New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 923508 = | 39 (0.770) | 3 (0.060) | 3/246 | NT | 7.3% | coding (1685/2169 nt) | PP_0804 | protein secretion ABC transporter permease/ATP‑binding protein |
? | NC_002947 | 923559 = | 39 (0.810) | coding (1634/2169 nt) | PP_0804 | protein secretion ABC transporter permease/ATP‑binding protein |
GACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGGTCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGCCGTGGAACAGCCTCGCGTACTGCGGCAGCAGGCCGACGTCACGGCGCAGGTCAGCAGGGTCGAGGTGGGCCATGGCGATGCCGTCCAGGCTGATCTCGCCCTGCACCAGATCCATGGCCCCACCCAGCGCCTGCAGCAAGGTTGATTTGCCGGCGCCGTTGCGGCCCAGCACGGCAATGCGCTCGCCCGGCTGGATATC > NC_002947/923360‑923653 | gACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGGTCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGCCGTGGAACAGCCTCGCGTACTGCGGCAGCAGGCCGACGTCACGGCGCAGGTcag < 4:168987/149‑1 (MQ=255) gACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGGTCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGCCGTGGAACAGCCTCGCGTACTGCGGCAGCAGGCCGACGTCACGGCGCAGGTcag < 2:68800/149‑1 (MQ=255) cGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGGTCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGCCGTGGAACAGCCTCGCGTACTGCGGCAGCAGGCCGACGTCACGGCGCAGGTcag > 3:267882/1‑147 (MQ=255) tCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGGTCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGCCGTGGAACAGCCTCGCGTACTGCGGCAGCAGGCCGACGTCACGGCGCAGGTCAGCAGGGTc < 7:300362/149‑1 (MQ=255) tCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGGTCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAGGGTTTCCCGCAGGGTGCCGTGGAACAGCCTCGCGTACTGCGGCAGCAGGCCGACGTCACGGCGCAGGTCAGCAGGGTc < 4:228312/149‑1 (MQ=255) cAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGGTCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGCCGTGGAACAGCCTCGCGTACTGCGGCAGCAGGCCGACGTCACGGCGCAGGTCAGCAGGGTc > 4:95464/1‑147 (MQ=255) ccAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGGTCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGCCGTGGAACAGCCTCGCGTACTGCGGCAGCAGGCCGACGTCACGGCGCAGGTCAGCAGGGTCGAGGTGGGc < 1:148778/149‑1 (MQ=255) ccAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGGTCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGCCGTGGAACAGCCTCGCGTACTGCGGCAGCAGGCCGACGTCACGGCGCAGGTCAGCAGGGTCGAGGTGGGc < 8:153510/149‑1 (MQ=255) ccAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGGTCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGCCGTGGAACAGCCTCGCGTACTGCGGCAGCAGGACGAAGTCACGGCGCAGGTCAGCCGGGTCGCGGTGGGc > 4:230501/1‑149 (MQ=255) ggcgggCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGGTCGCTGGCCGGGCCGGCAGCGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGCCGTGGAACAGCCTCGCGTACTGCGGCAGCAGGCCGACGTCACGGCGCAGGTGAGCAGGGTCGAGGTGGGCCATg < 3:261733/148‑1 (MQ=255) cgGCCACCAGTTCCTGGTCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGCCGTGGAACAGCCTCGCGTACTGCGGCAGCAGGCCGACGTCACGGCGCAGGTCAGCAGGGTCGAGGTGGGCCATGGCGATGCCGTcc < 3:95464/149‑1 (MQ=255) ccaccaGTTCCTGGTCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGCCGTGGAACAGCCTCGCGTACTGCGGCAGCAGGCCGACGTCACGGCGCAGGTCAGCAGGGTCGAGGTGGGCCATGGCGATGCCGTCCAgg < 6:274867/149‑1 (MQ=255) caGTTCCTGGTCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCTCAGGGTGCCGTGGAACAGCCTCGCGTACTGCGGCAGCAGGCCGACGTCACGGCGCAGGTCAGCAGGGTCGAGGTGGGCCATGGCGATGCCGTCCAGGCTGa > 6:15110/1‑149 (MQ=255) aGTTCCTGGTCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGCCGTGGAACAGCCTCGCGTACTGCGGCAGCAGGCCGACGTCACGGCGCAGGTCAGCAGGGGCGAGGTGGGCCATGGCGATGCCGTCCAGGCTGAt < 7:171214/149‑1 (MQ=255) ttCCTGGTCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGCCGTGGAACAGCCTCGCGTACTGCGGCAGCAGGCCGACGTCACGGCGCAGGTCAGCAGGGTCGAGGTGGGCCATGGCGATGCCGTCCAGGCTGAtct > 1:190575/1‑149 (MQ=255) ggTCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGCCGTGGAACAGCCTCGCGTACTGCGGCAGCAGGCCGACGTCACGGCGCAGGTCAGCAGGGTCGAGGTGGGCCATGGCGATGCCGTCCAGGCTGATCTCGccc > 1:38124/1‑149 (MQ=255) gTCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGCCGTGGAACAGCCTCGCGTACTGCGGCAGCAGGCCGACGTCCCGGCGCAGGTCAGCAGGGTCGAGGTGGGCCATGGCGATGCCGTCCAGGCTGATCTAGCCCt > 6:228129/1‑149 (MQ=255) tCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCTCAGGGTGCCGTGGAACAGCCTCGCGTACTGCGGCAGCAGGCCGACGTCACGGCGCAGGTCAGCAGGGTCGAGGTGGGCCATGGCGATGCCGTCCAGGCTGATCTCGCCCTg < 5:15110/149‑1 (MQ=255) gatatccagccgggcgagcgcattgccgtgctgggccgcaacggcgccggcaaatcaaccttgctgcaggcgctgggtggggccatggatctggtGCAGGGTCGAGGTGGGCCATGGCGATGCCGTCCAGGCTGATCTCGCCCTGCa > 7:268647‑M1/96‑147 (MQ=255) cctggccGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGCCGTGGAACAGCCTCGCGTACTGCGGCAGCAGGCCGACGTCACGGCGCAGGTCAGCAGGGTCGAGGTGGGCCATGGCGATGCCGTCCAGGCTGATCTCGCCCTGCAc > 6:92752/1‑145 (MQ=255) tggccGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGCCGTGGAACAGCCTCGCGTACTGCGGCAGCAGGCCGACGTCACGGCGCAGGTCAGCAGGGTCGAGGTGGGCCATGGCGATGCCGTCCAGGCTGATCTCGccc < 7:71797/138‑1 (MQ=255) tggccGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGCCGTGGAACAGCCTCGCGTACTGCGGCAGCAGGCCGACGTCACGGCGCAGGTCAGCAGGGTCGAGGTGGGCCATGGCGATGCCGTCCAGGCTGATCTCGccc > 8:71797/1‑138 (MQ=255) ccGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGCCGTGGAACAGCCTCGCGTACTGCGGCAGCAGGCCGACGTCACGGCGCAGGTCAGCAGGGTCGAGGTGGGCCATGGCGATGCCGTCCAGGCTGATCTCGCCCTGCACCAGATCCAt < 2:23377/149‑1 (MQ=255) cGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGCCGTGGAACAGCCTCGCGTACTGCGGCAGCAGGCCGACGTCACGGCGCAGGTCAGCAGGGTCGAGGTGGGCCATGGCGATGCCGTCCAGGCTGATCTCGCCCTGCACCAGATCCATGGCccca < 8:143598/149‑1 (MQ=255) aGGGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGCCGTGGAACAGCCTCGCGTACTGCGGCAGCAGGCCGACGTCACGGCGCAGGTCAGCAGGGTCGAGGTGGGCCATGGCGATGCCGTCCAGGCTGATCTCGCCCTGCCCCAGATCCCTGGCcccccc > 6:226511/1‑149 (MQ=255) ggTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGCCGTGGAACAGCCTCGCGTACTGCGGCAGCAGGCCGACGTCACGGCGCAGGTCAGCAGGGTCGAGGTGGGCCATGGCGATGCCGTCCAGGCTGATCTCGCCCTGCACCAGATCCATGGCcccacc > 1:155870/1‑147 (MQ=255) tGAGGTTTTCCCGCAGGGTGCCGTGGAACAGCCTCGCGTACTGCGGCAGCAGGCCGACGTCACGGCGCAGGTCAGCAGGGTCGAGGTGGGCCATGGCGATGCCGTCCAGGCTGATCTCGCCCTGCACCAGATCCATGGCCCCACCCAgc < 5:63476/149‑1 (MQ=255) aGGTTTTCCCGCAGGGTGCCGTGGAACAGCCTCGCGTACTGCGGCAGCAGGCCGACGTCACGGCGCAGGTCAGCAGGGTCGAGGTGGGCCATGGCGATGCCGTCCAGGCTGATCTCGCCCTGCACCAGATCCATGGCCCCACCCAgcg < 2:38124/148‑1 (MQ=255) ggccgcaacggcgccggcaaatcaaccttgctgcaggcgctgggtggggccatggatctggtGCAGGGTCGAGGTGGGCCATGGCGATGCCGTCCAGGCTGATCTCGCCCTGCACCAg > 4:83946‑M1/63‑118 (MQ=255) ggccgcaacggcgccggcaaatcaaccttgctgcaggcgctgggtggggccatggatctggtGCAGGGTCGAGGTGGGCCATGGCGATGCCGTCCAGGCTGATCTCGCCCTGCACCAg < 3:83946‑M1/56‑1 (MQ=255) cAGCCTCGCGTACTGCGGCAGCAGGCCGACGTCACGGCGCAGGTCAGCAGGGTCGAGGTGGGCCATGGCGATGCCGTCCAGGCTGATCTCGCCCTGCACCAGATCCATGGCCCCACCCAGCGCCTGCAGCAAGGTTGATTTGCCGgcgc > 6:188127/1‑149 (MQ=255) ccTCGCGTACTGCGGCAGCAGGCCGACGTCACGGCGCAGGTCAGCAGGGTCGAGGTGGGCCATGGCGATGCCGTCCAGGCTGATCTCGCCCTGCACCAGATCCATGGCcccaccc > 4:34580/1‑115 (MQ=255) ccTCGCGTACTGCGGCAGCAGGCCGACGTCACGGCGCAGGTCAGCAGGGTCGAGGTGGGCCATGGCGATGCCGTCCAGGCTGATCTCGCCCTGCACCAGATCCATGGCcccaccc < 3:34580/115‑1 (MQ=255) tACTGCGGCAGCAGGCCGACGTCACGGCGCAGGTGAGCAGGGTCGTTGTGGGCCATGGCGATGCCGTCCATGCTGATCTCGCCCTGCACCAGATCCATGGCCCCACTCAGCGCCTGCAGCAAGGTTGATTTGCCGGCGCCGTTGCggac < 5:228129/149‑3 (MQ=255) cTGCGGCAGCAGGCCGACGTCACGGCGCAGGTCAGCAGGGTCGAGGTGGGCCATGGCGATGCCGTCCAGGCTGATCTCGCCCTGCACCAGATCCATGGCCCCACCCAGCGCCTGCAGCAAGGTTGATTTGCCGGCGCCGTTGCGGccc < 2:283153/148‑1 (MQ=255) gCGGCAGCAGGCCGACGTCACGGCGCAGGTCAGCAGGGTCGAGGTGGGCCATGGCGATGCCGTCCAGGCTGATCTCGCCCTGCACCAGATCCATGGCCCCACCCAGCGCCTGCAGCAAGGTTGATTTGCCGGCGCCGTTGCGGCCCAGc > 2:117583/1‑149 (MQ=255) cGGCAGCAGGCCGACGTCACGGCGCAGGTCAGCAGGGTCGAGGTGGGCCATGGCGATGCCGTCCAGGCTGATCTCGCCCTGCACCAGATCCATGGCCCCACCCAGCGCCTGCAGCAAGGTTGATTTGCCGGCGCCGTTGCGGCCCAg < 2:155870/147‑1 (MQ=255) cGGCAGCAGGCCGACGTCACGGCGCAGGTCAGCAGGGTCGAGGTGGGCCATGGCGATGCCGTCCAGGCTGATCTCGCCCTGCACCAGATCCATGGCCCCACCCAGCGCCTGCAGCAAGGTTGATTTGCCGGCGCCGTTGCGGCCCAGCa > 7:290766/1‑149 (MQ=255) gcagcaGGCCGACGTCACGGCGCAGGTCAGCAGGGTCGAGGTGGGCCATGGCGATGCCGTCCAGGCTGATCTCGCCCTGCACCAGATCCATGGCCCCACCCAGCGCCTGCAGCAAGGTTGATTTGCCGGCGCCGTTGCGGCCCAGCACg > 8:303759/1‑149 (MQ=255) gcagcaGGCCGACGTCACGGCGCAGGTCAGCAGGGTCGAGGTGGGCCATGGCGATGCCGTCCAGGCTGATCTCGCCCTGCACCAGATCCATGGCCCCACCCAGCGCCAGCAGCAAGGTTGATTTGCCGGCGCCGTTGCGGCCCAGCACg > 5:280894/1‑149 (MQ=255) cagcagGCCGACGTCACGGCGCAGGTCAGCAGGGTCGAGGTGGGCCATGGCGATGCCGTCCAGGCTGATCTCGCCCTGCACCAGATCCATGGCCCCACCCAGCGCCTGCAGCAAGGTTGATTTGCCGGCGCCGTTGCGGCCCAGCACgg < 5:92752/149‑1 (MQ=255) aCGTCACGGCGCAGGTCAGCAGGGTCGAGGTGGGCCATGGCGATGCCGTCCAGGCTGATCTCGCCCTGCACCAGATCCATGGCCCCACCCAGCGCCTGCAGCAAGGTTGATTTGCCGGCGCCGTTGCGGCCCAGCACGGCAATGCGCTc < 4:267882/149‑1 (MQ=255) cACGGCGCAGGTCAGCAGGGTCGAGGTGGGCCATGGCGATGCCGTCCAGGCTGATCTCGCCCTGCACCAGATCCATGGCCCCACCCAGCGCCTGCAGCAAGGTTGATTTGCCGGCGCCGTTGCGGCCCAGCACGGCAATGCGCTCGccc > 1:218482/1‑149 (MQ=255) gctggTCAGCAGGGTAGAGGTGGGCGATGGCGATGCCGTCCAGGCTGATCTCGACCTGCACCAGATCCTTGGCCCCACCCAGCGCCTGCAGCAAGGTTGATTTGCCGTCGCGGTTGCGGCCCAGCACGGCAATGCGCTCGCCCGGCTgg < 1:93819/146‑1 (MQ=255) gcAGGTCAGCAGGGTCGAGGTGGGCCATGGCGATGCCGTCCAGGCTGATCTCGCCCTGCACCAGATCCATGGCCCCACCCAGCGCCTGCAGCAAGGTTGATTTGCCGGCGCCGTTGCGGCCCAGCACGGCAATGCGCTCGCCCGGCTgg < 2:190575/149‑1 (MQ=255) gcAGGTCAGCAGGGTCGAGGTGGGCCATGGCGATGCCGTCCAGGCTGATCTCGCCCTGCACCAGATCCATGGCCCCACCCAGCGCCTGCACCAAGGTTGATTTGCCGGCGCCGTTGCGGCCCAGCACCGCAATGCTCTCGCCCGGCTg > 2:93819/1‑148 (MQ=255) gTCAGCAGGGTCGAGGTGGGCCATGGCGATGCCGTCCAGGCTGATCTCGCCCTGCACCAGATCCATGGCCCCACCCAGCGCCTGCAGCAAGGTTGATTTGCCGGCGCCGTTGCGGCCCAGCACGGCa > 6:26063/1‑127 (MQ=255) gTCAGCAGGGTCGAGGTGGGCCATGGCGATGCCGTCCAGGCTGATCTCGCCCTGCACCAGATCCATGGCCCCACCCAGCGCCTGCAGCAAGGTTGATTTGCCGGCGCCGTTGCGGCCCAGCACGGCa < 5:26063/127‑1 (MQ=255) GCAGGGTCGAGGTGGGCCATGGCGATGCCGTCCAGGCTGATCTCGCCCTGCACCAGATCCATGGCCCCACCCAGCGCCTGCAGCAAGGTTGATTTGCCGGCGCCGTTGCGGCCCAGCACGGCAATGCGCTCGCCCGGCTGGATATc > 7:29032‑M1/1‑146 (MQ=255) GCAGGGTCGAGGTGGGCCATGGCGATGCCGTCCAGGCTGATCTCGCCCTGCACCAGATCCATGGCCCCACCCAGCGCCTGCAGCAAGGTTGATTTGCCGGCGCCGTTGCGGCCCAGCACGGCAATGCGCTCGCCCGGCTGGATATc < 8:29032‑M1/146‑1 (MQ=255) | GACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGGTCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGCCGTGGAACAGCCTCGCGTACTGCGGCAGCAGGCCGACGTCACGGCGCAGGTCAGCAGGGTCGAGGTGGGCCATGGCGATGCCGTCCAGGCTGATCTCGCCCTGCACCAGATCCATGGCCCCACCCAGCGCCTGCAGCAAGGTTGATTTGCCGGCGCCGTTGCGGCCCAGCACGGCAATGCGCTCGCCCGGCTGGATATC > NC_002947/923360‑923653 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |