New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3623866 = | 45 (0.890) | 3 (0.060) | 3/244 | NT | 7.5% | coding (187/1344 nt) | PP_3194 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | 3623927 = | 31 (0.650) | coding (126/1344 nt) | PP_3194 | hypothetical protein |
CGCCGGGGCAGACCATGGACGTCACGCCGGCAGCCAGAACGTGCTGAGCGAAGAACAGCCCCCGCAGGGCGCGAAACTCGTCGC‑TGGTCCAGATGTCGATGTCTTCCTCGCTCTGGGCATTGCCAAACGCCAGGTGGGTGTGCACGTCCACCAGCCCGGGCATGACGAACTGGCCGTGGGCTTCACGGTCGCCGGGTTGTGGACGGGGTGCCTCGGCGGTTGGCCCGACATGGCGGATCACGCCGTCTTCGATGATCAATGTCTGTCGTTGGCGGGTGTGCAGGC > NC_002947/3623722‑3624006 | atgatgagagagctctccaatgagttccctgcacctgcactgctccaccgtgttcgacgggactagcctgcacacccgccaacgacagacattgatcatcgaagactgcttgatcctccatgtcgggccatccgccgaggcacccCGTc > 2:196463‑M1/146‑149 (MQ=255) gCCGGGGCAGACCATGGACGTCACGCCGGCAGCCAGAACGTGCTGAGCGAAGAACAGCCCCCGCAGGGCGCGAAACTCGTCGC‑TGGTCCAGATGTCGATGTCTTCCTCGCTCTGGGCATTGCCAAACGCCAGGTGGGTGTGCACGTcca > 8:60202/1‑149 (MQ=255) gCAGACCATGGACGTCACGCCGGCAGCCAGAACGTGCTGAGCGAAGAACAGCCCCCGCAGGGCGCGAAACTCGTCGC‑TGGTCCAGATGTCGATGTCTTCCTCGCTCTGGGCATTGCCAAACGCCAGGTGGGTGTGCACGTCCACCAGcc > 2:185982/1‑149 (MQ=255) agagctcaccaatgagtgccctgcacctgcactgctccaccctgttcgacggcactggcctgcacacccgccaacgacagacattgatcatcgaagacggcgtgatccgccatgtcgggccaaccgccgaggcacccCGTCCACCAGcc < 2:162710‑M1/12‑1 (MQ=255) aGACCATGGACGTCACGCCGGCAGCCAGAACGTGCTGAGCGAAGAACAGCCCCCGCAGGGCGCGAAACTCGTCGC‑TGGTCCAGATGTCGATGTCTTCCTCGCTCTGGGCATTGCCAAACGCCAGGTGGGTGTGCACGTCCACCAGCCCg > 1:198319/1‑149 (MQ=255) cATGGACGTCACGCCGGCAGCCAGAACGTGCTGAGCGAAGAACAGCCCCCGCAGGGCGCGAAACTCGTCGC‑TGGTCCAGATGTCGATGTCTTCCTCGCTCTGGGCATTGCCAAACGCCAGGTGGGTGTGCACGTc < 1:212152/135‑1 (MQ=255) cATGGACGTCACGCCGGCAGCCAGAACGTGCTGAGCGAAGAACAGCCCCCGCAGGGCGCGAAACTCGTCGC‑TGGTCCAGATGTCGATGTCTTCCTCGCTCTGGGCATTGCCAAACGCCAGGTGGGTGTGCACGTc > 2:212152/1‑135 (MQ=255) aTGGACGTCACGCCGGCAGCCAGAACGTGCTGAGCGAAGAACAGCCCCCGCAGGGCGCGAAACTCGTCGC‑TGGTCCAGATGTCGATGTCTTCCTCGCTCTGGGCATTGCCAAACGCCAGGTGGGTGTGCACGTCCACCAGCCCGGGCAt > 4:287948/1‑149 (MQ=255) tCACGCCGGCAGCCAGAACGTGCTGAGCGAAGAACAGCCCCCGCAGGGCGCGAAACTCGTCGC‑TGGTCCAGATGTCGATGTCTTCCTCGCTCTGGGCATTGCCAAACGCCAGGTGGGTGTGCACGTCCACCAGCCCGGGCATGACGAAc < 4:145126/149‑1 (MQ=255) aCGCCGGCAGCCAGAACGTTCTGAGCTAAGAACACCCCCCGCAGGGCGCGAAACTCGTCGC‑TGGTCCAGATGTCGATGACTTCCTAGCTCTGGGCATTGCCAAACGCAAGGTGGGTCTGCACGTCCACCAGCCCGGGCTTGACGAACTg > 6:307717/1‑149 (MQ=255) aCGCCGGCAGCCAGAACGTGCTGAGCGAAGAACAGCCCCCGCAGGGCGCGAAACTCGTCGC‑TGGTCCAGATGTCGATGTCTTCCTCGCTCTGGGCATTGCCAAACGCCAGGTGGGTGTGCACGTCCACCAGCCCGGGCATGACGAACt < 5:5436/148‑1 (MQ=255) ggCAGCCAGAACGTGCTGAGCGAAGAACAGCCCCCGCAGGGCGCGAAACTCGTCGC‑TGGTCCAGATGTCGATGTCTTCCTCGCTCTGGGCATTGCCAAACGCCAGGTGGGTGTGCACGTCCACCAGCCCGGGCATGACGAACTGGCCGt < 7:289556/149‑1 (MQ=255) ggCAGCCAGAACGTGCTGAGCGAAGAACAGCCCCCGCAGGGCGCGAAACTCGTCGC‑TGGTCCAGATGTCGATGTCTTCCTCGCTCTGGGCATTGCCAAACGCCAGGTGGGTGTGCACGTCCACCAGCCCGGGCATGACGAACTGGCCGt < 5:284542/149‑1 (MQ=255) cAGAACGTGCTGAGCGAAGAACAGCCCCCGCAGGGCGCGAAACTCGTCGC‑TGGTCCAGATGTCGATGTCTTCCTCGCTCTGGGCATTGCCAAACGCCAGGTGGGTGTGCACGTCCACCAGCCCGGGCATGACGAACTGGCCGTGGGCtt < 8:4791/149‑1 (MQ=255) gAACGTGCTGAGCGAAGAACAGCCCCCGCAGGGCGCGAAACTCGTCGC‑TGGTCCAGATGTCGATGTCTTCCTCGCTCTGGGCATTGCCAAACGCCAGGTGGGTGTGCACGTCCACCAGCCCGGGCATg < 6:29518/128‑1 (MQ=255) gAACGTGCTGAGCGAAGAACAGCCCCCGCAGGGCGCGAAACTCGTCGC‑TGGTCCAGATGTCGATGTCTTCCTCGCTCTGGGCATTGCCAAACGCCAGGTGGGTGTGCACGTCCACCAGCCCGGGCATg > 5:29518/1‑128 (MQ=255) gTGCTGAGCGAAGAACAGCCCCCGCAGGGCGCGAAACTCGTCGC‑TGGTCCAGATGTCGATGTCTTCCTCGCTCTGGGCATTGCCAAACGCCAGGTGGGTGTGCACGTCCACCAGCCCGGGCATGACGAACTGGCCGTGGGCTTCACGGt > 2:251083/1‑149 (MQ=255) ctccaccctgttcgacggcactggcctgcacacccgccaacgacagacattgatcatcgaagacggcgtgatccgccatgtcgggccaaccgccgaggcacccCGTcc < 6:277519‑M1/5‑1 (MQ=255) ctccaccctgttcgacggcactggcctgcacacccgccaacgacagacattgatcatcgaagacggcgtgatccgccatgtcgggccaaccgccgaggcacccCGTcc > 5:277519‑M1/104‑108 (MQ=255) caccctgttcgacggcactggcctgcacacccgccaacgacagacattgatcatcgaagacggcgtgatccgccatgtcgggccaaccgccgaggcacccCGTCCACCAGCCCGGGCATGACGAACTGGCCGTGGGCTTCACGGTCGcc < 5:129830‑M1/49‑1 (MQ=255) aGCGAAGAACAGCCCCCGCAGGGCGCGAAACTCGTCGC‑TGGTCCAGATGTCGATGTCTTCCTCGCTCTGGGCATTGCCAAACGCCAGGTGGGTGTGCACGTCCACCAGCCCGGGCATGACGAACTGGCCGTGGGCTTCACGGTCGCCgg > 4:52031/1‑149 (MQ=255) cGAAGAACAGCCCCCGCAGGGCGCGAAACTCGTCGCTTGGTCCAGATGTCGATGTCTTCCTCGCTCTGGGCATTGCCAAACGCCAGGTGGGTGTGCACGTCCACCAGCCCGGGCATGACGAACTGGCCGTGGGCTTCACGGTCGCCggg > 1:57387/1‑149 (MQ=255) cGAAGAACAGCCCCCGCAGGGCGCGAAACTCGTCGC‑TGGTCCAGATGTCGATGTCTTCCTCGCTCTGGGCATTGCCAAACGCCAGGTGGGTGTGCACGTCCACCAGCCCGGGCATGACGAACTGGCCGTGGGCTTCACGGTCGCCGGGt > 3:28595/1‑149 (MQ=255) gaagaaCAGCCCCCGCAGGGCGCGAAACTCGTCGC‑TGGTCCAGATGTCGATGTCTTCCTCGCTCTGGGCATTGCCAAACGCCAGGTGGGTGTGCACGTCCACCAGCCCGGGCATGACGAACTGGCCGTGGGCTTCACGGTCGCCGGGtt < 2:198319/149‑1 (MQ=255) gaagaaCAGCCCCCGCAGGGCGCGAAACTCGTCGC‑TGGTCCAGATGTCGATGTCTTCCTCGCTCTGGGCATTGCCAAACGCCAGGTGGGTGTGCACGGCCACCAGCCCGGGCATGACGAACTGGCCGTGGGCTTCACGGTCGCCGGGtt < 1:306660/149‑1 (MQ=255) aagaaCAGCCCCCGCAGGGCGCGAAACTCGTCGC‑TGGTCCAGATGTCGATGTCTTCCTCGCTCTGGGCATTGCCAAACGCCAGGTGGGTGTGCACGTCCACCAGCCCGGGCAt > 8:251498/1‑113 (MQ=255) aagaaCAGCCCCCGCAGGGCGCGAAACTCGTCGC‑TGGTCCAGATGTCGATGTCTTCCTCGCTCTGGGCATTGCCAAACGCCAGGTGGGTGTGCACGTCCACCAGCCCGGGCAt < 7:251498/113‑1 (MQ=255) aCAGCCCCCGCAGGGCGCGAAACTCGTCGC‑TGGTCCAGATGTCGATGTCTTCCTCGCTCTGGGCATTGCCAAACGCCAGGTGGGTGTGCACGTCCACCAGCCCGGGCATGACGAACTGGCCGTGGGCTTCACGGTCGCCGGGTTGTGGa < 3:287948/149‑1 (MQ=255) ggcactggcctgcacacccgccaacgacagacattgatcatcgaagacggcgtgatccgccatgtcgggccaaccgccgaggcacccCGTCCACCAGCCCGGGCATGACGAACTGGCCGTGGGCTTCACGGTCGCCGAGTTGTGGACgg > 1:162710‑M1/88‑149 (MQ=255) gcactggcctgcacacccgccaacgacagacattgatcatcgaagacggcgtgatccgccatgtcgggccaaccgccgaggcacccCGTCCACCAGCCCGGGCATGACGAACTGGCCGTGGGCTTCACGGTCGCCGGGTTGTGGACggg > 6:129830‑M1/87‑149 (MQ=255) ccGCAGGGCGCGAAACTCGTCGC‑TGGTCCAGATGTCGATGTCTTCCTCGCTCTGGGCATTGCCAAACGCCAGGTGGGTGTGCACGTCCACCAGCCCGGGCATGACGAACTGGCCATGGGCTTCACGGTCGCCGGGTTGTGGACGGGGTg > 7:258537/1‑149 (MQ=255) cgcgAAACTCGTCGC‑TGGTCCAGATGTCGATGTCTTCCTCGCTCTGGGCATTGCCAAACGCCAGGTGGGTGTGCACGTCCACCAGCCCGGGCATGACGAACTGGCCATGGGCTTCACGGTCGCCGGGTTGTGGACGGGGTGCCTcggcg < 8:258537/149‑1 (MQ=255) gcgAAACTCGTCGC‑TGGTCCAGATGTCGATGTCTTCCTCGCTCTGGGCATTGCCAAACGCCAGGTGGGTGTGCACGTCCACCAGCCCGGGCATGACGAACTGGCCGTGGGCTTCACGGTCGCCGGGTTGTGGACGGGGTGCCTcggcgg > 7:104918/1‑149 (MQ=255) gAAACTCGTCGC‑TGGTCCAGATGTCGATGTCTTCCTCGCTCTGGGCATTGCCAAACGCCAGGTGGGTGTGCACGTCCACCAGCCCGGGCATGACGAACTGGCCGTggg > 5:170667/1‑108 (MQ=255) gAAACTCGTCGC‑TGGTCCAGATGTCGATGTCTTCCTCGCTCTGGGCATTGCCAAACGCCAGGTGGGTGTGCACGTCCACCAGCCCGGGCATGACGAACTGGCCGTggg < 6:170667/108‑1 (MQ=255) gAAACTCGTCGC‑TGGTCCAGATGTCGATGTCTTCCTCGCTCTGGGCATTGCCAAACGCCAGGTGGGTGTGCACGTCCACCAGCCCGGGCATGACGAACTGGCCGTGGGCTTCACGGTCGCCGGGTTGTGGACGGGGTGCCGCGGCGGtt < 1:185982/149‑1 (MQ=255) aCTCGTCGC‑TGGTCCAGATGTCGATGTCTTCCTCGCTCTGGGCATTGCCAAACGCCAGGTGGGTGTGCACGTCCACCAGCCCGGGCATGACGAACTGGCCGTGGGCTTCACGGTCGCCGGGTTGTGGACGGGGTGCCTCGGCGGTTGGc < 3:254916/149‑1 (MQ=255) tgtcgatgtcTTCCTCGCTCTGGGCATTGCCAAACGCCAGGTGGGTGTGCACGTCCACCAGCCCGGGCATGACGAACTGGCCGTGGGCTTCACGGTCGCCGGGTTGTGGACGGGGTGCCTCGGCGGTTGGCCCGACATGGCGGATCACg < 2:57387/149‑1 (MQ=255) gtcgatgtcTTCCTCGCTCTGGGCATTGCCAAACGCCAGGTGGGTGTGCACGTCCACCAGCCCGGGCATGACGAACTGGCCGTGGGCTTCACGGTCGCCGGGTTGTGGACGGGGTGCCTCGGCGGTTGGCCCGACATGGCGGATCACGc > 6:60686/1‑149 (MQ=255) tcgatgtcTTCCTCGCTCTGGGCATTGCCAAACGCCAGGTGGGTGTGCACGTCCACCAGCCCGGGCATGACGAACTGGCCGTGGGCTTCACGGTCGCCGGGTTGTGGACGGGGTGCCTCGGCGGTTGGCCCGACATGGCGGATCACGcc > 2:141079/1‑149 (MQ=255) ttCCTCGCTCTGGGCATTGCCAAACGCCAGGTGGGTGTGCACGTCCACCAGCCCGGGCATGACGAACTGGCCGTGGGCTTCACGGTCGCCGGGTTGTGGACGGGGTGCCTCGGCGGTTGGCCCGACATGGCGGATCACGCCGTCTTCga > 5:177570/1‑149 (MQ=255) ttCCTCGCTCTGGGCATTGCCAAACGCCAGGTGGGTGTGCACGTCCACCAGCCCGGGCATGACGAACTGGCCGTGGGCTTCACGGTCGCCGGGTTGTGGACGGGGTGCCTCGGCGGTTGGCCCGACATGGCGGATCACGCCGTCTTCga > 2:267135/1‑149 (MQ=255) ttCCTCGCTCTGGGCATTGCCAAACGCCAGGTGGGTGTGCACGTCCACCAGCCCGGGCATGACGAACTGGCCGTAGGCTTCACGGTCGCCGGGTTGTGGACGGGGTGCCTCGGCGGTTGGCCCGACATGGCGGATCACGCCGTCTTCga > 3:98817/1‑149 (MQ=255) ccTCGCTCTGGGCATTGCCAAACGCCAGGTGGGTGTGCACGTCCACCAGCCCGGGCATGACGAACTGGCCGTGGGCTTCACGGTCGCCGGGTTGTGGACGGGGTGCCTCGGCGGTTGGCCCGACATGGCGGATCACGCCGTCTTCga < 3:52031/147‑1 (MQ=255) cTCGCTCTGGGCATTGCCAAACGCCAGGTGGGTGTGCACGTCCACCAGCCCGGGCATGACGAACTGGCCGTGGGCTTCACGGTCGCCGGGTTGTGGACGGGGTGCCTCGGCGGTTGGCCCGACATGGCGGATCACGCCGTCTTCgatg > 4:248697/1‑148 (MQ=255) ggCATTGCCAAAGGCCAGGTGGTGGTGGACGTCGACCAGCCCGGGCATGACGAACTGGCCGTTGGCTTCACGGTCGCAGGGTTGTGGACGTGGTGCCTCGGCGGTTGGCCCGACATGGCGGATCACGCCGTCTTCGATGATCAAtg < 5:307717/146‑1 (MQ=255) aTTGCCAAACGCCAGGTGGGTGTGCACGTCCACCAGCCCGGGCATGACGAACTGGCCGTGGGCTTCACGGTCGCCGGGTTGTGGACGGGGTGCCTCGGCGGTTGGCCCGACATGGCGGATCACGCCGTCTTCgat < 3:156059/135‑1 (MQ=255) aTTGCCAAACGCCAGGTGGGTGTGCACGTCCACCAGCCCGGGCATGACGAACTGGCCGTGGGCTTCACGGTCGCCGGGTTGTGGACGGGGTGCCTCGGCGGTTGGCCCGACATGGCGGATCACGCCGTCTTCgat > 4:156059/1‑135 (MQ=255) aTTGCCAAACGCCAGGTGGGTGTGCACGTCCACCAGCCCGGGCATGACGAACTGGCCGTGGGCTTCACGGTCGCCGGGTTGTGGACGGGGTGCCTCGGCGGTTGGCCCGACATGGCGGATCACGCCGTCTTCGATGATCAAtgtctgtc < 5:60686/149‑1 (MQ=255) aCGCCAGGTGGGTGTGCACGTCCACCAGCCCGGGCATGACGAACTGGCCGTGGGCTTCACGGTCGCCGGGTTGTGGACGGGGTGCCTCGGCGGTTGGCCCGACATGGCGGATCACGCCGTCTTCGATGATCAATGTCTGTCGTTGGCgg < 6:177570/149‑1 (MQ=255) gtgggtgTGCACGTCCACCAGCCCGGGCATGACGAACTGGCCGTGGGCTTCACGGTCGCCGGGTTGTGGACGGGGTGCCTCGGCGGTTGGCCCGACATGGCGGATCACGCCGTCTTCGATGATCAATGTCTGTCGTTGGCGGGTGTGCa < 7:60202/149‑1 (MQ=255) ggtgTGCACGTCCACCAGCCCGGGCATGACGAACTGGCCGTGGGCTTCACGGTCGCCGGGTTGTGGACGGGGTGCCTCGGCGGTTGGCCCGACATGGCGGATCACGCCGTCTTCGATGATCAATGTCTGTCGTTGGCGGGTGTGCAGGc < 8:104918/149‑1 (MQ=255) gtgtGCACGTCCACCAGCCCGGGCATGACGAACTGGCCGTGGGCTTCACGGTCGCCGGGTTGTGGACGGGGTGCCTCGGCGGTTGGCCCGACATGGCGGATCACGCCGTCTTCGATGATCAATGTCTGTCGTTGGCggg > 4:282355/1‑139 (MQ=255) gtgtGCACGTCCACCAGCCAGGGCATGACGAACTGGCCGTGGGCTTCACGGTCGCCGGGTTGTGGACGGGGTGCCTCGGCGGTTGGCCCGACATGGCGGATCACGCCGTCTTCGATGATCAATGTCTGTCGTTGGCggg < 3:282355/139‑1 (MQ=255) | CGCCGGGGCAGACCATGGACGTCACGCCGGCAGCCAGAACGTGCTGAGCGAAGAACAGCCCCCGCAGGGCGCGAAACTCGTCGC‑TGGTCCAGATGTCGATGTCTTCCTCGCTCTGGGCATTGCCAAACGCCAGGTGGGTGTGCACGTCCACCAGCCCGGGCATGACGAACTGGCCGTGGGCTTCACGGTCGCCGGGTTGTGGACGGGGTGCCTCGGCGGTTGGCCCGACATGGCGGATCACGCCGTCTTCGATGATCAATGTCTGTCGTTGGCGGGTGTGCAGGC > NC_002947/3623722‑3624006 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |