| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 6099117 = | 34 (0.680) | 3 (0.060) | 3/244 | NT | 9.5% | intergenic (‑29/‑60) | PP_5350/zwf | RpiR family transcriptional regulator/glucose 6‑phosphate 1‑dehydrogenase |
| ? | NC_002947 | 6099162 = | 25 (0.520) | intergenic (‑74/‑15) | PP_5350/zwf | RpiR family transcriptional regulator/glucose 6‑phosphate 1‑dehydrogenase | |||||
TCGGCCATGGAGCTGTGCATGACGGCAGCCGGGTCGAGCAGCACGTGGTCGGCCACTTTCAGTTCCGATTTGCGCAGCAAGTGGCGCGATTGGGCGATATGTTGCAACAGATTCACAGGCGGGACTCGGTTATGATCGGCTTGCCGGGTTGTAGCTTTCTTGTAGTTATACTACATGGACGCCAACCCGCCCAGT‑TAAACGAACGTGGAGAGTGGTGGTTTGACTATTCCTTGCGACATTCTGGTCTTCGGCGGCACCGGTGATCTGGCCCTGCACAAATTGCTTCCGGCG > NC_002947/6098973‑6099263 | cacggcagggttcagacgggcctcgcgaaacaggtggtagagcgacggaagcaatttgtgcagggccagatcaccggtgccgccgaagaccagaatgtcgcaaggaatagtcaaaccaccactctccacgttcgtttaactgggCGGGt < 4:60009‑M1/5‑1 (MQ=255) ggCCATGGAGCTGTGCATGACGGCAGCCGGGTCGAGCAGCACGTGGTCGGCCACTTTCAGTTCCGATTTGCGCAGCAAGTGGCGCGATTGGGCGATATGTTGCAACAGATTCACAGGCGGGACTCGGTTATGATCGGCTTGCCGGGtt < 2:253580/148‑1 (MQ=255) cggcagggttcagacgggcctcgcgaaacaggtggtagagcgccggaagcaatttgtgcagggccagatcaccggtgccgccgaagaccagaatgtcgcaaggaatagtcaaaccaccactctccacgttcgtttaactgggCGGGTTg > 1:5447‑M1/143‑149 (MQ=255) gCCATGGAGCTGTGCATGACGGCAGCCGGGTCGAGCAGCACGTGGTCGGCCACTTTCAGTTCCGATTTGCGCAGCAAGTGGCGCGATTGGGCGATATGTTGCAACAGATTCACAGGCGGGACTCGGTTATGATCGGCTTGCCggg > 5:168594/1‑145 (MQ=255) gCCATGGAGCTGTGCATGACGGCAGCCGGGTCGAGCAGCACGTGGTCGGCCACTTTCAGTTCCGATTTGCGCAGCAAGTGGCGCGATTGGGCGATATGTTGCAACAGATTCACAGGCGGGACTCGGTTATGATCGGCTTGCCggg < 6:168594/145‑1 (MQ=255) cATGGAGCTGTGCATGACGGCAGCCGGGTCGAGCAGCACGTGGTCGGCCACTTTCAGTTCCGATTTGCGCAGCAAGTGGCGCGATTGGGCGATATGTTGCAACAGATTCACAGGCGGGACTCGGTTATGATCGGCTTGCCGGGTTGTAg < 1:141792/149‑1 (MQ=255) tGGAGCTGTGCATGACGGCAGCCGGGTCGAGCAGCACGTGGTCGGCCACTTTCAGTTCCGATTTGCGCAGCAAGTGGCGCGATTGGGCGATATGTTGCAACAGATTCACAGGCGGGACTCGGTTATGATCGGCTTGCCGGGTTGTAGCt < 6:176192/149‑1 (MQ=255) ggcctcgcgaaacaggtggtagagcgccggaagcaatttgtgcagggccagatcaccggtgccgccgaagaccagaatgtcgcaaggaatagtcaaaccaccactctccacgttcgtttaactgggc > 1:197540‑M1/127‑127 (MQ=255) ggcctcgcgaaacaggtggtagagcgccggaagcaatttgtgcagggccagatcaccggtgccgccgaagaccagaatgtcgcaaggaatagtcaaaccaccactctccacgttcgtttaactgggc < 2:197540‑M1/1‑1 (MQ=255) aTGACGGCAGCCGGGTCGAGCAGCACGTGGTCGGCCACTTTCAGTTCCGATTTGCGCAGCAAGTGGCGCGATTGGGCGATATGTTGCAACAGATTCACAGGCGGGACTCGGTTATGATCGGCTTGCCGGGTTGTAGCTTTCTTGTAGtt < 1:10135/149‑1 (MQ=255) ggCAGCCGGGTCGAGCAGCACGTGGTCGGCCACTTTCAGTTCCGATTTGCGCAGCAAGTGGCGCGATTGGGCGATATGTTGCAACAGATTCACAGGCGGGACTCGGTTATGATCGGCTTGCCGGGTTGTAGCTTTCtt < 8:100739/138‑1 (MQ=255) ggCAGCCGGGTCGAGCAGCACGTGGTCGGCCACTTTCAGTTCCGATTTGCGCAGCAAGTGGCGCGATTGGGCGATATGTTGCAACAGATTCACAGGCGGGACTCGGTTATGATCGGCTTGCCGGGTTGTAGCTTTCtt > 7:100739/1‑138 (MQ=255) gCAGCCGGGTCGAGCAGCACGTGGTCGGCCACTTTCAGTTCCGATTTGCGCAGCAAGTGGCGCGATTGGGCGATATGTTGCAACAGATTCACAGGCGGGACTCGGTTATGATCGGCTTGCCggg < 5:66379/124‑1 (MQ=255) gCAGCCGGGTCGAGCAGCACGTGGTCGGCCACTTTCAGTTCCGATTTGCGCAGCAAGTGGCGCGATTGGGCGATATGTTGCAACAGATTCACAGGCGGGACTCGGTTATGATCGGCTTGCCggg > 6:66379/1‑124 (MQ=255) cGGGTCGAGCAGCACGTGGTCGGCCACTTTCAGTTCCGATTTGCGCAGCAAGTGGCGCGATTGGGCGATATGTTGCAACAGATTCACAGGCGGGACTCGGTTATGATCGGCTTGCCGGGTTGTAGCTTTCTTGTAGTTATACTACATgg < 2:107762/149‑1 (MQ=255) gggTCGAGCAGCACGTGGTCGGCCACTTTCAGTTCCGATTTGCGCAGCAAGTGGCGCGATTGGGCGATATGTTGCAACAGATTCACAGGCGGGACTCGGTTATGATCGGCTTGCCGGGTTGTAGCTTTCtt > 7:198464/1‑131 (MQ=255) gggTCGAGCAGCACGTGGTCGGCCACTTTCAGTTCCGATTTGCGCAGCAAGTGGCGCGATTGGGCGATATGTTGCAACAGATTCACAGGCGGGACTCGGTTATGATCGGCTTGCCGGGTTGTAGCTTTCtt < 8:198464/131‑1 (MQ=255) cGAGCAGCACGTGGTCGGCCACTTTCAGTTCCGATTTGCGCAGCAAGTGGCGCGATTGGGCGATATGTTGCAACCGATTCACAGGCGGGACTCTGTTATGATCGGCTTGCCGGGTTGTAGCTTTCTTGTAGTTATACTACATGGACga > 5:306609/1‑147 (MQ=255) agcagcACGTGGTCGGCCACTTTCAGTTCCGATTTGCGCAGCAAGTGGCGCGATTGGGCGATATGTTGCAACAGATTCACAGGCGGGACTCGGTTATGATCGGCTTGCCGGGTTGTAGCTTTCTTGTAGTTATACTACATGGACGCCaa < 6:36805/149‑1 (MQ=255) caCGTGGTCGGCCACTTTCAGTTCCGATTTGCGCAGCAAGTGGCGCGATTGGGCGATATGTTGCAACAGATTCACAGGCGGGACTCGGTTATGATCGGCTTGCCGGGTTGTAGCTTTCTTGTAGTTATACTACATGGACGCCAACCCGc > 5:69678/1‑149 (MQ=255) gccggaagcaatttgtgcagggccagatcaccggtgccgccgaagaccagaatgtcgcaaggaatagtcaaaccaccactctccacgttcgtttaactgggCGGGTTGTAGCTTTCTTGTAGTTATACTACATGGACGCCAACCCGccc > 3:234153‑M1/102‑149 (MQ=255) ggCCACTTTCAGTTCCGATTTGCGCAGCAAGTGGCGCGATTGGGCGATATGTTGCAACAGATTCACAGGCGGGACTCGGTTATGATCGGCTTGCCGGGTTGTAGCTTTCTTGTAGTTATACTACATGGACGCCAACCCGCCCAGT‑Taa > 4:202180/1‑148 (MQ=255) cTTTCAGTTCCGATTTGCGCAGCAAGTGGCGCGATTGGGCGATATGTTGCAACAGATTCACAGGCGGGACTCGGTTATGATCGGCTTGCCGGGTTGTAGCTTTCTTGTAGTTATACTACATGGACGCCAACCCGCCCAGT‑TAaacgaac > 3:115990/1‑149 (MQ=255) tttCAGTTCCGATTTGCGCAGCAAGTGGCGCGATTGGGCGATATGTTGCAACAGATTCACAGGCGGGACTCGGTTATGATCGGCTTGCCGGGTTGTAGCTTTCTTGTAGTTATACTACATGGACGCCAACCCGCCCAGT‑TAaacgaacg > 7:11047/1‑149 (MQ=255) tttCAGTTCCGATTTGCGCAGCAAGTGGCGCGATTGGGCGATATGTTGCAACAGATTCACAGGCGGGACTCGGTTATGATCGGCTTGCCGGGTTGTAGCTTTCTTGTAGTTATACTACATGGACGCCAACCCGCCCAGT‑TAaacgaacg > 6:161873/1‑149 (MQ=255) cagggccagatcaccggtgccgccgaagaccagaatgtcgcaaggaatagtcaaaccaccactctccacgttcgtttaactgggCGGGTTGTAGCTTTCTTGTAGTTATACTACATGGACGCCAACCCGcc > 6:5373‑M1/85‑131 (MQ=255) cagggccagatcaccggtgccgccgaagaccagaatgtcgcaaggaatagtcaaaccaccactctccacgttcgtttaactgggCGGGTTGTAGCTTTCTTGTAGTTATACTACATGGACGCCAACCCGcc < 5:5373‑M1/47‑1 (MQ=255) ttCCGATTTGCGCAGCAAGTGGCGCGATTGGGCGATATGTTGCAACAGATTCACAGGCGGGACTCGGTTATGATCGGCTTGCCGGGTTGTAGCTTTCTTGTAGTTATACTACATGGAc < 7:5947/118‑1 (MQ=255) ttCCGATTTGCGCAGCAAGTGGCGCGATTGGGCGATATGTTGCAACAGATTCACAGGCGGGACTCGGTTATGATCGGCTTGCCGGGTTGTAGCTTTCTTGTAGTTATACTACATGGAc > 8:5947/1‑118 (MQ=255) caccggtgccgccgaagaccagaatgtcgcaaggaatagtcaaaccaccactctccacgttcgtttaactgggCGGGtt > 3:17073‑M1/74‑79 (MQ=255) caccggtgccgccgaagaccagaatgtcgcaaggaatagtcaaaccaccactctccacgttcgtttaactgggCGGGtt < 4:17073‑M1/6‑1 (MQ=255) cagcaAGTGGCGCGATTGGGCGATATGTTGCAACAGATTCACAGGCGGGACTCGGTTATGATCGGCTTGCCGGGTTGTAGCTTTCTTGTAGTTATACTACATGGACGCCAACCCGCCCAGT‑TAAACGAACGTGGAGAGTGGTGGTTTGa < 4:115990/149‑1 (MQ=255) agcaAGTGGCGCGATTGGGCGATATGTTGCAACAGATTCACAGGCGGGACTCGGTTATGATCGGCTTGCCGGGTTGTAGCTTTCTTGTAGTTATACTACATGGACGCCAACCCGCCCAGT‑TAAACGAACGTGGAGAGTGGTGGTTTGAc < 6:69678/149‑1 (MQ=255) tGGCGCGATTGGGCGATATGTTGCAACAGATTCACAGGCGGGACTCGGTTATGATCGGCTTGCCGGGTTGTAGCTTTCTTGTAGTTATACTACATGGACGCCAACCCGCCCAGT‑TAAACGAACGTGGAGAGTGGTGGTTTGa < 6:16091/142‑1 (MQ=255) tGGCGCGATTGGGCGATATGTTGCAACAGATTCACAGGCGGGACTCGGTTATGATCGGCTTGCCGGGTTGTAGCTTTCTTGTAGTTATACTACATGGACGCCAACCCGCCCAGT‑TAAACGAACGTGGAGAGTGGTGGTTTGa > 5:16091/1‑142 (MQ=255) gcgATTGGGCGATATGTTGCAACAGATTCACAGGCGGGACTCGGTTATGATCGGCTTGCCGGGTTGTAGCTTTCTTGTAGTTATACTACATGGACGCCAACCCGCCCAGT‑TAAACGAACGTGGAGAGTGGTGGTTTGACTATTCCTTGc < 5:161873/149‑1 (MQ=255) ggCGATATGTTGCAACAGATTCACAGGCGGGACTCGGTTATGATCGGCTTGCCGGGTTGTAGCTTTCTTGTAGTTATACTACATGGACGCCAACCCGCCCAGT‑TAAACGAACGTGGAGAGTGGTGGTTTGACTATTCCtt < 2:16142/140‑1 (MQ=255) ggCGATATGTTGCAACAGATTCACAGGCGGGACTCGGTTATGATCGGCTTGCCGGGTTGTAGCTTTCTTGTAGTTATACTACATGGACGCCAACCCGCCCAGT‑TAAACGAACGTGGAGAGTGGTGGTTTGACTATTCCtt > 1:16142/1‑140 (MQ=255) ggCGATATGTTGCAACAGATTCACAGGCGGGACTCGGTTATGATCGGCTTGCCGGGTTGTAGCTTTCTTGTAGTTATACTACATGGACGCCAACCCGCCCAGT‑TAAACGAACGTGGAGAGTGGTGGTTTGACTATTCCTTGCGACATTc > 6:223295/1‑149 (MQ=255) ggCGATATGTTGCAACAGATTCACAGGCGGGACTCGGTTATGATCGGCTTGCCGGGTTGTAGCTTTCTTGTAGTTATACTACATGGACGCCAACCCGCCCAGT‑TAAACGAACGTGGAGAGTGGTGGTTTGACTATTCCTTGCGACATTc > 4:43856/1‑149 (MQ=255) ttCACAGGCGGGACTCGGTTATGATCGGCTTGCCGGGTTGTAGCTTTCTTGTAGTTATACTACATGGACGCCAACCCGCACAGT‑TAAAAGAACGTGGAGAGTGGTGGTTTGACTATTCCTTGCGAGATTCTGGTCTTCggcggctacgg > 3:59579/1‑144 (MQ=255) ggACTCGTTTATGATCGGCTTGCCGGGTTGTAGCTTTCTTGTAGTTATACTACATGGACGCCAACCCGCCCAGT‑TAAACGAACGTGGAGAGTGGGGGTTTGACTATTCCTTGCGACATTCTGGTCTTCGGCGGCACCGGTGATCTGGcc < 3:202180/149‑1 (MQ=255) ggACTCGGTTATGATCGGCTTGCCGGGTTGTAGCTTTCTTGTAGTTATACTACATGGACGCCAACCCGCCCAGT‑TAAACGAACGTGGAGAGTGGTGGTTTGACTATTCCTTGCGACATTATGGTCTTCGTCGGCACAGGTGATCTGGc > 4:31557/1‑148 (MQ=255) gACTCGGTTATGATCGGCTTGCCGGGTTGTAGCTTTCTTGTAGTTATACTACATGGACGCCAACCCGCCCAGT‑TAAACGAACGTGGAGAGTGGTGGTTTGACTATTCCTTGCGACATTCTGGTCTTCGGCGGCACCGGTGATCTGGccc < 8:11047/149‑1 (MQ=255) tCGGTTATGATCGGCTTGCCGGGTTGTAGCTTTCTTGTAGTTATACTACATGGACGCCAACCCGCCCAGT‑TAAACGAACGTGGAGAGTGGTTGTTTGACTATTCCTTGCGACATTCTGGTCTTCGGCGGCACCGGTGATCTGGCCCTg > 5:318212/1‑148 (MQ=255) ggTTATGATCGGCTTGCCGGGTTGTAGCTTTCTTGTAGTTATACTACATGGACGCCAACCCGCCCAGT‑TAAACGAACGTGGAGAGTGGTGGTTTGACTATTCCTTGCGACATTCTGGTCTTCGGCGGCACCGGTGATCTGGCCCTGca > 6:283035/1‑148 (MQ=255) ggCTTGCCGGGTTGTAGCTTTCTTGTAGTTATACTACATGGACGCCAACCCGCCCAGT‑TAAACGAACGTGGAGAGTGGTGGTTTGACTATTCCTTGCGACATTCTGGTCTTCGGCGGCACCGGTGATCTGGCCCTGCACAAATTGCTTc < 5:223295/149‑1 (MQ=255) ccGGGTTGTAGCTTTCTTGTAGTTATACTACATGGACGCCAACCCGCCCAGTATAAACGAACGTGGAGAGTGGTGGTTTGACTATTCCTTGCGACATTCTGGTCTTCGGCGGCACCGGTGATCTGGCCCTGCACAAATTGCTTCCGgcg > 1:79729/1‑149 (MQ=255) | TCGGCCATGGAGCTGTGCATGACGGCAGCCGGGTCGAGCAGCACGTGGTCGGCCACTTTCAGTTCCGATTTGCGCAGCAAGTGGCGCGATTGGGCGATATGTTGCAACAGATTCACAGGCGGGACTCGGTTATGATCGGCTTGCCGGGTTGTAGCTTTCTTGTAGTTATACTACATGGACGCCAACCCGCCCAGT‑TAAACGAACGTGGAGAGTGGTGGTTTGACTATTCCTTGCGACATTCTGGTCTTCGGCGGCACCGGTGATCTGGCCCTGCACAAATTGCTTCCGGCG > NC_002947/6098973‑6099263 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |