New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2873270 = | 43 (0.850) | 3 (0.060) | 3/242 | NT | 7.4% | coding (50/474 nt) | cigR | membrane protein |
? | NC_002947 | 2873328 = | 35 (0.740) | coding (108/474 nt) | cigR | membrane protein |
CCTGCCTTGTCAGCCATCCCTGCTGAGGCTGCTGCAAGTGAAGCAGGCGTGCGCACCGTCTATAGTGTGGGGCAACCTCTCGCGCAAAGGATGCTCACATGGCCAGATCACCAATCATGACAGCCGTTGTCACCTCATTGGCGGTGGCCTTGGCCTCTGGTCCGGTGCTCGCCGACCCGGGTAATGGCAAAGGCCAGGGCCAAGGTCAGGGGCACGGCAAGGGCCAGGCGCCGCACGCCCAGGGCCAGGGCAATTCGGGCGGCCACAAGCAGAGCGCCGGCGGCAATGACTGGCA > NC_002947/2873123‑2873417 | ctgcggtggccaccgaggatgcccagtacatcgccacggtcgatggacgggccgccgtgccagtcattgccgccggcgctctgctggtggccgcccgaattgccctggccctgggcgtgcggcgcctggcccttgccgtgcccctgacc > 8:206441‑M1/148‑149 (MQ=255) cctgcctTGTCAGCCATCCCTGCTGAGGCTGCTGCAAGTGAAGCAGGCGTGCGCACCGTCTATAGTGTGGGGCAACCTCTCGCGCAAAGGATGCTCACATGGCCAGATCACCAATCATGACAGCCGTTGTCACCTCATTGGCGGtggc < 7:262140/148‑1 (MQ=255) gcctTGTCAGCCATCCCTGCTGAGGCTGCTGCAAGTGAAGCAGGCGTGCGCACCGTCTATAGTGTGGGGCAACCTCTCGCGCAAAGGATGCTCACATGGCCAGATCACCAATCATGACAGCCGTTGTCACCTCATTGGCGGtggccttg > 5:99865/1‑149 (MQ=255) cggtggccaccgaggatgcccagtacatcgccacggtcgatggacgtgccgccgtgccagtcattgccgccggcgctctgcttgtggccgcccgaattgccctggccctgggcgtgcggcgcctggcccttgccgtgcccctgaCCt > 5:60762‑M1/145‑147 (MQ=255) tGTCAGCCATCCCTGCTGAGGCTGCTGCAAGTGAAGCAGGCGTGCGCACCGTCTATAGTGTGGGGCAACCTCTCGCGCAAAGGATGCTCACATGGCCAGATCACCAATCATGACAGCCGTTGTCACCTCATTGGCGGtggccttggcct > 8:71329/1‑149 (MQ=255) aGCCATCCCTGCTGAGGCTGCTGCAAGTGAAGCAGGCGTGCGCACCGTCTATAGTGTGGGGCAACCTCTCGCGCAAAGGATGCTCACATGGCCAGATCACCAATCATGACAGCCGTTGTCACCTCATTGGCGGTGGCCTTGGCCTCTg < 7:71329/148‑1 (MQ=255) tgctgcAAGTGAAGCAGGCGTGCGCACCGTCTATAGTGTGGGGCAACCTCTCGCGCAAAGGATGCTCACATGGCCAGATCACCAATCATGACAGCCGTTGTCACCTCATTGGCGGTGGCCTTGGCCTCTGGTCCGGTGCTCGCCGAccc > 3:13667/1‑149 (MQ=255) ctgcGAGTGAAGCAGGCGTGCGCACCGTCTATAGTGTGGGGCAACCTCTCGAGCAAAGGATGCTCACATGGCCAGATCACCAATCATGACAGCCGTTGTCACCTCATTGGCGGTGGCCTTGGCCTCTGGTCCGGTGCTCGCCGACCCgg < 3:15112/149‑1 (MQ=255) ctgcAAGTGAAGCAGGCGTGCGCACCGTCTATAGTGTGGGGCAACCTCTCGCGCAAAGGATGCTCACATGGCCAGATCACCAATCATGACAGCCGTTGTCACCTCATTGGCGGTGGCCTTGGCCTCTGGTCCGGTGCTCGCCGACCCgg < 6:324286/149‑1 (MQ=255) tgcAAGTGAAGCAGGCGTGCGCACCGTCTATAGTGTGGGGCAACCTCTCGCGCAAAGGATGCTCACATGGCCAGATCACCAATCATGACAGCCGTTGTCACCTCATTGGCGGtggccttggc > 3:208358/1‑122 (MQ=255) tgcAAGTGAAGCAGGCGTGCGCACCGTCTATAGTGTGGGGCAACCTCTCGCGCAAAGGATGCTCACATGGCCAGATCACCAATCATGACAGCCGTTGTCACCTCATTGGCGGtggccttggc < 4:208358/122‑1 (MQ=255) gcAAGTGAAGCAGGCGTGCGCACCGTCTATAGTGTGGGGCAACCTCTCGCGCAAAGGATGCTCACATGGCCAGATCACCAATCATGACAGCCGTTGTCACCTCATTGGCGGTGGCCTTGGCCTCTGGTCCGGTGCTCGCCGACCCggg > 8:121293/1‑148 (MQ=255) aaGTGAAGCAGGCGTGCGCACCGTCTATAGTGTGGGGCAACCTCTCGCGCAAAGGATGCTCACATGGCCAGATCACCAATCATGACAGCCGTTGTCACCTCATTGGCGGTGGCCTTGGCCTCTGGTCCGGTGCTCGCCGACCCGGGTaa > 6:125457/1‑149 (MQ=255) aaGTGAAGCAGGCGTGCGCACCGTCTATAGTGTGGGGCAACCTCTCGCGCAAAGGATGCTCACATGGCCAGATCACCAATCATGACAGCCGTTGTCACCTCATTGGCGGTGGCCTTGGCCTCTGGTCCGGTGCTCGCCGACCCGGGTaa > 3:9616/1‑149 (MQ=255) tGAAGCAGGCGTGCGCACCGTCTATAGTGTGGGGCAACCTCTCGCGCAAAGGATGCTCACATGGCCAGATCACCAATCATGACAGCCGTTGTCACCTCATTGGCGGTGGCCTTGGCCTCTGGTCCGGTGCTCGCCGACCCGGGTAATgg > 5:260846/1‑149 (MQ=255) gCAGGCGTGCGCACCGTCTATAGTGTGGGGCAACCTCTCGCGCAAAGGATGCTCACATGGCCAGATCACCAATCATGACAGCCGTTGTCACCTCATTGGCGGTGGCCTTGGCCTCTGGTCCGGTGCTCGCCGACCCGGGTAATGGCaaa < 7:118175/149‑1 (MQ=255) cAGGCGTGCGCACCGTCTATAGTGTGGGGCAACCTCTCGCGCAAAGGATGCTCACATGGCCAGATCACCAATCATGACAGCCGTTGTCACCTCATTGGCGGTGGCCTTGGCCTCTGGTCCGGTGCTCGCCGACCCGGGTAATGGCAAAg < 8:100239/149‑1 (MQ=255) cAGGCGTGCGCACCGTCTATAGTGTGGGGCAACCTCTCGCGCAAAGGATGCTCACATGGCCAGATCACCAATCATGACAGCCGTTGTCACCTCATTGGCGGTGGCCTTGGCCTCTGGTCCGGTGCTCGCCGACCCGGGTAATGGCAAAg < 6:99865/149‑1 (MQ=255) gCGTGCGCACCGTCTATAGTGTGGGGCAACCTCTCGCGCAAAGGATGCTCACATGGCCAGATCACCAATCATGACAGCCGTTGTCACCTCATTGGCGGTGGCCTTGGCCTCTGGTCCGGTGCTCGCCGACCCGGGTAATGGCAAAGGc > 8:279531/1‑148 (MQ=255) acgggccgccgtgccagtcattgccgccggcgctctgcttgtggccgcccgaattgccctggccctgggcgtgcggcgcctggcccttgccgtgcccctgaCCTTGGCCTCTGGTCCGGTGCTCGCCGACCCGGGTAATGGCAAAGGc < 5:203671‑M1/47‑1 (MQ=255) cGTGCGCACCGTCTATAGTGTGGGGCAACCTCTCGCGCAAAGGATGCTCACATGGCCAGATCACCAATCATGACAGCCGTTGTCACCTCATTGGCGGTGGCCTTGGCCTCTGGTCCGGTGCTCGCCGACCCGGGTAATGGCAAAGGCCa < 5:291892/149‑1 (MQ=255) tGCGCACCGTCTATAGTGTGGGGCAACCTCTCGCGCAAAGGATGCTCACATGGCCAGATCACCAATCATGACAGCCGTTGTCACCTCATTGGCGGTGGCCTTGGCCTCTGGTCCGGTGCTCGCCGACCCGGGTAATGGCAAAGGCCAgg < 2:210001/149‑1 (MQ=255) cgcACCGTCTATAGTGTGGGGCAACCTCTCGCGCAAAGGATGCTCACATGGCCAGATCACCAATCATGACAGCCGTTGTCACCTCATTGGCGGTGGCCTTGGCCTCTGGTCCGGTGCTCGCCGACCCGGGTAATGGCAAAGGCCAGGGc < 7:279531/149‑1 (MQ=255) cgcACCGTCTATAGTGTGGGGCAACCTCTCGCGCAAAGGATGCTCACATGGCCAGATCACCAATCATGACAGCCGTTGTCACCTCATTGGCGGTGGCCTTGGCCTCTGGTCCGGTGCTCGCCGACCCGGGTAATGGCAAAGGCCAGGGc < 5:166185/149‑1 (MQ=255) ccgtgccagtcattgccgccggcgctctgcttgtggccgcccgaattgccctggccctgggcgtgcggcgcctggcccttgccgtgcccctgaCCTTGGCCTCTGGTCCGGTGCTCGCCGACCCGGGTAATGGCAAAGGCCAGGGCCaa > 2:322314‑M1/94‑149 (MQ=255) cgtgccagtcattgccgccggcgctctgcttgtggccgcccgaattgccctggccctgggcgtgcggcgcctggcccttgccgtgcccctgaCCTTGGCCTCTGGTCCGGTGCTCGCCGACCCGGGTAATGGCAAAGGCCAGGGCCAAg > 6:203671‑M1/93‑149 (MQ=255) gTCTATAGTGTGGGGCAACCTCTCGCGCAAAGGATGCTCACATGGCCAGATCACCAATCATGACAGCCGTTGTCACCTCATTGGCGGTGGCCTTGGCCTCTGGTCCGGTGCTCGCCGACCCGGGTAATGGCAAAGGCCAGGGCCAAGGt < 6:260846/149‑1 (MQ=255) ccagtcattgccgccggcgctctgcttgtggccgcccgaattgccctggccctgggcgtgcggcgcctggcccttgccgtgcccctgaCCt > 7:156027‑M1/89‑91 (MQ=255) ccagtcattgccgccggcgctctgcttgtggccgcccgaattgccctggccctgggcgtgcggcgcctggcccttgccgtgcccctgaCCt < 8:156027‑M1/3‑1 (MQ=255) tgtgGGGCAACCTCTCGCGCAAAGGATGCTCACATGGCCAGATCACCAATCATGACAGCCGTTGTCACCTCATTGGCGGTGGCCTTGGCCTCTGGTCCGGTGCTCGc < 6:22636/107‑1 (MQ=255) tgtgGGGCAACCTCTCGCGCAAAGGATGCTCACATGGCCAGATCACCAATCATGACAGCCGTTGTCACCTCATTGGCGGTGGCCTTGGCCTCTGGTCCGGTGCTCGc > 5:22636/1‑107 (MQ=255) tgtgGGGCAACCTCTCGCGCAAAGGATGCTCACATGGCCAGATCACCAATCATGACAGCCGTTGTCACCTCATTGGCGGTGGCCTTGGCCTCTGGTCCGGTGCTCGCCGACCCGGGTAATGGCAAAGGCCAGGGCCAAGGTCAGGGGCa > 3:140282/1‑149 (MQ=255) tgtgGGGCAACCTCTCGCGCAAAGGATGCTCACATGGCCAGATCACCAATCATGACAGCCGTTGTCACCTCATTGGCGGTGGCCTTGGCCTCTGGTCCGGTGCTCGCCGACCCGGGTAATGGCAAAGGCCAGGGCCAAGGTCAGGGGCa > 2:143357/1‑149 (MQ=255) gtgGGGCAACCTCTCGCGCAAAGGATGCTCACATGGCCAGATCACCAATCATGACAGCCGTTGTCACCTCATTGGCGGTGGCCTTGGCCTCTGGTCCGGTGCTCGCCGACCCGGGTAATGGCAAAGGCCAGGGCCAAGGTCAGGGGCAc > 4:44485/1‑149 (MQ=255) tgGGGCAACCTCTCGCGCAAAGGATGCTCACATGGCCAGATCACCAATCATGACAGCCGTTGTCACCTCATTGGCGGTGGCCTTGGCCTCTGGTCCGGTGCTCGCCGACCCGGGTAATGGCAAAGGCCAGGGCCAAGGTCAGGGGCACg < 8:33805/149‑1 (MQ=255) aaCCTCTCGCGCAAATGATGCTCACATGACCACATCACCAATAATGACAGCCGTTGTCACCTCTTTTGCGGTGGCCTTGGCCTCTGGTCCGGTGCTCGCCGACCCGGGTAATGGCAAAGGCCAGGGCCAAGGTCAGGGGCACGGCAAgg < 8:49601/149‑1 (MQ=255) aaCCTCTCGCGCAAAGGATGCTCACATGGCCAGATCACCAATCATGACAGCCGTTGTCACCTCATTGGCGGTGGCCTTGGCCTCTGGTCCGGTGCTCGCCGACCCGGGTAATGGCAAAGGCCAGGGCCAAGGTCAGGGGCACGGCAAgg < 3:44485/149‑1 (MQ=255) gCTCACATGGCCAGATCACCAATCATGACAGCCGTTGTCACCTCATTGGCGGTGGCCTTGGCCTCTGGTCCGGAGCTCGCCGACCCGGGTAATGGCAAAGGCCAGGGCCAAGGTCAGGGGCACGGCAAGGGCCAGGCGCCGCACGcc > 2:173196/1‑147 (MQ=255) caTGGCCAGATCACCAATCATGACAGCCGTTGTCACCTCATTGGCGGTGGCCTTGGCCTCTGGTCCGGTGCTCGCCGACCCGGGTAATGGCAAAGGCCAGGGCCAAGGt < 8:249218/109‑1 (MQ=255) caTGGCCAGATCACCAATCATGACAGCCGTTGTCACCTCATTGGCGGTGGCCTTGGCCTCTGGTCCGGTGCTCGCCGACCCGGGTAATGGCAAAGGCCAGGGCCAAGGt > 7:249218/1‑109 (MQ=255) gCCAGATCACCAATCATGACAGCCGTTGTCACCTCATTGGCGGTGGCCTTGGCCTCTGGTCCGGTGCTCGCCGACCCGGGTAATGGCAAAGGCCAGGGCCAAGGTCAGGGGCACTGCAAGGGCCAGGCGCCGCACGCccagggccagg < 1:173196/148‑1 (MQ=255) tCATGACAGCCGTTGTCACCTCATTGGCGGTGGCCTTGGCCTCTGGTCCGGTGCTCGCCGACCCGGGTAATGGCAAAGGCCAGGGCCAAGGTCAGGGGCACGGCAAGGGCCAGGcgcc > 6:54712/1‑118 (MQ=255) tCATGACAGCCGTTGTCACCTCATTGGCGGTGGCCTTGGCCTCTGGTCCGGTGCTCGCCGACCCGGGTAATGGCAAAGGCCAGGGCCAAGGTCAGGGGCACGGCAAGGGCCAGGcgcc < 5:54712/118‑1 (MQ=255) gACAGCCGTTGTCACCTCATTGGCGGTGGCCTTGGCCTCTGGTCCGGTGCTCGCCGACCCGGGTAATGGCAAAGGCCAGGGCCAAGGTCAGGGGCACGGCAAGGGCCAGGCGCCGCACGCCCAGGGCCAGGGCAATTCGGGCGGCcac > 3:37421/1‑148 (MQ=255) aCAGCCGTTGTCACCTCATTGGCGGTGGCCTTGGCCTCTGGTCCGGTGCTCGCCGACCCGGGTAATGGCAAAGGCCAGGGCCAAGGTCAGGGGCACGGCAAGGGCCAGGCGCCGCACGCCCAGGGCCAGGGCAATTCGGGCGGCCACaa < 1:143357/149‑1 (MQ=255) ccGTTGTCACCTCATTGGCGGTGGCCTTGGCCTCTGGTACGGTGCTCGCCGACACGGGTAATGGCAAATGCCAGGGCAAAGGTCAGGGGAACGGCAAGGGCCAGGCGCCGCACGCCCAGGGCCAGGGCAATTCGGGCTGCCACAAg > 7:143920/1‑146 (MQ=255) ttGTCACCTCATTGGCGGTGGCCTTGGCCTCTGGTCCGGTGCTCGCCGACCCGGGTAATGGCAAAGGCCAGGGCCAAGGTCAGGGGCACGGCAAGGGCCAGGCGCCGCACGCCCAGGGCCAGGGCAATTCGGGCGGCCACAAGCAGAgc < 5:125457/149‑1 (MQ=255) ccTCATTGGCGGTGGCCTTGGCCTCTGGTCCGGTGCTCGCCGACCCGGGTAATGGCAAAGGCCAGGGCCAAGGTCAGGGGCACGGCAAGGGCCAGGCGCCGCACGCCCAGGGCCAGGGCAATTCGGGCGGCCACAAGCAGAGCGCcggc > 5:289415/1‑149 (MQ=255) cTCATTGGCGGTGGCCTTGGCCTCTGGTCCGGTGCTCGCCGACCCGGGTAATGGCAAAGGCCAGGGCCAAGGTCAGGGGCACGGCAAGGGCCAGGCGCCGCACGCCCAGGGCCAGGGCAATTCGGGCGGCCACAAGCAGAGCGCcggcg > 6:71549/1‑149 (MQ=255) aTTGGCGGTGGCCTTGGCCTCTGGTCCGGTGCTCGCCGACCCGGGTAATGGCAAA‑GCCAGGGCCAAGGTCAGGGGCACGGCAAGGGCCAGGCGCCGCACGCCCAGGGCCAGGGCAATTCGGGCGGCCACAAGCAGAGCGCCGGCGGCaa < 4:13667/149‑1 (MQ=255) ttGGCGGTGGCCTTGGCCTCTGGTCCGGTGCTCGCCGACCCGGGTAATGGCAAAGGCCAGGGCCAAGGTCAGGGGCACGGCAAGGGCCAGGCGCCGCACGCCCAGGGCCAGGGCAATTCGGGCGGCCACAAGCAGAGCGCCGGCGGCaa < 7:121293/149‑1 (MQ=255) gCGGTGGCCTTGGCCTCTGGTCCGGTGCTCGCCGACCCGGGTAATGGCAAAGGCCAGGGCCAAGGTCAGGGGCACGGCAAGGGCCAGGCGCCGCACGCCCAGGGCCAGGGCAATTCGGGCGGCCACAAGCAGAGCGCCGGCGGCAATGa > 3:146662/1‑149 (MQ=255) ggTGGCCTTGGCCTCTGGTCCGGTGCTCGCCGACCCGGGTAATGGCAAAGGCCAGGGCCAAGGTCAGGGGCACGGCAAGGGCCAGGCGCCGCACGCCCAGGGCCAGGGCAATTCGGGCGGCCACAAGCAGAGCGCCGGCGGCAATGACt < 5:71549/149‑1 (MQ=255) gccttggcctCTGGTCCGGTGCTCGCCGACCCGGGTAATGGCAAAGGCCAGGGCCAAGGTCAGGGGCACGGCAAGGGCCAGGCGCCGCACGCCCAGGGCCAGGGCAATTCGGGCGGCCACAAGCAGAGCGCCGGCGGCAATGACTGGCa > 1:318513/1‑149 (MQ=255) | CCTGCCTTGTCAGCCATCCCTGCTGAGGCTGCTGCAAGTGAAGCAGGCGTGCGCACCGTCTATAGTGTGGGGCAACCTCTCGCGCAAAGGATGCTCACATGGCCAGATCACCAATCATGACAGCCGTTGTCACCTCATTGGCGGTGGCCTTGGCCTCTGGTCCGGTGCTCGCCGACCCGGGTAATGGCAAAGGCCAGGGCCAAGGTCAGGGGCACGGCAAGGGCCAGGCGCCGCACGCCCAGGGCCAGGGCAATTCGGGCGGCCACAAGCAGAGCGCCGGCGGCAATGACTGGCA > NC_002947/2873123‑2873417 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |