| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 4702830 | 34 (0.680) | 4 (0.080) | 4/252 | NT | 10.5% | coding (630/2055 nt) | kdpB | K+ transporting ATPase subunit KdpB |
| ? | NC_002947 | = 4702864 | 35 (0.710) | coding (596/2055 nt) | kdpB | K+ transporting ATPase subunit KdpB | |||||
AAGATCAGCGGCAGGCTGCCACCCGCGAAGTGGGCGAACGGCTGCAAGGTCACCACCACGATCAGGAAAATCAGGGTCAGGCCGATCAGCAGGATGTCGAGGGCGATTTCGTTTGGGGTCTTCTGCCGCTTGGCACCTTCGACCAGGGCGATCATGCGGTCCAGGGTCGACTCGCCCGGGTTGCTGGTGATGCGGATAAGCAGCCAGTCGGAGACCAGCCGCGTATTGCCGGTCACCGCCGAGCGGTCGCCACCTGATTCGCGTATTACCGGTGCGGATTCGCCGGTAAT > NC_002947/4702687‑4702976 | tctaTCAGCGGCAGGCTGCCTCCCGAGAAGTTGGCGAACGGCTGCAAGTTCAACAACACGATCAGTAAAATCAGGTTCAGGCCGATCAGCAGGATGTCTAGGGCGATTTCGTTTGGGGTCTTCTGCCGCTTGGCACCTTCGAACAggg < 8:254911/145‑1 (MQ=255) tCAGCGGCAGGCTGCCACCCGCGAAGTGGGCGAATGGCTGCAAGGTCACCACCACGATCAGGAAAATCAGGGTCAGGCCGATCAGCAGGATGTCGAGGGCGATTTCGTTTGGGGTCTTCTGCCGCTTGGCACCTTCGACCAGGGCGAt > 4:148733/1‑148 (MQ=255) tCAGCGGCAGGCTGCCACCCGCGAAGTGGGCGAACGGCTGCAAGGTCACCACCACGATCAGGAAAATCAGGGTCAGGCCGATCAGCAGGATGTCGAGGCCGATTTCGTTTGGGGTCTTCTGCCGCTTGGCACCTTCGACCAggg > 7:254911/1‑144 (MQ=255) gCCACCCGCGAAGTGGGCGAACGGCTGCAAGGTCACCACCACGATCAGGAAAATCAGGGTCAGGCCGATCAGCAGGATGTCGAGGGCGATTTCGTTTGGGGTCTTCTGCCGCTTGGCACCTTCGACCAGGGCGATCATGCGGTCCAggg > 8:224100/1‑149 (MQ=255) ccACCCGCGAAGTGGGCGAACGGCTGCAAGGTCACCACCACGATCAGGAAAATCAGGGTCAGGCCGATCAGCAGGATGTCGAGGGCGATTTCGTTTGGGGTCTTCTGCCGCTTGGCACCTTCGACCAGGGCGATCATGCGGTCCAGGGt < 5:242535/149‑1 (MQ=255) aCCCGCGAAGTGGGCGAACGGCTGCAAGGTCACCACCACGATCAGGAAAATCAGGGTCAGGCCGATCAGCAGGATGTCGAGGGCGATTTCGTTTGGGGTCTTCTGCCGCTTGGCACCTTCGACCAGGGCGATCATGCGGTCCAGGGTc > 3:170362/1‑148 (MQ=255) gAAGTGGGCGAACGGCTGCAAGGTCACCACCACGATCAGGAAAATCAGGGTCAGGCCGATCAGCAGGATGTCGAGGGCGATTTCGTTTGGGGTCTTCTGCCGCTTGGCACCTTCGACCAGGGCGATCATGCGGTCCAGGGTCGACTCGc < 2:81852/149‑1 (MQ=255) gggCGAACGGCTTGAATGTCACCACCTCGATCAGGAAAATGAGGTTCAGGCCGATCAGCAGGATGTCGAGGGCTATTTCGTTTGGGTGCTTCTGCCGCTTGGCACCTTCGACGATGGCGATCATGCGGTCCTGGGTCGACTCGCCCggg < 4:2685/149‑1 (MQ=255) ttcgaACGGCTGCAAGGTCACCACCACGATCATGAATATCAGGGTCAGGCCGATCAGCAGGATGTCGAGGGCTTTTTCGTTTGGGGTCTTCTGCCGCTTGGCACTTTCGACCAGGGCGATCATGCGGTCCATGGTCGACTCGCCCGgg > 1:63269‑M2/3‑146 (MQ=255) ggCGAACGGCTGCAAGGTCACCACCACGATCAGGAAAATCAGGGTCAGGCCGATCAGCAGGATGTCGAGGGCGATTTCGTTTGGGGTCTTCTGCCGCTTGGCACCTTCGACCAGGGCGATCATGCGGTCCAGGGTCGACTCGCCCGggt < 7:17974‑M2/149‑4 (MQ=255) cGAACGGCTGCAAGGTCACCACCACGATCAGGAAAATCAGGGTCAGGCCGATCAGCAGGATGTCGAGCGCGATTTCGTTTGGGGTCTTCTGCCGCTTGGCACCTACGACCAGGGCTATCATGAGGTCCAGGGTCGACTCGCCCGgg < 2:63269‑M2/146‑3 (MQ=255) cggcggCAAGGTCACCACCACGATCAGGAAAATCAGGGTCAGGCCGATCAGCAGGATGTCGAGGGCGATTTCGTTTGGGGTCTTCTGCCGCTTGGCACCTTCGACCAGGGCGATCATGCGGTCCAGGGTCGACTCGCCCGGGTTGCTgg < 3:97578/149‑1 (MQ=255) cGGCTGCAAGGTCACCACCACGATCAGGAAAATCAGGGTCAGGCCGATCAGCAGGATGTCGAGGGCGATTTCGTTTGGGGTCTTCTGCCGCTTGGCACCTTCGACCAGGGCGATCATGCGGTCCAGGGTCGACTCGCCCGGGTTGCTgg < 8:17974/149‑1 (MQ=255) cAAGGTCACCACCACGATCAGGAAAATCAGGGTCAGGCCGATCAGCAGGATGTCGAGGGCGATTTCGTTTGTGGTCTTCTGCCGCTTGGCACCTTCGACCAGGGCGATCATGCGGTCCAGGGTCGACTCGCCCGGGTTGCTGGTGAt < 4:170362/147‑1 (MQ=255) caccaccacGATCAGGAAAATCAGGGTCAGGCCGATCAGCAGGATGTCGAGGGCGATTTCGTTTGGGGTCTTCTGCCGCTTGGCACCTTCGACCAGGGCGATCATGCGGTCCAGGGTCGACTCGCCCGGGTTGCTGGTGATGCGGAt > 5:167843/1‑147 (MQ=255) caccacGATCAGGAAAATCAGGGTCAGGCCGATCAGCAGGATGTCGAGGGCGATTTCGTTTGGGGTCTTCTGCCGCTTGGCACCTTCGACCAGGGCGATCATGCGGTCCAGGGTCGACTCGCCCGGGTTGCTGGTGATGCGGATAagca < 7:224100/149‑1 (MQ=255) caccacGATCAGGAAAATCAGGGTCAGGCCGATCAGCAGGATGTCGAGGGCGATTTCGTTTGGGGTCTTCTGCCGCTTGGCACCTTCGACCAGGGCGATCATGCGGTCCAGGGTCGACTCGCCCGGGTTGCTGGTGATGCGGATAag > 6:120977/1‑147 (MQ=255) gcAGGAAAATCAGGGTCAGGCGGATCAGCAGGATGGCGAGGGCGATTTCGTTTGGGGTGTTCTGCGGCTTGGCACCTTCGGCCAGGGCGCTCATGCGGTCCAGGGTCGACTCGCCCGGGTTGCTGGTGATGCGGAGAAGCGGCCGGTCg > 6:310617/2‑149 (MQ=255) ggAAAATCAGGGTCAGGCCGATCAGCAGGATGTCGAGGGCGATTTCGTTTGGGGTCTTCTGCCGCTTGGCACCTTCGACCcgggcgagtcgaccctggaccgcatgatcgccctggtc < 1:21395‑M1/118‑39 (MQ=255) ggAAAATCAGGGTCAGGCCGATCAGCAGGATGTCGAGGGCGATTTCGTTTGGGGTCTTCTGCCGCTTGGCACCTTCGACCcgggcgagtcgaccctggaccgcatgatcgccctggtc > 2:21395‑M1/1‑80 (MQ=255) ggAAAATCAGGGTCAGGCCGATCAGCAGGATGTCGAGGGCGATTTCGTTTGGGGTCTTCTGCCGCTTGGCACCTTCGACCAGGGCGATCATGCGGTCCAGGGTCGACTCGCCCGGGTTGCTGGTGATGCg < 6:95356/130‑1 (MQ=255) ggAAAATCAGGGTCAGGCCGATCAGCAGGATGTCGAGGGCGATTTCGTTTGGGGTCTTCTGCCGCTTGGCACCTTCGACCAGGGCGATCATGCGGTCCAGGGTCGACTCGCCCGGGTTGCTGGTGATGCg > 5:95356/1‑130 (MQ=255) gAAAATCAGGGTCAGGCCGATCAGCAGGATGTCGAGGGCGATTTCGTTTGGGGTCTTCTGCCGCTTGGCACCTTCGACCAGGGCGATCATGCgg < 8:253843/94‑1 (MQ=255) aTCAGGGTCAGGCCGATCAGCAGGATGTCGAGGGCGATTTCGTTTGGGGTCTTCTGCCGCTTGGCACCTTCGACCcgggcgagtcgaccctggaccgcatgatcgccctggt > 7:71785‑M1/1‑75 (MQ=255) aTCAGGGTCAGGCCGATCAGCAGGATGTCGAGGGCGATTTCGTTTGGGGTCTTCTGCCGCTTGGCACCTTCGACCcgggcgagtcgaccctggaccgcatgatcgccctggt < 8:71785‑M1/112‑38 (MQ=255) tCAGGGTCAGGCCGATCAGCAGGATGTCGAGGGCGATTTCGTTTGGGGTCTTCTGCCGCTTGGCACCTTCGACCAGGGCGATCATGCGGTCCAGGGTCGACTCGCCCGGGTTGCTGGTGATGCGGATAAGCAGCCAGTCGGAGACCAGc < 6:167843/149‑1 (MQ=255) gggTCAGGCCGATCAGCAGGATGTCGAGGGCGATTTCGTTTGGGGTCTTCTGCCGCTTGGCACCTTCGACCAGGGCGATCATGCGGTCCAGGGTCGACTCGCCCGGGTTGCTGGTGATGCGGATAAGCAGCCAGTCGGAGACCAGCcgc > 6:98813/1‑149 (MQ=255) ggTCAGGCCGATCAGCAGGATGTCGAGGGCGATTTCGTTTGGGGTCTTCTGCCGCTTGGCACCTTCGACCAGGGCGATCATGCGGTCCAGGGTCGACTCGCCCGGGTTGCTGGTGATGCGGATAAGCAGCCAGTCGGAGACCAGCcgcg > 4:160129/1‑149 (MQ=255) ggCCGATCAGCAGGATGTCGAGGGCGATTTCGTTTGGGGTCTTCTGCCGCTTGGCACCTTCGACCAGGGCGATCATGCGGTCCAGGGTCGACTCGCCCGGGTTGCTGGTGATGCGGATAAGCAGCCAGTCGGAGACCAGCCGCGTATTg > 6:149029/1‑149 (MQ=255) agcagGATGTCGAGGGCGATTTCGTTTGGGGTCTTCTGCCGCTTGGCACCTTCGGCCAGGGCGATCATGCGGTCCAGGGTCGACTCGCCCGGGTTGCTGGTGATGCGGATAAGCAGCCAGTCGGAGACCAGCCGCGTATTGCCGGTCa < 5:310617/148‑1 (MQ=255) agcagGATGTCGAGGGCGATTTCGTTTGGGGTCTTCTGCCGCTTGGCACCTTCGACCAGGGCGATCATGCGGTCCAGGGGCGACTCGCCCGGGTTGCTGGTGATGCGGATAAGCAGCCAGTCGGAGACCAGCCGCGTATTGCCGGTCa < 3:148733/148‑1 (MQ=255) ggATGTCGAGGGCGATTTCGTTTGGGGTCTTCTGCCGCTTGGCACCTTCGACCAGGGCGATCATGCGGTCCAGGGTc > 7:171974/1‑77 (MQ=255) ggATGTCGAGGGCGATTTCGTTTGGGGTCTTCTGCCGCTTGGCACCTTCGACCAGGGCGATCATGCGGTCCAGGGTc < 8:171974/77‑1 (MQ=255) tCGAGGGCGATTTCGTTTGGGGTCTTCTGCCGCTTGGCACCTTCGACCAGGGCGATCATGCGGTCCAGGGTCGACTCGCCCGGGTTGCTGGTGATGCGGATAAGCAGCCAGTCGGAGACCAGCCGCGTATTGCCGGTCACCGCCGAGCg < 5:120977/149‑1 (MQ=255) cGATTTCGTTTGGGGTCTTCTGCCGCTTGGCACCTTCGACCAGGGCGATCATGCGGTCCAGGGTCGACTCGCCCGGGTTGCTGGTGATGCGGATAAGCAGCCAGTCGGAGACCAGCCGCGTATTGCCGGTCACCGCCGAGCGGTCGCCa > 1:317873/1‑149 (MQ=255) ttctGCCGCTTGGCACCTTCGACCAGGGCGATCATGCGGTCCAGGGTCGACTCGCCCGGGTTGCTGGTGATGCGGATAAGCAGCCAGTCGGAGACCAGCCGCGTATTGCCGGTCACCGCCGAGCGGTCGCCACCTGATTCGCGTATTAc > 1:65433/1‑149 (MQ=255) ttctGCCGCTTGGCACCTTCGACCAGGGCGATCATGCGGTCCAGGGTCGACTCGCCCGGGTTGCTGGTGATGCGGATAAGCAGCCAGTCGGAGACCAGCCGCGTATTGCCGGTCACCGCCGAGCGGTCGCCACCTGATTCGCGTATTAc > 5:101422/1‑149 (MQ=255) ctGCCGCTTGGCACCTTCGACCAGGGCGATCATGCGGTCCAGGGTCGACTCGCCCGGGTTGCTGGTTATGCGGATAAGCAGCCAGTCGGAGACCAGCCGCGTATTGCCGGTCACCGCCGAGCGGTCGCCACCTGATTCGCGTATTAc < 5:98813/147‑1 (MQ=255) gCCGCTTGGCACCTTCGACCAGGGCGATCATGCGGTCCAGGGTCGACTCGCCCGGGTTGCTGGTGATGCGGATAAGCAGCCAGTCGGAGACCAGCCGCGTATTGCCGGTCAccg > 2:221465/1‑114 (MQ=255) gCCGCTTGGCACCTTCGACCAGGGCGATCATGCGGTCCAGGGTCGACTCGCCCGGGTTGCTGGTGATGCGGATAAGCAGCCAGTCGGAGACCAGCCGCGTATTGCCGGTCAccg < 1:221465/114‑1 (MQ=255) gCCGCTTGGCACCTTCGACCAGGGCGATCATGCGGTCCAGGGTCGACTCGCCCGGGTTGCTGGTGATGCGGATAAGCAGCCAGTCGGAGACCAGCCGCGTATTGCCGGTCACCGCCGAGCGGTCGCCACCTGATTCGCGTATTACCGGt > 3:151352/1‑149 (MQ=255) ccGCTTGGCACCTTCGACCAGGGCGATCATGCGGTCCAGGGTCGACTCGCCCGGGTTGCTGGTGATGCGGATAAGCAGCCAGTCGGAGACCAGCCGCGTATTGCCGGTCACCGCCGAGCGGTCGCCACCTGATTCGCGTATTACCg < 3:160129/146‑1 (MQ=255) cACCTTCGACCAGGGCGATCATGCGGTCCAGGGTCGACTCGCCCGGGTTGCTGGTGATGCGGATAAGCAGCCAGTCGGAGACCAGCCGCGTATTGCCGGTCACCGCCGAGCGGTCGCCACCTGATTCGCGTATTACCGGTGCGGATTCg > 6:82808/1‑149 (MQ=255) cGACCAGGGCGATCATGCGGTCCAGGGTCGACTCGCCCGGGTTGCTGGTGATGCGGATAAGCAGCCAGTCGGAGACCAGCCGCGTATTGCCGGTCACCGCCGAGCGGTCGCCAc > 3:81037/1‑114 (MQ=255) gACCAGGGCGATCATGCGGTCCAGGGTCGACTCGCCCGggtcgaaggtgccaagcggcagaagaccccaaacgaaatcgccctcgacatcctgctgatcggcctgaccctgattttcc < 1:21395‑M2/118‑81 (MQ=255) gACCAGGGCGATCATGCGGTCCAGGGTCGACTCGCCCGggtcgaaggtgccaagcggcagaagaccccaaacgaaatcgccctcgacatcctgctgatcggcctgaccctgattttcc > 2:21395‑M2/1‑38 (MQ=255) aCCcgggcgagtcgaccctggaccgcatgatcgccctggtcgaaggtgccaagcggcagaagaccccaaacgaaatcgccctcgacatcctgctgatcggcctgaccctgattttcctgatcgtggtggtgaccttgcagccgttcgcc < 7:17974‑M1/149‑147 (MQ=255) aCCAGGGCGATCATGCGGTCCAGGGTCGACTCGCCCGggtcgaaggtgccaagcggcagaagaccccaaacgaaatcgccctcgacatcctgctgatcggcctgaccctgat > 7:71785‑M2/1‑37 (MQ=255) aCCAGGGCGATCATGCGGTCCAGGGTCGACTCGCCCGggtcgaaggtgccaagcggcagaagaccccaaacgaaatcgccctcgacatcctgctgatcggcctgaccctgat < 8:71785‑M2/112‑76 (MQ=255) cccgggcgagtcgaccctggacctcatgatagccctggtcgtaggtgccaagcggcagaagaccccaaacgaaatcgcgctcgacatcctgctgatcggcctgaccctgattttcctgatcgtggtggtgaccttgcagccgttcg < 2:63269‑M1/146‑145 (MQ=255) cccgggcgagtcgaccatggaccgcatgatcgccctggtcgaaagtgccaagcggcagaagaccccaaacgaaaaagccctcgacatcctgctgatcggcctgaccctgatattcatgatcgtggtggtgaccttgcagccgttcgaa > 1:63269‑M1/1‑2 (MQ=255) cAGGGCGATCATGCGGTCCAGGGTCGACTCGCCCGGGTTGCTGGTGATGCGGATAAGCAGcc < 6:66149/62‑1 (MQ=255) cAGGGCGATCATGCGGTCCAGGGTCGACTCGCCCGGGTTGCTGGTGATGCGGATAAGCAGcc > 5:66149/1‑62 (MQ=255) | AAGATCAGCGGCAGGCTGCCACCCGCGAAGTGGGCGAACGGCTGCAAGGTCACCACCACGATCAGGAAAATCAGGGTCAGGCCGATCAGCAGGATGTCGAGGGCGATTTCGTTTGGGGTCTTCTGCCGCTTGGCACCTTCGACCAGGGCGATCATGCGGTCCAGGGTCGACTCGCCCGGGTTGCTGGTGATGCGGATAAGCAGCCAGTCGGAGACCAGCCGCGTATTGCCGGTCACCGCCGAGCGGTCGCCACCTGATTCGCGTATTACCGGTGCGGATTCGCCGGTAAT > NC_002947/4702687‑4702976 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |