New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3623866 = | 45 (0.890) | 3 (0.060) | 3/244 | NT | 7.5% | coding (187/1344 nt) | PP_3194 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | 3623927 = | 31 (0.650) | coding (126/1344 nt) | PP_3194 | hypothetical protein |
GCCCCCGCAGGGCGCGAAACTCGTCGCTGGTCCAGATGTCGATGTCTTCCTCGCTCTGGGCATTGCCAAACGCCAGGTGGGTGTGCACGTCCACCAGCCCGGGCATGACGAACTGGCCGTGGGCTTCACGGTCGCCGGGTTGTGGACGGGGTGCCTCGGCGGTTGGCCCGACATGGCGGATCACGCCGTCTTCGATGATCAATGTCTGTCGTTGGCGGGTGTGCAGGCCAGTGCCGTCGAACAGGGTGGAGCAGTGCAGGTGCAGGGCACTCATTGGTGAGCTCTCTCATCTT > NC_002947/3623779‑3624071 | ggcactggcctgcacacccgccaacgacagacattgatcatcgaagacggcgtgatccgccatgtcgggccaaccgccgaggcacccCGTCCACCAGCCCGGGCATGACGAACTGGCCGTGGGCTTCACGGTCGCCGAGTTGTGGACgg > 1:162710‑M1/88‑149 (MQ=255) gcactggcctgcacacccgccaacgacagacattgatcatcgaagacggcgtgatccgccatgtcgggccaaccgccgaggcacccCGTCCACCAGCCCGGGCATGACGAACTGGCCGTGGGCTTCACGGTCGCCGGGTTGTGGACggg > 6:129830‑M1/87‑149 (MQ=255) ccGCAGGGCGCGAAACTCGTCGCTGGTCCAGATGTCGATGTCTTCCTCGCTCTGGGCATTGCCAAACGCCAGGTGGGTGTGCACGTCCACCAGCCCGGGCATGACGAACTGGCCATGGGCTTCACGGTCGCCGGGTTGTGGACGGGGTg > 7:258537/1‑149 (MQ=255) cgcgAAACTCGTCGCTGGTCCAGATGTCGATGTCTTCCTCGCTCTGGGCATTGCCAAACGCCAGGTGGGTGTGCACGTCCACCAGCCCGGGCATGACGAACTGGCCATGGGCTTCACGGTCGCCGGGTTGTGGACGGGGTGCCTcggcg < 8:258537/149‑1 (MQ=255) gcgAAACTCGTCGCTGGTCCAGATGTCGATGTCTTCCTCGCTCTGGGCATTGCCAAACGCCAGGTGGGTGTGCACGTCCACCAGCCCGGGCATGACGAACTGGCCGTGGGCTTCACGGTCGCCGGGTTGTGGACGGGGTGCCTcggcgg > 7:104918/1‑149 (MQ=255) gAAACTCGTCGCTGGTCCAGATGTCGATGTCTTCCTCGCTCTGGGCATTGCCAAACGCCAGGTGGGTGTGCACGTCCACCAGCCCGGGCATGACGAACTGGCCGTGGGCTTCACGGTCGCCGGGTTGTGGACGGGGTGCCGCGGCGGtt < 1:185982/149‑1 (MQ=255) aCTCGTCGCTGGTCCAGATGTCGATGTCTTCCTCGCTCTGGGCATTGCCAAACGCCAGGTGGGTGTGCACGTCCACCAGCCCGGGCATGACGAACTGGCCGTGGGCTTCACGGTCGCCGGGTTGTGGACGGGGTGCCTCGGCGGTTGGc < 3:254916/149‑1 (MQ=255) tgtcgatgtcTTCCTCGCTCTGGGCATTGCCAAACGCCAGGTGGGTGTGCACGTCCACCAGCCCGGGCATGACGAACTGGCCGTGGGCTTCACGGTCGCCGGGTTGTGGACGGGGTGCCTCGGCGGTTGGCCCGACATGGCGGATCACg < 2:57387/149‑1 (MQ=255) gtcgatgtcTTCCTCGCTCTGGGCATTGCCAAACGCCAGGTGGGTGTGCACGTCCACCAGCCCGGGCATGACGAACTGGCCGTGGGCTTCACGGTCGCCGGGTTGTGGACGGGGTGCCTCGGCGGTTGGCCCGACATGGCGGATCACGc > 6:60686/1‑149 (MQ=255) tcgatgtcTTCCTCGCTCTGGGCATTGCCAAACGCCAGGTGGGTGTGCACGTCCACCAGCCCGGGCATGACGAACTGGCCGTGGGCTTCACGGTCGCCGGGTTGTGGACGGGGTGCCTCGGCGGTTGGCCCGACATGGCGGATCACGcc > 2:141079/1‑149 (MQ=255) ttCCTCGCTCTGGGCATTGCCAAACGCCAGGTGGGTGTGCACGTCCACCAGCCCGGGCATGACGAACTGGCCGTGGGCTTCACGGTCGCCGGGTTGTGGACGGGGTGCCTCGGCGGTTGGCCCGACATGGCGGATCACGCCGTCTTCga > 2:267135/1‑149 (MQ=255) ttCCTCGCTCTGGGCATTGCCAAACGCCAGGTGGGTGTGCACGTCCACCAGCCCGGGCATGACGAACTGGCCGTGGGCTTCACGGTCGCCGGGTTGTGGACGGGGTGCCTCGGCGGTTGGCCCGACATGGCGGATCACGCCGTCTTCga > 5:177570/1‑149 (MQ=255) ttCCTCGCTCTGGGCATTGCCAAACGCCAGGTGGGTGTGCACGTCCACCAGCCCGGGCATGACGAACTGGCCGTAGGCTTCACGGTCGCCGGGTTGTGGACGGGGTGCCTCGGCGGTTGGCCCGACATGGCGGATCACGCCGTCTTCga > 3:98817/1‑149 (MQ=255) ccTCGCTCTGGGCATTGCCAAACGCCAGGTGGGTGTGCACGTCCACCAGCCCGGGCATGACGAACTGGCCGTGGGCTTCACGGTCGCCGGGTTGTGGACGGGGTGCCTCGGCGGTTGGCCCGACATGGCGGATCACGCCGTCTTCga < 3:52031/147‑1 (MQ=255) cTCGCTCTGGGCATTGCCAAACGCCAGGTGGGTGTGCACGTCCACCAGCCCGGGCATGACGAACTGGCCGTGGGCTTCACGGTCGCCGGGTTGTGGACGGGGTGCCTCGGCGGTTGGCCCGACATGGCGGATCACGCCGTCTTCgatg > 4:248697/1‑148 (MQ=255) ggCATTGCCAAAGGCCAGGTGGTGGTGGACGTCGACCAGCCCGGGCATGACGAACTGGCCGTTGGCTTCACGGTCGCAGGGTTGTGGACGTGGTGCCTCGGCGGTTGGCCCGACATGGCGGATCACGCCGTCTTCGATGATCAAtg < 5:307717/146‑1 (MQ=255) aTTGCCAAACGCCAGGTGGGTGTGCACGTCCACCAGCCCGGGCATGACGAACTGGCCGTGGGCTTCACGGTCGCCGGGTTGTGGACGGGGTGCCTCGGCGGTTGGCCCGACATGGCGGATCACGCCGTCTTCgat > 4:156059/1‑135 (MQ=255) aTTGCCAAACGCCAGGTGGGTGTGCACGTCCACCAGCCCGGGCATGACGAACTGGCCGTGGGCTTCACGGTCGCCGGGTTGTGGACGGGGTGCCTCGGCGGTTGGCCCGACATGGCGGATCACGCCGTCTTCgat < 3:156059/135‑1 (MQ=255) aTTGCCAAACGCCAGGTGGGTGTGCACGTCCACCAGCCCGGGCATGACGAACTGGCCGTGGGCTTCACGGTCGCCGGGTTGTGGACGGGGTGCCTCGGCGGTTGGCCCGACATGGCGGATCACGCCGTCTTCGATGATCAAtgtctgtc < 5:60686/149‑1 (MQ=255) aCGCCAGGTGGGTGTGCACGTCCACCAGCCCGGGCATGACGAACTGGCCGTGGGCTTCACGGTCGCCGGGTTGTGGACGGGGTGCCTCGGCGGTTGGCCCGACATGGCGGATCACGCCGTCTTCGATGATCAATGTCTGTCGTTGGCgg < 6:177570/149‑1 (MQ=255) gtgggtgTGCACGTCCACCAGCCCGGGCATGACGAACTGGCCGTGGGCTTCACGGTCGCCGGGTTGTGGACGGGGTGCCTCGGCGGTTGGCCCGACATGGCGGATCACGCCGTCTTCGATGATCAATGTCTGTCGTTGGCGGGTGTGCa < 7:60202/149‑1 (MQ=255) ggtgTGCACGTCCACCAGCCCGGGCATGACGAACTGGCCGTGGGCTTCACGGTCGCCGGGTTGTGGACGGGGTGCCTCGGCGGTTGGCCCGACATGGCGGATCACGCCGTCTTCGATGATCAATGTCTGTCGTTGGCGGGTGTGCAGGc < 8:104918/149‑1 (MQ=255) gtgtGCACGTCCACCAGCCCGGGCATGACGAACTGGCCGTGGGCTTCACGGTCGCCGGGTTGTGGACGGGGTGCCTCGGCGGTTGGCCCGACATGGCGGATCACGCCGTCTTCGATGATCAATGTCTGTCGTTGGCggg > 4:282355/1‑139 (MQ=255) gtgtGCACGTCCACCAGCCAGGGCATGACGAACTGGCCGTGGGCTTCACGGTCGCCGGGTTGTGGACGGGGTGCCTCGGCGGTTGGCCCGACATGGCGGATCACGCCGTCTTCGATGATCAATGTCTGTCGTTGGCggg < 3:282355/139‑1 (MQ=255) cccgtccacaacccggcgaccgtgaagcccacggccagttcgtcatgcccgggctggtggacgGGGTGCCTCGGCGGTTGGCCCGACATGGCGGATCACGCCGTCTTCGATGATCAATGTCTGTCGTTGGCGGGTGTGCAGGCCAGTGc > 6:129830‑M2/64‑149 (MQ=255) ccgtccacaactcggcgaccgtgaagcccacggccagttcgtcatgcccgggctggtggacgGGGTGCCTCGGCGGTTGGCCCGACATGGCGGATCACGCCGTCTTCGATGATCAATGTCTGTCGTTGGCGGGTGTGCAGGCCAGTGcc > 1:162710‑M2/63‑149 (MQ=255) CACCAGCCCGGGCATGACGAACTGGCCGTGGGCTTCACGGTCGCCGGGTTGTGGACGGGGTGCCTCGGCGGTTGGCCCGACATGGCGGATCACGCCGTCTTCGATGATc > 1:216286‑M1/1‑109 (MQ=255) CACCAGCCCGGGCATGACGAACTGGCCGTGGGCTTCACGGTCGCCGGGTTGTGGACGGGGTGCCTCGGCGGTTGGCCCGACATGGCGGATCACGCCGTCTTCGATGATc < 2:216286‑M1/109‑1 (MQ=255) gCCCGGGCATGACGAACTGGCCGTGGGCTTCACGGTCGCCGGGTTGTGGACGGGGTGCCTCGGCGGTTGGCCCGACATGGCGGATCACGCCGTCTTCGATGATCAAtgt > 8:218564/1‑109 (MQ=255) ggcgaccgtgaagcccacggccagttcgtcatgcccgggctggtggacgGGGTGCCTCGGCGGTTGGCCCGACATGGCGGATCACGCCGTCTTCGATGATCAATGTCTGTCGTTGGCGGGTGTGCAGGCCAGTGCCGTCGAACAGGGTg < 5:129830‑M2/100‑1 (MQ=255) aCGAACTGGCCGTGGGCTTCACGGTCGCCGGGTTGTGGACGGGGTGCCTCGGCGGTTGGCCCGACATGGCGGATCACGCCGTCTTCGATGATCAATGTCTGTCGTTGGCGGGTGTGCAGGCCAGTGCCGTCGAACAGGGTGGAGCAgtg > 8:301275/1‑149 (MQ=255) aaCTGGCCGTAGGCTTCACGGTCGCCGGGTTGTGGACGGGGTGCCTCGGCGGTTGGCCCGACATGGCGGATCACGCCGTCTTCGATGATCAATGTCTGTCGTTGGCGGGTGTGCAGGCCAGTGCCGTCGAACAGGGTGGAGCAgtgcag < 4:98817/149‑1 (MQ=255) tGGCCGTGGGCTTCACGGTCGCCGGGTTGTGGACGGGGTGCCTCGGCGGTTGGCCCGACATGGCGGATCACGCCGTCTTCGATGATCAATGTCTGTCGTTGGCGGGTGTGCAGGCCAGTGCCGTCGAACAGGGTGGAGCAgtgcaggtg > 1:118252/1‑149 (MQ=255) gCCGTGGGCTTCACGGTCGCCGGGTTGTGGACGGGGTGCCTCGGCGGTTGGCCCGACATGGCGGATCACGCCGTCTTCGATGATCAATGTCTGTCGTTGGCGGGTGTGCAGGCCAGTGCCGTCGAACAGGGTGGAGCAgtgcaggtg > 1:33971/1‑147 (MQ=255) cGTGGGCTTCACGGTCGCCGGGTTGTGGACGGGGTGCCTCGGCGGTTGGCCCGACATGGCGGATCACGCCGTCTTCGATGATCAATGTCTGTCGTTGGCGGGTGTGCAGGCCAGTGCCGTCGAACAGGGTGGAGCAGtgcaggtgcagg < 1:251083/149‑1 (MQ=255) gTGGGCTTCACGGTCGCCGGGTTGTGGACGGGGTGCCTCGGCGGTTGGCCCGACATGGCGGATCACGCCGTCTTCGATGATCAATGTCTGTCGTTGGCGGGTGTGCAGGCCAGTGCCGTCGAACAGGGTGGAGCAGTGCAGGTGCAggg > 3:24511/1‑149 (MQ=255) ggTCGCCGGGTTGTGGACGGGGTGCCTCGGCGGTTGGCCCGACATGGCGGATCACGCCGTCTTCGATGATCAATGTCTGTCGTTGGCGGGTGTGCAGGCCAGTGCCGTCGAACAGGGTGGAGCAGTGCAGGTGCAGGGCACTCATTGGt < 3:248697/149‑1 (MQ=255) ggTCGCCGGGTTGTGGACGGGGTGCCTCGGCGGTTGGCCCGACATGGCGGATCACGCCGTCTTCGATGATCAATGTCTGTCGTTGGCGGGTGTGCAGGCCAGTGCCGTCGAACAGGGTGGAGCAGTGCAGGTGCAGGGCACTCATTGGt < 1:141079/149‑1 (MQ=255) tCGCCGGGTTGTGGACGGGGTGCCTCGGCGGTTGGCCCGACATGGCGGATCACGCCGTCTTCGATGATCAATGTCTGTCGTTGGCGGGTGTGCAGGCCAGTGCCGTCGAACAGGGTGGAGCAGTGCAGGTGCAGGGCACTCATTGGTGa < 7:301275/149‑1 (MQ=255) ggctggtggacgGGGTGCCTCGGCGGTTGGCCCGACATGGCGGATCACGCCGTCTTCGATGATCAATGTCTGTCGTTGGCGGGTGTGCAGGCCAGTGCCGTCGAACAGGGTGGAGCAGTGCAGGTGCAGGGCACTCATTGGTGAGctct < 2:162710‑M2/137‑1 (MQ=255) ttGTGGACGGGGTGCCTCGGCGGTTGGCCCGACATGGCGGATCACGCCGTCTTCGATGATCAATGTCTGTCGTTGGCGGGTGTGCAGGCCAGTGCCGTCGAACAGGGTGGAGCAGTGCAGGTGCAGGGCACTCATTGGTGAGctctct > 5:166992/1‑148 (MQ=255) ggacgGGGTGCCTCGGCGGTTGGCCCGACATGGCGGATCACGCCGTCTTCGATGATCAATGTCTGTCGTTGGCGGGTGTGCAGGCCAGTGCCGTCGAACAGGGTGGAg > 5:277519‑M2/6‑108 (MQ=255) ggacgGGGTGCCTCGGCGGTTGGCCCGACATGGCGGATCACGCCGTCTTCGATGATCAATGTCTGTCGTTGGCGGGTGTGCAGGCCAGTGCCGTCGAACAGGGTGGAg < 6:277519‑M2/103‑1 (MQ=255) gacgGGGTGCCTCGGCGGATGGCCCGACATGGAGGATCAAGCAGTCTTCGATGATCAATGTCTGTCGTTGGCGGGTGTGCAGGCTAGTCCCGTCGAACACGGTGGAGCAGTGCAGGTGCAGGGAACTCATTGGAGAGCTCTCTCatcat > 2:196463‑M2/5‑147 (MQ=255) | GCCCCCGCAGGGCGCGAAACTCGTCGCTGGTCCAGATGTCGATGTCTTCCTCGCTCTGGGCATTGCCAAACGCCAGGTGGGTGTGCACGTCCACCAGCCCGGGCATGACGAACTGGCCGTGGGCTTCACGGTCGCCGGGTTGTGGACGGGGTGCCTCGGCGGTTGGCCCGACATGGCGGATCACGCCGTCTTCGATGATCAATGTCTGTCGTTGGCGGGTGTGCAGGCCAGTGCCGTCGAACAGGGTGGAGCAGTGCAGGTGCAGGGCACTCATTGGTGAGCTCTCTCATCTT > NC_002947/3623779‑3624071 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |