New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 3926238 | 39 (0.770) | 3 (0.060) | 3/240 | NT | 7.9% | coding (253/1629 nt) | peaA | quinohemoprotein amine dehydrogenase subunit alpha |
? | NC_002947 | = 3926260 | 34 (0.730) | coding (231/1629 nt) | peaA | quinohemoprotein amine dehydrogenase subunit alpha |
AGCCGACGCTCCATGGCGTAGCGCACGCCATCGGTTTCGCTGGGCGCCAGGCCCTGTTTGTCGGCCAGGTATTTGACCAGCGTGCGAC‑GATCGTCGTCGCTGATCTGAAGGCCATGCATCACCTGCATGCGGGCGATGCTCAT‑‑CAGCCAGCCTTCCGGTGTCTTGCGCTGGTGGCTGATGCGGCTATAGGTGTCGTTGCCTTCGGGGATATGGCACCCCATGCACTTGTTCTGCAACAGGCTCGGGCCCTGCTCGGCCGCCATGGCCTGGGTGCTCAGCAGCGCGGCGGCGA > NC_002947/3926090‑3926381 | aGCCGACGCTCCATGGCGTAGCGCACGCCATCGGTTTCGCTGGGCGCCAGGCCCTGTTTGTCGGCCAGGTATTTGACCAGCGTGCGAC‑GATCGTCGTCGCTGATCTGAAGGCCATGCATCACCTGCATGCGGGCGATGCTCAT‑‑CAGCCA < 8:278728‑M1/149‑1 (MQ=255) ccGACGCTCCATGGCGTAGCGCACGCCATCGGTTTCGCTGGGCGCCAGGCCCTGTTTGTCGGCCAGGTATTTGACCAGCGTGCGAC‑GATCGTCGTCGCTGATCTGAAGGCCATGCATCACCTGCATGCGGGCGATGCTCAT‑‑cagccagc < 4:54284/149‑1 (MQ=255) aTGGCGTAGCGCACGCCATCGGTTTCGCTGGGCGCCAGGCCCTGTTTGTCGGCCAGGTATTTGACCAGCGTGCGAC‑GATCGTCGTCGCTGATCTGAAGGCCATGCATCACCTGCATGCGGGCGATGCTCAT‑‑CAGCCAGCCTTCCGgtgt > 5:119753/1‑149 (MQ=255) gCGTAGCGCACGCCATCGGTTTCGCTGGGCGCCAGGCCCTGTTTGTCGGCCAGGTATTTGACCAGCGTGCGAC‑GATCGTCGTCGCTGATCTGAAGGCCATGCATCACCTGCATGCGGGCGATGCTCAT‑‑CAGCCAGCCTTCCGGTGTCtt < 1:304971/149‑1 (MQ=255) gTAGCGCACGCCATCGGTTTCGCTGGGCGCCAGGCCCTGTTTGTCGGCCAGGTATTTGACCAGCGTGCGAC‑GATCGTCGTCGCTGATCTGAAGGCCATGCATCACCTGCATGCGGGCGATGCTCAT‑‑CAGCCAGCCTTCCGGTGTCTTgc > 8:19521/1‑149 (MQ=255) gcgcACGCCATCGGTTTCGCTGGGCGCCAGGCCCTGTTTGTCGGCCAGGTATTTGACCAGCGTGCGAC‑GATCGTCGTCGCTGATCTGAAGGCCATGCATCACCTGCATGCGGGCGATGCTCAT‑‑CAGCCAGCCTTCCGGTGTCTTGCGCt > 1:124464/1‑149 (MQ=255) cATCGGTTTCGCTGGGCGCCAGGCCCTGTTTGTCGGCCAGGTATTTGACCAGCGTGCGAC‑GATCGTCGTCGCTGATCTGAAGGCCATGCATCACCTGCATGCGGGCGATGCTCAT‑‑CCGCCAGCGTTCCGGTGTCTTGCGCTGGtggct < 8:284253‑M2/148‑6 (MQ=255) tCGGTTTCGCTGGGCGCCAGGCCCTGTTTGTCGGCCAGGTATTTGACCAGCGTGTGAC‑GATCGTCGTCGCTGATCTGAAGTCCATGCATCACCTGCATGCGGGCGATGCTCAT‑‑CAGCCAccagcgcaagacaccggaaggctggctgat < 7:65513‑M1/149‑31 (MQ=255) cGGTTTCGCTGGGCGCCAGGCCCTGTTTGTCGGCCAGGTATTTGACCAGCGTGCGAAAGATCGTCGTCGCTGATCTGAAGGCCATGCATCACCTGCATGCGGGCGATGCTCAT‑‑CAGCCAGCCTTCCGGTGTCTTGCGCTGGtggctgat < 1:88349‑M2/149‑9 (MQ=255) tttCGCTGGGCGCCAGGCCCTGTTTGTCGGCCAGGTATTTGACCAGCGTGCGAC‑GATCGTCGTCGCTGATCTGAAGGCCATGCATCACCTGCATGCGGGCGATGCTCAT‑‑CAGCCAGCCTTCCGGTGTCTTGCGCTGGTGGCTGATGCgg < 8:182341/149‑1 (MQ=255) cGCTGGGCGCCAGGCCCTGTTTGTCGGCCAGGTATTTGACCAGCGTGCGAC‑GATCGTCGTCGCTGATCTGAAGGCCATGCATCACCTGCATGCGGGCGATGCTCAT‑‑CAGCCAGCCTTCCGGTGTCTTGCGCTGGTGGCTGATGCGGCt < 7:230126/148‑1 (MQ=255) gCTGGGCGCCAGGCCCTGTTTGTCGGCCAGGTATTTGACCAGCGTGCGAC‑GATCGTCGTCGCTGATCTGAAGGCCATGCATCACCTGCATGCGGGCGATGCTCAT‑‑CAGCCAGCCTTCCGGTGTCTTGCGCTGGtggctg < 5:265124‑M2/139‑7 (MQ=255) gCTGGGCGCCAGGCCCTGTTTGTCGGCCAGGTATTTGACCAGCGTGCGAC‑GATCGTCGTCGCTGATCTGAAGGCCATGCATCACCTGCATGCGGGCGATGCTCAT‑‑CAGCCAGCCTTCCGGTGTCTTGCGCTGGtggctg > 6:265124‑M2/1‑133 (MQ=255) cTGGGCGCCAGGCCCTGTTTGTCGGCCAGGTATTTGACCAGCGTGCGAC‑GATCGTCGTCGCTGATCTGAAGGCCATGCATCACCTGCATGCGGGCGATGCTCAT‑‑CAGCCAGCCTTCCGGTGTCTTGCGCTGGTGGCTGATGCGGCtata < 5:131052/149‑1 (MQ=255) tGGGCGCCAGGCCCTGTTTCTCGGCCAGGTATTTGACCAGCGTGCGAC‑GATCGTCGTCGCTGATCTGAAGGCCATGCATCACCTGCATGCGGGCGATGCTCAT‑‑CAGCCAGCATTCCGGTGTCTTGCGCTGGTGGCTGATGCGGCTATAg > 4:171244/1‑149 (MQ=255) gcgcCAGGCCCTGTTTGTCGGCCAGGTATTTGACCAGCGTGCGAC‑GATCGTCGTCGCTGATCTGAAGGCCATGCATCACCTGCATGCGGGCGATGCTCAT‑‑CAGCCAGCCTTCCGGTGTCTTGCGCTGGTGGCTGATGCGGCTATAGgtg < 1:222570/149‑1 (MQ=255) gcgcCAGGCCCTGTTTGTCGGCCAGGTATTTGACCAGCGTGCGAC‑GATCGTCGTCGCTGATCTGAAGGCCATGCATCACCTGCATGCGGGCGATGCTCAT‑‑CAGCCAGCCTTCCGGTGTCTTGCGCTGGTGGCTGATGCGGCTATAGgtg < 2:88349/149‑1 (MQ=255) cAGGCCCTGTTTGTCGGCCAGGTATTTGACCAGCGTGCGAC‑GATCGTCGTCGCTGATCTGAAGGCCATGCATCACCTGCATGCGGGCGATGCTCAT‑‑CAGCCAccagcgcaagacaccggaaggctggctgatga < 2:18422‑M1/134‑33 (MQ=255) cAGGCCCTGTTTGTCGGCCAGGTATTTGACCAGCGTGCGAC‑GATCGTCGTCGCTGATCTGAAGGCCATGCATCACCTGCATGCGGGCGATGCTCAT‑‑CAGCCAccagcgcaagacaccggaaggctggctgatga > 1:18422‑M1/1‑102 (MQ=255) tttGTCGGCCAGGTATTTGACCAGCGTGCGAC‑GATCGTCGTCGCTGATCTGAAGGCCATGCATCACCTGCATGCGGGCGATGCTCAT‑‑CAGCCAGCCTTCCGGTGTCTTGCGCTGGTGGCTGATGCGGCTATAGGTGTCGTTGCCTTCg < 5:36253/148‑1 (MQ=255) cAGGTATTTGAACAGCGTGCGAC‑GATGGTCGTCGCTGATCTGAAGGCCATGCATCACCTGGATGCGGGCGATGCTCAT‑‑CAGCCAGCCTTCCGGTGTCTTGCGCTGGTGGCTGATGCGGCTATAGGTGTGGTTGCCTTCGGGGATATGGc < 1:323649/149‑1 (MQ=255) gTATTTGACCAGCGTGCGAC‑GATCGTCGTCGCTGATCTGAAGGCCATGCATCACCTGCATGCGGGCGATGCTCAT‑‑CAGCCAGCCTTCCGGTGTCTTGCGCTGGTGGCTGATGCGGCTATAGGTGTCGTTGCCTTCGGGGATATGGCa < 2:179191/147‑1 (MQ=255) gTATTTGACCAGCGTGCGAC‑GATCGTCGTCGCTGATCTGAAGGCCATGCATCACCTGCATGCGGGCGATGCTCAT‑‑CAGCCAGCCTTCCGGTGTCTTGCGCTGGTGGCTGATGCGGCTATAGGTGTCGTTGCCTTCGGGGATATGGCa > 1:179191/1‑147 (MQ=255) tttGACCAGCGTGCGAC‑GATCGTCGTCGCTGATCTGAAGGCCATGCATCACCTGCATGCGGGCGATGCTCAT‑‑CAGCCAGCCTTCCGGTGTCTTGCGCTGGTGGCTGATGCGGCTATAGGTGTCGTTGCCTTCGGGGATATGGCAcccc < 2:124464/148‑1 (MQ=255) tttGACCAGCGTGCGAC‑GATCGTCGTCGCTGATCTGAAGGCCATGCATCACCTGCATGCGGGCGATGCTCAT‑‑CAGCCAGCCTTCCGGTGTCTTGCGCTGGTGGCTGATGCGGCTATAGGTGTCGTTGCCTTCGGGGATATGGCACCCCa > 2:7816/1‑149 (MQ=255) cAGCGTGCGAC‑GATCGTCGTCGCTGATCTGAAGGCCATGCATCACCTGCATGCGGGCGATGCTCATAGCACCCCCCATACGGGTGTTTTGCGGGGTTGGATGAGGCGGATATAGGTGACTTTGCATGGGGGGATATGGCCCCCCATGCa > 1:96135/1‑149 (MQ=255) cAGCGTGCGAC‑GATCGTCGTCGCTGATCTGAAGGCCATGCATCACCTGCATGCGGGCGATGCTCAT‑‑CAGCCAGCCTTCCGGTGTCTTGCGCTGGTGGCTGATGCGGCTATAGGTGTCGTTGCCTTCGGGGATATGGCACCCCATGCACt > 7:60372/1‑149 (MQ=255) gac‑gaTCGTCGTCGCTGATCTGAAGGCCATGCATCACCTGCATGCGGGCGATGCTCAT‑‑CAGCCAGCCTTCCGGTGTCTTGCGCTGGTGGCTGATGCGGCTATAGGTGTCGTTGCCTTCGGGGATATGGCACCCCATGCACTTGTTCTg > 1:43976/1‑148 (MQ=255) gac‑gaTCGTCGTCGCTGATCTGAAGGCCATGCATCACCTGCATGCGGGCGATGCTCAT‑‑CAGCCAGCCTTCCGGTGTCTTGCGCTGGTGGCTGATGCGGCTATAGGTGTCGTTGCCTTCGGGGATATGGCACCCCATGCACTTGTTCTg > 5:309135/1‑148 (MQ=255) c‑gaTCGTCGTCGCTGATCTGAAGGCCATGCATCACCTGCATGCGGGCGATGCTCAT‑‑CAGCCAGCCTTCCGGTGTCTTGCGCTGGTGGCTGATGCGGCTATAGGTGTCGTTGCCTTCGGGGATATGGCACCCCATGCACTTGTTCTGCaa > 1:86394/1‑149 (MQ=255) aTCGTCGTCGCTGATCTGAAGGCCATGCATCACCTGCATGCGGGCGATGCTCAT‑‑CAGCCAGCCTTCCGGTGTCTTGCGCTGGTGGCTGATGCGGCTATAGGTGTCGTTGCCTTCGGGGATATGGCACCCCATGCACTTGTTc < 6:243258/142‑1 (MQ=255) aTCGTCGTCGCTGATCTGAAGGCCATGCATCACCTGCATGCGGGCGATGCTCAT‑‑CAGCCAGCCTTCCGGTGTCTTGCGCTGGTGGCTGATGCGGCTATAGGTGTCGTTGCCTTCGGGGATATGGCACCCCATGCACTTGTTc > 5:243258/1‑142 (MQ=255) aTCGTCGTCGCTGATCTGAAGGCCATGCATCACCTGCATGCGGGCGATGCTCAT‑‑CAGCCAGCCTTCCGGTGTCTTGCGCTGGTGGCTGATGCGGCTATAGGTGTCGTTGCCTTCGGGGATATGGCACCCCATGCACTTGTTCTGCaa > 7:305041/1‑147 (MQ=255) aTCGTCGTCGCTGATCTGAAGGCCATGCATCACCTGCATGCGGGCGATGCTCAT‑‑CAGCCAGCCTTCCGGTGTCTTGCGCTGGTGGCTGATGCGGCTATAGGTGTCGTTGCCTTCGGGGATATGGCACCCCATGCACTTGTTCTGCAACa < 1:7816/149‑1 (MQ=255) aTCGTCGTCGCTGATCTGAAGGCCATGCATCACCTGCATGCGGGCGATGCTCAT‑‑CAGCCAGCCTTCCGGTGTCTTGCGCTGGTGGCTGATGCGGCTATAGGTGTCGTTGCCTTCGGGGATATGGCACCCCATGCACTTGTTCTGCAACa < 2:86394/149‑1 (MQ=255) gtcgCTGATCTGAAGGCCATGCATCACCTGCATGCGGGCGATGCTCAT‑‑CAGCCAGCCTTCCGGTGTCTTGCGCTGGTGGCTGATGCGGCTATAGGTGTCGTTGCCTTCGGGGATATGGCACCCCATGCACTTGTTCTGCAACAGGCTCg < 8:60372/149‑1 (MQ=255) tcgCTGATCTGAAGGCCATGCATCACCTGCATGCGGGCGATGCTCAT‑‑CAGCCAGCCTTCCGGTGTCTTGCGCTGGTGGCTGATGCGGCTATAGGTGTCGTTGCCTTCGGGGATATGGCACCCCATGCACTTGTTCTGCAACAGGCTCgg < 6:309135/149‑1 (MQ=255) cTGATCTGAAGGCCATGCATCACCTGCATGCGGGCGATGCTCAT‑‑CAGCCAGCCTTCCGGTGTCTTGCGCTGGTGGCTGATGCGGCTATAGGTGTCGTTGCCTTCGGGGatat < 7:184167/112‑1 (MQ=255) cTGATCTGAAGGCCATGCATCACCTGCATGCGGGCGATGCTCAT‑‑CAGCCAGCCTTCCGGTGTCTTGCGCTGGTGGCTGATGCGGCTATAGGTGTCGTTGCCTTCGGGGatat > 8:184167/1‑112 (MQ=255) cTGATCTGAAGGCCATGCATCACCTGCATGCGGGCGATGCTCAT‑‑CAGCCAGCCTTCCGGTGTCTTGCGCTGGTGGCTGATGCGGCTATAGGTGTCGTTGCCTTCGGGGATATGGCACCCCATGCACTTGTTCTGCAACAGGCTCGGGcc < 8:305041/149‑1 (MQ=255) aaGGCCATGCATCACCTGCATGCGGGCGATGCTCAT‑‑CAGCCAGCCTTCCGGTGTCTTGCGCTGGTGGCTGATGCGGCTATAGGTGTCGTTGCCTTCGGGGATATGGCACCCCATGCACTTGTTCTGCAACAGGCTCGGGCCCTGc < 2:96135/145‑1 (MQ=255) cATGCATCACCTGCATGCGGGCGATGCTCAT‑‑CAGCCAGCCTTCCGGTGTCTTGCGCTGGTGGCTGATGCGGCTATAGGTGTCGTTGCCTTCGGGGATATGGCACCCCATGCACTTGTTCTGCAACAGGCTCGGGCCCTGCTCGgccgc > 5:32957/1‑148 (MQ=255) tGCATCACCTGCATGCGGGCGATGCTCAT‑‑CAGCCAGCCTTCCGGTGTCTTGCGCTGGTGGCTGATGCGGCTATAGGTGTCGTTGCCTTCGGGGATATGGCACCCCATGCACTTGTTCTGCAACAGGCTCGGGCCCTGCTCGGCCGCCAt < 3:171244/149‑1 (MQ=255) ccTGCATGCGGGCGATGCTCAT‑‑CAGCCAGCCTTCCGGTGTCTTGCGCTGGTGGCTGATGCGGCTATAGGTGTCGTTGCCTTCGGGGATATGGCACCCCATGCACTTGTTCTGCAACAGGCTCGGGCGCTGCTCGGCCGCCATGGCCTgg < 6:119753/149‑1 (MQ=255) ccTGCAGGCGGGCGCCGCTCAG‑‑CAGCCCGCCTTCCGGGGTCGTGCGCTGGTGGCTGATGCGGCTATAGGTGTCGTTGCCTTCGGGGATATGGCACCCCATGCACTTGTTCTGCAACAGGCTCGGGCCCTGCTCGGCCGCCATGGCCTgg < 6:231222/149‑1 (MQ=255) tGCTCAT‑‑CAGCCAGCCTTCCGGTGTCTTGCGCTGGTGGCTGATGCGGCTATAGGTGTCGTTGCCTTCGGGGATATGGCACCCCATGCACTTGTTCTGCAACAGGCTCGGGCCCTGCTCGGCCGCCATGGCCTGGGTGCTCAGCAGcgcg < 3:147348/149‑1 (MQ=255) tcat‑‑caGCCAGCCTTCCGGTGTCTTGCGCTGGtggctgatgagcatcgcccgcatgcaggtgatgcatggccttcagatcagcgacgacgatcgtcgcacgctggtcaaatacctggccgacaaacagggcctg < 2:18422‑M2/134‑103 (MQ=255) tcat‑‑caGCCAGCCTTCCGGTGTCTTGCGCTGGtggctgatgagcatcgcccgcatgcaggtgatgcatggccttcagatcagcgacgacgatcgtcgcacgctggtcaaatacctggccgacaaacagggcctg > 1:18422‑M2/1‑32 (MQ=255) at‑‑caGCCAccagcgcaagacaccggaaggctggctgatgagcatcgcccgcatgcaggtgatgcatggccttcagatcagcgacgacgatctttcgcacgctggtcaaatacctggccgacaaacagggcctggcgcccagcgaaaccg < 1:88349‑M1/149‑142 (MQ=255) at‑‑caGCCAGCCTTCCGGTGTCTTGCGCTGGtggctgatgagcatcgcccgcatgcaggtgatgcatggacttcagatcagcgacgacgatcgtcacacgctggtcaaatacctggccgacaaacagggcctggcgcccagcgaaaccga < 7:65513‑M2/149‑120 (MQ=255) t‑‑caGCCAGCCTTCCGGTGTCTTGCGCTGGTGGCTGATGCGGCTATAGGTGTCGTTGCCTTCGGTGATATGGCACCCCATGCACTTGTTCTGCAACAGGCGCGGGCCCTGCTCGGCCGCCATGGCCTGGGTGCTCAGCAGCgcggcggcg < 7:83977/149‑1 (MQ=255) t‑‑caGCCAGCCTTCCGGGTTCTTGCTCTGGTGGCTGATGCGGCTATAGGTGTCGTTGCCTTCGGGGATATGGCACCCCATGCACTTGTTCTGCAACAGGCTCGGGCCCTGCTCGGCCGCCATGGCCTGGGTGCTCAGCAGCgcggcggcg < 7:88380/149‑1 (MQ=255) caGCCAccagcgcaagacaccggaaggctggctgatgagcatcgcccgcatgcaggtgatgcatggccttcagatcagcgacgacgatcgtcgcacgctggtcaaatacctggccgacaaacagggcctggcgcccagc < 5:265124‑M1/139‑134 (MQ=255) caGCCAccagcgcaagacaccggaaggctggctgatgagcatcgcccgcatgcaggtgatgcatggccttcagatcagcgacgacgatcgtcgcacgctggtcaaatacctggccgacaaacagggcctggcgcccagc > 6:265124‑M1/1‑6 (MQ=255) aGCCAccagcgcaagacaccggaacgctggcggatgagcatcgcccgcatgcaggtgatgcatggccttcagatcagcgacgacgatcgtcgcacgctggtcaaatacctggccgacaaacagggcctggcgcccagcgaaaccgatg < 8:284253‑M1/148‑144 (MQ=255) | AGCCGACGCTCCATGGCGTAGCGCACGCCATCGGTTTCGCTGGGCGCCAGGCCCTGTTTGTCGGCCAGGTATTTGACCAGCGTGCGAC‑GATCGTCGTCGCTGATCTGAAGGCCATGCATCACCTGCATGCGGGCGATGCTCAT‑‑CAGCCAGCCTTCCGGTGTCTTGCGCTGGTGGCTGATGCGGCTATAGGTGTCGTTGCCTTCGGGGATATGGCACCCCATGCACTTGTTCTGCAACAGGCTCGGGCCCTGCTCGGCCGCCATGGCCTGGGTGCTCAGCAGCGCGGCGGCGA > NC_002947/3926090‑3926381 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |