New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4702830 | 34 (0.680) | 4 (0.080) | 4/252 | NT | 10.5% | coding (630/2055 nt) | kdpB | K+ transporting ATPase subunit KdpB |
? | NC_002947 | = 4702864 | 35 (0.710) | coding (596/2055 nt) | kdpB | K+ transporting ATPase subunit KdpB |
GGGCGAACGGCTGCAAGGTCACCACCACGATCAGGAAAATCAGGGTCAGGCCGATCAGCAGGATGTCGAGGGCGATTTCGTTTGGGGTCTTCTGCCGCTTGGCACCTTCGACCAGGGCGATCATGCGGTCCAGGGTCGACTCGCCCGGGTTGCTGGTGATGCGGATAAGCAGCCAGTCGGAGACCAGCCGCGTATTGCCGGTCACCGCCGAGCGGTCGCCACCTGATTCGCGTATTACCGGTGCGGATTCGCCGGTAATGGCGGCCTCGTTGACGGCCGCAATGCCTT > NC_002947/4702718‑4703005 | gggCGAACGGCTTGAATGTCACCACCTCGATCAGGAAAATGAGGTTCAGGCCGATCAGCAGGATGTCGAGGGCTATTTCGTTTGGGTGCTTCTGCCGCTTGGCACCTTCGACGATGGCGATCATGCGGTCCTGGGTCGACTCGCCCggg < 4:2685/149‑1 (MQ=255) ttcgaACGGCTGCAAGGTCACCACCACGATCATGAATATCAGGGTCAGGCCGATCAGCAGGATGTCGAGGGCTTTTTCGTTTGGGGTCTTCTGCCGCTTGGCACTTTCGACCAGGGCGATCATGCGGTCCATGGTCGACTCGCCCGgg > 1:63269‑M2/3‑146 (MQ=255) ggCGAACGGCTGCAAGGTCACCACCACGATCAGGAAAATCAGGGTCAGGCCGATCAGCAGGATGTCGAGGGCGATTTCGTTTGGGGTCTTCTGCCGCTTGGCACCTTCGACCAGGGCGATCATGCGGTCCAGGGTCGACTCGCCCGggt < 7:17974‑M2/149‑4 (MQ=255) cGAACGGCTGCAAGGTCACCACCACGATCAGGAAAATCAGGGTCAGGCCGATCAGCAGGATGTCGAGCGCGATTTCGTTTGGGGTCTTCTGCCGCTTGGCACCTACGACCAGGGCTATCATGAGGTCCAGGGTCGACTCGCCCGgg < 2:63269‑M2/146‑3 (MQ=255) cggcggCAAGGTCACCACCACGATCAGGAAAATCAGGGTCAGGCCGATCAGCAGGATGTCGAGGGCGATTTCGTTTGGGGTCTTCTGCCGCTTGGCACCTTCGACCAGGGCGATCATGCGGTCCAGGGTCGACTCGCCCGGGTTGCTgg < 3:97578/149‑1 (MQ=255) cGGCTGCAAGGTCACCACCACGATCAGGAAAATCAGGGTCAGGCCGATCAGCAGGATGTCGAGGGCGATTTCGTTTGGGGTCTTCTGCCGCTTGGCACCTTCGACCAGGGCGATCATGCGGTCCAGGGTCGACTCGCCCGGGTTGCTgg < 8:17974/149‑1 (MQ=255) cAAGGTCACCACCACGATCAGGAAAATCAGGGTCAGGCCGATCAGCAGGATGTCGAGGGCGATTTCGTTTGTGGTCTTCTGCCGCTTGGCACCTTCGACCAGGGCGATCATGCGGTCCAGGGTCGACTCGCCCGGGTTGCTGGTGAt < 4:170362/147‑1 (MQ=255) caccaccacGATCAGGAAAATCAGGGTCAGGCCGATCAGCAGGATGTCGAGGGCGATTTCGTTTGGGGTCTTCTGCCGCTTGGCACCTTCGACCAGGGCGATCATGCGGTCCAGGGTCGACTCGCCCGGGTTGCTGGTGATGCGGAt > 5:167843/1‑147 (MQ=255) caccacGATCAGGAAAATCAGGGTCAGGCCGATCAGCAGGATGTCGAGGGCGATTTCGTTTGGGGTCTTCTGCCGCTTGGCACCTTCGACCAGGGCGATCATGCGGTCCAGGGTCGACTCGCCCGGGTTGCTGGTGATGCGGATAagca < 7:224100/149‑1 (MQ=255) caccacGATCAGGAAAATCAGGGTCAGGCCGATCAGCAGGATGTCGAGGGCGATTTCGTTTGGGGTCTTCTGCCGCTTGGCACCTTCGACCAGGGCGATCATGCGGTCCAGGGTCGACTCGCCCGGGTTGCTGGTGATGCGGATAag > 6:120977/1‑147 (MQ=255) gcAGGAAAATCAGGGTCAGGCGGATCAGCAGGATGGCGAGGGCGATTTCGTTTGGGGTGTTCTGCGGCTTGGCACCTTCGGCCAGGGCGCTCATGCGGTCCAGGGTCGACTCGCCCGGGTTGCTGGTGATGCGGAGAAGCGGCCGGTCg > 6:310617/2‑149 (MQ=255) ggAAAATCAGGGTCAGGCCGATCAGCAGGATGTCGAGGGCGATTTCGTTTGGGGTCTTCTGCCGCTTGGCACCTTCGACCAGGGCGATCATGCGGTCCAGGGTCGACTCGCCCGGGTTGCTGGTGATGCg > 5:95356/1‑130 (MQ=255) ggAAAATCAGGGTCAGGCCGATCAGCAGGATGTCGAGGGCGATTTCGTTTGGGGTCTTCTGCCGCTTGGCACCTTCGACCAGGGCGATCATGCGGTCCAGGGTCGACTCGCCCGGGTTGCTGGTGATGCg < 6:95356/130‑1 (MQ=255) tCAGGGTCAGGCCGATCAGCAGGATGTCGAGGGCGATTTCGTTTGGGGTCTTCTGCCGCTTGGCACCTTCGACCAGGGCGATCATGCGGTCCAGGGTCGACTCGCCCGGGTTGCTGGTGATGCGGATAAGCAGCCAGTCGGAGACCAGc < 6:167843/149‑1 (MQ=255) gggTCAGGCCGATCAGCAGGATGTCGAGGGCGATTTCGTTTGGGGTCTTCTGCCGCTTGGCACCTTCGACCAGGGCGATCATGCGGTCCAGGGTCGACTCGCCCGGGTTGCTGGTGATGCGGATAAGCAGCCAGTCGGAGACCAGCcgc > 6:98813/1‑149 (MQ=255) ggTCAGGCCGATCAGCAGGATGTCGAGGGCGATTTCGTTTGGGGTCTTCTGCCGCTTGGCACCTTCGACCAGGGCGATCATGCGGTCCAGGGTCGACTCGCCCGGGTTGCTGGTGATGCGGATAAGCAGCCAGTCGGAGACCAGCcgcg > 4:160129/1‑149 (MQ=255) ggCCGATCAGCAGGATGTCGAGGGCGATTTCGTTTGGGGTCTTCTGCCGCTTGGCACCTTCGACCAGGGCGATCATGCGGTCCAGGGTCGACTCGCCCGGGTTGCTGGTGATGCGGATAAGCAGCCAGTCGGAGACCAGCCGCGTATTg > 6:149029/1‑149 (MQ=255) agcagGATGTCGAGGGCGATTTCGTTTGGGGTCTTCTGCCGCTTGGCACCTTCGGCCAGGGCGATCATGCGGTCCAGGGTCGACTCGCCCGGGTTGCTGGTGATGCGGATAAGCAGCCAGTCGGAGACCAGCCGCGTATTGCCGGTCa < 5:310617/148‑1 (MQ=255) agcagGATGTCGAGGGCGATTTCGTTTGGGGTCTTCTGCCGCTTGGCACCTTCGACCAGGGCGATCATGCGGTCCAGGGGCGACTCGCCCGGGTTGCTGGTGATGCGGATAAGCAGCCAGTCGGAGACCAGCCGCGTATTGCCGGTCa < 3:148733/148‑1 (MQ=255) tCGAGGGCGATTTCGTTTGGGGTCTTCTGCCGCTTGGCACCTTCGACCAGGGCGATCATGCGGTCCAGGGTCGACTCGCCCGGGTTGCTGGTGATGCGGATAAGCAGCCAGTCGGAGACCAGCCGCGTATTGCCGGTCACCGCCGAGCg < 5:120977/149‑1 (MQ=255) cGATTTCGTTTGGGGTCTTCTGCCGCTTGGCACCTTCGACCAGGGCGATCATGCGGTCCAGGGTCGACTCGCCCGGGTTGCTGGTGATGCGGATAAGCAGCCAGTCGGAGACCAGCCGCGTATTGCCGGTCACCGCCGAGCGGTCGCCa > 1:317873/1‑149 (MQ=255) ttctGCCGCTTGGCACCTTCGACCAGGGCGATCATGCGGTCCAGGGTCGACTCGCCCGGGTTGCTGGTGATGCGGATAAGCAGCCAGTCGGAGACCAGCCGCGTATTGCCGGTCACCGCCGAGCGGTCGCCACCTGATTCGCGTATTAc > 5:101422/1‑149 (MQ=255) ttctGCCGCTTGGCACCTTCGACCAGGGCGATCATGCGGTCCAGGGTCGACTCGCCCGGGTTGCTGGTGATGCGGATAAGCAGCCAGTCGGAGACCAGCCGCGTATTGCCGGTCACCGCCGAGCGGTCGCCACCTGATTCGCGTATTAc > 1:65433/1‑149 (MQ=255) ctGCCGCTTGGCACCTTCGACCAGGGCGATCATGCGGTCCAGGGTCGACTCGCCCGGGTTGCTGGTTATGCGGATAAGCAGCCAGTCGGAGACCAGCCGCGTATTGCCGGTCACCGCCGAGCGGTCGCCACCTGATTCGCGTATTAc < 5:98813/147‑1 (MQ=255) gCCGCTTGGCACCTTCGACCAGGGCGATCATGCGGTCCAGGGTCGACTCGCCCGGGTTGCTGGTGATGCGGATAAGCAGCCAGTCGGAGACCAGCCGCGTATTGCCGGTCAccg > 2:221465/1‑114 (MQ=255) gCCGCTTGGCACCTTCGACCAGGGCGATCATGCGGTCCAGGGTCGACTCGCCCGGGTTGCTGGTGATGCGGATAAGCAGCCAGTCGGAGACCAGCCGCGTATTGCCGGTCAccg < 1:221465/114‑1 (MQ=255) gCCGCTTGGCACCTTCGACCAGGGCGATCATGCGGTCCAGGGTCGACTCGCCCGGGTTGCTGGTGATGCGGATAAGCAGCCAGTCGGAGACCAGCCGCGTATTGCCGGTCACCGCCGAGCGGTCGCCACCTGATTCGCGTATTACCGGt > 3:151352/1‑149 (MQ=255) ccGCTTGGCACCTTCGACCAGGGCGATCATGCGGTCCAGGGTCGACTCGCCCGGGTTGCTGGTGATGCGGATAAGCAGCCAGTCGGAGACCAGCCGCGTATTGCCGGTCACCGCCGAGCGGTCGCCACCTGATTCGCGTATTACCg < 3:160129/146‑1 (MQ=255) cACCTTCGACCAGGGCGATCATGCGGTCCAGGGTCGACTCGCCCGGGTTGCTGGTGATGCGGATAAGCAGCCAGTCGGAGACCAGCCGCGTATTGCCGGTCACCGCCGAGCGGTCGCCACCTGATTCGCGTATTACCGGTGCGGATTCg > 6:82808/1‑149 (MQ=255) cGACCAGGGCGATCATGCGGTCCAGGGTCGACTCGCCCGGGTTGCTGGTGATGCGGATAAGCAGCCAGTCGGAGACCAGCCGCGTATTGCCGGTCACCGCCGAGCGGTCGCCAc > 3:81037/1‑114 (MQ=255) gACCAGGGCGATCATGCGGTCCAGGGTCGACTCGCCCGggtcgaaggtgccaagcggcagaagaccccaaacgaaatcgccctcgacatcctgctgatcggcctgaccctgattttcc < 1:21395‑M2/118‑81 (MQ=255) gACCAGGGCGATCATGCGGTCCAGGGTCGACTCGCCCGggtcgaaggtgccaagcggcagaagaccccaaacgaaatcgccctcgacatcctgctgatcggcctgaccctgattttcc > 2:21395‑M2/1‑38 (MQ=255) aCCAGGGCGATCATGCGGTCCAGGGTCGACTCGCCCGggtcgaaggtgccaagcggcagaagaccccaaacgaaatcgccctcgacatcctgctgatcggcctgaccctgat > 7:71785‑M2/1‑37 (MQ=255) aCCAGGGCGATCATGCGGTCCAGGGTCGACTCGCCCGggtcgaaggtgccaagcggcagaagaccccaaacgaaatcgccctcgacatcctgctgatcggcctgaccctgat < 8:71785‑M2/112‑76 (MQ=255) cAGGGCGATCATGCGGTCCAGGGTCGACTCGCCCGGGTTGCTGGTGATGCGGATAAGCAGcc < 6:66149/62‑1 (MQ=255) cAGGGCGATCATGCGGTCCAGGGTCGACTCGCCCGGGTTGCTGGTGATGCGGATAAGCAGcc > 5:66149/1‑62 (MQ=255) gggCGATCATGCGGTCCAGGGTCGACTCGCCCGGGTTGCTGGTGATGCGGATAAGCAGCCAGTCGGAGACCAGCCGCGTATTGCCGGTCACCGCCGAGCGGTCGCCACCTGATTCGCGTATTACCGGTGCGGATTCGCCGGTAATggcg < 6:101422/149‑1 (MQ=255) tCATGCGGTCCAGGGGCGACTCGCCCGGGTTGCTGGTGATGCGGATAAGCAGCCAGTCGGAGACCAGCCGCGTATTGCCGGTCACCGCCGAGCGGTCGCCACCTGATTCGCGTATTACCGGTGCGGATTCGCCGGTAATGGCGGCCTCg < 5:149029/149‑1 (MQ=255) ggTCCAGGGTCGACTCGCCCGGGTTGCTGGTGATGCGGATAAGCAGCCAGTCGGAGACCAGCCGCGTATTGCCGGTCACCGCCGAGCGGTCGCCACCTGATTCGCGTATTACCGGTGCGGATTCGCCGGTAATGGCGGCCTCGTTGACg < 4:151352/149‑1 (MQ=255) gTCCAGGGTCGACTCGCCCGGGTTGCTGGTGATGCGGATAAGCAGCCAGTCGGAGACCAGCCGCGTATTGCCGGTCACCGCCGAGCGGTCGCCACCTGATTCGCGTATTACCGGTGCGGATTCGCCGGTAATg > 2:206346/1‑133 (MQ=255) gTCCAGGGTCGACTCGCCCGGGTTGCTGGTGATGCGGATAAGCAGCCAGTCGGAGACCAGCCGCGTATTGCCGGTCACCGCCGAGCGGTCGCCACCTGATTCGCGTATTACCGGTGCGGATTCGCCGGTAATg < 1:206346/133‑1 (MQ=255) gTCCAGGGTCGACTCGCCCGGGTTGCTGGTGAAGCGGATTAGCAGCCAGTAGGAGACCAGCCGCGTATTGCCGGTAACCGCCGAGCGGTCGCCACCGGATTGGCGTATTACCGGTGCGGCTTCGGCGGTAATGGCGGCCTCGTTGACgg > 1:37884/1‑149 (MQ=255) tCGCCCGGGTTGCTGGTGATGCGGATAAGCAGCCAGTCGGAGACCAGCCGCGTATTGCCGGTCACCGCCGAGCGGTCGCCACCTGATTCGCGTATTACCGGTGCGGATTCGCCGGTAATGGCGGCCTCGTTGACGGCCGCAATGCCtt > 6:248649/1‑148 (MQ=255) gCCCGGGTTGCTGGTGATGCGGATAAGCAGCCAGTCGGAGACCAGCCGCGTATTGCCGGTCACCGCCGAGCGGTCGCCACCTGATTCGCGTATTACCGGTGCGGATTCGCCGGTAATGGCGGCCTCGTTGACGGCCGCAATGCCtt < 5:248649/146‑1 (MQ=255) | GGGCGAACGGCTGCAAGGTCACCACCACGATCAGGAAAATCAGGGTCAGGCCGATCAGCAGGATGTCGAGGGCGATTTCGTTTGGGGTCTTCTGCCGCTTGGCACCTTCGACCAGGGCGATCATGCGGTCCAGGGTCGACTCGCCCGGGTTGCTGGTGATGCGGATAAGCAGCCAGTCGGAGACCAGCCGCGTATTGCCGGTCACCGCCGAGCGGTCGCCACCTGATTCGCGTATTACCGGTGCGGATTCGCCGGTAATGGCGGCCTCGTTGACGGCCGCAATGCCTT > NC_002947/4702718‑4703005 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |