New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2501809 = | 34 (0.680) | 3 (0.060) | 3/248 | NT | 8.5% | coding (248/1089 nt) | PP_2195 | putrescine‑binding protein |
? | NC_002947 | 2501860 = | 32 (0.660) | coding (299/1089 nt) | PP_2195 | putrescine‑binding protein |
GTGCGGTACGACACCTTTGACACCCCCGAAGTGCTGGAAACCAAGCTGTTGACCGGTGGTAGCGGCTACGACGTGGTGGTGCCGTCATCCACCGTGCTGGCCCGAGCGCTCAAGGCCCATGCCCTGCAACCGCTGGACGCTCAGGCCATGCCTGGTTATGGCAACCTCGACAAGGACCTGCTGGGCAAACTGGCCGAGGTTGACCCCGGCAACCGCCATGCTGTGCCGTACACCTGGGGCACGCTGGGCCTGGGGGTAAATGTGGAGGCAGTACGCCAGCGCCTTGGCGATG > NC_002947/2501712‑2502003 | gTGCGGTACGACACCTTTGACACCCCCGAAGTGCTGGAAACCAAGCTGTTGACCGGTGGTAGCGGCTACGACGTGGTGGTGCCGTCATCCACCGTGCTGGCCCGAGCGCTCAAGGCCCATGCCCTGCAACCGCTGGACGCTCAGGCCAt < 3:185275/149‑1 (MQ=255) gcgtgccccaggtgtacggcacagcatggcggttgccggggtcaacctcggccagtttgcccagcaggtccttgtcgaggttgccataaccaggcaTGGCCCGAGCGCTCAAGGCCCATGCCCTGCAACCGCTGGACGCTCAGGCCATg > 6:59880‑M1/97‑149 (MQ=255) acacCTTTGACACCCCCGAAGTGCTGGAAACCAAGCTGTTGACCGGTGGTAGCGGCTACGACGTGGTGGTGCCGTCATCCACCGTGCTGGCCCGAGCGCTCAAGGCCCATGCCCTGCAACCGCTGGACGCTCAGGCCATGCCTGGTTAt < 1:308896/149‑1 (MQ=255) cTTTGACACCCCCGAAGTGCTGGAAACCAAGCTGTTGACCGGTGGTAGCGGCTACGACGTGGTGGTGCCGTCATCCACCGTGCTGGCCCGAGCGCTCAAGGCCCATGCCCTGCAACCGCTGGACGCTCAGGCCATGCCTGGTTATGGc > 2:279663/1‑148 (MQ=255) aGTGCTGGAAACCAAGCTGTTGACCGGTGGTAGCGGCTACGACGTGGTGGTGCCGTCATCCACCGTGCTGGCCCGAGCGCTCAAGGCCCATGCCCTGCAACCGCTGGACGCTCAGGCCATGCCTGGTTATGGCAACCTCGACAAGGAcc > 2:308553/1‑149 (MQ=255) cTGGAAACCAAGCTGTTGACCGGTGGTAGCGGCTACGACGTGGTGGTGCCGTCATCCACCGTGCTGGCCCGAGCGCTCAAGGCCCATGCCCTGCAACCGCTGGACGCTCAGGCCATGCCTGGTTATGGCAACCTCGACAAGGACctgc < 1:308553/148‑1 (MQ=255) ggAAACCAAGCTGTTGACCGGTGGTAGCGGCTACGACGTGGTGGTGCCGTCATCCACCGTGCTGGCCCGAGCGCTCAAGGCCCATGCCCTGCAACCGCTGGACGCTCAGGCCATGCCTGGTTATgg < 3:24662/126‑1 (MQ=255) ggAAACCAAGCTGTTGACCGGTGGTAGCGGCTACGACGTGGTGGTGCCGTCATCCACCGTGCTGGCCCGAGCGCTCAAGGCCCATGCCCTGCAACCGCTGGACGCTCAGGCCATGCCTGGTTATgg > 4:24662/1‑126 (MQ=255) aaGCTGTTGACCGGTGGTAGCGGCTACGACGTGGTGGTGCCGTCATCCACCGTGCTGGCCCGAGCGCTCAAGGCCCATGCCCTGCAACCGCTGGACGCTCAGGCCATGCCTGGTTATGGCAACCTCGACAAGGACCTGCTGGGCAAACt > 8:121905/1‑149 (MQ=255) aaGCTGTTGACCGGTGGTAGCGGCTACGACGTGGTGGTGCCGTCATCCACCGTGCTGGCCCGAGCGCTCAAGGCCCATGCCCTGCAACCGCTGGACGCTCAGGCCATGCCTGGTTATGGCAACCTCGACAAGGACCTGCTGGGCAAACt < 3:145668/149‑1 (MQ=255) cctcggccagtttgcccagcaggtccttgtcgaggttgccataaccaggcaTGGCCCGAGCGCTCAAGGCCCATGCCCTGCAACCGCTGGACGCTCAGGCCATGCCTg < 7:65843‑M1/57‑1 (MQ=255) cctcggccagtttgcccagcaggtccttgtcgaggttgccataaccaggcaTGGCCCGAGCGCTCAAGGCCCATGCCCTGCAACCGCTGGACGCTCAGGCCATGCCTg > 8:65843‑M1/52‑108 (MQ=255) gTTGACCGGTGGTAGCGGCTACGACGTGGTGGTGCCGTCATCCACCGTGCTGGCCCGAGCGCTCAAGGCCCATGCCCTGCAACCGCTGGACGCTCAGGCCATGCCTGGTTATGGCAACCTCGACAAGGACCTGCTGGGCAAACTGGcc > 5:322317/1‑148 (MQ=255) gACCGGTGGTAGCGGCTACGACGTGGTGGTGCCGTCATCCACCGTGCTGGCCCGAGCGCTCAAGGCCCATGCCCTGCAACCGCTGGACGCTCAGGCCATGCCTGGTTATGGCAACCTCGACAAGGAc < 8:165763/127‑1 (MQ=255) gACCGGTGGTAGCGGCTACGACGTGGTGGTGCCGTCATCCACCGTGCTGGCCCGAGCGCTCAAGGCCCATGCCCTGCAACCGCTGGACGCTCAGGCCATGCCTGGTTATGGCAACCTCGACAAGGAc > 7:165763/1‑127 (MQ=255) aCCGGTGGTAGCGGCTACGACGTGGTGGTGCCGTCATCCACCGTGCTGGCCCGAGCGCTCAAGGCCCATGCCCTGCAACCGCTGGACGCTCAGGCCATGCCTGGTTATGGCAACCTCGACAAGGACCTGCTGGGCAAACTGGCCGAGGt < 3:192146/149‑1 (MQ=255) cgacgTGGTGGTGCCGTCATCCACCGTGCTGGCCCGAGCGCTCAAGGCCCATGCCCTGCAACCGCTGGACGCTCAGGCCATGCCTGGTTATGGCAACCTCGACAAGGACCTGCTGGGCAAACTGGCCGAGGTTGACCCCGGCAACCGc > 1:227217/1‑148 (MQ=255) gtgCCGTCATCCACCGTGCTGGCCCGAGCGCTCAAGGCCCATGCCCTGCAACCGCTTGACGCTCAGGCCATGCCTGGTTATGGCAACCTCGACAAGGACCTGCTGGGCAAACTGGCCGAGGTTGACCCCGGCAACCGCCATGCTGTGcc < 7:126892/149‑1 (MQ=255) gtgCCGTCATCCACCGTGCTGGCCCGAGCGCTCAAGGCCCATGCCCTGCAACCGCTGGACGCTCAGGCCATGCCTGGTTATGGCAACCTCGACAAGGACCTGCTGGGCAAACTGGCCGAGGTTGACCCCGGCAACCGCCATGCTGTGcc < 6:322317/149‑1 (MQ=255) tCCACCGTGCTGGCCCGAGAGCTCAAGGCCCATGCCCTGCAAACGCTGGACGCTCAGGCCATGCGTGGTTATGGCAACCTCGACAAGGACCTGCTGGGAAAACTGGCCGAGGTTGCCCCCGGCAACAGCCATGCTGTGCCGTACACGTg > 6:228116/1‑149 (MQ=255) cACCGTGCTGGCCCGAGCGCTCAAGGCCCATGCCCTGCAACCGCTGGACGCTCAGGCCATGCCTGGTTATGGCAACCTCGACAAGGACCTGCTGGGCAAACTGGCCGAGGTTGACCCCGGCAACCGCCATGCTGTGCCGTACACCTgg < 2:227217/148‑1 (MQ=255) caggcatggcctgagcgtccagcggttgcagggcatgggccttgagcgctcgggccaTGCCTGGTTATGGCAACCTCGACAAGGACCTGCTGGGCAAACTGGCCGAgg < 7:65843‑M2/51‑1 (MQ=255) caggcatggcctgagcgtccagcggttgcagggcatgggccttgagcgctcgggccaTGCCTGGTTATGGCAACCTCGACAAGGACCTGCTGGGCAAACTGGCCGAgg > 8:65843‑M2/58‑108 (MQ=255) tGCTGGCCCGAGCGCTCAAGGCCCATGCCCTGCAACCGCTGGACGCTCAGGCCATGCCTGGTTATGGCAACCTCGACAAGGACCTGCTGGGCAAACTGGCCGAGGTTGACCCCGGCAACCGCCATGCTGTGCCGTACACCTGGGGCACg > 5:266086/1‑149 (MQ=255) gCTGGCCCGAGCGCTCAAGGCCCATGCCCTGCAACCGCTGGACGCTCAGGCCATGCCTGGTTATGGCAACCTCGACAAGGACCTGCTGGGCAAACTGGCCGAGGTTGACCCCGGCAACCGCCATGCTGTGCCGTACACCTgg > 2:280023/1‑142 (MQ=255) gCTGGCCCGAGCGCTCAAGGCCCATGCCCTGCAACCGCTGGACGCTCAGGCCATGCCTGGTTATGGCAACCTCGACAAGGACCTGCTGGGCAAACTGGCCGAGGTTGACCCCGGCAACCGCCATGCTGTGCCGTACACCTgg < 1:280023/142‑1 (MQ=255) catggcctgagcgtccagcggttgcagggcatgggccttgagcgctcgggccaTGCCTGGTTATGGCAACCTCGACAAGGACCTGCTGGGCAAACTGGCCGAGGTTGACCCCGGCAACCGCCATGCTGTGCCGTACACCTGGGGCACGc > 6:59880‑M2/54‑149 (MQ=255) GCCCGAGCGCTCAAGGCCCATGCCCTGCAACCGCTGGACGCTCAGGCCATGCCTGGTTATGGCAACCTCGACAAGGACCTGCTGGGCAAACTGGCCGAGGTTGACCCCGGCAACCGCCATGCTGTGCCGTACACCTGGGGCACGCTggg < 3:108936‑M1/149‑1 (MQ=255) GCCCGAGCGCTCAAGGCCCATGCCCTGCAACCGCTGGACGCTCAGGCCATGCCTGGTTATGGCAACCTCGACAAGGACCTGCTGGGCAAACTGGCCGAGGTTGACCCCGGCAACCGCCATGCTGTGCCGTACACCTGGGGCACGCTggg > 4:294264‑M1/1‑149 (MQ=255) cgcTCAAGGCCCATGCCCTGCAACCGCTGGACGCTCAGGCCATGCCTGGTTATGGCAACCTCGACAAGGACCTGCTGGGCAAACTGGCCGAGGTTGACCCCGGCAACCGCCATGCTGTGCCGTACACCTGGGGCACGCTGGGCCTgggg < 1:279663/149‑1 (MQ=255) tCAAGGCCCATGCCCTGCAACCGCTGGACGCTCAGGCCATGCCTGGTTATGGCAACCTCGACAAGGACCTGCTGGGCAAACTGGCCGAGGTTGACCCCGGCAACCGCCATGCTGTGCCGTACACCTGGGGc < 4:17869/131‑1 (MQ=255) tCAAGGCCCATGCCCTGCAACCGCTGGACGCTCAGGCCATGCCTGGTTATGGCAACCTCGACAAGGACCTGCTGGGCAAACTGGCCGAGGTTGACCCCGGCAACCGCCATGCTGTGCCGTACACCTGGGGc > 3:17869/1‑131 (MQ=255) tCAAGGCCCATGCCCTGCAACCGCTGGACGCTCAGGCCATGCCTGGTTATGGCAACCTCGACAAGGACCTGCTGGGCAAACTGGCCGAGGTTGACCCCGGCAACCGCCATGCTGTGCCGTACACCTGGGGCACGCTGGGCCTGGGGGt > 3:166305/1‑148 (MQ=255) ggCCCATGCCCTGCAACCGCTGGACGCTCAGGCCATGCCTGGTTATGGCAACCTCg > 2:231448/1‑56 (MQ=255) ggCCCATGCCCTGCAACCGCTGGACGCTCAGGCCATGCCTGGTTATGGCAACCTCg < 1:231448/56‑1 (MQ=255) gCCCATGCCCTGCAACCGCTGGACGCTCAGGCCATGCCTGGTTATGGCAACCTCGACAAGGACCTGCTGGGCAAACTGGCCGAGGTTGACCCCGGCAACCGCCATGCTGTGCCGTaca > 4:92635/1‑118 (MQ=255) gCCCATGCCCTGCAACCGCTGGACGCTCAGGCCATGCCTGGTTATGGCAACCTCGACAAGGACCTGCTGGGCAAACTGGCCGAGGTTGACCCCGGCAACCGCCATGCTGTGCCGTaca < 3:92635/118‑1 (MQ=255) ccTGCAACCGCTGGACGCTCAGGCCATGCCTGGTTATGGCAACCTCGACAAGGACCTGCTGGGCAAACTGGCCGAGGTTGACCCCGGCAACCGCCATGCTGTGCCGTACACCTGGGGCACGCTg > 6:106519/1‑124 (MQ=255) ccTGCAACCGCTGGACGCTCAGGCCATGCCTGGTTATGGCAACCTCGACAAGGACCTGCTGGGCAAACTGGCCGAGGTTGACCCCGGCAACCGCCATGCTGTGCCGTACACCTGGGGCACGCTg < 5:106519/124‑1 (MQ=255) gACGCTCAGGCCATGCCTGGTTATGGCAACCTCGACAAGGACCTGCTGGGCAAACTGGCCGAGGTTGACCCCGGCAACCGCCATGCTGTGCCGTACACCTGGGGCACGCTGGGCCTGGGGGTAAATGTGGAGGCAGTACGCCAGCGCCt > 4:129631/1‑149 (MQ=255) aCGCTCAGGCCATGCCTGGTTATGGCAACCTCGACAAGGACCTGCTGGGCAAACTGGCCGAGGTTGACCCCGGCAACCGCCATGCTGTGCCGTACACCTGGGGCACGCTGGGCCTGGGGGTAAATGTGGAGGCAGTACGCCAGCGCCtt < 4:166305/149‑1 (MQ=255) cTCAGGCCATGCCTGGGTATGGCAACCTCGACAAGGACCTGCTGGGCAAACTGGCCGAGGTTGACCCCGGCAACCGCCATGCTGTGCCGTACACCTGGGGCACGCTGGGCCTGGGGGTAAATGTGGAGGCAGTACGCCAGCGCCTTGGc < 8:122910/149‑1 (MQ=255) ggccaTGCCTGGTTATGGCAACCTCGACAAGGACCTGCTGGGCAAACTGGCCGAGGTTGACCCCGGCAACCGCCATGCTGTGCCGTACACCTGGGGCACGCTGGGCCTGGGGGTAAATGTGGAGGCAGTACGCCAGCGCCTTGGCGAt < 4:23876‑M2/143‑1 (MQ=255) ggccaTGCCTGGTTATGGCAACCTCGACAAGGACCTGCTGGGCAAACTGGCCGAGGTTGACCCCGGCAACCGCCATGCTGTGCCGTACACCTGGGGCACGCTGGGCCTGGGGGTAAATGTGGAGGCAGTACGCCAGCGCCTTGGCGAt > 3:23876‑M2/6‑148 (MQ=255) gccaTGCCTGGTTATGGCAACCTCGACAAGGACCTGCTGGGCAAACTGGCCGAGGTTGACCCCGGCAACCGCCATGCTGTGCCGAACACCTGGGGCACGCTGGGCCTGGGGGTAAATGTGGAGGCAGTACGCCAGCGCCTTGGCGATg > 7:88892‑M2/5‑148 (MQ=255) | GTGCGGTACGACACCTTTGACACCCCCGAAGTGCTGGAAACCAAGCTGTTGACCGGTGGTAGCGGCTACGACGTGGTGGTGCCGTCATCCACCGTGCTGGCCCGAGCGCTCAAGGCCCATGCCCTGCAACCGCTGGACGCTCAGGCCATGCCTGGTTATGGCAACCTCGACAAGGACCTGCTGGGCAAACTGGCCGAGGTTGACCCCGGCAACCGCCATGCTGTGCCGTACACCTGGGGCACGCTGGGCCTGGGGGTAAATGTGGAGGCAGTACGCCAGCGCCTTGGCGATG > NC_002947/2501712‑2502003 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |