New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3547416 = | 45 (0.890) | 4 (0.080) | 4/246 | NT | 7.6% | coding (361/1377 nt) | PP_3132 | polysaccharide transporter |
? | NC_002947 | 3547489 = | 55 (1.150) | coding (434/1377 nt) | PP_3132 | polysaccharide transporter |
CATCCGCGGTTTCCTGCTGTTTGCCCTTACCCTGCTGCTGGCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTAC‑TGC‑CGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAACAAAAGCGCGTGGTATTGGTCGACCTTGCCTCGCAGGTGGCGGGCCTGGTGGTGATGCTCGTGCTGGGCTTGCTGACCCATTCGATCTGGGCGCTGGT > NC_002947/3547340‑3547636 | aggtcgaccaataccacgcgcttttgttggaaagtgcgtaccgccacatctatcttggtggactggaaaccccagaTGGCCG‑‑‑‑ACTCGACCTATGCCGCGCCGGTAC‑TGC‑CGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTg > 2:167293‑M1/77‑149 (MQ=255) ggtcgaccaataccccgcgcgtttgttggaaagtgcgtaccgccacatctatcttgggggactggaacccccagaTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTAC‑TGC‑CGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCAt > 7:229158‑M1/76‑149 (MQ=255) accaataccacgcgcttttgttggaaagtgcgtaccgccacatctatcttggtggactggaaaccccagaTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTAC‑TGC‑CGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTggg > 1:161821‑M1/71‑149 (MQ=255) tgctgTTTGCCCTTACCCTGCTGCTGGCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTAC‑TGC‑CGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAg > 5:27150/1‑149 (MQ=255) tttGCCCTTTCCCTGCTGGTGGCCCTGGGTTGTTGGTTGGGCCAACTGGCTGAGCTTTGGCCGGCCGACTCGACCCATGCCGCGCCGGTAC‑TGG‑CGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTcca < 4:134392/148‑1 (MQ=255) tttGCCCTTACCCTGCTGCTGGCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTAC‑TGC‑CGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTcca < 1:322095/148‑1 (MQ=255) cccTTACCCTGCTGCTGGCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTAC‑TGC‑CGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTccacc > 6:167459/1‑146 (MQ=255) ccTTACCCTGCTGCTGGCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTAC‑TGC‑CGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTccacc > 6:331658/1‑145 (MQ=255) ccTTACCCTGCTGCTGGCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTAC‑TGC‑CGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAaga < 5:167459/149‑1 (MQ=255) cTTACCCTGCTGCTGGCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTAC‑TGC‑CGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAaga > 3:262874/1‑148 (MQ=255) ccTGCTGCTGGCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTAC‑TGC‑CGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAagatagat < 8:156863/148‑1 (MQ=255) ccTGCTGCTGGCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTAC‑TGC‑CGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAagatagat > 7:156863/1‑148 (MQ=255) tgctgctgGCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGCCTCGACCTATGCCGCGCCGGTAC‑TGC‑CGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCCCCAAGATAGAtgtg > 8:66724/1‑149 (MQ=255) gtgctgGCCCTGGGTGGTTGGTTGGCCCAAATTGGTGCTCTGTGGGCGGCCGTCTCGACCTATTGCGCGGCGGTTCTTGCGCCTTGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGAtgt < 1:96454/147‑1 (MQ=255) tgGCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTAC‑TGC‑CGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTa > 1:146921/1‑149 (MQ=255) ggCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTAC‑TGC‑CGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCGGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTAc > 4:121529/1‑149 (MQ=255) ccTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTAC‑TGC‑CGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCa < 4:262874/149‑1 (MQ=255) gAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTAC‑TGC‑CGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTc < 5:331658/149‑1 (MQ=255) cTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTAC‑TGC‑CGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCcaa < 7:164759/149‑1 (MQ=255) tggttggCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTAC‑TGC‑CGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCcaac > 5:18947/1‑148 (MQ=255) cAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTAC‑TGC‑CGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAACAAAAGCGCGt < 6:103736/149‑1 (MQ=255) aaCTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTAC‑TGC‑CGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAACAAAAGCGCGTg < 6:43451/149‑1 (MQ=255) ggCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCAACCTATGCCGCGCCGGTAC‑TGC‑CGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAACAAAAGCGCGTGGTAt > 6:158782/1‑149 (MQ=255) gCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTAC‑TGC‑CGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAACAAAAGCGCGTGGTAtt > 3:232142/1‑149 (MQ=255) gCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTAC‑TGC‑CGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAACAAAAGCGCGTGGTAt < 4:126084/148‑1 (MQ=255) cccagatggccgccgacaggccggtgaccgccagtaccatcggcagtaccggcgcggcataggtcgagtcggccggccaTCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAACAAAAGCGCGTGGTATTGGt > 1:161821‑M2/80‑149 (MQ=255) atggccgccgacaggccggtgaccgccagtaccatcggcagtaccggcgcggcataggtcgagtcggccggccaTCTGGGGGTTCCAGTCCCCCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAACAAACGCGCGGGGTATTGGTCGAcc > 7:229158‑M2/75‑149 (MQ=255) cagatggccgccgacaggccggtgaccgccagtaccatcggcagtaccggcgcggcataggtcgagtcggccaTCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAACAAAAGCGCGTGGTATTGGTCGACCt > 2:167293‑M2/74‑149 (MQ=255) gccgccgacaggccggtgaccgccagtaccatcggcagtaccggcgcggcataggtcgagtcggccggccaTCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAACAAAAGCGCGTGGTATTGGTCGACCTTg < 2:161821‑M2/78‑1 (MQ=255) CGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTAC‑TGC‑CGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACtt > 4:137759‑M1/1‑114 (MQ=255) CGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTAC‑TGC‑CGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACtt < 3:137759‑M1/114‑1 (MQ=255) aCTCGACCTATGCCGCGCCGGTAC‑TGC‑CGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAACAAAAGCGCGTGGTATTGGTCGACCTTGCCTCGCAg < 2:146921/149‑1 (MQ=255) aCCTATGCCGCGCCGGTAC‑TGC‑CGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAACAAAAGCGCGTGGTATTGGTCGACCTTGCCTCGCAGGTGGc < 4:232142/149‑1 (MQ=255) cTATGCCGCGCCGGTAC‑TGC‑CGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAACAAAAGCGCGTGGTATTGGTCGACCTTGCCTCGCAGGTGGCgg < 1:191980/149‑1 (MQ=255) aTGCCGCGCCGGTAC‑TGC‑CGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAACAAAAGCGCGTGGTATTGGTCGACCTTGCCTCGCAGGTGGCgg > 5:155366/1‑147 (MQ=255) aTGCCGCGCCGGTAC‑TGC‑CGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAACAAAAGCGCGTGGTATTGGTCGACCTTGCCTCGCAGGTGGCgg < 6:155366/147‑1 (MQ=255) aTGCCGCGCCGGTAC‑TGC‑CGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAACAAAAGCGCGTGGTATTGGTCGACCTTGCCTCGCAGGTGGCGGGc > 5:333114/1‑149 (MQ=255) tGCCGCGCCGGTAC‑TGC‑CGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAACAAAAGAGCGTGGTATTGGTCGACCTTGCCTCGAAGGTGGCGGGcc > 7:12932/1‑149 (MQ=255) gCCGCGCCGGTAC‑TGC‑CGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAACAAAAGCGCGTGGTATTgg < 1:138070/121‑1 (MQ=255) gCCGCGCCGGTAC‑TGC‑CGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAACAAAAGCGCGTGGTATTgg > 2:138070/1‑121 (MQ=255) cgcgCCGGTAC‑TGC‑CGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAACAAAAGCGCGTGGTATTGGTCGACCTTGCCTCGCAGGTgg > 4:225558/1‑140 (MQ=255) cgcgCCGGTAC‑TGC‑CGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAACAAAAGCGCGTGGTATTGGTCGACCTTGCCTCGCAGGTgg < 3:225558/140‑1 (MQ=255) cgcgCCGGTAC‑TGC‑CGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAACAAAAGCGCGTGGTATTGGTCGACCTTGCCTCGCAGGTg < 5:170044/139‑1 (MQ=255) cgcgCCGGTAC‑TGC‑CGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAACAAAAGCGCGTGGTATTGGTCGACCTTGCCTCGCAGGTg > 6:170044/1‑139 (MQ=255) gTAC‑TGC‑CGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAACAAAAGCGCGTGGTATTGGTCGACCTTGCCTCGCAGGTGGCgg > 6:307461/1‑136 (MQ=255) gTAC‑TGC‑CGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAACAAAAGCGCGTGGTATTGGTCGACCTTGCCTCGCAGGTGGCgg < 5:307461/136‑1 (MQ=255) gC‑CGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAACAAAAGCGCGTGGTATTGGTCGACCTTGCCTCGCAGGTGGCGGGCCTGGTGGTGATGCTCg > 1:226940/1‑149 (MQ=255) c‑cGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAACAAAAGCGCGTGGTATTGGTCGACCTTGCCTCGCAGGTGGCGGGCCTGGTGGTGATGCTc < 6:18947/147‑1 (MQ=255) c‑cGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAACAAAAGCGCGTGGTATTGGTCGACCTTGCCTCGCAGGTGGCGGGCCTGGTGGTGATGCTCGt > 6:144991/1‑149 (MQ=255) c‑cGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGCGGCGGTACGCACTTTCCAACAAAAGCGCGTGGTATTGGTGGACCTTGCCTCGCAGGTGGCGGGCCTGGTGGTGATGCTCGt > 5:277958/1‑149 (MQ=255) gATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAACAAAAGCGCGTGGTATTGGTCGACCTTGCCTCGCAGGTGGCGGGCCTGGTGGTGATGCTCGTGc > 5:257977/1‑149 (MQ=255) aTGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCCACAAAAGCGCGTGGGATTGGTCGACCTTGCCTCGCAGGTGGCGGGCGTGGTGGTGATGCTGGTGCt > 5:235849/1‑149 (MQ=255) tACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAACAAAAGCGCGTGGTATTGGTCGACCTTGCCTCGCAGGTGGCGGGCCTGGTGGTGATGCTCGTGCTGGGc < 5:144991/149‑1 (MQ=255) tGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAACAAAAGCGCGTGGTATTGGTCGACCTTGCCTCGCAGGTGGCGGGCCtggtgg > 1:308336/1‑129 (MQ=255) tGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAACAAAAGCGCGTGGTATTGGTCGACCTTGCCTCGCAGGTGGCGGGCCtggtgg < 2:308336/129‑1 (MQ=255) tCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAACAAAAGCGCGTGGTATTGGTCGACCTTGCCTCGCAGGTGGCGGGCCTGGGGGTGATGCTCGTGCTGGGCTTGCTGAcc > 1:82261/1‑149 (MQ=255) gCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCcaac > 6:136313/1‑66 (MQ=255) gCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCcaac < 5:136313/66‑1 (MQ=255) gCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCAAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAACAAAAGCGCGTGGTATTGGTCGACCTTGCCTCGCAGGTGGCGGGCCTGGTGGTGATGCTCGTGCTGGGCTTGCTGACCCATTc > 3:53728/1‑148 (MQ=255) ccTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAACAAAAGCGCGTGGTATTGGTCGACCTTGCCTCGCAGGTGGCGGGCCtggt < 5:29085/114‑1 (MQ=255) ccTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAACAAAAGCGCGTGGTATTGGTCGACCTTGCCTCGCAGGTGGCGGGCCtggt > 6:29085/1‑114 (MQ=255) ccTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAACAAAAGCGCGTGGTATTGGTCGACCTTGCCTCGCAGGTGGCGGGCCTGGTGGTGATGCTCGTGCTGGGCTTGCTGACCCATTCGa < 6:333114/149‑1 (MQ=255) cTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAACAAAAGCGCGTGGTATTGGTCGACCTTGCCTCGCAGGTGGCGGGCCTGGTGGTGATGCTCGTGCTGGGCTTGCTGACCCATTCGa > 6:222347/1‑148 (MQ=255) tGTCGGCGGCCATCCGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAACAAAAGCGCGTGGTATTGGTCGACCTTGCCTCGCAGGTGGCGGGCCTGGTGGTGATGCTCGTGCTGGGCTTGCTGACCCATTCGATc > 4:223314/1‑149 (MQ=255) tCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAACAAAAGCGCTTGGTATTGGTCGACCTTGCCTCGCAGGTGGAGGTCAGGGTGGTGATGCTCGTGCTGGGCTTGCTGACCCATTCGATCTg > 1:266036/1‑149 (MQ=255) ggccaTCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAACAAAAGCGCGTGGTATTGGTCGACCTTGCCTCGCAGGTGGCGGGCCTGGTGGTGATGCTCGTGCTGGGCTTGCTGACccattcgagatggaa > 5:19359‑M2/6‑140 (MQ=255) aTCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAACAAAAGCGCGTGGTATTGGTCGACCTTGCCTCGCAGGTGGCGGGCCTGGTGGTGATGCTCGTGCTGGGCTTGCTGACCCATTCGATCTGGGCGCTGGt < 2:226940‑M2/148‑1 (MQ=255) | CATCCGCGGTTTCCTGCTGTTTGCCCTTACCCTGCTGCTGGCCCTGGGAGCTTGGTTGGCCCAACTGGCTGAGCTGTGGCCGGCCGACTCGACCTATGCCGCGCCGGTAC‑TGC‑CGATGGTACTGGCGGTCACCGGCCTGTCGGCGGCCATCTGGGGTTTCCAGTCCACCAAGATAGATGTGGCGGTACGCACTTTCCAACAAAAGCGCGTGGTATTGGTCGACCTTGCCTCGCAGGTGGCGGGCCTGGTGGTGATGCTCGTGCTGGGCTTGCTGACCCATTCGATCTGGGCGCTGGT > NC_002947/3547340‑3547636 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |