| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 3051679 = | 67 (1.330) | 3 (0.060) | 3/248 | NT | 5.5% | coding (379/1899 nt) | PP_2664 | two‑component system sensor histidine kinase/response regulator |
| ? | NC_002947 | 3051750 = | 39 (0.810) | coding (450/1899 nt) | PP_2664 | two‑component system sensor histidine kinase/response regulator | |||||
CGTCAACCGCCTGCTCAGCGAGGCCCGGCAGCGGGCCGAGACGGCCCACCAGCACCAGATTCGCCTGATTACCGACAACGTCCCGGCACTGATCGCTTACCTGAACGCCGATCTGGTCTACGAATTCACCAACAAGGTTTACGAAGAGT‑‑GGTATTGCTGGCCGCATGGCGTGATGCTGGGCCAGAGCCTGCGCGAGGCCCACAGCGAGCAGCACTACCAGCGCCTGGAAGGCTATGTGGCGCGGGCACTGGCGGGGGAGAGCGTGACGTTCGAGTTCGCCGAGACCAATATCAACG > NC_002947/3051531‑3051826 | gaagatacccaccccttcgccactggccaggcggttcgctacgtaggaacgcagcatgtagaggtcctggacgttgatattggtctcggcgaactcgaacgtcacgctctcccccgccagtgcccgcgccccatagcctaccaggcgct < 2:260194‑M1/1‑1 (MQ=255) agatacccaccacttcgccactggccaggcggttcggtacgtaggaacgcagcatgtagcgttcctggccgttgatattggtctcggcgaactcgaacgtcacgctctcccccgccagtgcccgcgccacatagccttccaggcgcT‑‑gg > 7:37667‑M1/147‑149 (MQ=255) atacccaccacttcgccactggccaggcggttcggttcgtaggaacgcagcatgtagcgttcatggccgttgatattggtctcggggaactcgatcgtcacgctctcccccgccagtgcccgcgcgacatagccttccaggcgct‑‑gtta > 2:158130‑M1/145‑146 (MQ=255) atacccaccacttcgccactggccaggcggttcggtacgtaggaacgcagcatgtagcgttcctggccgttgatattggtctcggcgaactcgaacgtcacgctctcccccgccagtgcccgcgccacatagccttccaggcgcT‑‑GGTa > 4:442‑M1/145‑149 (MQ=255) aCCGCCTGCTCAGCGAGGCCCGGCAGCGGGCCGAGACGGCCCACCAGCACCAGATTCGCCTGATTACCGACAACGTCCCGGCACTGATCGCTTACCTGAACGCCGATCTGGTCTACGAATTCACCAACAAGGTTTACGAAGAGT‑‑GGTAt > 7:175234/1‑149 (MQ=255) ccTGCTCAGCGAGGCCCGGCAGCGGGCCGAGACGGCCCACCAGCACCAGATTCGCCTGATTACCGACAACGTCCCGGCACTGATCGCTTACCTGCACGCCGATCTGGTCTACGAATTCACCACCAAGGTTTACGAAGAGT‑‑GGTATTGCt > 5:233924/1‑149 (MQ=255) ccTGCTCAGCGAGGCCCGGCAGCGGGCCGAGACGGCCCACCAGCACCAGATTCGCCTGATGACCGACAACGTCCCGGCACTGATCGCTTACCTGAACGCCGAGCGGGTCTACGACTTCACCAACCAGGGTTACGACGAGT‑‑GGTATTGcg > 8:70831/1‑148 (MQ=255) cacttcgccactggccaggcggttcggtacgtaggaacgcagcatgtagcgttcctggccgttgatattggtctcggcgaactcgaacgtcacgctctcccccgccagtgcccgcgccacatagccttccaggcgcT‑‑gg > 4:208526‑M1/137‑139 (MQ=255) cacttcgccactggccaggcggttcggtacgtaggaacgcagcatgtagcgttcctggccgttgatattggtctcggcgaactcgaacgtcacgctctcccccgccagtgcccgcgccacatagccttccaggcgcT‑‑gg < 3:208526‑M1/3‑1 (MQ=255) cTCAGCGAGGCCCGGCAGCGGGCCGAGATGGCCCACCAGCACCAGATTCGCCTGATTACCGACAACGTCCCGGCACTGATCGCTTACCTGAACGCCGATCTGGTCTACGAATTCACCAACAAGGTTTACGAAGAGT‑‑GGTATTGCTGGcc < 7:232757/149‑1 (MQ=255) cTCAGCGAGGCCCGGCAGCGGGCCGAGACGGCCCACCAGCACCAGATTCGCCTGATTACCGACAACGTCCCGGCACTGATCGCTTACCTGAACGCCGATCTGGTCTACGAATTCACCAACAAGGTTTACGAAGAGT‑‑GGTATTg > 8:98409/1‑143 (MQ=255) cTCAGCGAGGCCCGGCAGCGGGCCGAGACGGCCCACCAGCACCAGATTCGCCTGATTACCGACAACGTCCCGGCACTGATCGCTTACCTGAACGCCGATCTGGTCTACGAATTCACCAACAAGGTTTACGAAGAGT‑‑GGTATTg < 7:98409/143‑1 (MQ=255) aGCGAGGCCCGGCAGCGGGCCGAGACGGCCCACCAGCACCAGATTCGCCTGATTACCGACAACGTCCCGGCACTGATCGCTTACCTGAACGCCGATCTGGTCTACGAATTCACCAACAAGGTTTACGAAGAGT‑‑GGTATTGCTGGCCGCa > 6:167961/1‑149 (MQ=255) ccGGCAGCGGGCCGAGACGGCCCACCAGCACCAGATTCGCCTGATTACCGACAACGTCCCGGCACTGATCGCTTACCTGAACGCCGATCTGGTCTACGAATTCACCAACAAGGTTTACGAAGAGT‑‑GGTATTGCTGGCCGCATGGCGTGa < 8:89468/149‑1 (MQ=255) ccGGCAGCGGGCCGAGACGGCCCACCAGCACCAGATTCGCCTGATTACCGACAACGTCCCGGCACTGATCGCTTACCTGAACGCCGATCTGGTCTACGAATTCACCAACAAGGTTTACGAAGAGT‑‑GGTATTGCTGGCCGCATGGCGTGa < 8:175234/149‑1 (MQ=255) gCGGGCCGAGACGGCCCACCAGCACCAGATTCGCCTGATTACCGACAACGTCCCGGCACTGATCGCTTACCTGAACGCCGATCTGGTCTACGAATTCACCAACAAGGTTTACGAAGAGT‑‑GGTATTGCTGGCCGCATGGCGTGATGCTgg < 6:215439/149‑1 (MQ=255) cGAGACGGCCCACCAGCACCAGATTCGCCTGATTACCGACAACGTCCCGGCACTGATCGCTTACCTGAACGCCGATCTGGTCTACGAATTCACCAACAAGGTTTACGAAGAGT‑‑GGTATTGCTGGCCGCATGGCGTGATGCTGGGCCaga < 5:167961/149‑1 (MQ=255) cGGCCCACCAGCACCAGATTCGCCTGATTACCGACAACGTCCCGGCACTGATCGCTTACCTGAACGCCGATCTGGTCTACGAATTCACCAACAAGGTTTACGAAGAGT‑‑GGTATTGCTGGCCGCATGGCGTGATGCTGGGCCAGAGCCTg < 6:81927/149‑1 (MQ=255) gggccaccaccaccaGATTCGCCTGATTACCGACAACGTCCCGGCACTGATCGCTTACCTGAACGCCGATCTGGTCTACGAATTCACCAACAAGGTTTACGAAGAGT‑‑GGTATTGCTGGCCGCATGGCGTGATGCTGGGCCAGAGCCTgc < 6:226286/146‑1 (MQ=255) ggCCCACCAGCACCAGATTCGCCTGATTACCGACAACGTCCCGGCACTGATCGCTTACCTGAACGCCGATCTGGTCTACGAATTCACCAACAAGGTTTACGAAGAGT‑‑GGTATTGCTGGCCGCATGGCGTGATGCTGGGCCAGAGCCTgc > 3:63818/1‑149 (MQ=255) ggCCCACCAGCACCAGATTCGCCTGATTACCGACAACGTCCCGGCACTGATCGCTTACCTGAAAGCCGATCTGTTCTACGAATTCACCAACAAGGTTTACGAAGAGT‑‑GGTATTGCTGGCAGCATGGCGTGATGCTGGGCCATAGCCTgc > 3:38195/1‑149 (MQ=255) cccACCAGCACCAGATTCGCCTGATTACCGACAACGTCCCGGCACTGATCGCTTACCTGAACGCCGATCTGGTCTACGAATTCACCAACAAGGTTTACGAAGAGT‑‑GGTATTGCTGGCCGCATGGCGTGATGCTGGGCCAGAGCCTgcgc < 6:325726/149‑1 (MQ=255) accagcaccagATTCGCCTGATTACCGACAACGTCCCGGCACTGATCGCTTACCTGAACGCCGATCTGGTCTACGAATTCACCAACAAGGTTTACGAAGAGT‑‑GGTATTGCTGGCCGCATGGCGTGATGCTGGGCCAGAGCCTGCGCGAg > 5:10105/1‑149 (MQ=255) cccagCTTCGCCTGATTACCGACCAGGGCAGGTGTCTGATGGCTTACCTGAACGCCGATCTGGTCTACGAATTCACCAACAAGGTTTTCGAAGAGG‑‑GGTTTTGGTGGCGGGATGGCGTGTTGCTGGGCCTGATGCTGCGCGAGGCCcac < 6:330386/148‑1 (MQ=255) accagATTCGCCTGATTACCGACAACGTCCCGGCACTGATCGCTTACCTGAACGCCGATCTGGTCTACGAATTCACCAACAAGGTTTACGAAGAGT‑‑GGTATTGCTGGCCGCATGGCGTGATGCTGGGCCAGAGCCTGCGCGAGGCCca > 3:96175/1‑148 (MQ=255) accagATTCGCCTGATTACCGACAACGTCCCGGCACTGATCGCTTACCTGAACGCCGATCTGGTCTACGAATTCACCAACAAGGTTTACGAAGAGA‑‑GGTATTGCTGGCCGCATGGCGTGATGCTGGGCCAGAGCCTGCGCGAGGCCca > 1:262914/1‑148 (MQ=255) agATTCGCCTGATTACCGACAACGTCCCGGCACTGATCGCTTACCTGAACGCCGATCTGGTCTACGAATTCACCAACAAGGTTTACGAAGAGT‑‑GGTATTGCTGGCCGCATGGCGTGATGCTGGGCCAGAGCCTGCGCGAGGCCCACAGc > 6:177074/1‑149 (MQ=255) gtagcgttcctggccgttgatattggtctcggcgaactcgaacgtcacgctctcccccgccagtgcccgcgccacatagccttccaggcgcT‑‑GGTATTGCTGGCCGCATGGCGTGATGCTGGGCCAGAGCCTGCGCGAGGCCCACAGc < 3:274125‑M1/57‑1 (MQ=255) tCGCCTGATTACCGACAACGTCCCGGCACTGATCGCTTACCTGAACGCCGATCTGGTCTATGAATTCACCAACAAGGTTTACGAAGAGT‑‑GGTATTGCTGGCCGCATGGCGTGATGCTGGGCCAGAGCCTGCGCGAGGCCCACAGCGag > 2:169532/1‑148 (MQ=255) gcatGATTAGCGACAACGTCCCGGCACTGATCGCTTACCTGAACGCCGATCTGGTCTACGAATTCACCAACAAGGTTTACGAAGAGT‑‑GGTATTGCTGGCCGCATGGCGTGATGCTGGGCCAGAGCCTGCGCGAGGCCCACAGCGagca < 6:164557/145‑1 (MQ=255) gCCTGATTACCGACAACGTCCCGGCACTGATCGCTTACCTGAACGCCGATCTGGTCTATGAATTCACCAACAAGGTTTACGAAGAGT‑‑GGTATTGCTGGCCGCATGGCGTGATGCTGGGCCAGAGCCTGCGCGAGGCCCACAGCGagca < 1:169532/148‑1 (MQ=255) cTGAATACCGACAACGTCCCGGCACTGCTCGCTTACCTGTACCCCGTTCGGGGCTACGTAATCACCAACAAGGTTTACGTACAGTCCAGTATTGCTGGCCGCATGGCGTGATGCTGGGCCAGAGCCTGCGCGAGGCCCACAGCGagcag < 1:253886/149‑1 (MQ=255) cgttgatattggtctcggcgaactcgaacgtcacgctctcccccgccagtgcccgcgccacatagccttccaggcgcT‑‑GGTATTGCTGGCCGCATGGCGTGATGCTGGGCCAGAGCCTGCGCGAGGCCCACAGCGAGCAGCACTACCAg > 4:274125‑M1/78‑149 (MQ=255) ccGACAACGTCCCGGCACTGATCGCTTACCTGAACGCCGATCTGGTCTACGAATTCACCAACAAGGTTTACGAAGAGT‑‑GGTATTGCTGGCCGCATGGCGTGATGCTGGGCCAGAGCCTgcgc < 5:144485/122‑1 (MQ=255) ccGACAACGTCCCGGCACTGATCGCTTACCTGAACGCCGATCTGGTCTACGAATTCACCAACAAGGTTTACGAAGAGT‑‑GGTATTGCTGGCCGCATGGCGTGATGCTGGGCCAGAGCCTgcgc > 6:144485/1‑122 (MQ=255) gttgatattggtctcggcgaactcgaacgtcacgctctcccccgccagtgcccgcgccacatagccttccaggcgcT‑‑GGTATTGCTGGCCGCATGGCGTGATGCTGGGCCAGAGCCTGCGCGAGGCCCACAGCGAGCAGCACTACCAgc > 6:186830‑M1/77‑149 (MQ=255) cGACAACGTCCCGGCACTGATCGCTTACCTGAACGCCGATCTGGTCTACGAATTCACCAACAAGGTTTACGAAGAGT‑‑GGTATTGCTGGCCGCATGGCGTGATGCTGGGCCAGAGCCTGCGCGAGGCCCACAGc < 7:126757/133‑1 (MQ=255) cGACAACGTCCCGGCACTGATCGCTTACCTGAACGCCGATCTGGTCTACGAATTCACCAACAAGGTTTACGAAGAGT‑‑GGTATTGCTGGCCGCATGGCGTGATGCTGGGCCAGAGCCTGCGCGAGGCCCACAGc > 8:126757/1‑133 (MQ=255) aCAACGTCCCGGCACTGATCGCTTACCTGAACGCCGATCTGGTCTACGAATTCACCAACAAGGTTTACGAAGAGT‑‑GGTATTGCTGGc > 5:201516/1‑87 (MQ=255) aCAACGTCCCGGCACTGATCGCTTACCTGAACGCCGATCTGGTCTACGAATTCACCAACAAGGTTTACGAAGAGT‑‑GGTATTGCTGGc < 6:201516/87‑1 (MQ=255) tCGCTTACCTGAACGCCGATCTGGTCTACGAATTCACCAACAAGGTTTACGAAGAGT‑‑GGTATTGCTGGCCGCATGGCGTGATGCTGGGCCAGAGCCTGCGCGAGGCCCACAg > 6:291530/1‑112 (MQ=255) tCGCTTACCTGAACGCCGATCTGGTCTACGAATTCACCAACAAGGTTTACGAAGAGT‑‑GGTATTGCTGGCCGCATGGCGTGATGCTGGGCCAGAGCCTGCGCGAGGCCCACAg < 5:291530/112‑1 (MQ=255) ttACCTGAACGCCGATCTGGTCTACGAATTCACCAACAAGGTTTACGAAGAGT‑‑GGTATTGCTGGCCGCATGGCGTGATGCTGGGCCAGAGCCTGCGCGAGGCCCACAGCGAGCAGCACTACAAGCGCCTGGAAGGCTATGTGGctcgtg > 8:249574/1‑147 (MQ=255) ccTGAACGCCGATCTGGTCTACGAATTCACCAACAAGGTTTACGAAGAGT‑‑GGTATTGCTGGCCGCATGGCGTGATGCTGGGCCAGAGCCTGCGCGAGGCCCACAGCGAGCAGCACTACCAg < 5:327715/121‑1 (MQ=255) ccTGAACGCCGATCTGGTCTACGAATTCACCAACAAGGTTTACGAAGAGT‑‑GGTATTGCTGGCCGCATGGCGTGATGCTGGGCCAGAGCCTGCGCGAGGCCCACAGCGAGCAGCACTACCAg > 6:327715/1‑121 (MQ=255) ccTGAACGCCGATCTGGTCTACGAATTCACCAACAAGGTTTACGAAGAGT‑‑GGTATTGCTGGCCGCATGGCGTGATGCTGGGCCAGAGCCTGCGCGAGGCCCACAGCGAGCAGCACTACCAGCGCCTGGAAGGCTATGTGGCGCGGGCAc > 8:137785/1‑149 (MQ=255) cTGAACGCCGATCTGGTCTACGAATTCACCAACAAGGTTTACGAAGAGT‑‑GGTATTGCTGGCCGCATGGCGTGATGCTGGGCCAGAGCCTGCGCGAGGCCCACAGCGAGCAGCACTACCAGCGCCTGGAAGGCTATGTGGCGCGGGCa < 8:10668/147‑1 (MQ=255) cTGAACGCCGATCTGGTCTACGAATTCACCAACAAGGTTTACGAAGAGT‑‑GGTATTGCTGGCCGCATGGCGTGATGCTGGGCCAGAGCCTGCGCGAGGCCCACAGCGAGCAGCACTACCAGCGCCTGGAAGGCTATGTGGCGCGGGCa > 7:10668/1‑147 (MQ=255) cTGAACGCCGATCTGGTCTACGAATTCACCAACAAGGTTTACGAAGAGT‑‑GGTATTGCTGGCCGCATGGCGTGATGCTGGGCCAGAGCCTGCGCGAGGCCCACAGCGAGCAGCACTACCAGCGCCTGGAAGGCTATGTGGCGCGGGCACt > 7:162803/1‑149 (MQ=255) gCCGATCTGGTCTACGAATTCACCAACAAGGTTTACGAAGAGT‑‑GGTATTGCTGGCCGCATGGCGTGATGCTGGGCCAGAGCCTGCGCGAGGCCCACAGCGAGCAGCACTACCAGCGCCTGGAAGGCTAtgtg < 2:266960/132‑1 (MQ=255) gCCGATCTGGTCTACGAATTCACCAACAAGGTTTACGAAGAGT‑‑GGTATTGCTGGCCGCATGGCGTGATGCTGGGCCAGAGCCTGCGCGAGGCCCACAGCGAGCAGCACTACCAGCGCCTGGAAGGCTAtgtg > 1:266960/1‑132 (MQ=255) ccGATCTGGTCTACGAATTCACCAACAAGGTTTACGAAGAGT‑‑GGTATTGCTGGCCGCATGGCGTGATGCTGGGCCAGAGCCTGCGCGAGGCCCACAGCGAGCAGCACTACCAGCGCCTGGAAGGCTATGTGGCGCGGGCACTGGCgggg > 1:56300/1‑149 (MQ=255) cGATCTGGTCTACGAATTCACCAACAAGGTTTACGAAGAGT‑‑GGTATTGCTGGCCGCATGGCGTGATGCTGGGCCAGAGCCTGCGCGAGGCCCACAGCGAGCAGCACTACCAGCGCCTGGAAGGCTATGTGGCGCGGGCACTGGCgggg > 2:307182/1‑148 (MQ=255) gTCTACGAATTCACCAACAAGGTTTACGAAGAGT‑‑GGTATTGCTGGCCGCATGGCGTGATGCTGGGCCAGAGCCTGCGCGAGGCCCACAGCGAGCAGCACTACCAGCGCCTGGAAGGCTATGTGGCGCGGGCACTGGCGGGGGAGAGc < 4:63818/147‑1 (MQ=255) tCTACGAATTCACCAACAAGGTTTACGAAGAGT‑‑TGTATTGATGGCCGCATGGCGTGATGCTGGGCCAGAGCCTGCGCGAGGCCCACAGCGAGCAGCACTACCAGCGCCTGGAAGGCTATGTGGCGCGGGCACTGGCGGGGGAGAGCGTg < 7:249574/149‑1 (MQ=255) tACGAATTCACCAACAAGGTTTACGAAGAGT‑‑GGTATTGCTGGCCGCATGGCGTGATGCTGGGCCAGAGCCTGCGCGAGGCCCACAGCGAGCAGCACTACCAGCGCCTGGAAGGATATGTGGCGCGGGCACTGGCGGGGGAGAGGGTGag > 8:155346/1‑148 (MQ=255) cGAATTCACCAACAAGGTTTACGAAGAGT‑‑GGTATTGCTGGCCGCATGGCGTGATGCTGGGCCAGAGCCTGCGCGAGGCCCACAGCGAGCAGCACTACCAGCGCCTGGAAGGCTATGTGGCGCGGGCACTGGCGGGGGAGAGCGTGa < 4:96175/146‑1 (MQ=255) cGAATTCACCAACAAGGTTTACGAAGAGT‑‑GGTATTGCTGGCCGCATGGCGTGATGCTGGGCCAGAGCCTGCGCGAGGCCCACAGCGAGCAGCACTACCAGCGCCTGGAAGGCTATGTGGCGCGGGCACTGGCGGGGGAGAGCGTGa < 1:307182/146‑1 (MQ=255) aaTTCACCAACAAGGTTTACGAAGAGT‑‑GGTATTGCTGGCCGCATGGCGTGATGCTGGGCCAGAGCCTGCGCGAGGCCCACAGCGAGCAGCACTACCAGCGCCTGGAAGGCTATGTGGCGCGGGCACTGGCGGGGGAGAGCGTGACGTTc > 5:280688/1‑149 (MQ=255) ttCACCAACAAGGTTTACGAAGAGT‑‑GGTATTGCTGGCCGCATGGCGTGATGCTGGGCCAGAGCCTGCGCGAGGCCCACAGCGAGCAGCACTACCAGCGCCTGGAAGGCTATGTGGCGCGGGCACTGGCGGGGGAGAGCGTGACGTTCGa < 6:10105/149‑1 (MQ=255) tCACCAACAAGGTTTACGAAGAGT‑‑GGTATTGCTGGCCGCATGGCGTGATGCTGGGCCAGAGCCTGCGCGAGGCCCACAGCGAGCAGCACTACCAGCGCCTGGAAGGCTATGTGGCGCGGGCACTGGCGGGGGAGAGCGTGACGTTCGAg > 8:63891/1‑149 (MQ=255) cacaAACAAGGTTTACGAAGAGT‑‑GGTATTGCTGGCCGCATGGCGTGATGCTGGGCCAGAGCCTGCGCGAGGCCCACAGCGAGCAGCACTACCAGCGCCTGGAAGGCTATGTGGCGCGGGCACTGGCGGGGGAGAGCGTGACGTTCGAGt > 3:112268/1‑149 (MQ=255) aCCAACAAGGTTTACGAAGAGT‑‑GGTATTGCTGGCCGCATGGCGTGATGCTGGGCCAGAGCCTGCGCGAGGCCCACAGCGAGCAGCACTACCAGCGCCTGGAAGGCTATGTGGCGCGGGCACTGGCgg > 6:59911/1‑127 (MQ=255) aCCAACAAGGTTTACGAAGAGT‑‑GGTATTGCTGGCCGCATGGCGTGATGCTGGGCCAGAGCCTGCGCGAGGCCCACAGCGAGCAGCACTACCAGCGCCTGGAAGGCTATGTGGCGCGGGCACTGGCgg < 5:59911/127‑1 (MQ=255) caacaaGGTTTACGAAGAGT‑‑GGTATTGCTGGCCGCATGGCGTGATGCTGGGCCAGAGCCTGCGCGAGGCCCACAGCGAGCAGCACTACCAGCGCCTGGAAGGCTAtgtg < 7:60340/109‑1 (MQ=255) caacaaGGTTTACGAAGAGT‑‑GGTATTGCTGGCCGCATGGCGTGATGCTGGGCCAGAGCCTGCGCGAGGCCCACAGCGAGCAGCACTACCAGCGCCTGGAAGGCTAtgtg > 8:60340/1‑109 (MQ=255) aacaaGGTTTACGAAGAGT‑‑GGTATTGCTGGCCGCATGGCGTGATGCTGGGCCAGAGCCTGCGCGAGGCCCACAGCGAGCAGCACTACCAGCGCCTGGAAGGCTATGTGGCGCGGGCACTGGCGGGGGAGAGCGTGACGTTCGAGTTCGc > 8:85557/1‑149 (MQ=255) acaaGGTTTACGAAGAGT‑‑GGTATTGCTGGCCGCATGGCGTGATGCTGGGCCAGAGCCTGCGCGAGGCCCACAGCGAGCAGCACTACCAGCGCCTGGAAGGCTATGTGGCGCGGGCACTGGCGGGGGAGAGCGTGACGTTCGAGTTCGcc < 2:262914/149‑1 (MQ=255) acaaGGTTTACGAAGAGT‑‑GGTATTGCTGGCCGCATGGCGTGATGCTGGGCCAGAGCCTGCGCGAGGCCCACAGCGAGCAGCACTACCAGCGCCTGGAAGGCTATGTGGCGCGGGCACTGGCGGGGGAGAGCGTGACGTTCGAGTTCGcc > 5:260655/1‑149 (MQ=255) caaGGTTTACGAAGAGT‑‑GGTATTGCTGGCCGCATGGCGTGATGCTGGGCCAGAGCCTGCGCGAGGCCCACAGCGAGCAGCACTACCAGCGCCTGGAAGGCTATGTGGCGCGGGCACTGGCGGGGGAGAGCGTGACGTTCGAGTTCGCCg < 7:137785/149‑1 (MQ=255) aGGTTTAAGAAGAGT‑‑GGTATTGCTGGCCGCATGGCGTGATGCTGGGCCAGAGCCTGCGCGAGGCCCACAGCGAGCAGCAATACCAGCGCCTGGAAGGCTATGTGGCGCGGGCACTGGCGGGGGAGAGCGTGACGTTCGAGTTCgac > 8:296267/1‑144 (MQ=255) ggTTTACGAAGAGT‑‑GGTATTGCTGGCCGCATGGCGTGATGCTGGGCCAGAGCCTGCGCGAGGCCCACAGCGAGCAGCACTACCAGCGCCTGGAAGGCTATGTGGCGCGGGCACTGGCGGGGGAGAGCGTGACGTTCGAGTTCGCCgaga < 4:112268/149‑1 (MQ=255) tttACGAAGAGT‑‑GGTATTGCTGGCCGCATGGCGTGATGCTGGGCCAGAGCCTGCGCGAGGCCCACAGCGAGCAGCACTACCAGCGCCTGGAAGGCTATGTGGcgcg < 8:11072/106‑1 (MQ=255) tttACGAAGAGT‑‑GGTATTGCTGGCCGCATGGCGTGATGCTGGGCCAGAGCCTGCGCGAGGCCCACAGCGAGCAGCACTACCAGCGCCTGGAAGGCTATGTGGcgcg > 7:11072/1‑106 (MQ=255) gAAGAGT‑‑GGTATTGCTGGCCGCATGGCGTGATGCTGGGCCAGAGCCTGCGCGAGGCCCACAGCGAGCAGCACTACCAGCGCCTGGAAGGCTATGTGGCGCGGGCACTGGCGGGGGAGAGCGTGACGtt < 5:130161/128‑1 (MQ=255) gAAGAGT‑‑GGTATTGCTGGCCGCATGGCGTGATGCTGGGCCAGAGCCTGCGCGAGGCCCACAGCGAGCAGCACTACCAGCGCCTGGAAGGCTATGTGGCGCGGGCACTGGCGGGGGAGAGCGTGACGtt > 6:130161/1‑128 (MQ=255) agT‑‑GGTATTGCTGGCCGCATGGCGTGATGCTGGGCCAGAGCCTGCGCGAGGCCCACAGCGAGCAGCACTACCAGCGCCTGGAAGGCTATGTGGCGCGGGCACTGGCGGGGGAGAGCGTGACGTTc < 7:86661/125‑1 (MQ=255) agT‑‑GGTATTGCTGGCCGCATGGCGTGATGCTGGGCCAGAGCCTGCGCGAGGCCCACAGCGAGCAGCACTACCAGCGCCTGGAAGGCTATGTGGCGCGGGCACTGGCGGGGGAGAGCGTGACGTTc > 8:86661/1‑125 (MQ=255) T‑‑GGTATTGCTGGCCGCATGGCGTGATGCTGGGCCAGAGCCTGCGCGAGGCCCACAGCGAGCAGCACTACCAGCGCCTGGAAGGCTATGTGGCGCGGGCACTGGCGGGGGAGAGc > 6:29608‑M1/1‑114 (MQ=255) T‑‑GGTATTGCTGGCCGCATGGCGTGATGCTGGGCCAGAGCCTGCGCGAGGCCCACAGCGAGCAGCACTACCAGCGCCTGGAAGGCTATGTGGCGCGGGCACTGGCGGGGGAGAGc < 5:29608‑M1/114‑1 (MQ=255) T‑‑GGTATTGCTGGCCGCATGGCGTGATGCTGGGCCAGAGCCTGCGCGAGGCCCACAGCGAGCAGCACTACCAGCGCCTGGAAGGCTATGTGGCGCGGGCACTGGCGGGGGAGAGCGTGACGTTCGAGTTCGCCGAGACCAATATCAACg > 8:162803‑M1/1‑148 (MQ=255) | CGTCAACCGCCTGCTCAGCGAGGCCCGGCAGCGGGCCGAGACGGCCCACCAGCACCAGATTCGCCTGATTACCGACAACGTCCCGGCACTGATCGCTTACCTGAACGCCGATCTGGTCTACGAATTCACCAACAAGGTTTACGAAGAGT‑‑GGTATTGCTGGCCGCATGGCGTGATGCTGGGCCAGAGCCTGCGCGAGGCCCACAGCGAGCAGCACTACCAGCGCCTGGAAGGCTATGTGGCGCGGGCACTGGCGGGGGAGAGCGTGACGTTCGAGTTCGCCGAGACCAATATCAACG > NC_002947/3051531‑3051826 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |