| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 1206555 = | 55 (1.090) | 3 (0.060) | 3/246 | NT | 5.9% | coding (2446/3150 nt) | PP_1058 | hypothetical protein |
| ? | NC_002947 | 1206594 = | 43 (0.900) | coding (2407/3150 nt) | PP_1058 | hypothetical protein | |||||
ACCAGTTCGGAGAGGGCAGCGGGGCGGTCGCCGGAGCTGCCGATGGCGGTGGCCAATGAGGGCACCAGGTGGTCGAATGGATAGCCCACGCGTTTCCAGCGTTGGTGGATATCGAGGAAGGCTTCGATTTCGACCATGGTGCGGATGCGGCTGTCACGGGCGCCCTGGTGGCGGCTCTTGAACAGCCAGCCGTATACCTCCTGGCGTTCGAAACGACTGGCGTTGATCATCTCGGTCAGTGTCGAGCTCGGGTTCTTCAGCAGGTAGCCAAGCAGCCACAGGTCCAGCGGGTG > NC_002947/1206407‑1206699 | aCCAGTTCGGAGAGGGCAGCGGGGCGGTCGCCGGAGCTGCCGATGGCGGTGGCCAATGAGGGCACCAGGTGGTCGAATGGATAGCCCACGCGTTTCCAGCGTTGGTGGATATCGAGGAAGGCTTCGATTTCGACCATGGTGCGGATGCg < 3:4595/149‑1 (MQ=255) ttCGGAGAGGGCAGCGGGGCGGTCGCCGGAGCTGCCGATGGCGGTGGCCAATGAGGGCACCAGGTGGTCGAATGGATAGCCCACGCGTTTCCAGCGTTGGTGGATATCGAGGAAGGCTTCGATTTCGACCATGGTGCGGATGCGGCTGt > 3:271908/1‑149 (MQ=255) gagaGGGCAGCGGGGCGGTCGCCGGAGCTGCCGATGGCGGTGGCCAATGAGGGCACCAGGTGGTCGAATGGATAGCCCACGCGTTTCCAGCGTTGGTGGATATCGAGGAAGGCTTCGATTTCTAACATGGTGCGGATGCGGCTGTCACg > 8:291941/1‑149 (MQ=255) gCAGCGGGGCGGTCGCCGGAGCTGCCGATGGCGGTGTCCAATGAGGGCACCAGGTGGTCGAATGGATAGCCCACGCGTTTCCAGCGTTGGTGGATATCGAGGAAGGCTTCGATTTCGACCATGGTGCGGATGCGGCTGTCACGGGCGcc < 4:311730/149‑1 (MQ=255) cAGCGGGGCGGTCGCCGGAGCTGCCGATGGCGGTGGCCAATGAGGGCACCAGGTGGTCGAATGGATAGCCCACGCGTTTCCAGCGTTGGTGGATTTCGAGGAAGGCTTCGATTTCGACCATGGTGCGGATGCGGCTGTCACGGGCGccc > 1:60259/1‑149 (MQ=255) gggCGGTCGCCGGAGCTGCCGATGGCGGTGGCCAATGAGGGCACCAGGTGGTCGAATGGATAGCCCACGCGTTTCCAGCGTTGGTGGATATCGAGGAAGGCTTCGATTTCGACCATGGTGCGGATGCGGCTGTCACGGGCGCCCtggtg > 2:316276/1‑149 (MQ=255) gCGGTCGCCGGAGCTGCCGATGGCGGTGGCCAATGAGGGCACCAGGTGGTCGAATGGATAGCCCACGCGTTTCCAGCGTTGGTGGATATCGAGGAAGGCTTCGATTTCGACCATGGTGCGGCTGCGGCTGTCACGGGCGCCCTGGTggc > 7:111829/1‑149 (MQ=255) gCGGTCGCCGGAGCTGCCGATGGCGGTGGCCAATGAGGGCACCAGGTGGTCGAATGGATAGCCCACGCGTTTCCAGCGTTGGTGGATATCGAGGAAGGCTTCGATTTCGACCATGGTGCGGATGCGGCTGTCACGGGCGCCCTGGTggc < 1:316276/149‑1 (MQ=255) gTCGCCGGAGCTGCCGATGGCGGTGGCCAATGAGGGCACCAGGTGGTCGAATGGATAGCCCACGCGTTTCCAGCGTTGGTGGATATCGAGGAAGGCTTCGATTTCGACCATGGTGCGGATGCGGCTGTCACGGGCGCCCTGGTggcggc > 1:320686/1‑149 (MQ=255) tCGCCGGAGCTGCCGATGGCGGTGGCCAATGAGGGCACCAGGTGGTCGAATGGATAGCCCACGCGTTTCCAGCGTTGGTGGATATCGAGGAAGGCTTCGATTTCGACCATGGTGCGGATGCGGCTGTCACGGGCGCCCTGGTGGCGGct < 5:211270/149‑1 (MQ=255) ccGGAGCTGCCGATGGCGGTGGCCAATGAGGGCACCAGGTGGTCGAATGGATAGCCCACGCGTTTCCAGCGTTGGTGGATATCGAGGAAGGCTTCGATTTCGACCATGGTGCGGATGCGGCTGTCAc < 1:300859/127‑1 (MQ=255) ccGGAGCTGCCGATGGCGGTGGCCAATGAGGGCACCAGGTGGTCGAATGGATAGCCCACGCGTTTCCAGCGTTGGTGGATATCGAGGAAGGCTTCGATTTCGACCATGGTGCGGATGCGGCTGTCAc > 2:300859/1‑127 (MQ=255) ccGGAGCTGCCGATGGCGGTGGCCAATGAGGGCACCAGGTGGTCGAATGGATAGCCCACGCGTTTCCAGCGTTGGTGGATATCGAGGAAGGCTTCGATTTCGACCATGGTGCGGATGCGGCTGTCACGGGCGCCCTGGTGGCGGCTCtt < 5:4919/149‑1 (MQ=255) ccGGAGCTGCCGATGGCGGTGGCCAATGAGGGCACCAGGTGGTCGAATGGATAGCCCACGCGTTTCCAGCGTTGGTGGATATCGAGGAAGGCTTCGATTTCGACCATGGTGCGGATGCGGCTGTCACGGGCGCCCTGGTGGCGGCTCtt < 3:231627/149‑1 (MQ=255) aGCTGCCGATGGCGGTGGCCAATGAGGGCACCAGGTGGTCGAATGGATAGCCCACGCGTTTCCAGCGTTGGTGGATATCGAGGAAGGCTTCGATTTCGACCATGGTGCGGATGCGGCTGTCACGGGCGCCCTGGTGGCGGCTCTTGAAc < 2:320686/149‑1 (MQ=255) tccacccgctggacctgtggctgcttggctacctgctgaagaacccgagctcgacactgaccgagatgatcaacgccactcgtttcgaacgccaggaggtatacggctGGCTGTCACGGGCGCCCTGGTGGCGGCTCTTGAAcagccag > 8:100780‑M1/109‑149 (MQ=255) tGGCCAATGAGGGCACCAGGTGGTCGAATGGATAGCCCACGCGTTTCCAGCGTTGGTGGATATCGAGGAAGGCTTCGATTTCGACCATGGTGCGGATGCGGCTGTCACGGGCGCCCTGGTGGCGGCTCTTGAACAGCCAGCCGTATAcc > 7:196573/1‑149 (MQ=255) aGGGCACCAGGTGGTCGAATGGATAGCCCACGCGTTTCCAGCGTTGGTGGATATCGAGGAAGGCTTCGATTTCGACCATGGTGCGGATGCGGCTGTCACGGGCGCCCTGGTGGCGGCTCTTGAACAGCCAGCCGTATACCTCCTGGCg < 2:130459/148‑1 (MQ=255) ctacctgctgaagaacccgagctcgacactgaccgagatgatcaacgccagtcgtttcgaacgccaggaggtatacggctGGCTGTCACGGGCGCCCTGGTGGCGGCTCTTGAAcagc > 6:257096‑M1/81‑118 (MQ=255) ctacctgctgaagaacccgagctcgacactgaccgagatgatcaacgccagtcgtttcgaacgccaggaggtatacggctGGCTGTCACGGGCGCCCTGGTGGCGGCTCTTGAAcagc < 5:257096‑M1/38‑1 (MQ=255) gtCGAATGGATAGCCCACGCGTTTCCAGCGTTGGTGGATATCGAGGAAGGCTTCGATTTCGACCATGGTGCGGATGCGGCTGTCACGGGCGCCCTGGTGGCGGCTCTTGAACAGCCAGCCGTATACCTCCTGGCGTTCGAAACGACTgg > 8:261319/1‑149 (MQ=255) tCGAATGGATAGCCCACGCGTTTCCAGCGTTGGTGGATATCGAGGAAGGCTTCGATTTCGACCATGGTGCGGATGCGGCTGTCACGGGCGCCCTGGTGGCGGCTCTTGAAca < 6:282487/112‑1 (MQ=255) tCGAATGGATAGCCCACGCGTTTCCAGCGTTGGTGGATATCGAGGAAGGCTTCGATTTCGACCATGGTGCGGATGCGGCTGTCACGGGCGCCCTGGTGGCGGCTCTTGAAca > 5:282487/1‑112 (MQ=255) cGAATGGATAGCCCACGCGTTTCCAGCGTTGGTGGATATCGAGGAAGGCTTCGATTTCGACCATGGTGCGGATGCGGCTGTCACGGGCGCCCTGGTGGCGGCTCTTGAACAGCCAGCCGTATACCTCCTGGCGTTCGAAACGACTGGCg > 7:261174/1‑149 (MQ=255) aaTGGATAGCCCAGGCGTTTCCGTCGTTGGTGGATATCGAGGTAGGCTTCGATTTCGACCATGGTGGGTATGCGGCTGTCACGGGCGCCGTGGTGGCGGCTCTTTAACAGCCAGCCGTATACCTCCTGGCGTTCGAAACGACTGGCGtt < 5:204310/149‑1 (MQ=255) aaTGGATAGCCCACGCGTTTCCAGCGTTGGTGGATATCGAGGAAGGCTTCGATTTCGACCATGGTGCGGATGCGGCTGTCACGGGCGCCCTGGTGGCGGCTCTTGAACAGCCAGCCGTATACCTCCTGGCGTTCGAAACGACTGGCGtt < 5:320985/149‑1 (MQ=255) ggATAGCCCACGCGTTTCCAGCGTTGGTGGATATCGAGGAAGGCTTCGATTTCGACCATGGTGCGGATGCGGCTGTCACGGGCGCCCTGGTGGCGGCTCTTGAACAGCCAGCCGTATACCTCCTGGCGTTCGAAACGACTGGCGTTGa > 3:171252/1‑148 (MQ=255) gCCCACGCGTTTCCAGCGTTGGTGGATATCGAGGAAGGCTTCGATTTCGACCATGGTGCGGATGCGGCTGTCACGGGCGCCCTGGTGGCGGCTCTTGAACAGCCAGCCGTATACCTCCTGGCGTTCGAAACGACTGGCGTTGATCAtct < 8:261174/149‑1 (MQ=255) cccACGCGTTTCCAGCGTTGGTGGATATCGAGGAAGGCTTCGATTTCGACCATGGTGCGGATGCGGCTGTCACGGGCGCCCTGGTGGCGGCTCTTGAACAGCCAGCCGTATACCTCCTGGCGTTCGAAACGACTGGCGTTGATCAtctc > 2:86786/1‑149 (MQ=255) ccACGCGTTTCCAGCGTTGGTGGATATCGAGGAAGGCTTCGATTTCGACCATGGTGCGGATGCGGCTGTCACGGGCGCCCTGGTGGCGGCTCTTGAACAGCCAGCCGTATACCTCCTGGCGTTCGAAACGACTGGCGTTg > 8:76995/1‑140 (MQ=255) ccACGCGTTTCCAGCGTTGGTGGATATCGAGGAAGGCTTCGATTTCGACCATGGTGCGGATGCGGCTGTCACGGGCGCCCTGGTGGCGGCTCTTGAACAGCCAGCCGTATACCTCCTGGCGTTCGAAACGACTGGCGTTg < 7:76995/140‑1 (MQ=255) ccACGCGTTTCCAGCGTTGGTGGATATCGAGGAAGGCTTCGATTTCGACCATGGTGCGGATGCGGCTGTCACGGGCGCCCTGGTGGCGGCTCTTGAACAGCCAGCCGTATACCTCCTGGCGTTCGAAACGACTGGCGTTGATCAtctc > 3:219316/1‑148 (MQ=255) ccACGCGTTTCCAGCGTTGGTGGATATCGAGGAAGGCTTCGATTTCGACCATGGTGCGGATGCGGCTGTCACGGGCGCCCTGGTGGCGGCTCTTGAACAGCCAGCCGTATACCTCCTGGCGTTCGAAACGACTGGCGTTGATCAtctc < 4:219316/148‑1 (MQ=255) ccACGCGTTTCCAGCGTTGGTGGATATCGAGGAAGGCTTCGATTTCGACCATGGTGCGGATGCGGCTGTCACGGGCGCCCTGGTGGCGGCTCTTGAACAGCCAGCCGTATACCTCCTGGCGTTCGAAACGACTGGCGTTGATCATCTCg > 5:158882/1‑149 (MQ=255) ccACGCGTTTCCAGCGTTGGTGGATATCGAGGAAGGCTTCGATTTCGACCATGGTGCGGATGCGGCTGTCACGGGCGCCCTGGTGGCGGCTCTTGAACAGCCAGCCGTATACCTCCTGGCGTTCGAAACGACTGGCGTTGATCATCTCg > 7:53333/1‑149 (MQ=255) aCGCGTTTCCAGCGTTGGTGGATATCGAGGAAGGCTTCGATTTCGACCATGGTGCGGATGCGGCTGTCACGGGCGCCCTGGTGGCGGCTCTTGAACAGCCAGCCGTATACCTCCTGGCGTTCGAAACGACTGGCGTTGATCATCTCGGt > 2:93097/1‑149 (MQ=255) ccAGCGTTGGTGGATATCGAGGAAGGCTTCGATTTCGACCATGGTGCGGATGCGGCTGTCACGGGCGCCCTGGTGGCGGCTCTTGAAca > 2:8715/1‑89 (MQ=255) ccAGCGTTGGTGGATATCGAGGAAGGCTTCGATTTCGACCATGGTGCGGATGCGGCTGTCACGGGCGCCCTGGTGGCGGCTCTTGAAca < 1:8715/89‑1 (MQ=255) ccAGCGTTGGTGGATATCGAGGAAGGCTTCGATTTCGACCATGGTGCGGATGCGGCTGTCACGGGCGCCCTGGTGGCGGCTCTTGAACAGCCAGCCGTATACCTCCTGGCGTTCGAAACGACTGGCGTTGATCATCTCGGTCAGTGTc > 4:292771/1‑148 (MQ=255) cAGCGTTGGTGGATATCGAGGAAGGCTTCGATTTCGACCATGGTGCGGATGCGGCTGTCACGGGCGCCCTGGTGGCGGCTCTTGAACAGCCAGCCGTATACCTCCTGGCGTTCGAAACGACTGGCGt > 6:208538/1‑127 (MQ=255) cAGCGTTGGTGGATATCGAGGAAGGCTTCGATTTCGACCATGGTGCGGATGCGGCTGTCACGGGCGCCCTGGTGGCGGCTCTTGAACAGCCAGCCGTATACCTCCTGGCGTTCGAAACGACTGGCGt < 5:208538/127‑1 (MQ=255) cAGCGGTGGTGGATATGGAGGAAGGCGTCGATGTCGACCATGGTGCGGATGCGGCTGTCACGGGCGCCCTGGTGGCGGCTGTTGAACAGCCAGCCGTATACCTGCTGGCGGTCGAAGCGCGTGGGGTTGAGCGTGTCGGTGAggggc > 8:216868/1‑143 (MQ=255) aGCGTTGGTGGATATCGAGGAAGGCTTCGATTTCGACCATGGTGCGGATGCGGCTGTCACGGGCGCCCTGGTGGCGGCTCTTGAACAGCCAGCCGTATACCTCCTGGCGTTCGAAACGACTGGCGTTGATCATCTCGGTCAGTGTCGAg < 7:261319/149‑1 (MQ=255) ttGGTGGATATCGAGGAAGGCTTCGATTTCGACCATGGTGCGGATGCGGCTGTCACGGGCGCCCTGGTGGCGGCTCTTGAACAGCCAGCCGTATACCTCCTGGCGTTCGAAACGACTGGCGTTGATCATCTCGGTCAGTGTCGAGCTCg < 8:57266/149‑1 (MQ=255) gtggATATCGAGGAAGGCTTCGATTTCGACCATGGTGCGGATGCGGCTGTCACGGGCGCCCTGGTGGCGGCTCTTGAACAGCCAGCCGTATAcctcct < 8:60413/98‑1 (MQ=255) gtggATATCGAGGAAGGCTTCGATTTCGACCATGGTGCGGATGCGGCTGTCACGGGCGCCCTGGTGGCGGCTCTTGAACAGCCAGCCGTATACCTCCTGGCGTTCGAAACGACTGGCGTTGATCATCTCGGTCAGTGTCGAGCTCGGGt > 8:55599/1‑149 (MQ=255) atatCGAGGAAGGCTTCGATTTCGACCATGGTGCGGATGCGGCTGTCACGGGCGCCCTGGTGGCGGCTCTTGAACAGCCAGCCGTATACCTCCTGGCGTTCGAAACGACTGGCGTTGATCATCTCGGTCAGTGTCGAGCTCGGGttctt < 7:55599/149‑1 (MQ=255) tCGAGGAAGGCTTCGATTTCGACCATGGTGCGGATGCGGCTGTCACGGGCGCCCTGGTGGCGGCTCTTGAACAGCCAGCCGTATACCTCCTGGCGTTCGAAACGACTGGCGTTGATCATCTCGGTCAGTGTCGAGCTCGGGTTCTTca < 8:53333/148‑1 (MQ=255) cGAGGAAGGCTTCGATTTCGACCATGGTGCGGATGCGGCTGTCACGGGCGCCCTGGAGGCGGCTCTTGAACAGCCAGCCGTATACCTCCTGGCGTTCGAAACGACTGGCGTTGATCATCTCGGTCAGTGTCGAGCTCGGGTTCTTcag > 7:61589/1‑148 (MQ=255) gAGGAAGGCTTCGATTTCGACCATGGTGCGGATGCGGCTGTCACGGGCGCCCTGGTGGCGGCTCTTGAACAGCCAGCCGTATACCTCCTGGCGTTCGAAACGACTGGCGTTGATCATCTCGGTCAGTGTCGAGCTCGGGTTCTTcagca < 4:171252/149‑1 (MQ=255) gCTTCGATTTCGACCATGGTGCGGATGCGGCTGTCACGGGCGCCCTGGTGGCGGCTCTTGAACAGCCAGCCGTATACCTCCTGGCGTTCGAAACGACTGGCGTTGATCATCTCGGTCAGTGTCGAGCTCGGGTTCTTCAGCAGGTAGcc < 2:60259/149‑1 (MQ=255) cGATTTCGACCATGGTGCGGATGCGGCTGTCACGGGCGCCCTGGTGGCGGCTCTTGAACAGCCAGCCGTATACCTCCTGGCGTTCGAAACGACTGGCGTTGATCATCTCGGTCAGTGTCGAGCTCGGGTTCTTCAGCAGGTAGCCaa < 7:216868/147‑1 (MQ=255) gATTTCGACCATGGTGCGGATGCGGCTGTCACGGGCGCCCTGGTGGCGGCTCTTGAACAGCCAGCCGTATACCTCCTGGCGTTCGAAACGACTGGCGTTGATCATCTCGGTCAGTGTCGAGCTCGGGTTCTTCAGCAGGTAGCCAagc < 8:180961/148‑1 (MQ=255) tCGACCATGGTGCGGATGCGGCTGTCACGGGCGCCCTGGTGGCGGCTCTTGAACAGCCAGCCGTATACCTCCTGGCGTTCGAAACGACTGGCg > 8:221414/1‑93 (MQ=255) tCGACCATGGTGCGGATGCGGCTGTCACGGGCGCCCTGGTGGCGGCTCTTGAACAGCCAGCCGTATACCTCCTGGCGTTCGAAACGACTGGCg < 7:221414/93‑1 (MQ=255) tCGACCATGGTGCGGATGCGGCTGTCACGGGCGCCCTGGTGGCGGCTCTTGAACAGCCAGCCGTATACCTCCTGGCGTTCGAAACGACTGGCGTTGATCATCTCGGTCAGTGTCGAGCTCGGGTTCTTCAGCAGGTAGCCAAGCAGCca > 1:168786/1‑149 (MQ=255) gACCATGGTGCGGATGCGGCTGTCACGGGCGCCCTGGTGGCGGCTCTTGAACAGCCAGCCGTATACCTCCTGGCGTTCGAAACGACTGGCGTTGATCATCTCGGTCAGTGTCGAGCTCGGGTTCTTCAGCAGGTAGCCAAGCAGCca > 5:198873/1‑147 (MQ=255) gCGGATGCGGCTGTCACGGGCGCCCTGGTGGCGGCTCTTGAACAGCCAGCCGTATACCTCCTGGCGTTCGAAACGACTGGCGTTGATCATCTCGGTCAGTGTCGAGCTCGGGTTCTTCAGAAGGTAGCAAAGCAGCCAAAGGTCAAGCg > 8:199376/1‑149 (MQ=255) ggAGGCGGCTGTCACGGGCGCCCTGTTGGCGGCTCTTGAACAGCCAGCCGTATACCTCCTGGCGTTCGAAACGACTGGCGTTGATCATCTCGGTCAGTGTCGAGCTCGGGTTCTTCAGCAGGTAGCCAAGCAGCCACAGGTCCAGCggg < 8:111829/149‑1 (MQ=255) aTGCGGCTGTCACGGGCGCCCTGGTGGCGGCTCTTGAACAGCCAGCCGTATACCTCCTGGCGTTCGAAACGACTGGCGTTGATCATCTCGGTCAGTGTCGAGCTCGGGTTCTTCAGCAGGTAGCCAAGCAGCCACAGGTCCAGCGGGTg < 1:86786/149‑1 (MQ=255) GGCTGTCACGGGCGCCCTGGTGGCGGCTCTTGAACAGCCAGCCGTATACCTCCTGGCGTTCGAAACGACTGGCGTTGATCATCTCGGTCAGTGTCGAGCTCGGGt > 5:10962‑M1/1‑105 (MQ=255) GGCTGTCACGGGCGCCCTGGTGGCGGCTCTTGAACAGCCAGCCGTATACCTCCTGGCGTTCGAAACGACTGGCGTTGATCATCTCGGTCAGTGTCGAGCTCGGGt < 6:10962‑M1/105‑1 (MQ=255) | ACCAGTTCGGAGAGGGCAGCGGGGCGGTCGCCGGAGCTGCCGATGGCGGTGGCCAATGAGGGCACCAGGTGGTCGAATGGATAGCCCACGCGTTTCCAGCGTTGGTGGATATCGAGGAAGGCTTCGATTTCGACCATGGTGCGGATGCGGCTGTCACGGGCGCCCTGGTGGCGGCTCTTGAACAGCCAGCCGTATACCTCCTGGCGTTCGAAACGACTGGCGTTGATCATCTCGGTCAGTGTCGAGCTCGGGTTCTTCAGCAGGTAGCCAAGCAGCCACAGGTCCAGCGGGTG > NC_002947/1206407‑1206699 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |