New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5996712 = | 52 (1.030) | 4 (0.080) | 4/252 | NT | 7.1% | coding (320/1983 nt) | PP_5252 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | 5996795 = | 54 (1.100) | coding (237/1983 nt) | PP_5252 | hypothetical protein |
CTGCGGGGTAGGCGTGCGCGCAGCCTGGTCCTTGAGCATGCGCAGGGCATCGGCCACTGACGGTACCCCTTCCCAACGCAGCTCGAGGTTGTAGTTCAGACCGCCACGGATCAGGTGCAGGTGCGAGTCATTGAGGCCCGGGATCACCGTGCGCTGCTTGAGGTCGATGATCTGCGAGGCGGCACCCTTGTGGGCCATGGCCTCGGCGTCGCTGCCCACGGCGATGAAGCGGCCGTCCTTGATGGCGACGGCGGTCGCGGTGGGCTTTTCTCGGTCAACGGTGTGCAGTTT > NC_002947/5996570‑5996860 | cTGCGGGGTAGGCGTGCGCGCAGCCTGGTCCTTGAGCATGCGCAGGGCATCGGCCACTGACGGTACCCCTTCCCAACGCAGCTCGAGGTTGTAGTTCAGACCGCCACGGATCAGGTGCAGGTGCGAGTCATTGAGGCCCGGGATCACCg > 4:145187/1‑149 (MQ=255) cGGGGTAGGCGTGCGCGCAGCCTGGTCCTTGAGCATGCGCAGGGCATCGGCCACTGACGGTACCCCTTCCCAACGCAGCTCGAGGTTGTAGTTCAGACCGCCACGGATCAGGTGCAGGTGCGAGTCATTGAGGCCCGGGATCACCGTgc < 8:183355/149‑1 (MQ=255) ggTAGGCGTGCGCGCAGCCTGGTCCTTGAGCATGCGCAGGGCATCGGCCACTGACGGTACCCCTTCCCAACGCAGCTCGAGGTTGTAGTTCAGACCGCCACGGATCAGGTGCAGGTGCGAGTCATTGAGGCCCGGGATCACCGTGCgct > 4:76101/1‑149 (MQ=255) gTAGGCGTGCGCGCAGCCTGGTCCTTGAGCATGCGCAGGGCATCGGCCACTGACGGTACCCCTTCCCAACGCAGCTCGAGGTTGTAGTTCAGACCGCCACGGATCAGGTGCAGGTGCGAGTCATTGAGGCCCGGGATCACCGTGCgctg > 3:284186/1‑149 (MQ=255) ggCGTGCGCGCAGCCTGGTCCTTGAGCATGCGCAGGGCATCGGCCACTGACGGTACCCCTTCCCAACGCAGCTCGAGGTTGTAGTTCAGACCGCCACGGATCAGGTGCAGGTGCGAGTCATTGAGGCCCGGGATCACCGTGCGCTGCtt < 7:145287/149‑1 (MQ=255) gCGTGCGCGCAGCCTGGTCCTTGAGCATGCGCAGGGCATCGGCCACTGACGGTACCCCTTCCCAACGCAGCTCGAGGTTGTAGTTCAGACCGCCACGGATCAGGTGCAGGTGCGAGTCATTGAGGCCCGGGATCACCGTGCGCTGCtt > 4:102514/1‑148 (MQ=255) gctcAGCCTGGTCCTTGAGCATGCGCAGGGCATCGGCCACTGACGGTACCCCTTCCCAACGCAGCTCGAGGTTGTAGTTCAGACCGCCACGGATCAGGTGCAGGTGCGAGTCATTGAGGCCCGGGATCACCGTGCGCTGCTTGAGGTc > 5:88542/4‑148 (MQ=255) gctcacgcatccacgcaaggaggttccatgaccgccgacctgattctgttcaacggcaaactgcacaccgttgaccgtgaaaagcccaccgcgaccgccgtcgccatcaaggacggccgcttcATCACCGTGCGCTGCTTGAGGTCgat < 6:133459‑M1/26‑1 (MQ=255) gcaaggaggttccatgaccgccgacctgattctgttcaacggcaaactgcacaccgttgaccgagaaaagcccaccgcgaccgccgtcgccatcaaggacggccgcttcATCACCGTGCGCTGCTTGAGGTCGATGATCTGCGAggcgg < 8:40265‑M1/40‑1 (MQ=255) gggCATCGGCCACTGACGGTACCCCTTCCCAACGCAGTTCGAGGTTGTAGTTCAGACCGCCACGGATCCGGTGCAGGTGCGAGTCATTGAGGCCCGGGATCACCGTGCGCTGCTTGAGGTCGATGATCTGCGAGGCGGCACCCTTGTgg < 7:195023/149‑1 (MQ=255) gggCATCGGCCACTGACGGTACCCCTTCCCAACGCAGCTCGAGGTTGTAGTTCAGACCGCCACGGATCAGGTGCAGGTGCGAGTCATTGAGGCCCGGGATCACCGTGCGCTGCTTGAGGTCGATGATCTGCGAGGCGGCACCCTTGTgg > 5:147465/1‑149 (MQ=255) gCATCGGCCACTGACGGTACCCCTTCCCAACGCAGCTCGAGGTTGTAGTTCAGACCGCCACGGATCAGGTGCAGGTGCGAGTCATTGAGGCCCGGGATCACCGTGCGCTGCTTGAGGTCGATGATCTGCGAGGCGGCACCCTtgtg < 8:260166/146‑1 (MQ=255) gCATCGGCCACTGACGGTACCCCTTCCCAACGCAGCTCGAGGTTGTAGTTCAGACCGCCACGGATCAGGTGCAGGTGCGAGTCATTGAGGCCCGGGATCACCGTGCGCTGCTTGAGGTCGATGATCTGCGAGGCGGCACCCTtgtg > 7:260166/1‑146 (MQ=255) gCATCGGCCACTGACGGTACCCCTTCCCAACGCAGCTCGAGGTTGTAGTTCAGACCGCCACGGATCAGGTGCAGGTGCGAGTCATTGAGGCCCGGGATCACCGTGCGCTGCTTGAGGTCGATGATCTGCGAGGCGGCACCCTTGTGGGc > 3:154848/1‑149 (MQ=255) cATCGGCCACTGACGGTACCCCTTCCCAACGCAGCTCGAGGTTGTAGTTCAGACCGCCACGGATCAGGTGCAGGTGCGAGTCATTGAGGCCCGGGATCACCGTGCGCTGCTTGAGGTCGATGATCTGCGAGGCGGCACCCTTGTGGGcc < 3:223754/149‑1 (MQ=255) cATCGGCCACTGACGGTACCCCTTCCCAACGCAGCTCGAGGTTGTAGTTCAGACCGCCACGGATCAGGTGCAGGTGCGAGTCATTGAGGCCCGGGATCACCGTGCGCTGCTTGAGGTCGATGATCTGCGAGGCGGCACCCTTGTGGGc > 3:217317/1‑148 (MQ=255) tCGGCCACTGACGGTACCCCTTCCCAACGCAGCTCGAGGTTGTAGTTCAGACCGCCACGGATCAGGTGCAGGTGCGAGTCATTGAGGCCCGGGATCACCGTGCGCTGCTTGAGGTCGATGATCTGCGAGGCGGCACCCTTGTGGGCCAt > 6:147132/1‑149 (MQ=255) ccACTGACGGTACCCCTTCCCAACGCAGCTGGAGGTTGTAGTTCAGACCGCCACGGATCAGGTGCAGGTGCGAGTCATTGAGGCCCGGGATCACCGTGCGCTGCTTGAGGTCGATGATCTGCGAGGCGGCACCCTTGTGGGCCATGGcc > 1:29029/1‑149 (MQ=255) ccACTGACGGTACCCCTTCCCAACGCAGCTCGAGGTTGTAGTTCAGACCGCCACGGATCAGGTGCAGGTGCGAGTCATTGAGGCCCGGGATCACCGTGCGCTGCTTGAGGTCGATGATCTGCGAGGCGGCACCCTTGTGGGCCATGGcc > 3:80026/1‑149 (MQ=255) cTGACGGTACCCCTTCCCAACGCAGCTCGAGGTTGTAGTTCAGACCGCCACGGATCAGGTGCAGGTGCGAGTCATTGAGGCCCGGGATCACCGTGCGCTGCTTGAGGTCGATGATCTGCGAGGCGGCACCCTTGTGGGCCATGGCCTCg > 2:199220/1‑149 (MQ=255) aCGGTACCCCTTCCCAACGCAGCTCGAGGTTGTAGTTCAGACCGCCACGGATCAGGTGCAGGTGCGAGTCATTGAGGCCCGGGATCACCGTGCGCTGCTTGAGGTCGATGATCTGCGAGGCGGCACCCTTGTGGGCCATgg < 5:184922/141‑1 (MQ=255) aCGGTACCCCTTCCCAACGCAGCTCGAGGTTGTAGTTCAGACCGCCACGGATCAGGTGCAGGTGCGAGTCATTGAGGCCCGGGATCACCGTGCGCTGCTTGAGGTCGATGATCTGCGAGGCGGCACCCTTGTGGGCCATgg > 6:184922/1‑141 (MQ=255) cTTCCCAACGAAGCTAGAGGATGAAGTTAAGACAGCAAAGTATCAGGTGCAGGTGCGAGTCATTGAGACCCGTGATCACCGTGCGATGATTGAGGTCGATGATCTGCTAGGCGGCACCCTTGTGGGCCATGGCCTCTGCTTCGCTGcc > 2:207478/1‑148 (MQ=255) ttCCCAACGCAGCTCGAGGTTGTAGTTCAGACCGCCACGGATCAGGTGCAGGTGCGAGTCATTGAGGCCCGGGATCACCGTGCGCTGCTTGAGGTCGATGATCTGCGAGGCGGCACCCTTGTGGGCCATGGCCTCGGCGTCGCTGCCCa > 5:237940/1‑149 (MQ=255) ttCCCAACGCAGCTCGAGGTTGTAGTTCAGACCGCCACGGATCAGGTGCAGGTGCGAGTCATTGAGGCCCGGGATCACCGTGCGCTGCTTGAGGTCGATGATCTGCGAGGCGGCACCCTTGTGGGCCATGGCCTCGGCGTCGCTGCCCa > 1:35173/1‑149 (MQ=255) cAACGCAGCTCGAGGTTGTAGTTCAGACCGCCACGGATCAGGTGCAGGTGCGAGTCATTGAGGCCCGGGATCACCGTGCGCTGCTTGAGGTCGATGATCTGCGAGGCGGCACCCTTGTGGGCCATGGCCTCGGCGTCGCTGCCCACGGc > 2:106108/1‑149 (MQ=255) aaCGCAGCTCGAGGTTGTAGTTCAGACCGCCACGGATCAGGTGCAGGTGCGAGTCATTGAGGCCCGGGATCACCGTGCGCTGCTTGAGGTCGATGATCTGCGAGGCGGCACCCTTGTGGGCCATGGCCTCGGCGTCGCTGCCCACGGCg < 2:29029/149‑1 (MQ=255) aCGCAGCTCGAGGTTGTAGTTCAGACCGCCACGGATCAGGTGCAGGTGCGAGTCATTGAGGCCCGGGATCACCGTGCGCTGCTTGAGGTCGATGATCTGCGAGGCGGCACCCTTGTGGGCCATGGCCTCGGCGTCGCTGCCCACGGCGa < 3:145187/149‑1 (MQ=255) cGCAGCTCGAGGTTGTAGTTCAGACCGCCACGGATCAGGTGCAGGTGCGAGTCATTGAGGCCCGGGATCACCGTGCGCTGCTTGAGGTCGATGATCTGCGAGGCGGCACCCTTGTGGGCCATGGCCTCGGCGTCGCTGCCCACGGCGAt < 4:217317/149‑1 (MQ=255) cGCAGCTCGAGGTTGTAGTTCAGACCGCCACGGATCAGGTGCAGGTGCGAGTCATTGAGGCCCGGGATCACCGTGCGCTGCTTGAGGTCGATGATCTGCGAGGCGGCACCCTTGTGGGCCATGGCCTCGGCGTCGCTGCCCACGGCGAt < 3:102514/149‑1 (MQ=255) aactgcacaccgttgaccgagaaaagcccaccgcgaccgccgtcgccatcaaggacggccgcttcATCACCGTGCGCTGCTTGAGGTCGATGATCTGCGAGGCGGCACCCTTGTGGGCCATGGCCTCGGCGTCGCTGCCCACGGCGATg > 7:40265‑M1/66‑149 (MQ=255) ctgcacaccgttgaccgtgaaaagcccaccgcgaccgccgtcgccatcaaggacggccgcttcATCACCGTGCGCTGCTTGAGGTCGATGATCTGCGAGGCGGCACCCTTGTGGGCCATGGCCTCGGCGTCGCTGCCCACGGCGATGaa > 5:133459‑M1/64‑149 (MQ=255) gAGGTTGTAGTTCAGACCGCCACGGATCAGGTGCAGGTGCGAGTCATTGAGGCCCGGGATCACCGTGCGCTGCTTGAGGTCGATGATCTGCGAGGCGGCACCCTTGTGGGCCATGGCCTCGGCGTCGCTGCCCACGGCGATGAAGCg < 6:88542/147‑1 (MQ=255) gTTGTAGTTCAGACCGCCACGGATCAGGTGCAGGTGCGAGTCATTGAGGCCCGGGATCACCGTGCGCTGCTTGAGGTCGATGATCTGCGAGGCGGCACCCTTGTGGGCCATGGCCTCGGCGTCGCTGCCCACGGCGATGAAGCGGCCGt > 2:111054/1‑149 (MQ=255) gTAGTTCAGACCGCCACGGATCAGGTGCAGGTGCGAGTCATTGAGGCCCGGGATCACCGTGCGCTGCTTGAGGTCGATGATCTGCGAGGCGGCACCCTTGTGGGCCATGGCCTCGGCGTCGCTGCCCACGGCGATGAAGCGGCCGTCCt > 5:191114/1‑149 (MQ=255) tAGTTCAGACCGCCACGGATCAGGTGCAGGTGCGAGTCATTGAGGCCCGGGATCACCGTGCGCTGCTTGAGGTCGATGATCTGCGAGGCGGCACCCTTGTGGGCCATGGCCTCGGCGTCGCTGCCCACGGCGATGAAGCGGCCGTCCtt < 3:76101/149‑1 (MQ=255) gTTCAGACCGCCACGGATCAGGTGCAGGTGCGAGTCATTGAGGCCCGGGATCACCGTGCGCTGCTTGAGGTCGATGATCTGCGAGGCGGCACCCTTGTGGGCCATGGCCTCGGCGTCGCTGCCCACGGCGATGAAGCGGCCGTCCTTGa > 3:17483/1‑149 (MQ=255) ttCAGACCGCCACGGATCAGGTGCAGGTGCGAGTCATTGAGGCCCGGGATCACCGTGCGCTGCTTGAGGTCGATGATCTGCGAGGCGGCACCCTTGTGGGCCATGGCCTCg < 8:27751/111‑1 (MQ=255) cAGACCGCCACGGATCAGGTGCAGGTGCGAGTCATTGAGGCCCGGGATCACCGTGCGCTGCTTGAGGTCGATGATCTGCGAGGCGGCACCCTTGTGGGCCATGGCCTCGGCGTCGCTGCCCACGGCGATGAAGCGGCCGTCCTTGATg < 4:80026/148‑1 (MQ=255) aGACCGCCACGGATCAGGTGCAGGTGCGAGTCATTGAGGCCCGGGATCACCGTGCGCTGCTTGAGGTCGATGATCTGCGAGGCGGCACCCTTGTGGGCCATGGCCTCGGCGTCGCTGCCCACGGCGATGAAGCGGCCGTCCTTGATgg < 5:147132/148‑1 (MQ=255) aGACCGCCACGGATCAGGTGCAGGTGCGAGTCAGTGAGGCCCGGGATCACCGGGCGCTGCTTGAGGGCGATGATCTGCGAGGCGGCACCCTTGTGGGCCATGGCCTCGGCGTCGCTGCCCACGGCGATGAAGCGGCCGTCCTTGATGGc < 7:260407/149‑1 (MQ=255) aCCGCCACGGATCAGGTGCAGGTGCGAGTCATTGAGGCCCGGGATCACCGTGCGCTGCTTGAGGTCGATGATCTGCGAGGCGGCACCCTTGTGGGCCATGGCCTCGGCGTCGCTGCCCACGGCGATGAAGCGGCCGTCCTTGATGGCGa > 1:136822/1‑149 (MQ=255) ccGCCACGGATCAGGTGCAGGTGCGAGTCATTGAGGCCCGGGATCACCGTGCGCTGCTTGAGGTCGATGATCTGCGAGGCGGCACCCTTGTGGGCCATGGCCTCGGCGTCGCTGCCCACGGCGATGAAGCGGCCGTCCTTGATGGCGAc > 4:283199/1‑149 (MQ=255) ggATCAGGTGCAGGTGCGAGTCATTGAGGCCCGGGATCACCGTGCGCTGCTTGAGGTCGATGATCTGCGAGGCGGCACCCTTGTGGGCCATGGCCTCGGCGTCGCTGCCCACGGCGATGAAGCGGCCGTCCt < 4:167065/132‑1 (MQ=255) ggATCAGGTGCAGGTGCGAGTCATTGAGGCCCGGGATCACCGTGCGCTGCTTGAGGTCGATGATCTGCGAGGCGGCACCCTTGTGGGCCATGGCCTCGGCGTCGCTGCCCACGGCGATGAAGCGGCCGTCCt > 3:167065/1‑132 (MQ=255) gATCAGGTGCAGGTGCGAGTCATTGAGGCCCGGGATCACCGTGCGCTGCTTTAGGTCGATGATCTGCGAGGCGGCACCCTTGTGGGCCATTGCCTCGGCGTCGCTGCCCACGGCGATGAAGCGGCCGTCCTTGATGGCGACGGCGGTcg < 4:284186/149‑1 (MQ=255) gATCAGGTGCAGGTGCGAGTCATTGAGGCCCGGGATCACCGTGCGCTGCTTGAGGTCGATGATCTGCGAGGCGGCACCCTTGTGGGCCATGGCCTCGGCGTCGCTGCCCACGGCGATGAAGCGGCCGTCCTTGATGGCGACGGCGGTcg > 6:128675/1‑149 (MQ=255) ggtgcaggtgcGAGTCATTGAGGCCCGGGATCACCGTGCGCTGCTTGAGGTCGATGATCTGCGAGGCGGCACCCTTGTGGGCCATGGCCTCGGCGTCGCTGCCCACGGCGATGAAGCGGCCGTCCTTGATGGCGACGGCGGTCGCGGTg < 2:112855/149‑1 (MQ=255) gtgcaggtgcGAGTCATTGAGGCCCGGGATCACCGTGCGCTGCTTGAGGTCGATGATCTGCGAGGCGGCACCC‑TCTGGGCCATGGCCTCGGCGTCGCTGCCCACGGCGATGAAGCGGCCGTCCTTGATGGCGACGGCGGTCGCGGTggg > 2:69147/1‑149 (MQ=255) aggtgcGAGTCATTGAGGCCCGGGATCACCGTGCGCTGCTTGAGGTCGATGATCTGCGAGGCGGCACCCTTGTGGGCCATGGCCTCGGCGTCGCTGCCCACGGCGATGAAGCGGCCGTCCTTGATGGCGACGGCGGTCGCGGTGGGCtt < 2:11262/149‑1 (MQ=255) gtgcGAGTCATTGAGGCCCGGGATCACCGTGCGCTGCTTGAGGTCGATGATCTGCGAGGCGGCACCCTTGTGGGCCATGGCCTCGGCGTCGCTGCCCACGGCGATGAAGCGGCCGTCCTTGATGGCGACGGCGGTCGCGGTGGGCtttt > 2:235115/1‑149 (MQ=255) tgcGAGTCATTGAGGCCCGGGATCACCGTGCGCTGCTTGAGGTCGATGATCTGCGAGGCGGCACCCTTGTGGGCCATGGCCTCGGCGTCGCTGCCCACGGCGATGAAGCGGCCGTCCTTGATGGCGACGGCGGTCGCGGTGGGCTTTtc > 7:159742/1‑149 (MQ=255) aGTCATTGAGGCCCGGGATCACCGTGCGCTGCTTGAGGTCGATGATCTGCGAGGCGGCACCCTTGTGGGCCATGGCCTCGGCGTCGCTGCCCACGGCGATGAAGCGGCCGTCCTTGATGGCGACGGCGGTCGCGGTGGGCTTTTCTCgg > 6:160920/1‑149 (MQ=255) ttGAGGCCCGGGATCACCGTGCGCTGCTTGAGGTCGATGATCTGCGAGGCGGCACCCTTGTGGGCCATGGCCTCGGCGTCGCTGCCCACGGCGATGAAGCGGCCGTCCTTGATGGCGACGGCGGTCGCGGTGGGCTTTTCTCGGTCAAc > 4:5740/1‑149 (MQ=255) aGGCCCGGGATCACCGTGCGCTGCTTGAGGTCGATGATCTGCGAGGCGGCACCCTTGTGGGCCATGGCCTCGGCGTCGCTGCCCACGGCGATGAAGCGGCCGTCCTTGATGGCGACGGCGGTCGCGGTGGGCTTTTCTCGGTCAACGgt < 6:237940/149‑1 (MQ=255) ggCCCGGGATCACCGTGCGCTGCTTGAGGTCGATGATCTGCGAGGCGGCACCCTTGTGGGCCATGGCCTCGGCGTCGCTGCCCACGGCGATGAAGCGGCCGTCCTTGATGGCGACGGCGGTCGCGGTGGGCTTTTCTCGGTCAACGgtg < 1:199220/149‑1 (MQ=255) ccGGGATCACCGTGCGCTGCTTGAGGTCGATGATCTGCGAGGCGGCACCCTTGTGGGCCATGGCCTCGGCGTCGCTGCCCACGGCGATGAAGCGGCCGTCCTTGATGGCGACGGCGGTCGCGGTGGGCTTTTCTCGGTCAACGGtgtg > 1:287096/1‑148 (MQ=255) ATCACCGTGCGCTGCTTGAGGTCGATGATCTGCGAGGCGGCACCCTTGTGGGCCATGGCCTCGGCGTCGCTGCCCACGGCGATGAAGCGGCCGTCCTTGATGGCGACGGCGGTCGCGGTGGGCTTTTCTCGGTCAACGGTGTGCAGttt > 4:154848‑M1/1‑149 (MQ=255) | CTGCGGGGTAGGCGTGCGCGCAGCCTGGTCCTTGAGCATGCGCAGGGCATCGGCCACTGACGGTACCCCTTCCCAACGCAGCTCGAGGTTGTAGTTCAGACCGCCACGGATCAGGTGCAGGTGCGAGTCATTGAGGCCCGGGATCACCGTGCGCTGCTTGAGGTCGATGATCTGCGAGGCGGCACCCTTGTGGGCCATGGCCTCGGCGTCGCTGCCCACGGCGATGAAGCGGCCGTCCTTGATGGCGACGGCGGTCGCGGTGGGCTTTTCTCGGTCAACGGTGTGCAGTTT > NC_002947/5996570‑5996860 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |