New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1206555 = | 55 (1.090) | 3 (0.060) | 3/246 | NT | 5.9% | coding (2446/3150 nt) | PP_1058 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | 1206594 = | 43 (0.900) | coding (2407/3150 nt) | PP_1058 | hypothetical protein |
CGATGGCGGTGGCCAATGAGGGCACCAGGTGGTCGAATGGATAGCCCACGCGTTTCCAGCGTTGGTGGATATCGAGGAAGGCTTCGATTTCGACCATGGTGCGGATGCGGCTGTCACGGGCGCCCTGGTGGCGGCTCTTGAACAGCCAGCCGTATACCTCCTGGCGTTCGAAACGACTGGCGTTGATCATCTCGGTCAGTGTCGAGCTCGGGTTCTTCAGCAGGTAGCCAAGCAGCCACAGGTCCAGCGGGTGGACCTTGGCGATGTAACCCTGGTCGGGCAGGTCGTA > NC_002947/1206447‑1206735 | tccacccgctggacctgtggctgcttggctacctgctgaagaacccgagctcgacactgaccgagatgatcaacgccactcgtttcgaacgccaggaggtatacggctGGCTGTCACGGGCGCCCTGGTGGCGGCTCTTGAAcagccag > 8:100780‑M1/109‑149 (MQ=255) tGGCCAATGAGGGCACCAGGTGGTCGAATGGATAGCCCACGCGTTTCCAGCGTTGGTGGATATCGAGGAAGGCTTCGATTTCGACCATGGTGCGGATGCGGCTGTCACGGGCGCCCTGGTGGCGGCTCTTGAACAGCCAGCCGTATAcc > 7:196573/1‑149 (MQ=255) aGGGCACCAGGTGGTCGAATGGATAGCCCACGCGTTTCCAGCGTTGGTGGATATCGAGGAAGGCTTCGATTTCGACCATGGTGCGGATGCGGCTGTCACGGGCGCCCTGGTGGCGGCTCTTGAACAGCCAGCCGTATACCTCCTGGCg < 2:130459/148‑1 (MQ=255) gtCGAATGGATAGCCCACGCGTTTCCAGCGTTGGTGGATATCGAGGAAGGCTTCGATTTCGACCATGGTGCGGATGCGGCTGTCACGGGCGCCCTGGTGGCGGCTCTTGAACAGCCAGCCGTATACCTCCTGGCGTTCGAAACGACTgg > 8:261319/1‑149 (MQ=255) cGAATGGATAGCCCACGCGTTTCCAGCGTTGGTGGATATCGAGGAAGGCTTCGATTTCGACCATGGTGCGGATGCGGCTGTCACGGGCGCCCTGGTGGCGGCTCTTGAACAGCCAGCCGTATACCTCCTGGCGTTCGAAACGACTGGCg > 7:261174/1‑149 (MQ=255) aaTGGATAGCCCAGGCGTTTCCGTCGTTGGTGGATATCGAGGTAGGCTTCGATTTCGACCATGGTGGGTATGCGGCTGTCACGGGCGCCGTGGTGGCGGCTCTTTAACAGCCAGCCGTATACCTCCTGGCGTTCGAAACGACTGGCGtt < 5:204310/149‑1 (MQ=255) aaTGGATAGCCCACGCGTTTCCAGCGTTGGTGGATATCGAGGAAGGCTTCGATTTCGACCATGGTGCGGATGCGGCTGTCACGGGCGCCCTGGTGGCGGCTCTTGAACAGCCAGCCGTATACCTCCTGGCGTTCGAAACGACTGGCGtt < 5:320985/149‑1 (MQ=255) ggATAGCCCACGCGTTTCCAGCGTTGGTGGATATCGAGGAAGGCTTCGATTTCGACCATGGTGCGGATGCGGCTGTCACGGGCGCCCTGGTGGCGGCTCTTGAACAGCCAGCCGTATACCTCCTGGCGTTCGAAACGACTGGCGTTGa > 3:171252/1‑148 (MQ=255) gCCCACGCGTTTCCAGCGTTGGTGGATATCGAGGAAGGCTTCGATTTCGACCATGGTGCGGATGCGGCTGTCACGGGCGCCCTGGTGGCGGCTCTTGAACAGCCAGCCGTATACCTCCTGGCGTTCGAAACGACTGGCGTTGATCAtct < 8:261174/149‑1 (MQ=255) cccACGCGTTTCCAGCGTTGGTGGATATCGAGGAAGGCTTCGATTTCGACCATGGTGCGGATGCGGCTGTCACGGGCGCCCTGGTGGCGGCTCTTGAACAGCCAGCCGTATACCTCCTGGCGTTCGAAACGACTGGCGTTGATCAtctc > 2:86786/1‑149 (MQ=255) ccACGCGTTTCCAGCGTTGGTGGATATCGAGGAAGGCTTCGATTTCGACCATGGTGCGGATGCGGCTGTCACGGGCGCCCTGGTGGCGGCTCTTGAACAGCCAGCCGTATACCTCCTGGCGTTCGAAACGACTGGCGTTg > 8:76995/1‑140 (MQ=255) ccACGCGTTTCCAGCGTTGGTGGATATCGAGGAAGGCTTCGATTTCGACCATGGTGCGGATGCGGCTGTCACGGGCGCCCTGGTGGCGGCTCTTGAACAGCCAGCCGTATACCTCCTGGCGTTCGAAACGACTGGCGTTg < 7:76995/140‑1 (MQ=255) ccACGCGTTTCCAGCGTTGGTGGATATCGAGGAAGGCTTCGATTTCGACCATGGTGCGGATGCGGCTGTCACGGGCGCCCTGGTGGCGGCTCTTGAACAGCCAGCCGTATACCTCCTGGCGTTCGAAACGACTGGCGTTGATCAtctc < 4:219316/148‑1 (MQ=255) ccACGCGTTTCCAGCGTTGGTGGATATCGAGGAAGGCTTCGATTTCGACCATGGTGCGGATGCGGCTGTCACGGGCGCCCTGGTGGCGGCTCTTGAACAGCCAGCCGTATACCTCCTGGCGTTCGAAACGACTGGCGTTGATCAtctc > 3:219316/1‑148 (MQ=255) ccACGCGTTTCCAGCGTTGGTGGATATCGAGGAAGGCTTCGATTTCGACCATGGTGCGGATGCGGCTGTCACGGGCGCCCTGGTGGCGGCTCTTGAACAGCCAGCCGTATACCTCCTGGCGTTCGAAACGACTGGCGTTGATCATCTCg > 5:158882/1‑149 (MQ=255) ccACGCGTTTCCAGCGTTGGTGGATATCGAGGAAGGCTTCGATTTCGACCATGGTGCGGATGCGGCTGTCACGGGCGCCCTGGTGGCGGCTCTTGAACAGCCAGCCGTATACCTCCTGGCGTTCGAAACGACTGGCGTTGATCATCTCg > 7:53333/1‑149 (MQ=255) aCGCGTTTCCAGCGTTGGTGGATATCGAGGAAGGCTTCGATTTCGACCATGGTGCGGATGCGGCTGTCACGGGCGCCCTGGTGGCGGCTCTTGAACAGCCAGCCGTATACCTCCTGGCGTTCGAAACGACTGGCGTTGATCATCTCGGt > 2:93097/1‑149 (MQ=255) ccAGCGTTGGTGGATATCGAGGAAGGCTTCGATTTCGACCATGGTGCGGATGCGGCTGTCACGGGCGCCCTGGTGGCGGCTCTTGAACAGCCAGCCGTATACCTCCTGGCGTTCGAAACGACTGGCGTTGATCATCTCGGTCAGTGTc > 4:292771/1‑148 (MQ=255) cAGCGTTGGTGGATATCGAGGAAGGCTTCGATTTCGACCATGGTGCGGATGCGGCTGTCACGGGCGCCCTGGTGGCGGCTCTTGAACAGCCAGCCGTATACCTCCTGGCGTTCGAAACGACTGGCGt < 5:208538/127‑1 (MQ=255) cAGCGTTGGTGGATATCGAGGAAGGCTTCGATTTCGACCATGGTGCGGATGCGGCTGTCACGGGCGCCCTGGTGGCGGCTCTTGAACAGCCAGCCGTATACCTCCTGGCGTTCGAAACGACTGGCGt > 6:208538/1‑127 (MQ=255) cAGCGGTGGTGGATATGGAGGAAGGCGTCGATGTCGACCATGGTGCGGATGCGGCTGTCACGGGCGCCCTGGTGGCGGCTGTTGAACAGCCAGCCGTATACCTGCTGGCGGTCGAAGCGCGTGGGGTTGAGCGTGTCGGTGAggggc > 8:216868/1‑143 (MQ=255) aGCGTTGGTGGATATCGAGGAAGGCTTCGATTTCGACCATGGTGCGGATGCGGCTGTCACGGGCGCCCTGGTGGCGGCTCTTGAACAGCCAGCCGTATACCTCCTGGCGTTCGAAACGACTGGCGTTGATCATCTCGGTCAGTGTCGAg < 7:261319/149‑1 (MQ=255) ttGGTGGATATCGAGGAAGGCTTCGATTTCGACCATGGTGCGGATGCGGCTGTCACGGGCGCCCTGGTGGCGGCTCTTGAACAGCCAGCCGTATACCTCCTGGCGTTCGAAACGACTGGCGTTGATCATCTCGGTCAGTGTCGAGCTCg < 8:57266/149‑1 (MQ=255) gtggATATCGAGGAAGGCTTCGATTTCGACCATGGTGCGGATGCGGCTGTCACGGGCGCCCTGGTGGCGGCTCTTGAACAGCCAGCCGTATAcctcct < 8:60413/98‑1 (MQ=255) gtggATATCGAGGAAGGCTTCGATTTCGACCATGGTGCGGATGCGGCTGTCACGGGCGCCCTGGTGGCGGCTCTTGAACAGCCAGCCGTATACCTCCTGGCGTTCGAAACGACTGGCGTTGATCATCTCGGTCAGTGTCGAGCTCGGGt > 8:55599/1‑149 (MQ=255) atatCGAGGAAGGCTTCGATTTCGACCATGGTGCGGATGCGGCTGTCACGGGCGCCCTGGTGGCGGCTCTTGAACAGCCAGCCGTATACCTCCTGGCGTTCGAAACGACTGGCGTTGATCATCTCGGTCAGTGTCGAGCTCGGGttctt < 7:55599/149‑1 (MQ=255) tCGAGGAAGGCTTCGATTTCGACCATGGTGCGGATGCGGCTGTCACGGGCGCCCTGGTGGCGGCTCTTGAACAGCCAGCCGTATACCTCCTGGCGTTCGAAACGACTGGCGTTGATCATCTCGGTCAGTGTCGAGCTCGGGTTCTTca < 8:53333/148‑1 (MQ=255) cGAGGAAGGCTTCGATTTCGACCATGGTGCGGATGCGGCTGTCACGGGCGCCCTGGAGGCGGCTCTTGAACAGCCAGCCGTATACCTCCTGGCGTTCGAAACGACTGGCGTTGATCATCTCGGTCAGTGTCGAGCTCGGGTTCTTcag > 7:61589/1‑148 (MQ=255) gAGGAAGGCTTCGATTTCGACCATGGTGCGGATGCGGCTGTCACGGGCGCCCTGGTGGCGGCTCTTGAACAGCCAGCCGTATACCTCCTGGCGTTCGAAACGACTGGCGTTGATCATCTCGGTCAGTGTCGAGCTCGGGTTCTTcagca < 4:171252/149‑1 (MQ=255) gCTTCGATTTCGACCATGGTGCGGATGCGGCTGTCACGGGCGCCCTGGTGGCGGCTCTTGAACAGCCAGCCGTATACCTCCTGGCGTTCGAAACGACTGGCGTTGATCATCTCGGTCAGTGTCGAGCTCGGGTTCTTCAGCAGGTAGcc < 2:60259/149‑1 (MQ=255) cGATTTCGACCATGGTGCGGATGCGGCTGTCACGGGCGCCCTGGTGGCGGCTCTTGAACAGCCAGCCGTATACCTCCTGGCGTTCGAAACGACTGGCGTTGATCATCTCGGTCAGTGTCGAGCTCGGGTTCTTCAGCAGGTAGCCaa < 7:216868/147‑1 (MQ=255) gATTTCGACCATGGTGCGGATGCGGCTGTCACGGGCGCCCTGGTGGCGGCTCTTGAACAGCCAGCCGTATACCTCCTGGCGTTCGAAACGACTGGCGTTGATCATCTCGGTCAGTGTCGAGCTCGGGTTCTTCAGCAGGTAGCCAagc < 8:180961/148‑1 (MQ=255) tCGACCATGGTGCGGATGCGGCTGTCACGGGCGCCCTGGTGGCGGCTCTTGAACAGCCAGCCGTATACCTCCTGGCGTTCGAAACGACTGGCg < 7:221414/93‑1 (MQ=255) tCGACCATGGTGCGGATGCGGCTGTCACGGGCGCCCTGGTGGCGGCTCTTGAACAGCCAGCCGTATACCTCCTGGCGTTCGAAACGACTGGCg > 8:221414/1‑93 (MQ=255) tCGACCATGGTGCGGATGCGGCTGTCACGGGCGCCCTGGTGGCGGCTCTTGAACAGCCAGCCGTATACCTCCTGGCGTTCGAAACGACTGGCGTTGATCATCTCGGTCAGTGTCGAGCTCGGGTTCTTCAGCAGGTAGCCAAGCAGCca > 1:168786/1‑149 (MQ=255) gACCATGGTGCGGATGCGGCTGTCACGGGCGCCCTGGTGGCGGCTCTTGAACAGCCAGCCGTATACCTCCTGGCGTTCGAAACGACTGGCGTTGATCATCTCGGTCAGTGTCGAGCTCGGGTTCTTCAGCAGGTAGCCAAGCAGCca > 5:198873/1‑147 (MQ=255) gCGGATGCGGCTGTCACGGGCGCCCTGGTGGCGGCTCTTGAACAGCCAGCCGTATACCTCCTGGCGTTCGAAACGACTGGCGTTGATCATCTCGGTCAGTGTCGAGCTCGGGTTCTTCAGAAGGTAGCAAAGCAGCCAAAGGTCAAGCg > 8:199376/1‑149 (MQ=255) ggAGGCGGCTGTCACGGGCGCCCTGTTGGCGGCTCTTGAACAGCCAGCCGTATACCTCCTGGCGTTCGAAACGACTGGCGTTGATCATCTCGGTCAGTGTCGAGCTCGGGTTCTTCAGCAGGTAGCCAAGCAGCCACAGGTCCAGCggg < 8:111829/149‑1 (MQ=255) aTGCGGCTGTCACGGGCGCCCTGGTGGCGGCTCTTGAACAGCCAGCCGTATACCTCCTGGCGTTCGAAACGACTGGCGTTGATCATCTCGGTCAGTGTCGAGCTCGGGTTCTTCAGCAGGTAGCCAAGCAGCCACAGGTCCAGCGGGTg < 1:86786/149‑1 (MQ=255) ctggctgttcaagagccgccaccagggcgcccgtgacagccAGCCGTATACCTCCTGGCGTTCGAAACGAGTGGCGTTGATCATCTCGGTCAGTGTCGAGCTCGGGTTCTTCAGCAGGTAGCCAAGCAGCCACAGGTCCAGCGGGTGGa > 8:100780‑M2/42‑149 (MQ=255) GGCTGTCACGGGCGCCCTGGTGGCGGCTCTTGAACAGCCAGCCGTATACCTCCTGGCGTTCGAAACGACTGGCGTTGATCATCTCGGTCAGTGTCGAGCTCGGGt < 6:10962‑M1/105‑1 (MQ=255) GGCTGTCACGGGCGCCCTGGTGGCGGCTCTTGAACAGCCAGCCGTATACCTCCTGGCGTTCGAAACGACTGGCGTTGATCATCTCGGTCAGTGTCGAGCTCGGGt > 5:10962‑M1/1‑105 (MQ=255) gctgttcaagagccgccaccagggcgcccgtgacagccAGCCGTATACCTCCTGGCGTTCGAAACGACTGGCGTTGATCATCTCGGTCAGTGTCGAGCTCGGGTTCTTCAGCAGGTAg > 6:257096‑M2/39‑118 (MQ=255) gctgttcaagagccgccaccagggcgcccgtgacagccAGCCGTATACCTCCTGGCGTTCGAAACGACTGGCGTTGATCATCTCGGTCAGTGTCGAGCTCGGGTTCTTCAGCAGGTAg < 5:257096‑M2/80‑1 (MQ=255) TGTCACGGGCGCCCTGGTGGCGGCTCTTGAACAGCCAGCCGTATACCTCCTGGCGTTCGTAACGACTGGCGTTGATCATCTCGGTCAGTGTCGAGCTCGGGTTCTTCAGCAGGTAGCCAAGCAGCCACAGGTCCAGCGGGTGGACCTTg > 8:196573‑M1/1‑149 (MQ=255) TCACGGGCGCCCTGGTGGCGGCTCTTGAACAGCCAGCCGTATACCTCCTGGCGTTCGAAACGACTGGCGTTGATCATCTCGGTCAGTGTCGAGCTCGGGTTCTTCAGCAGGTAGCCAAGCAGCCACAGGTCCAGCGGGTGGACCTTg > 7:291941‑M1/1‑147 (MQ=255) aCGGGCGCCCTGGTGGCGGCTCTTGAACAGCCAGCCGTATACCTCCTGGCGTTCGAAACGACTGGCGTTGATCATCTCGGTCAGTGTCGAGCTCGGGTTCTTCAGCAGGTAGCCAAGCAGCCACAGGTCCAGCGGGTGGACCTTGGCg < 7:199376/148‑1 (MQ=255) gggCGCCCTGGTGGCGGCTCTTGAACAGCCAGCCGTATACCTCCTGGCGTTCGAAACGACTGGCGTTGATCATCTCGGTCAGTGTCGAGCTCGGGTTCTTCAGCAGGTAGCCAAGCAGCCACAGGTCGAGCGGGTGGACCTTGGCGATg > 5:223851/1‑149 (MQ=255) cgcCCTGGTGGCGGCTCTTGAACAGCCAGCCGTATACCTCCTGGCGTTCGAAACGACTGGCGTTGATCATCTCGGTCAGTGTCGAGCTCGGGTTCTTCAGCAGGTAGCCAAGCAGCCACAGGTCCAGCGGGTGGACCTTGGCGATGTaa < 6:158882/149‑1 (MQ=255) cTGGTGGCGGCTCTTGAACAGCCAGCCGTATACCTCCTGGCGTTCGAAACGACTGGCGTTGATCATCTCGGTCAGTGTCGAGCTCGGGTTCTTCAGCAGGTAGCCAAGCAGCCACAGGTCCAGCGGGTGGACCTTGGCGATGTAACCCt < 2:168786/149‑1 (MQ=255) gcggcTCTTGAACAGCCAGCCGTATACCTCCTGGCGTTCGAAACGACTGGCGTTGATCATCTCGGTCAGTGTCGAGCTCGGGTTCTTCAGCAGGTAGCCAAGCAGCCACAGGTCTAGCGGGTGGACCTTGGCGATGTAACCCTGGTCgg < 6:223851/149‑1 (MQ=255) ctTGAACAGCCAGCCGTATACCTCCTGGCGTTCGAAACGACTGGCGTTGATCATCTCGGTCAGTGTCGAGCTCGGGTTCTTCAGCAGGTAGCCAAGCAGCCACAGGTCCAGCGGGTGGACCTTGGCGATGTAACCCTGGTCGGGCAGGt > 6:145658/1‑149 (MQ=255) ttGAACAGCCAGCCGTATACCTCCTGGCGTTCGAAACGACTGGCGTTGATCATCTCGGTCAGTGTCGAGCTCGGGTTCTTCAGCAGGTAGCCAAGCAGCCACAGGTCCAGCGGGTGGACCTTGGCGATGTAACCCTGGTCGGGCAGGTc > 1:121840/1‑149 (MQ=255) tGAACAGCCAGCCGTATACCTCCTGGCGTTCGAAACGACTGGCGTTGATCATCTCGGTCAGTGTCGAGCTCGGGTTCTTCAGCAGGTAGCCAAGCAGCCACAGGTCCAGCGGGTGGACCTTGGCGATGTAACCCTGGTCg > 8:215944/1‑140 (MQ=255) tGAACAGCCAGCCGTATACCTCCTGGCGTTCGAAACGACTGGCGTTGATCATCTCGGTCAGTGTCGAGCTCGGGTTCTTCAGCAGGTAGCCAAGCAGCCACAGGTCCAGCGGGTGGACCTTGGCGATGTAACCCTGGTCg < 7:215944/140‑1 (MQ=255) aaCAGCCAGCCGTATACCTCCTGGCGTTCGAAACGACTGGCGTTGATCATCTCGGTCAGTGTCGAGCTCGGGTTCTTCAGCAGGTAGCCAAGCAGCCACAGGTCCAGCGGGTGGACCTTGGCGATGTAACCCTGGTCGGGCAGGTCGTa > 2:27915/1‑149 (MQ=255) | CGATGGCGGTGGCCAATGAGGGCACCAGGTGGTCGAATGGATAGCCCACGCGTTTCCAGCGTTGGTGGATATCGAGGAAGGCTTCGATTTCGACCATGGTGCGGATGCGGCTGTCACGGGCGCCCTGGTGGCGGCTCTTGAACAGCCAGCCGTATACCTCCTGGCGTTCGAAACGACTGGCGTTGATCATCTCGGTCAGTGTCGAGCTCGGGTTCTTCAGCAGGTAGCCAAGCAGCCACAGGTCCAGCGGGTGGACCTTGGCGATGTAACCCTGGTCGGGCAGGTCGTA > NC_002947/1206447‑1206735 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |