New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5996712 = | 52 (1.030) | 4 (0.080) | 4/252 | NT | 7.1% | coding (320/1983 nt) | PP_5252 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | 5996795 = | 54 (1.100) | coding (237/1983 nt) | PP_5252 | hypothetical protein |
GCAGCTCGAGGTTGTAGTTCAGACCGCCACGGATCAGGTGCAGGTGCGAGTCATTGAGGCCCGGGATCACCGTGCGCTGCTTGAGGTCGATGATCTGCGAGGCGGCACCCTTGTGGGCCATGGCCTCGGCGTCGCTGCCCACGGCGATGAAGCGGCCGTCCTTGATGGCGACGGCGGTCGCGGTGGGCTTTTCTCGGTCAACGGTGTGCAGTTTGCCGTTGAACAGAATCAGGTCGGCGGTCATGGAACCTCCTTGCGTGGATGCGTGAGCGGAACCGGCTTGGCCGGTAAAA > NC_002947/5996647‑5996939 | aactgcacaccgttgaccgagaaaagcccaccgcgaccgccgtcgccatcaaggacggccgcttcATCACCGTGCGCTGCTTGAGGTCGATGATCTGCGAGGCGGCACCCTTGTGGGCCATGGCCTCGGCGTCGCTGCCCACGGCGATg > 7:40265‑M1/66‑149 (MQ=255) ctgcacaccgttgaccgtgaaaagcccaccgcgaccgccgtcgccatcaaggacggccgcttcATCACCGTGCGCTGCTTGAGGTCGATGATCTGCGAGGCGGCACCCTTGTGGGCCATGGCCTCGGCGTCGCTGCCCACGGCGATGaa > 5:133459‑M1/64‑149 (MQ=255) gAGGTTGTAGTTCAGACCGCCACGGATCAGGTGCAGGTGCGAGTCATTGAGGCCCGGGATCACCGTGCGCTGCTTGAGGTCGATGATCTGCGAGGCGGCACCCTTGTGGGCCATGGCCTCGGCGTCGCTGCCCACGGCGATGAAGCg < 6:88542/147‑1 (MQ=255) gTTGTAGTTCAGACCGCCACGGATCAGGTGCAGGTGCGAGTCATTGAGGCCCGGGATCACCGTGCGCTGCTTGAGGTCGATGATCTGCGAGGCGGCACCCTTGTGGGCCATGGCCTCGGCGTCGCTGCCCACGGCGATGAAGCGGCCGt > 2:111054/1‑149 (MQ=255) gTAGTTCAGACCGCCACGGATCAGGTGCAGGTGCGAGTCATTGAGGCCCGGGATCACCGTGCGCTGCTTGAGGTCGATGATCTGCGAGGCGGCACCCTTGTGGGCCATGGCCTCGGCGTCGCTGCCCACGGCGATGAAGCGGCCGTCCt > 5:191114/1‑149 (MQ=255) tAGTTCAGACCGCCACGGATCAGGTGCAGGTGCGAGTCATTGAGGCCCGGGATCACCGTGCGCTGCTTGAGGTCGATGATCTGCGAGGCGGCACCCTTGTGGGCCATGGCCTCGGCGTCGCTGCCCACGGCGATGAAGCGGCCGTCCtt < 3:76101/149‑1 (MQ=255) gTTCAGACCGCCACGGATCAGGTGCAGGTGCGAGTCATTGAGGCCCGGGATCACCGTGCGCTGCTTGAGGTCGATGATCTGCGAGGCGGCACCCTTGTGGGCCATGGCCTCGGCGTCGCTGCCCACGGCGATGAAGCGGCCGTCCTTGa > 3:17483/1‑149 (MQ=255) cAGACCGCCACGGATCAGGTGCAGGTGCGAGTCATTGAGGCCCGGGATCACCGTGCGCTGCTTGAGGTCGATGATCTGCGAGGCGGCACCCTTGTGGGCCATGGCCTCGGCGTCGCTGCCCACGGCGATGAAGCGGCCGTCCTTGATg < 4:80026/148‑1 (MQ=255) aGACCGCCACGGATCAGGTGCAGGTGCGAGTCATTGAGGCCCGGGATCACCGTGCGCTGCTTGAGGTCGATGATCTGCGAGGCGGCACCCTTGTGGGCCATGGCCTCGGCGTCGCTGCCCACGGCGATGAAGCGGCCGTCCTTGATgg < 5:147132/148‑1 (MQ=255) aGACCGCCACGGATCAGGTGCAGGTGCGAGTCAGTGAGGCCCGGGATCACCGGGCGCTGCTTGAGGGCGATGATCTGCGAGGCGGCACCCTTGTGGGCCATGGCCTCGGCGTCGCTGCCCACGGCGATGAAGCGGCCGTCCTTGATGGc < 7:260407/149‑1 (MQ=255) aCCGCCACGGATCAGGTGCAGGTGCGAGTCATTGAGGCCCGGGATCACCGTGCGCTGCTTGAGGTCGATGATCTGCGAGGCGGCACCCTTGTGGGCCATGGCCTCGGCGTCGCTGCCCACGGCGATGAAGCGGCCGTCCTTGATGGCGa > 1:136822/1‑149 (MQ=255) ccGCCACGGATCAGGTGCAGGTGCGAGTCATTGAGGCCCGGGATCACCGTGCGCTGCTTGAGGTCGATGATCTGCGAGGCGGCACCCTTGTGGGCCATGGCCTCGGCGTCGCTGCCCACGGCGATGAAGCGGCCGTCCTTGATGGCGAc > 4:283199/1‑149 (MQ=255) ggATCAGGTGCAGGTGCGAGTCATTGAGGCCCGGGATCACCGTGCGCTGCTTGAGGTCGATGATCTGCGAGGCGGCACCCTTGTGGGCCATGGCCTCGGCGTCGCTGCCCACGGCGATGAAGCGGCCGTCCt < 4:167065/132‑1 (MQ=255) ggATCAGGTGCAGGTGCGAGTCATTGAGGCCCGGGATCACCGTGCGCTGCTTGAGGTCGATGATCTGCGAGGCGGCACCCTTGTGGGCCATGGCCTCGGCGTCGCTGCCCACGGCGATGAAGCGGCCGTCCt > 3:167065/1‑132 (MQ=255) gATCAGGTGCAGGTGCGAGTCATTGAGGCCCGGGATCACCGTGCGCTGCTTTAGGTCGATGATCTGCGAGGCGGCACCCTTGTGGGCCATTGCCTCGGCGTCGCTGCCCACGGCGATGAAGCGGCCGTCCTTGATGGCGACGGCGGTcg < 4:284186/149‑1 (MQ=255) gATCAGGTGCAGGTGCGAGTCATTGAGGCCCGGGATCACCGTGCGCTGCTTGAGGTCGATGATCTGCGAGGCGGCACCCTTGTGGGCCATGGCCTCGGCGTCGCTGCCCACGGCGATGAAGCGGCCGTCCTTGATGGCGACGGCGGTcg > 6:128675/1‑149 (MQ=255) ggtgcaggtgcGAGTCATTGAGGCCCGGGATCACCGTGCGCTGCTTGAGGTCGATGATCTGCGAGGCGGCACCCTTGTGGGCCATGGCCTCGGCGTCGCTGCCCACGGCGATGAAGCGGCCGTCCTTGATGGCGACGGCGGTCGCGGTg < 2:112855/149‑1 (MQ=255) gtgcaggtgcGAGTCATTGAGGCCCGGGATCACCGTGCGCTGCTTGAGGTCGATGATCTGCGAGGCGGCACCC‑TCTGGGCCATGGCCTCGGCGTCGCTGCCCACGGCGATGAAGCGGCCGTCCTTGATGGCGACGGCGGTCGCGGTggg > 2:69147/1‑149 (MQ=255) aggtgcGAGTCATTGAGGCCCGGGATCACCGTGCGCTGCTTGAGGTCGATGATCTGCGAGGCGGCACCCTTGTGGGCCATGGCCTCGGCGTCGCTGCCCACGGCGATGAAGCGGCCGTCCTTGATGGCGACGGCGGTCGCGGTGGGCtt < 2:11262/149‑1 (MQ=255) gtgcGAGTCATTGAGGCCCGGGATCACCGTGCGCTGCTTGAGGTCGATGATCTGCGAGGCGGCACCCTTGTGGGCCATGGCCTCGGCGTCGCTGCCCACGGCGATGAAGCGGCCGTCCTTGATGGCGACGGCGGTCGCGGTGGGCtttt > 2:235115/1‑149 (MQ=255) tgcGAGTCATTGAGGCCCGGGATCACCGTGCGCTGCTTGAGGTCGATGATCTGCGAGGCGGCACCCTTGTGGGCCATGGCCTCGGCGTCGCTGCCCACGGCGATGAAGCGGCCGTCCTTGATGGCGACGGCGGTCGCGGTGGGCTTTtc > 7:159742/1‑149 (MQ=255) aGTCATTGAGGCCCGGGATCACCGTGCGCTGCTTGAGGTCGATGATCTGCGAGGCGGCACCCTTGTGGGCCATGGCCTCGGCGTCGCTGCCCACGGCGATGAAGCGGCCGTCCTTGATGGCGACGGCGGTCGCGGTGGGCTTTTCTCgg > 6:160920/1‑149 (MQ=255) ttGAGGCCCGGGATCACCGTGCGCTGCTTGAGGTCGATGATCTGCGAGGCGGCACCCTTGTGGGCCATGGCCTCGGCGTCGCTGCCCACGGCGATGAAGCGGCCGTCCTTGATGGCGACGGCGGTCGCGGTGGGCTTTTCTCGGTCAAc > 4:5740/1‑149 (MQ=255) aGGCCCGGGATCACCGTGCGCTGCTTGAGGTCGATGATCTGCGAGGCGGCACCCTTGTGGGCCATGGCCTCGGCGTCGCTGCCCACGGCGATGAAGCGGCCGTCCTTGATGGCGACGGCGGTCGCGGTGGGCTTTTCTCGGTCAACGgt < 6:237940/149‑1 (MQ=255) ggCCCGGGATCACCGTGCGCTGCTTGAGGTCGATGATCTGCGAGGCGGCACCCTTGTGGGCCATGGCCTCGGCGTCGCTGCCCACGGCGATGAAGCGGCCGTCCTTGATGGCGACGGCGGTCGCGGTGGGCTTTTCTCGGTCAACGgtg < 1:199220/149‑1 (MQ=255) ccGGGATCACCGTGCGCTGCTTGAGGTCGATGATCTGCGAGGCGGCACCCTTGTGGGCCATGGCCTCGGCGTCGCTGCCCACGGCGATGAAGCGGCCGTCCTTGATGGCGACGGCGGTCGCGGTGGGCTTTTCTCGGTCAACGGtgtg > 1:287096/1‑148 (MQ=255) ttcatcgccgtgggcagcgacgccgaggccatggcccacaagggtgccgcctcgcagatcatcgacctcaagcagcgcacggtgatGAAGCGGCCGTCCTTGATGGCGACGGCGGTCGCGGTGGGCTTTTCACGGTCAACGGTGTGCAg > 5:133459‑M2/87‑149 (MQ=255) catcgccgtgggcagcgacgccgaggccatggcccacaagggtgccgcctcgcagatcatcgacctcaagcagcgcacggtgatGAAGCGGCCGTCCTTGATGGCGACGGCGGTCGCGGTGGGCTTTTCTCGGTCAACGGTGTGCAGtt > 7:40265‑M2/85‑149 (MQ=255) ATCACCGTGCGCTGCTTGAGGTCGATGATCTGCGAGGCGGCACCCTTGTGGGCCATGGCCTCGGCGTCGCTGCCCACGGCGATGAAGCGGCCGTCCTTGATGGCGACGGCGGTCGCGGTGGGCTTTTCTCGGTCAACGGTGTGCAGttt > 4:154848‑M1/1‑149 (MQ=255) cGTGCGCTGCTTGAGGTCGATGATCTGCGAGGCGGCACCCTTGTGGGCCATGGCCTCGGCGTCGCTGCCCACGGCGATGAAGCGGCCGTCCTTGATGGCGACGGCGGTCGCGGTGGGCTTTTCTCGGTCAACGGTGTGCAGTTTGCCGt < 6:191114/149‑1 (MQ=255) tGCGCTGCTTGAGGTCGATGATCTGCGAGGCGGCACCCTTGTGGGCCATGGCCTCGGCGTCGCTGCCCACGGCGATGAAGCGGCCGTCCTTGATGGCGACGGCGGTCGCGGTGGGCTTTTCTCGGTCAACGGTGTGCAGTTTGCCGTTg < 5:128675/149‑1 (MQ=255) gctgctTGAGGTCGATGATCTGCGAGGCGGCACCCTTGTGGGCCATGGCCTCGGCGTCGCTGCCCACGGCGATGAAGCGGCCGTCCTTGATGGCGACGGCGGTCGCGGTGGGCTTTTCTCGGTCAACGGTGTGCAGTTTGCCGTTGAAc < 3:176303/149‑1 (MQ=255) ctgctgGAGGTCGATGATGTGCGAGGCGGCACCCTTGTGGGCCATGGCCTCGGCGTCGCTGCCCACGGCGATGAAGCGGCCGTCCTTGATGGCGACGGCGGTCGCGGTGGGCTTTTCTCGGTCAACGGTGTGCAGTTTGCCGTTGAACa < 1:207478/149‑1 (MQ=255) aGGTCGATGATCTGCGAGGCGGCACCCTTGTGGGCCATGGCCTCGGCGTCGCTGCCCACGGCGATGAAGCGGCCGTCCTTGATGGCGACGGCGGTCGCGGTGGGCTTTTCTCGGTCAACGGTGTGCAGTTTGCCGTTGAACAGAATCa < 2:287096/148‑1 (MQ=255) aGGTCGATGATCTGCGAGGCGGCACCCTTGTGGGCCATGGCCTCGGCGTCGCTGCCCACGGCGATGAAGCGGCCGTCCTTGATGGCGACGGCGGTCGCGGTGGGCTTTTCTCGGTCAACGGTGTGCAGTTTGCCGTTGAACAGAATCAg < 6:147465/149‑1 (MQ=255) gTCGATGATCTGCGAGGCGGCACCCTTGTGGGCCATGGCCTCGGCGTCTCTGCCCACGGCGATGAAGCGGCCGTCCTTGATGGCGACGGCGGTCGCGGTGGGCTTTTCTCGGTCAACGGTGTGCAGTTTGCCGTTGAACAGAATCAGGt > 4:195297/1‑149 (MQ=255) gTCGATGATCTGCGAGGCGGCACCCTTGTGGGCCATGGCCTCGGCGTCGCTGCCCACGGCGATGAAGCGGCCGTCCTTGATGGCGACGGCGGTCGCGGTGGGCTTTTCTCGGTCAACGGTGTGCAGTTTGCCGTTGAACAGAATCAGGt < 5:160920/149‑1 (MQ=255) gatgatCTGCGAGGCGGCACCCTTGTGGGCCATGGCCTCGGCGTCGCTGCCCACGGCGATGAAGCGGCCGTCCTTGATGGCGACGGCGGTCGCGGTGGGCTTTTCTCGGTCAACGGTGTGCAGTTTGCCGTTGAACAGAATCAGGTcgg > 1:65078/1‑149 (MQ=255) tgatATGCGAGGCGGCACCCTTGTGGGCCATGGCCTCGGCGTCGCTGCCCACGGCGATGAAGCGGCCGTCCTTGATGGCGACGGCGGTCGCGGTGGGCTTTTCTCGGTCAACGGTGTGCAGTTTGCCGTTGAACAGAATCAGGTcggcg > 7:210252/1‑149 (MQ=255) atCTGCGAGGCGGCACCCTTGTGGGCCATGGCCTCGGCGTCGCTGCCCACGGCGATGAAGCGGCCGTCCTTGATGGCGACGGCGGTCGCGGTGGGCTTTTCTCGGTCAACGGTGTGCAGTTTGCCGTTGAACAGAATCAGGTCGGCGGt > 2:6268/1‑149 (MQ=255) tCTGCGAGGCGGCACCCTTGTGGGCCATGGCCTCGGCGTCGCTGCCCACGGCGATGAAGCGGCCGTCCTTGATGGCGACGGCGGTCGCGGTGGGCTTTTCTCGGTCAACGGTGTGCAGTTTGCCGTTGAACAGAATCAGGTCGGCGGt > 5:133943/1‑148 (MQ=255) tGCGAGGCGGCACCCTTGTGGGCCATGGCCTCGGCGTCGCTGCCCATGGCGATGAAGCGGCCGTCCTTGATGGCGACGGCGGTCGCGGTg < 1:63097/90‑1 (MQ=255) tGCGAGGCGGCACCCTTGTGGGCCATGGCCTCGGCGTCGCTGCCCACGGCGATGAAGCGGCCGTCCTTGATGGCGACGGCGGTCGCGGTg > 2:63097/1‑90 (MQ=255) tGCGAGGCGGCACCCTTGTGGGCCATGGCCTCGGCGTCGCTGCCCACGGCGATGAAGCGGCCGTCCTTGATGGCGACGGCGGTCGCGGTGGGCTTTTCTCGGTCAACGGTGTGCAGTTTGCCGTTGAACAGAATCAGGTCGGCGGTCAt > 8:242048/1‑149 (MQ=255) ggcACCCTTGTGGGCCATGGCCTCGGCGTCGCTGCCCACGGCGATGAAGCGGCCGTCCTTGATGGCGACGGCGGTCGCGGTGGGCTTTTCTCGGTCAACGGTGTGCAGTTTGCCGTTGAACAGAATCAGGTCGGCGGTCATGGAAcctc > 1:11075/1‑149 (MQ=255) aCCCTTGTGGGCCATGGCCTCGGCGTCGCTGCCCACGGCGATGAAGCGGCCGTCCTTGATGGCGACGGCGGTCGCGGTGGGCTTTTCTCGGTCAACGGTGTGCAGTTTGCCGTTGAACAGAATCAGGTCGGCGGTCATGGAACCTCCtt > 6:328232/1‑149 (MQ=255) ccgcctcgcagatcatcgacctcaagcagcgcacggtgatGAAGCGGCCGTCCTTGATGGCGACGGCGGTCGCGGTGGGCTTTTCTCGGTCAACGGTGTGCAGTTTGCCGTTGAACAGAATCAGGTCGGCGGTCATGGAACCTCCTTGc < 8:40265‑M2/109‑1 (MQ=255) gtgGGCCATGGCCTCGGCGTCGCTGCCCACGGCGATGAAGCGGCCGTCCTTGATGGCGACGGCGGTCGCGGTGGGCTTTTCTCGGTCAACGGTGTGCAGTTTGCCGTTGAACAGAATCAGGTCGGCGGTCATGGAACCTCCTTGCGt < 6:133943/147‑1 (MQ=255) ggCCATGGCCTCGGCGTCGCTGCCCACGGCGATGAAGCGGCCGTCCTTGATGGCGACGGCGGTCGCGGTGGGCTTTTCTCGGTCAACGGTGTGCAGTTTGCCGTTGAACAGAATCAGGTCGGCGGTCATGGAACCTCCTTGCGTGGAt < 2:35173/148‑1 (MQ=255) ccATGGCCTCGGCGTCGCTGCCCACGGCGATGAAGCGGCCGTCCTTGATGGCGACGGCGGTCGCGGTGGGCTTTTCTCGGTCAACGGTGTGCAGTTTGCCGTTGAACAGAATCAGGTCGGCGGTCAt > 5:187900/1‑127 (MQ=255) ccATGGCCTCGGCGTCGCTGCCCACGGCGATGAAGCGGCCGTCCTTGATGGCGACGGCGGTCGCGGTGGGCTTTTCTCGGTCAACGGTGTGCAGTTTGCCGTTGAACAGAATCAGGTCGGCGGTCAt < 6:187900/127‑1 (MQ=255) ccATGGCCTCGGCGTCGCTGCCCACGGCGATGAAGCGGCCGTCCTTGATGGCGACGGCGGTCGCGGTGGGCTTTTCTCGGTCAACGGTGTGCAGTTTGCCGTTGAACAGAATCAGGTCGGCGGTCATGGAACCTCCTTGCGTGGATGCg > 3:214923/1‑149 (MQ=255) gCCTCGGCGGCGCTGCCCACGGCGATGAAGCGGCCGTCCTTGATGGCGACGGCGGTCGCGGTGGGCTTTTCTCGGTCAACGGTGTGCAGTTTGCCGTTGAACAGAATCAGGTCGGCGGTCATGGAACCTCCTTGCGTGGATGCGTGAGc < 1:106108/149‑1 (MQ=255) atcgacctcaagcagcgcacggtgatGAAGCGGCCGTCCTTGATGGCGACGGCGGTCGCGGTGGGCTTTTCACGGTCAACGGTGTGCAGTTTGCCGTTGAACAGAATCAGGTCGGCGGTCATGGAACCTCCTTGCGTGGATGCGTGAGc < 6:133459‑M2/123‑1 (MQ=255) ggCGTCGCTGCCCACGGCGATGAAGCGGCCGTCCTTGATGGCGACGGCGGTCGCGGTGGGCTTTTCTCGGTCAACGGTGTGCAGTTTGCCGTTGAACAGAATCAGGTCGGCGGTCATGGAACCTCCTTGCGTGGATGCGTGAGCGGAAc < 1:6268/149‑1 (MQ=255) ccACGGCGATGACGCGGCCGTCCTTGATGGCGACGGCGGTCGCGGTGGGCTTTTCTCGGTCAACGGTGTGCAGTTTGCCGTTGAACAGAATCAGGTCGGCGTTCATGGAACCTCCTTGCGTGGATGCGTGAGCGGAACCGGCTTGGCCg < 4:17483/149‑1 (MQ=255) ccACGGCGATGAAGCGGCCGTCCTTGATGGCGACGGCGGTCGCGGTGGGCTTTTCTCGGTCAACGGTGTGCAGTTTGCCGTTGAACAGAATCAGGTCGGCGGTCATGGAACCTCCTTGCGTGGAt < 3:263309/125‑1 (MQ=255) ccACGGCGATGAAGCGGCCGTCCTTGATGGCGACGGCGGTCGCGGTGGGCTTTTCTCGGTCAACGGTGTGCAGTTTGCCGTTGAACAGAATCAGGTCGGCGGTCATGGAACCTCCTTGCGTGGAt > 4:263309/1‑125 (MQ=255) ccACGGCGATGAAGCGGCCGTCCTTGATGGCGACGGCGGTCGCGGTGGGCTTTTCTCGGTCAACGGTGTGCAGTTTGCCGTTGAACAGAATCAGGTCGGCGGTCATGGAACCTCCTTGCGTGGATGCGTGAGCGGAACCGGCTTGGCCg > 4:257821/1‑149 (MQ=255) ccACGGCGATGAAGCGGCCGTCCTTGATGGCGACGGCGGTCGCGGTGGGCTTTTCTCGGTCAACGGTGTGCAGTTTGCCGTTGAACAGAATCAGGTCGGCGGTCATGGAACCTCCTTGCGTGGATGCGTGAGCGGAACCGGCTTGGCCg < 2:11075/149‑1 (MQ=255) cACGGCGATGAAGCGGCCGTCCTTGATGGCGACGGCGGTCGCGGTGGGCTTTTCTCGGTCAACGGTGTGCAGTTTGCCGTTGAACAGAATCAGGTCGGCGGTCATGGAACCTCCTTGCGTGGATGCGTGAGCGGAACCGGCTTGGCCgg > 1:153114/1‑149 (MQ=255) aCGGCGATGAAGCGGCCGTCCTTGATGGCGACGGCGGTCGCGGTGGGCTTTTCTCGGTCAACGGTGTGCAGTTTGCCGTTGAACAGAATCAGGTCGGCGGTCATGGAACCTCCTTGCGTGGATGCGTGAGCGGAACCGGCTTGGCCGGt < 3:195297/149‑1 (MQ=255) gCGATGAAGCGGCCGTCCTTGATGGCGACGGCGGTCGCGGTGGGCTTTTCTCGGTCAACGGTGTGCAGTTTGCCGTTGAACAGAATCAGGTCGGCGGTc < 6:300627/99‑1 (MQ=255) gCGATGAAGCGGCCGTCCTTGATGGCGACGGCGGTCGCGGTGGGCTTTTCTCGGTCAACGGTGTGCAGTTTGCCGTTGAACAGAATCAGGTCGGCGGTc > 5:300627/1‑99 (MQ=255) cGATGAAGCGGCCGTCCTTGATGGCGACGGCGGTCGCGGTGGGCTTTTCTCGGTCAACGGTGTGCAGTTTGCCGTTGAACAGAATCAGGTCGGCGGTCATGGAACCTCCTTGCGTGGATGCGTGAGCGGAACCGGCTTGGCCGGTaaaa < 1:235115/149‑1 (MQ=255) | GCAGCTCGAGGTTGTAGTTCAGACCGCCACGGATCAGGTGCAGGTGCGAGTCATTGAGGCCCGGGATCACCGTGCGCTGCTTGAGGTCGATGATCTGCGAGGCGGCACCCTTGTGGGCCATGGCCTCGGCGTCGCTGCCCACGGCGATGAAGCGGCCGTCCTTGATGGCGACGGCGGTCGCGGTGGGCTTTTCTCGGTCAACGGTGTGCAGTTTGCCGTTGAACAGAATCAGGTCGGCGGTCATGGAACCTCCTTGCGTGGATGCGTGAGCGGAACCGGCTTGGCCGGTAAAA > NC_002947/5996647‑5996939 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |