTTGGCGATCTTCCTCGGTGGCCTGTTc > 8:205032/1‑101 (MQ=255) tgggatgggaCCGGCGGCAAGGTGCTCGGCAACCTGAACATCGT‑GCCGCAGGACATCCTGCTGGCCTTGGCGATCTTCCTCGGTGGCCTGTTCGCCATCCGTGTGGTCAAGCGCTGGCTGAGCGACCGCCTGCTGCCGGAAACCGAGAt > 3:284004/1‑149 (MQ=255) gggatgggaCCGGCGGCAAGGTGCTCGGCAACCTGAACATCGTGGCCGCAGGACATCCTGCTGGCCTTGGCGATCTTCCTCGGTGGCCTGTTCGCCATCCGTGTGGTCAAGCGCTGGCTGAGCGACCGCCTGCTGCCGGAAACCGAGAt > 1:66530/1‑149 (MQ=255) ggatgggaCCGGCGGCAAGGTGCTCGGCAACCTGAACATCGT‑GCCGCAGGACATCCTGCTGGCCTTGGCGATCTTCCTCGGTGGCCTGTTCGCCATCCGTGTGGTCAAGCGCTGGCTGa > 6:171630/1‑119 (MQ=255) ggatgggaCCGGCGGCAAGGTGCTCGGCAACCTGAACATCGT‑GCCGCAGGACATCCTGCTGGCCTTGGCGATCTTCCTCGGTGGCCTGTTCGCCATCCGTGTGGTCAAGCGCTGGCTGa < 5:171630/119‑1 (MQ=255) ccGGCGGAAAGGTGCTCGGCAACCTGAACATCGT‑GCCGCAGGACATCCTGCTGGCCTTGGCGATCTTCCTCGGTGGCCTGTTCGCCATCCGTGTGGTCAAGCGCTGGCTGAGCGACCGCCTGCTGCCGGAAACCGAGATGGACGCCgg > 5:144177/1‑148 (MQ=255) cggcggCAAGGTGCTCGGCAACCTGAACATCGT‑GCCGCAGGACATCCTGCTGGCCTTGGTGATCTTCCTCGGTGGCCTGTTCGCCATCCGTGTGGTCAAGCGCTGGCTGAGCGACCGCCTGCTGCCGGAAACCGAGATGGACGCCGGCa > 2:67062/1‑149 (MQ=255) | CCTCGCCATCAGGCGCAGGCCAGCACCATACTGGCCGGCATCGGCCGCACTGTCGTGCTGTTCCTGGCACTGCTGCTGGTGTTGATGCCGTCGGGTACCAGCCCTAGCGAATTGCTGTTGAGTCTGGGCGACTGGGATGGGACCGGCGGCAAGGTGCTCGGCAACCTGAACATCGT‑GCCGCAGGACATCCTGCTGGCCTTGGCGATCTTCCTCGGTGGCCTGTTCGCCATCCGTGTGGTCAAGCGCTGGCTGAGCGACCGCCTGCTGCCGGAAACCGAGATGGACGCCGGCA > NC_002947/822070‑822361 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |