New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2501809 = | 34 (0.680) | 3 (0.060) | 3/248 | NT | 8.5% | coding (248/1089 nt) | PP_2195 | putrescine‑binding protein |
? | NC_002947 | 2501860 = | 32 (0.660) | coding (299/1089 nt) | PP_2195 | putrescine‑binding protein |
CGTCGCCCCGCAAACCCTGCAGCGCTTCGAACAGGAAACGGGCTACAAGGTGCGGTACGACACCTTTGACACCCCCGAAGTGCTGGAAACCAAGCTGTTGACCGGTGGTAGCGGCT‑ACGACGTGGTGGTGCCGTCATCCACCGTGCTGGCCCGAGCGCTCAAGGCCCATGCCCTGCAACCGCTGGACGCTCAGGCCATGCCTGGTTATGGCAACCTCGACAAGGACCTGCTGGGCAAACTGGCCGAGGTTGACCCCGGCAACCGCCATGCTGTGCCGTACACCTGGGGCACG > NC_002947/2501663‑2501954 | cGTCGCCCCGCAAACCCTGCAGCGCTTCGAACAGGAAACGGGCTACAAGGTGCGGTACGACACCTTTGACACCCCCGAAGTGCTGGAAACCAAGCTGTTGGCCGGAGGTAGCGGCT‑ACGACGTGGTGGTGCCGTCATCCACCGTGCTg < 3:226521/148‑1 (MQ=255) cGTCGCCCCGCAAACCCTGCAGCGCTTCGAACAGGAAACGGGCTACAAGGTGCGGTACGACACCTTTGACACCCCCGAAGTGCTGGAAACCAAGCTGTTGACCGGTGGTAGCGGCT‑ACGACGTGGTGGTGCCGTCATCCACCGTGCTgg < 7:278462/149‑1 (MQ=255) gTCGCCCCGCAAACCCTGCAGCGCTTCGAACAGGAAACGGGCTACAAGGTGCGGTACGACACCTTTGACACCCCCGAAGTGCTGGAAACCAAGCTGTTGACCGGTGGTAGCGGCT‑ACGACGTGGTGGTGCCGTCATCCACCGTGCTGGc > 2:189604/1‑149 (MQ=255) catcgccaaggcgctggcgtactgcctccacatttacccccaggcccagcgtgccccaggtgttcggcacagcatggcggttgccggggtcaacctcggccagtttgcccagcaggtccttgtcgaggttgccataaccaggcaTGGc > 7:88892‑M1/145‑148 (MQ=255) atcgccaaggcgctggcgtactgcctccacatttacccccaggcccagcgtgccccaggtgtacggcacagcatggcggttgccggggtcaacctcggccagtttgcccagcaggtccttgtcgaggttgccataaccaggcaTGGcc < 4:23876‑M1/5‑1 (MQ=255) atcgccaaggcgctggcgtactgcctccacatttacccccaggcccagcgtgccccaggtgtacggcacagcatggcggttgccggggtcaacctcggccagtttgcccagcaggtccttgtcgaggttgccataaccaggcaTGGcc > 3:23876‑M1/144‑148 (MQ=255) ccccGCAAACCCTGCAGCGCTTCGAACAGGAAACGGGCTACAAGGTGCGGTACGACACCTTTGACACCCCCGAAGTGCTGGAAACCAAGCTGTTGACCGGTGGTAGCGGCT‑ACGACGTGGTGGTGCCGTCATCCACCGTGCTGGccc > 7:243633/1‑147 (MQ=255) ccGCAAACCCTGCAGCGCTTCGAACAGGAAACGGGCTACAAGGTGCGGTACGACACCTTTGACACCCCCGAAGTGCTGGAAACCAAGCTGTTGACCGGTGGTAGCGGCT‑ACGACGTGGTGGTGCCGTCATCCACCGTGCTGGCCCGAgc > 8:87669/1‑149 (MQ=255) cAAACCCTGCAGCGCTTCGAACAGGAAACGGGCTACAAGGTGCGGTACGACACCTTTGACACCCCCGAAGTGCTGGAAACCAAGCTGTTGACCGGTGGTAGCGGCT‑ACGACGTGGTGGTGCCGTCATCCACCGTGCTGGCCCGAGCGCt > 2:261340/1‑149 (MQ=255) cTGCAGCGCTTCGAACAGGAAACGGGCTACAAGGTGCGGTACGACACCTTTGACACCCCCGAAGTGCTGGAAACCAAGCTGTTGACCGGTGGTAGCGGCT‑ACGACGTGGTGGTGCCGTCATCCACCGTGCTGGc > 8:139318/1‑134 (MQ=255) cTGCAGCGCTTCGAACAGGAAACGGGCTACAAGGTGCGGTACGACACCTTTGACACCCCCGAAGTGCTGGAAACCAAGCTGTTGACCGGTGGTAGCGGCT‑ACGACGTGGTGGTGCCGTCATCCACCGTGCTGGc < 7:139318/134‑1 (MQ=255) cAGCGCTTCGAACAGGAAACGGGCTACAAGGTGCGGTACGACACCTTTGACACCCCCGAAGTGCTGGAAACCAAGCTGTTGACCGGTGGTAGCGGCT‑ACGACGTGGTGGTGCCGTCATCCACCGTGCTGGCCCGAGCGCTCAAGGCCCa > 2:308896/1‑149 (MQ=255) aGCGCTTCGAACAGGAAACGGGCTACAAGGTGCGGTACGACACCTTTGACACCCCCGAAGTGCTGGAAACCAAGCTGTTGACCGGTGGTAGCGGCT‑ACGACGTGGTGGTGCCGTCATCCACCGTGCTGGCCCGAGCGCTCAAGGCCCAt < 6:54952/149‑1 (MQ=255) gcgcTTCGAACAGGAAACGGGCTACAAGGTGCGGTACGACACCTTTGACACCCCCGAAGTGCTGGAAACCAAGCTGTTGACCGGTGGTAGCGGCT‑ACGACGTGGTGGTGCCGTCATCCACCGTGCTGGCCCGAGCGCTCAAGGCCCATg < 1:179585/149‑1 (MQ=255) cGAACAGGAAACGGGCTACAAGGTGCGGTACGACACCTTTGACACCCCCGAAGTGCTGGAAACCAAGCTGTTGACCGGTGGTAGCGGCT‑ACGACGTGGTGGTGCCGTCATCCACCGTGCTGGCCCGAGCGCTCAAGGCCCATGCCCTg < 7:87669/148‑1 (MQ=255) gAACAGGAAACGGGCTACAAGGTGCGGTACGACACCTTTGACACCCCCGAAGTGCTGGAAACCAAGCTGTTGACCGGTGGTAGCGGCT‑ACGACGTGGTGGTGCCGTCATCCACCGTGCTGGCCCGAGCGCTCAAGGCCCATGCCCTGc < 8:270998/148‑1 (MQ=255) gAACAGGAAACGGGCTACAAGGTGCGGTACGACACCTTTGACACCCCCGAAGTGCTGGAAACCAAGCTGTTGACCGGTGGTAGCGGCT‑ACGACGTGGTGGTGCCGTCATCCACCGTGCTGGCCCGAGCGCTCAAGGCCCATGCCCTGc < 8:98150/148‑1 (MQ=255) aaCAGGAAACGGGCTACAAGGTGCGGTACGACACCTTTGACACCCCCGAAGTGCTGGAAACCAAGCTGTTGACCGGTGGTAGCGGCT‑ACGACGTGGTGGTGCCGTCATCCACCGTGCTGGCCCGAGCGCTCAAGGCCCATGCCCTGCaa > 4:192146/1‑149 (MQ=255) aaaCGGGCTACAAGGTGCGGTACGACACCTTTGACACCCCCGAAGTGCTGGAAACCAAGCTGTTGACCGGTGGTAGCGGCT‑ACGACGTGGTGGTGCCGTCATCCACCGTGCTGGCCCGAGCGCTCAAGGCCCATGCCCTGCAACCGCTg > 4:145668/1‑149 (MQ=255) aaCGGGCTACAAGGTGCGGTACGACACCTTTGACACCCCCGAAGTGCTGGAAACCAAGCTGTTGACCGGTGGTAGCGGCT‑ACGACGTGGTGGTGCCGTCATCCACCGTGCTGGCCCGAGCGCTCAAGGCCCATGCCCTGCAACCGCTgg < 8:243633/149‑1 (MQ=255) cAAGGTGCGGTACGACACCTTTGACACCCCCGAAGTGCTGGAAACCAAGCTGTTGACCGGTGGTAGCGGCT‑ACGACGTGGTGGTGCCGTCATCCACCGTGCTGGCCCGAGCGCTCAAGGCCCATGCCCTGCAACCGCTGGACGCTCAgg < 1:189604/149‑1 (MQ=255) cAAGGTGCGGTACGACACCTTTGACACCCCCGAAGTGCTGGAAACCAAGCTGTTGACCGGTGGTAGCGGCT‑ACGACGTGGTGGTGCCGTCATCCACCGTGCTGGCCCGAGCGCTCAAGGCCCATGCCCTGCAACCGCTGGACGCTCAgg < 2:151493/149‑1 (MQ=255) cAAGGTGCGGTACGACACCTTTGACACCCCCGAAGTGCTGGAAACCAAGCTGTTGACCAGTGGTAGCGGCTCTATTCGTGGTGGTGCCGTCATCCACCGTGCTGGCCCGAGCGCTCAAGGCCCATGCCCTGCAACCGCTGGACGCTCa < 1:261340/148‑1 (MQ=255) aaGGTGCGGTACGACACCTTTGACACCCCCGAAGTGCTGGAAACCAAGCTGTTGACCGGTGGTAGCGGCT‑ACGACGTGGTGGTGCCGTCATCCACCGTGCTGGCCCGAGCGCTCAAGGCCCATGCCCTGCAACCGCTGGACGCTCAGGc < 4:230710/149‑1 (MQ=255) gTGCGGTACGACACCTTTGACACCCCCGAAGTGCTGGAAACCAAGCTGTTGACCGGTGGTAGCGGCT‑ACGACGTGGTGGTGCCGTCATCCACCGTGCTGGCCCGAGCGCTCAAGGCCCATGCCCTGCAACCGCTGGACGCTCAGGCCAt < 3:185275/149‑1 (MQ=255) gcgtgccccaggtgtacggcacagcatggcggttgccggggtcaacctcggccagtttgcccagcaggtccttgtcgaggttgccataaccaggcaTGGCCCGAGCGCTCAAGGCCCATGCCCTGCAACCGCTGGACGCTCAGGCCATg > 6:59880‑M1/97‑149 (MQ=255) acacCTTTGACACCCCCGAAGTGCTGGAAACCAAGCTGTTGACCGGTGGTAGCGGCT‑ACGACGTGGTGGTGCCGTCATCCACCGTGCTGGCCCGAGCGCTCAAGGCCCATGCCCTGCAACCGCTGGACGCTCAGGCCATGCCTGGTTAt < 1:308896/149‑1 (MQ=255) cTTTGACACCCCCGAAGTGCTGGAAACCAAGCTGTTGACCGGTGGTAGCGGCT‑ACGACGTGGTGGTGCCGTCATCCACCGTGCTGGCCCGAGCGCTCAAGGCCCATGCCCTGCAACCGCTGGACGCTCAGGCCATGCCTGGTTATGGc > 2:279663/1‑148 (MQ=255) aGTGCTGGAAACCAAGCTGTTGACCGGTGGTAGCGGCT‑ACGACGTGGTGGTGCCGTCATCCACCGTGCTGGCCCGAGCGCTCAAGGCCCATGCCCTGCAACCGCTGGACGCTCAGGCCATGCCTGGTTATGGCAACCTCGACAAGGAcc > 2:308553/1‑149 (MQ=255) cTGGAAACCAAGCTGTTGACCGGTGGTAGCGGCT‑ACGACGTGGTGGTGCCGTCATCCACCGTGCTGGCCCGAGCGCTCAAGGCCCATGCCCTGCAACCGCTGGACGCTCAGGCCATGCCTGGTTATGGCAACCTCGACAAGGACctgc < 1:308553/148‑1 (MQ=255) ggAAACCAAGCTGTTGACCGGTGGTAGCGGCT‑ACGACGTGGTGGTGCCGTCATCCACCGTGCTGGCCCGAGCGCTCAAGGCCCATGCCCTGCAACCGCTGGACGCTCAGGCCATGCCTGGTTATgg > 4:24662/1‑126 (MQ=255) ggAAACCAAGCTGTTGACCGGTGGTAGCGGCT‑ACGACGTGGTGGTGCCGTCATCCACCGTGCTGGCCCGAGCGCTCAAGGCCCATGCCCTGCAACCGCTGGACGCTCAGGCCATGCCTGGTTATgg < 3:24662/126‑1 (MQ=255) aaGCTGTTGACCGGTGGTAGCGGCT‑ACGACGTGGTGGTGCCGTCATCCACCGTGCTGGCCCGAGCGCTCAAGGCCCATGCCCTGCAACCGCTGGACGCTCAGGCCATGCCTGGTTATGGCAACCTCGACAAGGACCTGCTGGGCAAACt < 3:145668/149‑1 (MQ=255) aaGCTGTTGACCGGTGGTAGCGGCT‑ACGACGTGGTGGTGCCGTCATCCACCGTGCTGGCCCGAGCGCTCAAGGCCCATGCCCTGCAACCGCTGGACGCTCAGGCCATGCCTGGTTATGGCAACCTCGACAAGGACCTGCTGGGCAAACt > 8:121905/1‑149 (MQ=255) gTTGACCGGTGGTAGCGGCT‑ACGACGTGGTGGTGCCGTCATCCACCGTGCTGGCCCGAGCGCTCAAGGCCCATGCCCTGCAACCGCTGGACGCTCAGGCCATGCCTGGTTATGGCAACCTCGACAAGGACCTGCTGGGCAAACTGGcc > 5:322317/1‑148 (MQ=255) cctcggccagtttgcccagcaggtccttgtcgaggttgccataaccaggcaTGGCCCGAGCGCTCAAGGCCCATGCCCTGCAACCGCTGGACGCTCAGGCCATGCCTg > 8:65843‑M1/52‑108 (MQ=255) cctcggccagtttgcccagcaggtccttgtcgaggttgccataaccaggcaTGGCCCGAGCGCTCAAGGCCCATGCCCTGCAACCGCTGGACGCTCAGGCCATGCCTg < 7:65843‑M1/57‑1 (MQ=255) gACCGGTGGTAGCGGCT‑ACGACGTGGTGGTGCCGTCATCCACCGTGCTGGCCCGAGCGCTCAAGGCCCATGCCCTGCAACCGCTGGACGCTCAGGCCATGCCTGGTTATGGCAACCTCGACAAGGAc < 8:165763/127‑1 (MQ=255) gACCGGTGGTAGCGGCT‑ACGACGTGGTGGTGCCGTCATCCACCGTGCTGGCCCGAGCGCTCAAGGCCCATGCCCTGCAACCGCTGGACGCTCAGGCCATGCCTGGTTATGGCAACCTCGACAAGGAc > 7:165763/1‑127 (MQ=255) aCCGGTGGTAGCGGCT‑ACGACGTGGTGGTGCCGTCATCCACCGTGCTGGCCCGAGCGCTCAAGGCCCATGCCCTGCAACCGCTGGACGCTCAGGCCATGCCTGGTTATGGCAACCTCGACAAGGACCTGCTGGGCAAACTGGCCGAGGt < 3:192146/149‑1 (MQ=255) cgacgTGGTGGTGCCGTCATCCACCGTGCTGGCCCGAGCGCTCAAGGCCCATGCCCTGCAACCGCTGGACGCTCAGGCCATGCCTGGTTATGGCAACCTCGACAAGGACCTGCTGGGCAAACTGGCCGAGGTTGACCCCGGCAACCGc > 1:227217/1‑148 (MQ=255) gtgCCGTCATCCACCGTGCTGGCCCGAGCGCTCAAGGCCCATGCCCTGCAACCGCTTGACGCTCAGGCCATGCCTGGTTATGGCAACCTCGACAAGGACCTGCTGGGCAAACTGGCCGAGGTTGACCCCGGCAACCGCCATGCTGTGcc < 7:126892/149‑1 (MQ=255) gtgCCGTCATCCACCGTGCTGGCCCGAGCGCTCAAGGCCCATGCCCTGCAACCGCTGGACGCTCAGGCCATGCCTGGTTATGGCAACCTCGACAAGGACCTGCTGGGCAAACTGGCCGAGGTTGACCCCGGCAACCGCCATGCTGTGcc < 6:322317/149‑1 (MQ=255) tCCACCGTGCTGGCCCGAGAGCTCAAGGCCCATGCCCTGCAAACGCTGGACGCTCAGGCCATGCGTGGTTATGGCAACCTCGACAAGGACCTGCTGGGAAAACTGGCCGAGGTTGCCCCCGGCAACAGCCATGCTGTGCCGTACACGTg > 6:228116/1‑149 (MQ=255) cACCGTGCTGGCCCGAGCGCTCAAGGCCCATGCCCTGCAACCGCTGGACGCTCAGGCCATGCCTGGTTATGGCAACCTCGACAAGGACCTGCTGGGCAAACTGGCCGAGGTTGACCCCGGCAACCGCCATGCTGTGCCGTACACCTgg < 2:227217/148‑1 (MQ=255) tGCTGGCCCGAGCGCTCAAGGCCCATGCCCTGCAACCGCTGGACGCTCAGGCCATGCCTGGTTATGGCAACCTCGACAAGGACCTGCTGGGCAAACTGGCCGAGGTTGACCCCGGCAACCGCCATGCTGTGCCGTACACCTGGGGCACg > 5:266086/1‑149 (MQ=255) gCTGGCCCGAGCGCTCAAGGCCCATGCCCTGCAACCGCTGGACGCTCAGGCCATGCCTGGTTATGGCAACCTCGACAAGGACCTGCTGGGCAAACTGGCCGAGGTTGACCCCGGCAACCGCCATGCTGTGCCGTACACCTgg < 1:280023/142‑1 (MQ=255) gCTGGCCCGAGCGCTCAAGGCCCATGCCCTGCAACCGCTGGACGCTCAGGCCATGCCTGGTTATGGCAACCTCGACAAGGACCTGCTGGGCAAACTGGCCGAGGTTGACCCCGGCAACCGCCATGCTGTGCCGTACACCTgg > 2:280023/1‑142 (MQ=255) | CGTCGCCCCGCAAACCCTGCAGCGCTTCGAACAGGAAACGGGCTACAAGGTGCGGTACGACACCTTTGACACCCCCGAAGTGCTGGAAACCAAGCTGTTGACCGGTGGTAGCGGCT‑ACGACGTGGTGGTGCCGTCATCCACCGTGCTGGCCCGAGCGCTCAAGGCCCATGCCCTGCAACCGCTGGACGCTCAGGCCATGCCTGGTTATGGCAACCTCGACAAGGACCTGCTGGGCAAACTGGCCGAGGTTGACCCCGGCAACCGCCATGCTGTGCCGTACACCTGGGGCACG > NC_002947/2501663‑2501954 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |