New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3547416 = | 45 (0.890) | 4 (0.080) | 4/246 | NT | 7.6% | coding (361/1377 nt) | PP_3132 | polysaccharide transporter |
? | NC_002947 | 3547489 = | 55 (1.150) | coding (434/1377 nt) | PP_3132 | polysaccharide transporter |
GCGCCAGAACATCATCCAGAGCCACCGCGGAGACGATCCGGACTTTCTCAACACCGCCTGGACCGTGCAGATCATCCGCGGTTTCCTGCTGTTTGCCCTTACCCTGCTGCTGGCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTAC‑TGC‑CGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAACAAAAGCGCGTGGTATT > NC_002947/3547268‑3547555 | accagcgcccagatcgaatgggtcagcaagcccagcacgagcatcaccaccaggcccgccacctgcgaggcaaggtcgaccaataccacgcgcttttgttggaaagtgcgtaccgccacatctatcttggtggactggaaaccccagat < 2:226940‑M1/1‑1 (MQ=255) ttccatctcgaatgggtcagcaagcccagcacgagcatcaccaccaggcccgccacctgcgaggcaaggtcgaccaataccacgcgcttttgttggaaagtgcgtaccgccacatctatcttggtggactggaaaccccagaTggcc > 5:19359‑M1/143‑147 (MQ=255) atcCAGAGCCACCGCGGAGACGATCCGGACTTTCTCAACACCGCCTGGACCGTGCAGATCATCCGCGGTTTCCTGCTGTTTGCCCTTACCCTGCTGCTGGCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTc > 5:200779/1‑149 (MQ=255) tcCAGAGCCACCGCGGAGACGATCCGGACTTTCTCAACACCGCCTGGACCGTGCAGATCATCCGCGGTTTCCTGCTGTTTGCCCTTACCCTGCTGCTGGCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCg < 8:148887/149‑1 (MQ=255) agagCCACCGCGGAGACGATCCGGACTTTCTCAACACCGCCTGGACCGTGCAGATCATCCGCGGTTTCCTGCTGTTTGCCCTTACCCTGCTGCTGGCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCtgtg < 4:292525/133‑1 (MQ=255) agagCCACCGCGGAGACGATCCGGACTTTCTCAACACCGCCTGGACCGTGCAGATCATCCGCGGTTTCCTGCTGTTTGCCCTTACCCTGCTGCTGGCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCtgtg > 3:292525/1‑133 (MQ=255) cgCCACCGCGGAGACGATCCGGACTTTCTCAACACCGCCTGGACCGTGCTGATCATCCGCGGTTTCCTGCTGTTTGCCCTTACCCTGCTGCTGGCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCtgt < 8:129558/129‑1 (MQ=255) agCCACCGCGGAGACGATCCGGACTTTCTCAACACCGCCTGGACCGTGCTGATCATCCGCGGTTTCCTGCTGTTTGCCCTTACCCTGCTGCTGGCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCtgt > 7:129558/1‑130 (MQ=255) agCCACCGCGGAGACGATCCGGACTTTCTCAACACCGCCTGGACCGTGCAGATCATCCGCGGTTTCCTGCTGTTTGCCCTTACCCTGCTGCTGGCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTa > 1:157461/1‑149 (MQ=255) gCCACCGCGGAGACGATCCGGACTTTCTCAACACCGCCTGGACCGTGCAGATCATCCGCGGTTTCCTGCTGTTTGCCCTTACCCTGCTGCTGGCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTAt < 2:157461/149‑1 (MQ=255) ccACCGCGGAGACGATCCGGACTTTCTCAACACCGCCTGGACCGTGCAGATCATCCGCGGTTTCCTGCTGTTTGCCCTTACCCTGCTGCTGGCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATg > 7:242978/1‑149 (MQ=255) gATCCGGACTTTCTCAACACCGCCTGGACCGTGCAGATCATCCGCGGTTTCCTGCTGTTTGCCCTTACCCTGCTGCTGGCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTAC‑t > 4:154526/1‑149 (MQ=255) tCCGGACTTTCTCAACACCGCCTGGACCGTGCAGATCATCCGCGGTTTCCTGCTGTTTGCCCTTACCCTGCTGCTGGCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTAC‑TGc < 3:126725/149‑1 (MQ=255) aCTTTCTCAACACCGCCTGGACCGTGCAGATCATCCGCGGTTTCCTGCTGTTTGCCCTTACCCTGCTGCTGGCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTAC‑TGC‑CGATg > 5:80222/1‑149 (MQ=255) aCTTTCTCAACACCGCCTGGACCGTGCAGATCATCCGCGGTTTCCTGCTGTTTGCCCTTACCCTGCTGCTGGCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTAC‑TGC‑CGATg < 3:154526/149‑1 (MQ=255) cAACACCGCCTGGACCGTGCAGATCATCCGCGGTTTCCTGCTGTTTGCCCTTACCCTGCTGCTGGCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTAC‑TGC‑CGATGGTACTgg > 2:96454/1‑149 (MQ=255) cAACACCGCCTGGACCGTGCAGATCATCCGCGGTTTCCTGCTGTTTGCCCTTACCCTGCTGCTGGCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTAC‑TGC‑CGATGGTACTgg > 3:207705/1‑149 (MQ=255) aaCACCGCCTGGACCGTGCAGATCATCCGCGGTTTCCTGCTGTTTGCCCTTACCCTGCTGCTGGCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTAC‑TGC‑CGATGGTACTgg < 2:191688/148‑1 (MQ=255) aaCACCGCCTGGACCGTGCAGATCATCCGCGGTTTCCTGCTGTTTGCCCTTACCCTGCTGCTGGCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTAC‑TGC‑CGATGGTACTGGc > 5:103736/1‑149 (MQ=255) accccGCCTGGACCGTGCAGATCATCCGCGGTTTCCTGCTGTTTGCCCTTACCCTGCTGCTGGCCCTGGGAGCTTGGTGGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTAC‑TGC‑CGATGGTACTGGCg < 6:200779/146‑1 (MQ=255) acCGCCTGGACCGTGCAGATCATCCGCGGTTTCCTGCTGTTTGCCCTTACCCTGCTGCTGGCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTAC‑TGC‑CGATGGTACTg < 3:220616/144‑1 (MQ=255) acCGCCTGGACCGTGCAGATCATCCGCGGTTTCCTGCTGTTTGCCCTTACCCTGCTGCTGGCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTAC‑TGC‑CGATGGTACTg > 4:220616/1‑144 (MQ=255) ccTGGACCGTGCAGATCATCCGCGGTTTCCTGCTGTTTGCCCTTACCCTGCTGCTGGCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTAC‑TGC‑CGATGGTACTGGCGGTCAcc > 3:126084/1‑149 (MQ=255) gACCGTGCAGATCATCCGCGGTTTCCTGCTGTTTGCCCTTACCCTGCTGCTGGCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTAC‑TGC‑CGATGGTACTGGCGGTCACCGGc < 4:207705/148‑1 (MQ=255) tGCAGATCATCCGCGGTTTCCTGCTGTTTGCCCTTACCCTGCTGCTGGCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCCATGCCGCGCCGGTAC‑TGC‑CGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGAcg > 3:134392/1‑149 (MQ=255) caaggtcgaccaataccacgcgcttttgttggaaagtgcgtaccgccacatctatcttggtggactggaaaccccagaTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTAC‑TGC‑CGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCggcggc < 2:161821‑M1/71‑1 (MQ=255) atcatcCGCGGTTTCCTGCTGTTTGCCCTTACCCTGCTGCTGGCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTAC‑TGC‑CGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCggcggc > 2:191980/1‑149 (MQ=255) tcatcCGCGGTTTCCTGCTGTTTGCCCTTACCCTGCTGCTGGCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTAC‑TGC‑CGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGcc < 6:80222/149‑1 (MQ=255) aggtcgaccaataccacgcgcttttgttggaaagtgcgtaccgccacatctatcttggtggactggaaaccccagaTGGCCG‑‑‑‑ACTCGACCTATGCCGCGCCGGTAC‑TGC‑CGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTg > 2:167293‑M1/77‑149 (MQ=255) ggtcgaccaataccccgcgcgtttgttggaaagtgcgtaccgccacatctatcttgggggactggaacccccagaTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTAC‑TGC‑CGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCAt > 7:229158‑M1/76‑149 (MQ=255) accaataccacgcgcttttgttggaaagtgcgtaccgccacatctatcttggtggactggaaaccccagaTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTAC‑TGC‑CGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTggg > 1:161821‑M1/71‑149 (MQ=255) tgctgTTTGCCCTTACCCTGCTGCTGGCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTAC‑TGC‑CGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAg > 5:27150/1‑149 (MQ=255) tttGCCCTTTCCCTGCTGGTGGCCCTGGGTTGTTGGTTGGGCCAACTGGCTGAGCTTTGGCCGGCCGACTCGACCCATGCCGCGCCGGTAC‑TGG‑CGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTcca < 4:134392/148‑1 (MQ=255) tttGCCCTTACCCTGCTGCTGGCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTAC‑TGC‑CGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTcca < 1:322095/148‑1 (MQ=255) cccTTACCCTGCTGCTGGCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTAC‑TGC‑CGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTccacc > 6:167459/1‑146 (MQ=255) ccTTACCCTGCTGCTGGCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTAC‑TGC‑CGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTccacc > 6:331658/1‑145 (MQ=255) ccTTACCCTGCTGCTGGCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTAC‑TGC‑CGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAaga < 5:167459/149‑1 (MQ=255) cTTACCCTGCTGCTGGCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTAC‑TGC‑CGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAaga > 3:262874/1‑148 (MQ=255) ccTGCTGCTGGCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTAC‑TGC‑CGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAagatagat > 7:156863/1‑148 (MQ=255) ccTGCTGCTGGCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTAC‑TGC‑CGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAagatagat < 8:156863/148‑1 (MQ=255) tgctgctgGCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGCCTCGACCTATGCCGCGCCGGTAC‑TGC‑CGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCCCCAAGATAGAtgtg > 8:66724/1‑149 (MQ=255) gtgctgGCCCTGGGTGGTTGGTTGGCCCAAATTGGTGCTCTGTGGGCGGCCGTCTCGACCTATTGCGCGGCGGTTCTTGCGCCTTGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGAtgt < 1:96454/147‑1 (MQ=255) ctgGCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTAC‑TGC‑CGATGGTACTg < 7:58398/87‑1 (MQ=255) ctgGCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTAC‑TGC‑CGATGGTACTg > 8:58398/1‑87 (MQ=255) tgGCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTAC‑TGC‑CGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTa > 1:146921/1‑149 (MQ=255) ggCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTAC‑TGC‑CGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCGGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTAc > 4:121529/1‑149 (MQ=255) ccTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTAC‑TGC‑CGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCa < 4:262874/149‑1 (MQ=255) gAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTAC‑TGC‑CGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTc < 5:331658/149‑1 (MQ=255) cTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTAC‑TGC‑CGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCcaa < 7:164759/149‑1 (MQ=255) tggttggCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTAC‑TGC‑CGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCcaac > 5:18947/1‑148 (MQ=255) cAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTAC‑TGC‑CGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAACAAAAGCGCGt < 6:103736/149‑1 (MQ=255) aaCTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTAC‑TGC‑CGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAACAAAAGCGCGTg < 6:43451/149‑1 (MQ=255) ggCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCAACCTATGCCGCGCCGGTAC‑TGC‑CGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAACAAAAGCGCGTGGTAt > 6:158782/1‑149 (MQ=255) gCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTAC‑TGC‑CGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAACAAAAGCGCGTGGTAtt > 3:232142/1‑149 (MQ=255) gCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTAC‑TGC‑CGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAACAAAAGCGCGTGGTAt < 4:126084/148‑1 (MQ=255) | GCGCCAGAACATCATCCAGAGCCACCGCGGAGACGATCCGGACTTTCTCAACACCGCCTGGACCGTGCAGATCATCCGCGGTTTCCTGCTGTTTGCCCTTACCCTGCTGCTGGCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTAC‑TGC‑CGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAACAAAAGCGCGTGGTATT > NC_002947/3547268‑3547555 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |